‫أساسيات الوراثة‬

‫المحاضرة رقم (‪)4‬‬

 ‫نظم إصالح المادة الوراثية‬
‫‪DNA repair system‬‬
‫تعتبر كل من اإلشعاع والمواد الكيمائية المسببة للطفرات‬ ‫•‬
‫والحرارة واألخطاء اإلنزيمية من األشياء التي تضر بالمادة‬
‫الوراثية ‪.‬‬
‫فعلى سبيل المثال يوجد عديد من آالف القواعد التي تفقد‬ ‫•‬
‫من المادة الوراثية تلقائيا في كل يوم من خاليا الثدييات‪.‬‬
‫وقد وجد أن بعض أنواع من الضرر الذي يصيب المادة‬ ‫•‬
‫الوراثية قد يكون أثناء التضاعف أو أثناء عملية النسخ‪.‬‬
‫تمتلك الخاليا الطرق العديدة لكي تقلل من هذه األضرار‪.‬‬ ‫•‬
 -:‫• وعموما تقع نظم اإلصالح في ثالث أقسام رئيسية‬

• 1- Damage reversal
• 2- Excision repair
• 3- Post replicative repair
 ‫‪ -‬اإلصالح باستخدام الضرر العكسي‪-:‬‬ ‫•‬
‫أ‪ -‬وجد أن األشعة فوق البنفسجية )‪ Ultraviolet light (UV‬تسبب ارتباط ما‬ ‫•‬
‫بين القواعد البيريميدية في المادة الوراثية‪.‬‬
‫ب‪ -‬وعموما يتم االرتباط ما بين السيتوسين والسيتوسين ‪C-C‬اوما بين‬ ‫•‬
‫السيتوسين والثيامين ‪.C-T‬‬
‫ج‪ -‬ولكن وجد أن أساس تأثير هذا اإلشعاع يكون االرتباط ما بين الثيامين‬ ‫•‬
‫والثيامين ‪.T-T‬‬
‫وقد وجد في خاليا‪ E . coli‬وجود إنزيم ‪ DNA photolyase‬وهو ناتج جين‬ ‫•‬
‫‪ )photoreactivation) phr gene‬أي انه يتضح من هذه الكلمة أنه يتم‬
‫إعادة اإلصالح في وجود الضوء حيث يتحد هذا اإلنزيم في الظالم مع قواعد‬
‫الثيامين المتصلة معا ‪ T-T‬وعند تسليط الضوء على هذه الخاليا فيقوم هذا‬
‫اإلنزيم بكسر الرابطة ما بين الثيامين والثيامين باستخدام الطاقة الضوئية ثم‬
‫يتحرر هذا اإلنزيم من المادة الوراثية بعد أداء مهامه ولكن يغيب هذا النوع من‬
‫اإلصالح في اإلنسان ويتواجد في البكتيريا ‪ ,‬الكائنات الراقية البسيطة ‪.‬‬
 ‫• ‪ -‬اإلصالح باستخدام إنزيمات القطع ‪Excision repair‬‬
‫• يشير هذا النوع من اإلصالح إلى تحريك الجزء الخاطئ من المادة‬
‫الوراثية وتستطيع اإلنزيمات أن تحس بوجود تحطيم في الحلزون‬
‫المزدوج المتسبب عن ضرر من مصدر أو آخر‪.‬‬
‫• ‪ -1‬إذا ما حدث تعريض المادة الوراثية لألشعة فوق‬
‫البنفسجية‪ Ultra violet UV Damage Repair‬مع غياب نظام‬
‫اإلصالح السابق ذكره فنجد انه تتكون في السيتوبالزم ‪ T-T‬بعد‬
‫حوالي نصف ساعة‪.‬‬
‫• أثناء ذلك تقوم هذه اإلنزيمات بعمل فجوة ‪ gap‬أو مسافة ما بين‬
‫خيطي المادة الوراثية وتستطيع هذه اإلنزيمات أن تحدد ‪ T-T‬على‬
‫خيطي المادة الوراثية ‪.‬‬
 ‫• وتتكون هذه اإلنزيمات من تحت وحدات تشفر‪ P‬بواسطة‬
‫جينات ‪ uvrA, uvrB, uvrC‬والتي تسمى ‪ABC‬‬
‫(‪)excision nuclease‬‬ ‫‪ excinuclease‬نسبة إلى‬
‫وهذه اإلنزيمات تقطع الخيط الذي به ضرر عند الرابطة‬
‫الثامنة من روابط ‪ phospho-diester bond‬عند الطرف‬
‫‘‪ 5‬وعند الر‪P‬ابطة الخامسة من ر‪P‬وابط ‪phospho-‬‬
‫‪ diester bond‬عند الطر‪P‬ف ‘‪3‬‬
‫• ويأتي إنزيم يسمى ‪ DNA helicase-II‬وهو ناتج جين‬
‫‪ uvrD‬بتحر‪P‬يك ‪ 13‬ز‪P‬وج من القواعد والتي تشتمل على‬
‫الضرر‪.‬‬
 ‫وبعد ذلك يقوم إنزيم البلمرة ‪ DNA polymerase-I‬بتكامل‬ ‫•‬
‫القواعد الموجودة على الخيط الثاني (الطبيعي) ثم يقوم إنزيم‬
‫‪ DNA ligase‬وهو يقوم بارتباط هذه القواعد المكونة‬
‫حديثا مع القواعد القديمة العادة شكل الشريط مرة أخرى ‪.‬‬
‫ويوجد هذا النوع من اإلصالح في كل الكائنات بدأ من‬ ‫•‬
‫الفيروسات حتى الوصول للكائنات الراقية‪.‬‬
‫فاألشخاص الذين يتكون لديهم بقع عند التعريض لألشعة‬ ‫•‬
‫فوق البنفسجية الناتجة من الشمس يكون لديهم معدل عالي‬
‫على اإلصابة بسرطان الجلد ‪Xeroderma pigment sun‬‬
‫ويسمي هذا النوع من اإلصالح بال‬ ‫•‬
‫)‪Nucleotide Excision Repair (NER‬‬ ‫•‬
 ‫• أو قد يحدث اإلصالح بنفس هذا النظام عند تواجد قواعد‬
‫مخالفة للمادة الوراثية ‪ AP-Repair‬مثل تواجد القاعدة‬
‫يوراسيل في المادة الوراثية‪.‬‬
‫• وأيضا مثل الطر‪P‬يقة السابقة فان اإلنزيمات تحس بالضرر‬
‫في المادة الوراثية وتقوم بتحريك القاعدة الخطأ وتسمى‬
‫‪AP-endonuclease‬‬
‫• والتي تتحرك فعلى سبيل المثال ‪Uracil-DNA‬‬
‫‪ glycosylase‬وهو ناتج جين ‪ ung‬يتعرف على‬
‫القاعدة(‪ )U‬داخل ويخرجها‬
 ‫• ثم تقوم إنزيمات‪-AP endonuclease‬‬
‫والتي تقسم إلى قسمين‪:-‬‬
‫القسم األول(‪ AP-endonuclease )class I‬للجهة’ ‪3‬‬
‫والقسم الثاني )‪ AP-endonuclease (class II‬للجهة’‪ 5‬وتحرك‬
‫إنزيمات‪ exonuclease‬منطقة صغيرة من ال‪( DNA‬من ‪4-2‬‬
‫قواعد)‬
‫ثم تقوم إنزيمات البلمرة ‪ DNA polymerase‬بمأل الفجوة بناء على‬
‫الشريط الثاني ثم يتبعه إنزيم‪ DNA ligase‬الذي يربط الشريط مرة‬
‫ثانية‪.‬‬
‫ويسمي هذا النوع من اإلصالح بال )‪Base Excision Repair(BER‬‬
 ‫• إصالح االرتباط الخاطئ ‪-: Mismatch Repair‬‬
‫• هذا النوع من اإلصالح قادر على إصالح حوالي ‪ %99‬من ال‬
‫‪ DNA‬ح‪P‬يثن‪PP‬جد ا‪P‬نه‪:- P‬‬
‫عند تضاعف ال‪ DNA‬فتحدث بعض األخطاء من إنزيمات البلمرة فعلى‬
‫سبيل المثال نجد أن القاعدة(‪ )G‬تتحد مع القاعدة‪ ) )T‬بدال من‬
‫القاعدة(‪ ) C‬في الخيط الجديد المتكون ‪( Progeny‬النسل) ‪.‬‬
‫ونجد أن القواعد ال تتالءم مع بعضها ومن هنا يأتي دور هذا النوع من‬
‫اإلصالح ويتحكم في هذا النوع من اإلصالح‬
‫جينات‪ mutH ,mutL ,mutS ,mutU‬والتي تكون قادرة على‬
‫تحريك القاعدة الخطا بعملية القطع وقد تسمى الجينات ‪mutator‬‬
 ‫خطوات اإلصالح‪-:‬‬
‫‪-1‬تقوم إنزيمات المسئولة عن االرتباط الخاطئ بتحريك‬
‫القاعدة الخطأ عن طر‪P‬يق عمل فجوة‪ nick‬في شريطي‬
‫ال‪DNA‬‬
‫‪ -2‬ويجب أن نسأل سؤال وهو هل تقوم إنزيمات االرتباط‬
‫الخاطئ بالتعرف على الشريط الناتج (النسل) أم تتعرف على‬
‫الشريط القالب؟‬
‫ولإلجابة على هذا السؤال نجد أنه في خاليا ال ‪E. coli‬‬
‫الشريط القالب يحتوى على مجموعة ميثيل ويسمى بحالة‬
‫‪ DNA methylase‬بينما الشريط الناتج لم يتكون به بعد‬
‫مجموعة الميثيل والخطأ الذي حدث في شريط‬
‫النسل‪. progeny strand‬‬
‫تقوم إنزيمات االرتباط الخاطئ بتتبع شكل الشوكة ‪ fork shape‬في‬ ‫•‬
‫ال ‪ DNA‬والتي تدل على تضاعفه ‪ replication fork‬وتصل‬
‫هذه اإلنزيمات إلى المكان الذي حدث به خطأ قبل حدوث عملية‬
‫ال‪. methylation‬‬
‫ويتضح أن الفجوة تبدأ عند تتابع‪ ’GATC-3-’5‬بواسطة البروتينات‬ ‫•‬
‫الناتجة من جينات ‪ mutL,mutH‬أما االرتباط الخاطئ مسئول عن‬
‫االرتباط به بروتين ناتج من جين ال‪. mutS‬‬
‫ثم تقوم إنزيمات ال‪ DNA helicase II‬ونواتج جين ‪mutU‬‬ ‫•‬
‫بإخراج الشظية ‪ fragment‬وتحريرها من شريط النسل‬
‫‪. progeny strand‬‬
‫ثم تقوم إنزيمات البلمرة من نوع ‪ DNA polymerase I‬بتكامل‬ ‫•‬
‫القواعد الصحيحة‪.‬‬
‫ثم تقوم إنزيمات ‪ DNA ligase‬بربط الشريط مرة أخرى‪.‬‬ ‫•‬
 ‫• ‪ -‬إصالح التضاعفات المتقدمة ‪SOS response‬‬
‫‪Post replicative repair‬‬
‫• عندما يشعر إنزيم البلمرة ‪ DNA polymerase III‬من‬
‫نوع بحدوث ضرر ‪ damage‬في شريط ال‪ DNA‬في‬
‫خاليا ال ‪ E. coli‬مثل وجود‪thymine dimer‬‬
‫• فال يستطيع توقف عملية تخليق ال‪ DNA‬ولكن يترك‬
‫مسافة تقدر‪ P‬ب‪ 800‬قاعدة أو اكثر‬
‫• وإذا تركت هذه المسافة فانه يحدث إما كسر في ال‪DNA‬‬
‫أو نقص في المعلومات الور‪P‬اثية التي تحويها هذه‬
‫المنطقة ولتصليح ذلك نجد ما يلي‪-:‬‬
‫• تقوم مجموعة من اإلنزيمات متخصصة وتسمى ‪RecA‬‬
‫‪ locus‬باحتواء هذه المنطقة والتي بها الضرر و التي بها‬
‫أيضا منطقة فارغة وتسمى هذه اإلنزيمات‬
‫أحيانا‪. recombinational‬‬
 ‫• أيضا نجد أن هذه اإلنز‪P‬يمات تقوم بتحفيز نوع أخر‪ P‬من‬
‫المحفز‪P‬ات تسمى‪ LexA‬والتي تساعدها في القيام‬
‫بوظيفتها‪.‬وتكون وظيفة ال ‪ LexA‬قبل وبعد اإلصالح تثبيط‬
‫‪ 17‬جين من جينات اإلصالح‪.‬‬
‫• كذلك تقوم بروتينات ‪ RecA‬بتحريك الخيط المفرد من‬
‫ال‪ DNA‬والذي به الضرر‪ P‬حتى الوصول إلى الشريط‬
‫األبوي الثاني واخذ الجزء الذي يحدث تكامل لمال الفجوة‬
‫فقط دون تصليح منطقة‪. T-T‬‬
‫• تقوم اإلنز‪P‬يمات الداخلية من نوع‪ Endonucleases‬بإزالة‬
‫هذه المنطقة المحتوية على‪ gap‬وجعلها حرة‪.‬‬
 ‫• تقوم إنز‪P‬يمات البلمرة من نوع ‪DNA polymerase I‬‬
‫بتكامل القواعد الموجودة على الشريط الثاني(السفلي)‬
‫والذي اخذ منه منطقة لتكامل الشريط العلوي ‪.‬‬
‫• تقوم إنزيمات الربط ‪ DNA ligase‬بربط القواعد الموجودة‬
‫في الشريط العلوي وكذلك ربط القواعد الموجودة في‬
‫الشريط السفلي‪.‬‬
‫• والى اآلن لم يتم إصالح ال‪ T-T‬والتي يتم إصالحها إما‬
‫بطريقة ال‪ Photo reactivation‬أو ال‪Excision‬‬
‫‪ repair‬لتحريك ‪. T-T‬‬