Sveučilište u Splitu

Prirodoslovno-matematički fakultet
Odjel za kemiju


 prof. dr. sc. Maja Pavela-Vrančič

1
 Cilj predmeta:
 proučavanje kako
složene kemijske
reakcije podržavaju
život

2
 Živi organizmi trebaju stalan priliv
slobodne energije

Kemotrofni organizmi:
dobivaju slobodnu energiju
oksidacijom hranjivih tvari

Fototrofni organizmi:
hvatanjem svjetlosne energije

Energiju koriste za:

 gibanje
 aktivni prijenos
 biosintezu Kolibrić može uskladištiti dovoljno goriva za
 amplifikaciju signala neprekidni let preko Meksičkog zaljeva ( 800 km)

3
 Oksidacija ugljika
ide uz oslobađanje energije
H O
O O
C H CH3OH C
C C
H H H H OH
H O
metan metanol formaldehid mravlja ugljikov
kiselina dioksid
Go (oksidacije)
(kJ/mol) - 820 - 703 - 523 -285 0

Masti i ugljikohidrati važan su izvor stanične energije

Masne kiseline su bogatije energijom – atomi ugljika u masnim

kiselinama više su reducirani od atoma ugljika u ugljikohidratima

masna kiselina glukoza

4
 Živi organizmi dijele se s obzirom na
oblik ugljika koji koriste za dobivanje energije

organski
 Autotrofni organizmi (proizvođaći) spojevi + O2
proizvode vlastitu hranu (složene
organske spojeve) iz jednostavnih
anorganskih molekula
autotrofni heterotrofni
organizmi organizmi
 Heterotrofni organizmi (potrošaći)
kao izvor ugljika koriste hranjive
tvari
CO2 + H2O

5
 METABOLIZAM
Skup svih pretvorbi tvari i energije koje se događaju
u stanici ili u organizmu

Lasica - brzi metabolizam

Ljenivac
 spori metabolizam
 uglavnom se hrani biljkama
 lat. acedia- apatija ili lijenost

 provedu i više od tjedan dana 6

viseći naglavce s istog stabla
Osnovna uloga metabolizma

 Opskrba i potrošnja
energije,
energija

 sinteza molekula za
izgradnju staničnih O2
struktura i molekula
potrebnih za rad i klorofil
funkciju stanice, za glukoza
rast i razvoj,

 odstranjivanje H2O CO2

otpadnih proizvoda.

7
 Metabolizam je organiziran u
metaboličke putove

ENERGIJOM BOGATE
 Biorazgradni metabolički HRANJIVE TVARI
putovi = katabolizam ugljikohidrati, masti, proteini
 složeni metaboliti razgrađuju
se do jednostavnih produkata
KATABOLIZAM ANABOLIZAM
 energija, oslobođena (oksidacijski, (redukcijski,
oksidacijom gorivih molekula, egzergoni) endergoni)
pohranjuje se u obliku ATP,
NADH, FADH2, GTP, NADPH
BIOSINTETSKE PRETEČE
aminokiseline, šećeri
 razgradnja do zajedničkih masne kiseline, dušikove baze
intermedijera
ENERGIJOM SIROMAŠNI STANIČNE
KRAJNJI PROIZVODI MAKROMOLEKULE
 Biosintetski metabolički H2O, CO2, NH3 proteini, polisaharidi
putovi = anabolizam lipidi, nukleinske kiseline

8
 Metabolički putovi sastoje se od niza uzastopnih
enzimski-kataliziranih reakcija

Metabolička karta

Polazišta, stanice, odredišta, smjerovi,

putovi, raskrižja?

9
Metabolički putovi isprepliću se preko zajedničkih međuprodukata (intermedijera)

Metabolizam je skup metaboličkih sustava

Kataboličke reakcije konvergiraju prema Metabolizam Metabolizam

zajedničkom međuproduktu, dok anaboličke složenih ugljikohidrata kofaktora i vitamina
reakcije divergiraju od zajedničkog
Metabolizam Metabolizam
međuprodukta nukleotida
lipida

Metabolizam
ugljikohidrata Metabolizam
ostalih
Metabolizam aminokiselina
lipida
Metabolizam
aminokiselina

Energijski
metabolizam
Metabolizam
ostalih tvari
ATP
Everything should be made as 10
simple as possible, but not simpler Albert Einstein
 Postupna oksidacija koja se odvija u stanici omogućava
visoko iskorištenje energije pohranjene u hrani

Postupna oksidacija šećera u stanici Izravno sagorijevanje šećera

Enzimski katalizirane reakcije Nekatalizirana reakcija

- visoka energija aktivacije

šećer šećer
Slobodna energija

Dio slobodne energije

pohranjuje se u obliku Sva slobodna energija se
aktiviranih nosača oslobađa u obliku topline;
(ATP, NADH) ne skladišti se !

11
Energija gorivih molekula ne predaje se izravno
endergonim metaboličkim procesima

Adenozin-trifosfat (ATP)

 ATP je univerzalna valuta esterska veza adenin

adenin
slobodne energije u biološkim G hidrolize= -14 kJ/mol
o

sustavima

 ATP je glavni neposredni izvor

slobodne energije

 ATP nije skladišni oblik

slobodne energije
anhidridne veze
G hidrolize = -30,5 kJ/mol
o
riboza

ATP + H2O  ADP + Pi

ATP + H2O  AMP + PPi

PPi + H2O  2Pi
12
G´je promjena slobodne energije pri uvjetima
koji vladaju u stanici

aA + bB cC + dD

G´ ovisi o prirodi reaktanata i njihovoj koncentraciji

[C]c [D]d
G´ = Go´ + RT ln
[A]a [B]b

Go´ = standardna promjena slobodne energije kod pH 7

Standardno stanje biokemijskih reakcija

pH = 7, t = 25 oC, aktivitet H+ iona (pH 7) = 1

Go´ hidrolize ATP = - 30,5 kJ/mol

U stanici: G´ hidrolize ATP  - 50 kJ/mol

13
 Skup reakcija koji čini metabolički put mora biti
termodinamski povoljan
(negativna promjena slobodne energije)

Sprega termodinamski nepovoljne reakcije s termodinamski

povoljnom reakcijom može tu reakciju učiniti spontanom

(1) A B+C G1o = +10 kJ/mol

(2) C D G2o = -30 kJ/mol

(3) A B+D G3o = G1o + G2o = -20 kJ/mol

14
 ATP-ADP ciklus:
glavni oblik energetske razmjene u
biološkim sustavima
hranjive tvari + O2 CO2 + H2O
egzergone
reakcije

ADP + Pi ATP

endergone
reakcije
produkti reaktanti
15
 Bazalni metabolizam
 Bazalni metabolizam: najmanja količina
energije potrebna za održavanje osnovnih
životnih funkcija u stanju mirovanja pri
vanjskoj temperaturi od 20 oC

 BMR (basal metabolic rate)

Žene
 BMR u kcal/dan = 655 + (9,6 x težina u kg) +
(1,8 x visina u cm) - (4,7 x starost u god)

Muškarci
 BMR u kcal/dan = 66 + (13,7 x težina u kg) +
(5 x visina u cm) - (6,8 x starost u godinama)

Stvarno potrebna količina energije:

 bez fizičke aktivnosti: BMR x 1,2
 lagana fizička aktivnost: BMR x 1,37
 umjerena fizička aktivnost: BMR x 1,55
 fizička aktivnost: BMR x 1,73
 trening: BMR x 1,9

16
Energija gorivih molekula oslobađa se
u tri stupnja
proteini polisaharidi lipidi
pentoze I. stupanj
heksoze
Hidroliza složenih molekula
aminokiseline glicerol, na građevne podjedinice
glukoza
masne kiseline

gliceraldehid-3-fosfat
II. stupanj
Razgradnja do
jednostavnih metabolita

piruvat

acetil--CoA

Ciklus III. stupanj

limunske
kiseline Oksidacija acetil-CoA putem CLK,
prijenos elektrona na NAD+ i FAD,
oksidacijska fosforilacija do ATP

Oksidacijska fosforilacija

17
NH3 H2O CO2
 Vrste metaboličkih putova

 linearni put
 produkt reakcije je supstrat slijedeće reakcije
ABCDE

 ciklički put
A
 intermedijeri se obnavljaju E
B
 spiralni put
D C
 isti skup enzima djeluje
višekratno

18
 Obilježja metaboličkih reakcija

 šest osnovnih skupina kemijskih reakcija

 relativno jednostavni reakcijski mehanizmi

1. Oksido-redukcijske reakcije

O O 2e- + 2H+ O O
C C
C O H C OH
CH3 CH3
piruvat
2e- + 2H+ laktat

19
2. Reakcije u kojima O O ATP ADP O O
nastaje kovalentna C C

veza (na pr. C-C veza) C O H C OH

CH3 CH2
CO2 Pi
C
O O
piruvat oksaloacetat
H O H O
C C
B: + H C O H BH+ + C O H
R aldoza R

H
H O H
3. Izomerizacija
H C O H C
B: + C O BH+ + C O
R ketoza R

20
 CH2OH CH2OH
4. Prijenos skupine 5. Hidroliza HO O H O OH
H H
OH H O OH H
H H H
H OH H OH
laktoza
H2O

CH2OH CH2OH
HO O OH H O OH

glukoza glukoza-6-fosfat H
OH H + H
OH H
H H HO H
H OH H OH
galaktoza glukoza
6. Adicija na dvostruku vezu, eliminacija
H H H H
H+
C C + H2O H C C H
H H OH H
21
 Metabolički putovi regulirani su preko enzima koji
kataliziraju ključne ireverzibilne korake
 Biosintetski i razgradni putovi gotovo uvijek
su razdvojeni
 odvijaju se u specifičnim staničnim
odjeljcima
 međusobna pretvorba metabolita odvija se
različitim putovima i katalizirana je
različitim enzimima

A
E
E1 E2 A X
X E
Nezavisna kontrola brzine reakcije: Usporavanje reakcije AX,
usporava i reakciju XA
inhibicija enzima E1 ne utječe na enzim E2
22
Mnoge metaboličke reakcije regulirane su
energijskim nabojem stanice

ATP + ½ ADP
Energijski naboj = __________________________
ATP + ADP + AMP

U fiziološkim uvjetima zbroj

ATP + ADP + AMP
je konstantan

Vrijednost energijskog naboja:

0 (samo AMP) - 1 (samo ATP)

23
CILJ

24