Professional Documents
Culture Documents
เรียบเรียงโดย
นางสาวธิลาวรรณ อาจนนลา นิสิตชั้นปที่ 3
ภาควิชาชีววิทยา สาขาจุลชีววิทยา คณะวิทยาศาสตร มหาวิทยาลัยมหาสารคาม
บทนํา
Extremophile
คือ จุลินทรียที่เจริญในสภาวะที่รุนแรง มีทั้งเอ็กตรีมทางกายภาพ ไดแก อุณหภูมิ ความดันหรือ
รังสี และเอ็กทรีมทางภูมิศาสตร- เคมี ไดแก ความแหงแลง ความเค็มและความเปนกรด – ดางอีกดวย สวน
ใหญแลว Extremophiles อยูใน domain Archaea
แหลงที่พบสิ่งมีชีวิตกลุม Extremophiles
Extremophiles สามารถพบไดในบริเวณตางๆ ดังนี้
1. ทะเลสาบน้ําเค็ม (hypersaline lake) ซึ่งมีความเค็มของเกลือสูงในระดับ 2-5M พบจุลินทรียกลุม
Extreme halophile
2. ทะเลลึก (Deep sea) เปนบริเวณที่มีความดันสูง จึงพบ Barophile
3. น้ําพุรอน (Hotspring) และปากปลองภูเขาไฟ (Geysers) ซึ่งในบริเวณนี้จะพบ extremophile กลุม
Hyperthermophile
3
A B C
D E F
Environmental extremes
Extremophiles ในสิ่งแวดลอมสามารถแบงได ดังนี้
1. อุณหภูมิ
2. ความดัน
3. ความเค็ม
4. ความแหงแลง
5. รังสี
6. pH
ความดัน (Pressure)
Barophile และ Piezophile สิ่งมีชีวิตในกลุมนี้จะอาศัยอยูในที่มีความดันสูง อาศัยอยูใตทะเล
หรือมหาสมุทรลึก ตัวอยางเชนแบคทีเรีย Shewanella sp. (Chiaki Kato และคณะ, 1998)
4. ความแหงแลง (Desiccation)
Xerophile
คือ สิ่งมีชีวิตที่สามารถเจริญไดในทีที่มีความแหงแลง เชน ในทะเลทราย
5. รังสี (Radiation )
สิ่งมีชีวิตในกลุมนี้เปนพวกที่สามารถทนตอระดับรังสีไดสูง สวนมากเปนรังสีอัลตราไวโอเลต
แตสิ่งมีชีวิตกลุมนี้สามารถตานรังสีปรมาณูไดดวย ตัวอยางเชน Micrococcus radiodurans, Deinococcus
radiodurans. โดยD. radiodurans เปนแบคทีเรียแกรมลบ และเปนสปชีสที่เปนรูจักมากที่สุด เพราะสามารถ
ทนตอสภาพรังสีที่สูงได D. radiodurans ถูกคนพบในป ค.ศ. 1956 โดย Arthur W. Anderson จาก Oregon
Agricultural Experiment Station เมือง Corvallis มลรัฐออริกอน ประเทศสหรัฐอเมริกา เขาทําการทดลอง
เกี่ยวกับเเนื้อสัตวฉายรังสี และพบวาหลังจากฉายรังสีในปริมาณสูงถึง 10,000 เกรยซึ่งสามารถฆาเซลลสิ่งมี
สิ่งมีชีวิตทุกชนิดที่เขารูจัก เนื้อสัตวที่ไดรับรังสีก็ยังเกิดการเนาเสีย เขาจึงแยกและเพาะเลี้ยงแบคทีเรียที่
กอใหเกิดการเนาเสียนั้น แบคทีเรียนี้ไดรับการขนานนามในภายหลังวา Deinococcus radiodurans แปลตาม
ศัพทวา “ผลไมประหลาดที่ทนรังสี” ( กนกพร ,สถาบันเทคโนโลยีนิวเคลียรแหงชาติ )
6. pH
Alkaliphile
คือ สิ่งมีชีวิตที่เจริญในที่ที่มีความเปนดางสูง เจริญไดที่ pH 9 หรือ pHมากกวา 9 ตัวอยาง
Natronobacterium, Spirulina spp.
Acidophile
คือ สิ่งมีชีวิตที่เจริญดีดีในที่ที่มีความเปนกรดสูง pH ต่ําๆ ตัวอยางเชนไซยาโนแบคทีเรียชนิด
Cyanidium caldarium, แบคทีเรียชนิด Ferroplasma sp. และสาหราย Dunaliella acidophila
6
ประโยชนของ Extremophiles
Biotechnology
Hyperthermophile
ในกลุมของ Hyperthermophile จะนํา Thermus aquaticus มาใชประโยชนในการตรวจเอกลักษณ
ของสิ่งมีชีวิต โดยเราใช Taq polymerase ที่ไดจากการสกัดเอนไซมจาก T. aquaticus ที่สามารถทํางานไดที่
อุณหภูมิสูงมาใชแทนเอนไซม DNA polymerase ที่สกัดไดจากแบคทีเรียทั่ว ๆ ไป ซึ่งไมทนตอความรอนใน
เทคนิค Polymerase chain reaction (PCR) ซึ่งเทคนิคดังกลาวจะตองใชความรอนสูงกวา 90°C ในการแยก
สายของดีเอ็นเอ ดังนั้น การใชเอนไซม DNA polymerase ที่สกัดไดจาก T. aquaticus ทําใหเราสามารถเพิ่ม
จํานวนดีเอ็นเอไดเปนระบบอยางตอเนื่องโดยไมตองมีการเติมเอนไซม DNA polymerase เขาไปใน
ปฎิกิริยาบอย ๆ (MICHAEL A. INNIS และคณะ, 1988)
Pyrococcus furiosus
Pfu DNA polymerase เปนเอนไซมที่แยกไดจาก Pyrococcus furiosus ซึ่งเจริญไดดีที่อุณหภูมิ 100 °C
สําหรับตัวเอนไซมมีคุณสมบัติทนความรอนสูงมาก โดยหลังจากนําเอนไซมไปไวที่ 95°C เปนเวลา1 ชั่วโมง
activity มากกวา 95% ยังคงอยู เอนไซมไมมีกิจกรรมของ 5′-3′ exonuclease แตจะมี 3′-5′ exonuclease ดวย
เหตุนี้จึงทําให เอนไซมมี fidelity ที่สูงเหมาะสําหรับงาน PCR ที่ตองการความถูกตองของลําดับเบสใน
amplified product สูง เชน การทํา genomic cloning, การศึกษาการกลายพันธุ (Karl Otto Stetter, 1994)
8
Dunaliella salina
Alkalizymes
การประยุกตใช extremophile ในกลุม Alkaliphile มีการนําเอนไซมที่ผลิตโดยแบคทีเรียกลุมนี้
มาใชในดาน biotechnology ซึ่งไดแก เอนไซม pullulanases, lipases, xylanases, Proteases และ cellulases
(Bertus van den Burg, 2003)
Alkaline Protease
แบคทีเรียที่พบวาผลิต Alkaline Protease สวนใหญเปนแบคทีเรียในจีนัส Bacillusไดแก Bacillus pumilus
Bacillus halodurans, Bacillus alcalophilus และ Bacillus clausii
ประโยชนของ Alkaline Proteases
เอนไซม alkaline protease ที่ผลิตขึ้นเพื่อใชในผงซักฟอกมีหลายชนิด สามารถยอยสลาย
peptide bond ในโปรตีนไดดี ทั้งยังยอย ester bond ของไขมันไดอีกดวย ทนทานตอระดับ pH ตาง ๆ ไดดี
และทํางานไดดีโดยไมตองการ ions เปน cofactor ซึ่งนับวาเปนขอดี ก็เพราะวาในผงซักฟอก หรือน้ํายาทํา
ความสะอาดทั้งหลาย มักมี ion chelating agent เพื่อปรับใหน้ําออนลง อุตสาหกรรมหนังมีการใช alkaline
protease เพื่อยอยสลายขนสัตวและยอยหนังสัตวเพื่อใหหนังสัตวออนตัวสามารถพับ และเย็บได (Aehle W
และคณะ, 1993)
9
Alkaline Lipase
แบคทีเรียที่ผลิตเอนไซม Alkaline Lipase พบวามีหลายจีนัสสามารถผลิตเอนไซมนี้ได โดยพบ
กระจายอยูในจีนัส Thermococcus, Natrobacterium, Bacillus, Methylobacter
ประโยชนของ Alkaline Lipase
Alkaline Lipase ใชเปนสวนผสมในน้ํายาซักผา น้ํายาลางจาน เพื่อชวยในการยอยสลายคราบไขมัน
Alkaline Xylanase
มีจุลินทรียที่มีความสามารถในการผลิตทั้งในกลุมของรา ยีสต และแบคทีเรีย ในกรณีแบคทีเรียมัก
พบวาเปนแบคทีเรียในจีนัส Bacillus ไดแก Bacillus pumilus, Aspergillus nidulans KK-99 ,Bacillus firmus
และ Bacillus funiculus
ประโยชนของ Alkaline Xylanase
ใชในอุตสาหกรรมการทํากระดาษ ใชในการฟอกสีเยื่อกระดาษ ฟอกสีเสนใยลินินและทําให
เสนใยนุมขึ้น เติมในน้ําผลไมทําใหน้ําผลไมใส (Beg QK และคณะ, 2001)
Alkaline Pullulanase
สวนใหญพบแบคทีเรียในจีนัส Bacillusที่ผลิตเอนไชม Pullulanase ไดแก Bacillus halodurans
Clostridium thermohydrosulfuricum, Bacillus alcalophilus และ Bacillus sp.
ประโยชนของ Alkaline Pullulanase
ใชผสมในน้ํายาลางจานเพื่อชวยยอยคารโบฮัยเดรตที่ตกคาง
ประโยชนดาน Environment
(A) (B)
ภาพที่ 4 ลักษณะทางสัณฐานวิทยาของ Deinococcus radiodurans
(A) D. radiodurans บนอาหารเลี้ยงเชื้อ และ (B) กลุมเซลลขอ D. radiodurans
ที่มา : http://en.wikipedia.org/wiki/Deinococcus_radiodurans
Deinococcus radiodurans
Deinococcaceae ประกอบดวยแบคทีเรียสองสกุล คือ Deinococcus และ Deinobacter ทั้งสองสกุล
ตางกันตรงที่ Deinococcus เปนแบคทีเรียแกรมบวก แต Deinobacter เปนแบคทีเรียแกรมลบ Deinococcus
radiodurans เปนสปชีสที่เปนรูจักมากที่สุด
Deinococcus radiodurans ถูกคนพบในป ค.ศ. 1956 โดย Arthur W. Anderson จากเมือง Corvallis
มลรัฐออริกอน ประเทศสหรัฐอเมริกา เขาทําการทดลองเกี่ยวกับเนื้อสัตวฉายรังสี และพบวาหลังจากฉาย
รังสีในปริมาณสูงถึง 10,000 เกรย ซึ่งสามารถฆาเชลลสิ่งมีชีวิตทุกชนิดที่เขารูจัก เนื้อสัตวที่ไดรับรังสีก็ยัง
เกิดการเนาเสีย เขาจึงแยกและเพาะเลี้ยงแบคทีเรียที่กอใหเกิดการเนาเสียนั้น แบคทีเรียนี้ไดรับการขนาน
นามในภายหลังวา Deinococcus radiodurans แปลตามศัพทวา ผลไมประหลาดซึ่งทนตอรังสี
ปจจัยสําคัญที่ทําใหเชลลโดยทั่วไปออนแอตอรังสีคือ อันตรายจากรังสีมีตอดีเอ็นเอซึ่งเปนสาร
พันธุกรรม และโปรตีนซึ่งเปนโครงสรางและเปนเครื่องจักรอันสําคัญของเชลล D. radiodurans มีกลไก
11
สรุป
Extremophile เปนสิ่งมีชีวิตที่สามารถเจริญไดในสภาวะที่รุนแรงหรือสภาวะแวดลอมที่ผิดปกติ
สิ่งมีชีวิตกลุมนี้สามารถเจริญไดในบริเวณตางๆ ไดแก น้ําผุรอน ปากปลองภูเขาไฟ ใตทะเลลึกหรือใต
มหาสมุทรที่มีความดันของน้ําสูงๆ บริเวณขั้วโลกเหนือและขั้วโลกใตที่มีอากาศหนาวเย็น บริเวณที่มีความ
แหงแลง เชน ทะเลทราย บริเวณที่มีรังสีสูง รวมถึงในบริเวณที่มีสภาพความเปนกรด – ดางสูงในปจจุบันได
มีการศึกษาและใชประโยชนจากสิ่งมีชีวิตในกลุมExtremophileอยางกวางขวางทั้งในดานเทคโนโลยีชีวภาพ
และดานอุตสาหกรรม ไดแก การใชประโยชนในกระบวนการ polymerase chain reaction เพื่อตรวจหา
เอกลักษณของสิ่งมีชีวิ การใชประโยชนของเอนไซมในอุตสาหกรรมประเภทตางๆนั้น สวนใหญจะเปนการ
ใชเอนไซม ไดแก เอนไซม proteases, lipases, xylanases, cellulases และpullulanases อุตสาหกรรมการ
ผลิตสารทําความสะอาด เชน ผงซักฟอก น้ํายาลางจาน เพื่อชวยยอยสลายคราบไขมันและคารโปรไฮเดรตที่
ตกคาง อุตสาหกรรมการทํากระดาษ ผาและหนัง เชนใชในการฟอกสีเยื่อกระดาษ ฟอกสีเสนใยลินินและทํา
ใหเสนใยนุมขึ้น และอุตสาหกรรมน้ําผลไม เชน ชวยยอยสลายเสนใยหรือเยื่อของผลไมทําใหสามารถคั้นน้ํา
ผลไมไดปริมาณมากขึ้นและยังชวยลดความขนของน้ําผลไมเนื่องมาจากเสนใยที่ปนอยูในน้ําผลไมดวย ทํา
ใหน้ําผลไมใสและมีความหนืดลดลง เปนตน
16
บรรณานุกรม
Aehle, W., A.Amory , D.Schomburg , H.Sobek , D.Wilke and R.Vetter . 1993. Rational protein
engineering and industrial application:structure prediction by homology and rational design of
protein-variants with improved “washing performance” – the alkalineprotease from Bacillus
alcalophilus. J. Biotechnol . 28 :31–40.
Baumeister, W., M. Barth, R.Guckenberger, R.Hegerl, M.Hahn and W.O. Saxton. 1987. Three-
dimensional Structure of the Regular Surface Layer (HPI Layer) of Deinococcus radiodurans. J.
Mol. Biol. 187 : 241-250.
Van den Burg B.2003. Extremophiles as a source for novel enzymes. Current Opinion in Microbiology.
6 :213–218.
Chiaki, K., H. Horikoshi, j.Tamaoka, L.Li, Y. Nakamura, and Y. Nogi. 1998. Extremely Barophilic
Bacteria Isolated From the Mariana Trench , Challenger Deep, at a Depth of 11,00 Meters.
Appl.Environ.Microbiol. 64 : 1510-1513.
17
Fiala, G., K.O. Stetter. 1986. “Pyrococcus furiosus sp. Nov. represents a novel genus of marine
heterotrophic archaebacteria growing optimally at 100 °C” Archive of Microbiology. 145 : 56-61.
Dol: 10.1007/BF00413027 (http://dx.dol.org/10.10007/BF00413027)
Haruyuki ,A., 2005. Recent progress towards the application of hyperthermophiles and their enzymes.
Current Opinion in Chemical Biology. 9:166–173.
Hassan, B., C.M. Sara, J.D. Michael, K.F. James, P.W. Lawrence, W.M. Kenneth and Z. Min. 2000.
Engineering Deinococcus radiodurans for metal remediation in radioactive mixed waste
Environments. Nature biotechnology. 18 : 85-90.
Ito, S. 1997. Alkaline cellulases from alkaliphilic Bacillus : Enzymatic properties, genetics, and
Application to detergents. Springer-Verlag. 1 : 61-66.
Korikoshi, K. 1999. Alkaliphiles: Some Applications of Their Products for Biotechnology. Microbiology
and molecular biology reviews. p. 735–750.
Lynn J. Rothschild and Rocco L. Mancinelli. 2001. Life in extreme environments. NASA Ames Research
Center, Moffett Field, California 94035-1000, USA
Michael,. A. I., B.M. Kenneth , H.G. David and D.B. Mary ann. 1988. DNA sequencing with Thermus
aquaticus DNA polymerase and direct sequencing of polymerase chain reaction-amplified DNA.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 85 : 9436-9440.
18
Packo ,P.L., J.Marcel and H.W. Rene. 2003. Exploring and exploiting carotenoid accumulation in
Dunaliella salina for cell-factory applications. Trends in Biotechnology . 26 :11.
Valentina ,V.U. 2006. Bioremediation of toxic heavy metals using acidothermophilic autotrophes.
Bioresource Technology. 97 : 1237–1242.