Professional Documents
Culture Documents
By
Mariany Razali
Session Plan
• General Characteristics of Enzymes
• Enzyme Structure
• Enzyme Nomenclature
• Enzyme Function
• Enzyme Specificity
• Factors Affecting Enzyme Activity
• Enzyme Inhibition
• Regulation of Enzyme Activity
• Medical Uses of Enzymes
Sifat-sifat enzim
• Hampir semua enzim adalah protein
• Enzim : suatu senyawa yang berstruktur protein baik murni
maupun protein yang terikat pada gugus non protein
Enzymes denaturation due to pH or temperature change
• Bekerja spesifik
Masing-masing sel pada tubuh manusia terdapat 1000 enzim yang berbeda
Every reaction in the cell requires its own specific enzyme
• Larut dalam air
• Enzim sensitif dan labil terhadap panas
• Fungsi : katalis
• Enzim dapat dipresipitasi oleh ammonium sulfate and trichloroacetic
acid.
Struktur Enzim
Berdasarkan strukturnya, enzim terdiri atas komponen yang disebut apoenzim yang
berupa protein dan gugus protetik berupa non protein. Gugus prostetik dibedakan
menjadi koenzim dan kofaktor
Simple enzim
- Tersusun hanya dari protein
Enzim terkonjugasi
Terdiri dari :
– Apoenzyme
• Conjugate enzyme without its cofactor
• Protein part of a conjugated enzyme
• Termolabil
– Koenzim (Cofactor)
• Non-protein part of a conjugated enzyme
• Termostabil
• Apoenzym tidak dapat mengkatalis reaksi tanpa kofaktor.
– kombinasi apoenzym dengan kofaktor membuat enzim terkonjugasi berfungsi.
• Holoenzyme = apoenzyme + cofactor
– The biochemically active conjugated enzyme.
Berdasarkan strukturnya, enzim terdiri atas komponen yang disebut apoenzim
yang berupa protein dan gugus protetik berupa non protein. Gugus prostetik
dibedakan menjadi koenzim dan kofaktor
Komponen penyusun enzim terdiri dari :
1. Apoenzim, bagian enzim aktif yang tersusun atas protein yang bersifat
termolabil (mudah berubah) terhadap faktor lingkungan
2. Kofaktor,yaitu komponen non protein yang berupa :
a. Ion-ion anorganik (aktivator).
Berupa logam yang berikatan lemah dengan enzim, Contoh ion logam (Zn2+,
Mg2+, Mn2+ , Ca 2+ & Fe2+). Ion klorida, ion kalsium merupakan ion anorganik
yang membantu enzim amilase mencerna karbohidrat (amilum)
b. Gugus prostetik
Senyawa organik yang berikatan kuat dengan enzim, FAD (Flavin Adenin
Dinucleotide), biotin, dan heme merupakan gugus prostetik yang mengandung
zat besi berperan memberi kekuatan ekstra pada enzim terutama katalase,
peroksidase, sitokrom oksidase.
c. Koenzim molekul organik non protein kompleks, ex: NAD (Nicotineamide
Adenine Dinucleotide), koenzim-A, ATP, dan vitamin yang berperan dalam
memindahkan gugus kimia, atom, atau elektron dari satu enzim ke enzim lain..
• Tidak semua enzim memiliki struktur yang lengkap terdiri dari apoenzim dan kofaktor.
Contoh enzim ribonuklease pankreas hanya terdiri atas polipeptida dan tidak mengandung
gugus kimiawi yang lain.
Defenisi Enzim
Term Defenisi
Enzim (simpel) Protein only enzyme that facilitates a chemical reaction
Koenzim Compound derived from a vitamin (e.g. NAD+ ) that
assists an enzyme in facilitating a chemical reaction
Kofaktor Metal ion (e.g. Mg2+) that that assists an enzyme in
facilitating a chemical reaction
Apoenzim Protein only part of an enzyme (e.g. isocitrate
dehydrogenase) that requires an additional coenzyme to
facilitate a chemical reaction (not functional alone)
Haloenzim Combination of the apoenzyme and coenzyme which
together facilitating a chemical reaction (functional)
Nomenklatur Enzim
Enzyme dinamakan menurut tipe reaksi yang
dikatalisis dan/atau substrat.
• Substrate = the reactant upon which the specific
enzyme acts (Enzim berikatan dengan substrate)
Akhiran enzim –ase
– Lactase, amylase, lipase or protease
Beberapa enzim pencernaan berakhiran –in
– Pepsin, trypsin & chymotrypsin
Berawalan dari tipe reaksi enzim yang katalisis
– Oxidase : redox reaction
– Hydrolase : Addition of water to break one component
into two parts
Identitas substrat sering digunakan bersamaan
dengan tipe reaksi.
– Pyruvate carboxylase, lactate dehydrogenase
6 kelas utama enzim berdasarkan tipe reaksi yang dikatalisis
Oxidoreductase Redox reaction (reduction Examples are dehydrogenases catalyse
& oxidation) reactions in which a substrate is oxidised or
reduced
• The substrate (KEY) must fit exactly into the rigid enzyme (LOCK)
• Upon completion of the chemical reaction, the products are released from the active site,
so the next substrate molecule can bind
2. Induced Fit Model
• Analogy: a glove (enzyme) changes shape when a hand (substrate) is inserted into it
Sisi aktif enzim (Active Site)
• Sisi aktif enzim (active site) adalah bagian dari molekul enzim tempat
berikatannya substrat, untuk membentuk kompleks enzim substrat, dan
selanjutnya membentuk produk akhir.
• Sisi aktif suatu enzim berbentuk 3 dimensi „crevice-like‟, berupa lekukan
pada permukaan protein enzim, yang dibentuk dari struktur sekunder
dan tersier bagian protein enzim.
• Tempat substrat berikatan secara lemah (misalnya interaksi elektrostatik,
ikatan hidrogen, ikatan van der Waals, dan interaksi hidrofobik)
• Sebuah enzim dapat memiliki lebih dari satu active site
• Rantai samping asam amino dalam active site penting dl menentukan
spesifitas substrat
Spesifisitas Enzim
• Absolute Specificity
– An enzyme will catalyze a particular reaction for only one substrate
– Most restrictive of all specificities
• Not common
• Group Specificity
– The enzyme will act only on similar substrates that have a specific
functional group
• Stereochemical Specificity
– Enzim dapat membedakan diantara stereoisomers
– Chirality is inherent in an active site (as amino acids are chiral compounds)
• RULE:
– The rate of an enzyme-catalyzed
reaction is always directly proportional
to the amount of the enzyme present
• In a living cell:
– The [substrate] is much higher
than the [enzyme]
• Enzymes are not consumed in the
reaction