Professional Documents
Culture Documents
Buněčné Membrány HOTOVO
Buněčné Membrány HOTOVO
2020/2021
Struktura
1) Struktura a chemické složení biologických
membrán
- vývoj modelů membrán
- chemické složení
- vlastnosti
2) Vybrané funkce membrán
BIOLOGICKÁ – BUNĚČNÁ -
PLAZMATICKÁ MEMBRÁNA E. BUNĚK
Jsou komplikovamé (chemicky i strukturálně) struktury složeny z mnoha menších elementů jejíž hlavní vlastností je
ohromná dynamika
• Integrita a funkce buňky = každá buněčná membrána vyváří
rámec pro integritu a fungování buňky
• Cca 5 - 10 nm ´pouze návodný údaj (tloušťka) - je dána molekulární velikostí
základních komponentů
(lipidy a proteiny)
Proč se udává rozmezí?
Membrána je často složena z
unikátních typů komponent
a proto má i unikátní
tloušťku
VYBRANÉ FUNKCE MEMBRÁN
Bilogické membrány - když nerozlišujeme mezi mebránou buněčnou a membránou kompartmentovou- se účastní velkého
množství funkcí => membrána má selektivní vlastnosti (není polopropustná) = není důležitá jen její polopropustnost ale
závisí na ní spousta dalších vlastností buňky
Tvar Selektivní
= rozdělení vnitřního prostředí (na organely)
Kompartmentace receptivita a
Modré = vlastnosti membrány Zelné = vlastnosti membrán transdukce
které dodávají buňce její které umožňují
mechaniku dynamiku signálů
E-kurz
Adheze KOMUNIKACE
1. E. Overton (1890s)
= základní vhled do chemické podstaty do vnější membrány
Prováděl experimenty s membránami rostlinných buněk (s
nepolárními izoláty techto membr.) sledoval jakým způsobem
– rozpustnost látky ve jsou látky přes
tyto lipidy
vnějším obalu buňky schopny
procházet
Z výsledků odvodil tzv.:
– Overtonovo pravidlo
Čím je látka nepolárnější (čím víc je rozpustná v tucích/ lipidech)
tím lépe touto membránou (lipidy) proniká
https://www.wiley.com/college/karp/0471465801/samplechapter/ch04.pdf
VÝVOJ POZNÁNÍ STRUKTURY A
CHEMICKÉHO SLOŽENÍ MEMBRÁN
3. H. Davson a J. Danielli (1935, 1950)
Další vývoj šel od 30. let a – lipidová dvojvrstva pokrytá proteiny
úkolem bylo zjistit zda tyto
membrány obsahují pouze – proteiny lemované póry
lipidy nebo i jiné složky
– jednotkový membránový model
= vytvořili teorii že buněčná membrána se skládá z lipidové dvojvrstvy, která má v sobě skrz na skrz globulární proteiny
https://www.wiley.com/college/karp/0471465801/samplechapter/ch04.pdf
VÝVOJ POZNÁNÍ STRUKTURY A
CHEMICKÉHO SLOŽENÍ MEMBRÁN
KONEČNÝ MODEL
Tento model je v základní části složen
4. S. J. Singer a G. Nicholson (1972) z lipidové dvojvrstvy, kde jsou lipidy
Tento model vytvořil – fluidně mozaikový model specificky orientovány a jsou v nich
zavzaty další komponenty (proteiny
CENTÁLNÍ DOGMA MEMBRÁNOVÉ BIOLOGIE atd.)
ALE není to konečná věc
= uspořádání, struktura
a chování základních
složek (hl. lipidů)
této membrány se
pohybuje v různých
fázích, které
umožňují aby ta
tekutost / fázové
rozhraní bylo
dynamicky
udržováno
(zvláště změnami
teplot a prostředí)
https://www.wiley.com/college/karp/0471465801/samplechapter/ch04.pdf
CHEMICKÉ SLOŽENÍ
3 základní složky: sacharidy/
Proteiny Lipidy Cukry
Plazmatická 54 36 10
Jaderná 66 32 2
ER 62 27 10
Golgi 64 26 10
Mitochondrie (Ext) 55 45 0
Mitochondrie (Int) 78 22 0
Ery 19 43 8
Myelin 18 79 3
Za určitých okolností se mohou poměry dost dramaticky měnit
Mohou být přesahy :
- např. posunutý poměr ve vnitřních membránách u ER nebo Golgiho komplexu
glykoproteiny, glykolipidy
ve prospěch proteinů a existují i situace kdy jsou lipidy preferovány (viz tabulka)
CHEMICKÉ SLOŽENÍ MEMBRÁN
Díky fázovému chování lipidů a variacím, které souvisí i s jejich chemickým složením - z jejich hydrofilní části, řetězců
mastných kyselin - je dnes známo více než 1000 různých lipidů (nejčastěji fosfolipidů) v membránách eukaryontních
buněk = NEJEDNÍ SE O HOMOGENNÍ SKUPINU
• Fosfolipidy
• Glykolipidy Lipidy
• Steroidní lipidy (cholesterol)
• Bílkoviny
Proteiny
• Glykoproteiny
• Cukry
Zbytek
• Ostatní
FOSFOLIPIDY
= molekuly které mají svoji polární a nepolární část a obě dvě se mohou významně lišit z pohledu chemického chování a
struktury. Tyto fosfolipidy mohou být i modifikovány tím že obsahují různé substituenty, které nesou náboj (a to s ezárověň
projevuje i tím jak se mění jejich tvar)
• Amfifilita
• Mastné kyseliny
• Náboj
• Tvar
Fospolipidy jsou
charakteristické pro
eukaryontní buňky ale do
jisté míry i pro ty
prokaryontní - ale nacházíme
odlišné fospolipidy u říše
ARCHEA
Cylindrické Kónické
• Fosfatidylcholin • Fosfatidylethanolamin
• Fosfatidylserin • Fosfatidylová kyselina
• Deriváty
• Fosfatidylinositol (PI -)
Některé z fosfolipidů se
vždy nacházejí v membráně
na její vnitřní vrstvě a jiné
na té vnější
= např. PI- a PS- se
nacházejí na VNITŘNÍ
straně dvojvrtsvy a mají
záporný náboj = určují
nabití a polarizaci membr.
=> dopad na transportní
mechanismy (hlavně ty co
závisí na elektrochemickém přenos nervových
gradientu - pohyb iontů vzruchů na srdce a
dovnitř/ven atd.) https://slideplayer.com/slide/10252631/
mozku
Membránový % zastoupení
fosfolipid v membráně = není homogenní ale je odlišné
Jak je možné že systém ví jaký fosfolipid má být nejvíce uvnitř nebo naopak?
Je to otázka LIPIDOVÉHO METABOLISMU
A LOKALIZACE
%vnitřní %vnější
Fosfatidyl-
etanolamin
Fosfatidylcholin
Sfingomyelin
Fosfatidylserin
Fosfatidylinositol
Fosfatidylinositol
4-fosfát
Fosfatidylinositol
4,5-bisfosfát
Fosfatidylová kyselina
https://bio.libretexts.org/Bookshelves/Biochemistry/Book%3A_Biochemistry_Free_For_All_(Aher
n%2C_Rajagopal%2C_and_Tan)/03%3A_Membranes/3.01%3A_Basic_Concepts_in_Membrane
s
Spektrum fofolipidů a jejich
uspořádání v membráně je
UNIKÁTNÍ a musí být nějak
regulováno!
Je regulováno minimálně 2mi různými způsoby:
Pro každou 1) Na místě tím kde se odehrává sysntéza fosfolipidů = hlavně v ER - vytváří
organelu většinu strukturních fosfolipidů, včetně cholesterolu + se podílí i GOLGI
vidíme různé
druhy fosfolipidů
co se v ní nachází
kvantitativní zastoupení:
P4 ATPázy - enzymy, které fungují v rámci lipidové dvouvrstvy a jsou schopny
přicházející fosfolipidy vhodně
umísťovat (= má to i svůj funkční GLYKOLIPIDY
význam) => Jak se dostanou fl. na místo? putují v endozomech (vezikule) a ty pak
fůzují s membránou
= ZÁKLAD (většinou)
Glykosylované =
konjugované s cukernou
složkou
https://biology441.wordpress.com/2017/03/12/lipid-rafts-and-their-role-in-alzheimer-disease/
2. Signální transdukce
4. Neurotransmise
- Neurologové si myslí že rafty tvoří klíč pro neurotransmisy
Jaké mají buňky mechanismy aby mohli fluiditu udržovat? = chemiscká struktura fosfolipidu a dané množství fosfolipidu v
daném úseku membrány (fosfolipid se může lišit nejen tím jak je postavena polární část = HLAVA, ale také jakým způsobem je
uspořádán OCAS = ne/nasycená kyselina
FLUIDITA MEMBRÁN
• Pohyb fosfolipidů
Je různý:
Máme důkazy že se fosfolipidy opravdu
pohybují laterálně a rotačně
1) Rotace
2) Laterální difúze
3) Flip-flop (flipázy,
flopázy, skramblázy)
1) a 2) je smontánní
3) = pohyb jednoho z mnoho mnoho fosfolipidů za delší časový
úsek - jsou to úseky co jsou regulovány enzymaticky, existují
zde různé enzymy, ktreé jsou schopné ten daný fosfolipid vzít
a přesunout ho z vnitřní na vnější vrstvu nebo naopak
= tomu pohybu se říká FLIP FLOP (je odpovědný za velmi
charakteristické změny díky distribuci v rámci membrán)
FLUIDITA MEMBRÁN
• Cholesterol fyziologických
= steroidní produkt, nedílnou součástí našich membrán a je potřeba i v celé další řadě
funkcí
Pokud ho přestaneme konzumovat tak ho musí vyrábět ER našich buněk
DŮKAZY FLUIDITY
1. Selektivní značení - fúze
= Experimenty ve ktreých se fosfolipidy jedné buňky označili nějakou barvou - nejčastěji fluorescentní - a fosfolipidy na
membráně druhé buňky se označili odlišnou barvou, pak se ty buňky zfúzovali. Nejprve došlo k tomu že červená a zelená
barva byli odděleny (což odpovídá kompartmentu membrány co pochází z té původní buňky), ale později se zjistilo, že se
barvy PROMÝCHALI = což byl důkaz toho, že fosfolipidy se nějakým způsobem pohybují (nejčastěji laterálně)
DŮKAZY FLUIDITY
2. Vybělování (FRAP)
Jedná se v podstatě o to, že část membrány se laserem vybělí a vybělené místo se potom sleduje ( to místo kde ta barvička
zmizela) a když se pák dále zjišťuje, že se ta barvička vrací do toho vyběleného místa po vybělení je to důkaz toho, že se
zase ty složky membrány pohybují a že jsou schopny tuto vybělenou část opět zaplnit
DŮKAZY FLUIDITY
• Molekulární agregace/segregace
je podkladem hydrofobního mismatche fosfolipidů
PROTEIN-LIPIDOVÉ INTERAKCE
Existece proteinů NENÍ naprosto nezávislá Lipidy- funkce
na fosfolipidech - právě styk mezi A) energetická
proteinem a lipidem upravuje B) bariérová -není pouze
fukce daného proteinu mechanika, ale je zde celá řada
(změna konformace, pozice, funkčních aspektů, které plní
změna stabilita) + tyto interakce úlohu regulační
ovlivňují i lipidy samotné, jelikož C) mnohé z těchto lipidů pak
mohou umožnit transport lipidů slouží jako substráty (základní
mezi jednotlivé kompartmenty molekuly) ze kterých potom
memnrány enzymy vyrábí první a druhé
posli = významné komponenty
signalizace a signální trasndukce
Jak vypadají?
• 50 % léčiv membrán
jsou látky co interagují s membránou a jejími proteiny = jsou KLÍČOVÉ pro stavbu
Kromě nich pak známe i membránové bílkoviny, které jsou EXTRINZNÍ = jsou na povrchu buňky a mají trochu jiné
vazebné inerakce a trochu jinou úloku v dané funkci buňky
MEMBRÁNOVÉ BÍLKOVINY II
Transmembránové (integrální, intrinzní)
Průchod a povaha interakce
To jestli proniká mmebránou nebo ne je dáno jeho unikátní strukturou = spektrem aminokyselin - z nichž AK, které
potom interagují s vnitřní doménou membrány musí být vyšší AK nepolární povahy
https://www.wiley.com/college/karp/0471465801/samplechapter/ch04.pdf
MEMBRÁNOVÉ BÍLKOVINY
Periferní (extrinzní) – navázané na vnější či vnitřní
Jsou velmi často spojeny a ukotveny pomocí
cukerných složek = velmi často vytváří glykoproteiny
povrch
https://www.wiley.com/college/karp/0471465801/samplechapter/ch04.pdf
MEMBRÁNOVÉ BÍLKOVINY-FUNKCE
Podle toho co ta bylkovina dělá se rozdělují do 4 základních kategorií
Přenašeče = různé kanály a transportní systémy => jsou to tvz. stopturní bílkoviny, které zprostředkovávají adhezi a kontakty
mezi buněčné nebo mezi membránou a extracelulární matrix
Membrána je sociálním médiem buňky - přes ni buňka kontroluje a řídí s kým se bude bavit, jaké signály bude ignorovat atd.
= velmi významná funkce
GLYKOKALYX Periferní extrizní proteiny s navázanými cukernými
složkami tvoří takovou tenkou vrstvu = GLYKOKALYX
Fce a vlastnosti:
- povrchový náboj Součástí glykokalyxu jsou glykoproteiny, které tvoří
antigenní systémy, které určují identitu buňky
- koncentrace iontů (reaktivitu buňky vůči jiné látce)
- filtr Glykokalyx a jeho povaha asi určují průnik látek do buňky např. vody =
klíčové v případech akutních metabolických stavů nebo osmotickz
- ochrana závažných stavů = může mít dopad do praktického života
- specifita v diferenciaci
SPOJENÍ S EXTRACELULÁRNÍ
MATRIX
Glykokalyx je zároveň styčnou plochou pro danou buňku v souvislosti s vnějším prostředí = ECM
prostřednictvím buněčné membrány se buňka KOTVÍ - jednak směrem k povrchu (pokud je to adherující buňka) + ineraguje s
tzv. STROMATEM = ECM (chemicky obrovsky bohatý)
Proteiny
Glykokonjugáty:
fibronektin, laminin,
imunoglobuliny,
integriny, kadheriny,
MHC receptory,
heparany,
chondroitin sulfáty,
proteoglykany
SPOJENÍ S INTRACELULÁRNÍMI
KOMPONENTY
Buněčná membrána směrem k matrix nebo směrem dovnitř ke stromatu vytváří nutnou podstatu ADHEZE
MOŽNOSTI ADHEZE
Většina našich buněk existuje v adherentním stavu - proto aby mohli adherovat musí vytvářět speciální struktutry, kterými
adheruje (neadheruje celou membránou ale určitými částmi = pomocí CAM)
kadheriny
• CAM – adhezivní
molekuly buněk
– Molekulární senzory Ig-CAM
– 4 superrodiny
• Integriny
• Kadheriny selektiny
• Selektiny
• Ig-CAM
Každá z rodin má mnoho funkcí a různých významů
integriny
Kadheriny = významné adhezivní molekuly hlavně v epitelu
Ig-CAM = protilátkové adhezivní molekuly, fungují hlavně
α
imunitního systému β
Selektiny a integriny = podmiňují aby se buňka správně adherovala
na povrch nějaké tkáně, nebo správně adherovala s jinými buňkami
=> pro vytvoření TKÁŇOVÉ ARCHUTEKTURY
Adhezi jsme
Membrány jsou planární (což platí o mmebráně buněčné) ale často jsou zakřivené, což platí hlavně u ORGANEL = JSOU
DEFORMOVANÉ
- filopodie, lamelipodie
- klatrinové váčky, kaveoly
Deformace můžeme dělit na velké (makrodefrormace) a malé (mikrodeformace = vytváření různých výběžků, váčků,
kaveolek atd.)
MEMBRÁNOVÉ DEFORMACE
1. Metabolismus lipidů
2. Nepřímé vytváření proteinových konstrukcí
(„scaffolding“)
3. Interakce – lipidy a proteiny
+ participace cytoskeletu
(praktická cvičení)
Tyto membránové deformace jsou výsledkem koordinovaných a
komplikovaných procesů = metabolismus lipidů, specifickou
interakcí mezi lipidy a proteiny, ktreá pak podmiňuje vytváření tzv
proteinových komplexů + i fukce vnitřního cytoskeletu
=> to vše umožňuje deformace membrány a schopnost buňky měnit
tvar, tvorba endozomu (vnitřního váčku)
http://jcs.biologists.org/content/128/15/2747
Na úrovni molekulárně biochemické je to otázka konkrétních styků mezi doménami proteinů a jednotlivými fosfolipidy
Podstatné je to, že existují určité proteiny, které mají určité domény, které jsou určeny pro tento účel aby interagovali s
určitými fosfolipidy/ sfingolipidy a vytvářeli deformace, které pak podmiňují biologickou rekativitu
https://www.wiley.com/college/karp/0471465801/samplechapter/ch04.pdf
TRANSPORTNÍ MECHANIZMY
Buňka trasnportuje dovnitř nebo ven látky o různé velikosti a chemické podstatě a identitě - přímo NEBO přes
přenašeče NEBO ne vyjímečných případech jde o transport, který je zprostředkován membránou
• Velikost
• Rozpustnost
Rozdělovníky (to jestli membrána určí jestli bude transportovat přímo nebo pomocí
deformace je pak otázka SELEKTIVNÍ PERMEABILITY, která řeší jak ta molekula je veliká
• Náboj
jak se rozpouští, zda nese náboj, jaký má gradient, jestli na to má dost energie a obecně
jak je nastaveno prostředí
• Gradienty
To vše hraje úlohu v tom jestli se rozhodne pro ten ten nebo ten mechanismus přenosu
• Energie
• Přenašeče
• Prostředí
MOŽNOSTI TRANSPORTU
• Pasivní
- osmóza
- jednoduchá difůze
- usnadněná difůze (iontové kanály,
aquaporiny)
• Aktivní
- primární (ATPázy, ABC transportéry)
= nejčasteji ATPázy
- sekundární - sodnodraselná pumpa, vápená pumpa, protonová
pumpa
ABC TRANSPORTÉRY
= skupina transportních proteinů, které se nachází u všech typů buněk
• Konzervované (prokaryota až eukaryota)
• Více než 100 (48 – člověk, 16 charakterizovaných,
14 – chorobami) struktura
= charakteristika spočívá v tom, že některé z nich byly klonovány a přesně se zní jejich
a funkce a u mnoha z nich známe spojení jejich defektu s chorobami
Pozn.: sekalo se to
- centální složka se deformuje po navázání ATP na určitá místa té struktury a zění se forma a může se ta složka v
centru exportovat asi
VYBRANÉ KLINICKÉ PŘÍKLADY
Disfunkce ABC tarnsportérů
• Ostatní iontové kanály Tento kanál exportuje choridy ven a zároveň brání absorbci sodíku
s tím,že brání i pronikání vody ven
• Hydratace sekrecí exkrecí Tím že vypumpovává Cl ven tak je následuje voda což vede k
tomu, že se vnější prostor HYDRATUJE =>
Cl a inhibicí absorpce Na
Většinou se to týká tkání kde buňky sekterují MUCUS, který by
• Respirační trakt, pankreas, měl být odstraňován (ciliomukózním tahem)
žlučový systém, střevo, Pokud nedochází k tomuto transportu tak se voda nedostává v
patřičném množství ven tak sekret buněčný co je také vylučován
mužské genitálie tak nabývá husté formy a není tedy zkapalňován a nemůže být
jednoduše odstraňován => začíná pokrývat povrchy a vede k
degeneraci a řadou obtíží
VEZIKULÁRNÍ TRANSPORT
a úloha membán v tomto trasnportu
Otázka vnitřního trasnportu
- uplatnění váčků (kde se uplatní membránové
systémy)
- pomocí mikrotubulů
Celý transport stojí i padá
také na exo a endocytóze
KLATRINY stane
- musí se změnit, správně označit,
naakumulovat = není to jednoduchá záležitost
RŮZNÉ DRUHY OPLÁŠTĚNÍ
VÁČKŮ
Po označení může dojít tedy k transportu mezi mebránovými
strukturami nebo mezi mebránovou strukturou a buněčnou
stěnou
Figure 13-24b Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Plošky adres, ketré určují specifitu: