DOMAIN ARCHAEA

Domain Archaea 1
 Klasifikasi Archaea
PANDUANNYA:
Bergeys Manual of Determinative Bacteriology (8th
Edition; 1974):

Kingdom Prokaryotae:
▪ Division I. Cyanobacteria
▪ Division II. Bacteria (19 Parts):

✓Part 7 : Halobacteriaceae (Archaea)

✓Part 12: Genus Sulfolobus (Archaea)
✓Part 13: Methanogenic bacteria (Archaea)
Domain Archaea 2
1. Klasifikasi Fenetik
❑ Bergeys Manual of Systematic Bacteriology
(Vol 1 – 4, First Edition; 1984 - 1989):
Vol 1: Wall-less & gram negative bacteria
Vol 2: Gram positive & phototrophic bacteria
Vol 3: Gram positive bacteria & archaea
Vol 4: Gram positive bacteria (Actinomycetes)

❑ Bergeys Manual of Determinative Bacteriology

(9th Edition; 1994)
❑ Kingdom Prokaryotae: (33 Sections)
• Division I. Gracilicutes : gram negative
• Division II. Firmicutes : gram positive
• Division III. Tenericutes: tanpa dinding sel (Mycoplasma)
• Division IV. Mendosicutes: archaea(bacteria)
Domain Archaea 3
2. Klasifikasi Filogenetik

❑Bergeys’s manual of Systematic Bacteiology,

Vol. 1 – 5, Edisi 2 (2001)

Vol 1: Archaea → bercabang & fototrofik

Vol 2: Proteobacteria
Vol 3: G + C rendah→ bakteri Gram positif
Vol 4: G + C tinggi → bakteri Gram positif
Vol 5: Panctomycetes, Spirochaetes, Fibrobacteres,
Bacteroidetes & Fusobacteria

Domain Archaea 4
 KEANEKARAGAMAN
Pohon Filogeni Makhluk Hidup

Domain Archaea 5
 Archaea & Carl Woese

Carl Woese

Domain Archaea 6
 Perbedaan Archaea dengan Bacteria

• Dinding sel
• Membran sitoplasma
• Resistensi terhadap antibiotik
• Jumlah subunit RNA Polimerase
• Adanya intron tRNA pada Archaea

Domain Archaea 7
 Keanekaragaman Mikrobia

A. Domain Archaea:
Dunia Archaea: 2 Phylum
B. Domain Bacteria :
Dunia Bacteria : 23 Phylum
C. Domain Eukarya:
1. Dunia Fungi
2. Dunia Protista
3. Dunia Plantae
4. Dunia Animalia

Domain Archaea 8
 Klasifikasi Filogenetik

Domain Archaea 9
 Morfologi Sel Archaea

Domain Archaea 10
 KLASIFIKASI-FILOGENI

Bergeys Manual of Systematic Bacteriology

(Vol 1 – 5, Second Edition; 2001 - Sekarang)

I. Domain Archaea

1. Phylum Crenarcheota (1 Class: 3 Orders)

2. Phylum Euryarcheota (7 Classes: 9 Orders)

Domain Archaea 11
 Domain Archaea (hanya 1 Kingdom)
Kingdom Archaea (2 Phylum)

Phylum I. Crenarchaeota ( 1 Classis)

Classis 1. Thermoprotei (3 Ordo)

Ordo 1. Thermproteales (2 Familia)
Familia 1. Thermoproteaceae (4 Genera)
Familia 2. Thermofilaceae (1 Genus)
Ordo 2. Desulforococcales (2 Familia)
Familia 1. Desulforococcaceae (8 Genera)
Familia 2. Pyrodictiaceae (3 Genera)
Ordo 3. Sulfolobales (1 Familia)
Familia 1. Sulfolobaceae ( 6 Genera)
Domain Archaea 12
 Habitat Crenarchaeota

- Filum Crenarchaeota pada umumnya hidup di

daerah geothermal yang banyak mengandung H0
atau H2S.
- Di daratan habitat Crenarchaeota seperti solfataras
(Italia, Islandia, USA, dan Selandia Baru)
- Di dalam laut habitat Crenarchaeota adalah palung
hydrothermal

Domain Archaea 13
 Habitat Crenarchaeota

Habitat Crenarchaeota di daratan

Domain Archaea 14
 Genus Crenarchaeota Darat

- Beberapa genus dari filum Crenarchaeota

yang memiliki habitat daratan adalah:
- Sulfolobus

- Acidianus

- Thermoproteus

- Pyrobaculum

Domain Archaea 15
 Ordo: Sulfolobales
(Sulfolobus, Acidianus)

Sulfolobus acidocaldarius Acidianus infernus

Domain Archaea 16
 Genus: Sulfolobus

Sulfolobus solfataricus

FeS2 + 7H2O + 2H2O → 2FeSO4 + 2H2SO4

2S0 + 3O2 + 2H2O → 2H2SO4
2H2 + O2 → 2H2O

Domain Archaea 17
 Ordo: Thermoproteales
(Thermoproteus, Thermofilum, Pyrobaculum)

Thermoproteus neutrophilus

Thermofilum librum

Pyrobaculum aerophilum.

Domain Archaea 18
 Genus: Thermoproteus

H2 + S0 → H2S
TEM image by Wolfram Zillig.
Archaea an-aerobik→
Copy right: K.O.Stetter &
R.Rachel, Univ.Regensburg ektrim termofilik

Domain Archaea 19
 Genus Crenarchaeota Laut

Beberapa genus dari filum Crenarchaeota yang

memiliki habitat palung dan gunung berapi laut
adalah:

• Pyrodictium

• Pyrolobus

• Ignicoccus

• Staphylothermus
Domain Archaea 20
 Genus Pyrodyctium dan Pyrolobus

a. Pyrodictium occultum

b. P. occultum.

c. Pyrolobus fumarii

Domain Archaea 21
 Genus: Desulforococcus

Desulforococcus saccahrovorans

Domain Archaea 22
 Genus: Staphylothermus

Staphylothermus marinus

Domain Archaea 23
 Phylum II. Euryarchaeota (7 Classis)

Classis 1. Methanobacteria (1 Ordo)

Ordo 1. Methanobacteriales (2 Familia)

✓ Familia 1. Methanobacteriaceae ( 4 Genera)

✓ Familia 2. Methanothermaceae (1 Genus)

Methanogenic Archaea
Domain Archaea 24
 Genus: Methanobacterium

Methanobacterium thermoautotrophicum
JELASKAN POTENSI NYA SAAT PRESENTASI

Domain Archaea 25
Genus: Methanobacterium & Methylomonas

Methylomonas scandinavium

Methanobacterium subterraneum

Methanobacterium bryanti
Domain Archaea 26
 Classis 2. Methanococci (3 Ordo)
Ordo 1. Methanococcales (2 Familia)
Familia 1. Methanococcaceae (2 Genera)
Familia 2. Methanocaldococcaceae (2 Genera)

Ordo 2. Methanomicrobiales (3 familia)

Familia 1. Methanomicrobiaceae (6 Genera)
Familia 2. Methanocorpusculaceae (1 Genus)
Familia 3. Methanospirillaceae (1 Genus)
Genus 1. Methanocalculus (Genus incertae sedis)

Ordo 3. Methanosarcinales (2 familia)

Familia 1. Methanosarcinaceae (6 Genera)
Familia 2. Methanosaetaceae (1 Genus)
Domain Archaea 27
Genus: Methanococcus & Methanomicrobium

Methanococcus vineli Methanomicrobium mobile

SAAT PRESENTASI : SEBUTKAN POTENSI YANG DIMILIKI

Domain Archaea 28
 Genus: Methanosarcina

Methanosarcina acetivorans Methanosarcina barkeri

Domain Archaea 29
Classis 3. Halobacteria (1 Ordo)
Ordo 1. Halobacteriales (1 Familia; 1 Genus)

Classis 4. Thermoplasmata (1 Ordo)

Ordo 1. Thermoplasmatales (2 Familia)
Familia 1. Thermoplasmataceae (1 Genus)
Familia 2. Picrophilacese (1 Genus)
Classis 5. Thermococci (1 Ordo)
Ordo 1. Thermococcales (1 Familia)
Familia 1. Thermococcaceae (2 Genera)

Domain Archaea 30
 Archaea halofilik

Methanosarcina mazei

Great Salt Lake, pink wave

Domain Archaea 31
 Genus: Halobacterium

Halobacterium salinarum Halobacterium salinarum

Domain Archaea 32
 Genus: Halobacterium

Halobacterium bloom di Halobacterium halobium

danau Cheetam, Australia

Domain Archaea 33
 Genus: Halobacterium
Mekanisme Halobacterium memproduksi ATP
menggunakan bacteriorhodopsin

Domain Archaea 34
 Archaea thermofilik

Sulfolobussolfataricus

Domain Archaea 35
 Genus: Thermoplasma & Thermococcus

Thermoplasma acidophilum Thermococcus acidiminovorans

Domain Archaea 36
 Pohon Thermoplasma

Domain Archaea 37
 Genus: Pyrococcus

Pyrococcus furiosus

Pyrococcus abysi

Domain Archaea 38
Classis 6. Archaeoglobi (1 Ordo)
Ordo 1. Archaeoglobales (1 Familia)
Familia 1. Archaeoglobaceae (2 Genera)

Classis 7. Methanopyri (1 Ordo)

Ordo 1. Methanopyrales (1 Familia)
Familia 1. Methanopyraceae (1 Genus)

Domain Archaea 39
 Genus: Archaeoglobus

Archaeoglobus fulgidus

A. veneficus

Archaeoglobus (biofilm)

Domain Archaea 40
 Genus: Methanopyrus

Methanopyrus kandleri

Domain Archaea 41
 Phyllum III. Thaumarchaeota

• Merupakan kelompok archaea nitrifikasi

• Mampu hidup di suhu dingin dan kandungan nutrisi
rendah
• Contoh: Nitrosopumilus maritimus
Domain Archaea 42
 Phyllum IV. Nanoarchaeota

• Berukuran sangat kecil, hanya 1% dari E. coli

• Hidup sebagai parasit pada Crenarchaeota Ignicoccus
• Contohnya Nanoarchaeum equitans

Domain Archaea 43
 Phyllum V. Korarchaeota

• Berbentuk filamen
• Memiliki habitat pada daerah hot vents
• Tidak memiliki beberapa enzim untuk metabolism
• Contohnya Korarchaeum cryptofilum
Domain Archaea 44