TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG THƯƠNG TP.

HỒ CHÍ MINH

TÌM HIỂU VÀ PHÂN TÍCH CƠ SỞ

DỮ LIỆU PROTEIN
GVHD: Trần Hoàng Ngâu

Lâm Khánh Dương- 2008210090

 NỘI DUNG

Giới thiệu Cơ sỡ dữ liệu là gì ?

Các loại cơ sở dữ
Cách sử dụng
liệu Protein
 GIỚI THIỆU
• PROTEIN CẤU TẠO TỪ CÁC AXIT
AMIN LIÊN KẾT VỚI NHAU VÀ TẠO
THÀNH CHUỖI DÀI, CÓ ĐẾN 20
LOẠI AXIT AMIN KHÁC NHAU GIÚP
XÁC ĐỊNH VAI TRÒ CỦA TỪNG
LOẠI PROTEIN.ÍT NHẤT CÓ 10.000
LOẠI PROTEIN KHÁC NHAU
TRONG CƠ THỂ.
 CƠ SỠ DỮ LIỆU LÀ GÌ ?
• NƠI MÀ CÁC THÔNG TIN, TÀI LIỆU, NGHIÊN CỨU VỀ PROTEIN ĐƯỢC ĐĂNG TẢI LÊN CHO
CÁC CÁ NHÂN NHƯ NHÀ KHOA HỌC, NGHIÊN CỨU SINH VÀ SINH VIÊN THỰC TẬP. LÀ MỘT
NƠI THƯ VIỆN SỐ CUNG CẤP RẤT NHIỀU LOẠI THÔNG TIN NHƯ CẤU TRÚC, TRÌNH TỰ
PROTEIN, CHỨC NĂNG VÀ SỐ LIỆU.
CÁC LOẠI CƠ SỞ DỮ LIỆU PROTEIN
Cơ sở dữ liệu trình tự

Cơ sở dữ liệu cấu trúc

Cơ sở dữ liệu tương tác

Cơ sở dữ liệu chú thích chức năng

Cơ sở dữ liệu liên quan đến bệnh tật

Cơ sở dữ liệu biểu thức

MỘT SỐ VÍ DỤ VỀ CƠ SỞ DỮ LIỆU PROTEIN
Ngân hàng gen (NCBI)
UNIPROT
NGÂN HÀNG DỮ LIỆU PROTEIN (PDB) CƠ SỞ DỮ LIỆU PROTEIN TƯƠNG TÁC (DIP)

InterPro
Kho lưu trữ sinh học (BioGRID)
LÀM THẾ NÀO ĐỂ SỬ DỤNG CƠ SỞ DỮ
LIỆU PROTEIN?
Phải xác định được mục đích nghiên
cứu

Lựa chọn nguồn cơ sở dữ liệu phù hợp

với bản than

Lựa chọn từ khóa phù hợp

CẢM ƠN CÔ VÀ CÁC BẠN ĐÃ LẮNG NGHE