Professional Documents
Culture Documents
Cytoskelet Hotovo
Cytoskelet Hotovo
2020/2021
Struktura
1) Cytoskelet – součásti, struktura, funkce,
patologie, klinický význam
- mikrotubuly
- mikrofilamenta
- intermediární filamenta
CYTOSKELET - HISTORIE zeleně = mikrotubuli, červeně = aktinová vlákna, modře = jádro,
žluté výběžky = intermediální filamenta
MILNÍKY HISTORIE
1942 Objev aktomyozinu
1968 Tubulin, kolchicin, MV
1968-1978 Identifikace IF
1989, 1995 Ɣ tubulin a MTOC
1992-1998 Bakteriální cytoskelet
1999 Úplná motilita in vitro
https://cellbiology.med.unsw.edu.au/cellbiology/index.php/Cytoskeleton_Introduction
Obrázek ktreý byl prvním elektron optickým snímkem neporušeného cytoskeletu neporušené eukaryontní buňky
CYTOSKELET – OBECNÉ
CHARAKTERISTIKY
= strukturu cytoskeletu najdeme ve všech různých typech
• Univerzální, přesto specifické eukaryontních buněk (živočišné, houby a některé rostliné
-mají však
• Mnohočetné funkce – fyzikální vlastnosti specifické
Má 3 základní funkce =
• Dynamický (tvorba) 1) UDRŽUJE VNITŘNÍ INTEGRITU uspořádání a jsou
PROSTŘEDÍ - stabilita organel uzpůsobené tomu
• Topografie a organizace 2) - FUNKČNOST VNITŘNÍHO jaký způsob života
= strukturně se velmi často mění a buňka si ho buňka vede, v
PROSTŘEDÍ - pohyby, reguluje procesy
uzpůsobuje k jejímu životu nebo konkrétní funkci jakém
ERY NEURONY
3) INTEGRITU BUŇKY V RÁMCI prostředí se nachází
PROSTŘEDÍ - kotvení buňky =>
odvíjejí se z toho
funkce cytoskeletu
odlišné=>
Exprese různých cytoskeletálních struktru a jeho specifické uspořádání pak hrají roli v tkáňové a buněčně diferenciální
Cell Rep s22, 1151–1158J, 2018
diagnostice Principles Mol, Cell, Medical Neurobiol 2012,101-118
= soustava 3 navzájem propojených a komunikujících vláken => mikrotubuly, aktinová filamenta a intermediální filamenta
- každé z těchto vláken má
své strukturní uspořádání,
velikost a organizaci
CYTOSKELET
= existují i v rozloženém stavu na monomerní komponenty
Kromě základních vláken do cytoskletu řadíme i základní monomerní komponenty
• Vlákna (jejich stavební kameny) a také další tzv. asiované a s cytoskeletem interagující molekuly
a signály
• Monomerní komponenty
Ty nejenom
• Asociované a interagující molekuly upravují vlastní
funkčnost
cytoskeletu, ale
také fungují od
cytoskleteu ke
zbytku buňky,
protože
cytoskelet se
může uplatňovat
v signalizačních i
jiných procesech
MIKROTUBULY - FUNKCE
Jsou to polymerní struktury, které se nachází v každé jedné
buňce mnohobuněčného organismu
Exprimovány ve všech
Jejich základní strukturnía funkčí jednotkou = MONOMER
je tzv. TUBULIN buňkách – house keeping
=> protein, který je exprimován ve všech buňkách JSOU TO DYNAMICKÉ STRUKTURY
(bez ohledu na to jak jsou diferencovány) - proto se - stále se zkracují/ prodlužují a jsou ve středu všech aktivit
genům, který tento tubulin kóduje (nneí tedy jeden gen,
ale je jich vícero, stejně jako je vícero typů tubulinu)
1) Mechanická podpora buňky
říká HOUSE KEEPOVÉ (= jsou to geny, které každá 2) Buněčný pohyb (cilie a bičíky)
buňka musí mít)
3) Intracelulární transport -
Mikrotubuli mají celou řadu funkcí:
- jednak jsou spojeny s mechanikou (aby buňka nějak vypadala
molekuly a organely
-
aby se správně kotvila, aby se správně pohybovala = 4) Buněčné dělení – mitotické
pomocí appendixů CILIÍ A BIČÍKŮ)
- slouží ale i také jako hustá dopravní síť (pro molekuly, vřeténko
organely a produkty) = INTRACELULÁRNÍ TRASNPORT
- uplatnění mají i při buněčném dělení 5) Signalizace
- mají roli i signalizační
MIKROTUBULY – BUNĚČNÁ
TOPOGRAFIE
Můžeme je dělit na dvě topograficko-architektonické konfigurace = jejich uspořádání se mění podle toho v jakém stádiu života
se buňka nachází => buňky z tohoto pohledu dělíme na 2 skupiny:
Centrozom je spojen
• Funkce Centrozom podléhá tzv. CENTROZOMOVÉMU pericentrozomálním
komplexem
CYKLU - existuje v souvislosti s buněčným
(modré)
cyklem. Centrozomy jsou obvykle duplikovány
• Cyklus v S fázi (stejně jako duplikace DNA) =
duplikace centriolů v rámci centrozomu
A centrozomy se i Zdvojení
oddělí aby pak mohly centriol a
cestovat do opačných specificky se
pólů buňky uspořádají
(tvar L)
- polarizované (nemigrující)
Asymetrie dodává systému možnost jak velmi rychle a flexibilně regulovat velikost =dynamická nerovnováha
mikrotubulu = za na jeho + konci bude mikrotubulus růst nebo stagnovat nebo naopak se
VLASTNOSTI MIKROTUBULŮ
bude zkracovat
Ve chvíli kdy dimer není dlobulární, ale podlouhlý, tak při vazbě GTP na beta tubulin má nějakou konfiguraci v prostoru a je
pokřivený => ve chvíli kdy dojde ke změně GTP na GDP tak se stabilizuje a stává se rovnějším - k této situaci dochází většinou
když se zabuduje tento alfa beta heterodimer do struktur mikrotubulu na tom tzv. +´konci
DYNAMIKA MIKROTUBULŮ II
Podle posledních modelů vypadá mirotubulus takto:
Na konci mikrotubulu, který označujeme jako + => dochází k přidávání nových heterodimerů. Jakmile se ten heterodimer
připojí do daného úseku na ten daný plus konec tak je aktivovaná GTPázová aktivita tubulinů a ta uzavře beta tubuliny v
mikrotubulu v tzv. GDP stavu
polymerizace
(+) konec
(-) konec
Pak záleží na tom jak rychle jsou tyto nové heterodimery přidávány -
vetšinou rychlost přidávání je taková aby pokrývala konec tzv. STABILIZUJÍCÍ ČEPIČKA (může mít až několik
stovek heterodimerů ve svém obsahu)
Upraveno dle Curr Opin Cell Biol. 2010;22(1):104–111.
K této čepičce se poté váží různé asociované proteiny, které pak ovlivňují rychlost přidávání nových heterodimerů, nebo
naopak jejich ztrátu
DYNAMIKA MIKROTUBULŮ III
Vše je uzpůsobeno tak aby rychlost valstního přidávání byla nějakým způsobem regulována z pohledu toho co buňka
potřebuje (jestli potřebuje aby mikrotubulus rostl nebo aby zůstal
stejný nebo aby se zkracoval) (+) konec
zbytkové GTP
proto tento konec může být
přepínán mezi stavy
růstovými, které jsou
stabilizované
(-) konec
= to vsše následně ovlivní "pomalost"
jakou budou mikrotubuly
KATASTROFA
přidávány depolymerace
nebo se přepnout do stadia
KATASTROFY, kdy dochází
k hydrolýze, uvolňování
heterodimerů a mikrotubulus
(+) konec se velmi rychůe zkacuje - což
zase může být korigováno
(-) konec velmi rychlou záchranou
Tento proces obsahuje spoustu faktorů
které ho ovlivňují: ZÁCHRANA depolymerace
Rychlost jakou je schopen systém dodávat nové heterodimery, jak rychle se dimery řetězí, jak rychle se hydrolyzuje GTP na
Upraveno dle Curr Opin Cell Biol. 2010;22(1):104–111.
GDP,jak se ktomu staví asocivané proteiny na plus konci = a dojde k polymeraci, polarizaci nebo depolymeraci
„TREADMILLING A DYNAMIKA“
Díky aktivnímu stavu ve kterém jsou na jedné straně
hetreodimery přidávány nebo také ne (to platí také o mínus
konci, ale ten je méně aktivní = hlavní růst nebo zkracování
mikrotubulů se děje na plus konci)
Dochází za určitých okolností k průtoku některých
heterodimerů, které začnou na jednom konci a dostanou se
na konec opačný a následně jsou ztráceny depolymerací =
TREADMILLING (= průtok)
Praktický význam: např u Alzheimrovy choroby, kdy plaky beta amyloidu, které se
často nachází post mortem v mozku, jsou jednoznačné v tom že se v nich nevyskytuje
TAU PROTEIN
• Buněčná a tkáňová
specificita
- Kineziny
- Dyneiny
S mikrotubuli spjaté motorové proteiny
- Myoziny
= je asociován podobným způsobem s
aktinovými vlákny
Každá z těchto rodin je buněčně a tkáňově specifická = různé buňky mají různé varianty motorů
KINEZINOVÁ SUPERRODINA I Stranově specifický transport je důležitý u buněk, které jsou
polarizované (neurony, epitelové buňky)
• 45 savčích genů KIF Každá eukaryontní buňka disponuje cca 100 různými motorovými
proteiny
• 15 rodin
• 3 typy Tyto proteiny jsou většinou kódovánny více než jedním genem (= superrodiny)
- N (amino terminus) – (+) konec C a N => jde o to jakým svým koncem
bílkovinného řetězce směřují ke kterému konci
- M (střed) toho daného mikrotubulu
- C (carboxy terminus) – (-) konec
Rozlišují se podle toho jakým způsobem se pohybují
=
N a C se mohou pohybovat oběma
směry ( jak k plus tak k minus
konci)
M kineziny =
ty fungují jako destabilizační
=> depolymerizují daný
mikrotubulus
http://www.microscopyu.com/moviegallery/sweptfield/folu-ypet-eb3-sfc/
KINEZINOVÁ SUPERRODINA II
• Přenášené „náklady“ • Monomery
- vezikuly - naplněné materiálem • Dimery
- organely (mito, lyso, endo) Kineziny pak existují v různých konfiguracích (viz výše)
Většina z nich je dimerický = mají dvě motorové
- individuální molekuly jednotky/domény, kterými poté pochodují po
mikrotubulu
http://www.microscopyu.com/moviegallery/sweptfield/folu-ypet-eb3-sfc/
KINEZINOVÁ
SUPERRODINA III
• Regulace
- fosforylace
- Rab GTPáza
- vápník
Musí být regulovány - nemohou se pohybovat samovolně - máme 3:
POHYBY V RÁMCIN
CHROMOZOMU A JEJICH
SEGREGACE
Mikrotubuly dnes
= významný regulační
prvek
PATOLOGICKÉ STAVY
SPOJENÉ S MIKROTUBULY I
• Ciliopatie = choroby, které jsou spojeny s nefungujícími mikrotubuly
• Nádorová onemocnění
• Vývojové vady
• Neplodnost - pokud se spermatické buňky kvůli nesprávné funkci mikrotubulů, tudíž i jejich
bičíku nepohybují tak daná jedinec je sterilní
• Infekční onemocnění
MIKROTUBULY INHIBUJÍCÍ
LÁTKY (MTAs)
• Inhibitory mikrotubulů
- vazba specificky či nespecificky
- mitotické vřeténko
- interfázické mikrotubuly
Mikrotubuly patří také mezi velmi časté cíle intervenční terapie a zvláště v onkologii =>
protože mají velmi významnou úlohu při buněčném dělení a nádorové buňky se často dělí
Inhibitory mikrotubulů = jsou látky které se na mikrotubuly s určitou specificitou vážou a likvidují je nebo je omezují =>
takže ovlivňují buněčné dělení pomocí interference s mitotickým vřeténkem a dokonce ovlivňují i interfazické
mikrotubuli
MIKROTUBULY INHIBUJÍCÍ
LÁTKY (MTAs) = jedy
M-destabilizující
= ten se v medicíně ale moc nevyužívá jelikož je v
- Kolchicin postatě toxický
- Vinca (vinkristin, vinblastin, vinflunin)
- Eribulin
- příklady josu minimum na naučení
M-stabilizující
- Taxany (Kabazitaxel, nab-paclitaxel)
- objeveny v 80. letech
- Taccanolidy
- Discodermolide
- Epothilony Image Amy Rothstein
1) Tvar a kinetika
2) Buňka-buňka, buňka-ECM
3) Cytokineze
4) Kontrakce
5) Mechanotransdukce
6) Pohyby
2= jak se správně složí nebo adheruje do extracelulární matrix
3 = aby se správně fyzicky rozdělila
4 = aby se dokázala správně kontrahovat => základ pohybu na
makroskopické úrovni
MIKROFILAMENTA I
NUKLEACE A ELONGACE
Nerostou z ničeho nic - rostou z nějakého místa = NUKLEAČNÍ - proto se tam musí nacházet faktory, které tuto nukleaci
umožní (= PROMOČNÍ FAKTORY PRO NUKLEACI)
1) Mikrofilamenta nenukleují z jednoho, max. ze dvou míst v buňce, ale Z MNOHA RŮZNÝCH MÍST (= ty se často nachází v
subkortikálním kortexu = subkortikální oblasti pod buněčnou membránou)
DYNAMIKA MIKROFILAMENT
2) Nereguluje se délka vlákna Vlákno aktinové není nahé =
prostřednictvím plus konce tak jako u není bez dalších proteinů,
mikrotubulů, ale prostřednictvým protože by bylo nestálé
ASOCIOVANÝCH PROTEINŮ
=> na růstu a změně konformace
pak závisí přítomnost různého typu
3) Rozdíl v regulaci růstu s mikrofilamenty asociovaných
vlákna = všechno závisí na proteinů
koncentraci volného aktinu
(pokud je koncentrace G-aktinu
vysoká tak vlákno roste na obou dvou
koncích, pokud je nízká pak vlákno skoro neroste, pokud je průměrná tak vlákno
roste víc na +´ konci
než na -´konci kde
je hydrolýza
rychlejší)
(/mikrotubulus je pořád
ukotven - koncem v jednom místě a roste
halvně na jednom konci)
Dynamika mikrofilament připomíná silně dynamiku mikrotubulů
aspoň v tom smyslu že rostou na jednom konci, na kterým jsou tyto monomery
přidávány a mohou růst i na konci druhém, ale ten růst na plus konci je intenzivnější
(proto plus konec)
Jakou formu pak na konci
PROTEINY ASOCIOVANÉ
to aktinové vlákno bude mít
záleží na velkém množství
S MIKROFILAMENTY = není to funkce
aktinového vlákna ale
různých asociovaných proteinů (viz níže) - zamezují růstu tím že konec obalí a stabilizují atd atd. proteinů co jsou s nimi
asociovány
CapZ
spektrin
gelsolin
MOTOROVÉ PROTEINY
ASOCIOVANÉ S MIKROFILAMENTY
Slouží také jako prostředek k transportu, který je spojen s motorovou superrodinou
myozinů ( jsou složeny podobně jako kyneziny a dyneiny z katalytické hlavy, která se
váže na daný aktin a má část, která působí jako konvertor = část na kterou se pak
může daný náklad vázat )
• Myozinová superrodina
(35)
• Učlověka 39 genů
• Monomery a dimery
Myoziny se označují římskými číslicemi podle toho do jaké kategorie spadají
= nesvalové: myozin II(úloha při cytokynezi), myozin I, VI a VII (při funkci vnitřního ucha) atd.
• Přenášení nákladů
• Kontrakce
Různé typy myozinů se uplatňují na celé řadě různých procesů - téměř všech aktivit a hlavně těch mechano-pohybových
aktivit buňky
FYZIOLOGICKÁ RELEVANCE
Byvíme se o NESVALOVÉM MYOZINU
Je to o tom jestli daný mozin funguje jak má - pokud ne tak se pak jedná o různé genetické vady, mutace v genu, které jsou
dědičné a které pak vyústí v různé fenotypy genu (izolované = typy hluchoty / nebo pak i sysntémové = syndromy)
Je potřeba vnímat v jakém rozsahu buňky a naše tělo konkrétně myozinové buňky využívá
Mikrofilamenta se projevují na fyziologické nebo patologické úrovni a do praxe
https://www.mechanobio.info/pathogenesis/what-are-actin-comet-tails/
Stamm et al. 2003
MIKROFILAMENTA INHIBUJÍCÍ
LÁTKY (TOXINY)
Známe látky/ toxiny, které se specificky váží a interagují s aktinovou složkou cytoskeletu a mohou ji inhibovat
=> v tomto případě se nepoužívá žádný jako léčivo protože jsou příliš toxické (ne jako u mikrotubulů)
• Tkáně
- i jejich nadbuněčná/ tkáňová úloha je velmi
známa
Mají i svoji jinou
funkci
v rámci laminu
= laminy jsou
příklady intermediálních
filament, které se účastní nejen na regulaci genové exprese
ale i na tom, že oni
jsou ti, kteří zahajují rozpad
buněčného jádra a pak
i jeho skládáni v daných
momentech buněčného
dělení
=> to se děje jejich tzv.
fosforylací
PATOLOGICKÉ STAVY SPOJENÉ
S INTERMEDIÁRNÍMI FILAMENTY
Pokud filamenta nefungují konkrétně tak jak by měli =
• Epidermolysis bulosa vznikají patologie:
simplex
• Svalové dystrofie a
myopatie Pokud u jedince nefungují cytokeratiny určitého typu,
následuje zvýšená fragilita kůže, vytváření puchýřovitých
lézí a rozpad kůže
= epidermolysis bulosa symplex
• Alexandrova choroba
(GFAP) =devastujícími
není chorobou kůže ale je to fatální onemocněné CNS, které je spojeno s naprosto
poruchami vývoje mozku a lebky ( poškožení GFAP = gliálního
fibrilárníhoaciodpyrického proteinu)
SHRNUTÍ
• Cytoskelet je dynamický komponent
buněk s mnoha funkcemi = není statický
• Individuální komponenty cytoskeletu
jsou funkčně a regulačně propojené
= není tvořen jen jednou
komponentou
• Cytoskelet a jeho dysfukce jsou
významnou příčinou mnoha
samostatných patologií či jako součást
širšího paofyziologického rámce daného
onemocnění