You are on page 1of 140

Budapesti Mszaki s Gazdasgtudomnyi Egyetem

Vegyszmrnki s Biomrnki Kar


Alkalmazott Biotechnolgia s lelmiszertudomnyi Tanszk

rta:

NMETH RON
Lektorlta:

REZESSYN SZAB JUDIT

IPARI MIKROBIOLGIA
Egyetemi tananyag

2011

COPYRIGHT: 2011-2016, Dr. Nmeth ron, BME Vegyszmrnki s Biomrnki Kar


Alkalmazott Biotechnolgia s lelmiszertudomnyi Tanszk
LEKTORLTA: Dr. Rezessyn Szab Judit, Budapesti Corvinus Egyetem
Creative Commons NonCommercial-NoDerivs 3.0 (CC BY-NC-ND 3.0)
A szerz nevnek feltntetse mellett nem kereskedelmi cllal szabadon
msolhat, terjeszthet, megjelentethet s eladhat, de nem mdosthat.
TMOGATS:
Kszlt a TMOP-4.1.2-08/2/A/KMR-2009-0028 szm, Multidiszciplinris, modulrendszer, digitlis
tananyagfejleszts a vegyszmrnki, biomrnki s vegysz alapkpzsben cm projekt keretben.

KSZLT: a Typotex Kiad gondozsban


FELELS VEZET: Votisky Zsuzsa
AZ ELEKTRONIKUS KIADST ELKSZTETTE: Benk Mrta
ISBN 978-963-279-478-5
KULCSSZAVAK:
biotechnolgia, ipari mikrobiolgia, alkalmazott mikrobiolgia, mikrobiolgiai mveletek, mikrobilis
anyagcsere, mikrobilis rendszertan, ipari baktriumok, ipari gombk, ipari algk, kevert tenyszetek
alkalmazsa.
SSZEFOGLALS:
Az elmlt vekben vitathatatlan biotechnolgiai fejldsnek voltunk s vagyunk tani, amely fejlesztsek
sorn mindig feltnnek a mikroorganizmusok, akr mint termel biokataliztorok, akr mint termkek, vagy
egyre gyakrabban mint gn/enzim forrsok. Ennek ksznheten a biotechnolgiai/biomrnki kpzsben az
ltalnos mikrobiolgit egy specifikus Ipari mikrobiolgia kveti, amelynek clja rendszerezetten
sszefoglalni a mikrobk nyjtotta lehetsgeket, potencilokat, illetve az ezek kiaknzshoz szksges
alapismereteket.
Ezt szem eltt tartva a jegyzet elszr a bevezets utn a mikroorganizmusokkal s kezelskkel kapcsolatos
mveleteket s alapismerteket (fiziolgiai, biokmiai) tekinti t, majd pedig a mikrobilis rendszertant
kvetve abbl kiemelve az ipari vonatkozs trzseket bemutatja a mikrobkban rejl ipari
lehetsgeket, s utal a mr mkd technolgikra.

Tartalom

TARTALOM
ALAPISMERETEK, IPARI MIKROBIOLGIAI MDSZEREK ................................................ 5
1.1. Bevezets az ipari mikrobiolgiba ............................................................................................. 5
Vrs biotechnolgia .................................................................................................................. 5
Fehr biotechnolgia ................................................................................................................... 6
Zld biotechnolgia .................................................................................................................... 6
Esettanulmny 1. Lizingyrts ................................................................................................ 7
Esettanulmny 2. 1,3-propndiolgyrts .................................................................................. 9
1.2. (Ipari) Mikrobiolgiai mveletek ............................................................................................... 14
Trzsizolls ............................................................................................................................. 14
Trzsfenntarts .......................................................................................................................... 20
Trzs-screening ......................................................................................................................... 21
Identifikci .............................................................................................................................. 25
Trzsfejleszts........................................................................................................................... 26
1.3. Mikroorganizmusok ipari alkalmazsa ...................................................................................... 31
Az oxign szerepe ..................................................................................................................... 31
Aerobok tenysztse ................................................................................................................. 32
Anaerob fermentcik (erjesztsek) .......................................................................................... 32
Szubmerz kontra felleti fermentci ....................................................................................... 37
2. AZ IPARI MIKROBIOLGIA BIOKMIAI S FIZIOLGIAI HTTERE ............................. 40
2.1. Sznforrsok hasznosulsa, klnleges metabolizmusok .......................................................... 40
C1-forrsok hasznosulsa ........................................................................................................ 40
C2-metabolizmus ...................................................................................................................... 41
C3-metabolizmus ...................................................................................................................... 42
C4-metabolizmus ...................................................................................................................... 43
C5-metabolizmus ...................................................................................................................... 43
C6-metabolizmus ...................................................................................................................... 44
C7-metabolizmus ...................................................................................................................... 44
Specilis energianyer metabolizmusok (biometallurgy) ......................................................... 44
2.2. Primer metabolitok ..................................................................................................................... 46
2.3. Szekunder metabolitok ............................................................................................................... 46
De novo szekundermetabolit-termels ...................................................................................... 46
Szteroid- (szekunder metabolit) konverzi ............................................................................... 50
3. AZ IPARI MIKROORGANIZMUSOK S TECHNOLGIK TRGYALSA
TRZSRENDSZERTANBA ILLESZTVE .................................................................................. 57
3.1. Mikrobilis rendszertan .............................................................................................................. 57
Klasszikus rendszertan .............................................................................................................. 58
Filogenetikus rendszertan ......................................................................................................... 58
Bakterilis filogentika .............................................................................................................. 59
A baktriumok trzsnek elgazsi sorrendje ........................................................................... 60
Az indelmodell megbzhatsga s prediktv lehetsgei ........................................................ 61
3.2. Ipari szempontbl fontos (s)baktriumok ................................................................................. 65
1. Archek ................................................................................................................................. 65
2. Firmicutes ............................................................................................................................. 68
3. Actinobacterek ...................................................................................................................... 72
4. Thermotoga ........................................................................................................................... 79
5. Fusobacteriumok ................................................................................................................... 80
6.-7. Deinococcus-Thermus ...................................................................................................... 80
8. Chloroflexi ............................................................................................................................ 81
9. Cyanobacterek ....................................................................................................................... 81
10. Spirohaetk ......................................................................................................................... 82
11., 12,. 13. Chlorobik, Fibrobacterek, Bacteroidesek .............................................................. 82
1.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

14., 15., 16. Planctomyceta-k, Verrucomicrobiumok, Chlamydik .......................................... 83


17. Aquificae ............................................................................................................................. 83
18., 19., 20., 21., 22. Proteobacterek ......................................................................................... 84
3.3. Ipari szempontbl fontos gombk .............................................................................................. 95
Basidomycotak .......................................................................................................................... 97
Ascomycotak............................................................................................................................. 99
Zygomycotak .......................................................................................................................... 100
3.4. Iparilag jelents algk .............................................................................................................. 101
3.5. Vegyes tenyszetek alkalmazsa .............................................................................................. 102
3.6. A vakcinagyrts mikrobiolgija ........................................................................................... 103
4. A MIKROORGANIZMUSOK IPARI FELHASZNLSNAK ETIKAI S KOCKZATI
KRDSEI .................................................................................................................................. 106
5. KITEKINTS .............................................................................................................................. 109
6. SZSZEDET ............................................................................................................................... 110
7. NELLENRZ KRDSEK AZ IPARI MIKROBIOLGIA CM JEGYZETHEZ ............ 118
Tesztmegold kulcs ......................................................................................................................... 128
8. HIVATKOZSOK ...................................................................................................................... 129
BRK, ANIMCIK, VIDEK, TBLZATOK JEGYZKE ................................................... 138
brk, animcik, videk ............................................................................................................... 138
Tblzatok ....................................................................................................................................... 139

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

1.

ALAPISMERETEK, IPARI MIKROBIOLGIAI


MDSZEREK

1.1. Bevezets az ipari mikrobiolgiba


Az 1990-es vekben sok olyan jslat ltott napvilgot, melyek szerint a XXI. sz. a biotechnolgiai
forradalmat kveten a biotrsadalommal lesz jellemezhet. Valban, az utbbi vtizedek mikrobiolgiai, biokmiai, genetikai, molekulris biolgiai s biotechnolgiai fejlesztsei lassan a htkznapi emberhez is ilyen vagy olyan formban eljutnak, s klnsen a krnyezetvdelmen keresztl
szlesebb trsadalmi csoportokban is rezhetv vlnak.
A biotechnolgit amely teht a Biotrsadalom meghatroz rsze sokflekppen definiltk mr. Taln a legegyszerbb gy megadni, mint egy olyan fogalom, amely a biolgiai
rendszerek emberi cl (gyakran termels orientlt) felhasznlst jelenti.
Annak bemutatsra, hogy az utbbi vtizedekben mekkorra duzzadtak a biotechnolgia kutatsi s
alkalmazsi terletei az 1.1.1. tblzatban kerlt sszefoglalsra a klnbz szakterleteket jelz
sznkdrendszer.
1.1.1. tblzat: Sznkdrendszer a Biotechnolgiai terletek jellsre
Szn
Vrs
Fehr
Zld
Kk
Barna
Fekete
Bbor
Srga
Arany
Szrke

Biotechnolgiai kutatsi s alkalmazsi terlet


Egszsggyi, orvosi, diagnosztikai biotechnolgia
Ipari biotechnolgia
Mezgazdasgi, krnyezetvdelmi biotechnolgia
Vzparti s tengeri biotechnolgia
Szraz, sivatagi biotechnolgia
Bioterror, biolgiai fegyverek
Biotechnolgiai tallmnyok, szabadalmak
lelmiszer- s tpllkozstani biotechnolgia
Bioinformatika, nanotechnolgia
Klasszikus fermentci s Bioprocess

Noha az egyes sznek hasznlata mg nem szleskren elterjedt, s olykor diszkrepancival


terhelt, a tblzatban szerepl els hrom terletet mr szinte egy vtizede e hrom sznkddal jellik,
ezrt ezeket hasonltjuk ssze az albbiakban az gazatot jellemz termkek, mikrobiolgiai,
biokmiai s technolgiai ignyek szempontjbl.
Vrs biotechnolgia
Mivel a vrs biotechnolgia termkeit az egszsggyben gygyszati clokra hasznljk (diagnosztikumok, vakcink, gygyszerek), ezrt termkoldalrl kis mennyisg nagy rtk (low volume
high value) jellemzi ket. Ez azt jelenti, hogy az ves vilgtermels termkenknt nhny szz tonna,
amelyek ra viszont igen magas (penicillin: 10-12 $/kg, vakcink: 20-30 $/dzis). A vrs biotechnolgiai termkek ellltsakor legyenek azok (rekombionns) fehrjk vagy biokonverzival
nyert msodlagos anyagcseretermkek (ld. ksbb) enzimeket vagy nyugv-, illetve aktvan
szaporod tenyszeteket hasznlnak. Biokmiai szempontbl a termel trzsekkel szemben tmasztott
kvetelmny, hogy j hozammal, kevs szennyez mellktermk ksretben termeljk a cltermket.
Ezt gyakran trzsfejlesztssel rik el, illetve a termel mikroorganizmussal szemben tmasztott msik
mikrobiolgiai elvrs gyakran a j expresszis kpessg (megfelel fehrjeszerkezet kialaktsa mind
a 4 szinten1, lehetleg extracellulrisan). Technolgiai oldalrl taln a legmeghatrozbb a minsgFehrjeszerkezet 4 szintje: Elsdleges szerkezet: aminosavsorrend; msodlagos sz.: hosszabb szakaszok
trrendezdse a-hlix vagy b-red formba; harmadlagos szerkezet: 3D feltekereds, amelyet msodlagos
ktsek stabilizlnak; negyedleges: alegysgek kapcsoldsi szerkezete (pl.: 222)
1

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

Ipari mikrobiolgia

biztosts, amelynek szinte mindent alrendelnek, s amely a kltsgeket is jelentsen befolysolja


(=mindig ugyanolyan kivl minsg).
Fehr biotechnolgia
A fehr biotechnolgia clja a vegyipar kifehrtse, azaz krnyezetkmlbb ttele. Ez cljaiban
hasonl a szleskren hasznlt zldkmia kifejezssel, m mg ez utbbi a kmiai szintzisek
krnyezetkmlbb ttelt kvnja elrni, addig a fehr biotechnolgia a kmiai szintzisek mellett
biolgiai gyrtsokat kvn a vegyiparban meghonostani, mivel ezek energiaignye s krnyezetterhelse ltalban kisebb az azonos termket elllt vegyipari eljrsnl. A vegyipar jelenleg is
fennll struktrja kolajalap, azaz svnyi olajbl nyerik finomtssal az elsdleges alapanyagokat,
illetve az energit is. Ennek analgijra a fehr biotechnolgia eredmnyeit felhasznlva kb. egy
vtizede terjed a biofinomt elnevezs, amely teht olyan biokombint, amely megjul alapanyagbl
fedezi a nyersanyag- s energiaignyt is.
A biofinomtkhoz szorosan kapcsolhat a platformalkot vegylet fogalma, amelyet olyan
vegyletekre hasznlunk, amelyeknek egy sor piackpes, rtkes szrmazkt konvencionlis vegyipari folyamatokkal el lehet lltani. A platformvegyleteket ltalban sznatomszm szerint csoportostjk, gy lteznek C3-C4-C5-C6-C7 platformok. A biofinomtk gyakran biolgiai ton megjul
nyersanyagbl ilyen platform kemiklit lltanak el.
A fehr biotechnolgia termkeit is a vegyipari termkekhez hasonlan amelyek ms ipargak
(kozmetikai, oldszer, polimer iparok) viszonylag olcs tmeges alapanyagaiknt szolglnak a
nagy tmeg kis rtk (high amount low value) jellemzi, s ltalban de novo fermentcis
eljrssal kszlnek (pl.: oldszerek 0,4-1,4 $/kg).
Biokmiai szempontbl az olcs tmegtermkek miatt a j szubsztrthasznosuls mg fontosabb,
illetve a megfelel metabolikus utak aktivlsa s a tbbi inaktivlsa is cskkenti a feldolgozsi
(downstream) s termkkinyersi kltsgeket. Mikrobiolgiai szempontbl a termel trzs termktolerancija fontos, s a trzsfejlesztsnek itt is fontos szerepe van. Technolgiai aspektusbl az
abszolt kltsghatkonysg a cl mindenekfelett (olcs up/downstream). A kis termeli s kereskedelmi rrs miatt a hatkony technolgia mellett nagy mennyisgek ellltsa, azaz nagy
termelkapacitsok szksgesek minimlis mveleti lps mellett.
Zld biotechnolgia
A zld biotechnolgiba korbban belertettk a krnyezetvdelmi, mezgazdasgi s lelmiszer-ipari
gazatokat, m ezek lassan kln sznkdot kapnak. Az viszont mindegyikre igaz, hogy a termkeik
nagy tmegben kerlnek ellltsra kicsi vagy kzepes rtkkel (takarmnyok, trend- kiegsztk,
biopeszticidek, talajjavtk stb.).
Biokmiai szempontbl a specilis zek kialaktshoz az egy termk de novo fermentcik
helyett a heterofermentatv anyagcserjek kedvezbbek, illetve a specilis tprtkek kialaktshoz
klnbz anyagok (fehrjk, vitaminok) akkumulcijra kpes mikrobk kerlnek felhasznlsra.
Olykor enzimes technolgia is elfordul (izocukorgyrts). Ehhez mikrobiolgiai szempontbl
klnsen a biopeszticidek gyrtsakor szksges tovbb a haszonnvny-krokoz viszonynak, s
a krokozs mechanizmusnak ismerete. Technolgia szempontbl klnsen az lelmiszer-ipari
termkeknl a minsgbiztosts ismt jelents szerephez jut, amely ersen felhasznl centrikus
(kedvez szn, szag, halmazllapot termk).
A fenti BIOTECHNOLGIAI pldkon igyekeztnk demonstrlni, hogy noha a biotechnolgia
mra egy sok terletet tlet gazatt vlt, az egyes szakterletek kzs pontja a MIKROBA, amely
az egyes technolgikat s termkeket alapveten befolysolja. Pldul egy tejsav-fermentcinl az
alkalmazott tpkzegnek olcsnak kell lennie, de a mikroba valamennyi ignyt (C, N, vitaminforrs)
ki kell elgtenie gy, hogy a feldolgozsi mveletek a lehet legegyszerbben (s legolcsbban)
nyerhessk ki a termket. Ahhoz, hogy a biotechnolgia kulcsszerepljt, a mikrobt megismerjk, s
cljainknak megfelelen a leghatkonyabban kihasznljuk, a mikrobatudomnnyal, de legalbb annak
ipari mikrobiolgiai rszvel kell tisztban lennnk.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

E jegyzet clja, hogy az iparban hasznlatos mikrobiolgiai mveleteket, lettani jelensgeket,


potencilokat bemutassa. A napjainkban egyre nagyobb mretet lt szvettenysztsi eljrsok
azonban nem kerlnek trgyalsra.
Amint azt a vrs/fehr/zld biotechnolgia rvid bemutatsnl lttuk, az ipari mikrobiolgia 3
tudomnyterlet kztt elhelyezked interdiszciplinris tudomny: Biokmia, Mikrobiolgia, Mrnki
tudomnyok (1.1.1. bra).

1.1.1. bra: Az ipari mikrobiolgia helye a tudomnyban


Az ipari mikrobiolgia trgya teht szksgkppen a termel mikroorganizmusok (termszetes s
rekombinns trzsek, illetve kevert tenyszetek), valamint a hozzjuk kapcsold (mikrobiolgiai)
mveletek.
Bevezetsknt kvetkezik kt esettanulmny az ipari mikrobiolgia eredmnyeinek demonstrlsra.
Esettanulmny 1. Lizingyrts [1]

O
NH2

HO
NH2

1.1.2. bra: A lizin kplete


A lizin egy esszencilis aminosav (1.1.2. bra), ezrt ellltsa mind az llati takarmnyozs, mind a
humn lelmezs szempontjbl fontos. A lizinpiac vi 600 000 t termket produkl, amely vente
tovbbi 5-7%-kal bvl (2005).
Az elllts els kulcslpse a fermentci. Ezt glkz/szaharz- vagy melaszalapon vgzik, s
30-40%-os hozammal kpzdik a lizin (100150 g/L koncentrciban).
A fermentcit Corynebacterium glutamicum-mal vgzik, amelyet elszr 1956-ban izolltak egy
korabeli j mdszer segtsgvel (bioautogrf technika) glutaminsavtermels cljbl. A mdszer
lnyege, hogy az izoltumokat Petri-csszben lv agar tpkzegen kinvesztik, replika mdszerrel a
Petri-csszrl msolatot ksztenek, majd a msolaton kintt telepeket UV-val ellik, vgl flje egy

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

Ipari mikrobiolgia

jabb agaros tpkzeget rtegeznek, amelybe a keresett metabolitra hinymutns mikrobt


szuszpendlnak, s jra inkubljk. Ennek kvetkeztben az ellt izoltumok mr nem, a
hinymutnsok pedig csak ott fognak kinni a 2. agar felsznn, ahol az als agaron kinvesztett
izoltum a hinyz metabolitot termelte (1.1.3. animci) [2]. Szmos izoltum vizsglatbl kiderlt,
hogy a glutaminsav-termelk lizintermelsre is alkalmasak, mert mindkt aminosav a citrtkr (TCA
ciklus) intermedierbl eredeztethet (1.1.4. bra).

1.1.3. animci: A bioautogrf mdszer


A mikroorganizmus ltal sznforrsknt elfogyasztott cukrok a glikolzisen keresztl bomlanak le
piroszlsav foszfoenolpiruvt acetil-koenzim-A tvonalon. Az utbbi molekula az acetilcsoportjt egy oxlecetsavnak tadva citromsavat hoz ltre, amely kt lpsben dekarboxilezdik (2 szndioxid keletkezse kzben) s oxlecetsav marad vissza, a kvetkez acetil-csoport eloxidlsra. A
krfolyamat egyes intermedierjei azonban az aminosavfermentci esetn beplnek az ellltand
aminosavba, gy a krfolyamat megszakadna. Ennek ellenslyozsra mkdnek az anaplerotikus
(feltlt) reakcik, amelyek szintn a cukrokbl a piruvton t vagy akr a foszfoenolpiruvtbl
kzvetlenl is oxlecetsavat termelnek. Az 1.1.4. brn az is lthat, hogy a TCA-bl a lizin fel
vezet metabolikus t elgazik, s homoszerinen keresztl tovbbi aminosavak (treonin, metionin,
izoleucin) kpzdnek, cskkentve ezzel a bevitt cukrok lizinre trtn hasznosulst (hozamt).
Ennek okn a kezdeti (60-as vek, 20%-os hozam [1]) trzsfejlesztsek homoszerin tvonal
nlkli trzsek kialaktsra irnyultak, amelyek ellltshoz a klasszikus random mutci
szelekci ciklikus ismtlses mdszert alkalmaztk. A sejtek lettani funkciihoz azonban szksg
volt azokra az aminosavakra is, amelyek a homoszerin tvonalon kpzdtek, gy a homoszerin
hinymutns (Hom-) trzsek termelkpessge nem az elvrt mrtkben javult. Ennek kikszblsre
a hinyz aminosavakat a tpkzegbe kellett adagolni, ami nvelte az eljrs kltsgeit. Ennek
elkerlsre kifejlesztettk a leaky mutns (csepeg, tereszt) mdszert, amely olyan mutnsok
szelektlst clozta meg, amelyekben nem eltnt, hanem jelentsen lecskkent egy tvonal kulcsenzimnek aktivitsa. gy a mellktvonal csak kis anyagramot (fluxust) pocskolt el, viszont
egyetlen aminosavbl sem volt teljes hinya a sejteknek.
A kvetkez, mg mindig klasszikus trzsfejlesztssel kivitelezett cl olyan regulcis mutnsok
ltrehozsa volt, ahol a negatv visszacsatolsok eliminldtak. Pldul a kpzdtt lizin az
aszparagin-kinz enzimet magasabb koncentrciban mr gtolja, amely gy az aszparagin lizin
tvonal lellshoz vezet. Mivel az ipar szmra a kltsghatkonyabb termels s lfeldolgozs a cl
azaz a magas termkkoncentrci az elnys , az ipari fermentci szmra fontos volt, hogy az ezt
akadlyoz regulcis mechanizmusokat kiiktassk. A leaky mutnsok szablyozsi (regulcis)
szempontbl is jelentsnek bizonyultak, mivel a cskkent fluxus kisebb koncentrcikat eredmnyezett a mellktermk-tvonalon, gy a mellktermkek negatv feedback mechanizmusa elhanyagolhatv vlt.
A modern kori (80-as vek) trzsfejlesztsek sorn j mdszereket vetettek be. Ezek kz
tartozik a metabolikus fluxus analzis (MFA), amelyet izotpos nyomkvetssel is altmasztottak.
Ezekkel a mdszerekkel megllaptst nyert, hogy anyagram szempontjbl az anaplerotikus
reakcik jelentik a szk keresztmetszetet. Megllaptottk azt is, hogy a kt lehetsges feltlt
mechanizmus kzl a piruvtkarboxilz enzimen keresztl vezet t felel az anaplerotikus aktivits
90%-rt.
A fenti trzsfejlesztsek eredmnyekppen napjainkban 150 g/L vgtitert s kb. 50%-os hozamot lehet
elrni a lizinfermentci sorn.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

1.1.4. bra: Glutaminsav- s lizinmetabolizmus


Esettanulmny 2. 1,3-propndiolgyrts
Az 1,3-propndiolgyrts az utbbi kt vtizedben futott fel kzel 200 000 t/v mennyisgre (1.1.5.
bra). Ennek a gyors s intenzv nvekedsnek az alapja a megnvekedett piaci igny. Korbban csak

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

10

Ipari mikrobiolgia

oldszerknt, kenanyagknt s fagyllknt alkalmaztk, m a 90-es vek ta a manyagipar


hasznlja fel legnagyobb mennyisgben a poli-trimetiln-tereftalt (PTT) ellltsra. A PTT
klnleges szerkezettel rendelkezik a hasonl clokra hagyomnyosan hasznlt polietiln-tereftalthoz
(PET) s polibutiln-tereftalthoz (PBT) kpest. (1.1.6. bra).
250.000

PD [t/v]

200.000
150.000
100.000
50.000
0
1990

1995

2000

2005

2010

1.1.5. bra: Az 1,3-propndiol-elllts alakulsa az utbbi kt vtizedben

1.1.6. bra: A propndiol okozta klnleges szerkezet PTT polimer


(PET: polietiln-tereftalt, PTT: poli-trimetiln-tereftalt, PBT: polibutiln-tereftalt,
ET: etiln, PR: propiln, BU: butiln, TFS: tereftlsav)
Az brrl ltszik, hogy a propndiollal alkotott kopolimer szerkezete klnleges hajtogatssal
rendelkezik. Ennek oka az, hogy mg mind az etiln, mind a butiln esetben a diol OH csoportok
szimmetrikusak egymshoz kpest s tkletes cisz vagy transz helyzetek, addig a propndiol
esetben az OH csoportok hidrognjei (amelyek helyre a ftlsav kt) egymssal szget zrnak be
(1.1.7. animci). Ez a klnleges szerkezet igen elnys tulajdonsgokat klcsnz a PTT-nek,
amelynek kvetkeztben egyre kiterjedtebben hasznljk fel textilik, szlak, szvetek, ecsetszrk
gyrtsban.

1.1.7. animci: 1,3-PD klnleges szerkezete

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

11

Noha mindkt monomert napjainkig javarszt szintetikusan lltjk el kolaj-alapanyagon (PD:


akrolein hidrolzisvel vagy etilnoxid hidroformilezsvel), az 1,3 propndiolt fermentcis ton is
ellltjk, gy a belle ksztett manyagok megjulv vltak (a fermentci alapjul szolgl
cukrot nvnyekbl nyerik).
A szintetikus eljrsok esetn nagy nyomst s hmrskletet, valamint nehzfm-kataliztorokat
hasznlnak (1.1.8. bra), ugyanakkor a DuPont s a Tate & Lyle ltal kzsen felptett fermentcis
zem pedig ehhez kpest 30%-kal kevesebb energit ignyel s 55%-kal kevesebb veghzhats gzt
termel az enyhbb krlmnyeknek ksznheten.
H2O, H+

H
Degussa:

50-70C

H2, Ni
O

HO

135bar, 75-140C

Akrolein

Shell Chemicals:

kataliztor

CO

Etilnoxid

Dupont+Tate&Lyle:

kukorica

mag

H2

HO
OH
1,3-propndiol

100C, 100bar

25-30C
55-90C
glicerin
kemnyt
glkz
E.coli

1.1.8. bra: az 1,3-propndiol-elllt technolgik


Ipari mikrobiolgiai szempontbl a termel trzset rdemes megvizsglni.
A termszetben elfordul mikroorganizmusok kzl a lactobacillusok, klebsiellk, citrobacterek,
enterobacterek, clostridiumok [5] kpesek glicerin anaerob (leveg kizrt) fermentcijval 1,3propndiolt ellltani.
Amint az az 1.1.9. brn lthat, a fenti mikrobk a glicerint egy oxidcis lpst kveten
(glicerin-dehidrogenz enzim EC 1.1.1.6) a glikolzisen s a citrtkrn keresztl hasznostjk. Mind a
glikolzis, mind pedig a TCA-ciklus reduklt koenzimet termel (NADH2), amely aerob esetben a
terminlis oxidciban a lgkri oxign segtsgvel vz keletkezse mellett oxidldik vissza
(regenerldik). A felsorolt mikrobk egyik rsze fakultatv anaerob anyagcserj, azaz leveg
jelenltben is s anaerob krlmnyek kztt is kpes szaporodni, a msik rszk pedig obliglt
anaerob metabolizmussal rendelkezik. 1,3-propndiol azonban kizrlag az anaerob krlmnyek
mellett jelenik meg, mert lettani szerepe a terminlis oxidci ptlsa, azaz a koenzim visszaoxidlsa anaerob krlmnyek mellett.
Mindezek alapjn a kvetkez megfontolsok tehetk:
1) a termszetes termel trzsek nem alkalmasak ipari termelsre, mert A) patognek, B) sok
ms metabolit mellett kevs 1,3-propndiolt termelnek C) szubsztrt inhibci vagy
termkgtls ll fent, D) csak glicerinbl kpesek 1,3-propndiol ellltsra (a glicerin mint
alapanyag csak a biodzelgyrts elterjedse s a szennyezstr metanol, sk, kataliztorok
mikrobk kifejlesztsvel vlt jelentss).
2) A biotechnolgusok hziastott mikrobja, az Escherichia coli csak valamelyik termszetes
propndiol termel trzs enzimjeinek segtsgvel tehet kpess a propndiol-ellltsra, m
ehhez mg szksges valamilyen mikrobilis (Saccharomyces) gn s gntermk, amelyekkel
a glkzbl a glicerin elllthat.
3) Jl termel trzs kifejlesztshez teht ezttal nem a klasszikus izolls-screening-mutci
screening mveletsorral, hanem rekombinns technikval jutottak.
A termszetes 1,3-propndiol-termel trzsekbl 4 kulcsenzimet volt szksges az Escherichia coli-ba
tvinni: 1) gliceirn-dehidrogenz (GDH, EC 1.1.1.6, NAD+ koenzim segtsgvel a glicerint 1,3 Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

12

Ipari mikrobiolgia

dihidroxiacetonn alaktja; 2) glicerin dehidratz (GDHt, EC 4.2.1.30, amely B12 koenzim segtsgvel
gyks reakciban vizet hast le a glicerinrl); 3) 1,3-propndiol-oxidoreduktz (PDOR, EC 1.1.1.202,
amely reduklt NADH2 koenzim segtsgvel reduklja a vzkilpssel kapott 3-hidroxipropionaldehidet 1,3-propndioll (1.1.10. bra). Ezltal a sejten bell a glicerin diszproporcija
valsul meg.

1.1.9. bra: Az anaerob glicerin metabolizmus

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

H2C OH
O
H2C OH

DHA-foszft
Glikolzis

13

GDH

H2C OH
HC OH
H2C OH

DHA

Glicerin
NAD+

NADH2
H2O
H2C OH
HC OH
H2C OH
Glicerin

GDHt

HC O
CH2
H2C OH

PDOR

H2C OH
CH2
H2C OH

HPA

PD

1.1.10. bra: A glicerinmetabolizmus enzimei: GDH, GDHt, PDOR,


(DHA: dihidroxiaceton, HPA: hidroxipropionaldehid, PD: 1,3-propndiol)
A 4. kulcsenzim (ez idig rendszertanba nem sorolt) a GDHt kulcsenzim reaktivcijhoz
szksges, mivel a GDHt minden molekula talaktsa utn a B12 koenzimvel komplexben marad,
ahonnan ez az enzim szabadtja fel mind a koenzimet, mind a kulcsenzimet ATP energia segtsgvel.
Ahhoz, hogy glkzalapon lehessen 1,3-propndiolt ellltani, mg tovbbi 2 enzimre volt szksg:
G3DH (glicerin-3-foszft-dehidrogenz) s GPP (glicerin-3-foszfatz).
Ezekkel a gntvitelekkel mr kpess tettk az E.coli-t az 1,3-propndiol-termelsre, de mg
ipari hasznlatra nem volt alkalmas. A gyrtsba val bevons eltt a termkinhibci hatst ki kellett
kszblni (termktolerns mutnsok), illetve a mellktermkeket (tovbbi metabolitokat) termel
tvonalakat kellett minimalizlni. Mindezek vgre az elkszlt trzs 160 g/L PD-t is kpes
ellltani, ha a B12 koenzimet adagoljk (ezt nem termli az E. coli). Az 1,3-PD technolgija
kvethet nyomon az 1.1.11 hiperpicture-n.

1.1.11. hyperpicture: A rekombinns PD fermentcis technolgia


A technolgia els lpse a kis lptk oltanyag-elllts 2L-es rzatott lombikban. A
laboratriumi steril 2YT tpkzeget oltjk be a termel E.coli fenntart (ld. Trzsfenntarts, ferde
agaros kmcs, Petri-csszs tenyszet, liofilizlt ampulla) tenyszetrl. A fermentci 34C-on
zajlik, s egyb C-forrs hinyban a szerves nitrognforrsok szntartalmbl (tripton, leszt)
plnek fel a kultra sejtjei. A rzats a kevers mellett a levegztetst is biztostja. Mintegy 10h
tenyszid utn kerl az oltanyag az elksztett (tpkzeggel feltlttt lesterilezett) 1500 L-es
oltreaktorba. A rekombinns technolgia alkalmazsnak egyik htrnya, hogy a termel hasznos
mutnsok megtartsnak rdekben lland szelekcis nyomst kell fenntartani, s ezt ez esetben is
mint ltalban antibiotikum hozzadsval oldjk meg, mivel az antibiotikum-rezisztencia a
heterolg gnekhez van kapcsolva. Ebben a lptkben teht mr antibiotikum (Spectinomycin
250g/10m3) hozzadsval vdik a termelkpessg megmaradst, illetve tpkzegnek nem egy
hagyomnyos laboratriumi, hanem a termel trzsre optimlt tpkzeget hasznlnak. A fermentcit

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

14

Ipari mikrobiolgia

33-34C-on s pH=6,8-on vgzik 0,3VVM (DO=10%) levegztets mellett kevert levegztetett


bioreaktorban, szakaszos technikval 21h hosszan.
A termel reaktorban ugyanezen krlmnyek s 34%-os hozam mellett trtnik glkzalapon
42h hosszan az 1,3-propndiol fermentcija. A termkkpzst B12 koenzim hozzadsval (kt
rszletben) indukljk, mivel a gazdaszervezet (E.coli) nem kpes ennek szintzisre, ugyanakkor a
GDHt (2. kulcsenzim) aktivitshoz szksges. A termel reaktorban azonban a glkzt rtpllssal
biztostjk, s mintegy 10g/L krli rtken tartjk.
Az elkszlt fermentlevet visszasterilezs utn (75C-os inaktivls 45 p-en keresztl) tadjk a
feldolgozzemnek, ahol els lpsknt az ellt s rszben flokkullt sejtektl mikroszrssel
szabadulnak meg (termk a permetumban tallhat). Tovbbi membrn mveletekkel (ultra-, majd
nanoszrs) s ipari kromatogrfival szabadulnak meg elbb a fehrjk nagy rsztl, ksbb
valamennyi ksr szennyez anyagtl.
A fenti kt plda megmutatta, hogy a klasszikus vletlenszer mutci-szelekci folyamat s
rekombinns DNS technika miknt hasznosulhat technolgia szinten, illetve hogyan trlhetnek meg a
mikrobiolgiai trzsfejlesztsre fordtott forrsok.

1.2. (Ipari) Mikrobiolgiai mveletek


Minden iparban hasznlt mikroba se egy termszetbl szndkkal vagy vletlenl kivlasztdott
(=izollt) mikroba. Az ipari termkspektrum, illetve termelsi hatkonysg nvelse rdekben fontos
tovbbi hasznosthat metabolitok, illetve mikrobk felkutatsa, valamint gyakran a korbbinl
hatkonyabb termelk keresse. E folyamat hrom lpsbl ll: kinyers (izolls), szrvizsglat
(screening), azonosts (identifikci). E hrom mvelet igen szorosan pl egymsra, hiszen egy
fajokban ds termszetes lhelyrl nagyon sok fajta mikroba tenyszthet ki, ezrt a nagyobb
hatkonysg rdekben az izollst mr elszrssel kombinljk, vagyis az adott feladatnak
megfelel tulajdonsgokra szelektven trtnik az izolls.
Trzsizolls
A mikroorganizmusok legnagyobb szmban s diverzitsban a klnbz talajok fels rtegeiben
fordulnak el, de termszetesen (tenger)vzbl s levegbl is lehet mikrobkat izollni. A talaj
kulcsfontossgt a mikrobk izollsban mi sem tkrzi jobban, mint hogy a trzskeresssel s
fejlesztssel foglalkoz intzmnyek (trzsgyjtemnyek, gygyszergyrak) gyakran riznek
talajmintkat a vilg legklnbzbb helyeirl, s ezekrl indtjk az izollst.
Az izollsi technika fgg attl, hogy A) clzottan, egy a szakirodalom alapjn megfelelnek vlt
mikrobt talljunk, vagy B) minden potencilis mikrobt szeretnnk kinyerni, amelyek egy adott
tulajdonsggal rendelkeznek.
Szilrd mintbl
A szilrd mintbl/rl trtn izollst foglalja ssze az 1.2.1. bra.
A) Ha egy clmikrobt szeretnnk izollni, akkor az els szelektv lps lehet a minta klnbz
intenzits szrtsa, amelynek kvetkeztben elszr a vegetatv sejtek (hifk, baktriumok)
pusztulnak el, aztn az egyre kitartbb sprk is.
B) Ha minden kedvez tulajdonsg (pl. enzimtermel) mikroba potencilis kivlasztott lehet,
akkor nem clszer szrtssal frakcionlni a talajminta mikroflrjt.
A mintt teht elszrtssal vagy anlkl 1) folykony tpkzegbe juttatjuk, s hgts utn vagy
anlkl szlesztjk (soil-dilution-plate method), vagy 2) Petri-csszs agarlemez felsznre szrjuk, s
steril vzzel nedvestjk, majd sztkenjk (soil-plate method), vagy 3)steril plcval a mintafelsznrl
vesznk mintt, s ezt rintkeztetjk Petri-csszs vagy folykony tpkzeggel.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

15

1.2.1. bra: Izolls szilrd mintrl


Talajmintbl trtn izollst mutat be az 1.2.1. videofilm.

1.2.1. vide: Izolls


Brmelyik mdon is kerlt a minta rintkezsbe a tenyszt tpkzeggel, ltalban a homogenits
a cl, illetve inkublssal kinveszteni az izoltumo(ka)t.
Az izolls sorn preszelekci cljbl a tpkzeget klnbz adalkokkal egszthetik ki. Az
adalkok clja lehet a msfajtj mikrobk elnyomsa (pl. baktriumok izollsakor gombk,
penszek visszaszortsa), illetve a clmikroba irnti szelektivitst lehet gy nvelni (specilis
szubsztrtok sk alkalmazsa).
A klasszikus ipari mikrobiolgia sorn szintn talajmintbl izolltk a fbb antibiotikum termel
trzseket. Mivel az antibiotikumok ltalban gygyszerknt kerlnek piacra, ezrt az izollstl a
termk- (s profit) termelsig hossz t vezet, amely sorn a tiszta tenyszet izollst kveten

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

16

Ipari mikrobiolgia

fermentcis fejlesztseket (tpkzeg-optimls, pH-, hmrsklet-, cukorprofil stb. meghatrozsa),


biolgiai-, majd kmiaiaktivits-teszteket vgeznek, vgl toxikolgiai s klinikai vizsglatok (3
fzisban) utn kerl sor a piaci bevezetsre.
Folyadkmintbl
A folyadk fzis minta elnye, hogy knnyen rintkeztethet a tpoldattal, viszont ltalban
kevesebb csrt tartalmaz, ezrt els lpsknt dstsra van szksg. Ennek rdekben vagy 1) magt
a mintt inkubljk, s ezt kveten adjk a tpoldathoz, majd az jabb inkubci utn oltjk
agarlemezre, vagy 2) tpoldattal egytt inkubljk, s errl oltanak szilrd tptalajra, vagy 3) steril
szrmembrnon tszrik a mintt, s a membrnt inokulumknt adjk a tpkzeghez (oldatba vagy
agarlemezre).
Leveg-(gz)mintbl
Ez esetben a legkisebb a csraszm, ezrt itt 1) intenzv dstst alkalmaznak a gz tszrsvel vagy
2) nyitott Petri-csszs agarlemezzel exponlnak. Ilyenkor a nyitott s tpkzeggel tlttt agarlemez
rintkezik a gztrrel, s a benne lv mikrobk inkubci utn megjelenhetnek az agaron.
Az albbiakban klnbz rendszertani csoportok izollsakor alkalmazott krlmnyeket mutatjuk
be.
1. Fonalas baktriumok (Actinomyces-ek) izollsa
Elforduls: leggyakrabban a Streptomyces s Micromonospora fajok fordulnak el mezgazdasgi
talajokban, tavak folyk s tenger ledkeiben. Termofil fajtk silkban s komposztban
is megtallhatk. Az Actinplanes fajok (antibiotikum ((teichoplanin)) termel) avarbl s
talajbl izollhatak, klnlegessgk, hogy aktvan mozg sprkkal rendelkeznek,
amelyek kemotaxissal keresik meg a kedvezbb krlmnyeket (huminsav, KCl, kitin).
Streptosporangiumok (szintn antibiotikumtermelk) szraz, alkalikus talajbl izollhatak. Az Actinomycesek kz tartoznak a Corynebacterium-ok is (ld. Lizingyrts,
illetve 3. fejezet Actinomycetk).
Mintavtel: a talaj fels 4-5cm-es rszbl trtnik, a minta trolsa idelisan -2030C kztt
lehetsges. A minta kmletes szrtsval a konkurens Gram-negatv baktriumok
ellhetek, magasabb hmrsklet (120C, 1h) alkalmazsval pedig minden vegetatv
baktrium s gomba eliminldik.
Tpkzeg: gyakran gombal szerekkel (cikloheximid, nystatin) akadlyozzk meg az izoltum
penszesedst. Az adalkolssal az izolls cljaira a kemotaxis is kiaknzhat.
Szelektv sznforrsknt kolloid kitint vagy sk, vitaminok ksretben huminsavat
szoktak alkalmazni.
Kitenyszts: a mezofilek (Topt.:25-30C) 7-14 nap alatt nnek ki, a termofilek (Topt.: 45-50C) 2-5 nap
alatt.
2. Anaerobok izollsa
Elforduls: levegtl elzrt, gyakran extrm lhelyeken, mint pldul bendben (biogztermel
metanognek), mlytengeri ledkekben (Streptomyces griseus B12-gyrtshoz), gejzrekben, hforrsokban (termostabil enzimek Archea baktriumokbl (=sbaktriumok)
Mintavtel: Hungate technikval, amely rszletesen a www.dsmz.de weboldalon olvashat (szeptumos tenyszt ednyt injekcis fecskendbe zrt inert gzzal bltik t, majd szintn a
tn keresztl oltjk be, illetve vesznek mintt).
A szigoran anaerob mikrobk rzkenyek a lgkri oxignre (amely reaktv peroxid
gykket okoz a sejtben), ezrt a mintk kezelsekor a leveg teljes kizrsra kell
trekedni.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

17

Tpkzeg: szksges oxigniniktor (pl.: resazurin), s gyakran reduklt komponensek alkalmazsa


(ezek oxidldjanak a sejtkomponensek helyett), mint pldul: NaSH, DiTioTreitol
(DTT), cisztein stb.
Kitenyszts: Anaerob boksz gzadszorbenssel vagy gztr tblts oxignmentestett (oxignmentestett) (lugol oldaton tbuborkoltatott) inert (N2) gzzal (1.2.2. bra).
A gzadszorbens mkdhet gy, hogy citromsavat, mszkvet s diatma fldet kevernek
ssze, s nedvests utn zrjk be az anaerob tenysztednybe. Ekkor a diatma fld
megkti az oxignt, a savas kzegben a karbont CO2-t bocst ki, azaz kicserldik a
leveg oxignje CO2-ra.
Egy msik esetben az adszorbensbl H2 s CO2 fejldik, s elbbi palldiumkataliztor
mellett vzz reagltatja az oxignt.
Az inert gzzal trtn tbltst az edny msik csonkjnak megvkuumozsval is el
lehet segteni.

1.2.2. bra: Anaerob tenysztrendszerek


3. Fonalas gombk izollsa
Elforduls: heterotrf szaprofita fajaik talajban, illetve rothad szerves anyagokon tallhatk meg
minden gvben. Egyes fajaik szimbionita letformban zuzmkban, illetve mikorrhizban fordulnak el, de vannak parazitk is, amelyek a gazdanvnyrl, rovarrl, halrl,
emlsrl stb. izollhatak.
Mintavtel: mivel szinte mindenhol elfordulnak, ktfle megolds hasznlatos: 1) kolgiai
megkzelts: a kvnt tulajdonsgnak megfelel lhelyrl prblnak izollni (pl.:
termostabil gombkat hforrsokbl, vegyszerlebontkat szennyezett talajbl stb.) 2)
Taxonmiai (rendszertani) megkzelts: rokonok tulajdonsgai alapjn pl.: citromsavtermel faj rokonait is be lehet vonni izolls+screening programba jobb citromsavtermel keressekor. 3) Csaltek mdszer: lebontand anyagot prs melegbe helyezik, gy az megpenszedik, azaz olyan fonalas gombk kolonizljk, amelyek kpesek
lebontani s felhasznlni a csaltket.
Elkszts: kmletes szrtssal vagy htssel (+5 -18 C).
Tpkzeg: szles irodalommal rendelkeznek. ltalban enyhn savany (pH=4,5-6), magas Cforrs- tartalm tpkzegeket hasznlnak, amelyekben a N-forrs gyakran csak ammnia
vagy nitrt, de a leggyakoribb fonalasgomba-tptalajok szerves nitrognforrst is
tartalmaznak (pl.: PDA, kukoricaliszt agar, maltakivonat stb.). Ezek a tpkzegek
szelektvv vagy flszelektvv tehetk (100-200 mg/l) antibiotikum kiegsztssel,
illetve a gyorsan kolonizl (burjnz) penszek ellen adalkokkal kiegszthetek.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

18

Ipari mikrobiolgia

Fonalas gombk izollsnl s tenysztsnl komoly gondot okozhatnak az atkk,


amelyek a gombval tpllkoznak, s keresztbe fertzhetik a Petri-csszs kultrkat.
Inkubls: mezofilek: 25-30C 714 nap, termofilek: 45-50C 25 nap
A fonalas gombk klnbz rendszertani egysgei annyira klnbznek egymstl, hogy
izollsukban is eltrhetnek:
A) Ascomycetes, Deuteromycetes (Imperfekt): ubiquiterek (szles kr elforduls), jl
sporullnak, ezrt knny az izollsuk (aspergillusok, penicilliumok, fusariumok).
B) Basidomycetes:
makroszkopikusak: (kalapos, pffeteg, tapl) termtestbl, mikorrhizbl
trtnhet az izolls
mikroszkopikusak: (rozsda s szggombk ) mikorrhizbl, de nehz
fenntartani, mert csak az l gazdanvnyen szaporodik.
Jl trik a benomylt (gombaellenes nvnyvdszer),
ezrt 0,5-5mg/l benomyl melletti izolls esetn javarszt
ezek nnek ki, a tbbi gomba visszaszorul.
C) Zygomycetes: ezek is ubiquiterek, s a legburjnzbb nvekedsek. A Petri-csszn ltalban
az els kinvk (Mucor, Rhizopus, Trichoderma)
A fonalas gombk izollsnak jelentsgt szles kr felhasznlsuk is indokolja (1.2.1. tblzat)
1.2.1. tblzat: Fonalas gombk ipari felhasznlsa
Elsdleges metabolitok

Msodlagos metabolitok

Enzimek ellltsa

Tradicionlis lelmiszerek
Egyb

Fonalas gomba
Aspergillus terreus
A. niger
A. niger, Yarrowia lipolytica
Eremothecium ashbyii
Aureobasidium pullulans
Saccharomyces cerevisiae
Penicillium chrysogenum
Cephalosporium acremonium
Aspergillus fumigatus
Claviceps purpurea
Penicillium sp.
A. niger
A. oryzae
A. awamori
Mucor sp.
Mucor, Rhizopus
kevert tenyszet
Trichoderma polysporum
Rhizopus, Fusarium

Termk
Itakonsav
glkuronsav
citromsav
riboflavin
pullulan
etanol
penicillinek
cefalosporinok
fumagillin
ergot alkaloidok
griseofulvin
lipz
-amilz
glucoamylase
rennin
ragi
shoyu
ciklosporinok
szteroidkonverzik

4. lesztgombk izollsa
Elforduls: fermentatv fajaik, amelyek cukrok felhasznlsval nyerik a szksges energit,
cukortartalm gymlcskn, bogykon, virgokon tallhatk meg. Ezek esetben
tbbnyire a terminlis elektronakceptor nem a lgkri oxign, hanem a cukormolekula
degradcis termkei (gy keletkeznek az elsdleges metabolitok.)
aerob fajaik: nehezen fermentlhat C-forrsokon tallhatk fleg meg, mint pldul
C4-C5, metanol, etanol, s klnbz poliolok (nvnyeken, gombkon, rovarokon,
kevs a talajban, nmely azonban csak ott).
Mintavtel: steril zacskba, vegbe kell gyjteni a mintt, amely nem trolhat jl. Talajminta esetn
a fels 10 cm-bl clszer az izollst vgezni.
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

19

Elkszts: dsts lehet szksges: pH=3,5-4 rzatott lombikban (levegztetve), gy elszaportva.


Tpkzeg: Maltakivonat (maltextract), krumplifzet (potatoe-dextrose-agar, PDA), de a pH 3,8 kell
legyen, azaz savasabb, mint a fonalas gombknl. 50200 mg/l kloramfenikol
hozzadsval baktriummentes izoltum nyerhet. ltalban ozmotolernsok, azaz 3040% glkz mellett is tenyszthetk
Inkubls: mezofileket 20-25C-on, a pszichrofileket 10-12C-on szkses tenyszteni.
A kvetkez kt csoport rendszertantl fggetlen, ezrt egyarnt tartalmaz baktriumokat, gombkat
stb-t.
5.

Alkalofilek izollsa

Az alkalofilek lgos pH optimum mikrobk, jelentsgk az antibiotikumok, mosszerenzimek


gyrtsban van.
Elforduls: alkalikus (szikes) talajok
Mintavtel: szilrd mintbl/rl
Elkszts: vizes szuszpenzi
Tpkzeg: glkz vagy kemnyt, peptonnal lesztkivonattal, skkal kiegsztve, pH=8,5-12
Kitenyszts: ltalban mezofilek, gy 30-37C-on 2-3 nap alatt rhet el.
6. Termofilek izollsa
A termofilek magas hmrskleti optimummal (55-75C) rendelkez mikrobk.
A termofilhmrsklet-optimum a mezofil s az extrm termofil kztt helyezkedik el, s
klnbzik a termotolerns fogalomtl: mg elbbieknl az optimlis nvekedsi hmrsklet alapjn
trtnt a besorols, addig a termotolerns csak elviseli (esetleg nvekszik is) a magasabb hmrskleten, de messze nem maximlis sebessggel szaporodik s termel. A termofilek kztt baktriumok, gombk s sbaktriumok is megtallhatk, mint ipari termel vagy enzim-, illetve gnforrs
mikroorganizmusok:
-

fonalas gombk: mivel 55-60C kztt szmos gomba izollhat, de 62C-on mr egy sem,
gy tnik, hogy az eukaritk nvekedsnek 60C krl korltja van, amelynek oka
felteheten, hogy nem tudnak termostabil jl funkcionl bels membrnokat ltrehozni
[166]. Termofil fonalas gombra plda a Thermomyces lanuginosus (50C optimummal
[167]), a Sporotrichum thermophile (45-50C [168]), s a Rhizomucor miehei (35-45C
[169]).
baktriumok: thiobacillusok (acidophilek), bborbakt: (fotoszint), cianobakt, actinomicetk.
tovbb algk, protozok, sbaktriumok

Elforduls: geotermikus hforrsok (gejzrek), spontn meleged szubsztrtok (sil), fttt krnyezet
(ermvi htvz), talaj, desvzi s tengeri ledkek (1.2.2. tblzat)
Mintavtel: gyakran obligt anaerobok (pl.: Thermotoga maritima), hiszen vagy az lhelyk
levegtl elzrt, vagy a magas hmrskleten nem olddik be az oxign a vizes kzegbe,
ezrt a mintavtelhez Hungate-technika (ld. Anaerobok izollsa) javasolt.
Elkszts: prologtat szksges, hogy ne szradjon ki a tenyszet a magas hmrskleten
Tpkzeg: komplex tpkzeg ajnlott, amelynek sszettele az eredeti lhelynek megfelel
(mlytengeri, vulkanikus stb.). A szoksos szilrdt gens (agar-agar) legfeljebb 65C-ig
hasznlhat, efelett gelln gumi (100C) vagy gelrite (+Ca2+ s Mg2+ sk) hasznlata
javasolt a magasabb olvadspont miatt.
Inkubls: prologtat, esetleg anaerob kamra lehet szksges.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

20

Ipari mikrobiolgia

1.2.2. tblzat: Termofil mikroorganizmusok lelhelyei


Lelhely
Geotermikus hforrsok
(savas-semleges-alkalikus)

Spontn meleged szubsztrtok


(silk, komposztok)

Tovbbi fttt krnyezetek


(ermvi htvz, konzervek stb.)
Nem fttt szubsztrtok
(talaj, por, leveg, ledk)

faj
Thermoproteus spp.
Thiobacillus spp.
Clostridium spp.
Thermoanaerobium spp.
Thermus spp.
Bacillus spp.
Thermotoga spp.
Bacillus spp.
Thermoactinomyces spp.
Streptomyces spp.
Thermomyces spp
Talaromyces spp.
Thermoascus spp.
Clostridium spp.
Thermomonospora spp.
Thermus spp.
Dactilarya spp.
Methanospirillium spp.
Methanogenium spp.
Thiobacillus spp.
Bacillus spp.
Lactobacillus spp.
Clostridium spp.

baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
sbaktriumok
baktrium
baktrium
fonalas baktriumok
fonalas gomba
fonalas gomba
fonalas gomba
baktrium
baktrium
baktrium
fonalas gomba
sbaktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok

Trzsfenntarts
A termszetbl izollt s/vagy mutcikkal nyert szntenyszetek fenntartsa szintn kiemelked
fontossg terlete az ipari mikrobiolginak. Gondoljuk csak meg, hogy egy mkd zemnl, ahol
lehetleg sajt izolls vagy fejleszts termel mikrobt alkalmaznak, micsoda kvetkezmnye
lenne a termel trzs elvesztsnek, tnkremenetelnek. Ennek szem eltt tartsval teht a
trzsfenntarts clja, hogy eredeti llapotban, azaz ugyanolyan szaporod s termelkpessg
formban tartsa fenn a termel trzset az zem indtstl a bezrsig, kedvez esetben akr
vtizedekig (persze kzben mindig kicsit jabb s jabb fejleszts sejtvonalat hasznlnak, de a trzs
ltalban azonos marad).
Az izoltumok eltartsra ktfle md ltezik: A) inaktv, s B) aktv formban.
Az aktv formban trtn trzsfenntartst mutatja be az 1.2.3. vide.

1.2.3. vide: Trzsfenntarts aktv formban


Az inaktv forma jelenti a termszetes szaportkpletek (pl.: sprk) eltartst klnbz
megoldsok segtsgvel (folyadkszuszpenziban, szilrd hordozra adszorbeltatva, micliummal
egytt megszrtva stb.).
Az aktv forma jelenti a nagyobb kihvst, hiszen ilyenkor a vegetatv sejtek fenntartsrl
beszlnk, amelyek rzkenyek a krnyezeti hatsokra, s br lassan, de szaporodnak, ami pedig a
genetikai vltozs (mutcik) veszlyt is magban hordozza. A vegetatv sejtek legjobban eltarthat

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

21

aktv formja a liofilezst (fagyasztva szrtst) kveten kapott sejtpor. Az eljrs lnyege, hogy
kmletes fagyasztst kveten a tpkzegbl s a sejtekbl egyre nagyobb vkuum alkalmazsval
elszublimltatjk a jeget, s vgl csak a szrazanyag-tartalomnak megfelel por marad vissza. A
kmletes fagyaszts kvetkeztben azonban a sejtmembrn nem srl, gy steril folyadk (vz,
fiziolgis soldat, puffer vagy tpkzeg) hozzadsval a sejtek rehidratlhatak, s ismt
tenyszhetek. Ezt az eljrst hosszabb tv (vtizedes) trols esetn alkalmazzk, pldul a
trzsgyjtemnyekben, gy az onnan beszerzett mikrobk rendszerint ilyen formban kerlnek a
megrendelhz.
A mindennapi hasznlat sorn azonban aktvan nv tenyszeteket hasznlnak, amelyek
szaporodsi sebessge a htszekrny 6-10C-os krnyezetben rendkvl lelassul, gy ltalban kb. 1
hnapig eltarthatk tlregeds nlkl. Ehhez Petri-csszbe nttt, megszilrdtott (pl.: agaros)
tpkzeget lehet alkalmazni, vagy helytakarkossg okn, illetve anaerob esetekben kmcsben s
esetenknt ferdn szilrdtott tpkzegen trtnik az eltarts. Az anaerob esetekben a tenyszet fl
paraffinolaj rtegezse is bevett szoks, illetve gyakran a szoksos agarfelsznre olts helyett olttvel
szrt tenyszeteket hoznak ltre (1.2.4. bra).

1.2.4. bra: Ferdeagaros, anaerob s szrt tenyszetek, Petri-csszk s oltkacsok


Az ilyen formban trolt tenyszetekrl val toltssal egyrszt a termel fermentcik
inokulumai kerlnek beoltsra, msrszt az regeds ellen is a trolt tenyszetet t kell idrl idre
oltani. Az toltst steril flke alatt vrs izzsig legetett steril oltkaccsal vgzik autoklvban (vagy
egyb mdon) sterilezett tpkzegre. Az tolts utn inkublni kell a tenyszetet, amg megjelennek a
telepek s/vagy a cskozott tenyszetek, majd ezt kveten kerlnek vissza a htszekrnybe jabb 1
hnapos fenntartsra, vagy esetleg idkzben fermentci indtshoz val felhasznlsra.
Trzs-screening
Az elbbiekben bemutatott mikrobaizollsi eljrsokkal klnbz fajtj, kpessg, eredet s
tulajdonsg mikrobk tucatjaira tehetnk szert ltrehozva egy trzsgyjtemnyt. Amikor azonban
ezek kztt keresnk egy adott tulajdonsggal rendelkezt, akkor ezt a tbb tucat mikrobt kell
szrvizsglat al vetni. Az ilyen vizsglatok jellemzje, hogy adott tulajdonsgot keres, lehetleg
gyorsan, tbb szz minta analzisn keresztl. Az ipari mikrobiolgiban a szrvizsglatot jobb
termelkpessg egyedek keressre is hasznljk, ilyenkor teht nemcsak a kvalitatv szrvizsglatot, hanem a kvantitatvot is el kell vgezni, azaz nem elg kivlogatni a termel- kpes
mikrobkat, hanem a legjobb termelkpessgeket kell kivlasztani (a legnagyobb hozamt,
produktivitst, vgtitert.
A szrvizsglat teht nagyfok automatizltsgot kvnna meg, mivel nagyszm mintt
lehetleg gyorsan s kvantitatv esetben pontosan kell elemezni. Ugyanakkor minden feladat ms
termszet, ms indikcij, teht nem lehet rutinfeladatknt vgrehajtani. A szrvizsglatok els
lpcsjben (ltalnos vizsglat nem optimlt krlmnyek mellett) mg minden potencilis jelltet ki
kell szelektlni, a bizonytalanokat is, amelyek a ksbbi lpcskn esetleg elvreznek, de az is lehet,
hogy optimlt krlmnyek kztt azok lesznek a legjobb termelk. Ezrt szksges az automatizlt
szrvizsglatok manulis felgyelete, esetleg fellbrlata is.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

22

Ipari mikrobiolgia

A nagy hatkonysg s kapacits analitikval elltott szrrendszereket HTS-nek (High


Throughput System) nevezzk.
A szrvizsglati mdszer nagyban fgg attl, hogy milyen cltulajdonsgot keresnk (pl.: 1.
adott enzimtermel mikrobt, 2. primermetabolit-termelt, 3. valamely szekunder metabolitot termel
mikrobt).
A klasszikus szrvizsglatok sorn enzimtermel mikrobk keressekor alapveten az
enzimaktivits-mrssel (assay) azonostjk a termelket, illetve szelektv tpkzeggel segtik ezek
izollst is. A primermetabolit-termelket klasszikusan szelektv tpkzegen vizsgljk, s valamilyen nagy kapacits s hatkonysg analitikai mdszerrel (GC, HPLC) kvetik nyomon a
metabolitok keletkezst. Ugyanez igaz a klasszikus szekunder metabolitot termelk screeningjre is,
azzal kiegsztve, hogy esetkben tovbbi analitikai vizsglatokat is vgeznek, mint pldul a
biolgiai aktivits s MIC- (minimal inhibitory concentration) meghatrozs.
A modern eljrsok a screening vizsglatokat miniatrizltk, s egy kb. 10x16cm-es manyag
lap 96 furatban prhuzamosan vgezhetv tettk. Ehhez szksges, hogy valamilyen indikcija
legyen a pozitv eredmnynek (pl.: sznreakci), amelyet egy plate-reader (lemezleolvas)
fotomterrel s a hozzkapcsolt megfelel szoftverrel lehet kirtkelni (1.2.5. bra).

1.2.5. bra: Microplate reader HTS szrvizsglathoz


Klasszikus mdszerek a szrvizsglatokhoz
A) Enzimtermelk szrse
Protezok termelshez a proteolitikus aktivits indikcija szksges, ezrt a tptalajba
kicsapott fehrjt kevernek. A pozitiv eredmnyt a telep krl megjelen tisztulsi zna adja,
mivel a kicsapott turbid fehrjt feloldja a protez termel izoltum.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

23

A kemnytbont amilztermel mikrobk izollsa hasonl elven trtnik, de a kicsapott


fehrjk helyett vzben nem oldod (=emiatt turbid) kemnytt alkalmaznak, s az amilztermel mikrobk ezt oldjk fel szintn tisztulsi znt eredmnyezve a telep krl.
Az ipari szempontbl rdekes tovbbi kt enzim (cellulz s lipz) esetben is ugyanezt az
elvet alkalmazzk, elbbi esetben cellulzrostok, utbbi esetben olaj emulzi feloldsa
eredmnyezi a tisztulsi znt a pozitv telepek krl.
A legnagyobb enzimgyrtk egyike a Novo, amelyik az 1970-es vekben mosszerenzimek
ellltsa cljbl keresett termostabil alkalikus protezokat. Ennek okn az alkalikus
talajmintkat kmletesen megszrtottk, gy a vegetatv sejteket elltk, csak a sprs
mikrobk maradtak izollhatak. Az ezutn kinv telepeket pH=9-10-re lltott, kicsapott
haemoglobint tartalmaz agarra vittk, s 45-50C-on inkubltk. A kintt telepek kzl a
kioltsi (tisztulsi) znval rendelkezket tovbb vizsgltk. Mivel a lombikos fermentcik
sorn kapott proteolitikus aktivits nem korrellt a tisztulsi zna mretvel, a kisebb znj
telepeket is rdemes volt tovbb vizsglni.
B) Primermetabolit-termelk keresse
Az elsdleges anyagcseretermkeket hatkonyan elllt mikrobk izollsakor kt mdszert
hasznlnak. Az egyik (ld. bioautogrf mdszer 1.1.3. animci) szerint a keresett metabolitra
hinymutns mikrobt hoznak elszr ltre random mutagenezissel, majd ezt szuszpendljk a
tptalajba. Az izoltumok roltsa utn inkubljk, majd az izoltumokat UV-val ellik, s
jabb inkubci kvetkezik a hinymutnsok tenysztsre. Ezek csak ott tudnak kinni, ahol
az izoltum a hinyz keresett metabolitot elzleg megtermelte, gy itt nem tisztulsi znt,
hanem j telepet kerestek. Ennek a mdszernek egyszerbb formja, ha ltezik olyan
termszetes trzs, amely a keresett metabolitot tovbb hasznostani tudja, gy nem kell
hinymutnst ltrehozni. Erre plda a tejsavtermelk keressekor propionsav baktriumok
hasznlata (ld. 2.1. C3 metabolizmus).
A msik mdszer a szerves savak nem specifikus indikcijra alkalmas. Ebben az esetben
mszkport (CaCO3) kevernek a tptalajba, amelyet a kpzdtt szerves savak feloldanak
ismt tisztulsi znt eredmnyezve.
C) Szekundermetabolit-termelk keresse
A fermentcis ipar trtnetnek legtbb szekunder metabolitja az antibiotikumok kz
tartozik. Az ezek ellltshoz szksges termel mikrobk keressekor a tptalajba a
szenzitv mikrobt szuszpendltk, amely ellen hatkony antibiotikumot kerestek. Az
antibiotikum termel izoltumok krl kioltsi znt lehet tapasztalni.
Az antibiotikumok detektlsra agarkorongos mdszert szoktak hasznlni, amely mdszert
szintn lehet screening clra adaptlni. Az agarkorongos mdszer sorn egy steril
paprkorongot titatnak az antibiotikummal, s olyan tptalajra helyezik, amelybe a szenzitv
mikrobt elre szuszpendltk, s ismt kioltsi znt vizsglnak inkubci utn.
Modern HTS szrvizsglatok
A) Enzimtermelk szrse megoldhat kapcsolt enzimes reakcival, ahol a kapcsolt reakci
szubsztrtja vagy koenzime (pl.: NAD+/NADH2 340nm-en mrhet) nyomon kvethet
fotometrisan.
Hasonlan optikailag kvethet a kromogn vagy fluorogn szubsztt vagy szubsztrt
analgok hasznlata a clenzimet termel mikrobk esetben. Ilyenkor a fent bemutatott
kszlkben (1.2.5. bra) nagyszm izoltumot lehet nyomon kvetni specilis lemezeken
(plate), amelyek furataiba a kromogn/fluorogn szubsztrtot/szubsztrtanalgot elre
adszorbeltatjk, gy a pozitv vlaszt ad izoltumokat a platereader (lemezolvas) kszlk
azonostani tudja.
B) Esetenknt kromogn/fluorogn szenzorokat alkalmaznak az elbbihez hasonl reakcik
kimutatsra mikrotiterlemez-olvas kszlk helyett.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

24

Ipari mikrobiolgia

C) Szintn a modern mdszerek kz tartozik a microarray technika. Ehhez fejlett


bioinformatikai adatbzisra van szksg, mivel a mdszer elve, hogy a keresett tulajdonsgot
kdol gn klompenter DNS-t kromogn/fluorogn jelzssel elltva adszorbeltatjk egy
mikrolemezre (DNS chip), s az izoltumokkal egytt inkubljk. Ezt kveten a nem
ktdtt, jelzett DNS-t eltvoltjk, s a kttt DNS-eket detektljk (pozitv izoltumok
esete).
D) Gyakran nincs lehetsg a keresett tulajdonsg azonnali in-situ indikcijra az inkubcival
paralell, ilyenkor a HTS rendszerek csak a nagyszm kis trfogat minta tenysztsre
hasznlhatk, s a tenyszts vgn online vagy off line analitika (GC, HPLC, MS,
infraspektroszkpia, NMR stb.) szksges.
Az albbiakban nhny ipari pldt mutatunk be termel trzs szrvizsglatban trtnt szelekcijra.
1.

Antibiotikum-termelk szrsre bevlt mdszer, hogy a potencilis termeltrzzsel egy


agarlemez kb. 1/3-ad nagysg krszelett oltjk be, s az inkubci sorn a biomasszakpzds mellett az esetlegesen termelt antibiotikum az agar be nem oltott rszei fel is
diffundl. Az els inkubcit kveten tesztorganizmusokat oltanak a be nem oltott 2/3-adra,
s ismt inkubljk az agarlemezeket. A tesztorganizmus(ok) nvekedsbl megllapthat,
hogy volt-e s milyen mrtk antibiotikum-termels (tbb antibiotikum messzebbre
diffundl, rvidebb teszttelep 1.2.6. bra).

1.2.6. bra: Antibiotikum-termelk szrvizsglati tesztje


2.

Egy japn gygyszergyrban j enzimtermel mikrobt kerestek szrvizsglattal. A cl a 7aminocephalospornsav (7-ACA) oldallnc-mdostsval flszintetikus cephalosporinszrmazkok ellltsa volt, amihez 7-ACA-deacetilz enzimre volt szksg. A 7-ACADA
enzimtermelk kivlogatsa rdekben a tptalajba 7-ACA-t adtak egyedli sznforrsknt,
gy csak az ennek hastsra kpes mikrobk szaporodhattak el. A vizsglt klnbz fajok
kzl a Rhodotorula glutinis leszt kerlt ki gyztesen a feladatra.

3.

Enziminhibtorok keressre sikerrel alkalmaztk a mikrotiter mdszert, amelynek felttele


valamilyen kis lptkben is alkalmazhat sznreakci. A -laktamz inhibtorok keressekor
az enzimaktivits-cskkenst kvettk nyomon valamilyen sznreakcival (pl.: penicillin
esetben a -laktamz enzimaktivitsnak eredmnyeknt keletkez penicilloinsav szthiometrikusan oxidlhat jddal, gy a kemnyt-jd kk komplexe elszntelenedik, -laktamz
inhibtor jelenltben kk marad).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

25

4. A gygyszergyrts sorn gyakran szksges a gygyts elrshez valamely receptor


blokkolsa vagy egy anyag receptorhoz ktsnek megakadlyozsa kompetitiv receptor
antagonistval. Az erre alkalamas metabolitok keressekor ltalban a receptort kipreparljk
s mikrotiterlemezre immbolizljk sznreakcival kombinlva.
5. j biotranszformcikhoz szksges mikrobk szrvizsglatra plda a mltbl s a jelenbl
is [6] a compactin-pravastatin talakts esete. A compactin egy penicilliumok fermentcijval elllthat vegylet, amelybl szelektv hidroxilezssel pravastatint lehet ellltani,
amely a mj koleszterinszintzist szelektven gtolja, ezzel elsegtve a kardiovaszkulris
betegsgek gygytst. A szrvizsglat sorn klnbz sznforrsok mellett 500 mg/L
compactint adtak az agaros tpkzeghez, s tbb mint 100 compactin rezisztens mikroba kzl
sikerlt kt j hidrexilez aktivitst kivlasztani (Pseudonocardia autotrphica, Streptomyces
griseolus).
6. A szrvizsglatokat egyre gyakrabban alkalmazzk olyan metabolitok keressre, amelyek az
immunrendszerre hatnak (pl.: immunszupressznsok). Ilyenkor a screening sorn a fehrvrsejtekkel (limfocitkkal) val reakcit vizsgljk.
7. Az agrr-biotechnolgia terletn rovarkrost metabolitokra vgeznek gyakran szrvizsglatokat. Ilyenkor a screening rendszer a clrovart vagy annak hernyjt is alkalmazza.
Mikrobiolgiai szrvizsglatokat alkalmaznak tovbb j gyomirtszerek, haszonnvnynvekedst serkent (auxinhats) metabolitok keressre is tesztnvny screeningbe iktatsval.
Gyakran van szksg egy ismert hatanyag jogvdett ellltsnak alternatvjra is, ilyenkor
szintn szrvizsglattal keresnek msik termel mikroorganizmust.
Vgezetl meg kell emlteni, hogy a trzsfejleszts (ld. Trzsfejleszts) sorn is alkalmaznak
szrvizsglatokat az j mikrobk kztt a kedvezbbek kiszrsre.
Identifikci
A mikrobiolgiai azonosts (identifikci) clja az j izoltumok rendszertani meghatrozsa,
besorolsa. Ehhez szmos tulajdonsgot kell megvizsglni, amelyekkel az adott faj egyrtelmen
meghatrozhat.
A rendszertan (taxonmia) valamilyen hasonlsgaik alapjn rendszerezi az llnyeket.
A(z ipari) mikrobiolgia hskorban a rendszertani besorolshoz a kls megfigyelsek s (ksbb) a
biokmiai tulajdonsgok alapjn osztlyoztk a mikroorganizmusokat. Napjainkban a rendszertan
talakuls alatt van, mert a modern gntechnikk lehetv tettk a molekulris (gn) szint rokonsgok
feltrkpezst, s ez gyakran eltr a klsleg megfigyeltektl.
Meg kell jegyezni, hogy az ipari mikrobiolgia terletn gyakran szksges ugyan az j
izoltumok azonostsa, m sok esetben ezeket a kltsges s munkaignyes vizsglatokat nem, vagy
csak rszben vgzik el iparjogvdelmi clzattal, hogy ne lehessen knnyen lemsolni a technolgit.
A klasszikus rendszertani besorolshoz a kvetkez vizsglati szempontok szerint rjk le az
izoltumokat:
makroszkopikusan: telep morfolgija, szne, szaga, mrete
mikroszkopikusan: A) vizulisan: sejt mrete, alakja, mozgsszerve, sejtmagja
B) mikrobiolgiai festsekkel: Gram-fests (sejtfal), sprafests, csillsznezs,
tokfests stb.
biokmiai reakcik: oxidzprba (aerotolerancia), tovbb indol-, urez-, knhidrogn-, arginin-,
xilz-, ammoncitrtprbk, aerob/anaerob dextrz fogyasztsa.
A rendszertannal bvebben foglalkozik e jegyzet a 3. fejezetben.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

26

Ipari mikrobiolgia

Trzsfejleszts
A fermentcis iparban kevs termszetbl izollt eredeti mikrobt hasznlnak. Mivel egy
fermentcin alapul technolgia kltsgt alapveten befolysolja a termel mikrobatrzs
hatkonysga (hozam, produktivits, vgtiter), ezrt klnsen a rgebbi technolgik az eredeti
termel trzset mra mr jelentsen tovbbfejlesztettk. Noha a felsorolt 3 kulcsparamter (hozam,
produktivits vgtiter) jelentsen javthat technolgiaoptimlssal (pH, oldott oxign, hmrsklet,
kevers, lptk stb.), de csak bizonyos korltokig, m jobb termel trzzsel optimls utn mg sokkal
jobb hatkonysg rhet el.
Mivel a fenotpusos tulajdonsgokat a genom (genotpus) hatrozza meg, ezrt ezt kell megvltoztatni a fejleszts rdekben.
Klasszikus trzsfejleszts

1.2.7. vide: Klasszikus trzsfejleszts


A klasszikus technika vletlenszer mutcik segtsgvel vltoztatta meg a termel mikroba
genomjt, majd a megvltozott kpessg utdok kzl szelektlta a jobban teljestket (=random
mutagenezis+screening). Ilyen UV-val generlt random mutagenezist mutat be az 1.2.7. vide. A
vletlenszer mutcik generlsa, majd a kedvezbb klnok szelekcija azt eredmnyezi, hogy a
kvnt cl elrshez igen nagyszm mutnst kell ltrehozni, s gy igen sok mutns utd kzl kell
kiszrni a jobban teljestket. Ez azt is jelenti, hogy noha a termelsi krlmnyek eltrnek a
laboratriumitl, mgis kizrlag kis lptkben lehet gazdasgosan trzsfejlesztst vghezvinni. A
laborlptkben jl teljest mutnsokat azutn fokozatos lptknvelssel (pilot plant =ksrleti (fl)
zemi lptken keresztl) lehet a termelsi szintre juttatni.
ltalban a trzsfejleszts olyan ciklikus folyamat, ahol a fent lert random mutagenezis+screening
kombincit folyamatosan ismtlik.
Az egyetlen lehetsg a vletlen mutcik irnytsra a szelekcis nyoms alkalmazsa, azaz
olyan krlmnyek alkalmazsa, amely mr a clnak megfelel mikrobk kitenysztst segti, a nem
megfelelkt htrltatja.
A modern gntechnolgik lehetv tettk, hogy a korbbi vletlenszer (random) mutcik
helyett clzott genetikai vltozst lehessen eszkzlni, s gy a vizsgland mutnsok szma is
radiklisan lecskkent, ami a trzsfejleszts (kltsg)hatkonysgt nagyban megnvelte. A clzott
genetikai beavatkozsokhoz ismerni kell a genom s a funkci kapcsolatt, az anyagcsereutakat s
azok szablyozst (gn azaz expresszi szint szablyozs, vagy fehrje szint szablyozs
(aktivtor/inhibtor), elre/visszacsatolsok)
Noha hatkonysga kisebb, mgis napjainkban is gyakran hasznlt mdszer a klasszikus
mutagenezis+screening kombincija a trzsfejleszts cljbl. A random (vletlenszer) mutcik
elidzsre kmiai vagy fizikai mutagneket alkalmaznak. Mg fizikai behatsknt UV besugrzst
szoks alkalmazni, a leggyakoribb kmiai gens a nitrozoguanidin (ami a DNS-t vltoztatja meg),
illetve bzisanalgok, amelyek hibs DNS-replikcit eredmnyeznek, valamint a frame shift
mutagnek (ltalban akridin festkek, amelyek eltoljk egy vagy nhny bzisprral a leolvassi
kdot).
Br a random mutagenezis+screening rendkvl egyszer (s olcs, ezek miatt hasznlatos mg
ma is), komoly kihvst jelent a megfelel mutagn dzis megtallsa. Tl nagy dzis esetn annyi
mutci jut egy sejtre, hogy az elpusztul, s a mutcik utn nem marad tll. Tl alacsony dzis
pedig nagyon kisszm mutcit eredmnyez, amelyek kztt kisebb valsznsggel tallhat
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

27

kedvez fenotpus egyed. Az UV sugrzsnl a besugrzsi id s a fny intenzitsa a kt


optimlhat paramter, amelyek fggenek a gazdaszervezettl. A kmiai mutagneknl az egyik
paramter a kontaktid, a msik a mutagn koncentrcija.
Mivel ezek fajtl fggetlenl a DNS-t vltoztatjk meg, ltalban rkkeltek!
A random mutcit kvet szrvizsglat is ktfle elven trtnhet: A) a random mdszer minden
izoltumot megvizsgl termelkpessgre, mg a B) racionlis mdszer valamely biokmiai
tulajdonsghoz kti a termelkpessget, s ezt a biokmiai tulajdonsgot monitorozza (pl.:
antimetabolit rezisztens trzsek sokkal tbb metabolitot termelnek, ha tllnek).
Modern trzsfejleszts anyagcsere-mrnksg (metabolic engineering) [21]
A modern trzsfejleszts sorn a genetikai eszkzk kihasznlsval a klasszikus vletlenszer
(random) genomvltozsokat lehet kivltani clzott vltoztatsokra. Ezltal jelentsen megn az
eslye a kvnt tulajdonsg mikroba elrsnek (nem kell sok vletlen mutcira vrni), s jelentsen
lecskken a flslegesen vizsglt (a nem megfelelen mutldott) mintk szma. Ezzel egytt is a
modern trzsfejleszts a klasszikushoz hasonlan gyakran cirkulris (ismtld) mveletsorbl ll
(1.2.8. bra)

1.2.8. bra: A modern trzsfejleszts vzlata


A fejleszts a meglv trzs metabolikus fluxus analzisvel kezddik, majd ennek mdostst
kell megtervezni a clnak megfelelen (mellktermkkpz tvonalak kikapcsolsa, j tvonal
gnjeinek bevitele, kofaktoregyensly megtartsa stb.), majd a szintzis sorn a terveknek megfelel
mikrobt lehet ltrehozni. Ezt kveten ismt analzisre van szksg, s esetleg ennek sorn tovbbi
fejleszts (tervezs+szintzis) lehetsge merl fl, illetve kiderlhetnek olyan, korbban ismeretlen
szablyozsi mechanizmusok, amelyek a megvltoztatott genom kvetkeztben megzavarjk,
megvltoztatjk a mikroba valdi metabolizmust a tervezettl eltren.
Azokban az esetekben, amikor heterolg fehrjeexpresszira van szksg a termel mikroba
kialaktshoz (azaz pl.: j termket kell ellltani egy adott gazdaszervezettel, vagy ki kell
terjeszteni a szubsztrt spektrumt), a metabolic engineering folyamat metabolikus tvonaltervezssel
kezddik. Ez tartalmazhat empirikus terveket vagy kivitelezhet in silico analziseket, azaz a sejtek
rszletes metabolizmus modelljt. Ezutn az tvonaltervezs utn a tervezett trzs elksztse, majd
tovbbi optimalizls kvetkezik a metabolic engineering ciklus szerint.
Mg a molekulris biolgia gyors fejldsvel a szintzislps sok esetben viszonylag triviliss
vlt (mg ha az ipari trzsek fejlesztse az alacsony transzformcis hatkonysg miatt fradtsgos is),
addig a gyors s hatkony iparszer krnyezetben vgezhet fenotpus-meghatrozs eszkzei az
analzis lpshez hinyosak. A teljes genomszekvencik rendelkezsre llsa j HighThroughput
System (HTS) analitikai technikkat eredmnyezett a transzkriptom, proteom, metabolom szmra.
Ezek a technikk azonban tovbbi finomtsra szorulnak, hogy a szablyozkat azonostani lehessen,
amelyek kulcsszerepet jtszanak a msodlagos anyagcsere tvonalak fluxusainak szablyozsban.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

28

Ipari mikrobiolgia

Mivel ezen a terleten gyakran esik sz egy szervezet valamilyen tpus molekulinak
sszessgrl, ezrt ezekre a kszletekre a gngenom analgijra -om vgzdssel (angolban
omics) bevezettek tovbbi fogalmakat. A gngenom fell indulva az RNS-kszlet kvetkezik
transzkriptom elnevezssel, majd a proteom (fehrjekszlet), illetve az ezek regultorainak sszessge,
az interaktom (klcsnhatk). Bevezettk tovbb a metabolitok sszessgre a metabolom s a
fluxusok sszessgre a fluxom elnevezseket is.
A biolgia kzponti alapelve (central dogma of biology), hogy az informci a DNS-en
troldik, onnan rdik t az RNS-re, amirl pedig a fehrjk szintetizldnak. Kiderlt azonban, hogy
szmos olyan szablyozsi funkci ltezik, amelyek miatt egy-egy gnhez nem lehet egyrtelmen
funkcit rendelni. Ezrt ltre jtt egy j kutatsi terlet a funkcionlis genomika (functional genomics),
amelynek feladata, hogy egy adott gn ltal kdolt fehrje funkciit feltrkpezze. Ehhez azonban
szksges volt a sejten belli folyamatok analitikjnak fejldsre.
Az anyagcsere-mrnksg legfbb clja, hogy genetikai manipulcikkal fejlessze a termel trzs
metabolikus fenotpust. A kapott fenotpusok ennek ellenre gyakran szuboptimlisak s nem
kielgtek a genetikai mdostsok kzvetett hatsai vagy ismeretlen szablyoz klcsnhatsok
miatt. Ezrt ersen ajnlott a teljes metabolikus szablyozst figyelembe venni az anyagcseremrnksg sorn.
A metabolizmus szablyozsa vagy enzim, vagy gn szinten fordul el. Utbbi globlis
szablyozk s/vagy szigmafaktorok hatsa alatt ll. A gnszablyozsok vltoznak az idvel a
tenysztsi felttelektl vagy a sejt llapottl fggen. A klasszikus metabolikus mrnki
megkzeltsek egyik htrnya, hogy ezt nem veszik figyelembe, vagy kevs figyelmet tulajdontanak
ennek.
Bsges informci ll rendelkezsre a loklis genetikai szablyozsrl s a sejtmetabolizmus
biokmijrl, illetve fiziolgijrl, de meglepen keveset tudunk a teljes anyagcsere tfog
szablyozsrl. St, noha a HTS technikkban benne van a lehetsg, hogy a transzkriptomok,
proteomok, metabolomok s fluxonomok kztti mehanizmust feltrja, tbbsgk csak pillanatkpet
ad egy llapotrl, s az a mdszer, ami a klnbz szint informcikat egysgbe foglaln mg
ismeretlen. gy mg mindig messze vagyunk a szablyozsi elvek sejtszint megrtstl. Br mr
sikerlt megalkotni az Escherichia coli teljes sejtmodelljt, mg fontosabb vlt az in vivo vizsglatok
analzise s a posztgenomikai kutatsokhoz a sejtek egsz rendszernek egyttes kezelse. Ezen cl
elrshez fontos az anyagcsere tfog szablyozsnak vizsglata a klnbz szintek (genom,
transzkriptom, proteom stb.) informciinak integrlt figyelembe vtelvel
A legfontosabb informci a komplex anyagcsere-szablyozs mechanizmusnak megrtsben a
centrlis anyagcsere fluxusainak eloszlsa lehet, mivel ez a gn- s fehrjeexpresszi (vagy
enzimaktivits) s az intracellulris metabolitok kifejezdse. A metabolikus fluxus analzise a kulcsmetabolitok anyagmegmaradsi elvn alapszik. A sejten belli fluxusokat a mrt fluxusokbl
anyagmrlegek segtsgvel hatrozzk meg. A mrhet kls fluxusok szma korltozott, s a
szthiometriai korltok miatt gyakran alulhatrozott algebrai rendszert kapunk. Ezrt kofaktor
anyagmrlegeket is nha be kell vonni a szthiometriai modellbe, vagy egy optimalizland objektv
fggvnyt kell bevezetni. A centrlis anyagcsere anabolikus s katabolikus funkcikat is ellt (felpt
s lebont is), hiszen kofaktorokat s ptkveket szolgltat a makromolekulk szintzishez
(anabolizmus), csakgy, mint az energiatermelshez (katabolizmus). Az optimlst a katabolizmus
vagy az anabolizmus, vagy mindkett szempontjbl el lehet vgezni a szthiometriai korltok
mellett. A fluxusmrleg-analzist szleskren hasznljk a steady state (llandsult llapot)
metabolikus fluxusainak becslsre a sejtnvekeds maximalizlsnak rdekben. Az E. coli szinte
optimlisan hasznostja a sznforrst, ami ennek a trzsnek a klnleges elnye. Ennek ellenre a
fluxusszmtsok pontossga a kofaktorbecslsek megbzhatsgtl fgg, s a megfelel objektv
fggvnyvlasztstl. Ismeretlen reakcik jelenlte, amely kofaktort generl vagy fogyaszt,
rvnytelentheti azt a megkzeltst, hogy a kofaktor koncentrcija egyenslyban marad, s a
kivlasztott objektv fggvny nem lesz megfelel, vagy a megbzhatsga csak bizonyos sejtllapotokra fog korltozdni.
Egy alternatv megkzelts az izotp-nyomkvets, ami mrhet mennyisgeket hatroz meg az
intracellulris fluxuseloszlshoz kapcsoldan. Izotppal jelzett szubsztrtot lehet adni a sejtnek, s a

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

29

jellt sznatom el fog oszlani az anyagcsere-hlzaton. A vgs izotpdsuls a sejten belli


metabolitkszletben mrhetv vlik. A biomassza-hidroliztumokban az aminosavak sokkal nagyobb
feleslegben vannak jelen, mint prekurzoraik a centrlis metabolizmusban. gy knnyebb kvetkeztetni
a proteinogn aminosavak jellt mintzatbl az intracellulris metabolitok jellsi mintjra a
prekurzoraminosav kapcsolat alapjn. A nyomjelz ksrletek ltalban NMR spektroszkpit
hasznlnak vagy GC-MS technikt. Az NMR-t a C13 helyi dsulsnak meghatrozsra egydimenzis
H1 NMR-rel vgzik, vagy az izotopomerek mennyisgi meghatrozsra egydimenzis C13 NMR-t,
vagy ktdimenzis C13 H1 COSY NMR-t alkalmaznak. Br a C13 NMR egy hatkony s vonz
technika a metabolikusfluxus-analzis szmra, nagy mennyisg mintt ignyel, s a mdszer nem
kpes detektlni a metabolitokat 10-4M-os koncentrci alatt. Msrszt a GC-MS mdszer knnyen
analizl 10-7M-os koncentrciban is. Mindezek miatt a GC-MS megfelel lehet az alacsony
biomassza-koncentrcij tenyszetek fluxusanalzishez is. Pillanatnyilag ezek a nyomkvet
technikk a kzvetlen extracellulris fluxusmrsekkel kombinlva a legmegfelelbb mdszerek az
intracellulris metabolikus fluxuseloszlsok (metabolic flux distribution=MFD) megllaptsra,
csupn nhny modellezsi felttelezst hasznlva. Emellett a fluxusarny-analzis is hasznlhat az
elgazsok fluxusainak megllaptsra.
Br alkalmazsaikban a TCA ciklusra korltozdnak, nhny tovbbi analitikai megoldst a
jellsi ksrletekhez szmba kell mg venni. A becslt fluxusok konfidencia-intervallumt statisztikai
analzissel lehet megadni. A jellsi ksrletek tervezsnek optimalizlsra is fejlesztettek mr ki
mdszereket, s gy azonosthatsgi analziseket is bevezettek. Br a C13 fluxusanalzist szles krben
alkalmazzk az olyan mikrobkra, mint E. coli, Corynebacterium glutamicum, Saccharomyces
cerevisiae, Bacillus subtilis, ms llnyekre is kiterjesztettk, mint pldul cianobaktriumok,
nvnyi sejtek s emls sejtek (kztk egr-, agyi s idegsejtek, valamint rkos sejtek).
Az proteogn aminosavak izotopomer eloszlsainak hasznlata esetn egy jelents korlt, hogy
csak steady-state esetben alkalmazhat. Annak rdekben, hogy az analzist az iparilag rdekes
szakaszos tenysztsekre vagy dinamikus analzisre lehessen kiterjeszteni, az intracellulris
metabolitokat kell elszr meghatrozni. Ezek mrhetek CE-TOF-MS, GC/MS-MALDI/TOF, MS,
LC-MS/MS, vagy LC-MS technikkkal2. A fluxus dinamikjt GC-MS rendszerrel egymagban is
lehet mrni 1,3-propndiolgyrts sorn. A nem stacionrius fluxusok analzishez gyakran kinetikai
modelleket is felhasznlnak. Mivel az elsdleges metabolitkszlet nagysgrenddekkel kisebb, mint a
proteogn aminosavakbl felptett molekulakszlet, az izotpeloszls hamarabb ri el az llandsult
llapotot. A fluxusvltozs becslhet a kszletmretekkel felrt differencilegyenletekkel.
Mind a szmtsos fluxusmrleg-analzis (fluxus balance analysis FBA), amely mtrix mveletek segtsgvel kpes kezelni a tbb tucat metabolikus reakciegyenletet, mind pedig a fluxusok
meghatrozsra bevezetett ksrletes MFD mdszerek hasznosak a sejtfiziolgia megrtsben. FBA
egyszerre tud kezelni tbb szz metabolikus tvonalat, mg a ksrletes megkzelts hasznos a fbb
metabolikus tvonalak elsdleges meghatrozsban. A fluxuseredmnyeknek sszhangban kell
lennie vagy integrlva kell lennie ms informcikkal, mint pldul az anyagcserefluxusok irnyval,
az enzimek metabolitok ltali allosztrikus szablyozsval s transzkripcis szablyozsokkal stb.,
mivel a metabolikus hl funkcionlis viselkedse a gnexpresszi, fehrjeexpresszi s az
intracellulris metabolitok koncentrcijnak eredmnye. A jelents mrstechnikai fejldsnek
ksznheten minden szint omics-nak a globlis monitorozsa lehetsges. Annak rdekben, hogy
a metabolikus szablyozs tisztzdhasson, nagyon fontos a metabolikus fluxusok s a tbbi omics
integrlsa. Ez a systems biology-nak keresztelt, viszonylag j tudomnyterlet feladata. Meg kell
jegyezni, hogy a gnexpresszi, fehrjeexpresszi, sejten belli metabolitkoncentrci kzvetlenl
mrhet, mg a metabolikus fluxusok vagy reakcisebessgek nem, ezrt becslni kell ket.
A szmos megvalsult plda kzl az Escherichia coli-n vgzett szisztematikus anyagcseremrnksget mutatjuk be. Az E. coli teljes levegztets mellett is termel jelents mennyisg ecetsavat, amely 10-30%-a is lehet a teljes sznfluxusnak. Ennek oka az, hogy nem megfelelen kontrolllt a glkz felvtele, s a tl sok intracellulris glkzlebontsi termket (azaz piruvtot) a citrtkr
nem tudja elg hatkonyan feldolgozni, ezrt vagy elbb acetil-CoA, majd abbl ecetsav kpzdik
(Pta+Ack, azaz PhosphateAcetylTransferase+Acetil-kinz), vagy a piruvtbl kzvetlenl (pox azaz
2

Balla Jzsef: Analitikai kmia, Budapest, BME

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

30

Ipari mikrobiolgia

piruvt-oxidz) is ecetsavat llt a sejt el, elbbi esetben ATP is keletkezik. A glkz elfogysa utn
az ecetsavat visszaalaktja a sejt ATP segtsgvel acetil-CoA-v, s a citrtkrn s a terminlis
oxidcin keresztl energiatermelsre fordtja. Mivel az ecetsavkpzds jelents szubsztrthnyadot
elhasznl, illetve citotoxikus metabolitknt a sejtnvekedst gtolja, a kikszblse alapvet
fontossg az E. coli-val vgzett rekombinns (heterolg) fehrjeexpresszi s -elllts sorn.
Az egyik lehetsg, hogy cskkent aktivits glkztranszferrel rendelkez mutnsokat kell
ltrehozni a piruvt akkumlcijnak elkerlsre, vagy lehet a glkzkoncentrcit rtpllsos
technika segtsgvel alacsony rtken tartani, illetve lehet a foszfotranszferz rendszer (PTS) glkzspecifikus enzimnek expresszijt cskkenteni egy represszor molekula expresszltatsval. Ezeken
fell lehetsg van a citrtkr s a glioxilt ciklus intenzifiklsra is. Ez utbbi enzimeit az aceBAK
gn kdolja az izocitrt-dehidrogenzzal egytt. Ez a gn ecetsavon vagy zsrsavakon trtn
nvekedskor aktv, glkzon, glicerinen s piruvton represszlva van. A regulon transzkripcis
faktorai kzl a fadR mutcijval elrhet, hogy az utbbi sznforrsokon is aktv legyen az aceBAK
gn. gy teht a citotoxikus s szubsztrtvesztesget okoz ecetsav kpzdse kikszblhet az E.
coli-nl (1.2.9. bra)

1.2.9. bra: E. coli ecetsav kpzsnek elimincija: A) glkz transzfer deficiens mutns,
B) aceBAK gnekkel megnvelt glioxalt- s citrtkr- aktivits.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

31

A tejsav fermentatv ellltsnak rgta ismert problmja, hogy a jl termel lactobacillustrzsek igen sszetett tpanyagforrsokat (pl.: lesztkivonat) ignyelnek, amelyek viszonylag
kltsgesek, s feleslegk drgtja, illetve nehezti a downstream folyamatokat.
Ezrt E. coli-t is mdostottak gy, hogy elfogadhat tejsavtermelv vljon. Ehhez a trzs
glkz- specifikus PTS fehrjjnek, illetve a piruvt-formit-liz enzimnek, valamint a sajt lakttdehidrogenznak gnjt inaktivltk, s egy lactobacillus eredet L-LDH (laktt-dehidrogenzt)
expresszltattak vele. gy az E. coli alkalmass vlt tbb mint 70 g/L koncentrciban tejsavat
termelni 77%-os hozammal ecetsav, etanol, formit s D-tejsav nlkl.

1.3. Mikroorganizmusok ipari alkalmazsa


A mikroorganizmusok ipari alkalmazsakor a leghatkonyabb termels rdekben klnbz ignyeik
(tpkomponens, levegztets, pH stb.) figyelembe vtele s kielgtse a biotechnolgus feladata.
Rszletesen ezekkel a feladatokkal a Biomrnki mveletek3 foglalkozik, de nhny mikrobiolgiai
aspektust e jegyzet keretein bell is clszernek vltnk trgyalni.
Az oxign szerepe
A mikrobk centrlis (kzponti) anyagcserje a kvetkez smval szemlltethet (1.3.1. bra)

G
L
I
K
O
L

Z
I
S

Terminlis
oxidci
1.3.1. bra: A mikrobk centrlis anyagcserje
A kzponti anyagcseret sorn a sznforrs lebontsa (pl.: cukrok) a glikolzissel kezddik s a
piroszlsavig tart. Az ebbl kpzd acetilcsoport lp be a citrtkrbe, ahol az oxlecetsavval
sszekapcsoldik, s a kpzdtt citromsav kt lpsben dekarboxilezdik, s CO2 kerl kibocstsra
(ld. 1.1.4. bra). A citrtkr sorn a szn-dioxid-tvozs mellett reduklt koenzimek is keletkeznek
(NADH2), amelyek a terminlis oxidciban a lgkri oxign segtsgvel a respircinak nevezett
folyamatban regenerldnak jelents ATP energia keletkezse kzben. Ha a mikroba lgkri oxignt
hasznl, akkor gyakran tallkozik peroxigykkkel, amelyek igen reaktvak, s gy krtkonyak a
sejtekre. Ezek kzmbstsre az aerotolerns s/vagy aerob mikrobk katalz enzimeket termelnek
(gyakran peroxiszmban), amelyek a kros peroxidgykket rtalmatlantjk.
A fermentatv anyagcsere esetben azonban nincs lehetsg a lgkri oxign felhasznlsra a
reduklt koenzimek regenerlsa cljbl gy energianyersre sem, ezrt klnbz szerves vegyletek (metabolitok) segtsgvel trtnik meg az oxidci s a kisebb mrtk, de nlklzhetetlen
3

Lsd Sevella Bla: Biomrnki mveletek s folyamatok. Budapest, Typotex Kiad, 2011

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

32

Ipari mikrobiolgia

energiatermels. Ezek a klnbz erjedsi folyamatok, amelyek megklnbztetendk az anerob


lgzstl (amikor is az elektrondonor szerves molekula, pl. cukor), de az elektronakceptor sem nem a
lgkri oxign ((lgzs)), sem szerves anyag (fermentci), hanem oxigntl eltr szervetlen
molekula).
Oxignigny szempontjbl a mikrobk lehetnek aerobok (letfunkcihoz szksges a lgkri
oxign), aerotolernsok (nincs szksgk oxignre, de el tudjk viselni ((ltalban katalz pozitvak)),
fakultatv anaerobok (ha van oxign, hasznljk, ha nincs, akkor is lnek s szaporodnak), obligt
anaerobok (nincs szksgk oxignre, s nem tudjk elviselni sem (toxikus rjuk nzve).
A jegyzetben trgyalt anyagcsere utakat foglalja ssze a 2. fejezetben rszletesen trgyalt 2.1.2.
Anyagcsere utak sszefoglalsa cm hyperpicture.
Aerobok tenysztse
Az oxign egy klnleges szubsztrt, mert gzhalmazllapotban kell a rendszerbe juttatni, s a redoxegyenslyon keresztl az oxign mennyisge befolysolhatja a mikroba anyagcserjt. Egyes fermentcik a termk-ellltshoz oxignfelesleget ignyelnek (ekkor maximlis a termkhozam), msok
pedig klnleges oxignprofilt, esetleg oxignlimitet. Mindezek miatt az aerob fermentciknl vagy
felleti tenysztst kell alkalmazni (szilrd fzis fermentci, nem igazn lehet az oxignszintet
szablyozni), vagy a fermentlbe beolddott oxign mennyisgt mrni s gyakran szablyozni kell,
amihez a legclszerbb az oxignelektrd hasznlata (pl.: Clark-fle elektrd4). Az elektrd szolgltatta jel alapjn tbb helyen lehet beavatkozni: 1) keversi sebessg nvelsvel cskken a buborkmret s n az anyagtadsi fellet, teht javul az oxignelltottsg; 2) a leveg trfogatramnak
nvelsvel szintn tbb oxign juttathat a fermentlbe; 3) nagyobb nyoms leveg alkalmazsval
is tbb oxign vihet be; 4)vgs esetben oxignnel dstott levegt is lehet hasznlni. Noha a
hmrsklettl jelentsen fgg a teltsi oxignkoncentrci (amitl pedig az oxignbeoldds
hajtereje fgg), az alkalmazott hmrskletet ltalban a mikroba hmrskleti optimuma hatrozza
meg. A magas hmrskleten vgzett fermentciknl teht komoly gondot jelent a megfelel
levegztets biztostsa, mert 60-70C-on mr rosszul olddik az oxign (pl.: Thermus thermophylus)
Az ipari fermentciknl (pl.: citromsav- vagy fehrjetermels E. coli-val) gyakran jelent
problmt, hogy a nagy lptk reaktorok alja s teteje kztt jelents hidrosztatikai nyomsklnbsg
van, ami miatt az oxignbeoldds is klnbzik, teht inhomognn vlhat a reaktor. Ennek
kikszblsre tbb helyen vezetnek be levegt a fermentorba. A fejtrbe vezetett levegvel a habzs
mrtke is visszaszorthat.
Anaerob fermentcik (erjesztsek)
A fejezet elejn mr rszletesen bemutattuk az oxignt hasznost s nem hasznost mikroorganizmusokat. Az oxignt nem ignyl mikrobkat (obligt anaerobok, aerotolernsok, fakultatv
anaerobok) tenysztsi szempontbl most egyszerre trgyaljuk.
Mindegyik fajta tenysztsekor menteslnk a levegztets okozta problmktl (oxignlimit,
magas kever fordulatszm s nyrer, habzs stb.). A szigoran anaerobok esetben azonban inert
gz bevezetsre s alapos eloszlatsra (diszperglsra) van szksg, pont, mint az oxign esetben,
ezrt ilyenkor gyakran ugyanazt a gzbevezet rendszert hasznljk, mint a levegztetskor.
A klasszikus fermentcis ipar a primer metabolitok termelsvel alakult ki. Ezek nagyobb,
iparilag is hasznosthat mennyisgben a klnbz erjesztsek sorn keletkeznek, amikor a cukor
rszben savakk s alkoholokk oxidldik, rszben pedig az ekzben keletkezett reduklt koenzim
(NADH2) regenercijakor reduklt szerves vegyletekk alakul (pl. piroszlsavbl tejsav kpzdik
stb.). Ezeket az erjesztseket tekintjk t az albbiakban.
1. Etanolos erjeds
A hexzok erjesztsekor lesztk (Saccharomyces cerevisiae) s egyes baktriumok
(Zymomonas mobilis) metabolizmusa sorn 1:1 arnyban etilalkohol s szn-dioxid keletkezik
a piroszlsavon (glikolzis) keresztl. Az els lps a hexokinz katalizlta szubsztrt
4

Lsd Sevella Bla: Biomrnki mveletek s folyamatok. Budapest, Typotex Kiad, 2011

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

33

foszforilezs, majd a foszfo-frukto kinz ltal vgzett msodik foszforilezs eredmnyeknt a


6 sznatomos szubsztrt 2 db 3 sznatomos glicerin-aldehid foszftra bomlik, amelyek a
glikolzisben foszfoenolpiruvt-piroszlsav-acetaldehid-etanol tvonalon alakulnak t a
termkk.
A szubsztrt felvtele trtnhet A) tmogatott diffzival vagy B) aktv transzporttal. Elbbire
azrt van szksg, mert noha a sejten kvli trben tallhat magasabb koncentrciban a
szubsztrt gy a spontn diffzi is a felvtelt segti, de viszonylag nagy molekuljak a
monoszacharidok, amelyek ezrt csak lassan tudnak a sejtmembrnon tjutni, ezrt hordoz
molekulk segthetnek. A termkleads egyszer diffzival trtnik, gy a magas
termkkoncentrci gtolhatja a sajt kpzdst.
A diszacharidok klnbz utakon jutnak el a lebont appartushoz: a szacharz esetben az
invertz enzim a periplazms trben hastja kt monoszacharidra a szubsztrtot, amelyek
onnan a fenti mechanizmus szerint hasznosulnak; a laktz elszr transzportldik, majd
intracellulris -galaktozidz hidrolizlja; maltz esetben ugyanez a helyzet, de -glkozidz
vgzi az els intracellulris hastst
Napjaink kutatsainak fkuszban llnak azok a mikroorganizmusok (pl.: Pichia stipitis),
amelyek pentzokbl kpesek etanol ellltsra, mivel a 3. genercis bioetanol-elllts
hemicellulz-tartalm nvnyi hulladkok felhasznlst tzte ki clul (a kemnyt- s
cellulzalap technolgia utn).
Az etanolos erjeds mellktermkei lehetnek az acetaldehid (nha akkumlldik, de etanoll
alakulhat), illetve a glicerin-aldehid-3-foszft akkumlcijval a glicerin jelenik meg
mellktermkknt.
Tapasztalatok szerint az optimlis erjesztshez nmi oxign is szksges (a biomasszanvekedshez, mert teljesen anaerob krlmnyek mellett erre kptelenek az lesztk). Az
alkoholos erjedsnl kt szablyozsi mechanizmust kell figyelembe venni: Pasteur-effektus
az oxignlimitben mkd tenyszet anaerob metabolizmusra vlt (lassabb szaporods, ami
oxignt ignyel s etanoltermels); Crabtee-effektus: magas cukorkoncentrci esetn a
biomassza-kpzds helyett az aerob fermentci anaerob anyagcserre helyezi a hangslyt,
mert korltozott a terminlis oxidcis kapacitsa a mikrobnak.
Az etanoltermels sorn gy szubsztrt- s termkinhibci is fellp, utbbi kb. 112-114 g/L
titernl, ami pp a gazdasgosan kinyerhet termkkoncentrci hatrn mozog.
A termk etanolfelhasznlsa szles krben ismert, mint pldul ferttlentszerek, tiszttszerek, italok, zemanyagok, szintzisek stb.
2. Tejsavas erjeds
A tejsav termeldse igen gyakori az lvilgban a mikrobktl kezdve az emberig bezrlag.
A mikrobk esetben a legjelentsebb tejsavtermelk a tejsavbaktriumok (lactobacillusok,
lactococcusok, pediococcusok, streptococcusok, leuconostoc fajok stb. ), bacillusok, egyes
gombk (pl.: Rhizopus) s lesztk (pl.: Kluyweromyces lactis). A tejsavas erjeds tipikus
pldja a terminlis oxidci ptlsnak: oxign hinyban a reduklt koenzim (NADH 2)
visszaoxidlshoz a centrlis metabolizmus molekuljt a piroszlsavat hasznljk a
molekult a laktt-dehidrogenz enzim segtsgvel, gy a koenzimbl NAD a piroszlsavbl
tejsav keletkezik. A lactobacillusok emellett a sajt biomasszjuk felptsre szerves
nitrognforrsokat ignyelnek, amelyek nitrogntartalma mellett a szntartalom is
tpanyagknt szolgl, az emellett jelen lv sznhidrtok bontsval pedig a piroszlsavon
keresztl trtn tejsav-elllts sorn energit termelnek, gy bizonyos esetekben a cukor
szinte kizrlag tejsavv alakul (magas ~95-99%-os hozammal).
Mg a szubsztrt ltalban aktv transzportal jut be (pl.: glkz, laktz permez segtsgvel), a termelt tejsav disszocilatlan formban szabadon ki/be jut, m ez toxikus a sejtekre
nzve. A lakttion a protonokkal egytt szimport formban transzportldik.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

34

Ipari mikrobiolgia

A bejutott szubsztrt metabolizmusa szerint a tejsavtermelket kt csoportra szoks osztani:


homofermentatvak s heterofermentatvak. Elbbiek esetben a hexzok az Embden
MeyerhofParnas (glikolzis) tvonalon keresztl 1:2 mlarnyban tejsavat kpeznek, mg a
heterofermentatvak elbb dekarboxilezik a hexzt (a szn-dioxid tvozst buborkols jelzi),
majd a kpzdtt pentzbl tejsavat (3 sznatom) s valamely 2 sznatomos mellktermket
kpezik, ltalban ecetsavat vagy alkoholt. Nyilvn a fehr biotechnolgia szmra a
homofermentatvak a kedvezek a magas hozammal s konverzival, de a heterofermenttvak
is iparilag jelentsek: az lelmiszeriparban hasznlatosak, ahol a mellktermkek arnya adja
a kvnt aromt, zt.
A tejsavtermelk ltalban fakultatv anaerobok, ami ipari szempontbl szintn kedvez,
hiszen nincs szksg kltsges levegztetsre, sem inert gzra, a spontn beoldd oxign
viszont nem zavarja a mikrobkat, ugyanakkor gzbevezets hjn habzssal sem kell
szmolni, ettl a reaktor is jobban kihasznlhat.
A termk tejsav szles kr felhasznlssal rendelkezik az lelmiszeriparban, gygyszer- s
higinis termkekben, polimer,- briparban stb.
Egy specilis eset a Rhizopus oryzae, amely oxign jelenltben a cukrokat szn-dioxidd
oxidlja, s biomasszt kpez, anoxikus (kevs oxign) krlmnyek kztt tejsavat termel,
m teljesen anaerob krlmnyek kztt etanol a ftermk. Noha a termkprofil nagyban fgg
a morfolgijtl, a fenti hrom eset ltalnos e fonalas gombnl. A tejsavtermels
szempontjbl a pelletes morfolgia a legkedvezbb, amelynek kialakulsa viszont igen sok
tnyeztl fgg 1.3.2. bra [7]. Anyagtadsi szempontok miatt az optimlis pelletek sima
felletek s 1-2 mm tmrjek. Egy ilyan pellet felsznt mutatja be az 1.3.3. video, illetve
klnbz morfolgik lthatk az 1.3.4-1.3.7 brkon.
Fellet aktv
anyagok

Szilrd
rszecskk

Trzs
Kevers

Spra kora

Polimerek

Tpkzeg

pH

Spra konc.

Pellet kpzds
1.3.2. bra: A pelletkpzdst befolysol tnyezk

1.3.3. Pelletes morfolgia


Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

1.3.4. bra: Bolyhos pellet (1-2mm)

35

1.3.5. bra: ris (1cm) pellet


s szablytalan alak pellet

1.3.6. bra: Amorf s ris (2-3 cm) pellet


1.3.7. bra: Pelletfelszn mikroszkpos kpe
(400-szoros nagyts)
3. Homoacetogn erjeds
Az ecetsavrl mint mellktermkrl mr tbb esetben emltst tettnk, ltezik azonban olyan
erjedsi folyamat, amely a fermentlbe az ecetsavat bocstja ki f termkknt, s emellett
szn-dioxidgz kpzdik s tvozik a rendszerbl. Ilyenkor egy hexzbl 2 ecetsav s 2 CO2
keletkezik, mellktermkknt etanol fordulhat el. A hexzok a glikolzisen t, a pentzok
pedig a pentz foszft cikluson kersztl bomlanak le piroszlsavv, amelybl kpzdik
kzvetlenl vagy acetil-foszfton keresztl az ecetsav. A szubsztrtfelvtelre s a
termkleadsra a tejsavhoz hasonlan aktv transzport s disszocilatlan forma jellemz,
amely utbbi ez esetben is citotoxikus hats.
A termel mikrobk gyakran termofilek (pl.: Clostridium thermoaceticum, Acetogenium kiwi),
a kpzdtt ecetsavat pedig jellemzen a vegyipar hasznlja fel (az lelmiszeriparban ezek a
mikrobk nemkvnatosak).
4. Propionsavas erjeds
A propionsav jellemzen heterofermentcis folyamatok termke, ahol a fkomponens, a propionsav s mellette az ecetsav, a borostynksav s a tejsav is megjelenhet. A termel anyagcsere sorn a hexzok a glikolzisen keresztl eljutnak a piroszlsavig, majd rszben tejsavv
s ecetsavv, rszben oxlacettt alakulnak, amely utbbi a fumrsav-borostynksavpropionilCoA-n keresztl propionsavat kpez. Jellemzen mezofil, anaerob mikrobk vgzik
ezt a fajta fermentcit, mint pldul Propionibacterium acidipropionici, vagy P. shermanii.
A propionsav-baktriumok tejsavbl is kpesek propionsavat erjeszteni.
A megtermelt propionsavat takarmny- s lelmiszer-ipari tartstsra, polimerek s
peszticidek gyrtsra, valamint antifunglis szerknt is hasznljk.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

36

Ipari mikrobiolgia

5. Butanolos erjeds
Butanol fermentcis ton ktfle anyagcservel is keletkezhet: A) hexzok bontsbl a
glikolzisben piroszlsav keletkezik, amelynek acetilcsoportjt a koenzim-A (CoA) a
citrtkrbe szokta vinni, m kt acetil-CoA-bl aceton keletkezhet, illetve hrombl butirilCoA, majd abbl butanol, s emellett kzvetlenl a piroszlsavbl etanol (=ABE), valamint
a citrtkrben szn-dioxid; B) izopropil-alkohol kpzdik egy dehidrogenz-enzim segtsgvel az acetonbl a butanol s az etanol mellett (=IBE)
A technolgia nehzsge, hogy a butanol ersebb sejtmreg mg az etanolnl is, ezrt csak
igen kis koncentrciban halmozzk fel a termel mikroorganizmusok (0,5-1,0% ~10 g/L).
Emiatt desztillcis, extrakcis s kihajtsos (strippels) technolgik szksgesek a feldolgozsi mveletek sorn, amelyek viszonylag magas fajlagos kltsget eredmnyeznek.
A legltalnosabb butanoltermel mikroba az anaerob mezofil Clostridium acetobutylicum.
Ipari butanolos fermentcik az I. vilghbor utni nmet hadiipar szmra termeltek
butanolt, a ksbbiekben a kolajalap technolgik alacsonyabb kltsgei miatt a butanolfermentcis zemeket bezrtk. Napjainkban azonban a bioetanol analgijra szintn
energiahordozknt li renesznszt biobutanol elnevezssel immr a genetikai ismeretek
kiaknzsval a butanol fermentcis ellltsa.
6. Diolok, triolok, poliolok erjesztses ellltsnak ttekintse
A) etilnglikol: toxikussga ellenre a borhamists kulcsvegylete, szintetikusan olcsbb az
ellltsa
B) 1,3-propndiol: (bvebben: 1.1.fejezet 1,3-propndiol elllts) az enterobakterek,
klosztridiumok, egyes tejsavbaktriumok s egyes citrobakterek fajai kpesek anaerob
krlmnyek kztt a glicerinbl (a bels redox egyensly megrzsnek rdekben) 1,3propndiolt ellltani, mikzben a reduklt NADH2 koenzimet visszaoxidljk. Az 1,3propndiol minden esetben heterofermentatv anyagcservel keletkezik, azonban a
mellktermkek a termel mikrobra jellemzek (pl.: 2,3-butndiol a Klebsiellkra, vajsav
a Clostridiumokra stb.). Glkz kofermentcija gyakran segti az 1,3 propndiol
kpzdst (mert tbb NADH2 keletkezik a glkz lebontsakor, amit a propndiol tnak
kell regenerlni.)
C) 2,3-butndiol: az enterobakterek jellegzetes termke, amely 2 piroszlsavbl keletkezik.
Gumigyrtsra s metil-etil-keton (MEK) ellltsra hasznljk, amely utbbival az
zemanyagok oktnszmnvelse rhet el.
D) Glicerin (triol): lesztk glkzbl termelhetik akr ftermkknt is. A bor erjedsekor is
keletkezik pl.: Saccharomycesek, Pichik kzremkdsvel. A glicerin felel a bor testessgrt, ppen ezrt a bor glicerines feljavtsa borhamistsnak minsl. A glicerin
rgen a szappanfzs mellktermke volt, napjainkban egyes biodzeltechnolgik
(metanollal trtn nvnyolaj tszterezse estn) mellktermkeknt keletkezik nagy
mennyisgben nmileg szennyezett (metanol, kataliztor, lg stb.) formban.
E) Xillit: xiln hidrolzisvel xilz nyerhet, amelybl pl. Pichik segtsgvel xillit llthat
el, s destszerknt forgalmazhat.
F) Szorbit(ol): lesztk (pl.: Zymomonas mobilis) kpesek glkzbl az etanol mellett
szorbitot (az ol vgzds az angolbl ered, magyarul enlkl is hasznlatos, ez esetben
szorbit) ellltani.
Fentiekben teht klnbz anaerob fermentcit, erjesztst soroltunk fel. A levegztets
problematikja a szubmerz (folyadk fzis, szuszpenzis) fermentcik ta ll fent, s egy msik
klasszikus fermentcis technikval a felleti vagy szilrd fzis fermentcival rszben
kikszblhet.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

37

Szubmerz kontra felleti fermentci


Noha a biomrnki fermentcis tanulmnyok sorn megszoktuk, hogy a mikrobatenyszet az egy
adott faj vizes szuszpenzija, s ezzel a termszetben is tallkozhatunk (aludttej, joghurt stb.), egy
adott szubsztrt felsznn trtn tenyszts szintn mindennapos (pl.: penszes kenyr), s ugyanezen
folyamat kiaknzhat klasszikus technikaknt egyes rgikban (fleg zsiban).
A szilrd fzis fermentci (Solid State Fermentation SSF; amely csak rvidtsben azonos az
egyidej cukrosts s fermentcival Simultan Saccharification and Fermentation!) sorn a
biomasszaszaports s termkkpzs olyan nedves szubsztrton vagy inert hordozn trtnik, ahol
csak kttt vz tallhat (=vzaktivits). A termszetben ilyen folyamat a komposztls, silzs vagy a
talajszemcsk koszisztmja.
A felleti tenyszts elnye a szubmerz technikval szemben, hogy egyszerbb eszkzk s
tpkzegek hasznlatosak, kevesebb szennyvizet termel, s nha a feldolgozsi-tiszttsi mveletek
egyszerbbek (knnyebb a biomassza-eltvolts klnsen). Ugyanakkor htrnya, hogy nem
minden mikrobval vgezhet (pl. baktriumok jelents rsze), meglehetsen nehezen kontrolllhat,
inhomogn rendszer, amitl lassabb a metabolizmus (nincs mindentt optimlis krlmny), s a
reakci ez esetben is a kevs kttt vizes fzisban zajlik. Ezrt fleg tradicionlis zsiai (pl.: japn)
telek ellltsakor hasznljk.
Szubsztrt/hordoz oldalrl a kvetkez 3 szempontot kell figyelembe venni:
1) Anyaga: lehet mezgazdasgi hulladk (hidrolzis nlkl is hasznosthatk, szemben a szubmerz fermentcival), szervetlen, nagy szemcss rlt kzet, szintetikus manyag (poliuretn).
2) A szubsztrt/hordoz karakterisztikjt megadja a porozits, vzmegkt kpessg, mechanikai trs.
3) Szubsztrt/hordoz elkezelst ignyel-e, gymint fizikai elkezelsek (aprts, sterilezs
hvel vagy besugrzssal), vagy kmiai mdszerek (savas/lgos hidrolzis, extrakci), vagy e
kett kombincija.
Bioreaktor oldalrl a kvetkez megoldsok hasznlatosak:
1) Forgdobos bioreaktor citromsav-ellltshoz Aspergillus niger fonalas gombval (1.3.8.
bra) [8]

1.3.8. bra: Forgdobos bioreaktor

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

38

Ipari mikrobiolgia

2) Tlcs reaktor (Koii, 1.3.9. bra) [9]

1.3.9. bra: Koji tlcs reaktor


A fenti reaktor elnye, hogy a reaktorban a pratartalmat mrni s szablyozni lehet, a
tenyszeteket tart tlcsmodulok pedig alulrl csvezetk segtsgvel fthetek/hthetek.
3) Tlttt gyas bioreaktor
A tlttt gyas reaktoroknl egy oszlopszer reaktorba durva aprtk (darabos) szubsztrtot helyeznek
el, amelyet bepermeteznek a termel mikrobval, s alulrl enyhn levegztetik.
4) Fluidgyas reaktor
Nagyon hasonl a tlttt gyas reaktorhoz, de ebben az esetben knny a hordoz/szubsztrt, s
magasabb a leveg trfogatrama, gy a szilrd szubsztrt lebeg. Az intenzvebb levegztets miatt
knnyebben kiszrad a tenyszet.
5) Toronyreaktor
Az elve hasonlt egy rektifikl kolonnra: fentrl engedik be a szubsztrtot, amely halad lefel, s
ekzben rintkezik az alulrl bevezetett (szemberam) levegvel.
6) Alagttpus reaktor
Lass futszalag felett nvnyhzszeren flibl kszlt reaktor komposztlsi clra.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

1. Alapismeretek, ipari mikrobiolgiai mdszerek

39

A fenti reaktorokat mind azzal a cllal fejlesztettk ki, hogy a lehet legegyenletesebben szolgljk ki
a tenyszet ignyeit, s ugyanezen clbl legyen beavatkozsi lehetsg, azaz bizonyos paramtereket
szablyozni lehessen. Szablyozni lenne rdemes a pratartalmat, oxignkoncentrcit, pH-t,
hmrskletet.
Az albbiakban nhny pldt sorolunk fel ipari szilrdfzis fermentcira.
A) lelmiszerek ellltsa: Penicillium camember, Aspergillus sojae
B) Enzimek ellltsa: -amilzok, protezok Aspergillus oryzae-vel, cellulzok, pektinzok
Aspergilus niger.
C) Nvnyvdszerek: bioinszekticid Beauveria bassiana (ld. ksbb), biopeszticid
Fusariumok- ellen antagonista gomba (Trichoderma harzianum) termelse SSF technikval.
D) Csiperke (Agaricus bisporus) s laska (Pleurotus ostreatus) gombk termesztse.
E) Komposztls kevert tenyszettel, szabadban. Fontos a leveg arny s a pratartalom.
nmeleged folyamat. Alkalmas technika a szennyvziszapok (veszlyes hulladk)
kezelsre.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

40

2.

Ipari mikrobiolgia

AZ IPARI MIKROBIOLGIA BIOKMIAI S


FIZIOLGIAI HTTERE

2.1. Sznforrsok hasznosulsa, klnleges metabolizmusok


A mikroorganizmusok anyagcsere-folyamatai rendkvl szertegazak ezrt clszer valamilyen
rendszerben trgyalni ket. A legegyszerbb megolds a sznforrsok sznatomszma szerinti
sorbarendezs.
C1-forrsok hasznosulsa [19]
Az 1 db sznatomot tartalmaz szubsztrtok szma igen csekly, m a mikrobk szerepe itt sem
elhanyagolhat. Ide sorolhatk a metn (CH4), metil-halogenidek (CH3X, X: Cl, Br, stb.), metanol
(CH3OH), metil-amin (CH3-NH2), hangyasav (HCOOH), metilszulfid ((CH3)2S)) s a szn-dioxid
(CO2). A szn-dioxid-hasznost mikrobkat metanogneknek, a tbbi C1 szubsztrtot hasznostt
metilotrfnak szoks nevezni. Elbbiek definci szerint szn-szn kts nlkli szubsztrtot
hasznlnak, tbbnyire oxign segtsgvel (teht aerobok), a metanognek jellemzje pedig a
metntermels.
A felsorolt szubsztrtok hasznostsra kpes mikrobkat a termszetes szubsztrtok
krnyezetbl lehet izollni: metanolt nvnyek felsznrl (metanol=faszesz), metilamin a halak s
nvnyek bomlsakor keletkezik, metilhalogenidet s metilszulfidot pedig a tengeri algk termelnek
nagyobb mennyisgben.
A C1 szubsztrtok hasznostsa olyan elnykkel jr, mint a csekly verseny (ipari szempontbl
ez knnyebb containmentet jelent, azaz cskken a fertzsveszly), s olcs kolajalap nyersanyagok
jhetnek szmtsba (ez mindig relatv).
Metilotrfok a krnyezetvdelemben
A fldi let szempontjbl fontos tevkenysg, hogy a metilotrfok az veghzhatst okoz anaerob
lebontsok vgtermkeknt keletkez metnt (21x tbb ht tart vissza, mint a szn-dioxid) szndioxidd oxidljk.
Msik fontos metilotrf tulajdonsg, hogy szmos olyan krnyezetre kros anyagot kpesek
talaktani kevsb toxikus vagy rtalmatlan vegylett, amelyek nem igazi szubsztrtjai a mikrobnak
(nem kerlnek be a sejtbe s haladnak vgig valamelyik anyagcsereton), gy a metilotrfok
talajremediciban is hasznosthatk szennyezk, illetve hulladkok lebontsra.
Metilotrfok a biokatalzisben
Kiss szokatlannak tnhet a metanol (s trsai) mint szubsztrt (ok), m a XX. Szzad kzepn az
olajrak kedvez szintjn komoly prblkozsok s beruhzsok trtntek, pldul a brit ICI
vllalatnl kolaj eredet metanolon trtn SCP (single cell protein) gyrtsra. Akkor a metilotrf
mikroba sszettelt talltk tpllkozstanilag megfelelnek (emberi s) llati fogyasztra.
A metanolhasznosts s a Metanolalap trsadalom ma renesznszt li, s ennek jelents
magyar vonatkozsa is van.
Az 1994-ben kmiai Nobel-djjal kitntetett Olh Gyrgy kmikus 2005-ben jelentette meg A
kolaj s fldgz utn: a metanolgazdasg cm rtekezst [10].
Ebben 4 rvet sorol fel a metanol mint a gazdasg kzponti s meghatroz szereplje mellett: 1)
a fosszilis kszletek (kolaj, fldgz, szn) fogytn vannak, 2) a lgkri CO2-bl s CH4-bl (veghzhatst okoz gzok) elllthat, 3) egyszerre lehet energia- s nyersanyagforrs, s 4) knnyen
trolhat.
A Nobeldjat egy klnleges reakcimehanizmus felfedezsrt kapta Olh Gyrgy, amely
reakciban carbocation keletkezik intermedierknt. Ugyanez a kztitermk fordul el a metnbl
trtn bzikuskataliztor melletti oxidci, illetve szn-dioxidbl indul redukci sorn. Az mr
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

41

ismert volt, hogy metn oxidcijval hangyasav vagy formaldehid keletkezik, de az j reakcimechanizmussal e kt termk reakcijt is lehetett magyarzni, amely reakci viszont metanolt termel
(2.1.1. bra).

2.1.1. bra: Metanol-elllts szn-dioxidbl s metnbl


Ezek szerint a metanol a termszetben is elfordul, s viszonylag krnyezet- illetve kltsgkml
mdon szintetikusan is elllthat, teht egy llandan rendelkezsre ll, olcs, tiszta szubsztrt. Ez
alapjn a jv biotechnogijnak egyik kihvsa lehet, hogy a metilotrfokat kiaknzhatv tegye,
azaz a metabolizmus f fluxusait a ftermk fel lehessen tirnytani, s ezt a fluxust a
kltsghatkonysghoz szksges szintre lehessen emelni, illetve a mellktermkkpzst (trols sorn
kpzd metabolitok vagy bomlstermkek, szekretlt fehrjk, vdekezrendszerek ((enzimek,
antibiotikumok)) lehessen cskkenteni.
Mindehhez azonban a metilotrfok anyagcserjt kell jl ismerni.
A metilotrfok a metanolbl s a metilaminbl is a toxikus intermediert, a formaldehidet kpezik,
amelybl szn-dioxidot s energit termelnek, utbbit reduklt koenzimek (NADH2) formjban,
illetve a formaldehid vagy ribulz 5-foszfthoz kapcsoldik s a RuMP ciklusba kerl (ehhez
kapcsoldnak a bioszintetikus utak), vagy szerint kpez, s a szerin-cikluson keresztl kapcsoldik a
tbbi asszimilcis thoz. A metanognek ugyanezt az elvet kvetik, de els lpsknt
metnmonooxigenz-enzimmel (pMMO) a metnbl metanolt kpeznek, ahonnan mr azonosak az
anyagcseretjaik a metilotrfokval (2.1.2. hyperpicture)

2.1.2. hyperpicture: Az ipari mikrobiolgiban fontos anyagcsereutak sszefoglalsa


C2-metabolizmus
Az egyedli, cukrokhoz kiss hasonl ktsznatomos molekula a glikolaldehid. A legegyszerbb
cukorszer molekula, ezrt diznak is lehet nevezni. A pterin szintzisben jtszik szerepet (purinbzis, GTP-bl), s ezen keresztl a fltok ellltsban, amelyek bioszintzisek kofaktorai. A
sznhidrtok szintzisnek els lpcsje, hogy a formz reakciban kt formaldehidbl glikolaldehid
keletkezik, majd jabb formaldehid beplsvel glicerinaldehid, amibl izomerizcival dihidroxiaceton, s ez a glicerinaldehiddel ribulzt, izomerizci utn ribzt eredmnyez (2.1.3. bra).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

42

Ipari mikrobiolgia

2.1.3. bra: Cukorkpzds glikoladldehiden keresztl [11]


Ezzel egytt azon tulajdonsga miatt is kutatjk, hogy 2 formaldehidbl keletkezik egy
glikolaldehid, s ezt a reakcit (a sajt kpzdst) a glikolaldehid katalizlja, teht ez az els nreplikl mehanizmus.
A spontn ribzkpzs s az nreplikcis kpessg miatt az let nyomainak vilgrbeli keresse
sorn az rkutats fkuszban ll, tovbb szerin, triptofn, gygyszer s agrokemiklik szintzisben is hasznlatos. Reaktv volta miatt azonban termszetben nemigen fordul el, gy klasszikus
sznforrsknt nem ll a mikrobk rendelkezsre.
Elllthat szintetikusan s enzimesen etiln-glikolbl (pl.: Pichia pastoris alkohol-oxidz 1
segtsgvel, vagy Aspergillus japonicus glicerinoxidz enzim segtsgvel) is etiln-glikolbl.
A ktsznatomos vegyletek kzl az etanolt is kpesek a mikrobk hasznostani s ecetsavv
oxidlni. Mg a mr emltett crabtree effektus esetn a terminlis oxidci enzimjeinek tlterheltsge
miatt NADH2-felesleg keletkezik aminek segtsgvel az alkohol-dehidrogenz-enzim (ADH)
reduklja az acetaldehidet etanoll , addig a katabolitrepresszi elmlsval (azaz a cukor elfogysa
utn) az etanolt NADH2 (~energia)- termels mellett ecetsavv oxidlja a mikrobk egy rsze szintn
ADH segtsgvel.
C3-metabolizmus
A hrom sznatomos cukrok (trizok) az els olyan molekulk, ahol a cukormolekulnak aldehid
(glicerin-aldehid) s keto formja (1,3-dihidroxiaceton) is ltezik. Ezek mellett maga a glicerin is (ami
ketocsoport nlkli triol) npszer hrom sznatomos sznforrrs. A propionsav-baktriumok pedig a
tejsavat is kpesek hrom sznatomos szubsztrtknt hasznostani.
A glicerinmetabolizmus tvonalait az 1.1. fejezetben mr bemutattuk (1.1.8. bra)
A tejsav mikrobilis ellltst az 1.3. fejezetben mr trgyaltuk.
A tejsav felhasznlst a propionsav-baktriumok gy vgzik, hogy els lpsben piroszlsavv
oxidljk (NAD+ fggetlen laktt-dehidrogenz (LDH) segtsgvel), majd az bekerl a citrt-krbe
(oxlecetsavval), s onnan kerl ki propionil-CoA formjban. ltalban 3 tejsav molekulbl 2
propionsav s 1 ecetsav keletkezik 1 szn-dioxid tvozsa mellett.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

43

A propionsav-baktriumok tejsavfogyaszt tulajdonsgt a tejsavtermel mikrobk keressekor is


kihasznljk a screening vizsglatoknl a kvetkezkppen: a tpagaron kinvesztik az izoltumokat,
UV-val ellik azokat, s fljk jabb agarrteget ntenek, amelyben nincs sznforrs, s amelyet
Propionibacterium shermanii-val beoltanak. Ez egyb metabolizlhat sznforrs hjn csak azon
izoltumok fltt fog kinni, amelyek termeltek tejsavat.
C4-metabolizmus
Ngy sznatomos cukor- (szer) molekulk a glicerin (glycerol) analgijra az eritrittel (msnven
eritritollal) kezddnek, amelynek mind a 4 sznatomjn 1-1 OH-csoport tallhat (2.1.4. bra). Jelentsge, hogy belle Gluconobacter sejtek fermentcijval eritrulzt lehet ellltani a kozmetikai ipar
szmra, mert brbarnt szerknt (a dihidroxiacetonra rzkenyek rszre) forgalmazzk. Az eritrulz
(ketoforma) aldz formjt eritrznak nevezzk.

2.1.4. bra: Eritrittl az eritrzig


A ngy sznatomos cukrok kz tartozik a trez is, amely az eritrz izomerje. A kt kzps OHcsoport nem transz, hanem cisz helyzet a trez esetben.
Az eritrz metabolizmusrl keveset lehet tudni (leszmtva, hogy Bertrand mr 1900(!)-ban lerta
a Gluconobacter suboxydans tenyszet eritrit-ertirz talaktkpessgt), de nagy valsznsggel
foszforilldik, majd pedig vagy szterkpzdik belle, s szedoheptulz formjban hasznosul [12],
vagy a pentzfoszft-ciklusba kerl, s energiatermelsre fordtdik [13].
C5-metabolizmus

2.1.5. bra: Pentz-foszft ciklus [14]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

44

Ipari mikrobiolgia

Az t sznatomos cukrok javarszt a pentz-foszft ciklusban (PFC, angolul: PPP-Penthose phosphate


pathway) hasznosulnak (2.1.5. bra). Ennek funkcija egyrszt, hogy reduklt koenzimet (NADH2)
termeljen, amelybl a terminlis oxidci energit raktroz ATP formjban. Ezen fell a ciklusban
szmos alapvegylet tallhat, amelyek ellltsa is a PFC feladata (ribulz 5-foszft, szedoheptulz7-foszft, Fruktz-6- foszft, glicerin-aldehid-3-foszft stb.). Amint az brrl is ltszik, a ciklus egy
oxidatv, s egy nem oxidatv szakaszra bonthat. Elbbi feladata a dekarboxilezs, utbbi a cukrok
felptse, illetve a lebont anyagcsere szmra a glicerin-aldehid-3-foszft ellltsa.
C6-metabolizmus
A cukorhasznosts kzponti tvonala a glikolzis. A hat sznatomszm cukrok elssorban ezen
keresztl jutnak el a piroszlsavig, majd a TCA cikluson keresztl szn-dioxidknt a lgkrbe s
NADH2-knt a terminlis oxidciba kerlnek aerob krlmnyek esetn. Egyes esetekben (pl.
heterolaktikus erjeszts) egy dekarboxilezds utn a pentzfoszft-ciklusba kerlnek, s azon
keresztl jutnak el a piroszlsavig.
C7-metabolizmus
A ht sznatomos cukrok kevsb jellemzek a mikrobilis anyagcsere-folyamatokban, mint kisebb
sznatomszm trsaik. Leggyakoribb kpviseljk a szedoheptulz (2.1.6. bra).

OH

OH

OH

HO
OH

OH

2.1.6. bra: Szedoheptuloz


Nevezktanuk is eltr a kisebb cukormolekulktl: a ht sznatomos szerkezetet ltalban kt
kisebb sznatomszm cukor nevbl nevezik el (2.1.7. bra)
Jelentsgk a mikrobilis liposzaharidokban van.

OH

OH
OH

OH
OH
D-gluco

OH

OH

D-glicero

2.1.7. bra: D-glicero-D-gluko-heptulz


Specilis energianyer metabolizmusok (biometallurgy)
A sznforrsok gyakran az energiaforrs szerept is betltik, az albbiakban azonban olyan klnleges
mikrobk kerlnek bemutatsra, amelyek szokatlan reakcikkal nyerik a szksges energit. Ilyenkor
gyakran klnbz fmek redox talaktsnak pozitv energiamrlegt aknzzk ki a mikrobk, ezrt
iparilag is fontos lehetsget rejtenek ezek a metabolizmusok a biobnyszat (biometallurgia)
terletn.
Az rckinyers s feldolgozs egyttes neve a metallurgia. Ebben tudnak a specilis
anyagcserj mikrobk segteni, ezrt nevezik ezt biometallurginak.
A metallurgiban az svnyokban kttt fmek kinyersre vagy a klasszikus olvasztst hasznljk, vagy valamilyen kioldst (=angolul: leaching). A leaching sorn 4-fle eljrs ll rendelkezsre:

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

45

1) savas kiolds (pl.: Zn), 2) lgos kiolds (pl.: Al), 3) magas hmrsklet kiolds (pl.: S2-), 4)
kiolds komplex kpzssel (Au).
Ilyen kioldsi folyamatot kpesek a mikrobk is elidzni (bioleaching), pldul a kalkopirit
(2.1.8. bra, legelterjedtebb rzsvny, CuFeS2)-bl a rz kioldsra kpesek az Acidiphilium-trzsek
(A. multivorum, A. cryptum, A. organovorum) a 2.1.1. egyenlet szerint. Az Acidiphiliumok az alfaproteobakterek kz tartoz valdi baktriumok.

2.1.8. bra: Kalkopirit [15]

CuFeS2 4 Fe3 Cu 2 2 S0 5 Fe2


2 Fe2 2 H 0,5 O2 2 Fe3 H 2O

2.1.1. egyenlet

Ezeket a szokatlan s nemrgiben felfedezett mikrobkat Peng s mtsi [16] a kvetkezkkel jellemezte: Gram-negatv sprtlan plck, amelyek hmrskleti optimuma 40C, pH optimuma 3,5 (!).
A tenysztskhz hasznlhat tpkzeget a 2.1.1. tblzat mutatja be, amelyen 40 ra alatt lezajlik a
fermentci.
2.1.1. tblzat: Acidiphiliumok tpkzege
Komponens
(NH4)2SO4
MgSO4*7H2O
K2HPO4
KCl
Ca(NO3)2
Szerves anyag
leszt kivonat

Koncentrci
(g/L)
3
0,5
0,5
0,1
0,01
2
0,01%

A tenyszetet FTIR-rel vizsglva megllaptottk, hogy polihidroxibutyrate-ot termel. J nvekedst tapasztaltak ramnz, xilz, mannit, fruktz, glutaminsav s glicerin sznforrsokon, de ntt szaharzon, laktzon, hisztidinen, glutaminon s etanolon is.
Tetraciklinnel s ampicillinnel szemben rzkenynek talltk ezeket a mikrobkat, mg a sejtfalszintzist gtlkkal (penicillinek cefalosporinok) szemben nem.
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

46

Ipari mikrobiolgia

Rendszertanilag a valdi baktriumok (Eubaktriumok)\Alfaproteobakterek\Nitrospira csoportba


tartoznak kzeli rokonaikkal a Leptospirillumokkal egytt. Ez utbbi baktriumok vasoxidlk, ezrt a
vaskinyershez hasznljk iparszeren risi folyamatos zem oxidl tartlyokban.
Nagy hasonlsgot mutatnak, de a filogenetika szerint nem kzeli rokonok a fentiek a szintn
acidofil vasoxidl Ferroplasmkkal. Pldul a Ferroplasma acidophilum egy 35C-os hmrskleti
optimummal rendelkez (mezofil) savkedvel mikroba 1,7(!) pH optimummal, amely fleg a savas
bnyameddben (salak) tallhat meg, klnsen a pirit- (FeS) tartalmban. ltalban azrt ezekben a
savas rcmaradvnyokban tenyszik, mert itt mr ms mikrobk (pl.: Leptospirillumok s
Acidiphilumok) lesavanytottk a pH-t, olyan mrtkben, amely az autotrf Ferroplasma szmra
optimlis. Ilyen krlmnyek kztt Ferroplasma mr tud energit nyerni a pirit Fe2+ ionjainak
oxidlsval, amelyhez O2-t hasznl terminlis akceptorknt. A folyamat sorn mellktermkknt
knsav termeldik. Ez tovbb savanytja a tpkzeget.

2.2. Primer metabolitok


Az letfolyamatok kvetkeztben a tpkzegbe kikerl metabolitokat nevezzk elsdleges (primer)
metabolitoknak. Az letfolyamatokat a hasznostand szubsztrtok szerint csoportostva mr
bemutattuk (2.1. fejezet). ltalban a klnbz erjedsek (amelyeket mr szintn trgyaltunk 1.3.
fejezet) termkei tartoznak ide, mint etanol, ecetsav, tejsav, propionsav, 1,3-propndiol, aceton,
butanol, vajsav. Ezek nmlyikt lelmiszer-ipari, de fleg vegyipari clokra, illetve biozemanyagknt
hasznljk. Mindezek azt jelentik, hogy nagy mennyisgben alacsony ron kell ezeket ellltani, ezrt
igen hatkony anyagcserj termel mikrobkra van szksg, amely kpes j hozammal j konverzit
elrni viszonylag gyorsan (=j produktivits).
Fiziolgiai szempontbl ltalban az energiatermel folyamatok (NADH2 regenerls, glikolzis, TCA
ciklus stb.) mellktermkei.

2.3. Szekunder metabolitok


De novo szekundermetabolit-termels
A primer metabolitokkal szemben a szekunder metabolitok termelse nem a norml letfolyamatok
kvetkezmnye, hanem a specilis krnyezeti felttelek ltal kivltott reakci. A szekunder
metabolitok funkcija ugyanis elnyszerzs biztostsa megromlott letkrlmnyek (megvltozott
pH, cskkent tpanyag, cskkent lettr) esetn. Ilyen helyzeti elnyk kovcsolsval elsegthet az
egyed s a faj fennmaradsa nehz idkben is.
Trsadalmi szempontbl a mikrobilis s nvnyi szekunder metabolitok jtszanak fontos
szerepet.
A szekunder metabolitokkal kapcsolatban nhny fogalmat illik tisztzni:
anti- biosz=let elleni, teht az antibiotikum minden llny elleni szer
inhibtor=gtlszer, ami lasstja, vagy meglltja a nvekedst
sztatikum= lelltja a nvekedst (pl.: fungisztatikum)
cid=pusztt (bakteriocid, fungicid, viricid)
A helyzetielny-szerzsre klnbz stratgik kzl vlaszthat egy adott llny:
A) Mozgs (baktriumok, protozok mozgsszervvel rendelkezhetnek, s vizes kzegben kpesek
a helyvltoztatsra, nvnyek pedig helyzetvltoztatsra).
B) Terjeszked tpus nvekeds (pl.. fonalas gombk gyors kolonizcija, mindent bebort
penszfonalak, ehhez szksges a flnedves szubsztrt).
C) pH megvltoztatsa metabolitokkal: savtermelk (pH-t le), ammonifiklk (pH-t fel)
D) Hmrsklet loklis megvltoztatsa a mikrokrnyezetben (pl.: nagy mennyisg metabolikus
h termelse, ami megemeli a hmrskletet (pl.: komposztban, silban), s ez kedvez a
termofileknek.
E) Sziderofrok (ers fmkomplexkpzk) kzegbe bocstsval az enzimek esszencilis
fmkofaktorainak elszvsa.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

47

F) Antibiotikumok (szekunder metabolitok) termelse, amelyek a tbbi llnyre kros hatssal


vannak (sejtfalszintzist, fehrjeszintzist gtolnak stb.).
G) Extracellulris enzimek termelse tbb clbl is, pldul a nehezen hozzfrhet szubsztrtok
mobilizlsra (amilzok, cellulzok stb.), vagy a konkurencia bontsra (lizozim, kitinz stb.)
Az ipari mikrobiolgia szempontjbl az F) s G) pontok az rdekesek, m figyelembe kell venni,
hogy a termszetben az gy kibocstott anyagok (szekunder metabolitok s extracellulris enzimek)
csak mikrokrnyezetben kell hogy hassanak, ezrt a termszetbl izollt termel trzsek csak kis
koncentrciban termelik ezeket az genseket, illetve a tl nagy dzis a termel mikrobt is
krosthatja.
A legfontosabb szekunder metabolitokat foglalja ssze 2.3.1. tblzat.
2.3.1. tblzat: A legfontosabb mikrobilis szekunder metabolitok.

A szekunder metabolitok mkdst hatsuk szerinti csoportostsban mutatjuk be [17].


Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

48

Ipari mikrobiolgia

Antagonizmusok kialaktsa
1A) gomba s baktrium kzdelme sorn a Cephalosporium gramineaum fonalas gomba a
baktrium sejtfalszintzist gtl antibiotikumot termeli, de csak az szi bza felsznn (in
vitro Petri csszn nem)
1B) mikoparazitizmus: egyik gomba a msik lskdje. Pl.: az szaki feny parazitja egy
rozsdagomba (Monocillin nordinii), amelyen lskdik a Cronartium coleosporioides gomba,
s ezt antibiotikum termelssel ri el. Ezt az antibiotikumot fel lehet hasznlni a fenykrtev ellen.
1C) bakterilis predci ll fenn a Mixobaktriumok s ldozataik kztt, amely utbbiakat
antibiotikum segtsgvel lik el
Olykor elfordul olyan is, hogy sajt fajtrsai ellen termel antibiotikumot egy mikroba, pl.:
Pseudomonas phenazinium (fenazin tpus antibiotikumot termel), s az antibiotikumot nem
termel fajtrsaikat alaposan tlnttk.
1D) bakterilis kompetci: az ambk ltalban baktrimokat esznek, de egyes baktriumok (pl.:
Serratia marcescens) piros pigmentanyagot termelnek, ami elli a protzot (az albino, azaz
pigmentmentes fehr baktrium nem vltott ki cisztsodst, sprakpzst pusztulst az amba
rszrl)
1E) mikroorganizmus klcsnhatsa magasabb rend llnyekkel: gyakran toxintermels
(nvny ellen fitotoxin, ami gyakran ms mikrobkra is antagonizmussal hat, mintegy
antibiotikum), amire a nvny fitoalexin (~nvnyi antibiotikum) kivlasztsval vlaszol.
1F) mikrobk inszekticid hatsra plda a Beauveria bassiana (fonalas gomba) rovarok ellen,
illetve a Bacillus thringiensis endosprjnak ciklikus -toxinja a sznyogok ellen.
A kullancsok is rendelkeznek letalitssal jr gombs parzitval. A kullancsok termszetes
ellensgeinek felhasznlsa a kullancspopulci visszaszortsa rdekben a Biokontroll.
Mivel 4 ellensgt ismerjk a kullancsoknak, k a potencilis jelltek a biokontroll-funkci
betltshez.
sisakos guineai madr kullancsokkal tpllkozik, m ha sikerlne vele kullancsltszmot
cskkenteni, akkor a madrpopulci is cskkenne, ettl megint nhetne a kullancsok
szma, ekkor a madarat jra kellene telepteni
b) kullancsok rovar parazitja az Ixodiphagus, amely a darzsflkhez tartozik, s 0,1-5
mm-es nagysg. Petit a kulllancsba rakja, amelyek kikelskkor meglik a kullancsot
c) fonalfreg- (nematda) parazitval, de ez csak a vrrel magt jl teleszvott nstny
kullancson hat
d) fonalas gombk parazitizmusa: Metarhizium anisopliae (zld mszkr), Beauveria
bassiana (fehr mszkr), Lecanicillium psalliotae, Paecilomyces fumoroseus).
A Metharizium anisopliae [18] mr rendelezik ipari felhasznlssal a malriasznyog,
kullancs- s termeszirtsok sorn. Az imperfect gombk aszkomiceta csoportjba
tartozik. 2007 ta ipari lipztemel is, mert az indiai biodzelgyrts sorn
szobahmrskleti optimummal rendelkez lipzokra volt szksg. Inszekticid hatsnak
kifejtsekor megkapaszkodik a konidiosprja a rovar felsznn, s kutikulumbont
enzimekkel hift nveszt a rovar kltakarjba. Amint tr a rovar pncljn, tallkozik
annak immunrendszervel, ezrt vagy maszkroznia kell magt, hogy az immunrendszer
ne tasztsa ki, vagy immunszupressznsok termelsvel cskkenti az immunrendszer
hatkonysgt.
A M. anisopliae metabolitjai a destruxinok, amelyek 5 aminosavbl s hidroxisavbl
felpl cirkulris fehrjk. Ez lehetsget teremt a rekombinns biopeszticid termelsre.
A destruxinok egybknt citotoxikusak, mert Ca2+ transzportot vgeznek, s gy az
izmokat is blokkoljk. Mr tbb mint 30-fle destruxin szerkezett dertettk fel s rtk
le.
a)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

49

1G) Mikrobk antagonizmusa magasab rend latok (s ember) fel: pldul a fuzriumos bza
nem alkalmas mg takarmnyozsi clra sem, mert a krost fuzriumok mikotoxinokat
termelnek, amelyek mind a haszonllatot, mind az embert veszlyeztetik. A ragadozk is a
mikrobk temelte mikotoxinok miatt esznek ltalban friss hst, kivve a dgevk. A poshadt
vz ivsakor a vzben lv algk termelte toxinok okoznak rosszulltet.
2) Fmionszllt metabolitok
A fmionok (fleg kationok) fiziolgiai szerepe meghatroz, mivel az enzimkatalzis
kofaktorai, ezrt egyes esszencilis fmionok elszvsa a konkurencia ell komoly elnyhz
juttatja a fmionszllt metabolit termeljt. A nitrognfixl baktriumok esetben pldul
a nitrogenz- enzim Mo2+ jelenltben a legaktvabb, ms fmionokkal cskkent aktivits.
A fmionszllt metabolitok ltalban ionofrok, azaz olyan transzmembrn gensek
(tbbnyire peptidek), amelyek az ionok (elssorban alkli, s alklifldfm) ramlst a
sejtmembrnon keresztl meghatrozzk vagy aktv transzporttal, vagy csatornakpzssel.
A vasszllt faktorok (=sziderofrok) sok esetben antibiotikus hatsak. A primer s
szekunder metabolitok hatrn helyezhetk el, mert ugyan nem szksgesek a nvekedshez,
de vashinyos krlmnyek kztt stimulljk a nvekedst. A mikrobasejteknek ktfle
fmszllt rendszere van: egy kis s egy nagy affinits. Utbbihoz tartoznak a sziderofrok
is. Amg van elegend fmion jelen, addig a kis affinits rendszer mkdik. m a fmion
cskkense (pl.: valamilyen keltkpz megjelense miatt) aktivlja a sziderofrtermelst.
Szmos Streptomyces, Nocardia s Micromonospora faj termel sziderofr faktorokat. A
sziderofrok antibiotikus hatsa abban nyilvnul meg, hogy termeljk kihezteti a
konkurencit vas szempontjbl, mivel az nem kpes a vas-szideramin komplex felvtelre,
s gy nem jut vashoz. A sziderofr termelje pedig komplex formban lv vasat veszi fel.
Ilyen antibiotikum a nocardamin s a desferritriacetilfusigen.
Az ionofrok feladata mikrobkban, hogy segtsenek fenntartani a magas intracellulris
K+/Na+ arnyt is, azaz a koncentrci gradiens miatt kijutott kliumionokat visszapumpljk
a sejtbe, mikzben a szintn koncetrcigradiens miatt bejutott ntriumionokat kipumpljk a
kzegbe.
Az ionofr antibiotikumok kz tartoznak az enniatinok is, amelyek a destruxinokhoz
hasonlan ciklikus peptidek s a K+/Na+ transzportban vesznek rszt [20]. Piacon lv
ionofr antibiotikumok a calcimycin, ionomycin, lysocellin s a lasalocid, amelyek a Grampozitv mikrobk ellen hatsosak.
3) Mikroba s nvny szimbizisa szekunder metabolitok segtsgvel
3A) Tipikus plda a nvny-fonalas gomba szimbizisra az ektomikorhiza, ahol a nvnyi
tpanyagfelvtelt a gykr krl elhelyezked fonalas gomba segti. Ilyenkor gyakran (pl.:
fenyflknl) termelnek a nvny vdelme cljbl antibiotikus hats szekunder
metabolitokat a baktriumok ellen, cskkentve a betegsgveszlyt, s elnyhz juttatva a
szimbizist a tpanyagversenyben.
3B) Sziderofrok segtsgvel baktriumok is lhetnek nvnyekkel szimbizisban, ahol a
sziderofrt termel baktrium segti a nvny nvekedst. A pszeudobaktin termel
Pseudomonas fluorescens vagy Pseudomonas putida pldul elszvja a vasat a krokozk
ell egy lineris hexapeptid (sziderofr) segtsgvel.
4) Mikroba -nematda szimbizisa szekunder metabolit segtsgvel
Xenorhabdus luminescens baktrium s rokonai a Xenorhabdus fonalfrgek endoszimbioniti. Ez a szimbizis egytt tmadja meg a rovarokat, amelyeket a baktrium ltal termelt
antibiotikum pusztt el, s amely antibiotikum a tbbi baktriumot is tvoltartja a rovartetemtl.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

50

Ipari mikrobiolgia

5) Mikroba-rovar szimbizist is lehetv tesznek egyes szekunder metabolitok


Erre plda a rizsen l barna szcske, amelyben l Bacillus polymyxin polymyxin
antibiotikumot termel (ami egy ciklopeptidbl s egy hidrofb farokbl ll, s a Gramnegatvak lipopoliszaharid rtegt krostja), s gy vdi a szcskt a rizs flrjtl
(pl.:Xanthomonas campestris) .
6) Ferromon szerep szekunder metabolitok
6A) A Mucorales nemzettsgnl hm(+) s nstny(-) ivar gamtk tallkozsakor a
heterotallikus (+ s -) hifkbl trtn zigta kifejldshez trisporinsav szksges, de ennek
bioszintetkus tvonala rszben a +, rszben a - ivar fonalakon van kdolva.
6B) Allomycesek esetben a szirenin nev szekunder metabolitra a mozgkonyabb hm gamtk a
nstnyek fel vndorolnak kemotaxissal.
6C) Egy klnleges szimbizis esetben a rovar (poszmh) nemi ferromonjt az emsztcsatornjban l Aspergillus ochraceus termeli.
7) Morfolgiai differencildst is befolysolnak a szekunder metabolitok
Az antibiotikum-termels gyakran a prespora fzisban trtnik, a vegetatv forma hanyatl
fzisban. A sprzs s az antibiotikum-termels kztti kapcsolatot tbbflekppen is
bizonytottk, pldul egyes asporogn mikrobk elvesztettk antibiotikum-termel
kpessgket, illetve a sprakpzs inhibitora gtolta az antibiotikum-termelst is.
A Bacillus brevis a sprjnak kls felsznre Gramicidin S-t (szekunder metabolitot)
vlaszt ki, amely gtolja az elektrontranszport lncot s a kicsrzst. Extracellulris
protezzal le tudja hastani, s gy a csrzst megindtani.
Penicillium brevicompactum mikofenolsavat termel a kondidium tartk kifejldsekor,
aminek hatsra a tart a fny fel fordul.
A msodlagos anyagcsere a primer anyagcsere sorn keletkez metabolitokbl pti fel a
szksges szekunder metabolitokat. A fbb tvonalak az acetil-CoA-bl keletkez lipidek, illetve az
oxlecetsavbl indul szekunder metabolitok, valamint a szintn acetil csoportbl indul terpenoidok.
A szekunder metabolitok ellltst szmos tnyez befolysolja. Mind szn-, mind
nitrognforrs tekintetben a nehezebben hozzfrhet, limitlt mennyisg tpanyag kedvez a
msodlagos anyagcseretermkek keletkezsnek. gy sznforrsbl a klnbz poli- s/vagy
oligoszacharidok kedvezbbek az egyszer cukroknl. Nitrognforrsknt a fehrjk alkalmazsa nem
javasolt, mert a bellk keletkez aminosavak negatv visszacsatolssal hatnak a sajt szintziskre, s
ezen keresztl a szekunder anyagcserre. Foszforforrs tekintetben is a lassbb nvekeds (limitci)
a kedvez.
Nha szksges lehet egy-egy kulcsenzim termeldsnek indukcija a hatkony msodlagos
anyagcserhez, mint pldul Acremonium crysogenum esetben metioninadagolssal lehet a
cephalosporin-szintzist fokozni, vagy a Claviceps trzseknl az ergot alkaloidok szintzishez
triptofnadagolst alkalmaznak. Tovbbi tnyezk lehetnek a minor komponensek (fmionok) s az
oldottoxign-koncentrci, amelyek a szubsztrtokhoz hasonlan hatnak (limitci a kedvez), illetve
a CO2, amely gtolja pldul a penicillin kpzdst, vagy a fny, amelyrl csak kevs adat ll
rendelkezsre. A mikrobaszaporodsi fzis (trofofzis) s a termk keletkezsnek fzisa (idiofzis) a
szekunder anyagcsere sajtossgaknt klnvlik (mg a primer metabolitok termelse ltalban
nvekedshez kapcsolt a termk kpzdse), s gyakran az idiofzis alatt alkalmazand hmrsklet
alacsonyabb, mint a trofofzis.
Szteroid- (szekunder metabolit) konverzi
A szteroidok kzs vonsa a kmiai alapvz (2.3.1. bra), hogy a msodlagos anyagcsere termkei,
valamint hogy fontos fiziolgiai szerepk van az alacsonyabb rend s a magasabb rend llnyek-

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

51

ben, gy az emberben is. Ez utbbi tulajdonsguknak ksznheten a gygyszeripar szmra rgta


fontos vegyletek, gy ellltsuk s hasznostsuk szmos kutats trgya.

2.3.1. bra: A szternvzas alapvegylet a koleszterin szerkezete


Bioszintzisk sorn a sejtek acetil-CoA-bl ptik fel tbb lpsben az allilpentenil-pirofoszftot
s az izopentenil-pirofoszftot, amelyek addcijbl szkvalenon keresztl pl fel az alapvegylet, a
lanosterin. A szteroidneogenezis sorn ennek mdostsval keletkezik a tbbi szternvzas vegylet.
A szteroidok csoportostsa a funkci s a bioszintzis, valamint a termel llny szerint trtnik
(2.3.2. bra), gy megklnbztetnk:

2.3.2. bra: Szteroidok csaldfja [22]


- llati szteroidokat
- zeltlbak szteroidjai
- gerincesek szteroidjai
- hormonok: a kortikoidok olyan hormonok, amelyeket a mellkvesekreg termel (innen a nv
cortex kreg). Megklnbztetjk a shztartsban szerepet jtsz mineralokortikoidokat s
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

52

Ipari mikrobiolgia

a cukorhztartsban szerepl glkokortikoidokat, valamint a nemi hormonokat (ni/frfi nemi


szervek termelik, pl.: sztrogn, progeszteron, tesztoszteron), illetve az anabolikus
szteroidokat, amelyek andrognreceptor-stimultorok, s gy az izomnvekedst serkentik.
- koleszterin: sejtmembrn-fluiditsrt felel
- nvnyi szteroidok fitoszterinek: ltalban a szteroidkonverzi ipari alapanyagai (2.3.3. bra),
fiziolgiai funkcijuk ppgy a sejtmembrn befolysolsa, mint az llatok esetben a koleszterin.
- gomba eredet szteroidok ergoszterinek

HO

HO

HO
Szitoszterin

Sztigmaszterin

Kampeszterin

2.3.3. bra: Ipari alapanyagknt hasznostott fitoszterinek


Mint az a fentiekbl kitnik, a humnszervezetben nagyon fontos szablyoz szerepet tltenek be
a szteroidok, ezrt a gygyszati cl ellltsuk tbb vtizedes mltra tekint vissza. Ezek kezdetben
kizrlag szintetikus vegyipari lpseket tartalmaztak, m a krnyezetvdelmi elrsok
szigorodsval s a sztereokmia fejldsvel a biokmiai lpsek egyre nagyobb teret nyertek. Mivel
ilyen vegyletek esetben az optikailag aktv formk tbb kiralitscentrummal is rendelkeznek, s a
szternvz egy egy pontjn sztereoszelektv vdcsoportok alkalmazsval, majd eltvoltsval
oldhat csak meg a biolgiailag aktv vegylet ellltsa. Ezrt clszerbb a mikrobk enzimeinek
sztereoszelektivitst kihasznlva egy-egy specifikus mdostst ltaluk elvgezetni.
Mivel azonban ezek a vegyletek a msodlagos anyagcsere termkei, ezrt nem az akvan
nveked sejttenyszet vgzi a biokonverzit, hanem a felszaportott nyugv llapot sejtek indukcit
kveten valstjk meg a sztereospecifikus talaktst. Mivel a szteroid szubsztrt nem a mikroba
sznforrsa (legfeljebb energiaforrs), ezrt szinte vesztesg nlkl (nagy hozammal) alakthat t
termkk. Technolgiai nehzsget ltalban a szteroidok rossz vzoldhatsga jelent, amelyet
gyakran ciklodextrinek alkalmazsval kzdenek le. A ciklodextrinek olyan ciklikus poliszaharidmolekulk, amelyek magukba zrhatnak apolris hatanyagokat (a gyr kzepbe), s mivel a
ciklodextrinek vzben oldhatak, gy a beljk csomagolt apolris hatanyag is oldhatv vlik. A
ciklodextrin belseje s a folyadkfzis kztt adszorpcis megoszls ll fent, azaz ha a csekly
mrtkben oldott molekult a mikrobk a folyadkfzisbl elfogyasztjk, helykre a ciklodextrinekbl
jabb molekula fog kiolddni.
A mikrobilis szteroidkonverzik igen szleskren alkalmazhatk, de leggyakrabban a 17-redukci/17--oxidci, illetve ennek valamelyik msik OH-csoporttal egytt trtn szinkrn
redukcija/oxidcija (pl.: 3,17-diketoszteroid redukci) fordul el.
A 17-es atomon trtn oxidci/redukci az l szervezetekben is igen fontos, mivel a nemi
hormonok egymsba alakulst jelenti. A redox reakcit a 17-hidroxi-szteroiddehidrogenz-enzim
katalizlja, amelynek aktivitsa teht egyes nemi folyamatok felelse. Ennek alapjn a
gygyszeriparban is gyakran hasznljk ezeket az enzimes (vagy nyugvsejtes) biokonverzikat a
terpis hormonksztmnyek ellltsra. Az els publikci 1937-ben Saccaromyces cerevisiae-rl
rja le ezt a kpessget, azta azonban szmos baktriumrl (Pseudomonas, Bacillus, Brevibacterium,
Mycobacterium, Streptomyces fajokrl), gombrl (Aspergillus, Mucor, Penicillum, Hansenula,
Pichia, Saccharomyces), algrl (Chlorella, Chlorococcum) s protozorl (Pentatrichomonas,
Trichomonas) derlt ki a 17-OH-SDH aktivits.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

53

2.3.2. gyakori mikrobilis szteroidkonverzik


ksr
17--redukci
hidroxilezs
C5
C6
Bacillus sp., Botryosphaerica obtusa
C7
C10
C11
C12
C14
C15

Bacillus sp., Botryosphaerica obtusa,


Bacillus sp.
Bacillus sp., Phycomyces
blakesleeanus,

17--oxidci
Penicillium crustosum, P.chrysogenum
B. stearothermophilus, B. obtusa,
P. blakesleeanus
Botrytis cinerea, Rhizopus stolonifer
Absidia glauca
Cephalosporium aphidicola, R. stolonifer
A. glauca, B. obtusa
Bacillusok
A. glauca, Aspergillus fumigatus, B. obtusa

Az albbiakban nhny jellemz ipari szteroidkonverzit mutatunk be.


Ketoredukci Saccharomyces cerevisiae-vel nemi hormonok ellltsra
A szitoszterinbl ellltott androsztn-dionbl (AD) ketoredukcival tesztoszteront lehet ellltani,
noha az l emberi szervezetben a frfi nemi hormon koleszterinbl keletkezik. A ketoredukcit egyes
S. cerevisiae sejtek kpesek elvgezni. A tesztoszteronbl a C17 metilezsvel elbb metil-tesztoszteront (METESZ) lehet ellltani, majd az Arthrobacter simplex baktriummal ismt C1 dehidrognezst lehet elvgezni, ami Nerobolt eredmnyez (roborl szer), illetve a ni nemi hormonok
bioszintzise is koleszterinbl s/vagy tesztoszterinen keresztl trtnik (sztrogn/progeszteron).
Actinobacter fajok ltal vgzett szteroidkonverzik [24]
Szteroid- (oldallnc) lebonts: Szmos Actinobacter faj hasznostja a szteroidokat, mint egyedli szns energiaforrst. A lebontsi mehanizmus fgg a lebontand szteroid szerkezettl s a mikroba
fajtl. Az esztrnokat ltalban az A gyr hastsval bontjk le, mg a B gyr a leghozzfrhetbb
rsze a molekulavznak az androsztnek s a pregnnok esetben. A koleszterinnl s az epesavaknl
a lebomls kezddhet az oldallncon vagy a B gyrn. Nocardia fajok s mg nhny Streptomyces
ismert A-gyr-hast. Ennek ellenre az Actinobacterek tbbsgt a B gyr hastsval jellemzik.
Elsdleges figyelmet kapnak a biotechnolgiban azok az Actinobacterek, amelyek a szterinek
oldallncait bontjk, mikzben a szternvzat rintetlenl hagyjk. Nocardia restrictus s ms
Actinobacterek lehetv teszik a szls szubsztituens retroaldol elimincijt a C19-en s sztrognt
kpeznek 3,17-dioxo-C19(CO2OH)-androsztnbl. Az sztrognhozam csupn 8% volt, m 19hidroxiszitoszterol 3-acett talaktsval 72%- is elrhet.
Az Actinobacterek (Nocardia restrictus, Proactynomyces erythropolis stb.) a szetrinek klsavv
trtn alaktst is elvgzik.
A szterin oldallncnak lebontsa 14 konszekutv biokmiai reakcibl ll, amelyeket legalbb 9
klnbz katabolikus enzim katalizl. A fbb megoldand problmk a 3,17-diketoandrosztanok
oldallnc lebontsval trtn ellltsakor a kvetkezk: 1) a szteroidvz lebomlsa, 2) a
reakcitermkek ltali oldallnc-oxidci, 3) szterinek alacsony oldhatsga a vizes kzegben. Az 1)
problma kikszblsre a szubsztrt kmiai mdostsa, vagy a 9-hidroxilz kmiai inhibcija,
esetleg 3KSD blokkolt mutnsok hasznlata jelenthet megoldst.
A szitoszterinbl az oldallnc lehastsn keresztl Mycobacterium phlei baktriummal lltanak
el szmos zemben androsztendiont (AD, androst-4-n-3,17-dion), amely tbb hormonlis ksztmny intermediere. A 70%-os konverzit kveten diklretnnal vagy szelektven 85%-os metanollal
kiextrahljk a fermentlevet, s az extraktumot beproljk. Az AD szintzis utn acetilnt addicionltatnak, s a progeszteron hats etiszterint nyerik, amelyet tovbb is lehet alaktani spironolaktonn
(vzhajt).
A termel Mycobacterium phlei nevt a mykolsavnak ksznheti, amely egy hossz sznlnc
zsrsav a sejtek membrnjhoz ktve. E klnleges sejtfalszerkezet miatt nem mkdik a Gram-fests
sem, illetve klnsen ellenllv vlik a mikroba.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

54

Ipari mikrobiolgia

A mikrobk letben az oldallnc lebontsnak a fiziolgiai szerepe az ATP (energia) generls


[23]. Ehhez a katabolikus enzimek 4 csoportjt hasznljk a mikrobk fel: a zsrsavak -oxidcis
lebont enzmeit, az -oxidcis enzimeket, a metil-krotonil-CoA karboxill rendszert s a propionilCoA karboxilz rendszert. Ezek 9 enzime vesz rszt a szteroidok oldallnclebontsban 14 konszekutv reakciban, amelyek a kvetkezkppen sszegezhetk:
1 szitoszterin +3FAD++3NAD++3 coA 3 FADH2+ 3 prop-CoA +3 NADH2 +1 AcOH
3 prop-CoA+1 AcOH 18 NADH2+ 7 FADH2 + 1 AD
A keletkezett reduklt koenzimek vgs oxidcijakor tbb mint 80 ATP molekula keletkezik 1
oldallnc lebontsakor.
A kapott AD a kiindulsi intermediere az etiszterinnek (progeszteron hats, kmiai ton acetiln
addcival ellltott AD) s a progeszteronoknak
Hidroxilezs: Az Actinobacterok kpesek a szternvz hidroxilezsre klnbz pontokon
(1,2,6,7,9,11,12,14,15,16,17). A 9a hidroxilezst a Corynebacterium, Nocardia, Rhodococcus s
Mycobacterium nemzetsgek egyes fajai vgezhetik. Az Actinobacterok ketoszteroid-9-hidroxilzt
(9-KSH) eddig nem rtk le rszletesen, valsznleg az izollsi s tiszttsi nehzsgei miatt. Egy
ternr 9-KSH komplexet, amely flavoprotein reduktzt s ferredoxint is tartalmaz, izolltak egy
Nocardia fajbl. Az Arthrobacter oxydans 9-KSD-a s 3-KSD-a is plazmidon kdolt, de a nukleotid
szekvencijuk mg nem ismert.
A Rhodococcus 9-KSH-a egy dimer monoxigenz rszt tartalmaz, s a kdol gneket is
azonostottk mr.
Az Actinobacterok 11a s 11b hidroxillkpessge egy ritka tulajdonsg. Reichsteins szubsztrtot hidroxileztek Streptomyces fradiae segtsgvel hidrokortizonn, de csak csekly hozammal
(1,5%).
Az Actinobacterok azon tulajdonsga, hogy kpesek a szteroid vegyleteket a 22,23,24, s 26-os
poziciban is hidroxilezni intenzv kutats alatt ll, ami ahhoz is vezetett, hogy feltrjk a szteroidoldallnc lebomlsnak mehanizmust. Mycobacterium fortuitum szitoszterin talaktsa kzben
talltak 22-es atomon trtnt hidroxilezs 3-oxo-4n szrmazkait. A tovbbi kutatsok pedig azt
mutattk, hogy a szterinek sorozatos hidroxilezse az oldallnc ezen pozicijban az Actinobacterok
ltal vgzett oldallnclebonts egyes lpsei.
A hidrokortizon-elllts els lpsben Mycobacterium smegmatisszal a szitoszterin
oldallnct eltvoltjk, s a baktrium ugyanazon fermentciban a C9-re OH-csoportot is bevisz
(hidroxilez). Az gy kapott 9-hidroxi-androsztndionbl kmiai talaktsokkal lltjk el a
hidrokortizont (2.3.4. bra). Ezek els lpse a vzelvons, majd vzaddici (e kett kvetkeztben az
OH csoport tkerl 9-rl a 11-es sznatomra), majd oldallnc-kialakts kvetkezik acetilnnel, vgl
annak mdostsa.
A fermentcis lpshez glicerint adnak sznforrs gyannt, a szitoszterin oldallnchastsa pedig
az elbbi pldhoz hasonlan az energit szolgltatja a sejtek szmra. Mivel a szitoszterin
kristlyos formban van jelen, amelynek felsznhez a mikrobk odatapadnak, valamint a termk is
kristlyos formban keletkezik, ltszlag nem trtnik semmi, pedig a kristlyfermentci nyomn
rtkes talaktsokra kerl sor a szubsztrton.
A fermentcival ellltott 9-hidroxi-AD feldolgozsa az AD-ellltssal analg mdon
trtnik: elszr teljes extrakcival kinyerik a maradk szubsztrtot s a keletkezett termket
(diklrmetnnal), majd szelektv extrakciban elvlasztjk a kiindulsi s termk szteroidokat
(diizopropil terrel a termket oldjk, metanollal a szitoszterinmaradkot).
A kinyert 9a-hidroxi-androsztndiont 85%-os foszforsavval fzik vz kilps rdekben, majd
ismt vizet addicionltatnak s 11a-hidroxi-androsztndion keletkezik. Erre acetilnt addicionltatnak,
majd az gy bevitt oldallnckezdemnyt alaktjk tovbb, amg a hidrokortizonhoz jutnak.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

2. Az ipari mikrobiolgia biokmiai s fiziolgiai httere

55

Mycobacterium smegmatis

, 85% H3PO4

HO

+H2O

OH

5-6 nap, 11-12g/L, 70% konverzi, 1-3% inokulumm

HO

HO
H2O

Szitoszterin

9-hidroxi-androsztndion

O
HO

HO

HO

OH

O
CH

CH

HO

HO

Klium+acetiln
HO

HO

-hidroxi-androsztndion

O
Hidrokortizon

11-hidroxi-etiszterol

2.3.4. bra: Szitoszterinalap hidrokortizon- (bio)szintzis


Dehidrognezs: A C-C ktsek dehidrognezsnek kpessge egy jellegzetes tulajdonsga az
aktionobaktriumoknak, kztk is az Actinoplanes, Arthrobacter, Corynebacterium, Micromonospora,
Mycobacterium, Nocardia, Nocardioides, Rhodococcus s Streptomyces nemzetsgek egyes fajainak.
ltalban a C1, C4, C7, C8, C9, s C16 szn s az azt kvet sznatom kztt alakulnak ki a
dehidrognezs miatt ketts ktsek az Actinobacterok aktivitsnak ksznheten.
A 3-ketoszteroidok mikrobiolgiai 1(2) dehidrognezse (amit az 1950-es vek ta hasznlnak) a
prednizolon- s predniszteroidgyrts alapja. gy az Arthrobacter simplexet hasznljk a pregnnok,
androsztnok s szterin, illetve epesavak szrmazkainak ellltsra tbb vtizede.
A hidrokortizon hatkony gyulladscskkent hatanyag, de kedveztlenl hat a shztartsra,
ezrt a kevesebb mellkhatssal rendelkez rokon vegyleteit (pl.: prednizolon) is forgalmazzk. A
prednizolont aerob biokonverzival az Arthrobacter simplex (ms nven Nocardioides simplex vagy
Pimelobacter simplex, propionsav baktrium) lltja el hidrokortizonbl (2.1.13. bra).
O
HO

OH
O

HO
HO

OH

HO
HO

HO

Arthrobacter simplex
O

O
Hidrokortizon

O
Deperzolon

Prednizolon

OH

O
HO

O
O

O
Triamcinolon-acetenonid
(Ftorocort kencs)

2.3.5. bra: Hidrokortizon biokonverzija prednizolonn s szrmazkaiv


Hidrognezs: A szternvz ketts ktseinek hidrognezst gyakran a dehidrognezsrt felels
enzimek vgzik. gy a Nocardia opaca s N. corallina 3-ketoszteroid-dehidrogenza (3-KSD)
szteroid- dehidrognezst s hidrognezst is vgez az 1(2) pozciban. Ezzel szemben a
Mycobacterium globiforme esetben 3-KSD s 1(2)-dehidrogenzok kln enzimek. Mycobacterium
trzsek, amelyek a szitoszterinbl androsztndiont (AD, androszt-4-n-3,17-dion) s androszt-

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

56

Ipari mikrobiolgia

dindiont (ADD, androszt-1,4-din-3,17-dion)-t lltanak el szintn rendelkeznek kln 1(2)


dehidratl s 1(2) redukl enzim rendszerrel.
A C4 kettskts-redukcijra Streptomyces faecalist hasznlnak.
A pregnnok C1-es ketts ktsnek redukcija gyakran a C20 -redukcijhoz kapcsolt, amint az
az Arthrobacter simplex s A. globiformis pldjn is ltszik. Ez utbbi reakci ltalban szuboptimlis levegztets esetn fordul el; a reakcielegy levegztetse az egyenslyt a C1-n-20ketoszteroid5 fel tolja el.
Epoxills: Egyes Nocardia s Corynebacterium fajok kpesek a 9(11)-dehydroszteroidokat a 9,
11-epoxi-analgjaikk alaktani. Az ilyen talaktsoknl a megfelel 9-hidroxi szteroid a
valsznstett kztitermk.
Alkoholok oxidcija ketonokk vagy aldehidekk: Az Actinobacterok nagyon hatkonyak a 3bhidroxilcsoport oxidcijban a megfelel keton ellltsra. ltalban szles a szubsztrtspecifitsuk, s nagy a sztereospecifikussguk, ami ipari szempontbl rendkvl kedvez, mivel szinte
brmilyen szternvzas szubsztrtot optikailag tiszta termkk kpesek alaktani. gy a
Corynebacterium mediolanum a dehidro-epiandrosteront (DHEA) hatkonyan alaktja tesztoszteronn.
A C5-n-3-hidroxi szteroidok 3 hidroxicsoportjnak oxidcijt az Actinobacterok a C5->C4 ketts
kts izomerizcijval kapcsoltan vgzik. Nocardia erythropolis esetben megllaptottk, hogy a
szteroid C5 kettsktsnek hinya megakadlyozta a 4n-3-oxo forma kpzdst. Ezek az enzimek,
amelyek a 3-hidroxi-5-n talaktst 3-oxo-4-nn vgzik az oxidzok csaldjba tartoznak (pl.:
koleszterin oxidz (CO), EC 1.1.3.6.). Az Actinobacterok CO enzimt jelenleg a koleszterin
kimutatsra analitikai clokra hasznljk. Ilyen CO enzimaktivitst szmos Actinobacterban talltak,
kztk Nocardia, Rhodococcus, Corynebacterium, Streptomyces esetben. A gnmrnki mdszerek
lehetv tettk a hiper- s extracellulris CO-termel Actinobacterok ltrehozst.
Az egyik leggyakoribb oxidci a 17-hidroxi-szteroidok 17-oxo szrmazkainak ellltsa
Mycobacterium phlei segtsgvel (ld. androsztndion elllts).
Az Actinobacterek tovbbi szmos hidroxilcsoport oxidcijra kpesek (pl.: 3, 6, 7, 11
stb.), azonban ezek a megfelel kmiai eljrshoz kpest kevsb hatkonyak egyelre.
Szteroidszter-hidrolzis: A szteroidok acetilszrmazkainak hidrolizl kpessgt a Corynebacterium, Nocardia, Arthrobacter s Streptomyces fajoknl rtk le. A hidrolzis itt is kettskts
izomerizcihoz kapcsolt: a 3-acetoxi-C5-n szteroid dezacetilezsekor a 3-hidroxi-C4-n szrmazk
keletkezett.
Ketonok oxidcija szterekk vagy laktonokk: Szteroid jelenltben a monoxigenz-enzim oxignt
ptett be a C17 s C20 kz progeszteronon Rhodococcus rhodochrous esetben. Az enzim katalizlja
a progeszteron s annak 11/-hidroxi szrmazknak oxidatv szterezst, viszont az AD laktonizlst nem. Az enzim tulajdonsgai meglehetsen klnbztek a gomba eredet monooxigenzoktl. A kdol gnt rhodococcusbl rekombinns E. coli-ba klnozva nem tapasztalatak aktivitst progeszteronon.
Karboniltartalm vegyletek redukcija: A 3-karbonil csoport redukcija, amelyet az anaerob mikroorganizmusokra, lesztkre s egyes fonalas gombkra lertak, ritka az Actinobacterok kztt. Ez a
reakci gyakran hidrognezshez kttt. Koleszt-4-n-3-on reduklhat 5-kolesztn-3-ol-l Nocardia
corallina segtsgvel. A szterinek s a pregnan C17-es karbonilcsoportjnak Actinobacteres redukcija az oldallnchast folyamatokhoz kapcsolt. gy pldul a Streptomyces levendula ltal vgzett
progeszteron AD-tlakts mellktermkeknt 1-dehidro-tesztoszteron is kpzdtt.
Az Actinobacterek oldallnclebont s egyidejleg 17-redukcit eredmnyez kpessge
lehetv teszi az AD intermedier kikerlsvel az egylpcss biotechnolgiai tesztoszteron ellltst. Az irodalomban mr tallhat olyan publikci, amely szerint szterinekbl egy lpsben kristlyos tesztoszteront lehet 98-99%-os tisztasggal ellltani Mycobacterium trzsek segtsgvel [25].

C1-n s hasonl kifejezsekkel a C1 sznatom melletti ketts ktst jelltk.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

3.

57

AZ IPARI MIKROORGANIZMUSOK S TECHNOLGIK


TRGYALSA TRZSRENDSZERTANBA ILLESZTVE

A jegyzet eddigi fejezeteiben mr igen sok mikroorganizmus kerlt megemltsre, tbbsgkben mr


ipari hasznlatban lvk, de mint azt mr szintn bemutattuk, szmos mikroba rejt kiaknzhat
potencilt, amely realizldhat az adott mikroba tenysztsvel, illetve napjainkban gyakrabban az
adott mikroba gnforrsknt val felhasznlsval. Ezrt az ipari mikrobiolgia keretein bell mind a
mr hasznlatban lv, mind pedig a kiaknzhat potencilt rejt mikrobkat clszernek talljuk
bemutatni, s mivel gy mr igen nagyszm trzs kerlhet szba, clszer a rendszertani besorols
szerinti ismertetsk. Ez esetleg olyan sszefggsekre is rvilgt, hogy kt klnbz technolgia
alapjait jelent mikroba milyen rokonsgi kapcsolatban ll egymssal, s gy az egyes technolgiknl
szerzett tapasztalat segthet a msik technolgia megrtsben, fejlesztsben.

3.1. Mikrobilis rendszertan


A tudomny tbb ezer ves fejldse sorn felhalmozott risi informci halmaz kezelse rdekben
minden szakterleten valamilyen rendezsi elv mentn az informcikat rendszerbe foglaljk. A
biolgia, azaz az lvilg tudomnyterletn az informcik klasszikus rendszerezse a megfigyelt
hasonlsgok s az ezek alapjn fellltott vlt rokonsgok alapjn trtnt. Az els ilyen rendszertant
Arisztotelsz lltotta fel az lvilg rendszerezsre tbb mint 2000 ve a Historia Animalium c.
rsban [26]. A teremtmnyeket azok hasonlsga alapjn csoportostotta: llatok vrrel s vr nlkl,
vzi s szrazfldi llatok. gy gondolta, hogy a teremtmnyek hierarchikusan sorbarendezhetk a
legalacsonyabbtl a legfejlettebbig (ami az ember). Az llnyek lnyegt fixnek s megvltoztathatatlannak gondolta, s ez a nzete fenn is maradt a kvetkez 2000 vben. Amit viszont a mai napig az
nyomn hasznlunk, az a binomilis (ketts) elnevezse az llnyeknek. mg gy gondolta, hogy
az llnyeket hasonlsgaik alapjn egy genus-ba lehet sorolni, ahol az egyes tagokat egy jellemz
sajt karakter klnbzteti meg (=difference), ezrt a ketts nv Arisztotelsznl genus,
difference-knt nzett ki.
Tanait tantvnya, Theophrastus vltoztats nlkl kiterjesztette a nvnyekre, s munkssgval
(nvnyek lersa s nevelse) a botanika alaptjv vlt.
A XVI. sz.-ig nem trtnt rdemi vltozs a taxonmia terletn, mg Andrea Cesalpino olasz
fizikus az ltala rszletezett nvnyi lersokat a nvnyek gymlcsei s magjai alapjn nem kezdte
el rendszerezni, amellyel hatst gyakorolt a kvetkez nagy reformerre Carolus Linnaeus-re (1707
1778). Linn idejre szmos lers gyjtemny ltezett (pl.: az egyik legnagyobb a svjci fizikus,
Gaspard Bauhin (15601620) ltal rt illusztrlt 6000 nvny lerst tartalmaz), amelyek
inkoherensek voltak. 1735-ben jelentette meg The system of nature c. mvt, amelyben a nvnyeket
s llatokat a kirlysgok szintjtl a fajokig besorolta. Ezt a mvt tbbszr tdolgozta, mgnem a
vilgszerte ismert rendszertan ltrejtt. Pldul a blnkat eredetileg a halak kz sorolta, s ahogyan
lete vgig javtgatta, frisstgette a rendszertant az jabb s jabb tudomnyos eredmnyek alapjn,
gy napjainkig is a rendszertan egy folyamatosan fejld tudomnyg (3.1.1. tblzat).
3.1.1. tblzat: A rendszertan fejldse
Linnaeus (1735) Haeckel (1866) Chatton (1937) Copeland (1956) Whittaker (1969) Woese (1977)
Woese (1990)
"2 orszg"
"3 orszg"
"2 birodalom"
"4 orszg"
"5 orszg"
"6 orszg"
"3 domn"
Eubaktriumok Baktriumok
Prokaritk
Monera
Monera
Protisztk
sbaktriumok sbaktriumok
Protisztk
Protisztk
Protisztk
Gombk
Gombk
Nvnyek
Nvnyek
Nvnyek
Eukaritk
Eukaritk
Nvnyek
Nvnyek
llatok
llatok
llatok
llatok
llatok

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

58

Ipari mikrobiolgia

Ez a fejlds a XX. szzadban az addig csak mdostgatott rendszertant j alapokra helyezte: mg


a klasszikus rendszertan clja, hogy a vals rokonsgokat megllaptsa, s a hasonl fajokat hasonl
rendszertani kategrikba helyezze, addig a modern rendszertani mdszerek rvilgtottak arra a
tnyre, hogy a valsgban csak vlt rokoni kapcsolatok vannak egyes esetekben a rendszertanilag
rokonnak tartott fajok kztt. A modern rokonsg tesztek termszetesen a genetika eszkztrt
hasznljk, s a genetikai llomny azonossga/klnbzsge alapjn lltjk fel a pontos rokonsgi
fokot (rokoni tvolsgot), amelyek alapjn filogenetikus fa fellltsa vlik lehetv.
A legelterjedtebben hasznlt mikrobalersok s rendszertan a Bergey I. kiadsban kerlt
publiklsra a 80-90-es vekben, majd a modern genetikai alap II. kiadst megkezdtk 2000-ben
(jelenleg is tart). Ennek kvetkeztben jelenleg egy tmeneti idszakot lnk, amikor a rgi mr
elavult, az j pedig mg fejleszts alatt van. A modern kor taln legnagyobb (m nha megkrdjelezhet hitelessg) informcihalmaza az internet, amelyen jelenleg is kszl a Tree of Life webprojekt. Ennek lnyege, hogy az interneten elrhet tudomnyos publikcikat sszegyjtse s
felhasznlja a mikrobk rendszertannak ltrehozshoz.
Az j rendszertan htrnya, hogy sokkal lexiklisabb, s kevsb gyakorlatias: azaz egy adott faj
rendszertani besorolsbl a tulajdonsgai nem igazn derlnek ki, mg viszont szmos tovbbi nv
igen. Pldul az Escherichia coli a rgi rendszertanban Gram-negatv\plca\fakultatv anaerob\
\Escherichia nemzettsg tagjaknt kerlt meghatrozsra, mg a modern filogenetikus fn
Baktriumok\Proteobacterek\Gammaproteobacter\Enterobacteriales\Enterobactericeae\Escherichia
tvonalon tallhat meg. Nyilvn az elbbi lersbl tbb informci volt nyerhet a mikroba felismersvel kapcsolatban. ppen ezrt clszernek tnik a klasszikus rendszertan rvid ismertetse is.
Klasszikus rendszertan
A klasszikus mikrobiolgiai s biokmiai fenotpizlsok segtsgvel rendszerbe sorolt mikrobk
ler gyjtemnye a Bergeys Manual of Systematic Microbiology-ban jelent meg tbb javtott
kiadsban. Ebben a rendszreben a prokaritkat 4 divzira osztottk a sejtfalszerkezetk alapjn: I.
Gram-negatv baktriumok (k egy kls membrnrteg miatt nem festhetek Gram-festssel), II.
Gram-pozitv baktriumok (amelyeknl a festkkel reagl mureinhl (poliszaharid) szabadon
hozzfrhet, teht festhetek), III. Merev sejtfallal nem rendelkezk (pl.: csavart baktriumok),
illetve IV. sbaktriumok (primitvnek ltsz, mureint nem (esetleg pszeudomureint) tartalmaz
sejtfallal rendelkez mikrobk) (3.1.1. bra, lsd mg a 62. oldalon).
Filogenetikus rendszertan
A modern genetikailag tmogatott rendszertan ltrehozshoz a filogenetikai (phlon: trzs;
geneseis: szlets) analzisre van szksg. Ennek a tudomnyterletnek a clja, hogy az evolci
rekonstrulsval llaptsa meg a rokoni/leszrmazotti viszonyokat az llnyek kztt. Ehhez
szksges az elmlt vtizedek kutatsainak ksznheten felhalmozdott genomikai s proteomikai
ismeretek rendszerezse, azaz fejlett bioinformatikai infrastruktra. A filogenetikai analzist 3
egymsra pl szinten kell elvgezni: 1. szint: genomikai adatokbl az azonossgok/klnbsgek
feltrsval a rokoni kapcsolat s tvolsg felmrhet; 2. szint: proteomikai adatok segtsgvel az
egyes fehrjk s vltozsaik kvethetk nyomon, gy a rokoni tvolsg s az evolcis fa
pontosthat; 3. szint: a klnbz algoritmusok klnbz evolcis fkat eredmnyeznek, amelyek
kzl ki kell vlasztani a legvalsznbbet.
Az egyik sarkalatos pontja a mdszernek a megfelel indiktor gnllomny kivlasztsa, mivel
ezzel szemben tmasztott elvrs, hogy stabil legyen (lehetleg konzervlt, norml letfolyamatok
alatt nem vltoz), ugyanakkor a nagyobb evolcis lpst jelent behatsokra, mutcikra rzkeny
legyen. Ilyen konzervlt, de a mutcikat gyjt genom tallhat a mitokondriumokban s a
riboszmkban, ezrt ezek szekvencijnak meghatrozsval lehet a genetikai rokonsgokat
feltrkpezni.
A msik sarkalatos pontja az analzisnek a megfelel algoritmus kivlasztsa a rokoni tvolsgok
feltrkpezsre. Az egyik leggyakrabban alkalmazott mdszer a Neighbour joining (NJ szomszdsszevon mdszer), amelyhez szksges egy tvolsgmtrix felrsa a vizsgland fajok kztt, majd
ennek transzformlt vltozatban kell megkeresni a legkisebb rtkeket (legkzelebbi szomszdok),

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

59

megvizsglni az tvolsgukat a kzs ponttl, majd a tbbi vizsgland faj tvolsgt ugyanettl a
ponttl, azutn kezddik ellrl, de az elbb felismert szomszdokat egyknt kell kezelni az j
tvolsgi mtrix felrsakor. Egy msik algoritmus a maximum likelihood (ML legnagyobb valsznsg mdszere) mdszer, amely standard statisztikai megkzeltssel vizsglja a legvalsznbb
elgazsokat [30]. Egy harmadik szleskren hasznlt mdszer a maximum parsimony (MP legnagyobb takarkossg mdszere), amely a legkevesebb evolcis esemnyt keres algoritmus.
A filogenetikus analzis eredmnyeknt rajzolhat fel a filogenetikus fa, amelyen az elgazsok
tvolsga egyenesen arnyos az elgazs vgpontjain lv mikrobk genomazonossgval. Egy filogenetikus ft mutat a 3.1.2. bra (lsd mg a 63. oldalon).
Az els fontos lps a mikrobk trzsfejldsnek megrtsben a megfelelen objektv kritriumok keresse a fbb rendszertani csoportok definilshoz. Jelenleg a baktriumokat mintegy 23
fbb csoportba, azaz trzsbe soroljk, a 16S rRNS fik alapjn. Nmely ezen trzsek kzl csupn nhny fajt tartalmaz (pl.: Thermomicrobia, Chrysiogenetes, Fibrobacteres, Deferribacters), mg msok
mint pldul a Proteobaktriumok, Bakteroidk, Cianobaktriumok, Actinobacterok (nagy G+C
tartalm Gram-pozitvak) s a Firmicutes (kis G+C tartalm Gram-pozitvak) nagyon nagyok, s
fajok ezreit szmlljk, idertve az ismert baktriumok tbb mint 90-95%-t. A kisebb trzsek (pl.:
Fibrobakterek, Chlorobi) valamikor valamelyik nagyobb bakterilis csoport rszeknt kerltek besorolsra a kzs morfolgiai/fiziolgiai jellemziknek megfelelen, de ksbb levlasztottk ket a
16S rRNS trkp alapjn.
Bakterilis filogentika [27]
A mikrobiolgiai rendszertanban a Woese-fle reformok (1990) ta a besorolsokat a kvetkez
csoportokba teszik meg: domn (domn)>kingdom (kirlysg)>phyla (trzs)>class (osztly) >order
(rend)>family (csald)>genus (nemzetsg)>species (faj). Az ipari mikrobiolgiban hasznlatos
trzs kifejezs gyakran nem a fenti rendszertani csoportra utal, hanem arra, hogy egy adott faj sejtvonalrl van sz (valamely egyed leszrmazottai). Minimlis eltrsek (pl.: termk hozamban) lehetnek egy adott faj sejtvonalai kztt is. Azoknl a mikrobknl, amelyeket alaposan tanulmnyoztak
mr, elfordulnak a fajon bell alfajok (v. fajtk vagy varinsok), s azoknak is lehetnek klnbz
sejtvonalaik, trzseik.
Azt, hogy milyen tulajdonsgok hatrozzk meg a trzs besorolst alacsonyabb rend csoportokba, mint pldul osztlyba, rendbe vagy csaldba, sosem definiltk egyrtelmen a tudomnyos
vilgban. ppgy, mint azt a krdst, hogy mi alkot egy aldivzit vagy osztlyt egy trzsn bell.
Pldul, a Proteobakterek trzst jelenleg 5 aldivzira (vagy osztlyra) osztjk, nvszerint , , , s
proteobakterek. Ezek mindegyike fbb csoportokat alkot a baktriumokon bell, s tbbsgk
vilgosan megklnbztethet egymstl, illetve ms baktriumdivziktl, mind filogenetikus
fjukban, mind szmos ms forrsban. Az alacsonyabbrend kategrikba (alkategrik) val
besorols objektv felttelei nlkl nem vilgos, hogy mirt pont ezek a fbb bakterilis csoportok
kerltek aldivziknt (vagy osztlyknt) meghatrozsra, mg ms alig jellemzett csoportok nhny
ismert fajjal fbb trzsknt kerltek lersra. gy a rendszertani besorolsa a klnbz bakterilis
csoportoknak jelenleg teljesen nknyes.
Az a krds, hogy hogyan lehet a legalacsonyabb rendszertani beosztst a baktriumokon bell
definilni, kezdetben egy idelis szempontbl kzelthet meg. Egy idelis osztlyoz rendszerben a
trzs a leszrmazs fbb vonalait mutatja be, s a gykr egy kzs bakterilis st reprezentl. Minden
nagyobb elgazs, amely a trzsbl ered, a fa fbb csoportjait (vagy (mikrobilis) trzseit) jelenti
meg. Egy idelis osztlyoz rendszerben ezen elgazsok sorrendje a trzsn bell ismert, s a rendszer relatv nemzedkeken alapszik. Fontos, hogy ezek a trzsek (vagy elgazsok) vilgosan elklnljenek egymstl a fn val helyk alapjn. Minden szervezetnek, ami egy elgazst alkot,
rendelkeznie kell olyan tulajdonsgokkal, amelyek alapjn ms gak szervezeteitl megklnbztethet. Kisebb gak s gallyacskk, amelyek a fbb gak hajtsai, egyre kisebb rend rendszertani
fokokat reprezentlnak, pldul kisebb gak az osztlyok, rendek, csaldok, gallyak a nemzettsgek,
fajok. Az azonos kisebb gakon lv szervezeteknek tbb kzs tulajdonsga is kell legyen egymssal, mint a f g ms gainak szervezeteivel.
Az eddig f ismertetjegy alapjn meghatrozott fbb csoportok szma minimlis. Mivel azonban
a fajok klnbz elklntett csoportjai, amelyek ugyanazon ponton gaznak el mg akkor is, ha

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

60

Ipari mikrobiolgia

nincs egyedlll kzs tulajdonsguk, jelenleg provizrikus altrzseit kpviselik valamely trzsnek.
Ugyanakkor, amint tovbbi ismertetjegy vagy ms informci (ami elklnti ezeket az altrzseket,
vagy egyrtelmv teszi elgazsuk sorrendjt) elrhetv vlik, ezek az altrzsek egyedi trzsekk
lpnek el, vagy kt elklntett trzsre osztjk az eddigit. A legtbb fbb trzs jelenleg is valamilyen
csoportspecifikus ismertetjegy alapjn klnthet el. Ezen kritriumok alapjn a Proteobaktriumok
legalbb 3 f trzsre oszthatk, mindegyikk jl elklnthet a tbbitl, s az elgazsuk sorrendje is
egyrtelm. A -proteobakterek tvolrl rokonai az -proteobaktereknek, de ez a kapcsolat mg
tovbbi finomtsra szorul. A ,-proteobakterek szmos kzs ismertetjeggyel rendelkeznek. Noha
nhny ismertetjegy a -proteobaktereket megklnbzteti, s ksbbi elgazsra utal, a kapcsolat e
kt aldivzi (vagy altrzs) kztt tovbbi tanulmnyozst ignyel. Az ismertet szekvencikon
alapul fabra azt is jelzi, hogy a jelenleg f trzsknt jegyzett Bakteroidk (vagy Citofgok,
Flavobakterek Bakteroida csoport), Chlorobi s Fibrobakterek megbzhatan ugyanazon pontbl
gaznak el, s szmos megklnbztet tulajdonsggal rendelkeznek, amelyek egyedi trzsekk teszik
ket. gy a fentiekben kikttt kritriumoknak megfelelen ezeket a csoportokat egy trzsbe kellene
helyezni, s vagy osztlyokat, vagy rendeket kellene alkossanak ebben a f trzsben. A relatv
elgazsuk ezeknek az alcsoportoknak az FCB trzsn bell szintn jl megllapthat szmos
alcsoport-specifikus ismertet szekvencia alapjn.
A baktriumok trzsnek elgazsi sorrendje
A bakterilis filogenetika kzponti problmja, hogy megrtsk, hogy a klnbz bakterilis trzsek
hogyan kapcsoldnak egymshoz, s hogyan gaznak el a kzs stl. A 16S rRNS vagy ms
fehrje/gn alap filogenetikus csaldfk nem tudtk megoldani ezeket a kritikus aspektusokat, ms
jelents krdssel (pl.: fotoszintzis eredete, eukarita sejt eredete) egytt. Fontos betekintseket nyjtott ebben a tekintetben a konzervlt indelek (=inszercik s delcik) felfedezse s analzise szmos
univerzlisan elterjedt fehrjben. Ezek a konzervlt indelek tulajdonkppen a fvonal ismertetjegyei. Az ezekhez vezet genetikai esemnyeket ltalnosan gy tekintik, mint fontos evolcis
elgazsi pontokat, s ezek eloszlsnak mintzata a fajokban rtkes informcikat szolgltat a fajok
elgazsnak sorrendjrl, s a klnbz trzsek kztti kapcsolatrl.
Az indel modell alapjn fellltott bakterilis filogenetikus fa lthat a 3.1.3. brn (lsd mg a 64.
oldalon).
Egy ilyen indelmintzat-plda tallhat az RNS-polimerz -alegysgn (RpoB). Ez a magja az
RNS polimerznak, s minden fajban univerzlisan konzervldott. Az RpoB homolgok a klnbz
proteobakterekben ppgy, mint az Aquifex, Klamidik, Verrucomikrobk, Planctomycetk s BCF
esetben egy nagy inszertet tartalmaznak a fenti fajokra jellemz konzervlt rgiban, amely inszertet
a tbbi trzs (Spirohtk, Deinococcus-Thermusok, Chloroflexik, Fusobaktriumok, Actinobacterok,
Thermotogk, Firmicutesek) nem tartalmazza. Az inszert hinya az archek (sbaktriumok) RpoB
homolgjaiban egyrtelmen arra utal, hogy amely baktriumokbl hinyzik, azok az sibbek. Fajok
kztti eloszlsmintzata alapjn ez az inszert valsznleg az elbbiek kzs snl keletkezett, gy
ezek (proteobakterek, Aquifex, Klamidik, Verrucomikrobk, Planctomyceszek, s BCF) ksbb
gaztak le a fgrl.
Hasonlan ehhez egy msik prominens indelt azonostottak a DNS-girz B-alegysgn. Ebben az
esetben egy konzervlt, tbb mint 150 aminosavbl ll inszert tallhat a klnbz proteobakterek
s Aquifex, Klamidik, Verrucomikrobk, valamint Planktomiceszek DNS-girz B alegysgn, de nem
tallhat meg a tbbi baktriumtrzs kztk a BCF tagjai kztt. Ez az inszert az archek homolg fehrji kztt sem tallhat meg. Az Rpo s a girz fajok kztti eloszls-mintzatainak sszehasonltsa alapjn megllapthat, hogy a girz indelje az evolci ksbbi fzisban keletkezett, a Fibrobakterek-Chlorobi-Bakteroidk elgazsa utn. A fajok kztti eloszls-mintzat alapjn ez a kt indel
egyrtelmv teszi, hogy a Fibrobakter-Chlorobi-Bakteroidk (BCF) csoportok a Spirohtk,
Deinococcus-Thermus, Chloroflexek, Actibobakterek, Thermotog, s a Firmicutes trzsek utn, de a
proteobaktriumok, Aqificales, Klamidik, Verrucomikrobik s Planktomiceszek eltt gaztak el. A
fenti kt indelhez hasonlan szmos ms fvonalismertet-jegyet fedeztek fel tovbbi univerzlisan
elterjedt fehrjkben, amely ismertetk segtik a baktrium- trzsek elgazsi sorrendjnek megrtst.
Az indelek fajok kztti eloszlsi mintzata alapjn majdnem minden baktriumcsoportot egyrtelmen el
lehet klnteni, s lehetsges logikusan kikvetkeztetni a kzs stl val elgazsaik sorrendjt.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

61

Az indelmodell megbzhatsga s prediktv lehetsgei


A fvonal indeleinek tbbsge, amelyeken az elgazsi mintzatok alapulnak 1997 eltt kerltek
felfedezsre, amikor mg a szekvencia adatok igen korltozottak voltak, s a megszekvenlt genomok
szma 10 alatt volt.
Ennek ellenre ezen indelek mindegyike igen specifikus elrejelzseket tett (vagy tesz) az elfordulsukkal s hinyukkal kapcsolatban a klnbz baktriumtrzsek fajaiban. Ha ezek az
elgazsi mintk megbzhatak, s ezek az indelek egy si vonalban egy adott evolcis stdiumban
jelentkeztek, akkor minden feljebb fekv bakterilis trzs fajainak tartalmaznia kell az adott indelt,
mg minden ms csoport fajainak, amelyek az inszercis pont eltt gaztak el (azaz az inszercis pont
alatt fekszenek) hinyzik ezen indelje.
Ha a megllaptott indeleloszls a klnbz genomokban szorosan kveti a modell alapjn
elvrtat, akkor a megllaptott elgazsok megbzhatak. Ha ezek az indelek fggetlenl keletkeztek,
vagy az ket tartalmaz gn gyakran kerlt laterlis tadsra, akkor az indelek jelenlte vagy hinya a
klnbz fajokban nem kveti az elvrt mintzatot. A modellt szmos indelen teszteltk klnbz
teljesen feltrt genomokban, s megfelelen kvettk a modellt az eredmnyek.
A bakteriumtrzsek konzervlt indelek alapjn szrmaztatott elgazsi sorrendje nhny kivtellel
megegyezett a 16S rRNS alap filogenetikus fkkal, akrcsak szmos ms fehrje/gn alap
filogenetikus fkkal. A leggyakrabban publiklt fkon, a Thermotoga, Deinococcus-Thermus, Cianobaktriumok s a Zld-nem-kn-baktriumok csoportja korai elgazst mutat, mg msok (mint pldul
a Proteobacterek s Chlamydik, valamint a Bakteroides-Chlorobi csoportok) ksbb gaznak le. Egy
j filogenetikus tanulmny [28] 31 ltalnosan konzervlt fehrje szekvencijnak alapjn szintn
hatrozottan lltja, hogy a Firmicutes a legmlyebb (legels) elgazsi vonal (3.1.3. bra).
A Firmicutes s Actinobacterek korai elgazst ppgy, mint a Thermotogkt, DeinococcusThermusokt is altmasztjk a gnek sorrendjnek elrendezdsei a bakterilis genomokban. Lake s
munkatrsainak [29] tanulmnya azt is hatrozottan lltja, hogy a bakterilis fa gykere nem a Gramnegatv (vagy diderm) baktriumoknl van. Egy figyelemre mlt klnbsg a jelenlegi s a 16S rRNS
alap filogenetikus fk kztt az Aquifex-ek ksi elgazsa az jabb tanulmnyokban. Ez az anomlia
az Aquifex rRNS nagy G+C-tartalma miatt van, ami szmos hipertermofil szervezet kzs
tulajdonsga, gy emiatt az Archek kz csoportostottk, s az rRNS- fn korn elgaznak.
Az indelanalzis alapjn levezetett elgazsi sorrend a fbb szerkezeti klnbsgekkel is
sszhangban van a baktriumoknl (vagy prokaritknl). A baktriumokat kt csoportra osztjk attl
fggen, hogy egy membrnnal burkoltak (monodermk), vagy kt klnbz, a periplazms tr ltal
elvlasztott membrnnal (didermk) rendelkeznek. Ez a kt csoport durvn megfelel a Gram-pozitv s
Gram-negatv csoportostsnak. A konzervlt indelek alapjn is indokolt ez a szerkezeti elklnts, s
azt is kimutatta, hogy a monodermk (Gram-pozitvak) az sibbek. A levezetett elgazsi sorrend a
Deinococcus-Thermus csoportot egy kztes poziciba helyezi a Gram-pozitvak s negatvak kztt.
Ez az elhelyezs sszhangban van a Deinococcusok egyedlll szerkezetvel, ami egy vkony
peptido-glkn-rteget tartalmaz, s gy pozitvan festdnek a Gram-festssel, de bels s kls
membrnnal is krl vannak vve, hasonlan a legtbb Gram-negatv baktriumhoz. Ezek a
megllaptsok jelzik az evolcis tmenetet a Gram-pozitvaktl a negatvokig. gy a ritka vletlen
genetikai vltozsok (RGCs: Rare Genetic Changes) alapjn fellltott bakterilis filogenetika kpe j
egyezst mutat a genotpus s fenotpus kztt, ami arra utal, hogy megbzhat az indelmodell.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

62

Ipari mikrobiolgia

Gram (-)
baktriumok
(1. Divzi)

Gram (+)
Baktriumok
(2. Divzi)

1.
Coccusok

2.
Plck

1.
Gram aerob

1.
2.
Pseudomonas Legionella
nemzettsg nemzettsg

Plck

Coccusok

2. Gram
- Fak.
anaerob

1.
Enterobacter
csald

Merev sejtfal
nlkli baktriumok
(3. Divzi)

3.
Gram anaerob

2.
Nem
enterobacterek

1.
Bacteroides
nemzettsg

Gram
+

4.
Gram +
endosprs

5.
Gram +
sprtlan

sbaktriumok
(4.
Divzi)

1. Spirlis
2.
3.
4.
s hajtott Spirohtk Riketsia Mycoplasma
bakt.
flk
flk

6. Gram +
sprtlan
szablytalan alak

1.
2.
3.
Staphylococcus Micrococcus Streptococcus
1. Bacillus 2. Clostridium
1.
2.
1.
2.
3.
4.
5.
nemzettsg nemzettsg nemzettsg
nemzettsg nemzettsg Lactobacillus Listeria Corynebacterium Actinomicetk StreptomicetkMycobaktriumokNocardia
(aerob)
(anaerob)
nemzetsg nemzetsg
nemz

1.
2.
7.
1.
2.
Escherichia Salmonella
Proteus
Vibrio
Haemophilus
nemzetsg nemzettsg nemzettsg nemzettsg nemzettsg

3.1.1. bra: Bergey-fle bakterilis rendszertan

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

63

3.1.2. bra: Filogenetikus fa a 3 domn elmlet alapjn [162]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

64

Ipari mikrobiolgia

3.1.3. bra: Bakterilis filogenetikus fa az indelmodell alapjn [27]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

65

3.2. Ipari szempontbl fontos (s)baktriumok


A 3.1.3. bra sorszmozsa szerint trgyaljuk az egyes gait a bakterilis filogenetikus fnak az
albbiakban. Ennek knnyebb kvethetsge rdekben a rendszertant lehet tanulmnyozni a 3.2.1.
hyperpicture-n.

3.2.1. hyperpicture: Rendszertan


1. Archek
Az sbaktriumokat szles krben gy tekintik, mint az let 3 f domnjnak egyikt, noha eredetk
vita trgya. Korbban gy gondoltk, hogy csak extrm krnyezetben lnek, mint extrm forrsg
vagy forr s savas, extrm ss vagy nagyon savas, illetve lgos krnyezetben, de jabb tanulmnyok
bemutattk, hogy szles kren elterjedtek klnbz krnyezetekben is. Az archek metanogneket
is tartalmaznak, amelyek szigoran anaerob s gyakran termofil krnyezetben lnek, s amelyek
egyedl kpesek arra, hogy a metabolikus energijukat metanogenezisbl redukcival nyerjk. A 16S
rRNS-fn (3.1.2. bra) s szmos ms gn/fehrje szekvenicn alapul filogenetikus fn az sbaktriumfajok ga hatrozottan elklnl minden ms szervezettl. Radsul, szmos tovbbi tulajdonsg
(mint pldul az elgaz lnc terkts membrn lipidek, a sejtfalbl hinyz peptidoglkn, sajtos
RNS polimerz alegysg mintzat, mdosult bzisok jelenlte a tRNS-ben, egyedi DNS polimerz) is
azt jelzi, hogy szksges az archek kln definilsa. Ennek ellenre ezen tulajdonsgok nmelyike
nincs meg mindegyik sbaktriumban, vagy ms eukarita, illetve termofil szervezetben pedig
megtallhat.
Az archek filogenetikus analzise kt fcsoportra (vagy trzsre) osztsukhoz vezetett: Crenarchaeota
s Euryarchaeota. E kt csoport fajai klnsen az Euryarchaeotknl igen klnbznek metabolizmusukban s fiziolgijukban. A metabolikus s fiziolgiai, illetve ms egyedi tulajdonsgaik
alapjn az Euryarchaeotknl 5 funkcionlisan elklnthet csoportot hatroztak meg: metanognek
(3.2.2. bra), szulftreduklk, extrm halofilek, sejtfal nlkliek s extrm termofil knmetabolizl
baktriumok. Nmely ezen csoportok kzl polifiletikus a klnbz filogenetikus csaldfkon. Ezen
klnbz csoportoknak uniklis gn- vagy fehrjekszlete ami megklnbztetn ket minden
mstl mg meghatrozsra vr. Az utbbi vekben szmos archea teljes genomjt megszekvenltk, s az sszehasonlt analzisk rtkes informcikat szolgltatott a klnbz gnek/fehrjk
tekintetben, amelyek az Archekon bell elklntik a csoportokat, valamint a baktriumokkal s
Eukaritkkal val kapcsolatot is meghatrozzk.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

66

Ipari mikrobiolgia

3.2.2. bra: Methanosarcina metanogn sbaktrium [178]


Az sbaktriumok egyik legjabb, 31 jelz fehrje alapjn fellltott filogenetikus fjt mutatja a
3.2.3. bra (lsd mg a 93. oldalon).
Az sbaktriumok extrm lhelyeken is elfordulnak, ezrt az enzimeik ezen krlmnyek
kztt is aktvak, gy noha eddig csak nhny sbaktrium enzime jutott el a piaci megjelensig,
hatalmas potencilt rejtenek magukban, ezrt intenzven kutatjk ket. A klnleges lhely miatt az
enzimeik stabilak magas hmrskleten, extrm alacsony/magas pH-n, nagy nyomson, esetleg
mindezt magas strssel, oldszer-tolerancival, fmtolerancival kombinlva [31]. Az extrmofilek
enzimeinek (extremozimok) hasznlatnak szmos elnye van, pldul cskkent fertzdsveszly,
jobb anyagtadsi sebessg, alacsonyabb viszkozits, magasabb szubsztrtoldhatsg. Nhny rdekes
tulajdonsgot mutat be a 3.2.1. tblzat.
3.2.1. tblzat: Az sbaktriumok klnleges kpessgei
Tulajdonsg
nitrtredukl,
kemolitoautotrf,
termofil
metanogn
termoacidofil

termoaalkalofil
barofil
(nyomskedvel)
barofil
(nyomskedvel)
Wolfram mint kofaktor
tg=37min
kemnyttranszport-fehrjk

Tartomny

Faj
Pyrolobus fumarii

<113C
<110C
<0C
60-90C
pH 0-4
aerobok
anaerobok
(kevsb savas)
85C
pH 8,5-9
20-30 MPa [32]
20 MPa
103C

Methanopyrus kandleri
Methanogenium frigidum
Acidianus,
Ferriplasma,
Picrophilus,
Sulfolobus,
Thermoplasma
Methanogenium frigidum
Thermoproteus, tenax
Methanothermus fervidus
Thermococcusok
Paleococcus ferrophilus
Thermococcus barophilus
Paleococcus ferrophilus
Thermococcus barophilus
Pyrococcus furiosus

A leggyakrabban s legintenzvebben a magasabb hmrskleten is stabil s aktv enzimeket


kutatjk. Ezidig nem talltak olyan faktort, amely egyedl rhetn el az enzimek termostabilitst,
ugyanakkor lertak mr nhny jelensget, amelyek hozzjrulnak az archek enzimeinek hstabilitshoz: magasabb hidrofbicits, s felleti tltttsg, nagyobb szm ionpr s hidrognkts,
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

67

cskkent rugalmassg s felleti hurokmret, kisebb felszn/trfogat arny, kevesebb hrzkeny


aminosav s csonka amino- s karboxilterminns.
Noha a fenti klnleges kpessgek vagy egy rszk a modern genetikai eszkzkkel nyilvn
kiaknzhatk, egyelre az extrm krlmnyek kztt is stabil aktivitst mutat enzimek forrsaiknt
hasznostjk a (fehr)biotechnolgia cljaira az sbaktriumokat. Erre mutatunk be nhny pldt az
albbiakban. [31].
Nagy az ipari rdeklds a sznhidrt-metabolizmus enzimei klnsen a glikozil hidrolzok
irnt. Mivel minden kemnytbont technolgiban a szoksos fiziolgiai hmrskletnl
magasabbat alkalmaznak, a dextrinek, trehalzok, glkz s fruktz gyrti profitlhatnak a
termostabil kemnytbont enzimekbl. A Pyrococcus extracellulris -amilzai 120C 4h hkezels
utn is aktvak (vagy 130C-os kezels utn is), teht idelis jelltek a kemnytipar szmra. Az
archek pullulanzai is 90-100C kztt aktvak, s szubsztrt, valamint Ca2+ ionok hinyban is
megrzik az aktivitsukat. A termoacidofil archek glkoamilzai 90C-on s pH=2-n is aktvak
(Thermoplasma acidophilum, Picrophilus torridus s P. oshimae)
A trehalz (,-1,1-glkz dimer) fontos enzim, antitest, vakcina, hormonstabilzl szer, ellltsban a Sulfolobus-enzimek 75C-on jl hasznosthatk.
A ciklodextrinek ellltsra a ciklodextrin-glikoziltranszferzokat (CGTz) hasznljk, amelyek
kzl kiemeled a Thermococcus fajok a 100C feletti optimlis aktivitssal (kemnytbl klnbz ciklikus dextrinek ellltsa), gy a kemnytbonts s -ciklizls egylpcsben megvalsthatv vlik.
A cellulzbont enzimkomplex tagjai (endoglkanz, exoglkanz, -glkozidz) is fellelhetk
termostabil formban az archek enzimkszletben. A Pyrococcus furiosus -glkozidza 103C-on is
aktv. A P. horikoshii homolg enzime szerves oldszerben is stabil s aktv, ezrt heteroszaharidok
ellltsra hasznlhat.
Endo--1,4-xilanzok segtsgvel trtnik a hemicellulz xilnfrakcijnak lebontsa. Mg az
archea Pyridictum abyssi xilanza az egyik legmagasabb hmrskleti optimummal (110C)
rendelkez, a Thermococcus ziligii xilanza igen specifikus magas hmrskleten is (cellulzt nem
bontja, csak a xilnt), ezrt a biobleaching szmra rejt nagy lehetsgeket.
Hstabil kitinbont endo s exo kitinzokat is termelnek az archek. A Thermococcus
chitonophagus kitinza 120C 1h kezelst is 50%-os vesztesggel kibr, mg a Pyrococcus furiosus
termoaktv kitinzainak segtsgvel kpes kolloid kitinen, mint egyedli sznforrson nvekedni.
A fehrjebont enzimek taln a legrgebb ta keresett s piacra dobott biokataliztorok, mert a
mosszer- s detergensipar igen nagy mennyisgben hasznlja ket. A magas hmrskleti optimum
az alkalmazsok szempontjbl kedvez, mivel a magasabb hmrsklet moss hatkonyabban
tisztt. Ennek elenre az sbaktriumok szmos proteza kzl csak nhnyat rtak le eddig
rszletesen. Tbbsgk az alkalikus szerin-protezok csaldjba tatozik (Thermococcus setteri), de
talltak mr tiol protezt (Thermococcus kodakarensis) s savas protzt, metalloprotzt is Pyrococcus
furiosusban.
A biotechnolgia fejldsvel egyre elterjedtebb vlt a PCR technika, ahol a magas htrs
DNS- polimerzok preferltak. Az archek kzl ismt a Thermococcus s Pyrococcus trzseket rtk
mr le hiba nlkl msol termoaktv DNS-polimerz-forrsknt. jabban az sbaktriumok DNSpolimerzaival egsztik ki a Taq aktivitsokat, mert gy cskkenthet a hibs amplifikcik szma.
Az archek DNS-fgg enzimeit a genom szekvenlsokhoz is gyakran alkalmazzk, DNS-ligzaikat
pedig analitikai clokra hasznljk.
A vegyipar szmra fontos az optikailag tiszta alkoholok mint ptkvek ellltsa. Ehhez
alkohol-dehidrogenzokat (ADH) hasznlnak, amelyek hstabil homolgjai megtallhatk az
archekban: Sulfolobus solfataricus (3.2.4. bra) ADH-a NAD fgg s Zn-et is tartalmaz. A
legstabilabbak a pyrococcusok ADH-ai (felezsi id ~150h 80C-on).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

68

Ipari mikrobiolgia

3.2.4. bra: Sulfolobusvrus-fertzssel


Szintn az optikailag tiszta vegyletek szintzisben tltenek be fontos szerpet az szterzok.
Nmely archea (Aeropyrum pernix, Pyrobaculum calidifontis) eredet szterz igen termoaktv, s
mg vzzel elegyed oldszerekben (acetonitril, DMSO) is stabil. A legstabilabb szterzok a
Pyrococcus furiosusbl nyerhetk (felezsi id: 50 min 126C-on).
A vegyipari szintzisek fontos lpsei a C-C ktst kialakt reakcik, amelyeket az aldolzok s
a transzketolzok is katalizlnak. Az archek kzl a Sulfolobus solfataricus aldolzt rtk mr le
piruvt, illetve glicerinaldehid ellltsra. A sztereoszelektv Sulfolobus solfataricus amidza szles
szubsztrt spektrummal rendelkezik, s 95C-on is mg aktv.
Az enzimeiken kvl az archek tovbbi molekuli is rendelkeznek ipari felhasznlssal vagy
potencillal: az sbaktriumok lipidjei hstabil liposzmk ellltshoz alkalmazhatk; Sulfolobus
trzsek antibiotikus hats fehrjt is termelnek; chaperonjaik a rekombinns fehrjk hajtogatst
segtik. Mivel az sbaktriumok eltr kodonrendszert hasznlnak a valdi baktriumoktl, ezrt a
gnjeik kifejezse bakterilis gazdaszervezetben igen nehzkes, emiatt az utbbi idben archeaexpresszis rendszereket is ltrehoztak Methanococcus s Sulfolobus fajokbl.
2. Firmicutes
A csoport neve (=ers br) utal a sejtfal jelenltre, amely a legtbb nemzetsg esetben Gram-pozitv
fests, de nmelyek esetben vkony kls membrnnal takart, ezrt Gram-negatvan festdik. A
trzs kzs vonsaknt szemben a kvetkez Actinobacterek trzzsel a DNS-k kis G+C-tartalmt
jelltk ki, ez alapjn soroljk ide a nemzettsgeket, amelyek kztt szmos ipari jelentsg akad
(Bacillus, Lactobacillus, Clostridium stb. fajok.) A nemzettsgek azonban szinte minden ms
tulajdonsgban klnbznek, mivel vannak plcikk, kokkuszok, spirlisak, aerobok/anerobok,
endosprsak/sprtlanok is kzttk. Ezek azonban az egyes csaldokon bell sem elgg konzervlt
tulajdonsgok, gy nem megfelelek a besorolskor, ezrt is hasznljk ma mr a real-time (vals
idej) PCR technikt a DNS-alap osztlyozshoz. A firmicutes rendszertana azonban eme diverzits
miatt jelents vltozsokon ment t s megy t most is. Egyelre tbbnyire 3 osztlyt klnbztetnek
meg a Firmicutes trzsn bell: Bacillusok, Clostridiumok s a Mollicutes [27]. (3.2.2. tblzat, lsd
mg a 93. oldalon)
Ipari szempontbl a bacilli osztly bacilliales (katalz pozitvak) rendjnek legfontosabb tagja a
bacillusok nemzettsge, amelynek fajai kztt olyan fontosakat tallunk, mint a Bacillus subtilis
(3.2.5. bra), amelyet szinte a DNS felfedezse (Watson 1953) ta a Gram-pozitv baktriumok

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

69

modellszervezeteknt hasznlnak fel, s 1959-ben volt az els sikeres gntranszfer egy Bacillus
subtilis trzsbe [58].

3.2.5. bra: Bacillus subtilis [178]


A 90-es vek kzepre a biotechnolgusok egyik igslovrl annyi informci llt rendelkezsre (fiziolgiai folyamatok ((transzkripcis, transzlcis szablyozsok)), tenysztsi s ipari fermentcis tapasztalatok stb.), hogy rdemesnek tnt belle expresszis rendszert kszteni, amely
idegen fehrjk (ipari cl, gygyszati cl, lelmiszercl stb.) ellltsra nagy lptkben alkalmas. Az ilyen expresszis rendszerek olyan mdostott mikrobk (jelen esetben ez B. subtilis),
amelyek kpesek nagy koncentrciban bioaktv formban (helyes elsdleges, msodlagos, harmadlagos szerkezettel) fehrjket a fermentlbe extracellulrisan kivlasztani, mikzben eredeti protez
aktivitsukat lecskkentettk (s ezltal a termk lebonts cskkent), persze egyttal az aminosavmetabolizmust is szksgszeren kiegsztettk. gy mra valban a legelnysebb s taln a
legelterjedtebb ipari expresszis rendszerr vlt a B. subtilis, s olyan fehrjket lltanak el vele,
mint a termostabil kemnytbont enzimek (-amilzok, glkoamilzok, xilanzok), illetve a humn
interleukin-1 (ILE-1), amely az emebri immunvlasz egyik kzponti citokin6 molekulja [59].
A bacillusok tovbbi fajai sem szgyenkezhetnek: A Bacillus coagulans (nevt a tej fehrje kicsapsrl kapta) a tejipari trgyrts oltanyaga, illetve j enzim- (pl.: - s -amilz, xilanz, cellulz,
alkalikus protez, lipz stb.) s tejsavtermel. Elbbiek jelentsge a hstabilits s klnleges pHtolerancia miatt kiemelked, utbbi kpessge pedig azrt jelents, mert az 50-55C-on vgzett
tejsavfermentcikat nem kell sterilen vezetni, s gy jelets kltsgmegtakarts rhet el, ugyanakkor hozam s vgtiter tekintetben a szoksos (s kzeli rokon) Lactobacillus trzsekkel is versenykpes [60]. A bacillusok alkalmazsnak egyik iskola pldja a Bacillus thringiensis (vagy kezetek
hjjn: B. thueringiensis v. B. thuringiensis), amelynek endosprjnak felsznrl endotoxikus
fehrjt izolltak s klnoztak, mert a biokontroll sorn a rovarok ellen hatkony bio-irtszer (ipari
sznyogirts hatanyaga). Az 1980-as vektl kezdve alkalmazzk ezt a biopeszticidet, s a 90-es
vektl kezdve a gnmdostott nvnyek egyik nagy csoportjt a BT (Bacillus thringiensis Toxin)-t
kdol s expresszltat lepidoptera (lepkeflk) ellen nvdelemmel felszerelt gabonk adjk
(Monsanto kukorica stb.) [61]. A Bacillus licheniformis FDA ltal is elfogadott, GRAS listn szerepl
biztonsgos ipari s lelmiszer-ipari mikroorganizmus, amellyel szmos heterolg gnexpresszit
megvalstottak, illetve carbohidrz- (fleg -amilz) s protez- enzimeket lltanak vele el [62].
Szmos patogn mikroba is tallhat a bacillusok kztt, mint a Bacillus antraxis (Antrax vagy
lpfene) vagy B. cereus. A Bacillialacea mellett kt tovbbi, fleg egszsggyi vonatkozs csald, a

Gilman A, Goodman LS, Hardman JG, Limbird LE. Goodman & Gilman's the pharmacological basis of
therapeutics. New York: McGraw-Hill (2001). ISBN 0-07-135469-7
6

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

70

Ipari mikrobiolgia

Staphylococcuceae (pl.: S. aureus) s a Listeriak tallhatak meg (L. monocytogenes, 3.2.6. bra) a
Bacilliales rendben [64].

3.2.6. bra: Listeria monocytogenes [178]


A bacillusosztly msik fontos rendje a Lactobacilliales, azaz lactobacillusok. Ide tartoznak az
elssorban egszsggyi szempontbl rdekes Streptococcusok (pl. S. pyogenes (skarlt), S.
pneumoniae, S. bovis), illetve a blflra Enterococcusai (pl.: E. faecalis). Mindkt csald a tejiparban
jtszik szerepet. A S. thermophilus a kzeli rokon Lactobacillus delbruecki subsp. bulgaricusszal
egytt joghurtok mikrobitjt adja, s gy lelmiszer-ipari felhasznlsa jelents, emellett tejsavellltsra is hasznlhat [65]. Az Enterococcusok a mediterrn eredet sajtokban fontos szerepet
jtszana egyrszt a sajtok kedvez egszsggyi hatsnak kifejtsben, valamint a kszts
technolgijban is [63]. E kt kevsb jelents csald mellett a Lactobacilliceae csald tagjai a
Leuconostoc s Lactobacillus (3.2.7.) nemzettsgek.

3.2.7. bra: Lactobacillus acidophilus [178]


Ipari szempontbl a Leuconostoc mesenteroides almasav (=2-hidroxi-szukcint) termelsi
potencilja, valamint dextrnszukrz enzimtermel kpessge figyelemre mlt. Utbbi klnsen
divatos a funkcionlis lelmiszerek ellltsa kapcsn, amely enzim segtsgvel az
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

71

emsztenzimeknek ellenll glkooligoszaharidot szintetizl ez a mikroba [66]. A lactobacillusok


kz tartoznak a Pediococcusok is. ltalban ezen tejsavbaktriumok homolaktikus tejsavas
erjesztst hasznljk ki a kposzta savanytsakor. A Pediococcus acidilactici faj a blflra tagja, s
rszben tejsavtermelssel, rszben pediocinek (pediococcusok ltal termelt baktericinek) segtsgvel
antagonizmussal szortja vissza a fertzseket. Alacsony pH-n s magas hmrskleten (65C) is tll
[71].
Az Oenococcusok (3.2.8. bra) kz kevs fajt sorolnak, viszont ezek a nevknek megfelelen a
bor(alkohol)kszts (oenology enolgia) munkalovai. A borszati jelentsgk az zek kialaktsban jelentkezik (pl.: Oenococcus oeni), mivel a kemnyebb malonsavas (almasavas) zt (ami a mustbl ered) alaktjk a puhbb, teltebb, vajasabb tejsavas zz (malo-laktikus fermentci). E vegyletek
arnya hatrozza meg a bor zt.

3.2.8. bra: Oenococcus oeni [178]


A Lactococcusok a tejgazdasgokban jtszanak szerpet a tejtermkek s sajtok ellltsnl. A
Lactococcus lactis sp. lactis (3.2.9. bra) s a L. lactis sp. cremoris oltkultra szerept tlti be [72].
ltalban homolaktikusak, s f feladatuk a tej gyors lesavanytsa, ami megakadlyozza a
megromlst okoz mikrobk elszaporodst.

3.2.9. bra: Lactococcus lactis [178]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

72

Ipari mikrobiolgia

A Firmicutes 2. nagyosztlya a Clostridium-flk osztlya, amely fajokban s nemzettsgekben is


igen gazdag [148].
Ipari jelentsge lehet a Sarcina ventriculinak, amely a mikrobilis cellulztermels egyik
kpviselje. A Clostridium nemzetsgbl ipari jelentsge lehet a C. thermocellumnak, mivel
cellulzalapon etanolt fermentl, mr iparilag alkalmazzk a C. botulinum-ot (3.2.10. bra), amelynek
endotoxinja idegmreg, de kis koncentrciban botox nven forgalmazzk plasztikai sebszeti cllal.

3.2.10. bra: Clostridium botulinum


Vgl a C. acetobutlicum, amellyel risi mretekben nmet technolgival aceton-butanol-etanol
(ABE) femetncikat vgeztek. A Clostridiumok osztlyban szinte minden anyagcserre s letformra tallunk pldt: vajsavas erjeszt a Butyrivibrio, ecetsavtermel az Acetobacterium, nitrognfixl az Anaerococcus, propionsav termel a Propionispira, borostynksav- (szukcint) termel a
Succiniclasticum, szulftredukl Desulfosporosinus, dehalogenidez (halogenidekkel szubsztitult
szennyezsek bontsa) Desulfitobacteriumok.
A Firmicutes 3. csoportja a Mollicutes, ahol ipari potencil alig tallhat, viszont az eddig ismert
legkisebb baktriumokat (Mycoplasma genitalium) idesoroltk.
3. Actinobacterek
Az Actinobacterek trzst Gram-pozitv baktriumok alkotjk, amelyeknek nagy a G+C-tartalma
(>55%). Ez a csoport 39 csaldot s 130 genust tartalmaz, gy ez a legnagyobb trzs a baktriumokon
bell. Igen szles morfolgiai tartomnnyal rendelkeznek a coccusoktl (pl.: Micrococcus) a plcikagmbkn (pl.: Arthrobacter) keresztl, a tredezett hifn t (pl.: Nocardia) az lland s ersen
differencilt, elgaz micliumig (pl.: Streptomycesek) bezrlag. Szmos Actinobacter sprakpz,
amely sprk a mozg zoosprktl a klnleges propagulkig terjednek. lettanilag is nagyon
klnbznek, amint az kitnik szmos extracellulris enzimeik s tbb ezer metabolitjuk termelsbl
(belertve az antibiotikumokat is). Az Actinobacterek (klnsen a Streptomyces nemzetsg) a f
antibiotikum-termelk a gygyszeriparban. Ennek ellenre nhny Actinobacter fontos humn- s
llatpatogn. Pldul a Mycobacterium tuberculosis tuberkulzist okoz, Corynebacterium diphteriae
pedig diftrit, a Propionobacterium acne az akne (brhiba) okozja. Az Actinobacter fajok
szleskren elterjedtek mind a szrazfldi, mind pedig a vizes koszisztmkban, s a bioszanyagok
(cellulz, kitin) lebontsban s visszaforgatsban (sznkrforgalom) fontos szerepet jtszanak. Noha
az Actinobacterek egy elklntett csoportot kpeznek a 16S rRNS-fn, nincs ms megbzhat
biokmiai vagy molekulris tulajdonsguk, ami sajt jellegzetessge lenne a csoport tagjainak. Ennek
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

73

ellenre az jabb genomszekvencia-analzisek szmos konzervlt kzs s egyedlll indelt talltak,


amelyek vagy minden Actinobacterra jellemzek, vagy csak nhny alcsoportjukra, de fontos
informcikat szolgltattak a rendszertanuk, leszrmazsuk s egyedlll biokmiai s lettani
tulajdonsgaik megrtshez.
Az Actinobacterek csoportja igen gazdag fajszmban (3.2.3. bra). A legnpesebb rend az
actinomycetes rendje (ezen kvl mg az Actinobacterek osztlyba tartoznak a Rubrocacterek,
Sphaerobacterek, Cariobacterek, Acidimicrobiae-k, s a Bifidobacterek), amelynek tagjai mind
humnegszsggyi, mind ipari szempontbl jelentsek.
Az actinomycesek rendje tovbbi, igen klnbz alrendeket tartalmaz: Micrococcineae,
Corynebacterineae, Propionibacterineae, Pseudonocardineae, Frankinae, Micromonosporineae,
Streptomycineae, Catenulisporinea, Actynomycetaceae s Glycomycetaceae.
A Micrococcusok (Micrococcineae) a termszetben szleskren megtallhatk (levegben, talajban,
porban, vzben), Gram-pozitv gmb alak baktriumok, ltalban tertdknt fordulnak el. Ers
sejtfallal rendelkeznek, amely a biomasszatmeg 50%-t is kiteheti. Genomjuk G+C-tartalma nagy, s
plazmidot is gyakran hordoznak, amelyek hasznos tulajdonsgokat kdolnak. A M. luteus srga, a M.
roseus rzsaszn telepeket kpez maltakivonatos agaron. Elbbi a toxikus szerves anyagokon (pl.:
piridin) riboflavintermelsre kpes. Egyes mikrokokkuszok kztt csak 50%-os a genomazonossg,
ezrt valsznleg jra kell ket osztlyozni a 16S rRNS alapjn. Tbbsgk mezofil, de pszichrofil is
akad kztk (M. antarcticus). Habr nem sprakpz, mgis nagyon tll fajta (tbb 10 000 vet is
kibr). ltalban szaprofitk vagy kommenzalistk, de opportunista patognek is elfordulnak,
amelyek fleg a legyenglt immunrendszer szervezeteket tmadjk. Nehz igazolni a
patogenitsukat, mivel a norml emberi brflra tagjai.
Ipari felhasznlsuk tbbnyire a detoxifiklsra korltozdik, mivel szmos toxikus anyag
lebontsra kpesek, egyes trzsekkel azonban hossz sznlnc (C21-C34) alifs sznhidrognt
lltanak el.
A M. antarcticus faj hidegkedvel, gy 30C-os hmrskleti optimummal rendelkez alfa amlizt
izolltak belle, amely 12C-on is aktv. M.flavust eleveniszapos szennyvztiszttbl izolltk, s
aerob, heterotrfknt rtk le. Glicerint, trehalzt s dextrint hasznost sznforrsknt, de glkzt,
fruktzt, laktzt, arabinzt, xilitet, inozitot, ramnzt nem. A M. luteus srga, obliglt aerob, nem
patogn baktrium, amely ltalban egysejtknt (csoportosuls nlkli formban) tallhat meg.
Koagulz negatv, bacitracinrzkeny mikroba. A glutaminzenzime ipari szempontbl rdekes
(str) [35] A M. lylae a haltermkek megromlsrt felel, lehet humn patogn is. A M.
mucilaginosusrl (3.2.12. bra) 1981-ben kiderlt, hogy a Staphylococcusokhoz jobban hasonlt, ezrt
Staphylococcus salvarius nven szerepelt a kis G+C-tartalm Gram-pozitv baktriumok kztt, majd
2000-tl a Stomatococcus mucialginosus, ksbb a Rothik kz kerlt, s a szj mikroflrjnak
ttrjeknt a plakkok s gy a fogszuvasods kialakulst segti.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

74

Ipari mikrobiolgia

3.2.12. bra: Microccus mucilaginosus [178]


A Micrococcus roseus RJ6 trzset szteroidkonverziban lehet hasznostani, mivel egy
plazmidjnak termkei a koleszterin -> ADD s AD talaktst tudjk elvgezni [33]
A M. glutamicus trzsnek tbbfle ipari felhasznlsa van, a diazo festk eredet szennyezsek
lebontstl [35] a lizin termelsen t [36] a koimmobilizlt glutaminsav termelsig [37]. Utbbi
potencilt s a termeltrzseket napjainkban is kutatjk s fejlesztik [38].
A mikrokokkuszok egyik iparban is hasznlatos kzeli rokonai az Arthrobacter csald tagjai.
Jellemzen talajlakk, aerobok, s az exponencilis fzis sorn plcikk, a hanyatl fzisban pedig
kokkuszok formjban jelennek meg (reverzi: plcikk osztdsa kokkuszokk). Jl trik a
kiszradst s tpllkhinyt is. Az Arthrobacter simplex szteroidkonverzis kpessgeit mr
trgyaltuk (2.1. fejezet: Actinobacter-ek ltal vgzett szteroid konverzik), azonban az elmlt 100
vben tbbszr is j besorolst s nevet kapott (Arthrobacter simplex, Corynebacterium simplex,
Pimelobacter simplex). Jelenleg a szintn Actinomiceta Propionibaktriumok Nocardioides csaldjba
soroljk Pimelobacter simplex nven, teht nem a mikrokkuszok Arthrobacter csaldjba. Az
Arthrobacterek egyik kiemelked tagja az A. chlorophenolicus (3.2.13. bra), amely extrm lebontkpessgei rvn (piridon, klrofenol, Cr(VI) redukcija Cr(III)-m stb.) bioremedicikban
hasznlatos.

3.2.13. bra: Arthrobacter chlorophenolicus [178]


Az A. mobilis savas urezt fermentlt dtk karbamidtartalmnak, amely a karcinogn
etilkarbamt prekurzora, cskkentsre lehet hasznlni (pl.: japn rizsplinka, azaz szak esetben)
[44]. Az A. oxydans (jabban A. nicotinovorans [45], neve lhelyre utal: dohny nvnyen
nikotinlebont aktivits) is iparilag fontos szteroidkonverzis kpessgekkel rendelkezik, mint azt mr
szintn trgyaltuk (2.1. fejezet: Actinobacterek ltal vgzett szteroidkonverzik).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

75

A mikrokokkuszok msik rdekes s lelmiszeriparban hasznlt csaldja a brevibaktriumok,


amelyek a lbszagrt is felelnek (B. linens), s egyes sajtok (Limburger, Port-du-Salut, plpusztai)
erjesztsrt is. Ezek a mikrobk ugyanis kpesek az izzadt lbon az elhalt hmsejtek lebontsra
metntiol keletkezse kzben, s a szintn jelen lv propionsav-baktriumok termelte
ecetsavval+propionsavval egytt alakul ki a kellemtlen szag (erre mg izovalerinsav-termelssel a
Staphylococcus epidermis is rsegt [164]). A sajtaroma kialaktskor pedig a triptofnbont
kpessgk jtszik fontos szerepet [46]. A plpusztai sajt felsznre (aerob) kenik az oltflrt, amely
rzsasznes (=rzsflra), nylks bevonatot kpez, s igen ers szagot raszt. Ez a sajt egy viszonylag
fiatal (kicsit tbb mint 100 ves) hungarikum [47].
A Corynebacteriumok (Corynebacteriaceae) Gram-pozitv, plca alak, sprtlan, katalz pozitv,
aerob vagy fakultatv anaerob, csilltlan, egyenes vagy enyhn hajlott baktriumok, szleskren
elterjedtek a termszetben, tbbsgk rtalmatlan. Vannak kztk iparban is alkalmazottak (C.
glutamicum) s patognek, mint pldul a diftria krokozja (C. diphteriae (3.2.14. bra), amely
patogenitst (azaz diftriatoxin-termel kpessgt) egy baktriofgtl klcsnzi). Klns
ismertetjk, hogy polifoszft formjban inclusion-bodyban energit trolnak (=metakromatikus
granula), amelyeket a metiln-kk festk a szoksos kkfests helyett rzsasznre fest. Az alakjuk
vltoz is lehet a krlmnyektl fggen (=pleomorf).

3.2.14. bra: Corynebacterium diphteriae


A Corynebacteriumok sejtfaluk alapjn is jl elklnthetek. Mezo-diaminopimelinsavat
tartalmaz a murein hljuk szmos arabinogalaktn ismtldssel, csakgy mint corinemikolsavval
(=mikolsav 22-26 sznatommal), amelyeket diszaharid kapcsol ssze (mAGP mikolil-AGpeptidoglikn).
Tenysztsk viszonylag lass, mg kiegsztett tpkzegen is, s valamennyi trzs biotint (Hvitamin) ignyel. Nmelyik trzs tiamint (B1 vitamin) s PABA-t (B10 vitamin) is ignyel. Viszonylag
kicsi, szrks telepeket kpeznek, tbbnyire tltszak, de oplos a kzepk. Lffler tpkzegen
(pepton, glkz, NaCl, marhahskivonat, lvrszrummal (vz helyett) feltltve) srgs, fehrbe hajl
sznek a telepek.
Ipari hasznostsuk kiterjed az aminosavak, nukleotidok s ms tpllkozsi faktorok ellltsra,
valamint sznhidrognek lebontsra, sajtrlelsre s enzimtermelsre. Egyes trzsek antibiotikus
hats bakteriocint termelnek. A C. glutamicum a nevbl is lthatan a glutaminsavgyrtsra
alkalmas, s az anyagcsereutak mdostsval lizin s treonin aminosavakat is el lehet vele lltani.
Szintn ezzel a trzzsel sikerlt az emberi epidermlis nvekedsi faktort (EGF) aktv formban
ellltani, ami megnyitotta az utat tovbbi humnfehrje-expresszltatshoz C. glutamicummal. A
fehrjeexpresszit vagy az ltalnos kivlaszt ton (Sec > durva fellet endoplazmotkus retikulum

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

76

Ipari mikrobiolgia

-> Golgi), vagy az iker-aginin (Tat > aktv formban membrnon keresztl) transzlokcis ton lehet
elrni.
Egyes Corynebacteriumok lipofilek, azaz zsrban szeretnek szaporodni. A nemlipofileket fermentatvakra s nemfermentatvakra szoks osztani.
Fermentative Corynebacterium-ok:
Corynebacterium diphtheriae group
Corynebacterium xerosis and Corynebacterium striatum
Corynebacterium minutissimum
Corynebacterium amycolatum
Corynebacterium glucuronolyticum
Corynebacterium argentoratense
Corynebacterium matruchotii
Nem fermentative Corynebacterium-ok:
Corynebacterium afermentans subsp. afermentans
Corynebacterium auris
Corynebacterium pseudodiphtheriticum
Lipofilek:
Corynebacterium jeikeium
Corynebacterium urealyticum
Corynebacterium afermentans subsp. lipophilum
Corynebacterium accolens
Corynebacterium macginleyi
CDC coryneform groups F-1 and G
A Corynebaktriumok legkzelebbi rokonai a Mycobacteriumok (Mycobacteriaceae), idertve a
szteroidkonverziban hasznlt M. phlei s a tuberkulzis krokozjt (M. tuberculosis), valamint a
lepra krokozjt (M. leprae) is. Egy rszk lassan szaporodik (fleg a krokozk: marhatuberculzis
(M. bovis), humn tbc (M. tuberculosis 3.2.15. bra), lepra M. leprae)), msok pedig gyorsan (M.
phlei, M. smegmatis). A mikobaktriumok se nem Gram-pozitvak, se nem negatvak, hanem a Gramfestsre furcsn reaglnak, mivel a festkek savas/alkoholos lemossnak ellenllnak (acid-fast). Ezen
kpessgket s mg tovbbi nhnyat (pl.: antibiotikumrezisztencik egy rsze, csak a makrolid
antibiotikumok hatnak) a klnleges mikolsavas sejtfaluknak ksznhetik.

3.2.15. bra: Mycobacterium tuberculosis


A Mycobacteriumok kzeli rokonai a Nocardik. A norml szjflrban is elfordulnak, de
nokardizisos tdgyulladst (N. asteroides, N. brasiliensis) is okozhatnak. A N. lactamdurans ipari
fermentciban termeli a sertstenyszts antibiotikumt, az efrotomicint [50]. A nokardik bioaktv
komponensek ellltsrl is ismertek, gy a nocardicin [55] (-laktm vzas antibiotikum, N. uniformis termeli), tubelactomicin A [56] (makrolid antibiotikum mikrobaktriumok ellen (=rokonok(!)),
N. vinacea termeli) s a brasilicardin A [57] (triciklusos terpenoid immunszupresszns, N. brasilensis
termeli) ipari ellltsban rszt vesznek [51]. A N. farcinica s N. globerula iparilag rtkes
amidzok forrsa, amelyeket tbbnyire rekombinnsan lltanak el, s az akril-amid ellltsnl
hasznlnak [52].
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

77

A nokardik legkzelebbi rokonai a Rhodococcusok. Nhnyuk patogn, de tbbsgk jindulat,


s szinte mindenhol megtallhat, mint pldul talajban, vzben s eukarta sejtekben. 2006-ban
kszlt el a genom megszekvenelsa. 9,7Mb hossznak s 67% G+C-tartalmnak talltk. A
Rhodococcus trzsek alkalmazsa fontos, a szles kr vegyletlebont kpessgk s a bioaktv
szteroid-, akrilamid-, akrilsavtermelsk miatt, illetve a fosszilis zemanyagok biolgiai knmentestse vgett. Ezt a nagyfok genetikai s katabolikus vltozatossgot nemcsak a nagy kromoszmlis
DNS-nek, hanem 3 nagy, lineris plazmidjnak is ksznheti. A Rhodococcusok ksrleti szempontbl is kedvez trzsek gyors nvekedsi sebessgknek ksznheten. Ennek ellenre mg
nincsenek tkletesen jellemezve, lerva.
Egy msik fontos alkalmazsuk a biokonverzik terletn van, amelyek biolgiai rendszereket
hasznlnak olcs nyersanyagok rtkesebb vegyletekk alaktsban. A Rhodococcusok (3.2.16.
bra) ezen felhasznlsa az olyan veszlyes krnyezetszennyez anyagok lebontsnak kpessgbl
szletett, mint amilyen a toluol, naftalin s herbicidek. ltalban az aroms vegyletek hasznostsakor az els lpsben az aroms gyrt oxigenljk, s kt alkoholcsoport keletkezik a gyrn.
Ezutn bels/kls diolmechanizmus szerint a gyr felhasad, s tovbbi metabolizmus al kerl.
Mivel ezen folyamatok kmija igen sztereospecifikus, a keletkezett diolok kiralitsa tervezhet. Mg
a kmiai reakcik kiralitsnak kontrolllsa a szintetkus kmikusok szmra jelents kihvs, biolgiai folyamatokat lehet hasznlni a kirlis molekulk ellltsra, ha a kzvetlen kmiai szintzis
megvalsthatatlan vagy nem hatkony. Erre plda a Rhodococcusok felhasznlsa az indene ellltsban, ami a Crixivan nev AIDS-gygyszer prekurzora, egy protz inhibtor 2 kirlis centrummal a komplex molekulhoz szksges 5-bl.

3.2.16. bra: Rhodococcus species


Kevss jelents, kzeli rokonai a Nocardiknak s Rhodococcusoknak a Tsukamurellk [53].
Ezek talajban elfordul Actinomycetk, amelyek immunszupresszlt pciensekben tdgyulladst
okoznak. Klnlegessgk, hogy a sejtfalban tallhat mikolsavaik extrm hossz sznlnccal (~60
sznatom) rendelkeznek. A Tsukamurella paurometabola iparilag megfermentlt sejtjeinek liofilezett
formjt fitonematdk rtsra hasznljk a mezgazdasgban biokontroll sorn [54].
Az Actinomycetk kvetkez csoportja a Propionibacteriumok (Propionibacteriaceae), amelyek
nem mozg, sprtlan, anaerob plcikk, s gyakran krokozk (pl.: Propionibacterium acne (3.2.17.
bra), brprusokban szaporodik el, eltmve azokat, s aknt ltrehozva.).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

78

Ipari mikrobiolgia

3.2.17. bra: Propionibacterium acne


Nevket a klnleges propionsav-termel anyagcserjkrl kaptk, mint azt mr korbban
trgyaltuk (1.3. fejezet, erjedsek). A propionsav-baktriumok kereskedelmi rdekldsre tartanak
szmot a svjci tpus sajtok z- s lyukkpzse kapcsn, tovbb egyre elterjedtebb az a nzet, hogy a
propionsav-baktriumok probiotikumok, egyrszt az ltaluk termelt propionsav, B12-vitamin,
flacinok, bakterocinek miatt, msrszt a blflra tejsvabaktriumai nvekedsnek stimullsa vgett
[39]. Ilyen faj a P. freundenreichii subsp. shermanii. ppen a sajtgyrts sorn merlt fel elszr,
hogy a sajtmtrix kialakulsakor elszr tejsavas erjeds megy vgbe, amelyet az rlelsi szakaszban
propionsavas erjeds kvet, ezrt a propionsav-baktriumok alkalmasak a tejsavasan leerjedt fermentl
tovbbhasznostsra. Ipari szempontbl azonban a propionsav-baktriumok (PAB) tenysztse
jelenleg krlmnyes, mert lassan nvekv trzsek, amelyek az esetleges bakterilis fertzsekkel
nem tudnak versenyezni. Egyik megolds lehet a PAB-ok trzsfejlesztssel trtn felgyorstsa,
egy msik pedig az immobilizlt PAB-ok alkalmazsa.
A Propionibacterium acidipropionici propionsav-termelsre hasznlhat 37C-os optimlis
hmrsklet s anaerob krlmnyek valamint 6-os pH mellett, mg B12-termelsre is alkalmas 40Cos hmrskleti optimumammal s 0,5 vvm levegztets mellett 6,5-s pH-n [40].
Ugyanez a baktrium korbban (XX. sz. kzepe) Propionibacterium pentosaceum nven szerepel
a szakirodalomban viszonylag nagy terjedelemben, s a baktrium eritrittalakt kpessgre [41]
valamint nitrt-nitrit talaktsra [42] fkuszlva P. pentosaceum kpes a borostynksavat is
propionsavv alaktani [43], amivel megteremti az tjrs lehetsgt a C4 platformbl a C3-ba. A
propionibacteriumok egyik iparilag is szmottev csoportja a Nocardioidk csaldja s azon bell a
Pimelobacter simplex (korbban Arthrobacter simplex: szles kr szteroidkonverzis kpessgek).
Az actinomycetk kvetkez csaldja a Pseudonocardia-k (Pseudonocardiacea), amelyek sejtfala
nem tartalmaz mikolsavat. Tbbynyire lebontkpessgket rtk le, gy ezek is bioremmedicira
lakalmas fajok, mint pldul a sznhidrognbont Pseudonocardia hydrocarbonoxydans (olykor
Amylocota hydrocarbonoxydans nven szerepel). A P. sulfidoxydans egyes proteobakterekkel egytt a
bioszfra knkrforgsban jtszik szerepet, mivel a kntartalm aminosavak (mikrobilis)
lebontsakor dimetil-szulfid s dimetil-diszulfid keletkezik, amelyeket nhny proteobakter s
pszeudonokardia kpes csak szulftt alaktani. Ezt a tulajdonsgt szagmentest biofilmek
alkalmazsakor is kiaknzzk [48]. A P. halophobica szintn tbbszri tnevezs utn (Amylocota
autotrophica) kerlt mai filogenetikus helyre, s korbbi nevn antibiotikumkonverzis irodalmak
lelhetk fel [49]. Az elbbi Pseudonokardiak viszonylag jonnan felfedezett kzeli rokona az 1,4dioxnnal szennyezett ipari szennyvziszapbl izollt dioxnbont P. dioxanivorans. Tetrahidrofurn
s egyb terszrmazkok lebontsra is kpes.
Az Actinomycetk egyik legismerteb kpviseli a Streptomycesek, amelyek msodlagos
metobiltjaikrl hresek. A Streptomyces griseus (3.2.18. bra) tenyszetben fedeztk fel (1943) az
aminoglikozid tpus sztreptomicin antibiotikumot.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

79

3.2.18. bra: Streptomyces griseus


A neomycin, klramfnikol, streptomicinek mellett az utbbi vekben j szerepet kaptak a
Streptomycesek: heterolg gnepresszira egyre gyakabban hasznljk a Streptomyceseket, mivel az
eukarita fehrjk E. colival trtn kifejeztetse nem volt elg hatkony. Msodlagos metabolitjaik
kztt szmos antifunglis szer is tallhat: nisztatin (Streptomyces noursei), amphotericin B (S.
nodosus). A fajokban gazdag nemzetsg olyan antibiotikum termelsvel rendelezik, mint a klramfenikol (S. venezuelae), tetraciklin (S. rimosus), Vankomicin (S. orientalis). A penicillinrezisztens
mikrobk -laktamz enzimeinek gtlsval jra antibiotikum-rzkenny tehetk. Ehhez klavulnsavat szoktak a penicillinekkel egytt formulzni, amely kiegsztst a S. clavuligerus faj termel [161].
4. Thermotoga
A Thermotogk termofil vagy hipertermofil, leginkbb 80C (legmagasabb optimum a baktriumok
kztt) krl, semleges pH-n nvekv mikrobk. ltalban plca alak sejtek, kls membrnnal
(=toga) is bortva. Enzimeik a magas hmrskleten val aktivitsukrl ismertek. Mr a 90-es
vekben ipari szemszgbl foglalkoztak a celluloltikus s xilnbont enzimeikkel.
A strsk nagyon vltoz, mg egyesek extrm magas skoncentrcit is elviselnek, msok
csak alacsony skoncentrci mellett nvekednek, gy olyan vltozatos lhelyeken tallhatk meg,
mint pldul a seklyesek vagy a mlytengeri rendszerek s kontinentlis olajmezk. Elsknt a T.
maritimt izolltk egy vulknbl, majd egy olasz seklytengeri ledkbl, amely geotermikusan
ftve volt. A kvetkez faj a T. neopolitana volt, amelyet egy Npoly kzeli tenger alatti tengeri hforrsbl izolltak. A legjabb Thermotoga trzs 68C-os melegvzben 6,8-as pH-n n Nmetorszgban. Ezek az aerob Gram-negatv mikroorganizmusok ltalban sprtlanok, s szmos sznhidrtot
metabolizlnak, pldul glkzt, saccharzt, kemnytt, cellulzt s xilnt. Az L-alanin- termelsk
hasonl az sbaktriumok kz tartoz Thermococcusokval, ami azt mutatja, hogy a cukorbl Lalanin-elllts egy korbbi si metabolizmus jellegzetessge.

3.2.19. bra: Petrotoga sp.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

80

Ipari mikrobiolgia

Egy hasonl faj az anaerob Petrotoga (3.2.19. bra) olajtartlyokbl izollhat, ami felveti a krdst
mind a mly felszn alatti tllskrl, mind pedig az shonossgukrl ezen a klnleges koszisztmban.
5. Fusobacteriumok
Anaerob, heterotrf, fonalas szervezetek, noha a humn felslgti (torok, garat) szervek norml
flrjhoz is tartothatnak, szmos fertzs krokozi (Fusobacterium necrophorum), ezrt minden
Fusobaktert fertz gensknt kell kezelni. Ennek ellenre bacteriocineket [73], s -laktamzt [74] is
termeltethetnek velk.

3.2.20. bra: Fusobacterium novum [178]


6.-7. Deinococcus-Thermus
Kt rendet (Deinococcales s Thermales) magba foglal (ezrt ketts nev), kevs fajt tmrt
baktriumtrzs, ahov zmben extrmofilek tartoznak. A Deinococcus radioduranst (3.2.21. bra)
poliextrmofillnek is nevezik, mivel nevbl addan jl tri a sugrzsokat, s ezen fell mg
hidegtr, savtr, jl viseli a kiszradst s a vkuumot is (azaz rutazsra is kpes). Az ellenll
kpessgt annak ksznheti, hogy a genomjt tbb pldnyban is fenntartja, illetve hatkony DNSjavt rendszerrel rendelkezik. [165]

3.2.21. bra: Deinococcus radiodurans [178]


A Thermus thermophilus japn hforrsbl izollt 80C-os nvekedsi optimummal s intenzv
oxignignnyel rendelkezik, noha az oxign oldhatsga e magas hmrskleten meglehetsen kicsi.
Ugyanakkor hstabil enzimek forrs-mikoroorganizmusaknt nagy jelentsggel br (pl.: rTth-DNS
polimerz [67], -glkozidz [75]). A teljes genomjt megszekvenltk, gy lehetv tve a
termofilexpresszis rendszer kialaktst

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

81

8. Chloroflexi
Zld, nem knbaktriumok csoportja, ltalban fonalas morfolgival. A fnyt hasznljk
energiaforrsknt a zld pigmentjeik segtsgvel (nem kloroplaszt!), siklssal (gliding) mozognak.
A fnyhasznost rendszerk a magasabb rend llnyeknl megszokott II-tpus fotoszintetikus
reakcikzpontot hasznlja bakterioklorofillal, a Chlorobi fajaihoz hasonlan. Mg a magasabb rend
fotoszintetizl llnyek vizet hasznlnak elektron- donorknt, addig a Chloroflex-ek H2S-t (mint a
Chlorobi-k) vagy H2-t. A szoksos Calvin-ciklus helyett pedig egy sajtos, 3-hidroxi-propiont ciklust
hasznl a szerves anyagok beptsre. Szemben a szigoran anaerob Chlorobi fajokkal, kpesek aerob
heterotrf anyagcserre vagy anerob fotoheterotrf, illetve anaerob fotoautortf anyagcserre is [78].
Egy tpusfaj a Chloroflexus auranticus (3.2.22. bra), amely termofil baktrium sttben, oxign
jelenltben is szaporodik, s narancsszn. Fny mellett fotoszintetizl, s zld szn telepeket alkot
[76]. Ipari potencilt specilis amilzai jelentenek, amelyek a kemnytt nem maltzra vagy glkzra,
hanem maltotrizra s maltotetrazra (3, illetve 4 tag oligoszaharidokra) bontja, amelyeknek jabban
nagy jelentsge van az lelmiszeripar, gygyszeripar s a finomvegyipar szmra [77]. Ugyanezen
mikroba klnleges 3-hidroxi-piruvt- termel kpessge szintn ipari potencilt rejt, mivel a 3hidroxipiruvt s szrmazkai egy fontos platformot alkotnak, amelyek ellltshoz j megkzeltst
s j enzimeket szolgltathat a Chloroflexus auranticus [79].

3.2.22. bra: Chloroflexus auranticus [178]


A Chloroflexek msik rendje a Herpetosiphonales, amelynek egyik tpus faja a Herpetosiphon
aurantiacus [80], m ezek iparilag mg jelentktelenek.
9. Cyanobacterek
Fotoszintetikus baktriumok s a kloroplasztok csoportja. A mikroalgk jelents rsze is kzjk
tartozik. Poshadt llvizek lakja, amely vizek az ltaluk termelt cianotoxinok miatt mrgezek.
Nevket kkeszld sznknek ksznhetik. A cianobaktriumok oxigntermel fotoszintetikus kpessge tette lehetv a korbbi redukl lgkr oxidatvv ttelt, ami drmaian megvltoztatta az letformkat a Fldn, s megnvelte a biodiverzitst, noha ez veszlyeztette az oxignintolerns fajok
fennmaradst. Az endoszimbionita elmlet szerint a nvnyi s algakloroplasztok endoszimbionita
cianobaktriumokbl szrmaztathatk.
Biotechnolgiai potenciljukat jelzi, hogy az egysejt Synechocystis cianobaktrium volt a 3.
prokarita, amelynek teljes genomjt feltrkpeztk. Ez tovbbra is fontos modellszervezet maradt. A
genommretk tekintetben igen nagy szrs rzkelhet: Prochlorococcus 1,7Mb, Nostoc
punctiforme 9Mb, Calothrix 12-15Mb, ami mr az lesztvel azonos nagysg.
Felhasznlsuk szempontjbl nmelyeket lelmiszerknt forgalmaznak (pl.: Aphanizomenon
flos-aquae), ugynakkor jabban a zldenergia-termelsben jtszhatnak szerepet a napfny kzvetlen
elektromossgg alaktsval. A makroalgkhoz (ld. ksbb) hasonlan intenzven kutatjk a
cianobakter-alap alternatv zemanyag ellltsnak (dzel, benzin, kerozin) lehetsgt [81].
Leggyakoribb felhasznlsnak az Arthrospira (3.2.23. bra) nemzettsg fajai rvendenek, amelyeket
rszletesebben az Algk fejezetben trgyalunk (ezek elterjedt neve a Spirulina).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

82

Ipari mikrobiolgia

3.2.23. bra: Arthrospira (Spirulina) sp. [178]


10. Spirohaetk
ltalban csavarodott vagy szablytalan alak baktriumok, amelyek tbbsge krokoz (pl.: Lymekr -kullancsok ltal is terjesztett), amelyet a Borrelia burgdorferi okoz, vagy a Treponema pallidum,
amely a szifilisz krozja). Szaharoltikus [82] s etanoltermelkre [83] is tallunk pldt, de ipari
felhasznlsuk nincs. A Spirohaeta thermophila fermentatv anyagcservel rendelkezik, s a glkzt
tejsavv, etanoll, szn-dioxidd, illetve hidrognn alaktja [84].
11., 12,. 13. Chlorobik, Fibrobacterek, Bacteroidesek
Egyes forrsok szerint [27] a korbbi CFB (Cytophaga, Flavobacter, Bacteroides) csoportot
tszerveztk Fibrobacterek, Chlorobik, Bacteroidesek szmra. A Fibrobacterek tbbnyire a
bendben tallhtak meg, ezrt ipari szempontbl cellulzaik figyelemre mltak. A Fibrobacter
succinogenes j hozammal (Y=83%, br alacsony produktivitssal J=14 mg/lh) kpes a cellulzbl
borostynksavat (platformalkot!) ellltani.
A Chlorobi trzs (amelyet zld knbaktriumoknak is szoks nevezni) obligt fotolitotrfokat
foglal magba, amelyek szigoran anaerob fotoszintzist vgeznek, azaz elektrondonorknt H2S-ot
hasznlnak. ltalban anoxikus vizes kzegben tallhatk meg, ahov a napfny bejuthat. A
fotoszintetkius antennamolekulikat flexibilesen tudjk vltoztatni, aminek kvetkeztben vltoztatjk
az elnyelhet fnyhullmhosszt, s gy olyan rtegekben is letkpesek, ahol ms fotoszintetizl
szervezet szmra nincs vagy nem megfelel a berkez fny.

3.2.24. bra: Bacteroides biacutis


A CFB patogn, kommenzalista s szabadon l mikrobk diverz csoportja. A Bacteroides
fragilis toxi termelsrl ismert, de aminok ellltsra is hasznlhat, valamint a blbaktriumok
kztt is elfordul [69]. A norml humn mikrobita mintegy 20%-t a Bacteroides-ek teszik ki
(3.2.24. bra). A blbaktriumok kztt klnleges szerepk lehet, mivel igen j cukorlebont
kpessggel rendelkeznek. Az emberi emsztrendszer fels szakaszn (szj, nyelcs, gyomor s a
Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

83

vkonybl) a cukrok lebomlanak s felszvdnak, gy csak a poliszaharidok (pl.: nvnyi rostok)


szolglnak a vastagblben honos mikrobita szmra szn- s energiaforrsul. Az ilyen nvnyi rostok
fogyasztsa cskkentheti a vastagblrk kialakulsnak kockzatt. A klnbz fajok szubsztrtspecifitsa jelents klnbsgeket mutatnak, gy a bellk nyerhet degradcis enzimek is eltrek.
A B. fragilis kemnytszrmazkok (amilz s amilopektin) bontsban jeleskedik, a B. ovatusok
kztt pedig xiln, dextrn, pektin, guargumi s algint bontk is tallhatk.
14., 15., 16. Planctomyceta-k, Verrucomicrobiumok, Chlamydik
A Planctomicetkkal kapcsolatban az els felfedezs egy magyar nevhez fzdik (Gimesi Nndor)
1924-bl [70]. Az ltala a Lgymnyosi-tban felfedezett csillag alak llnyeket (3.2.25. bra)
planktonikus gombnak osztlyozta, csak ksbb derlt ki, hogy az egyik legfejlettebb prokaritrl
van sz. P. gimesii kpes cukrokat fermentlni (erjeszteni). Taxonmiai jellmezjk a peptidoglknmentes fehrjkkel bortott sejtfal, a sarjadz szaporods, DNS-t bort membrn, klnleges
morfolgia (nyeles sejtek, tbbsejtek, a nyllel hajlamosak megtapadni) s rszleges
kompartmentizci [85]. A Verrucomicrobium s Klamidik fajai ltalban eukaritk paraziti.

3.2.25. bra: Planctomyces bekefii


17. Aquificae
Az Aquificae fajok szigoran hipertermofilek, s jelenleg gy gondoljk, hogy ezek alkotjk a
baktriumok kztti els elgazst. Az elgazsi pont helye a filogenetikus fn vltoz, s nem
tisztzott. Ezt a trzset csak mostanban fedeztk fel a 16rRNS-ben tapasztalt eltrs alapjn.
Azonban ezen kvl nincs ms ismert molekula vagy tulajdonsg, amely megklnbztetn ket ms
baktriumoktl.
Kemolito-autotrfok, azaz CO2-t fixlnak, s szervetlen anyagok oxidlsval nyerik energijukat.
A trzs neve is innen ered: hidrogn gz oxidcijval (akr minimlis O2 segtsgvel) vizet
termelnek (Aquifex=vzjelz). Magas hmrskleti optimumuk miatt mint genetikai (s proteomikai)
potencilt kutatjk. ltalban 2-6 mikronos hosszsgak (3.2.26. bra), nem sprakpz Gramnegatv mikrobk. Az Aquifex pyrophilus anaerob mdon is kpes nvekedni, mikzben oxign helyett
nitrognt redukl.

3.2.26. bra: Aquifex aeolicus

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

84

Ipari mikrobiolgia

18., 19., 20., 21., 22. Proteobacterek


A Proteobakter gyjtnevet jabban a korbban hasznlatos bbor baktrium helyett vezettk be,
mivel a nagy diverzits taxonok kztt sok nem bbor szn s nhny fotoszintetizl is tallhat
[86]. A nv maga a grg Proteus nevbl szrmazik, jelezvn a sokfle idesorolt fajt. A 16S rRNSanalzisek alapjn a proteobakterek tbb szz nemzettsgt 5 (egyes forrsok szeint 6) osztlyba
soroltk, amelyeket a grg bc betivel jellnek (, , , , ()). Az rRNS-analzisek szerinti
elgazsi sorrend ms, mint az bc szerinti sorrend, e jegyzetben az eddigi koncepcihoz hven az
elgazsi sorrend szerint trgyaljuk a proteobaktereket.
Delta-, epszilon-proteobacterek
A delta-proteobacterek 3 nagy csoportra oszthatak: a szulft/kn redukl Desulfovibriokra, a
predtor fajta Bdellovibriokra s a gombaszer termtesteket s sprkat kpez Myxobacterekre. A
Desulfovibrio fajok a szulft, nitrit, nitrt, CrVI, UVI reduklkpessgk miatt eddig is a
(krnyezetvdelmi) kutatsok kzppontjban lltak (pl.: Desulfovibrio desulfuricans, D. vulgaris)
[144]. Az utbbi vtizedben olyan klnleges fajt (s szintn deltaproteobacter rokonait) fedeztk fel,
mint a Desulfobacter magneticus, amely magnetotaktikus, s magnetoszmjba magnetit svnyt
(FeII s FeIII oxidot) vlaszt ki (biomineralizci) [143].
A Bdellovibrio fajok ltalban ms Gram-negatv baktriumok predtorai, s azok periplazms
terben lnek (pl.: Bdellovibrio bacteriovorus). E klnleges baktriumok 160 m/s sebessggel (sajt
hossz 100x-a szekundumonknt) nekitkznek az ldozatnak, s kilyukasztjk annak kls
membrnjt, majd a lyukon t bekltznek a periplazms trbe, befoltozzk a lyukat, s vrnak. (ltens
llapot). Ezt kveten hidroltikus enzimeikkel feloldjk a gazdaszervezetet, s fonalas formban
benvik annak belsejt (bdelloplaszt). Az letciklus vgn a fonalak egyedi sejtekk esnek szt. Egy
E. coli sejtbl, kb 3-6 Bdellovibrio sejt keletkezik, de a nagyobb ldozatokbl akr 80 is keletkezhet
[145]. Biotechnolgiai potencilt a litikus enzimeik jelenthetnek, de egyelre ezek alkalmazsa nem
ismert.
A Myxococcus tagjai a legnagyobb genomak, s tpanyaghiny esetn termtestet (3.2.27. bra)
hoznak ltre, amely myxosprkat termel. Ezek rendkvl ellenllak. Aktv mozgsra (sikls)
kpesek: a temtestet trendezik, ezrt nylkabaktrium-nak is szoks nevezni ket [146].

3.2.27. bra: Myxococcus xanthus [178]


A Myxococcus xanthust hasznljk modellszervezetknt a Myxococcusok vltozatos, bioaktv,
msodlagos anyagcseretemkeinek vizsglatra. Ezek sajtos j szerkezet antitumor (pl.: epothilon,

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

85

hatsa, mint a paclitaxel), antibiotikus (pl.: orangicin), illetve sziderofr (Myxochellin) hats
anyagok [147], amelyek komoly (gygyszer)ipari lehetsgeket rejtenek.
Az epszilon-proteobacterek kztt a Campylobactereket s a Heliobactereket talljuk. Mindkt
nemzettsg emsztrendszeri megbetegedseket okoz, a Heliobacterekrl az utbbi vekben derlt ki,
hogy a gyomorfekly krokozja (Heliobacter pylori, 3.2.28. bra), amely fekly utn 6x nagyobb a
gyomorrk kialakulsnak eslye [142]. Ipari alkalmazs vagy annak lehetsge egyiknl sem ismert.

3.2.28. bra: Heliobacter pylori [178]


Alfa-proteobacterek [87]
A 16S rRNS-alap filogenetikus fn az alfa-proteobactereket 5 cluster-re osztjk. Az els a
Caulobakter-flket tartalmazza hrom tovbbi alcsoportba osztva. Ezek kzl ipari potencillal,
illetve felhasznlssal rendelkezik a Brevundimonas diminuta, amely kis mrete miatt vzszrk
hatkonysgnak tesztorganizmusa, valamint restrikcis endonuklezok (PdiI, PdmI) forrsa, korbbi
neve pedig Pseudomonas diminuta [88]. A Brevundimonas vesicularis pedig a biodegradlhat
manyagok alapanyagnak a poli-hidroxi-alkanotoknak ellltsra alkalmazhat akr frszporalap fermentciban is [89]. A msik alcsoportba tartoznak a Caulobacterek. A Caulobacter
crescentust (tpus trzs) expresszis rendszerknt hasznljk, mivel kismret fehrjket poszttranszlcis glikozilezs nlkl extracellulrisan termel [90]. Felhasznlhat haszonllatok vakcinlsra is, mivel egy klnleges S-layer kit segtsgvel a sejtek felsznn jelennek meg a klnozott
gnek gntermkei, amelyek antignek is lehetnek [91]. Egyes tengeri Cauolbacterek ers antibiotikumot (tiotropocint) termelnek, amely egyszerre gtolja a fitoplankton, algk s baktriumok nvekedst [92].
A Caulobakterek 2. csoportjba a Rhodobakter-flk tartoznak, idesorolva a Paracoccus nemzetsget is, amelynek tagjai (pl.: Paracoccus panthotrophus) felhasznlhatk poli-hidroxi-butirt (PHB,
biomanyag) ellltsra [94], astaxantin (karotinoid) elltsra (P. haeundaensis) [95]. A
Paracoccus denitrificans (korbban Micrococcus denitrificans) denitrifikl (nitrtredukl)
baktrium, teht fontos szerepe van a nitrogn-krforgalomban, s egyben a mitokondrium se, azaz
egy P. denitrificans endoszimbizisval jhetett ltre az eukaritk mitokondriuma [96]. A Rhodobacterek alkalmazsnak lehetsgre plda a Rhodobacter sphaeroides heterolg gnexpresszis
rendszere. Emellett szles kr anyagcsere- lehetsgekkel rendelkezik: noha legjobban anaerob
fotoszintzis mellett szaporodik, kpes fermentatv heterotrf anyagcserre (aerob, illetve anaerob
lgzssel is), illetve nitrognfixlsra is. A Rhodobacter capsulatus PHA- s PHB-termel kpessgt
szleskren kutatjk s fejlesztik [97]. Ugyanaezen faj a fotoszintetikus biohidrogn termelsben is
jeleskedik [98]. Szintn biotechnolgiai potencilt jelent a R. capsulatus esetben a bacteriocintermels is [99]. Kzeli rokonknt ide soroljk a Pseudorhodobactereket, Amaricoccusokat, Antarctobactereket, Leisingerkat, Octadecabactereket, is, m ezek ipari alkalmazsa jelenleg nem ismert.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

86

Ipari mikrobiolgia

A szintn idesorolt Ketogulonicigenium vulgare (3.2.29. bra) szorbz dehidrogenznak


irodalma viszonylag kiterjedt, klnsen, ha a korbbi nevn (Gluconobacter oxydans DSMz4025)
keressk. gy arra is fnyderl, hogy az egyik legrgebbi (bio)technolgia a C-vitamin- gyrts sorn
hasznlatos, amelynek kulcslpse a szorbit-szorbz talakts. Ezt ppen G.oxydans mikrobval
vgzik, amelyet 2001-ben soroltak t j taxonmiai helyre [100].

3.2.29. bra: Ketogulonicigenium vulgare


A Rhodobacter-flk kz tartoznak a Hyphomonasok, amelyek extracellulris poliszaharidokat
termelnek, s ezekkel mint ragasztval a biofilmek kpzdsben jtszanak szerepet (pl.: Hyphomonas
neptunium) [93].
Az alfaproteobacterek teljes filogenetikus fja ,szmos itt fel nem sorolt fajjal, hozzfrhet a
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/data/55/5/1907/DC1/1 cmen.
Felhasznlsi potenciljuk miatt azonban meg kell mg emlteni a nitrogn-krforgalomban
fontos szerepet jtsz alfaproteobaktereket. Az Azospirillium fajok a mezgazdasgban kerlnek
szndkosan (farmerek ltal), illetve termszetes ton felhasznlsra, mivel ezek megktik a lgkri
nitrognt, s az abbl kpzett ammnit glutamin formjban a szimbionita (haszon)nvny
gykernek tadjk, amirt cserbe az letfolyamataikhoz s a nitrognfixcihoz szksges
energiatermelskhz malonsavat (almasav) kapnak a nvnytl (heterotrf szimbizis). Ezltal
cskkenthet a felhasznlt mtrgya mennyisge.
A Nitrobacterek szintn az alfaproteobakterek kz tartoznak, s a nitrifikcirt felelnek, azaz az
ammnibl elbb nitritet, majd nitrtot lltanak el energianyers cljbl szn-dioxid fixci
kzben (kemoautotrf anyagcsere). A hvelyes nvnyek esetben ez az egymsra utaltsg
endoszimbizis formjban mgszorosabb, s ebben az esetben a Nitrobacterek legkzelebbi rokonai
a Rhizobiumok vgzik a nitrognmegktst.
A Rhizobiumok kztt tallhat meg jabban (2001) a nagy biotechnolgiai mlttal rendelkez
Agrobacterium tumefaciens [170] (3.2.30. bra), amely nvny patognknt a nvnyi gntranszfer
eszkzv vlt.

3.2.30. bra: Agrobacterium tumefaciens rpaszveten [178]


A Roseobacterek a tengeri mikrobita leggyakoribb tagjai, amelyek igen vltozatos msodlagos
anyagcseretermkekkel rendelkeznek ezrt intenzv (antibiotikum) kutatsok trgyt kpezik [101], de
tallhatak kztk denitrifiklk is (Roseobacter denitrificans) [102].
Vgl meg kell emlteni, hogy az alfaproteobacterek kztt olyan patogneket is tallunk, mint a
Rikettsik s Brucellk. Elbbiek az zeltlbak krokozi, amelyek akr tnetmentes vektorok is

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

87

lehetnek, s cspsk sorn vagy szkletkkel kerlnek t a parazitk az emberbe, ahol a hajszlereket
fertzik meg, s trombzist, szervi mkdszavart eredmnyeznek lz s kitses tnetek mellett
[103]. Mivel obliglt opportunistk, nmagukban nem tenyszhetk mestersges krnyezetben
(fermentorban), csak szveteken. A Brucellzis abortv betegsg, amely a szarvaslb nev betegsget okozza pldul teheneken, ahonnan tejjel vagy srlt brfelleten kerlhet t az emberbe, s
slyos lzas megbetegedst okoz.
A bioetanol-gyrts bakterilis jelltje a Zymomonas mobilis is alfa-proteobcter. Klnlegessge,
hogy sejtfalban hopaninsavat tartalmaz, amely az eukarita szterinekhez hasonlt. Ennek
ksznheten jl tolerlja a magas (13%) etanolkoncentrcit is. Emellett nagyobb etanolhozam s
kisebb biomassza-kpzds tapasztalhat a Z. mobilis etanolos fermentcijban [160].
Beta-proteobacterek
A Hydrogenophilaceae csald tagjai kz tartoznak a Thiobacillus nemzetsg fajai, amelyeket
biokontrollra lehet felhasznlni (pl.: T.denitrificans), mivel knporral trtn egyttes kiszrsuk utn
a krumplifldn a kenet knsavv oxidlja, melyet a krumplibogarak lrvi nem viselnek el [104]. A
Thiobacillus ferrooxidans a piriteloxidlst segti Acidophilumokkal egytt aerob krnyezetben
(respirl mikrobk). Nhny Thiobacillust 2000-ben tneveztek Acidithiobacillus, Halothiobacillus
s Thermithiobacillus nven a gammaproteobakterek kz soroltk. A Thiobacillusok igazi ipari
jelentsgt a szulfit svnyokbl trtn fmfelszabadts (=bioleachig) adja, amelyre plda az
autotrf kemolitotrf Thiobacillus ferrooxidans [105]. A Thiobacillus denitrificans klnleges
metabolikus repertorral rendelkezik: szervetlen kn- vegyletek oxidcijval vagy aerob FeIIoxidcival kapcsolja ssze a denitrifikcit (NO3->NH4+). Fakultatvan vlaszt az aerob respirci
s a denitrifikci kztt, s mezofill, illetve neutrofill hmrskleti s pH-tartomnyokban szaporodik szemben a termo- s acidofil knoxidl baktriumokkal. Az a klnleges mehanizmus, ahogy
az oldhatatlan szilrd svnyt hasznostani kpes mg pontosan nem ismert [106].
A Thiobacillusok kzvetlen rokonai a Hydrogenophilus nemzetsg tagjai, amelyek klnlegessge, hogy energiaszksgletket hidrogn oxidcijval nyerik [171].
A kvetkez csoportot az aerob, fonalas Sphaerotilusok alkotjk, tpusfajuk a Sphaerotilus
natans, ipari alkalmazsuk nem ismert.
ket kvetik a Neisserik, amelyek tipikus krokozk: Neissria gonorrhea (nemi betegsg), N.
meningitidis (agyhrtyagyullads) [107]. A Spirillumok felhasznlsrl nem ll rendelkezsre
informci, viszont a Burkholderia nemzettsg tagjai alkalmazhatk [108] a mezgazdasgban
biokontroll clokra, rhizobilis adalkknt, illetve biodegradciban, valamint xilanztermel is
tallhat kzttk [109]. A nagyobb felhasznlsi kr jobban megrthet, ha figyelembe vesszk,
hogy szinte valamennyi Burkholderia faj a Pseudomonasok jrabesorolsakor kerlt lersra, s
amelyek vizsglata nagyobb mltra tekint vissza, gy alkalmazsuk is szlesebb kr. Plda erre a
Burkholderia cepacia (3.2.31. bra) s B. gladioli, amelyek rendre a Pseudomonas cepacia s a P.
gladioli gamma-proteobacterekhez trtn tsorolsakor kerltek elszr lersra Yabouchi s
munkatrsai (1992) munkssga nyomn. Mindkt trzs lipzforrsknt hasznlatos [110].

3.2.31. bra: Burkholderia cepacia [178]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

88

Ipari mikrobiolgia

A Burkholderia rendbe tartoznak az Alcaligenaceae csald fajai is, amelyek kztt a Bordatella
pertusis, vagyis a szamrkhgs krokozja is megtallhat. Ennek biotechnolgiai jelentsge a
gyermekkori vakcina (DiPaTe, korbban DiPerTe) ellltsban s alkalmazsban van. A korbbi
DiPerTe vakcina gyakran vltott ki lzas olttsi mellkreakcikat, mita azonban a pertusis inaktivlt
sejtjei helyett antigneket alkalmaznak (acellulris azaz sejtmentes ksztmny), kevesebb a
mellkreakci. Egy msik klnleges nemzetsg az Alcaligenes, amelyeket ipari aminosav ellltsra hasznlnak, illetve az A. eutrophust PHB-termelsre is hasznljk.
Korbban szintn a Pseudomonas csaldba soroltk a Zoogloea fajokat, majd elklntettk a
tbbi obligt aerob, Gram-negatv sprtlan plciktl (=Pseudomonasok), mert sajtos zselatinszer
mtrixot kpeznek [111]. Ennek megfelelen biotechnolgiai alkalmazsra szinte kizrlag a
zoogloea gum, vagyis a klnleges extracellulris poliszaharid ellltsa esetn hasznljk e fajokat, kztk leggyakrabban a Zoogloea ramigerat.
A Ferribacterium limneticum szerves savak oxidcijval reduklja a Fe3+-t Fe2+-v [172]. Ennek
kzeli rokona szmos nitrognfixl nemzetsg (Azoarcus, Azovibrio, Azospira stb.), amelyek a
denitrifikcival egytt szmos szennyezanyag lebontst katalizljk (pl.: aroms szennyezk)
[173]. Aerob vagy anaerob heterotrf, nem-szulft-redukl, mrskelten termofildenitrifikl
baktriumok az olajmezk Petrobacter succinatimandens baktriumai, amelyek borostynksavon is
szaporodnak [174]. Klnleges fermentatv mikroba a Propionivibrio limicola), amely sem
sznhidrtokon, sem szerves savakon, de mgcsak szerves szennyez anyagokon sem kpes nni,
viszont kinik-savon s sikimik-savon propionsavat, szn-dioxidot ecetsavat termel [175]. A
Rhodocyclus nemzetsg tagkai anoxikus fototrfok, s a nevket a sejtek gyrs alakjrl kaptk,
aminek kvetkeztben a sejt kt plusa kzel kerl egymshoz [176, 177].
Gamma-proteobacterek
Fajokban meglehetsen gazdag proteobacter-csoport, amely szmos slyos betegsg (pl.: kolera)
krokozja mellett nhny biotechnolgiailag
jelents mikrobt (egyes Pseudomonas-okat,
Enterobacter-eket) is magba foglal.
A Beggiatoak nagymret (200 m!) fehr fonalas szervezetek, amelyek a nhny szintetikus
szervezet kz tartoznak. Ezek kpesek a lgkri szn-dioxidbl s a tengervzbl szervetlen
vegyletek energijnak felhasznlsval sznhidrtokat szintetizlni (autotrfok). Noha katalz
negatvak, lgkri oxign felhasznlsval heterotrf anyagcserre is kpesek, mivel az oxign okozta
nem kvnatos oxidcis folyamatokat kn segtsgvel kzmbsteni tudjk [112]. Tengeri szennyezdsek eltvoltsakor megjelennek (indiktor), s nagy mretk miatt szabad szemmel is lthatan
megjellik a szennyezst.
A msik autotrf gamma-proteobacter csoport a bborkn-baktriumok csoportja. Fotoszintziskhz nem vizet hasznlnak, mint a legtbb fotoszintetizl szervezet (cianobaktriumok, algk,
nvnyek), hanem knhidrognt, gy oxign helyett kenet szabadtanak fel [113]. Kt csaldra
oszthatak aszerint, hogy a kenet extracellulrisan (Ectothiorhodospiraceae) vagy intracellulrisan
(Chromaticeae) vlasztjk ki. A Chromaticae csald legjobban lert tagja a Thiocapsa roseopersicina,
amely ltal termelt hidrogenzenzim biotechnolgiai (biogz-termelsi) potencillal rendelkezik,
mivel a Thiocapsa alacsony nvekedsi hmrskleti optimuma (20-25C, szaki-tengeri izoltum(!))
ellenre a hidrogenza hstabil (>80C), protezoknak ellenll, s jl tolerlja az oxignt (a Thiocapsa
roseopercicina fakultatv anaerob) [114].
A gamma-proteobacterek specilis alkalmazssal br nemzettsge az Alcanivorax (pl.: A.
borkumensis, 3.2.32. bra), amely tengeri olajszennyezsek eltvoltsnl hasznosthat, amennyiben
kn s nitrogn is rendelkezsre ll [115].

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

89

3.2.32. bra: Alcanivorax borkumensis


Hasonl kpessgekkel rendelkeznek a Marinobacterek. A M. hydrocarbonoclasticus (korbban
Pseudomonas nautica) azonban mg extrm halotolerns is [117]
Hidegtr gamma-proteobacterek a Glaciecolak (pl.: G. polaris, G. agarilytica), amelyek a
sarkvidki jeges, oligotrp lhelyeken is meglnek [116].
Nagy biotechnolgiai potencilt rejt a Microbulbifer (jabban Saccharophagus) degradans
enzimkszlete, amely cellulz, algint s kitinbontsra is alkalmas enzimeket foglal magba [118].
Ezek segtsgvel a xilz- s cellulzalap etanolgyrts jelltje.
A gamma-proteobacterek kztt olyan krokozk s rokonaik is megtallhatak, mint a
Legionellak (pl.: L. pneumophila), Francisellak, Vibriok. A Legionellk hallos lgti fertzst
okoznak, s a szovjet idkben 100% mortalitsra mutltatott fajt is kifejlesztettek belle (=biolgiai
fegyver) [119]. A Francisella tularensis a tularemia krokozja, amely vadnyulakrl kerlhet
kullancsfertzs vagy vadszat kzben az emberekre, s feklyes lzzal jr, s akr
agyhrtyagyulladsba is torkollhat. Az USA-ban biolgiai fegyverknt is rendszerestettk. Tbbszr
tneveztk, elbb Bacterium tularensis, majd Pasturealla tularensisknt kerlt besorolsra [120, 121].
A patogn Vibrik ltal okozott egyik legslyosabb fertzs a kolera (Vibrio cholerae), amely
szennyezett vzzel terjed. Ugyanakkor a Vibrik fermentlnak (erjesztenek) is, illetve tetrodotoxint
termelnek (Vibrio alginolyticus), amely egy neurtoxikus (ntriumcsatorna szelektv blokkoljaknt
blokkolja az akcis potencil kialakulst) si tengeri alkaloid, s a szimbiotikus baktriumok ezzel
nyjtanak vdelmet a gazdaszervezeteiknek (hal) a ragadozk ellen, amirt cserbe bsges tpllkot
kapnak. [122].
A Vibrik klnleges rokonai a Photobacteriumok, amelyek biolumineszklnak (csakgy, mint a
szintn kzeli rokon Lucibacteriumok), azaz fnyt bocstanak ki, s szintn szimbiontk, tovbb
pszichrofilek (hidegkedvelk) s piezophilek (msnven barofilek vagy nyomskedvelk) [123]. A
Vibrio fisheri tovbbi klnlegessge, hogy csak egy adott sejtkoncentrci elrse utn bocstanak ki
a sejtek fnyt, amely koncentrcit a tengerben szabadon lve nem tudnak elrni, csak a halak
endoszimbizisban. Ehhez a szervezett vlaszreakcihoz sejt-sejt kztti kommunikci szksges
[124].

3.2.33. bra: Escherichia coli

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

90

Ipari mikrobiolgia

Ipari szempontbl taln a legjelentsebb gamma-proteobacter csoport az Enterobacterek.


Kztk olyan fajok tallhatak, mint a legtbbet vizsglt s iparszeren is alkalamzott heterolg
expresszis rendszer, az Esherichia coli, amelynek patogn fajti is lteznek (3.2.33. bra).
A glicerin 1,3-propndiol-talakts enzimeit is fleg az Enterobacteriaceae kztt (pl.:
Enterobacter, Citrobacter Klebsiella stb.) tallhatjuk meg.
Ide soroltk a mezgazdasgi jelentssggel br Erwina amylovora fajt is, amely az almaflk
tzelhalsos betegsgt okozza.
A Proteus nemzettsg tagjai igen vltozatos formban jelennek meg, ennek ksznhetik nevket
is. ltalban talajlakk s humn patognek (Proteus vulgaris, P. mirabilis, P. penneri) [125].
Taln a legismertebb humnpatogn enterobakterek a Salmonellk, kzlk is a Salmonella
enterica sp enterica alfajai, amelyek az telmrgezsek jellegzetes krokozi: typhi (hastfusz),
choleraesuis (szepszis) enteriditis (heveny gyomorronts)) [126, 127].
A Salmonellk kzeli rokonai az ltalban hgyuti fertzst okoz Serratik (pl.: Serratia
marcescens). Emellett azonban biotechnolgiai potencilt is rejtenek, mivel egy rtkes
gygyszerhatanyagot, a prodigiosint lehet velk hatkonyan ipari hulladkon ellltani. A
prodigiosin egy antifungicid, immunszupresszv s antiproliferatv pigment- molekula [128].
A Shigellak szintn kzeli, femlsket fertz rokonai a fenti enterobaktereknek [129]. A
norml blflra ecetsav s hangyasav termelsvel szortja vissza a shigellzis (S. flexnerii)
kialakulsnak lehetsgeit.
Vgl egy szintn komoly, jrvnyos megbetegeds, a pestis krokozja (Yersinia pestis) s
rokonai is az enterobakterek kz sorolandk. jabban antibiotikum (v. baktericid) termelst is
bizonytottk olyan krokozk ellen, mint pl.: Pseudomonas aeruginosa vagy Klebsiella pneumoniae,
vagy ppen Staphylococcus aureus [130].
A gamma-proteobacterek msik fontos csoportja a Pseodomonasok. A tpusnemzettsg
(Pseudomonas 3.2.34. bra) fajai a mikrobiolgia hskora ta ismertek, s szmos krokoz tartozik
kzjk (P. putida, P. aeruginosa, P. fluorescens), de olyan hasznos nemzettsgek is, mint az
Azotobacterek, Rhizobacterek, Cellvibrik.

3.2.34. bra: Pseudomonas sp.


Az Azotobacter vinelandii klnleges aerob nitrognfixl metabolizmussal rendelkezik,
amelynek nitrogenzenzimei eltrnek a szoksos (pl.: Azospirillium) molibdent kzpont mehanizmustl. letformjban is ms a megszokott nitrognfixlkhoz kpest: nem nvnyi szimbionita,
hanem szabadon l [131]. Tbb fajuk is (A. vinelandii, A. chroccocum) algint biopolimert termel, a
barna algkhoz hasonlan [132].
A Rhizobacterek a Rhizobiumokhoz hasonlan a hvelyes nvnyek gykrszveteinek endoszimbionitja, segtve a nvny nvekedst megfelel nitrogntartalm tpanyagok elltsa rvn (Nfixlk). Ugyanakkor ezeket a baktriumokat szoks Plant-Growth-Promoting-Rhizobacterinak
(PGPR-nvnyi nvekedst serkent rhizobaktereknek) nevezni, ahol a pontos tmogat mehanizmus

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

91

mg nem teljesen ismert, de valsznleg sziderofrok, fitohormonok segtsgvel s az svnyianyagfelvtellel segtik a nvny nvekedst [133].
A Cellvibrio nemzettsg fajai a nevkbl is lthatan cellulzbontk. Kztk a legintenzvebben
vizsglt faj a Cellvibrio japonicus, amelyet japn talajmintbl izolltak 1952-ben. Ennek megfelelen
klnbz a megszokottaktl valamiben eltr enzimeiket vizsgljk (arabinz [134], xilanz
[135] stb.), ezek jelents alkalmazsi potencillal rendelkeznek a bioipar szmra.
A gamma-proteobacterek kvetkez csoportja a Pasteurella-flk, ahov a humnpatogn
Haemophilus influenzae s a hzi baromfit fertz Pasteurella multocida kerlt tbbek kztt
besorolsra. Utbbi biotechnolgiai jelentsge, hogy az llattenysztk szmra vakcinaknt
inaktivlt Pasteurella-sejteket vagy azok antignjeit forgalmazzk. Hasonl a helyzet az
Actinobacillus pleuropneumoniae esetben, amely a sertsllomnyt fertzi, s vres habz szj/orr,
valamint magas lz mellett az llatok elhullst okozza [136].
A C1-metabolizmusnl mr bemutattunk olyan mikrobkat, amelyek a metanol, metn
hasznostsra kpesek. A gamma-proteobacterek ezen csoportja a Methylococcus-flk. A csoport
valamennyi nemzetsge metilotrf, metnhasznost. A nvad nemzettsg, amely a metilotrf
kutatsok kzppontjban ll nhny archeval egytt, a termofil Methylococcus capsulatus [137].
Iparilag tbb vtizede hasznlt mikrobk a gamma-proteobacterek kvetkez csoportjba sorolt
Xanthomonas-flk, kztk a Xanthomonas campestris, amellyel a szleskren (fleg azonban
lelmiszer-ipari clra) hasznostott xantn gumi fermentcis ellltst valstjk meg [141].
A jelen jegyzetben trgyalt utols gamma-proteobacter csoport a Succinivibrio-flk csoportja.
Az idesorolt Anaerobiospirillum succiniproducens okozhat megbetegedseket (baktermia) [138], de a
platformalkot borostynksav ellltsra is felhasznlhat [139]. A Succinimonas amylolytica
szintn nagy mennyisg borostynksav ellltsra kpes, kzvetlenl kemnytbl kiindulva
[140]. A nvad Succinivibrio dextrinosolvens segtsgvel heterofementatv tulajdonsgnak
ksznheten glkzalapon llthatk el borostynksav- s tejsav- stb. metabolitok.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

92

Ipari mikrobiolgia

3.2.3. bra: Az sbaktriumok csaldfja a rokonsgi tvolsgokkal (NJ/ML/MP algoritmussal is) [163]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

93

3.2.2. tblzat: Bacillusok osztlya

Bacilliales
rendje
(katalz
pozitv)

Bacillusok
csaldja

B.subtilis,
B.licheniformis,
B.thringiensis,
B.coagulans
B. antraxis

Staphylococcusok
csaldja

S. aureus

Listrik csaldja

Baktriumok
domnje

Firmicutes
trzs
(alacsony
G+C tart.)

Bacillusok
osztlya

Lactobacillusok
csaldja
Lactobacilliales
rend
(katalz
negatv)

Pediococcus
nemzetsg
Leuconostoc
nemzetsge
Strpetococcus
nemzetsge
Enterococcus
nemzetsge

Clostridiumok
osztlya
Mollicutes
osztly

Nmeth ron, BME

Lactobacillus
nemzetsg

www.tankonyvtar.hu

Listeria
monocytogenes
L. casei
L. rhamnosus
L. delbrueckii
L. helveticus
L. coryneformis
Pediococccus
acidilactici
L.
mesenteroides
S. bovis,
S. pyogenes,
S. thermophilus
E. faecalis

94

Ipari mikrobiolgia

3.2.11. bra: Az Actinobacterek csaldfja (Az NCBI taxonomia adatfile alapjn generlva)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

95

3.3. Ipari szempontbl fontos gombk


A gombk rendszertana a szaporodsi formk alapjn sorolja be a nemzetsgeket, fajokat, ezrt az
albbiakban rviden sszefoglaljuk a gombk szaporodsi folyamatait [149].

3.3.1. animci: Gombk letciklusai


A gombk ivartalan szaporodsa trtnhet sarjadzssal, hifatrssel, s ivartalan szaport
kpletek (sprk) segtsgvel, azaz sprzssal. Az letciklusuk folyamn ivaros szaporodsra is
kpesek, amely sorn egymstl idben jelentsen elvlasztva valsul meg a plazmogmia, kariogmia s a meizis (3.3.1. animci), gy a haploid dikarion s a diploid llapot is stabilan megtallhat forma. Mindhrom esetben van lehetsg ivartalan esetenknt sprs szaporodsra, amely sprk
fenotpusa meglehetsen hasonl, ezrt ugyanazon faj klnbz llapot formit (ivarosan, v.
ivartalanul szaporod) kln-kln is besoroltk a rendszertanba. Ennek kvetkezmnyeknt a
korbban elklntett ivaros (perfect) s ivartalan (imperfect) szaporods fajok kztt azonossgokra
derlt fny, azaz egy adott fajnak ltezik perfect (ms nven teleomorph) s imperfect (anamorph)
formja is (legfeljebb mg nem ismerjk). Pldul az anamorph Brettanomyces anomalus teleomorph
formja a Dekkara anomala [150].
A gombk morfolgija is igen vltozatos, ugyanazon faj klnbz llapotai morfolgijukban
is eltrnek: a Saccharomyces cerevisiae pkleszt egysejtes formban szaporodik szubmerz
krlmnyek mellett, m a krlmnyek megvltozsa esetn (szilrd tpkzeg, kevs N-forrs)
fonalas nvekedsre vlt [151].
Mindezeknek ksznheten a gombk rendszertana morfolgiai megfigyelseken alapult s nem
rokonsgi tvolsgokon, m az utbbi vtizedek teljes genomszekvenl programjainak ksznheten
fnyderlt a DNS-alap rokonsgokra, s ezek alapjn j rendszertan fellltsa kezddtt meg 2007tl, amely munka a mai napig tart.
Ezek alapjn a mg nem ltalnosan elfogadott, de legjabb rendszertan a kvetkezk szerint
alakul [153] (3.3.2. bra). A 3.3.2. brn pirossal kiemeltk az iparilag fontos gombkat tmrt
csoportokat, amelyek a kvetkezkben kerlnek trgyalsra.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

96

Ipari mikrobiolgia

3.3.2. bra: A legjabb gombarendszertan

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

97

Basidomycotak
A basidomycota-k az ascomycotkkal egytt alkotjk a Dikarya alkirlysgot, amelynek neve a stabil
dikarion llapotra utal, amelyben e kt trzs tagjai ltalban elfordulnak. A basidomycotk
legismertebb formi a kalapos gombk, amelyek felptst mutatja a 3.3.3. bra.

3.3.3. bra: Bazidomicetk felptse [154]


Nevket onnan kaptk, hogy a termtestt tmrl hifk a kalap aljn elhelyezked lemezeken
bazidiumokat nvesztenek, amelyekrl rendszerint 4-4 spra fzdik le.
A kalapos gombk ltalban az lelmiszeriparban kerlnek piacra, a biotechnolgiban ritkbban
hasznostjk ket. Az Agaricomycotina csoportjukba tartozik azonban a Ganoderma lucidum (pecstviaszgomba), amely szmos alkalmazssal s nagy lehetsgekkel rendelkezik, mivel immunerst,
vrnyomscskkent, koleszterincskkent hatsa van, tovbb javallott vesegyullads, asztma, gyomorbntalmak esetn is. jabban az AIDS s a rk ellenei kzdelemben is sikerrel alkalmazzk. A szles
kr alkalmazst a mintegy 150 fle triterpn s 50 poliszaharid molekuljnak ksznheti [155].
A pecstviaszgombhoz hasonlan a Shii Take gomba (Lentinus v. Lentinula edodes) is az
Agaricomycotak kz tartozik, s az zsiai hagyomnyok szerint fogyasztsa igen kedvez, mivel antitumor szaharidokat tartalmaz nagy mennyisgben [156].
Az Agaricus brasiliensis fenti rokonaihoz hasonl egszsgvd hatssal rendelkezik, s szoksos
biotechnolgiai mdszerekkel tenyszthet.
Tovbbi pldkat foglal ssze a 3.3.1. tblzat a kalapos gombk fermentcis (szubmerz,
bioreaktoros) felhasznlsra. Amint az a tblzatbl is lthat, a kalapos gombk fermentcijval
ellltott termkek az albbiak szerint csoportosthatk.
1) poliszaharidok
Elssorban az USA-ban, Japnban s Oroszorszgban nyerik ki vagy a termtestbl, vagy tenysztett
miclimbl, vagy a tenysztett miclium fermentlevbl. Az gy ellltott poliszaharidok antitumorhatssal rendelkeznek, azaz kemotrerpival kombinlva akadlyozzk a rk elrehaladst, s
cskkentik az tttek kialakulsnak eslyt. Nem kzvetlen hatst fejtenek ki, hanem a T-sejtes
immunvlaszt stimulljk ezek a poliszaharidok. Szerkezetket tekintve ltalban (1-3) kapcsolds
glknok, 1-6 elgazssal, ami szksges az antitumorlis hats kivltshoz. A nagy molekulatmegek hatkonyabbak a kisebbeknl. Kereskedelmi forgalomban kaphat a lentinn (Lentinus
edodes), PoliSzaharidKrestin (PSK) (Ganoderma lucidum) s a schizophyllan (Schizophyllum
commune).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

98

Ipari mikrobiolgia

2) terpenoidok
A terpenoidok izoprnszrmazkok. Nevket a terpnrl kaptk, amely tulajdonkppen izoprn dimer.
A(z) (bio) izoprn j perspektvkat kapott az utbbi vtizedben, mivel a hagyomnyos
kolajkrakkols mellett rekombinns technikval biolgiailag is elllthat polimerizcis s
zemanyagclra is [158]! Mivel biolgiailag elllthat, megjul nyersanyagokbl is lehet gyrtani,
s platformvegylet, teht szrmazkait egyszer, konvencionlis mdszerekkel lehet szintn
ellltani. Ha megfelel technolgival olcsn el lehet lltani, zemanyagclra is kivl lehet, mert
magasabb energiatartalommal br mind a dzelolajnl, mind a benzinnl. A polimer- s zemanyagcl
felhasznlsn kvl is nagy volumen alkalmazsnak rvend a gumiipar elasztomerjei, illetve a
ragasztk krben.
Az izoprnszrmazk terpenoidokat a sznlnc hossza s az azzal arnyos fizikai tulajdonsgaik
alapjn csoportostjk: illkony mono s szeszkviterpnek (sesquiterpenoids, C10-15, esszencilis
olajok), kevsb illkony triterpnek (C20), nem illkony terpenoidok s szterolok (C30), illetve
karotenoid pigmentek (C40). A pecstviaszgomba (Ganoderma lucidum) ltal termelt terpneket
szintn ebben a csoportostsban trgyaljuk. A ganodermasav A, B, C1, s C2 molekuli az emberi
mjsejtek nvekedst gtoljk, illetve antioxidnsknt vdik az eritrocitkat s a mjsejteket. A
termtest tbbi triterpnjvel egytt (ganoderiol B, ganodermanontriol) Anti-HIV1 s Anti-HIV1protez aktivitsak (elbbi a burokfehrje ktdsnek gtlst, utbbi pedig a virion fehrje
proteolitikus aktivlsnak gtlst jelenti). A diterpnek kztt a ciatnokat amelyek nevket a
Cyathus helenae madrtollrl izollt parazita gombrl kaptk szmos gomba termtestjbl
kimutattk, a sphaeroane tpusak pedig algkban is elfordulnak. Idetartozik mg a Drosophyla
subatratbl ellltott antimikrobilis hats tintinnadiol. A diterpnekre ltalban is jellemz, hogy
antimikrobilis hatsak, idegsejt-nvekedsi faktort induklnak (NGF), s opioid receptor agonsitk,
aminek a fjdalomcsillaptsban van szerepe. A szeszkviterpenoidok s monoterpenoidok szintn NGF
induktorok, inszekticidek s nematicidek.
3) ergoszterol
Az ergoszterol a D-vitamin prekurzora, UV hatsra kortizon s progeszteron keletkezik belle. A
gombknl a funkcija, hogy a sejtmembrn rszeknt segtse az integritst s a membrn fehrjk
aktivitst, illetve a sejt energiahztartst. A kereskedelmi forgalomba kerl termkeket lesztbl
vagy hulladkmiclium extrakcijval lltjk el.
4) ceramid
Kozmetikumokban nedvest gensknt alkalmazzk, de trend-kiegsztnek is kitn (lelmiszeripar), mivel immunerst, rkmegelz hatst is tulajdontanak neki.
A bazidomicetk (magasabb rend gombk) fermentcijnak clja, hogy a termtestekben
megtallhat rtkes anyagokat hatkonyan lltsk el. Ehhez ltalban talajtenyszeteket alkalmaznak, ami azonban 60-70 napig is eltart, s kevss kontrolllt. A szubmerz fermentci fonalas
gombk esetn (kalapos!) a megnveked viszkozits miatt nehzsgekbe tkzik, mert oxigntadsi
problmk s magasabb nyrer lp fel.
A Ganoderma lucidum esetn 50 g/L alatti (szubsztrt inhibci miatt) laktzzal vagy szaharzzal
vgzik a szekundermetabolit- (termk)ellltst, amely sznforrsok azonban a nvekedsnek nem
kedveznek. Ekzben az oldott oxign szintjt 20-30% krl clszer tartani, s gy a vgs sejt szrazanyagtartalom 22 g/L, az elrhet EPS(extracellulris-poliszaharid) 0,87 g/L, IPS (intracellulrispoliszaharid) 2,5 g/L, amely mellett mintegy 300 mg/L GA (ganodermasav) keletkezik. Az optimlis
Kla rtkt 781/h-ban llaptottk meg. A 10% krli oxignszint az aggregtumokban oxignlimithez
vezet, ami kisebb mrtk biomassza-kpzdst, m magasabb EPS-, IPS-, GA- koncentrcikat
eredmnyez gyenge produktivitssal. Mr 20% oxignszintnl mindez megfordul. A nyrer hatst
0,5-1 m/s cscssebessg tartomnyban rtk le, s megllaptottk, hogy a pelletmret gyorsabban n
az alacsonyabb kevers esetn, s ez az IPS-kpzdsnek kedvez, mg a magasabb keversebessg
hatsra a vgs sejt-szrazanyagtartalom (teht a biomasszahozam is) lecskent (14->10 g/L-re).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve

99

3.3.1. tblzat: Kalapos gombk fermentcis felhasznlsa [157]


Gomba
Agaricus brasiliensis

Termk
Poliszaharid
Ergosterol

Agrocybe cylindracea

Extracellulris
poliszaharid (EPS)
__________EPS_______
Poliszaharid
Teljes polifenol
tiszta triterpenoid

Antrodia camphorata

Auricularia polytricha
Collibybia maculate
Cordyceps militaris

Exobiopolimer
EPS
Cordycepin

Cordyceps sinensis

Cordycepin
Adenozin

Grifola frondosa

EPS

Inonotus obliquus

Exopolimer
Endopoliszaharid s EPS

Phellinus sp

EPS

Sarcodon aspratus

EPS

Schizophyllum
commune

Almasa (L-malonsav)

Lptk
5 L kevert reaktor, 2
db 6 lapt
turbinakevervel
3 L/5 L fermentci

Eredmny
1,67 g/L
25 mg/g sz.a.

_5 L BBraun
fermentor__

_______148
mg/L______
23,3% hozam
71 mg/g
108 mg/g
3,1 g/L
3,94 g/L
188,3 mg/L

350/500 L fermentor
3L/5 L fermentor
3L/5 L fermentor
21/30 L centrifugl
kever

3g/L

3L/5 L fermentor
5 L kevert reaktor
5 L air lift reaktor
15 L BBraun reaktor
300 L kevert
bioreaktor
3 L/5 L kevert
fermentor
3L/5 L kevert
fermentor
10/12 L
buborlkkolonna
7,2/8 L hurokreaktor
5 L airlift

5,3 g/L
4,53 g/L
1,252 g/L
0,495 g/L
3,59-5,3 g/L
2,68 g/L
Y<20%
Y>40%
3,05 g/L

Ascomycotak
Az Ascomycota osztly nevt a szaporods kzben kpzd aszkusz utn kapta (magyarul: tml, azaz
tmlsgombk, 3.3.4. bra.)
Az aszkuszos gombk esetben a dikarion llapot rvid ideig tart, gy nincs dikarion llapotban
ivartalan szaporodsuk. Az ivartalan szaporods sorn a hifn kpzdik konidiumtart, abban
konidiospra, amely mitzissal keletkezik, gy mitosprnak is hvjk. Ha azonban 2 heterotallikus
(azaz klnbz ivar) hifa vge sszeolvad (plazmogmia), ltrejn a dikarion, amelyben a magok
elbb mitzissal osztdnak, kivlasztdik az anyasejt, s a magok egyeslnek (kariogmia), ami
diploid llapothoz vezet, majd elbb meizissal, majd mitzissal osztdnak, s elrendezdnek a
tmlben, mg kialakul a jellemz 8 haploid aszkospra a tmlben.
A legtbb iparilag is hasznlt gomba az aszkuszos gombk kz tartozik.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

100

Ipari mikrobiolgia

3.3.4. bra: Aszkuszos gombk sprakpzse [159]


Az Aspergillusokat (pl.: A. niger) s Penicilliumokat (pl.: P. notatum) szleskren alkalmazzk
vtizedek ta. Az elbbieket a citromsavgyrtsra az utbbiakat antibiotikum-termelsre hasznljk.
A Pichik klnleges lebont enzimekkel rendelkeznek (P. stipitis: xilanzok), s a P. pastoris
mg metilotrf is, valamint kivl gazdaszervezet heterolg fehrjk kifejeztetsre (expresszis
rendszer).
Itt tallhat a kenyrstshez s az alkoholgyrtshoz hasznlatos pkleszt (Saccharomyces
cerevisiae, 3.3.5. vide). Az idesorolt candida fajok ltalban megtallhatk a norml humn flrban,
de opportunista patognekis.

3.3.5. vide: leszttenyszet


Zygomycotak
A zygomicetk esetben csak a haploid alak kpes ivartalanul sprkkal szaporodni (konidiosprk).
A 3.3.2. brn lthat, hogy a rendszertani csoportjuk ipari alkalmazssal br tagjai a Mucor s
Rhizopus nemzetsgek. A 3.3.6. videomikroszkpos felvtelen mutatja be a Rhizopus oryzae
micliumt, konidiumait s konidiosprit.

3.3.6. vide: Fonalas gomba sporangium


Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve 101

3.4. Iparilag jelents algk


Az alga mint gyjtnv nem fed rendszertani kategrit. A prokaritk kzl a cianobaktriumok
tartoznak a mikroalgk kz, illetve az eukaritk kztt mikro- s makroalgkat is tallunk. Elbbiek
lebegnek a vzben, utbbiak tbbmteresre is megnvn szilrd aljzathoz rgzlnek.
Algasajtossgok kz tartozik a fotoszintetikus kpessg, valamint a fotoszintetikus s segdpigmentek. Kzs tulajdonsguk tovbb az egysejt letforma, de klnbz szervezds szinten
llnak az egyes algk (fonalas, telepes stb.). A klnbz pigmentek kzs proplasztiszbl fejldnek
ki a krnyezeti ignyeknek megfelelen (algasejt genomja szablyozza), ugyanakkor sajt DNS-k is
van. Megklnbztetnek kloroplasziszt, amiloplasztot, elaioplasztot (olaj), etioplasztot s kromoplasztot.
Rendszerezsk szintn sokig morfolgiai alapon trtnt (fotoszintetikus pigmentek sszettele,
tartalktpanyagok, sejtfal szerkezete, ostorok szerkezete s elrendezdse, szemfolt), napjainkban
azonban itt is a DNS-alap jrarendszerezs zajlik.
Ipari alkalmazsra a cianobacterek kzl (prokarita algk) a mr emltett Spirullina (pl.:
Spirullina maxima) fajok alkalmasak, rszben funkcionlis lelmiszerknt, rszben a biodzeltechnolgia nyersanyagnak, a lipideknek (nvnyolaj) termeljeknt.

3.4.1. bra: Vrs alga [178]


Az eukarita algk iparilag is alkalmazott nemzetsge a Chlorella (pl.: Chlorella vulgaris). A
Glaucophytk, amelyek iparilag kevss jelentsek, a bizonytkai a kloroplaszt endoszimbizissal
magyarzott eredetnek, mivel bennk a kloroplaszt mg a fagocitzisos membrnnal is hatrolt, gy
jelentsgk nem ipari, hanem evolcitrtneti.
A Rhodopytk (vrs algk, 3.4.1. bra), mr rendelkeznek ipari felhasznlssal is, pldul az
agar-agart bellk (Gellidium amansi) nyerik ki. Karragnek gyrtsra hasznljk a Chondrus
crispust, r moszatot. A klasszikus zld algk a felszn kzelben szeretnek lebegni, ezrt klnbz
felletnagyobbt kpletet alaktottak ki, amitl igen vltozatos morfolgia jellemzi ket. A
Chlorophyta szintn zld moszatokat takar, amelyek tmlsgombkkal zuzmt kpeznek.
Klnleges jelensg a grgdinnyeh, amikor enyhn rzsaszn foltok jelenek meg a hban a
lbnyomokban. A havon lni (Chlamydomonas nivalis) csak klnleges lipidekbl ll membrnnal
lehet, amely folykonyabb hidegben, mint melegben. A rzsaszn pigmenteket az UV sugrzs
kiszrsre termelik.
Astaxantin termelsre lehetne hasznlni a Haematococcus pluvialis fajt, amely szaporodsi
fzisban zld szn, astaxantin termelsekor pedig vrses.
A Botriococcus braunii olaj temelse miatt biozemanyag-gyrtsra lesz felhasznlhat. Ezt
manapsg ktfle rendszerben lehet megoldani: vagy nyitott medenckben, kiszolgltatva az
idjrsnak, vagy zrt fotobioreaktorokban.
Jelenleg mg kevs alkalmazssal rendelkenek az igen fejlett csillrkamoszatok (Charophyta). A
srgs s barns mosztaok (Ascophyllum nodosum) viszont algint ellltsra hasznlhatk. Vgl az
Euglenidek azaz ostoros moszatok (Euglenia viridis) a vzvirgzs leggyakoribb okozi.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

102

Ipari mikrobiolgia

3.5. Vegyes tenyszetek alkalmazsa


A bioszfra minden rszn trsulsok formjban lnek a mikroorganizmusok, s az eddig trgyalt
alkalmazsokhoz a mikrobilgusok/biotechnolgusok erfesztsek rn jutnak el a szntenyszethez.
Egyes specilis felhasznlsok esetn ltalban olyankor, amikor mr van egy specializldott
vegyes tenyszet clszerbb a vegyes mikrobapopulcik hasznlata. Ilyen esetre plda a talajremedici, bioenergia s zldkmia egyes terletei, szennyvzkezels, illetve a klnbz lelmiszeripari termkek.
A bioremedici sorn ex situ vagy in situ tvoltjk el a talajt rt szennyezseket azok
lebontsval vagy kevsb toxikus formba alaktssal. A talajok rendelkeznek (a helyi mikrobitnak
ksznheten) ntisztulssal, m ez igen lass folyamat, amelyet optimlis krlmnyek megteremtsvel, esetleg hatkonyabb mikroba (vagy ms llny) kijuttatsval fel lehet gyorstani.
A bioremedicira Pseudomonas, Acinetobacter, Citrobacter, Flavobacterium vagy Chromobacter trzseket, illetve ezek keverkt szoks alkalmazni, mikzben biztostjk a megfelel
levegztetst, N- s P-forrsokat. Cr(VI) detoxifikcijra, redukcijra, akkumulcijra kpes az
Arthrobacter oxydans. Klnsen jelents az urn foszfor komplex formjban trtn megktse,
amelyet klnbz Citrobacter fajok (C. frendii, C. koseri) kpesek elvgezni. Az Acinetobacterek az
aroms sznhidrognek lebontsra kpesek.
A bioremedicik sorn gyakran alkalmaznak kometabolizmust. gy a sokig bonthatatlannak hitt
anyagok is biodegradlhatak. Ilyenkor ltalban nem tudjk a mikrobk energiatermelsre hasznlni
a bontand xenobiotkumot (krnyezetidegen anyag), ezrt energiahordoz szubsztrtot kell a
szennyezett terletre kijuttatni.
A zldenergia/vegyipar terletn MCB (mixed culture biotechnology) alkalmazsra is van
lehetsg, mivel olyan elnykkel rendelkeznek, mint sterilizls nlkli termels, j alkalmazkodkpessg, vegyes szubsztrtok hasznostsa s folyamatosthat eljrs.
A biogz termels olyan tbblpcss folyamat, ahol clszer lehet az MCB-alkalmazs, mivel az
egyes lpcsket (szubsztrt hidrolzise primer metabolitokig, acetogenezis (H2+CO2ecetsav), illetve
metanogenezis (H2+CO2=>metn (biogz) <=ecetsav)) ms-ms mikroba tudja ugyanazon
krlmnyek mellett leghatkonyabban vghez vinni. A kulcslps a metn (biogz) kibocstsa,
amely metanogenesisben sbaktriumok is rszt vehetnek, mint pldul a Methanococcus jannashi s
Methanosarcina acetivorans.
Az eleveniszapos szennyvztisztts sorn szintn inhomogn kevert kultra vgzi a szennyezsek
eltvoltst. Ezek kztt tallhat habkpz Nocardia sp s Microthrix parvicella is. Technolgiai
szempontbl knyes a populci egyenslya, mert ha a fonalas mikrobk szaporodnak el, amelyek
nylkt is kpeznek, akkor megvltoznak az lepedsi tulajdonsgok, s kimosdhatnak a mikrobk.
Ostorosok, ambk is rszt vesznek a tiszttsban, valamint zskmnybaktriumok elfogyasztsban.
Fmszennyezdsek eltvoltsa esetn Klebsiell,a Pseudomonas, Zooglea s Penicillium
nemzetsgek alkalmasak, vagy felleti adszorpcival, vagy citoplazms felvtellel, olykor illkony
formba alaktssal, vagy komplexlt kicsapssal.
Az lelmiszeriparban szintn gyakran lehet vegyes mikrobatenyszetekkel tallkozni. Ezek
jelenlte lehet elnys (fermentlt lelmiszerek), de akr htrnyos (lelmiszerek romlsa) is. Utbbi
oka, hogy az emberi fogyasztsra sznt lelmiszerek a mikrobk szmra is idelis tpkzegek, ezrt
az lelmiszerek kzvett szerepet jtszhatnak a patogn mikrobk terjesztsben is. Egyes mikrobk
jelenlte az lelmiszereken toxintermelsk miatt fokozott veszlyforrs. A romlst okoz mikrobk
jelenlte anyagcseretermkeik folytn jellegzetes szag- s zanyagokat eredmnyez.
Ugyanakkor szintn bizonyos (kellemes) szag- s z anyagok elrse rdekben fogyasztunk
fermentlt lelmiszereket is. Ilyen eljrsok a savanytsok (kposzta, aludtej stb.), alkoholos
erjedsek (szeszes italok), egyes pclevek alkalmazsa (szalmi, sonka), illetve rlelsi eljrsok,
pldul sajtok esetn.
Az ALKOHOLOS ERJEDSEK egyik legrgebben kiaknzott folyamata a borok ksztse.
Ezeket az alkoholos erjedseket a szlbogyrl a mustba kerl vadlesztk keverke okozza, kztk
apiculatus lesztk (Kloeckera apiculata, Hanseniaspora sp., Brettanomyces sp.), virglesztk
(Candida sp., Pichia sp.) s nylkalesztk (Debaromyces sp., Rhodotorula sp.). A vadlesztk arnya
s aktivitsa vrl vre vltoz lehet, gy nem lehetne mindig ugyanolyan kivl minsget ellltani,

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve 103

ezrt a nagyobb mrkk a vadlesztket visszaszortjk (knessav, szeparls, esetleg pasztrzssel),


s sajt oltkultrt (gyakran szntenyszetet) alkalmaznak, amelyek kztt a Saccharomyces fajok
dominlnak. Klnleges folyamat az aszsods a boroknl, amelyet a nemes rothaszt Botrytis cinerea
vgez gy, hogy a bogy behlzsval jelents vzvesztesget okoz. rdekessg, hogy a
nemkvnatos szrkerothadst is ugyanez a mikroba okozza.
A hsipari PCLEVEK alkalmazsakor ltalban nitrtos pclevet alkalmaznak (NaCl+KNO3),
amelyekben egyrszt kedvez tejsavbaktriumok (Lactobacillusok), msrszt nitrtbont mikrobk
szaporodtak el. A minsgi kvetelmnyeknek ksznheten a napjainkban mkd nagyzemek
starter kultrkat hasznlnak a spontn folyamatok helyett.
A SAVANYTS-ok egyik f lelmiszer-ipari terlete a tejtermkek gyrtsa. A frissen fejt
tejben idelis esetben 103-104 db/ml lcsra tallhat, amelyek kztt sem patognek, sem enterlis
mikrobk nem lehetnek. A norml tejflra (Micrococcusok, Lactobacillusok, Streptococcusok) a
fejskor az llat kltakarjrl s a levegbl kerlhet a tejbe, mivel a mirigyllomnyban steril tej
kpzdik. A savanytsrt a tejsavbaktriumok felelnek (ld. Firmicutes, C3-metabolizmus) Az
aludtejet a Streptococcus lactis (v. jabban Lactococcus) alvasztja meg, a S. lactis spp aromaticust
pedig acetoin s ms zanyagok termelse miatt vajkutlrkban alkalmazzk. A S. cremoris a tejfl
jellegzetes tejsavbaktriuma. Magasabb hmrsklet rlelseknl (sajtok, joghurtok) S. thermophilus
trzset hasznlnak kevert kultrban (pl.: sajt: Lactobacillus lactis vagy joghurtok esetben
Lactobacillus bulgaricusszal). A tejtermkek mikrobiotjt foglalja ssze a 3.5.1. tblzat.
3.5.1. tblzat: Tejtermkek mikrobiotja

Megnevezs

Mikrobk

Vajkultra
Str. lactis
Str. cremoris
Str. diacetilactis
Leuc. citrovorum

Joghurtkultra

Kefrkultra

Str. thermophilus
Lb. bulgaricus

Str. lactis
Str. cremoris
Lb. casei
Lb. caucasicus
Saccharomyces fragilis
Torula kefyr

Tenysztsi T

20-25 oC

42-45 oC

18-22 oC

Alvadsi id

12-18 ra

2-3 ra

14-20 ra

Kultra savfoka

36-38 SHo

40-45 SHo

38-40 SHo

Felhasznlsi
terlet

aludttej, tejfl

joghurt

kefr

3.6. A vakcinagyrts mikrobiolgija


A krokozkkal val tallkozs tlnyomrszt a gasztroenterlis s a lgzszervi szveteket rinti,
amelyek egszsges llnyekben tlagos fertz csraszm mellet kpesek megvdeni a szervezetet
egy fertzs kialakulstl. Ha azonban valamilyen legyenglt llapot vagy srls kvetkeztben a
szervezet ms, bels rszeibe kerlnek mikrobk, azaz az els vdelmi vonal, a kltakar mg, akkor
a msodik vdelmi vonal a vrrammal mindenhol jelen lv immunrendszer veszi fel a kzdelmet a
krokozval szemben. Az immunrendszer egyik rszt rklik az egyedek (veleszletett), a msik
rszt pedig az tesett fertzsek sorn szerzik be (adaptv immunrendszer). Az elbbit makrofgok,
granulocitk, natural-killer (NK) sejtek s B-sejtes limfocitk, utbit T s B-sejtes limfocitk
alkotjk. Az immunvlasz alapja, hogy a bekerlt krokoz egy specilis, csak r jellemz molekuljt

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

104

Ipari mikrobiolgia

(antignek: sejtfelszni fehrje, liposzaharid stb.) rzkelik az immunrendszer fehrvrsejtjei, s


aspecifikus mdon megprbljk likvidni, vagy legalbb izollni a fertzst, amg a specifikus
vlasszal elkszl a szervezet. A specifikus vlaszt antitesttermels formjban valstja meg az
immunrendszer.
A krokozk elleni vdelem lehet passzv, ha ksz antitesteket juttatnak be az oltanyaggal, illetve
aktv, ha az antitesteket hordoz genst (ellt, elgyengtett, inaktivlt sejt vagy csak az antign fehrje)
juttatjk be az lszervezetbe. Az utbbi megolds hossz tvon hatkonyabb, mert az rzkelt
antignre a szervezet sajt maga tanulja meg az antitest ellltst, gy brmikor jra el tudja lltani,
s egy esetleges jrafertzdst gyorsan kikszblni. Az immunrendszer kt rszt a 3.6.1. tblzat
hasonltja ssze.
3.6.1. tblzat Az immunrendszer felptse

Funkci

evolcis httr:
antignspecifits
elzetes aktivls
reakci
memria

Emls immunrendszere
Adaptv (szerzett)
Veleszletett
A vdelem els vonala,
A vdelem msodik vonala
fleg: patogn rzkels
fleg: patogn eltvoltsa,
(Antign feldolgozsa,
antign eltvoltsa a
prezentlsa, az adaptv vlasz
veleszletett rendszer
indukcija)
segtsgvel
mellesleg: patogn eltvoltsa
mellesleg: patogn felismers
si, konzervatv
fiatalabb
kevss specifikus
nagyon specifikus
nem szksges
szksges
azonnali
ksleltetett
nincs
van

A magyarorszgi ktelez vdoltsokat a 3.6.2. tblzat foglalja ssze.


3.6.2. tblzat: A magyarorszgi ktelez vdoltsok
Beadand
kor

vakcina
neve

betegsg

krokoz

baktrium
/vrus

0-6 ht

BCG

gmkr, tuberkulzis

Bacillus Calmette-Gurin
Mycobacterium tuberculosis

baktrium

Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus

bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus

Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus

bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus

Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus

bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus

2 hnap

DTPa
+Hib
+IPV

3 hnap

DTPa
+Hib
+IPV

4 hnap

DTPa
+Hib
+IPV

Nmeth ron, BME

torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus

www.tankonyvtar.hu

3. Az ipari mikroorganizmusok s technolgik trgyalsa trzsrendszertanba illesztve 105

15 hnap

MMR I.

18 hnap

DTPa
+Hib
+IPV

6 v

DTPa
+IPV

11 v

DT

11 v
14 v

MMR
revakcinci

Hepatitis B

kanyar (morbili)
mumpsz (paroitis)
rzsahiml (rubeola)
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
kanyar (morbili)
mumpsz (paroitis)
rzsahiml (rubeola)
mjgyullads

Morbili virus (Paramyxo)


Mumps vrus
Measles virus (Paramyxo)

vrus
vrus
vrus

Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus

bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus

Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
polio vrus

bakt.
bakt.
bakt.
vrus

Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Morbili virus (Paramyxo)
Mumps vrus
Measles virus (Paramyxo)
Hepatitis B virus

bakt.
bakt.
vrus
vrus
vrus
vrus

Az aktv immunizlskor alkalmazott vakcink ksztsekor nagyon fontos, hogy a krokoz


megfelel molekulja kerljn kivlasztsra s alkalmazsra. Ugyanazon faj klnbz geogrfiai
elfordulsai is hordozhatnak klnbz antign molekulkat, ezrt klnbz szerotpusokba szoks
sorolni a klnbz antignekkel rendelkez, de azonos fajhoz tartoz krokozkat.
A szerotpus-meghatrozs azonban nem olyan hierarchikus, mint a taxonmia, mert pldul
aVibrio cholerae estben 139 klnbz szerotpus sejtvonal kzl csak 2 termelt enterotoxint (ezek
az igazn problms krokozk). Ugyanakkor az Actinobacillus pleuropneumoniae esetben 15
szerotpust talltak, amelyek 4-fle toxint termelnek klnbz elosztsban. A 15-s szerotpus
lipopoliszaharidjnak O antignje kzs a 3-as s 8-as szerotpusval, teht rszleges keresztvdettsget lehet elrni. Mivel az Actinobacillus pleuropneumoniae toxin (Apx) esetben a IV-es
toxint valamennyi szerotpus termelte, ennek vakcinkban trtn alkalmazs indokolt. Megvizsglva,
hogy milyen vdettsget biztost az Apx IV vakcina, azt tapasztaltk, hogy 100%-os vdettsget
eredmnyezett (a baktrium hasznlata 80% krli vdettsget okozott), ugyanakkor a garatmandula
kolonizcijt nem tudta megakadlyozni, ami tovbbfertzs lehetsgt rejti magban. Ha a toxin
helyett kapszulris (tok) poliszaharidok kerltek kiprblsra, csak 70%-os vdettsg alakult ki, ami a
lipopoliszaharidok esetben tovbb cskkent. Ezek alapjn belthat, hogy milyen krltekinten kell
kivlasztani a vakcinlshoz megfelel stratgit.
Az oltanyagokat szoks csoportostani a hatanyaguk szerint. gy lteznek holt anyagot
tartalmazk (ellt sejt/vrus, inaktivlt toxin, transzgenikus/szintetikus antign), l, azaz attenult
(passzlt vagy genetikailag delcis mutns), l vektoros (l vektor pl.: norml flra tagjai, gymint
Lactobacillus sp termeli a szksges antignt a vdend szervezetben), immunkomplex (antitesthez
kttt krokoz, gyors kolonizci akadlyozva).
Az oltanyagok lehetnek n. subunit vakcink, amelyekben a krokoz antigntartalm rszt
hasznljk csupn fel. ltalban egyre gyakoribb a transzgnikus subunit oltanyagok alkalmazsa.
Konjuglt oltanyagokat ksztenek akkor, ha az antign nagyon gyenge immunvlasz kivltsra
kpes csupn. Ilyenkor ers vlaszt kivlt komponensekhez ktik (pl.:Streptococcus pneumoniae
szerotpus specifikus poliszaharidokat diftriatoxinhoz ktve alkalmazzk).
A vakcinagyrts egyik nagy kihvsa a krokozk ellltsa, a msik pedig azok megbzhat
inaktivlsa. Ez utbbira szoks kemiklikat (pl.: formaldehid) vagy fiziko-kmiai kezelseket (sugr, -sugr), esetleg molekulris biolgiai mdszereket alkalmazni (pl.: induklhat fg gnek
bevitelvel lzist idznek el).

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

106

4.

Ipari mikrobiolgia

A MIKROORGANIZMUSOK IPARI
FELHASZNLSNAK ETIKAI S KOCKZATI
KRDSEI

A biolgiai gensek hasznlatnak kockzata kt nagy terletre oszthat: 1) patogn mikrobkkal val
munkavgzs (elssorban egszsggyi s egyes kutatlaboratriumok esetben), 2) rekombinns
llnyek hasznlatval kapcsolatos kockzatok. Elbbi esetben kzvetlen egszsgkrost
kockzatrl beszlnk, mg a transzgenikus szervezetek (GMO) alkalmazsakor a kzvetett
(kolgiai) kockzat dominl. A kockzatok felmrse s minimlisra cskkentse mellett mindkt
terlet szmos etikai krdst is felvet (fertztt humn mintk kezelse, megbzhat GMO termel
farmerek stb.).
ltalnosan elfogadott az az elv, hogy minden mikroorganizmust potencilis patognknt kell
kezelni. Ennek oka az, hogy mg a legrtalmatlanabb ehet mikrobk is a vrbe kerlve szepszist
okozhatnak. A mikrobkat az Egszsggyi Vilgszervezet (WHO) 4 Biosafety Class-be (BsC Level
1-4) sorolta, s a besorolst kln-kln fellltottk a vrusokra, gombkra s a baktriumokra is. Az
1-es szint mikrobk kz az lelmiszer-ipari mikrobk s a normlflra mikrobi tartoznak
(Lactobacillu-sok, influenzavakcina), a 2-es szint mikrobk (Clostridium tetani, Candida albicans,
Hepatitis) mr patognek, de hatkony vdekezsi eszkz van ellenk, illetve nem terjednek
jrvnyszeren; a 3-as jelzs mikrobk (Bacillus anthracis, Paracoccoidioides brasilensis, HIV) mr
komoly megbetegedst okozhatnak, s terjedni is kpesek, de a jrvny hatkonyan megelzhet. A 4.
szintre sorolt mikrobk (Myoplasma mycoides, Ebola vrus) a legveszlyesebbek, mivel
gygythatatlan betegsget okoznak, s jrvnyszeren terjednek. A besorolsbl rgtn kitnik, hogy
idrl idre fell kell vizsglni a besorolst, mivel a tudomnyos ismertek bvlsvel elfordulhat,
hogy a korbban kezelhetetlennek mondott betegsg ellen idkzben kidolgoztak hatkony
vdekezst. Tipikus plda erre a HIV vrus, amely ma mr nem a legveszlyesebb 4., hanem a 3.
osztlyba tartozik.
A mikrobk kockzatval prhuzamosan a velk dolgoz laboratrimokat is hasonl elvek alapjn
osztlyokba soroljk. A 4.1.1. tblzatban a javasolt s elrt kockzatcskkent feltteleket foglaltuk
ssze.
4.1.1. tblzat: A klnbz BsC szintre sorolt laboratriumokkal szembeni kvetelmnyek
BsC szint:
labor izollsa
hermetikus
lezrs lehetsge
szellztets be
szellztets az
plet
rendszervel
szellztets
elklntve
kimen HEPAszr
duplaajts bejrat
(zsilip)
lgzrzuhany
eltr, ltz
eltr zuhannyal
elfoly anyagok
kezelse

Nmeth ron, BME

1.
-

2.
-

3.
~

4.
+

+
~

+
-

www.tankonyvtar.hu

4. A mikroorganizmusok ipari felhasznlsnak etikai s kockzati krdsei

107

A laboratriumok msodik vdelmi vonalknt mkdnek, feladatuk a krnyezet megvsa a


kockzatot jelent llnyek kijutstl. Az els vdelmi vonal a steril flke vagy a biztonsgi flke,
mivel ezek vannak legkzelebb a veszlyforrshoz. Elbbi feladata, hogy a steril munkavgzst
lehetv tegye, azaz a munkaanyag befertzdst megakadlyozza. A biztonsgi flke mr nemcsak
az anyagot vdi, hanem fleg a felhasznlt. A 2. vdelmi vonalhoz hasonlan a laminris flkket is
osztlyokba soroljk, amely besorols nagyjbl korrell a mikrobkkal: I.o. flkben csak BsC1
mikrobval szabad dolgozni, a II.o. (fleg II/A2-tl felfel) flke mr alkalmas a BsC2 s 3. mikrobk
kezelsre, a III.o.-ba mr csak biztonsgi flkk vannak, amelyek BsC3 s 4 mikrobk kezelsre
alkalmasak.
Az ipari mikrobiolgia szempontjbl a patogn mikrobkra vonatkoz elrsok kevsb
mrtkadnak tnhetnek, mivel a vakcinagyrtson kvl ritkn (vagy egyltaln nem) hasznlnak
virulens patogn mikrobkat termelsi clra. Ugyanakkor az egyre nagyobb mretekben megvalsul
transzgenikus mikrobt alkalmaz technolgik esetre nagyon hasonl elrsok vonatkoznak szmos
megfontols miatt.
A gnmdosts terjedsvel a GMO (gnmdostott organizmusok) llnyek szma s
mennyisge dinamikusan n. Igaz ez a haszonnvnyekre is, ahol a GMO nvnyekkel szemben taln
a legnagyobb a trsadalmi ellenlls, annak ellenre, hogy a korbbi nemestsi eljrsok szintn j
gnllomny haszonnvnyeket eredmnyeztek, a pontos genetikai vltozsok ismerete nlkl. Ezzel
szemben a transzgenikus nvnyek ltrehozsakor pontosan ismert gntvitelt valstanak meg egy
adott kedvez tulajdonsg megjelensnek rdekben. Meg kell azonban jegyezni azt is, hogy mg a
nemests sorn csak fajon belli (esetleg rokon fajok kztti) visszakeresztezs (=nemests)
trtnhetett, a modern technolgia egszen tvoli llnyek kztti gntranszfert is lehetv tesz (pl.:
hidegtolerancia gn az szaki-tengeri lepnyhalbl bzba), amely miatt a szokatlan gnek
klcsnhatsnak eredmnyekppen akr vratlan (esetleg kros) folyamatok is ltrejhetnek.
Fenti megfontolsokon fell a GMO llnyek gyakran nagyobb fittsggel rendelkeznek pp a
gnmdosts kvetkeztben, amely fittsg evolcis elnyt jelenthet, s gy kikerlve a termszetbe a
termszetes (honos) populcikat visszaszorthatjk7.
Ezen jelensgek vltottk ki a vilg szmos orszgban azt a trekedst, hogy nemzetkzi
egyezmnyt hozzanak ltre a bioszfra diverzitsnak megrzsre (Cartagenai jegyzknyv,
2000.01.29), illetve ennek rdekben a transzgnikus szervezetek ellltsrl, piacra kerlsrl,
hatrokon tvel mozgsrl klcsns tjkoztats megvalstsra.
Hasonl okokbl az amerikai lelmiszer s Gygyszergyi Hatsg (FDA) bevezette a GRAS(Gegnerally Recognised As Save) listt, amelyre csak olyan lelmiszer-ipari s gygyszeripari
adalkok, hatanyagok kerlhettek fl, amelyeket: vagy 1) 1958.01.01. ta hasznlnak (teht kellen
rgta, ahhoz, hogy legyen elegenden nagy fogyaszti ltszm), vagy 2) tudomnyos ksrletekkel
igazoltk az rtalmatlansgt, vagy 3) a szakrtk egyetrtenek a biztonsgossgban, ltalnosan
biztonsgosnak ismert.
A mikrobiolgiai eredet adalkok GRAS-listjnak egy rszt mutatja a 4.1.2. tblzat.
sszefoglalva megllapthat, hogy a mikroorganizmusok ipari alkalmazsakor a lehetsges
kockzatok mrlegelse utn a vonatkoz biztonsgi elrsok betartsval kell eljrni.

Szerencsre a piacorientlt trsadalom tlnyomrszt olyan gnmdostsokat vgzett eddig, amelyek a termk
minsgt s/vagy hozamt nveltk. Ez azonban a termel szervezet szmra plusz teher, azaz inkbb evolcis
htrny, semmint elny.
7

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

108

Ipari mikrobiolgia

4.1.2. tblzat: Mikrobiolgiai eredet lelmiszer-adalkok GRAS-listja


172.155

Streptomyces natalensis s Streptomyces chattanoogensis eredet Natamycin

172.325

Saccharomyces cerevisiae eredet pkleszt-fehrje

172.590

Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces fragilis, Candida utilis eredet leszt-maltakivonat

172.620

A Rodophycea osztly Gigartinaceae s Soliericeae csaldjainak albbi tagjaibl ellltott


karragn (hidrokolloid): Chondrus crispus, Chondrus ocellatus, Eucheuma cottonii, Eucheuma
spinosum, Gigartina acicularis, Gigartina pistillata, Gigartina radula, Gigartina stellata

172.655

Furcelleran, a Furcellaria fastigiata finomtott hidrokolloidja

172.695

Xanthomonas campestriseredet xantn gumi

172.725

Fusarium moniliforme fermetncijbl szrmaz Gibberellin sav

172.896

szraz leszt: Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces fragilis; s szrtott torula leszt,


Candida utilis

172.898

Saccharomyces cerevisiae eredet pkleszt glikn

173.110

Rhizopus niveus eredet amiloglikozidz a glestett kemnyt cukorr trtn hidrolzishez

173.120

Aspergillus niger eredet karbohidrzok s cellulzok kagylk, rkok feldolgozshoz

173.130

Rhizopus oryzae eredet sznhidrzok a kemnytalap dextrz ellltshoz

173.135

Micrococcus lysodeikticus eredet katalz a sajtgyrtshoz

173.140

Mucor miehei var. Cooney et Emerson eredet lipzok mint sajtok, zsrok, olajok s tejtermkek
zfokozi

173.145

Morteirella
vinaceae
szaharzgyrtshoz

173.150

Mikrobilis tejalvaszt enzimek a sajtgyrtshoz (Endothia parasitica, Bacillus cereus, Mucor


pusillus Lindt illetve mdostott Mucor miehei s Aspergillus oryzae, amelyek Rhizomucor miehei
var Cooney et Emerson eredet aszparaginsav-protz gnjt tartalmazzk

173.160

Candida guilliermondii mint fermentatv citromsav-elllt mikroba

173.165

Candida lipolytica mint fermentatv citromsav-elllt mikroba

173.280

oldszeres extrakcis mdszer az Aspergillus niger fermetnlevbl trtn citromsav kinyersre

Nmeth ron, BME

var.

raffinoseutilizer

alfa-galaktozidza

cukorrpa-alap

www.tankonyvtar.hu

5. Kitekints

5.

109

KITEKINTS

Taln nem szksges tovbb bizonygatni, hogy a biotechnolgia egy interdiszciplinris, szertegaz,
intenzven kutatott tudomnyterletbl napjainkra a mindennapokat is meghatroz fogalomm vlt.
Azt is bemutattuk e jegyzet elejn, hogy a biotechnolgia szertegaz terleteinek kzs pontja a
mikroorganizmus, gy az ipari mikrobiolgia szorosan sszefgg a biotechnolgival. E kt terlet
jvjrl is csak egymsra utaltsguk mellett lehet gondolkodni, azaz az ipari mikrobiolgia jvje a
biotechnolgiai terletek s irnyok ltal determinlt, ugyanakkor a biotechnolgia lehetsgeit a
mikroorganizmusok vilga hatrozza meg. Kzs jvjk mg mindig kt szlon fut, hiszen a
termszetben megtallhat mikrobk s azok klnleges tulajdonsgainak felkutatsa mg vtizedekig
eltarthat, figyelembe vve az ismert s a vlt mikrobk szmt a Fldn, ugyanakkor a rekombinns
termel trzsek nyjtotta flexibilis s knyelmes lehetsgek nyilvn egyre nagyobb teret fognak
hdtani.
Azt gondolhatnnk, hogy a biotechnolgiai forradalom vgt fogja jelenteni, ha a termszetben
tallhat sszes tulajdonsgot s enzimet (azaz az sszes ltez mikrobt s azok genomjt)
feltrkpezzk, s a kapott informcikszletbl gazdlkodva azok vgtelen kombincijval vges
szm tulajdonsgbl szinte vgtelen kombincij rekombinns fajt lehet ltrehozni, amelyekkel
minden fontos vegyipari eljrs kivlthatv vlna. Ugyanakkor a protein engineering tbb vtizedes
gyakorlata jelzi, hogy van lehetsg meglv tulajdonsgok talaktsra, s j tulajdonsgok (j
enzimek) ltrehozsra, ma mg fleg meglv peptidek teljes tszerkesztsvel, de idvel taln de
novo ellltsval is.
Az a krds, hogy a fenti nagy lehetsgekbl mi valsul meg a jvben, aligha vlaszolhat
meg, hiszen javban tart egy olyan biotechnolgiai hzgazat keresse, amely fenn tudn tartani az
eddigi fejldst, s tovbbi fejlesztseket generlni. Ilyen potencilis hzgazat lehet a gygyszergyrts, a biozemanyagok ellltsa, a fehr biotechnolgia, hogy nhny pldt emltsnk.
A biotechnolgia szkeptikusai napjainkban mg knnyen tallnak fogst a fejlesztsi
trekvseken, hiszen a kolajalap energiaszektor s a vegyipar energia- s anyagignyeinek megjul
alapokon trtn kivltshoz az egsz Fld felsznnek megmvelse is kevs lenne. Az is biztos
azonban, hogy a kolajkszletek majdani elfogysa utn szksg lesz az alternatv lehetsgekre mind
az energia-, mind a nyersanyag-felhasznls terletn. Szerencss esetben az energiaignyt ms
tovbbi alternatv utakon is ki lehet elgteni (szl, vz, nap, geotermikus stb.), teht csak a nyersanyagignyre kell ms biomassza-alap megoldst tallni.
A jv rdekes krdse, hogy a fnyhasznost tengeri algk az eddig ki nem hasznlt tengerek
felsznn mennyi biomassza-alap nyersanyagot, illetve zemanyagot tudnak majd ellltani. Az
algkkal kapcsolatban is hallani olyan kritikkat, hogy nem elg hatkonyak, ezrt a Fld sszes
tengere is kevs a jelenlegi s a nvekv energiaignyek algkkal trtn kielgtshez.
Ma mg csak remlhetjk, hogy a korltlannak ltsz lehetsgek kiaknzsval sikerl olyan
fejlesztseket realizlni, amelyekkel elrhetek az emberisg nagy volumen ignyeinek
kielgtshez szksges termelsihatkonysg-nvels, s a szkeptikusok bnatra hozzjrul majd a
biotechnolgia s a vele szorosan sszekapcsold ipari mikrobiolgia az emberisg energia- s
nyersanyag-problminak megoldshoz.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

110

6.

Ipari mikrobiolgia

SZSZEDET

acid-fast

savll

aerob

Oxignignyes faj.

anaerob

Levegkizrst ignyl anyagcsere vagy faj.

anaerob lgzs

Olyan respircis folyamat, ahol a terminlis


oxidciban a vgs elektron akceptor nem a
lgkri oxign, hanem valamilyen ms szervetlen
molekula (pl.: szulft)

anaplerotikus

=feltlt, egyes reakciutak ciklikusan mkdnek,


s ha a ciklus tagjai a termkvonal fel mozdultak,
akkor ptolni kell ket a ciklus szmra.

antimetabolit rezisztencia

Az antimetabolit egy olyan molekula, amely egy


adott metabolitot specifikusan megkt, gy az nem
ll rendelkezsre a sejt szmra. Amely sejtek erre
rezisztensek, felteheten tbb metabolitot
termelnek, mint amennyi antimetabolit a
rendszerben van, teht lehetnek jobb termelk.

Arisztotelsz

kori grg filozfus (Kr. e. 384322),


kiemelked tuds, tbb tudomny s az eurpai
kultra atyja, az els rendszertan megalkotja.

Bakteriocin

Baktriumok ltal termelt fehrjeszer (peptid)


toxin, amely hasonl baktriumok nvekedst
gtolja

biobnyszat

A bnyszat clja a fmek kinyerse svnyaikbl.


Egyes kzetek fmtartalma, illetve keverk volta
nem teszi lehetv a hatkony fmkinyerst, m
mikrobilis folyamatok kvetkeztben egyes
fmek kioldhatk, s a hg oldatbl kinyerhetk
gazdasgosan.

biokontroll

Agrrkifejezs, amely a krtevk szablyozst


(cskkentst) jelenti termszetes ellensgk
(valamilyen ms biolgiai rendszer) segtsgvel.

citokin

A citokin nv polipeptid regultorok nagy s


vegyes csaldjt takarja, amelyet a szervezetben
klnbz embriolgiai eredet sejtek termelnek
(nem csak az immunrendszer sejtjei).

COSY-NMR

=Correlation spectroscopy, molekula- szerkezet


feldertsre hasznlatos kt- dimenzis NMR
spektroszkpia. Egy kt- dimenzis NMR-mrs
egy sorozat egydimenzisbl ll, amelyek rdi
frekvencis pulzusok sorozatbl llnak
ksleltetsi peridussal a pulzusok kztt. Ezeket
az egydimenzis sorozatokat az idzts, a
frekvencia s az intenzits klnbzteti meg
egymstl. Nmely ksleltets alatt, az atommag

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

6. Szszedet

111

spinek foroghatnak egy adott ideig, amit evolcis


idnek hvnak. Az utols pulzus utn a magok a
frekvencit meghatrozzk. Az evolcis id
lptetsvel ktdimenzis adatok generlhatk az
egydimenzis adat- sorozatokbl.

crabtree effektus

Egyes mikrobk (fleg lesztk) estben jellemz,


hogy a tl magas cukor (C/E-forrs) mennyisge a
korltozott oxidcis kapacits sejtekben
megfelel levegztets ellenre is anaerob
anyagcserre vlt ki.

destruxinok

Ciklikus gomba (pl.: Metharisium anisopliae)


eredet toxinok, amelyek depsipeptidekbl llnak
(peptid kts helyett helyenknt szter kts van),
s a gerinctelenekben elnyomjk az immunvlaszt.

diszaharidok

Kt monomercukor-egysgbl felpl
cukormolekulk, pl.: laktz (1db glkz+ 1db
galaktz), maltz, cellobiz, szaharz stb.

diszproporci

egyidej oxidcisszm-nvekeds s -cskkens


egy adott reakci kvetkezmnyeknt.

diverzits

=sokflesg

ektomikoriza

Fonalas gombk nvnyi gykerekkel alkotott


szimbizisa.

elre/vissza csatols

szablyozsi mehanizmus, amikor egy hlzat


elbbi elemei valamelyik ksbbi tagra hatnak
(=elre), pldul egy metabolit gtolja az t
tovbb alakt enzimek egyikt. A visszacsatols
esetn az elbbi elem egy mg korbbira van (pl.:
gtl) hatssal.

enniatinok

Olyan ionofr antibiotikumok, amelyeket fonalas


gombk (pl.: Fusariumok) termelnek, s
depsipeptidbl (peptid kts helyett nelyenknt
szter kts van) llnak.

epidermlis nvekedsi faktor

Az emberi sejtek nvekedst, prolifercijt,


differencildst segt 53 aminosavbl ll
oligopeptid.

expressziszint szablyozs

Egy adott reakcitvonalat vagy funkcit


katalizl enzim(ek) gnjnek ki/be kapcsolsval
trtn szablyozs

expresszis rendszer

Az expresszis rendszerek olyan mdostott


mikrobk, amelyek kpesek nagy koncentrciban
bioaktv formban (helyes elsdleges,
msodlagos, harmadlagos szerkezettel) idegen
fehrjket a fermentlbe extracellulrisan
kifejezni, mikzben eredeti protez aktivitsukat
lecskkentettk (s ezltal a termk lebonts
cskkent).

extrm termofil

Extra magas hmrskletet kedvel.

Extrmofilek

Extrm krlmnyek (pH, hmrsklet,


skoncentrci, nyoms) mellett nvekv

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

112

Ipari mikrobiolgia

mikroorganizmusok.
Extrmozim

Extrm krlmnyek (pH, hmrsklet,


skoncentrci, nyoms) mellett aktv enzimek,
fehrjk.

fakultatv anaerob

Az anaerob/aerob krlmnyeket kb. egyformn


szeretik.

fehr biotechnolgia

Vagy msnven "ipari biotechnolgia" a


biotechnolgia azon ga, amely valamely
vegyipari technolgit kpes bioipari eljrssal
(enzimes, mikrobilis) technolgia szinten
kivltani.

fehrjeszint szablyozs

Fehrjk klcsnhatsa rvn trtn szablyozsa


egy reakcitnak (pl.: egyik fehrje a msik
kofaktora vagy inhibtora, esetleg aktivtora stb.)

Fenotipizls

Fenotpus (a genetikai informci alapjn


megjelen tulajdonsg) megllaptsa.

fermentatv anyagcsere

Olyan metabolizmus, amelyben az elektron- donor


s az elektronakceptor-molekula is szerves
molekula (pl.: cukorbl alkohol erjesztse).

fermentatv faj

Erjedst vgz faj

filogenetika

Rokonsgon alapul leszrmazssal foglalkoz


tudomny, amelynek modern formja genetikai
eszkzk (gnazonossg, mutcis mintzat
alapjn) segtsgvel derti fel a rokoni
kapcsolatokat.

fitoalexinek

Nvnyek ltal (baktriumok ellen) termelt


antibiotikus hats molekulk.

fitonematdk

nvnyi fonlfrgek, lskdk

fitotoxin

Nvnyek ellen termelt mikrobilis mreg.

fittsg

A transzgnikus llnyek rtermetsgnek


jelzsre hasznlatos fogalom, amely az j
tulajdonsg evolcis elnyt mri, s gy a
kockzatelemzs els lpse.

formzreakci

A cukorszintzis els lpse, amelyben 2


formaldehidbl formz jn ltre, majd erre jabb
formaldehidet addicionltatva glicerin-aldehid
keletkezik.

foszfotranszferz rendszer (PTS)

A szubsztrt szint foszforilcit vgz


enzimrendszer, amely foszforcsoportot
addicionltat a szubsztrtmolekulra (aktivlja azt)
a fszfoenol-piruvtrl. Ennek kvetkeztben vlik
lehetv a szubsztrt transzportja sejt belsejbe.

GC, HPLC

Analitikai (kromatogrfis) mdszerek.

halotolerns

=str, ltalban a fiziolgis skoncentrcinl


magasabb, ozmotikusan veszlyes
skoncentrcikat elviselk gyjtneve

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

6. Szszedet

113

heterofermentatv

Egy erjeszts vagy fermentci akkor


heterofermentatv, ha tbb fajta termk keletkezik
(heterogn termkprofil).

hexzok

Hat sznatombl ll cukorvegyletek


(szaharidok), pldul glkz, fruktz, galaktz stb.

hifa

Fonalas gombk tbbsejt, differencilatlan


sejtlnca (fonala).

homofermentatv

Egy erjeszts vagy ferementci akkor


homofermentatv, ha egyfajta termk keletkezik
(homogn termkprofil).

hozam

hatsfok jelleg mennyisg, amely azt mondja


meg, hogy a szubsztrt mekkora hnyada kerlt be
a biomasszba (biomassza-hozam), vagy a
termkbe (termkhozam). Mrtkegysge % vagy
g/g. Ha a szubsztrt- fogys helyett a bemrt
szubsztrt mennyisgvel szmolunk, a hozamhoz
hasonl, azonban rtkileg eltr mennyisget, a
kihozatalt vagy kitermelst kapjuk.

idiofzis

A mikrobilistermk-elllts hanyatl
sejtnvekedssel, s nvekedshez nem kapcsolt
termkkpzssel jellemezhet szakasza.

Inclusion body

A prokaritk zrvny testje, ahov a


hasznlhatatlan (pl.: heterogn fehrje), illetve a
ksbbi hasznlathoz elraktrozott anyagokat a
sejtek kivlasztjk.

Indel

=in(szert)+del(ci), azaz inszercival, vagy


delcival ltrejv mutci.

inszekticid

=rovarl

ionofr

ltalban zsroldhat molekula, amelynek


funkcija az ionok szlltsa a sejtmembrnon
keresztl.

izotopomer

Olyan izomerek, amelyek az izotp atom helyben


klnbznek egymstl.

katabolit represszi

Biolgiai szablyozsi mehanizmus, amely


lehetv teszi az anyagcsereenzimek szintzisnek
gtlsval, hogy mindig a legkedvezbb
szubsztrtot fogyasszk el elbb a
mikroorganizmusok. (A msika(ka)t hasznost
enzimek szintzise gtolt.)

kemolito-autotrfok

Sznforrsknt lgkri CO2-t hasznlnak, energia


forrsknt szervetlen vegyletek oxidcijt
aknzzk ki.

kenet

kenet a kn (mint anyag) trgyragozott (rgies)


formja, cserlhet knt-re

kofermentci

"=egytt fermentci", kt mikroba vagy kt


szubsztrt egyidej alkalmazsa egy tenyszetben.

klsav

Vzoldhatatlan szternvzas epesav, si a kltok.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

114

Ipari mikrobiolgia

kommenzalista

olyan kapcsolat ms (gazda) lszervezettel,


amely kapcsolat a gazda szmra semleges, a
kommenzalista szmra pedig elnys (pl.: a
brflra egyes tagjai)

kompetitv receptor antagonista

Olyan molekula, amely kapcsoldni kpes a


receptorhoz, de nem aktivlja azt.

leaky mutns

Olyan mutns, amely cskkent nvekeds, de


nem hinymutns. Ennek oka valamely
fiziolgiailag ignyelt enzimes reakci cskkent
aktivitsa.

magnetotaktikus

Mgneses teret magnetit svnyok fzrnek


segtsgvel rzkelni kpes mikroba.

makrolid antibiotikum

14, 15, vagy 16 tag makrolid laktongyrt


tartalmaz hatanyagok, jellemzen fehrje
szintzist gtl antibiotikumok.

malo-laktikus fermentci

A tejsavbaktriumok ltal vgzett olyan erjeds,


amely sorn az ersen savas almasav (=malonsav)
az enyhbb tejsavv s szndioxidd alakul.

Maximum likelihood (ML) mdszer


Maximum parsimony (MP) mdszer

A filogenetikus analzis egyik mdszere, amely


standard statisztikai mdszerekkel keresi a
legvalsznbb leszrmazsi varicit.
A filogenetikus analzis egyik mdszere, amely a
legkevesebb evolcis varicit keresi, s fogadja
el.

metabolit

Anyagcsere kvetkeztben keletkez molekula.

metanognek

A szn-dioxidot (nem fotoszintzis tjn)


hasznost mikrobkat nevezik gy.

metilotrfok

A szn-dioxidon kvli sszes egy sznatom


sznforrst hasznost mikrobkat nevezik gy.

mezofill

Kzepes (ltalban hmrskleti) tartomnyt


kedvel llny.

mezofill

Hmrskleti optimuma 1540C esik.

MIC

=MinimalInhibitoryConcentration az a dzis, ami


mr hatkony inhibcit okoz.

microarray technika

Nagyszm ksrletek vgzsre alkalmas


mdszer, amely egy furatokkal elltott lemez
gyors leolvassn s kirtkelsn (mikroplate
reader) alapul.

mikolsav

A mycobacteriumok sejtfalban tallhat hossz


sznlnc zsrsav, teht nem a miko=gomba
elnevezsbl szrmazik, noha az actinomycetk
kz sorolt Mycobacterium fonalakat kpes
nveszteni.

mutagnek

Mutcit elidz hatsok, gensek (lehetnek


kmiaiak (vegyszerek), fizikaiak (pl.: sugrzsok).

Neigbhour-joined (NJ) mdszer

A filogenetikus analzis egyik mdszere, amely

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

6. Szszedet

115

genetikaitvolsg-mtrix alapjn az egymshoz


legkzelebbi rokonokat keresi meg, majd a kzs
elgazsi pontjukat helyezi el a tbbi, tvolabbi
rokon kztt.
objektv fggvny

Az optimlsok sorn egy "legjobb" rtket


keresnk. Az a fggvny, amelynek rtkei kztt
keressk a legjobbat (optimlisat), az objektv
fggvny.

obliglt anaerob

Szigoran anaerob krlmnyek mellett nvekv.

oligotrp

Tpanyagszegny lhely

opportunista patogn

Olyan letforma, amely tlagos


gazdaszervezetekben nem okoz megbetedegedst,
csak annak legyenglse esetn.

Pasteur-effektus

Olyan mikrobilis jelensg, amely sorn az


elgtelen levegztets miatt a mikroba anaerob
anyagcserre vlt oxign jelenltben is.

pentzok

t sznatombl ll cukorvegyletek
(szaharidok), pldul xilz, arabinz stb.

peszticid

=krtevrt szer

platformalkot vegylet (platform kemiklia)

Olyan vegyletekre hasznljuk, amelyeknek egy


sor piackpes, rtkes szrmazkt konvencionlis
vegyipari folyamatokkal el lehet lltani.

poliextrmofil

Nemcsak egy paramter extrm rtkeit, hannem


tbbt is elviseli. Pl.: nemcsak acidofil, hanem
emellett halofil, termofil is egy adott llny.

polifilatikus

Nem egy kzs stl, hanem tbb stl


szrmaztathat trzs, faj.

porozits

A porozits vagy hzagtrfogat az reges szilrd


anyagok jellemzje, amely megadja a hzag
trfogatok arnyt az ssztrfogathoz kpest (pl.:
porszemcsk kztti lgtrfogat a porhalom
trfogathoz kpest, vagy porszemcsben a
hzagtrfogat a porszemcse trfogathoz kpest.)

Pregnnok

Szteroidok egy csoportja, amelyek a C1-en s C21en szubsztitultak. Pregnnokra (teltett pregnn
szrmazkok) s pregnadinekre (teltettlen
pregnnszrmazkok) oszthatk , utbbiak ketts
ktst is tartalmaznak. Elbbiekhez tartoznak a
kortizon, hidrokortizon, progeszteron.

primer metabolit

a mikrobk norml letfolyamatainak


kvetkeztben keletkez, ltalban szerves
molekula, amely teht ltalban nvekedshez
kapcsolt termkkpzs.

prodigiosin

Pyrrolylpyrromethane vz vrspigmentmolekula, antifungicid, antiproliferatv,


immunszupresszns, Serratik termelik.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

116

Ipari mikrobiolgia

produktivits

Az adott eljrs termelkenysgt mri. A


volumetrikus produktivits (g/l/h) megadja, hogy
trfogategysgenknt (L) s idegysgenknt (h)
hny g termk (termkproduktivits), illetve hny
g biomassza (biomassza produktivits) keletkezik.

propagula

Szaportkplet, elssorban a nvnyeknl


hasznljk.

proteinogn aminosav

Fehrjefelpt aminosav.

Proteus

Homroszi hs, aki Posseidon fkit nevelte, s a


vgtelen talakuls kpessgt kapta ajndkba.

random mutagenezis+screening

Trzsfejlesztsi mdszer, amely a hatkonyabb


trzs ksztse rdekben mestersges
vletlenszer mutltatst vgez a szli
genercin (random mutagenezis), majd a
lenysejteket szrvizsglattal minsti, s
kivlogatja (screening).

Reichstein szubsztrt

= 17,21-dihidroxi-progeszteron

rendszertan (taxonmia)

Az llnyek rendszerezsvel foglalkoz


tudomnyg. jabban nem a fenotpusos
hasonlsg, hanem a genotpusos
azonossg/klnbzsg alapjn (az evolci
rekonstrulsval) llapt meg rokoni
kapcsolatokat fajok kztt, s helyezi el ket
egymstl fgg tvolsgok alapjn.

replika mdszer

Petri-cssze-msols: a msoland petrit, fejjel


lefel rfordtjk egy brsonnyal bortott fabakra,
finoman megnyomjk, majd leveszik, s egy
msik, steril agarlemezt tesznek fel. gy pont oda
s pont ugyanolyan mikroba kerl , mint ahogy a
master petrin volt.

respirci

Lgzs, amely sorn a megelz anyagcsereutakon felhalmozott reduklt koenzim (pl.:


NADH2) regenerldik, mikzben egy szervetlen
molekula (aerob esetben a lgkri oxign)
redukldik.

retroaldol eliminci

Az aldol (C-C ktst kialakt) reakci visszafel,


azaz C-C ktst bont reakci.

reverzi

Plcikk osztdsa kokkuszokk


(Micrococcusok).

RGCs

Rare Genetic Changes ritka genetikai


vltozsok.

SCP

Single Cell Protein, azaz Egysejtfehrje. Humn


s llati tpllkkiegszt, a fehrjeszegny
tpllkok feljavtsra.

szaprofita

Elhalt szerves anyagot lebont letforma

szekunder metabolit

Kedveztlen krlmnyek esetn a mikrobk a


konkurencia elnyomsval problnak elnyre szert
tenni, s ehhez a msodlagos (szekunder)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

6. Szszedet

117

anyagcsere-termkeket lltjk el, s bocstjk ki


a fermentlbe. Anyagcsere szempontjbl a primer
metabolitokbl plnek fel a szekunder
metabolitok is.
szelekcis nyoms

A tenysztsi krlmnyek olyan megvlasztsa,


amely mellett csak a kvnt clmikroba n ki, a
tbbi mikroba visszaszorts alatt van, viszont a
clmikrobk kinesztse maximlisan elsegtett.

szigmafaktor

Genetikai generlis szablyoz fehrje, amely a


prokaritk transzkripcijt kpes elindtani vagy
megakadlyozni.

szubsztrt/termk inhibci

Nagy termk/szubsztrt koncentrci okozta


lassuls a nvekedsben.

TCA

TriCarboxilic Acid, vagy citr kr. (ld. 1.1.4. bra,


2.1.2. hyperpicture)

termofil

Hmrskleti optimuma >55C

termotolerns

Alacsonyabb hmrskleti optimum, de kpes


magasabb hmrskleten is nni.

tetrd

Egyes gmb alak baktriumok (coccusok) 4esvel sszellnak s tetrdot alkotnak.

trofofzis

A mikrobilistermk-elllts sejtszaporodssal,
nvekedssel jellemezhet tenysztsi szakasza.

ubiquiter

Szles kr elforduls.

vegetatv sejt

Aktv metabolizmussal s letfolyamatokkal


rendelkez sejt.

vgtiter

A folyamat vgre elrt koncentrci.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

118

7.

Ipari mikrobiolgia

NELLENRZ KRDSEK AZ IPARI


MIKROBIOLGIA CM JEGYZETHEZ
(A vastaggal szedett krdsek esszk, a krds alatt javasolt szempontok segtik a vlaszolst.
A tesztkrdseknl mindig 1 helyes vlasz tallhat)
1. fejezet
1. Mi a kapcsolat a biotechnolgia s az ipari mikrobiolgia kztt?
A)
B)
C)
D)

Az alkalmazott sznkdrendszer
A technolgia, mivel mindkett e fogalomra fkuszl
A kt terleten alkalmazhat mveletek halmaza.
A mikroorganizmus, amelynek ipari alkalmazsaival az ipari mikrobiolgia foglalkozik.

2. Mely tudomnyok hatrterlete az ipari mikrobiolgia?


A)
B)
C)
D)

Biokmia, mikrobiolgia, mrnki tudomnyok


Biokmia, mikrobiolgia, biolgia
Fiziolgia, mikrobiolgia, kmia
Anatmia, mrnki tudomnyok, kmia

3. Milyen szerepe van a biofinomtknak az ipari mikrobiolgiban?


A) Az ipari mikrobiolgia a biolgia finomtott ga, ezrt az maga a biofinomt
B) A biofinomt olyan ltestmny, ahol finomkmiai kutatsok mellett mikrobiolgiai
fejlesztseket vgeznek
C) A biofinomtkat a fehr biotechnolgiban alkalmazzk, ltalban mikrobilis fermentcikon alapulnak (=ipari mikrobiolgia)
D) E kt kifejezs egyms anagrammja
4. Mutassa be a biofinomtk 3 genercijt!
A) kori (borszatok), kzpkori (srfzs), jkori (plinkafzs)
B) 1-fix paramter (nyersanyag, technolgia, termk); 2-vltoz termkpaletta (tbbi fix); 3vltoztathat alapanyag, technolgia, termkpaletta
C) 1-bioetanol-zem; 2-biodzel-zem; 3-Biogz-zem
D) 1-sznkrforgalomra neutrlis; 2-nitrogn krforgalomra neutrlis; 3-foszfor krforgalomra neutrlis
5. Rszletesen mutasson be egy sikeres pldt az ipari mikrobiolgia trtnetbl!
(termk, termel trzs (izollsa), klasszikus s modern trzsfejleszts)
6. Mirt kellett leaky mutnsokat fejleszteni a lizintermelshez?
A) Hogy kicsurogjon a termk lizin.
B) Hogy teresszen a kittt gn termke (enzim), s minimlis aktivitssal megakadlyozza a letalitst.
C) Hogy teresszen a kittt gn termke (enzim), s minimlis aktivitssal elsegtse a
letalitst.
D) Mert a mellktermkek elfolyatsval javul a termkhozam.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

7. nellenrz krdsek az Ipari mikrobiolgia cm jegyzethez

119

7. Milyen gntechnolgiai trzsfejleszts vezetett a fermentcis az 1,3-propndiol ellltshoz?


A)
B)
C)
D)

Rekombinns glicerin ellltsa fermentcival.


A glicerin- s propndiol-termel tvonalak egy gazdaszervezetbe integrlsa.
A propndiol-termelshez szksges gnek glicerintermelkbe klnozsa.
A glicerintermelshez szksges gnek propndiol-termelkbe klnozsa.

8. Mutassa be s magyarzza el az izollsi mvelet lpseit!


(Pldul antibiotikum-termelk esetben az lhelytl a profitig vezet utat!)
9. Hasonltsa ssze a sugrgombk, fonalasgombk s az leszt(gomb)k izollst
(lhely, azaz izolls forrsa, mintavtel, elkszts, szelektv adalkols, inkubls szempontjbl.)
10. Mi az a screening, s milyen szempontokat kell figyelembe venni a vgzsekor?
A) A kpernyn screen val megjelentse a videomikroszkpnak, amely sorn a felbontst
kell szem eltt tartani.
B) Szrvizsglat, amely sorn minden potencilis pozitv vlaszt (keresett tulajdonsg), de
egyetlen negatvvlaszt sem szabad figyelembe venni.
C) Szrvizsglat, amely sorn a szrk integritst vizsgljuk.
D) Olyan mikrobiolgiai mvelet, amellyel a hasznlhatatlan mikrobkat kivlasztjuk s
megsemmistjk.
11. Ismertessen 3 olyan screeninget, ahol tisztulsi zna az indikci!
A)
B)
C)
D)

Inzulintermelk, citromsavtermelk, antibiotikum-termelk


koleszterintermelk, lipztermelk, proteztermelk
DNS-polimerz-termelk, tejsav-termelk, propionsavtermelk
cellulztermelk, tejsavtermelk, antibiotikum-termelk

12. Ismertesse a HighThroughputSystem mkdst egy kitallt pldn keresztl!


(Scale down, mikrotenyszts s mrs elve, indikcis lehetsgek)
13. Mutasson be 3 ipari pldt sikeres szrvizsglatra!
A) Hialuronsav-, epesav-, hgysav-ellltsa
B) 7-aminocephalospornsav, compactin-pravastatin
ellltsa
C) Kapronsav-, linolnsav-, aszkorbinsav-elllts
D) eritrz-, glicerin-, oktanolgyrtsa

biokonverzi,

-laktamz-inhibtor

14. Hasonltsa ssze a klasszikus s modern identifikcit!


(vizsglat elve, alapja, lersok pontossga, fellltott rendszertan diszkrepancii)
15. Magyarzza el a trzsfejleszts lnyegt s lpeseit!
(Mirt kell s mit kell megvltoztatni, illetve hogyan kell kivitelezni? Klasszikus s modern
mdszerek.)
16. Milyen alapanyagokbl rdemes Magyarorszgon tejsavat ellltani? Mi a klnbsg
kztk fermentcis (mikrobiolgiai) mveleti s technolgiai szempontbl?
(A nyersanyag sznhidrtja s a sznhidrt-hidrolzisek kapcsolata a fermentcival.)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

120

Ipari mikrobiolgia

17. Milyen ksrleteket clszer elvgezni tpkzeg-optimls sorn? Mutassa be a tejsav


pldjn!
A) Trzskivlaszts nyersanyagelkszts-vizsglat tpkzeg-otpimls
fermentcis paramterek optimlsalptknvels
B) Trzskivlaszts nyersanyagelkszts-vizsglat tpkzeg-otpimls
folyamattervezs szimulcival fermentcis paramterek optimlsalptknvels
C) Trzskivlaszts nyersanyagelkszts-vizsglat fermentcis paramterek
optimlsalptknvels
D) Trzskivlaszts nyersanyagelkszts-vizsglat tpkzeg-otpimls
fermentcis paramterek optimlsafolyamattervezs szimulcival
18. Mi a biokmiai funkcija az elsdleges anyagcseretermkek ellltsnak anaerob mikrobk
tenysztse sorn?
A)
B)
C)
D)

NADH2-termels a glikolzis sorn.


A terminlis oxidci hinyban reduklt koenzim regenerlsa.
CO2-kibocsts a citrtkr segtsgvel.
Pentzok lebontsa a pentz-foszft ciklus segtsgvel.

19. Melyik szubsztrt kedvezbb az etanolos erjedseknl: hexzok v. pentzok? Mirt?


A)
B)
C)
D)

A hexzok, mert esetkben 1:2 arnyban kpzdik az etanol s a CO2.


A pentzok, mert esetkben 1:2 arnyban kpzdik az etanol s a CO2.
A hexzok, mert esetkben 1:1 arnyban kpzdik az etanol s a CO2.
A pentzok, mert esetkben 1:1 arnyban kpzdik az etanol s a CO2.

20. Mi a Pasteur- s a Crabtree-effektus?


A)
B)
C)
D)

sok oxign s kevs cukor esetn anaerob anyagcserre vlt az leszt


kevs oxign s sok cukor esetn anaerob anyagcserre vlt az leszt
sok oxign s kevs cukor esetn aerob anyagcserre vlt az leszt
kevs oxign s sok cukor esetn aerob anyagcserre vlt az leszt

21. Mitl fgg, hogy a tejsavas erjeds sorn a termel mikroba melyik enantiomert termeli?
A)
B)
C)
D)

A felhasznlt szubsztrt sznatomszmtl.


A felhasznlt szubsztrt kiralitstl
A laktt dehidrogenz sztereospecifitstl
A Lactobacillus sztereospecifitstl

22. Milyen morfolgikkal tenyszthet a Rhizopus oryzae, s melyik mit termel?


A)
B)
C)
D)

egysejt(tejsav), fonalas(alkohol), pelletes(biomassza)


egysejt(alkohol), fonalas(biomassza), pelletes(tejsav)
telepes(alkohol), miclilis(tejsav), lszvetes(biomassza)
telepes(biomassza), miclilis(alkohol), lszvetes(tejsav)

23. Mely metabolitok a propionsavas erjeds mellktermkei?


A)
B)
C)
D)

Almasav, csersav, tejsav


Ecetsav, borostynksav, tejsav
Huminsav, ecetsav, szndioxid
Hangyasav, zsrsav, borostynksav

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

7. nellenrz krdsek az Ipari mikrobiolgia cm jegyzethez

121

24. Soroljon fel 3 nehzsget a butanoloserjeds-alap technolgik kapcsn!


A)
B)
C)
D)

Kis sznatomszm, ersen savas karakter, nem illkony termk.


Nehezen szrhet termk, nagy molsly, alacsony hozam.
A termk ers sejtmreg, kis koncentrciban keletkezik, heterofermentatv eljrs.
Lassan szaporod, patogn mikrobk termelik, kis produktivitssal.

25. Mutasson be 2 poliol-ellltst mikrobiolgiai/fiziolgiai/biokmiai szempontbl!


A) propndiol ellltsa Clostridiummal, xilit(ol)-elllts Gluconobacterrel
B) szorbit-elllts Z.mobilis-szal arabinzbl, s glicerin(glicerol)-elllts S.cerevisiaevel glkzbl.
C) Xilit(ol)-elllts Pichival xilzbl, s szorbit ellltsa Z. mobilisszal glkzbl.
D) Xilit(ol)-elllts Z. mobilisszal xilzbl, s szorbit ellltsa Pichival glkzbl.
26. Hasonltsa ssze a felleti s szumberz fermentcis eljrst!
(elnyk; htrnyok; alkalmazhat szubsztrtok, mikrobk s reaktorok; szablyozhat
paramterek)

2. fejezet
27. rjon pldt C1-szubsztrtra!
A) metanol
B) mentol
C) metil-acett
D) metil-akrilt
28. Ismertesse a metanolgazdasg mkdst! Mi lehet a biotechnolgia s ipari
mikrobiolgia szerepe benne?
(szintetikus lehetsgek, sznkrforgs, metabolikus lehetsgek)
29. Jellemezze a 2 leggyakoribb C2 szubsztrtot!
A)
B)
C)
D)

Ecetsav: oxidlhatenergia-nyerskor; etil-karbont: gyakori svny.


Sznsav: vzben oldhat; etilbenzot: sejtzemanyag.
Glikolaldehid: nreplikld, etanol: ecetsavv oxidlhat energia nyersekor.
Glikolaktid: tejsav-elllts; etanol: sejtzemanyag.

30. Hogyan tudjk egyes mikrobk a tejsavat szubsztrtknt hasznostani?


A)
B)
C)
D)

Piroszlsavon keresztl propndioll alaktjk


Piroszlsavon keresztl propionsavv alaktjk.
Foszfoenol-piruvton keresztl tejcukorr redukljk.
Foszfoenol-piruvton keresztl ATP-v alaktjk.

31. Melyik mikroba rendelkezik szles specifitssal a cukoroxidci terletn? (Plda!)


A)
B)
C)
D)

Sorbobacter suboxydans (pl.: szorbit-szorbz talakts)


Gluconobacter suboxydans (pl.: szorbit-szorbz talakts)
Gluconobacter suboxydans (pl.: glkz-szorbz talakts)
Corynebacterium pentosum (pentz-tejsav talakts)

32. Rszletesen mutasson be egy pldt a bioleaching terletrl!


(svny, mikroba, energianyers szthiometrija)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

122

Ipari mikrobiolgia

33. Mit jelent a fungisztatikum s a bakteriocid fogalom? Mely termkcsoportba tartoznak?


A)
B)
C)
D)

gombal, baktrium nvekedst gtl, primer metabolitok


gomba nvekedst gtl, baktriuml, primer metabolitok
gombal, baktrium nvekedst gtl, szekunder metabolitok
gombanvekedst gtl, baktriuml, szekunder metabolitok

34. Rviden mutasson be 2 msodlagos anyagcseretermket az antibiotikus hats nlkliek kzl!


A)
B)
C)
D)

Ciklosporin A: ciklikus spral; Aflatoxin: gombamreg


Ciklosporin A: imunszupresszns; Aflatoxin: gomba termelte mreg
Ergot alkaloidok: mellkvesehormonok, Klavulnsav: antibiotikum-rezisztencia
Ergot alkaloidok: nemihormonok, Klavulnsav: teltetlen zsrsav

35. Mit takar az enniatin s a destruxin?


A)
B)
C)
D)

mikrobilis ennivalt s lebont-szert


nvnyi ennivalt s lebont-szert
ionofr antibiotikumot s ionfr gomba metabolitot.
kromofr antibiotikumot s kromofr gomba metabolitot.

36. Mutassa be rszletesen a kullancsok ellen hasznlhat (mikro)biolgiai vdekezsi


eljrst!
(Kullancsok ellensgei, mikroba hatsmechanizmusa, )
37. Sorolja fel a msodlagos anyagcseretermkek funkciit, egyet rszletesen is ismertessen!
(pl.: termel mikroba kapcsolata a msik llnnyel)
38. Ismertesse a msodlagos anyagcseretermk ellltsnak kedvez paramtereket!
A)
B)
C)
D)

Lass kevers, szubsztrt-(Zn, Fe, Mg) inhibci


szubsztrt-(Zn, Fe, Mg) limitci, magasabb hmrsklet
szubsztrt-(C, N, O) limitci, magasabb hmrsklet
szubsztrt-(C, N, O) inhibci, magasabb hmrsklet

39. Definilja a kvetkez fogalmakat: Metabolic Engineering, Metabolic Fluxus Analysis,


Metabolic Controll Analysis, Metabolic Network Analysis, Systems Biology, Functional
genomics,
(Mi a hasonl fogalmak kztti klnbsg? Az adja meg a defincit.)
40. Mirt volt szksg a penicillintermels fejlesztsekor MCA s MNA-ra? Mik azok?
A) MCA: Metabolic Coefficient Analyisis, MNA: Microbial Network Anal.; Mikroba
tirnytsa Penicillin V. fel.
B) MCA: Metabolic Controll Analyisis, MNA: Metabol.Network Anal.; fluxusok tirnytsa
Penicillin V. fel.
C) MCA: Microbial Controll Analyisis, MNA: Metabol.Neutral Anal.; Mikroba tirnytsa a
Penicillin V. fel.
D) MCA: Mezophilic Controll Analyisis, MNA: Metabol.Network Anal.; fluxusok
tirnytsa Penicillin V. fel.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

7. nellenrz krdsek az Ipari mikrobiolgia cm jegyzethez

123

41. rja fel a szthiometriai mtrixot s a sebessgvektort egy olyan reakcihlra, ahol A-bl
keletkezik B (1. reakci), B-bl keletkezik C (2. r.), s C-bl keletkezik A (3. reakci). Milyen
vektort lehet ezekkel kiszmolni?
1

1
v A
r1



0 , v vB r r2 reakciosebessgekvektora
0 1 1
vC
r3
1 0 1
v1
rA



T 1 1 0 , v v2 r rB reakciosebessgekvektora
0 1 1
v3
rC
0
1 1
v1
rA



T 0 1 1 , v v2 r rB kpzodesisebessgekvektora
1
v3
rc
0 1
1 0 1
v1
rA



T 1 1 0 , v v2 r rB kpzodesisebessgekvektora
0 1 1
v3
rC

A) T 1

B)

C)

D)

42. Rajzoljon fel a koleszterint! Mutassa meg a mikrobilisan leggyakrabban mdostott pontokat!

A)

B)

C)

D)

43. Ismertesse a -redukcit a szteroidok konverzijnl!


(Mely pozciban gyakori, a reakci lettani jelentsge, plda konverzikra)
44. Mirt van szksg ciklodextrinre a szteroidkonverzik sorn?
A)
B)
C)
D)

Hogy az alkaloidok szintzise nagyobb hozammal trtnjen.


Hogy ciklikus dextrinek keletkezzenek a maradk cukorbl a feldolgozst knnytend.
Hogy ciklizlja a dextrineket a knnyebb feldolgozs rdekben.
Hogy oldatba vigye a vzben rosszul oldd szteroidszubsztrtot

45. Soroljon fel 2 Mycobacteriumot, amelyek a szteroidkonverzikban rszt vesznek!


A)
B)
C)
D)

M. phlei, M. smegmatis
M. cholesterus, M. tuberculosis
M. pelli, M. smaragdus
M. bovis, M. leprae

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

124

Ipari mikrobiolgia

46. Soroljon fel 3 alapanyagot a szteroidkonverzik vgzshez!


A)
B)
C)
D)

Prednizolon, kortizon, progeszteron


Sztigmaszetrin, szitoszterin, kampeszterin
sztron, koleszterin, tesztoszteron
METESZ, fitoszterin, kampesztrin

3. fejezet
47. Ismertesse a klasszikus mikrobilis rendszertan legutols csoportostsait!
(Hogyan nevezik az egyes csoportokat, melyik redszertan hny csoportra oszt stb.)
48. Mirt nem lehet az sbaktriumokat a Gram-fests szerint egyrtelmen besorolni?
A)
B)
C)
D)

Mert nincs mureinhljuk, mgis pozitvan festdnek.


Mert van mureinhljuk, de negatvan festdnek.
Mert pszeudomurein-hljuk van, amely nha pozitvan festdik.
Mert kls membrn takarja el a pszeudomurein-hlt, ezrt mindig negatvan festdnek.

49. Sorolja fel a klasszikus rendszertani besorols szempontjait!


A)
B)
C)
D)

Makro(sejt)morfolgia, mikro(telep)morfolgia, szag, szn, csillk szma


Makro(telep)morfolgia, mikro(sejt)morfolgia, szag, szn, biokmiai sajtsgok
Makro(telep)morfolgia, mikro(sejt)morfolgia, szag, szn, biokmiai sajtsgok
Makro(telep)morfolgia, mikro(sejt)morfolgia, szag, szn, fizikokmiai sajtsgok

50. Mutassa be a modern filogenetikai kutatsok 3 szintjt!


A)
B)
C)
D)

Fajszint, nemzetsgszint, rendszint


Trzsszint, osztlyszint, fajszint
Loklis, regionlis, kontinentlis adatelemzsek
Genomikai adatelemzs; proteomikai adatelemzs; evolcis fk sszevetse

51. Mutasson be 3 baktriumot a Proteobacterek kzl!


(Lehet azonos osztlybl (-) vagy klnbzbl is.)
52. Melyik rendszertani csoportba (trzsbe) tartoznak a kvetkez, iparilag is hasznlt fontos
fajok: Corynebacterium sp., Clostridium sp., Aspergillus sp. s Rhizopus sp.?
Rendre:
A) Actinomyces; Firmicutes, Ascomyceta, Zygomyceta
B) Archea; Firmicutes, Microsporida, Zygomyceta
C) Actinomyces; Fibrobacter, Microsporida, Saccharomicotina
D) Archea; Fibrobacter, Ascomyceta, Sacharomycotina
53. Ismertesse a gombk szaporodsi folyamatait!
(Ivaros, ivartalan, rktanyag kpia szm szerint)
54. Mutasson be egy bazidomicetk kz tartoz, iparilag is jelents gombt!
A)
B)
C)
D)

Lentinus edodes: shi take gomba, terpnek, immunerstk ellltsa


Aspergillus niger: aszkorbinsav ellltsa, pelletes morfolgia
Pichia stipitis: egysejt eukarita, C5-hasznost
Ganoderma lucidum: pecstviaszgomba, terpnek termelsre

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

7. nellenrz krdsek az Ipari mikrobiolgia cm jegyzethez

125

55. Mutasson be 2 ipari termket, amelyet kalapos gombk fermentcijval is el lehet lltani!
A)
B)
C)
D)

ergoszterin (D-vitamin prekurzora); ceramid (kozmetikumokhoz)


streptomycin (antibiotikum); lizin (aminosav)
kloramfenikol (antibiotikum); ganodermasav (terpenoid)
ciklosporin (immunszupresszns); Anttraciklin (antitumor gens)

56. Ismertesse a bioizoprnt a bazidomicetkkal kapcsolatban!


(izoprn platform, biolgiai ellts, szrmazkai s azok termeli)
57. Mik azok a terpenoidok?
A) Aroms benzolszrmazkok
B) Aroms naftalinszrmazkok
C) Heteroatomos ciklikus vegyletek
D) Izoprn dimer szrmazkai
58. Hasonltsa ssze az aszkomicetk, bazidomicetk s zygomicetk szaporodsi ciklusait!
(Ivaros s ivartalan reprodukci, gnllomny szma, az egyes llapotok meglte/hinya
alapjn.)
59. Milyen tulajdonsgok alapjn soroltk az algkat be a rendszertanba?
A)
B)
C)
D)

sznk s levlnagysguk szerint


leveleik mintzata alapjn
mret (morfolgia) s tartalktpanyagaik alapjn
Biokmiai tulajdonsgaik alapjn (fermentl, respirl stb.)

60. Soroljon fel 3 klnleges plasztiszt az algk sejtfelptse kapcsn!


A)
B)
C)
D)

glkoplaszt, kromoplaszt, protoplaszt


amiloplaszt, elaioplaszt, kromoplaszt
celluplaszt, protoplaszt, amiloplaszt
elaioplaszt, celluplaszt, protoplaszt

61. Hol fordulnak el a kkmoszatok?


A)
B)
C)
D)

mlytengerekben
hforrsokban, lgos-ss vizekben
tengeri ledkben
talajvzben

62. Sorolja fel, mire hasznljk a vrs moszatokat!


A)
B)
C)
D)

festkiparban (vzfestk)
indiktor nvnynek (krnyzetvdelem)
agar-agar, karragn, (lelmiszer-elllts)
szennyvztisztts (krnyezetvdelem)

63. Ismertesse a zld moszatok csoportjt!


(Hol tallhatk, mire s hogyan hasznlhatk stb.)
64. Hogyan alkalmazhatak az algk a megjul energiaforrsok tern?
(Mit termelnek, zrt/nyitott rendszerek stb.)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

126

Ipari mikrobiolgia

65. Sorolja fel, hogy a biotechnolgia mely terletein hasznlnak mikrobakonzorciumokat!


A)
B)
C)
D)

Krnyezetvdelem, zld vegyipar, lelmiszeripar


Krnyezetvdelem, gygyszergyrts, fehr biotechnolgia
lelmiszeripar, gygyszergyrts, manyagipar
lelmiszeripar, biobnyszat, manyagipar

66. Mutasson be egy remediciban hasznlatos mikrobt!


A)
B)
C)
D)

Corynebacterium diphteriae (diftria megktse)


Arthrobacter simplex (egyszer szennyezsek megktse)
Citrobacter freundi (urn megktse)
Leuconostoc mesenteroides (PLA lebontsa)

67. Milyen elnykkel jr a kevert tenyszetek alkalmazsa?


A)
B)
C)
D)

sterilezs nlkli technolgia, vegyes szubsztrthasznosts, alkalmazkod kpessg


kevesebb reaktor, gyorsabb biokonverzi, nagyobb produktivits
homogn rendszer, nagy hozam, tiszta termk
sterilezs nlkli, optikailag aktv technolgia

68. Ismertesse, hogy milyen anyagcserj mikrobk ptik fel a szennyvziszap-alap biogzelllt mikrobapopulcit!
(szerves savakecetsavmetnstb.))
69. Soroljon fel 2 krtkony s 2 hasznos mikrobt a szl mikroflrjbl!
A)
B)
C)
D)

Cephalosporangium sp., Botrytis cinerea; Aspergillus niger, Oenococcus sp.


Penicillium crysogenum, Anaerobacter; Schizosaccahromyces pombe
Penicillium expansum, Acetobacter sp.; Saccharomyces cerevisiae, Debaromyces sp.
Citrobacter freundii, Clostridium botulinum; Lactococcus lactis, Bacillus fragilis

70. Mirt hasznlnak a hsiparban kevert tenyszeteket?


A)
B)
C)
D)

tartsts, zests
savanyts, pcols, erjedsek
szs, fstlt z
aroma, savanyts

71. Hogyan mkdik az emberi immunrendszer els vdelmi vonala?


A)
B)
C)
D)

immunvlasz megtanulsa, antignek azonostsa


patognek likvidlsa, vdelmi hormonok induklsa
fehvrsejtek folyamatos jrrzse
patogn rzkelse s eltvoltsa, vagy antign-prezentls, adaptv vlasz elidzse

72. Hogyan mkdik az emberi immunrendszer msodik vdelmi vonala?


A)
B)
C)
D)

patogn eltvoltsa
az els vdelmi vonal fellbrlsa
az els vdelmi vonal rtestse
vrsvrtestek indukcija

73. Ismertesse a vakcink szempontjbl fontos antigneket (virlis, bakterilis)!


(pl.: fehrje- s ms molekulatpusok funkcik alapjn)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

7. nellenrz krdsek az Ipari mikrobiolgia cm jegyzethez

127

74. Mi az a szerotpus, s mi a jelentsge az oltanyagok szempontjbl?


A)
B)
C)
D)

Egy trzs felszni Ag szerinti besorolsa, immunolgiailag klnbznek.


Egy trzs felszni membrn szerinti besorolsa, immunolgiailag klnbznek.
Egy trzs felszni Ag szerinti besorolsa, immunolgiailag azonosak.
Egy trzs felszni membrn szerinti besorolsa, immunolgiailag azonosak.

75. Hogyan csoportosthatak az oltanyagok a bennk lv hatanyag alapjn?


A)
B)
C)
D)

Bakterilis, virlis stb.


Lipid, protein, szaharid
Aktv, passzv hatanyag
Holt anyag, attenult, immunkomplex, l vektoros

76. Rviden ismertessen egy inaktivlsi eljrst oltanyag ksztse sorn!


A) besugrzs, (foly. kromatogrfia), nvekedsi teszt
B) vegyszer hozzadsa, mintavtelekkel csraszm-ellenrzs, vegyszer-eltvolts (foly.
krom.), nvekedsi teszt
C) sterilezs, vegyszerezs, nvekedsi teszt
D) kiszs, renaturls, szrs, nvekedsi teszt

4. fejezet
77. Mi az elsdleges vdelmi vonal a biolgiai biztonsgtechnika terletn?
A)
B)
C)
D)

steril flke
laboratrium
gumikeszty+munkaruha
vdszemveg

78. Mi a msodlagos vdelmi vonal a biolgiai biztonsgtechnika terletn?


A)
B)
C)
D)

steril flke
laboratrium
gumikeszty+munkaruha
vdszemveg

79. Milyen osztlyokba soroljuk a WHO ajnlsnak megfelelen a mikrobkat?


A)
B)
C)
D)

A-D-ig felhasznlsuk szerint


A-D-ig elfordulsuk szerint
1-4-ig ellltsuk szerint
1-4-ig veszlyessgk szerint

80. Mi az a Cartagenai jegyzknyv?


A) Cartagenai konferencia absztrakt knyve
B) Az alrk cskentik a CO2-kibocstsukat
C) Az alrk klcsnsen informcit cserlnek a GMO-k ramlsrl.
D) Az alrk nvelik a krnyezetvdelmi kiadsaikat
E)
81. Ismertesse a biolgiai containment fogalmt s lehetsgeit!
(GMOk kockzata s programozhatsga)

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

128

Ipari mikrobiolgia

Tesztmegold kulcs

1.D

2.A

3.C

4.B

6.B

7.B

10.B

11.D

13.B

17.A

18.B

19.C

20.B

21.C

22.B

23.B

24.C

25.D

27.A

29.C

30.B

31.B

33.D

34.B

35.C

38.C

40.B

41.C

42.D

44.D

45.A

46.B

48.C

49.B

50.D

52.A

54.D

55.A

57.D

59.C

60.B

61.B

62.C

65.A

66.C

67.A

69.C

70.B

71.D

72.A

74.A

75.D

76.B

77.A

78.B

79.D

80.C

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

8. Hivatkozsok

129

8.

HIVATKOZSOK

[1]
[2]
[3]
[4]

M.Koffas s G. Stephanopoulus (review, 2005)


W. Leuchtenberger Appl Microbiol Biotechnol (2005) 69: 18
S. Udaka J Bacteriol. 1960 May; 79(5): 754755
Microbial production of 1,3-propanediol: Recent developments and emerging opportunities
Biotechnology Advances 27 (2009) 895913
Biebl H, Menzel K, Zeng A-P, Deckwer W-D. Microbial production of 1,3-propanediol. Applied
Microbiology and Biotechnology 1999,52:289-297.
Chao-Chen et. al. Screening of Compactin Resistant microorganism capable of converting compactin to
pravastatin Current Microbiology 2006,53:108-112
Vsrhelyi Mikls: Tejsavtermels fonalas gombval, Diplomamunka, BME, 2010.
PRADO, F. C. et al. Citric acid production by solid-state fermentation on a semi-pilot scale using
different percentages of treated cassava bagasse. Braz. J. Chem. Eng. [online]. 2005, vol.22, n.4, pp. 547555. ISSN 0104-6632.
Lth et al (2003) USP 6,620,614 B1
http://www.mta.hu/index.php?id=634&no_cache=1&backPid=390&tt_news=5151&cHash=71cfcfb769
Wikipedia the online ecyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/File:FormoseReaction.png
D-ERYTHROSE METABOLISM IN A STRAIN OF ALCALIGENES FAECALIS J.Bact. 1956,71(6),
649-654 http://jb.asm.org/content/vol71/issue6/index.dtl
http://www.genome.jp/kegg/pathway/map/map00030.png
Wikipedia the online ecyclopedia:
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/en/archive/5/5e/20061120074006!Ppp.svg
Wikipedia the online ecyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/File:Min_chalcopyrite.jpg
Peng et al Trans. Nonferrous.Met.Soc.China (2008)18, 1443-1449
http://www.ysxbcn.com/upfile/soft/200916/23-p1443.pdf
Arnold L. Demain,Aiqi Fang: The Natural Functions of Secondary Metabolites, (2000) Advances in
Biochemical Engineering/Biotechnology,Vol. 69,
http://www.springerlink.com/content/eand70p6w3ntnhwn/
Nature Reviews Microbiology 5, 377-383 (May 2007)
http://www.nature.com/nrmicro/journal/v5/n5/abs/nrmicro1638.html
Greg Crowther: Alcohol consumption as a way of life: the metabolism of methylotrophic bacteria
Metabolic modelers' group meeting, November 2004, Division of Allergy and Infectious Diseases within
the Department of Medicine at the University of Washington.
http://faculty.washington.edu/crowther/Research/methylo_intro_Nov2004.ppt
Martyn Ford: Mode of Action of Destruxin, Centre for Molecular Design, University of Portsmouth,
http://www.port.ac.uk/research/cmd/slideshows/filetodownload,43809,en.ppt
Kazuyuki Shimizu: Toward systematic metabolic engineering based on the analysis of metabolic
regulation by the integration of different levels of information, review, Biochemical Engineering Journal
46 (2009) 235251
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6V5N-4WKK1T61&_user=303407&_coverDate=11%2F01%2F2009&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=searc
h&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000016619&_version=1&_urlVersion=0&_userid=303407
&md5=ce39df0bd5e33986e88c26bde68cee6b&searchtype=a
Wikipedia The free encyclopedia Steroids. http://en.wikipedia.org/wiki/Steroid#Steroidogenesis
Szentirmai A. Microbial physiology of sidechain degradation of sterols, Journal of Industrial
Microbiology & Biotechnology Volume 6, Number 2, 101-115, DOI: 10.1007/BF01576429 (1990)
M. V. Donova: Transformation of Steroids by Actinobacteria: A Review, Applied Biochemistry and
Microbiology, 2007, Vol. 43, No. 1, pp. 114. http://www.springerlink.com/content/j75176573642n780/
Egorova, O., Nikolayeva, V., and Donova, M., J. Steroid Biochem. Mol. Biol., 2002, vol. 81, no. 3, pp.
273279.

[5]
[6]
[7]
[8]

[9]
[10]
[11]
[12]
[13]
[14]
[15]
[16]
[17]

[18]
[19]

[20]
[21]

[22]
[23]
[24]
[25]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

130

Ipari mikrobiolgia

[26]
[27]

http://davesgarden.com/guides/articles/view/2051/
Bacterial (Prokaryotic) Phylogeny Webpage (March 2007).
http://www.bacterialphylogeny.com/index.html
Ciccarelli, F. D., Doerks, T., von Mering, C., Creevey, C. J., Snel, B., and Bork, P. (2006). Toward
automatic reconstruction of a highly resolved tree of life. Science 311, 1283-1287.
Lake, J. A., Herbold, C. W., Rivera, M. C., Servin, J. A., and Skophammer, R. G. (2007). Rooting the tree
of life using nonubiquitous genes. Mol.Biol.Evol.24, 130-136.
Computational phylogenetics, Wikipedia, the free encyclopedia
http://en.wikipedia.org/wiki/Computational_phylogenetics 2010. oktber 26.
Ksenia Egorova and Garabed Antranikian: Industrial relevance of thermophilic Archaea, Current Opinion
in Microbiology 2005, 8:649655
COSTANZO BERTOLDO AND GARABED ANTRANIKIAN: The Order Thermococcales,
Prokaryotes (2006) 3:6981, Chapter 5. DOI: 10.1007/0-387-30743-5_5
http://www.springerlink.com/content/v20wq8765k62167x/fulltext.pdf
N. Dogra and G.N. Qazi: Biotransformation of cholesterol by Micrococcus species mediated by plasmid
DNA, World Journal of Microbiology & Biotechnology 15: 411415, 1999.
http://www.springerlink.com/content/u5546k47448h4p36/
Kazuaki Yoshimune, Yasuo Shirakihara, Mamoru Wakayama, Isao Yumoto: Crystal structure of salttolerant glutaminase from Micrococcus luteus K-3 in the presence and absence of its product lglutamate and its activator Tris, FEBS Journal, Volume 277, Issue 3, pages 738748, February 2010
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1742-4658.2009.07523.x/abstract
R.G. Saratale, G.D. Saratale, J.S. Chang, and S.P. Govindwar, Ecofriendly degradation of sulfonated
diazo dye C.I. Reactive Green 19A using Micrococcus glutamicus NCIM-2168, Bioresource Technology
Volume 100, Issue 17, September 2009, Pages 3897-3905
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6V24-4W386XT3&_user=10&_coverDate=09%2F30%2F2009&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=search&_s
ort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1521854297&_rerunOrigin=google&_acct=C000050221&_
version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=f333166c8a0e4b58df8db08291149fef&searchtype=a
MEENA LAKSHMAN and M.R. RAGHAVENDRA RAO: Excretion of lysine by Micrococcus
glutamicus J. Biosci., Vol. 3 Number 1, March 1981, pp. 51-55
http://www.ias.ac.in/jarch/jbiosci/3/51-55.pdf
I. Sunitha, K. Jagannadha Rao and C. Ayyanna: Coimmobilized whole cells of Pseudomonas reptilivora
and Micrococcus glutamicus in calcium alginate gel for the production of L-glutamic acid. Bioprocess
and Biosystems Engineering, Volume 18, Number 1, 55-58, DOI: 10.1007/PL00008974 (1997)
http://www.springerlink.com/content/b32gujlh4pj7l2rl/
GANGULY S. ; BANIK A. K. ; Induced mutation and selection of High Yielding Strain of
Micrococcus glutamicus for glutamic acid production, Journal of the Indian Chemical Society,
2010, vol. 87, no6, pp. 717-721
http://cat.inist.fr/?aModele=afficheN&cpsidt=22991226
N. Gardner, C.P. Champagne: Production of Propionibacterium shermanii biomass and vitamin B12
on spent media, Journal of Applied Microbiology, Volume 99, Issue 5, pages 12361245, November
2005
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2672.2005.02696.x/full
A. Quesada-Chanto, A. S. Afschar and F. Wagner: Optimization of a Propionibacterium acidipropionici
continuous culture utilizing sucrose, Applied Microbiology and Biotechnology Volume 42, Number 1, 1621, (1994) DOI: 10.1007/BF00170217
http://www.springerlink.com/content/jj4124461174p833/
Edward J. Wawszkiewicz: Erythritol metabolism by Propionibacterium pentosaceum. Role of Lerythrulose 1-phosphate, Biochemistry, 1968, 7 (2), pp 683687,
DOI: 10.1021/bi00842a025, http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/bi00842a025
Maria L. W. Gent-Ruijters, Francisca A. Meijere, Wijtske Vries and A. H. Stouthamer: Lactate
metabolism in Propionibacterium pentosaceum growing with nitrate or oxygen as hydrogen acceptor,
Antonie van Leeuwenhoek Volume 42, Number 3, 217-228, (1976) DOI: 10.1007/BF00394118
http://www.springerlink.com/content/lk3j875h85v44244/

[28]
[29]
[30]
[31]
[32]

[33]

[34]

[35]

[36]

[37]

[38]

[39]

[40]

[41]

[42]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

8. Hivatkozsok

[43]

[44]

[45]

[46]

[47]
[48]

[49]

[50]

[51]

[52]

[53]

[54]

[55]
[56]
[57]

[58]
[59]

131

E. A. DELWICHE', E. F. PHARES, AND S. F. CARSON: SUCCINIC ACID DECARBOXYLATION


SYSTEM IN PROPIONIBACTERIUM PENTOSACEUM AND VEILLONELLA GAZOGENES, J.
Bacteriol..(1956); 71: 503-625 http://jb.asm.org/cgi/reprint/71/5/598.pdf
Miyagawa K, Sumida M, Nakao M, Harada M, Yamamoto H, Kusumi T, Yoshizawa K, Amachi T,
Nakayama T.: Purification, characterization, and application of an acid urease from Arthrobacter
mobilis, J Biotechnol. 1999 Feb 19;68(2-3):227-36. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10194859
Yukiko Kodama*, Hiroshi Yamamoto, Norihide Amano and Teruo Amachi: Reclassification of Two
Strains of Arthrobacter oxydans and Proposal of Arthrobacter nicotinovorans sp. nov., Int J Syst
Bacteriol 42 (1992), 234-239; DOI 10.1099/00207713-42-2-234
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abstract/42/2/234
Ummadi, M.; Weimer, B. C., Tryptophan Catabolism in Brevibacterium linens as a Potential Cheese
Flavor Adjunct. Journal of Dairy Science 2001, 84, (8), 1773-1782.
http://www.dfrc.wisc.edu/DFRCWebPDFs/2001-Ummadi-JDS-84-1773.pdf
Wikepedia a szabad enciklopdia http://hu.wikipedia.org/wiki/P%C3%A1lpusztai_sajt
Reichert, K.; Lipski, A.; Pradella, S.; Stackebrandt, E.; Altendorf, K., Pseudonocardia asaccharolytica sp.
nov. and Pseudonocardia sulfidoxydans sp. nov., two new dimethyl disulfide-degrading actinomycetes
and emended description of the genus Pseudonocardia Int J Syst Bacteriol 1998, 48, (2), 441-449. doi:
10.1099/00207713-48-2-441. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abstract/48/2/441
KEIKO NAKAGAWA, KAZUO SATO, YOSHIHISA TSUKAMOTO and AKIO TORIKATA:
MICROBIAL CONVERSION OF MILBEMYCINS: 28-HYDROXYLATION OF MILBEMYCINS BY
Amycolata autotrophica, The Journal of Antibiotics Vol.46 , No.3(1993)pp.518-519
http://www.journalarchive.jst.go.jp/english/jnlabstract_en.php?cdjournal=antibiotics1968&cdvol=46&noi
ssue=3&startpage=518
Cover, W. H.; Kirpekar, A. C.; George, H.; Stieber, R. W., Calcium inhibition of efrotomycin production
by Nocardia lactamdurans Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, (1991) Vol. 7, pp 4144.
Yamamura, H.; Tamura, T.; Sakiyama, Y.; Harayama, S., Nocardia amamiensis sp. nov., isolated from a
sugar-cane field in Japan, Int J Syst Evol Microbiol 2007, 57, (7), 1599-1602. doi: 10.1099/ijs.0.64829-0.
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/57/7/1599
Xu M, Yu HM, Tan TW, Zhu YQ, Shen ZY: Molecular cloning of an amidase gene from Nocardia sp.
and its expressionin Escherichia coli Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao. (2006) Jul; 22(4):682-5. article in
chineese http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16894910
COLLINS, M. D.; SMIDA, J.; DORSCH, M.; STACKEBRANDT, E., Tsukamurella gen. nov. Harboring
Corynebacterium paurometabolum and Rhodococcus aurantiacus. Int J Syst Bacteriol 1988, 38, (4), 385391. doi: 10.1099/00207713-38-4-385 http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/38/4/385
Hernndez, A.; Weekers, F. d.; Mena, J. s.; Borroto, C.; Thonart, P., Freeze-drying of the biocontrol agent
Tsukamurella paurometabola C-924 Predicted stability of formulated powders. Industrial Biotechnology
2006, 2, (3), 209-212. doi:10.1089/ind.2006.2.209.
http://www.liebertonline.com/doi/pdf/10.1089/ind.2006.2.209
Wikipedia 2010. november 23. http://en.wikipedia.org/wiki/Nocardicin_A
Kinoshita, N.; Homma, Y.; Igarashi, M.; Ikeno, S.; Hori, M.; Hamada, M., Nocardia vinacea sp. nov.
Actinomycetologica 2001, 15, (1), 1-5.
Shigemori, H.; Komaki, H.; Yazawa, K.; Mikami, Y.; Nemoto, A.; Tanaka, Y.; Sasaki, T.; In, Y.; Ishida,
T.; Kobayashi, J. i., Brasilicardin A. A Novel Tricyclic Metabolite with Potent Immunosuppressive
Activity from Actinomycete Nocardia brasiliensis. The Journal of Organic Chemistry 1998, 63, (20),
6900-6904.
Colin R. Harwood: Bacillus subtilis and its relatives: molecular biological and industrial workhorses,
Trends in Biotechnology, Volume 10, 1992, Pages 247-256
Sui Lam Wong: Advances in the use of Bacillus subtilis for the expression and secretion of heterologous
proteins, Current Opinion in Biotechnology, Volume 6, Issue 5, 1995, Pages 517-522
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=MImg&_imagekey=B6VRV-45765YH-4R1&_cdi=6244&_user=303407&_pii=0958166995800859&_origin=search&_zone=rslt_list_item&_cover
Date=12%2F31%2F1995&_sk=999939994&wchp=dGLbVzzzSkzS&md5=849ab35125b5f838beb157d724845d6f&ie=/sdarticle.pdf

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

132

Ipari mikrobiolgia

[60]

T. Payot, Z. Chemaly and M. Fick Lactic acid production by Bacillus coagulanskinetic studies and
optimization of culture medium for batch and continuous fermentations , Enzyme and Microbial
Technology, Volume 24, Issues 3-4, 3 February 1999, Pages 191-199[61]
Vaughan A. Hilder and Donald Boulter: Genetic engineering of crop plants for insect resistance a
critical review (1999), Crop Protection, 18, 177-191
http://www.cib.espol.edu.ec/Digipath/D_Papers/42684.pdf
Boer, A. S.; Priest, F.; Diderichsen, B. r., On the industrial use of Bacillus licheniformis: a review. In
Applied Microbiology and Biotechnology, ed.; 'Ed.'^'Eds.' Springer Berlin / Heidelberg: 1994; 'Vol.' 40,
p^pp 595-598. http://www.springerlink.com/content/n6t3p7112042v146/fulltext.pdf
ENTerococci Industrial Platform http://imol.vub.ac.be/IMDO/projects/ENTIP.html
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Bacillus
Garbayo, I.; Vlchez, C.; Vega, J.; Nava-Saucedo, J.; Barbotin, J., Influence of immobilization
parameters on growth and lactic acid production by Streptococcus thermophilus and Lactobacillus
bulgaricus co-immobilized in calcium alginate gel beads. In Biotechnology Letters, ed.; 'Ed.'^'Eds.'
Springer Netherlands: 2004; 'Vol.' 26, p^pp 1825-1827.
http://www.springerlink.com/content/kj81u15234j1g452/fulltext.pdf
Application of Leuconostoc Mesenteroides Strains Isolated from Chinese Food Sources to Produce
Oligosaccharides to Be Used as Prebiotics (2009) web article, (2011. janur 4.) http://www.latestscience-articles.com/Basic_Sciences/Application-of-Leuconostoc-Mesenteroides-Strains-Isolatedfrom-Chinese-Food-Sour-763.html
Henne A. et al.: The genome sequence of the extreme termofil Thermus thermophilus, Nat. Biotechnol.
22 (5), 547-553, 2004
Nature Biotechnology (2004), 22(5), p.547 http://www.nature.com/nbt/journal/v22/n5/full/nbt956.html
A. A. SALYERS,* J. R. VERCELLOTTI, S. E. H. WEST, AND T. D. WILKINS: Fermentation of
Mucin and Plant Polysaccharides by Strains of Bacteroides from the Human Colon, APPLIED AND
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, (1977), Vol. 33, No. 2, p. 319-322,
Zs. Lang: Who has first observed Planctomycetes, (2005), Acta Microbiologica et Immunologica
Hungarica, 52(1), p.73-84 http://www.akademiai.com/content/qu476r5626227075/
Wikipedia, the onlyne Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Pediococcus_acidilactici (2010.12.31)
Wikipedia, the onlyne Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Lactococcus (2010.12.31)
A.A.E Oliveira, L.M. Farias, J.R. Nicoli, J.E. Costa and M.A.R. Carvalho: Bacteriocin production by
Fusebacterium isolates recovered from the oral cavity of human subjects with and without periodontal
disease and of marmosets Res. Microbiol. (1998), 149, 585-594
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VN3-3XXDWSF6&_user=303407&_coverDate=09%2F30%2F1998&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=searc
h&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000016619&_version=1&_urlVersion=0&_userid=303407
&md5=8c40601af3e32d2b2165cdecca539853&searchtype=a
Kononen, E.; Kanervo, A.; Salminen, K.; Jousimies-Somer, H., beta -Lactamase Production and
Antimicrobial Susceptibility of Oral Heterogeneous Fusobacterium nucleatum Populations in Young
Children. Antimicrob. Agents Chemother. 1999, 43, (5), 1270-1273.
http://aac.asm.org/cgi/reprint/43/5/1270
Anna Zdzieb_o, Jo zef Synowiecki : New source of the thermostable a-glucosidase suitable for single
step starch processing Food Chemistry 79 (2002) 485491
Wikipedia, the online Encyclopedia http://en.wikipedia.org/wiki/Chloroflexus (2010.12.31)
Khanok Ratanakhanokchai, Jun Kaneko, Yoshiyuki Kamio, and Kazuo Izaki: Purification and Properties
of a Maltotetraose- and Maltotriose-Producing Amylase from Chloroflexus aurantiacus, Appl Environ
Microbiol. 1992; 58(8): 24902494
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC195809/pdf/aem00049-0158.pdf
M T Madigan and T D Brock: Photosynthetic sulfide oxidation by Chloroflexus aurantiacus, a
filamentous, photosynthetic, gliding bacterium. J Bacteriol. 1975 May; 122(2): 782784.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC246117/?tool=pmcentrez
Hugler, M.; Menendez, C.; Schagger, H.; Fuchs, G., Malonyl-Coenzyme A Reductase from Chloroflexus
aurantiacus, a Key Enzyme of the 3-Hydroxypropionate Cycle for Autotrophic CO2 Fixation,
DOI: 10.1128/JB.184.9.2404-2410.2002. J. Bacteriol. 2002, 184, (9), 2404-2410.
http://jb.asm.org/cgi/content/short/184/9/2404

[61]

[62]

[63]
[64]
[65]

[66]

[67]
[68]
[69]

[70]
[71]
[72]
[73]

[74]

[75]
[76]
[77]

[78]

[79]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

8. Hivatkozsok

[80]

[81]
[82]
[83]

[84]

[85]

[86]

[87]

[88]
[89]

[90]
[91]
[92]

[93]
[94]

[95]

[96]
[97]

133

J G Holt and R A Lewin: Herpetosiphon aurantiacus gen. et sp. n., a new filamentous gliding organism.
J Bacteriol. 1968; 95(6): 24072408.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC315177/pdf/jbacter00588-0459.pdf
Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Cyanobacteria
Prokaryotes (2006), Chapter 4.1, 7:195-210: Free living saccharolytic Spirohetes: The genus Spirohaeta
http://resources.metapress.com/pdf-preview.axd?code=g50hph505208ltu1&size=largest
Ghasem D Najafpour, Lim Jit Kang: Evaluation and isolation of ethanol producer strain SMP-6, The
Proceedings of RSCE and 16th SOMChE, 28-30 Oct 2002 Malaysia
http://www.andrew.cmu.edu/user/jitkangl/Fermentation%20of%20Ethanol/Fermentation%20of%20Ethan
ol.htm
Peter H. Janssen and Hugh W. Morgan: Glucose Catabolism by Spirochaeta thermophila RI 19.B1,
JOURNAL OF BACTERIOLOGY,(1992), Vol. 174, No. 8 p. 2449-2453
http://jb.asm.org/cgi/reprint/174/8/2449.pdf
The Prokaryotes: Handbook of Microorganism (2006) 7:757-793 Chapter 8.1.: The order
Planctomycetales including the genera Planctomyces, Pirellula, Gemmata, and Isosphaera, and the
candidatus genera Brocadia, Kuenenia, and Scalindua
http://books.google.hu/books?id=LcCqW4IVj0C&pg=PA757&dq=The+prokaryotes+chapter+8.1&hl=hu&ei=7RAjTdDhJsqZOqjbyPsI&sa
=X&oi=book_result&ct=result&resnum=2&ved=0CC0Q6AEwAQ#v=onepage&q=The%20prokaryotes
%20chapter%208.1&f=false
Stackebrandt, E.; Murray, R. G. E.; Truper, H. G., Proteobacteria classis nov., a Name for the
Phylogenetic Taxon That Includes the "Purple Bacteria and Their Relatives" Int J Syst Bacteriol 1988, 38,
(3), 321-325. DOI: 10.1099/00207713-38-3-321. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/38/3/321
Lee, K.-B.; Liu, C.-T.; Anzai, Y.; Kim, H.; Aono, T.; Oyaizu, H., The hierarchical system of the
'Alphaproteobacteria': description of Hyphomonadaceae fam. nov., Xanthobacteraceae fam. nov. and
Erythrobacteraceae fam. nov. Int J Syst Evol Microbiol 2005, 55, (5), 1907-1919. DOI:
10.1099/ijs.0.63663-0. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/55/5/1907
Labrat.com: http://www.thelabrat.com/restriction/sources/Brevundimonasdiminuta.shtml
Silva, J. A.; Tobella, L. M.; Becerra, J.; Godoy, F.; Martnez, M. A., Biosynthesis of poly-[beta]hydroxyalkanoate by Brevundimonas vesicularis LMG P-23615 and Sphingopyxis macrogoltabida LMG
17324 using acid-hydrolyzed sawdust as carbon source. Journal of Bioscience and Bioengineering 2007,
103, (6), 542-546. http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VSD-4P5RTMP7&_user=10&_coverDate=06%2F30%2F2007&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=search&_s
ort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1598408746&_rerunOrigin=google&_acct=C000050221&_
version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=c09ab5dd7a8153a8d705eccf4490a012&searchtype=a
Production of heterologous polypeptides from freshwater caulobacter, United States Patent 6861245
http://www.freepatentsonline.com/6861245.html
CAULOBACTER S-LAYER KITS: For Recombinant Protein Secretion AND Peptide/Protein Display
http://www.flintbox.com/public/project/1487/
Yasuhiro et al.:Production of thiotropocin by a marine bacterium, Caulobacter sp. and its antimicroalgal
activities. Journal of Marine Biotechnology, (1997); 'Vol.' 5, pp 225-229.
http://www.springerlink.com/content/0hja15c5dgc3ew1l/
Microbe wiki: http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Hyphomonas_neptunium
van Aalst-van Leeuwen, M. A.; Pot, M. A.; van Loosdrecht, M. C. M.; Heijnen, J. J., Kinetic modeling of
poly(-hydroxybutyrate) production and consumption by Paracoccus pantotrophus under dynamic
substrate supply. Biotechnology and Bioengineering 1997, 55, (5), 773-782.
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/(SICI)1097-0290(19970905)55:5%3C773::AIDBIT7%3E3.0.CO;2-8/abstract
Young Tae Kim, Keunho Ji and Tae Hyug Jeong: Improved production of astaxanthin of the Paracoccus
haeundaensis by mutagenesis FASEB J. April 2010 24 (Meeting Abstract Supplement) 682.3
http://www.fasebj.org/cgi/content/meeting_abstract/24/1_MeetingAbstracts/682.3
Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Paracoccus_denitrificans
Kranz, R.; Gabbert, K.; Locke, T.; Madigan, M., Polyhydroxyalkanoate production in Rhodobacter
capsulatus: genes, mutants, expression, and physiology. Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, (8), 30033009. http://aem.asm.org/cgi/content/short/63/8/3003

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

134

Ipari mikrobiolgia

[98]

Uyar, B.; Schumacher, M.; Gebicki, J.; Modigell, M., Photoproduction of hydrogen by Rhodobacter
capsulatus from thermophilic fermentation effluent. In Bioprocess and Biosystems Engineering, ed.;
'Ed.'^'Eds.' Springer Berlin / Heidelberg: 2009; 'Vol.' 32, p^pp 603-606.
http://www.springerlink.com/content/r628k6535t8kw72g/
Sang Seo Lib et al: Bacteriocin from Purple Nonsulfur Phototrophic Bacteria, Rhodobacter
capsulatus, Journal of Bacteriology and Virology 2009. Vol. 39, No. 4 p.269 276, DOI
10.4167/jbv.2009.39.4.269
http://synapse.koreamed.org/Synapse/Data/PDFData/0079JBV/jbv-39-269.pdf
Taro Miyazaki,* Teruhide Sugisawa, and Tatsuo Hoshino : Pyrroloquinoline Quinone-Dependent
Dehydrogenases from Ketogulonicigenium vulgare Catalyze the Direct Conversion of l-Sorbosone to lAscorbic Acid Appl Environ Microbiol. 2006; 72(2): 14871495. doi: 10.1128/AEM.72.2.14871495.2006.
Galata 3 : Roseobacter bacteria the oceans stars project, Dnia
http://130.226.56.246/uk/Menu/Science/Roseobacter+bacteria+%E2%80%93+the+ocean%E2%80%99s+
stars
Roseobase, Genomic resource for marine Roseobacters: http://www.roseobase.org/roseo/och114.html
Sulinet, Digitlis tudstr: http://sdt.sulinet.hu/Player/Default.aspx?g=954cccbf-ed5b-47dd-bb7328761eae299b&cid=ad91047e-4823-4393-b137-5f3cb2b945e9
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Hydrogenophilaceae
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Acidithiobacillus
Joint Genom Institute Genom portal: http://genome.jgi-psf.org/thide/thide.home.html
Wikipedia, the online encyclopedia: http://de.wikipedia.org/wiki/Neisseria#Neisseria_meningitidis
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Burkholderia
Mohana, S.; Shah, A.; Divecha, J.; Madamwar, D., Xylanase production by Burkholderia sp. DMAX
strain under solid state fermentation using distillery spent wash. Bioresource Technology 2008, 99, (16),
7553-7564.
Anke Baselin: Optimization of lipase production in Burkholderia glumae, PhD-disszertci (2005), Ruhr
Universitaet (Bochum).http://deposit.ddb.de/cgibin/dokserv?idn=978412117&dok_var=d1&dok_ext=pdf&filename=978412117.pdf
Dugan, P.; Stoner, D.; Pickrum, H., The Genus Zoogloea. In The Prokaryotes, ed.; Dworkin, M.; Falkow,
S.; Rosenberg, E.; Schleifer, K.-H.; Stackebrandt, E., Springer New York: 2006; 'Vol.' p^pp 960-970.
http://www.springerlink.com/content/m202714852322t01/
MicrobeWiki: http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Beggiatoa
Wikipedia, the online Ecyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Purple_sulfur_bacteria
Fodor Barna: Hidrogenz rs a Thiocapsa roseopersicina baktriumban, PhD disszertci (2003),
Szegedi Tudomnyegyetem, http://doktori.bibl.u-szeged.hu/37/3/tz_hu937.pdf
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Alcanivorax
Van Trappen, S.; Tan, T.-L.; Yang, J.; Mergaert, J.; Swings, J., Glaciecola polaris sp. nov., a novel
budding and prosthecate bacterium from the Arctic Ocean, and emended description of the genus
Glaciecola Int J Syst Evol Microbiol 2004, 54, (5), 1765-1771. DOI: 10.1099/ijs.0.63123-0.
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/citmgr?gca=ijs;54/5/1765
Gauthier, M. J.; Lafay, B.; Christen, R.; Fernandez, L.; Acquaviva, M.; Bonin, P.; Bertrand, J.-C.,
Marinobacter hydrocarbonoclasticus gen. nov., sp. nov., a New, Extremely Halotolerant, HydrocarbonDegrading Marine Bacterium, Int J Syst Bacteriol 1992, 42, (4), 568-576. DOI: 10.1099/00207713-42-4568
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/42/4/568
Joint Genome Institute: http://genome.jgi-psf.org/micde/micde.home.html
Assyrian International News Agency (2008): http://www.aina.org/news/20081201063837.htm
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Francisella
Wikipedia, the online Encyclopedia: http://hu.wikipedia.org/wiki/Tular%C3%A9mia
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Tetrodotoxin
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Photobacterium

[99]

[100]

[101]

[102]
[103]
[104]
[105]
[106]
[107]
[108]
[109]

[110]

[111]

[112]
[113]
[114]
[115]
[116]

[117]

[118]
[119]
[120]
[121]
[122]
[123]

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

8. Hivatkozsok

135

[124] Carnegie Melon University (Pittsburgh), Molecular Biology of Prokaryotes course:


http://www.bio.cmu.edu/courses/03441/TermPapers/97TermPapers/lux/communication.html
[125] Phage Therapy Center (The Republic of Georgia):
http://www.phagetherapycenter.com/pii/PatientServlet?command=static_proteus
[126] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Salmonella_enterica
[127] Hazipatika.com: http://www.hazipatika.com/services/betegseglexikon/view/Salmonellozis?id=236
[128] Casullo de Arajo, H. W.; Fukushima, K.; Takaki, G. M. C., Prodigiosin Production by Serratia
marcescens UCP 1549 Using Renewable-Resources as a Low Cost Substrate. Molecules 2010, 15, (10),
6931-6940. http://www.mdpi.com/1420-3049/15/10/6931/pdf
[129] Baross Rezs: A hangyasav s a propionsav hatsa, Orszgos mezgazdasgi szakfolyirat - X. vfolyam
- 2006/09 ISSN 2061-552 http://www.agronaplo.hu/szakfolyoirat/2006/09/pr/2369
[130] Amjad Khalil, B., Z. Musa Abu and A. Mohammad, 2006. Production of antimicrobial agents from
thermophilic Yersinia sp.1 and Aeromonas hydrophila isolated from hot spring in Jordan valley.
Biotechnology, 5: 252-256. http://scialert.net/abstract/?doi=biotech.2006.252.256
[131] John Innes Center (Norwich, UK): http://www.jic.ac.uk/SCIENCE/molmicro/Azot.html
[132] A. Khanafari; A. Akhavan Sepahei: Alginate biopolymer production by Azotobacter chroococcum from
whey degradation, Int. J. Environ. Sci. Tech., 4 (4): 427-432, 2007
[133] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Rhizobacter
[134] Nurizzo, D.; Turkenburg, J. P.; Charnock, S. J.; Roberts, S. M.; Dodson, E. J.; McKie, V. A.; Taylor, E.
J.; Gilbert, H. J.; Davies, G. J., Cellvibrio japonicus [alpha]-L-arabinanase 43A has a novel five-blade
[beta]-propeller fold. 2002, 9, (9), 665-668. http://www.nature.com/nsmb/journal/v9/n9/full/nsb835.html
[135] Pell, G.; Szabo, L. r. n.; Charnock, S. J.; Xie, H.; Gloster, T. M.; Davies, G. J.; Gilbert, H. J., Structural
and Biochemical Analysis of Cellvibrio japonicus Xylanase 10C Journal of Biological Chemistry 2004
279 (12 ), 11777-11788 DOI: 10.1074/jbc.M311947200
http://www.jbc.org/content/279/12/11777.full.pdf+html
[136] Tenyszserts-llomny mentestse Actinobacillus pleuropneumoniae fertzstl, Magyar
llatorvosok lapja 2010(7) (2010.08.17.) http://www.magyarallatorvosoklapja.hu/node/79
[137] MicrobeWiki: http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Methylococcus_capsulatus
[138] McNell, M. M.; Martone, W. J.; Dowell, V. R., Bacteremia with Anaerobiospirillum succiniciproducens
Review of Infectious Diseases 1987 9 (4 ), 737-742 DOI: 10.1093/clinids/9.4.737
http://cid.oxfordjournals.org/content/9/4/737.full.pdf+html
[139] Nghiem, N.; Davison, B.; Suttle, B.; Richardson, G., Production of succinic acid by anaerobiospirillum
succiniciproducens. In Applied Biochemistry and Biotechnology, ed.; 'Ed.'^'Eds.' Humana Press Inc.:
1997; 'Vol.' 63-65, p^pp 565-576. http://www.springerlink.com/content/f86w142j30883u64/
[140] M. P. Bryant, Nola Small, Cecelia Bouma, and Hilda Chu: BACTEROIDES RUMINICOLA N. SP. AND
SUCCINIMONAS AMYLOLYTICA THE NEW GENUS AND SPECIES, J Bacteriol. 1958 July; 76(1):
1523. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC290147/pdf/jbacter00504-0033.pdf
[141] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Xanthomonas_campestris
[142] The Merck Manuals: http://www.merckmanuals.com/professional/sec02/ch013/ch013b.html
[143] Sakaguchi, T.; Arakaki, A.; Matsunaga, T., Desulfovibrio magneticus sp. nov., a novel sulfate-reducing
bacterium that produces intracellular single-domain-sized magnetite particles. Int J Syst Evol Microbiol
2002, 52, (1), 215-221. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/52/1/215
[144] MicrobeWiki: http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Desulfovibrio
[145] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Bdellovibrio
[146] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Myxobacteria
[147] Peter Meiser: Myxococcus xanthus a myxobacterial model strain as multiproducer of secondary
metabolites, PhD disszertci (2008), niversitaet des Saarlandes. http://scidok.sulb.unisaarland.de/volltexte/2008/1683/pdf/Dissertation_PeterMeiser_Internetversion.pdf
[148] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridiaceae
[149] Sveiczer kos: Mikrobiolgia II. Rszletes Mikrobiolgia jegyzet, BME 2005
http://bmekornyesz.hu/sqlatm/index.php?a=dl&f=silo/4.%20f%C3%A9l%C3%A9v/Mikrobiol%C3%B3g
ia/elojegyzet2.pdf

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

136

Ipari mikrobiolgia

[150] Smith MT, van Grinsven AM. Dekkera anomala sp. nov., the teleomorph of Brettanomyces anomalus,
recovered from spoiled soft drinks. Antonie Van Leeuwenhoek 1984,50:143-148
http://www.springerlink.com/content/q62764570q553565/
[151] Susanne Prinz,1 Iliana Avila-Campillo,1 Christine Aldridge,1 Ajitha Srinivasan,1 Krassen Dimitrov,1
Andrew F. Siegel,1,2 and Timothy Galitski1,3: Control of Yeast Filamentous-Form Growth by Modules in
an Integrated Molecular Network, Genome Res. 2004, 14(3): 380390.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC353223/pdf/0140380.pdf
[152] Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Fungus#Taxonomy
[153] Hibbett DS, et al. (2007). "A higher level phylogenetic classification of the Fungi". Mycological Research
111 (5): 50947
http://www.clarku.edu/faculty/dhibbett/AFTOL/documents/AFTOL%20class%20mss%2023,%2024/AFT
OL%20CLASS%20MS%20resub.pdf
[154] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Basidiomycota
[155] Maszlavr Petra: A PECSTVIASZ GOMBA, GANODERMA LUCIDUM (CURT.: FR.) KARST
HAZAI TERMESZTEHETSGNEK LEHETSGEI, PhD disszertci, Budapesti Corvinus
Egyetem (2008) http://phd.lib.uni-corvinus.hu/319/
[156] M. Zhang, S.W. Cui, P.C.K. Cheung and Q. Wang: Antitumor polysaccharides from mushrooms: a
review on their isolation process, structural characteristics and antitumor activity, Trends in Food Science
& Technology 18 (2007) 4-19
[157] Ya-Jie Tang*, Li-Wen Zhu, Hong-Mei Li and Dong-Sheng Li: Submerged Culture of Mushrooms in
Bioreactors Challenges, Current State-of-the-Art, and Future Prospects, Food Technol. Biotechnol. 45
(3) 221229 (2007) http://www.ftb.com.hr/45/45-221.pdf
[158] World Congress on Industrial Biotechnology and Bioprocessing, 2009.07.22, Montrel, Kanada
[159] BIODIDAC -A bank of digital resources for teaching biology:
http://biodidac.bio.uottawa.ca/thumbnails/filedet.htm?File_name=ASCO005B&File_type=GIF
[160] Wikipedia, the online encyclopedia:
http://www.albertschatzphd.com/?cat=articles&subcat=streptomycin&itemnum=001
[161] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Streptomyces#Biotechnology
[162] Wikipedia, the online encyclopedia: http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Phylogenetic_tree_hu.svg
[163] Beile Gao and Radhey S Gupta: Phylogenomic analysis of proteins that are distinctive of Archaea and its
main subgroups and the origin of methanogenesis, BMC Genomics 2007, 8:86, pp1-23,
http://www.biomedcentral.com/1471-2164/8/86
[164] Discovery Health Webpage:
http://health.howstuffworks.com/wellness/men/how-to-get-rid-of-foot-odor1.htm
[165] Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Deinococcus_radiodurans
[166] Michael R. Tansey and Thomas D. Brock: The Upper Temperature Limit for Eukaryotic Organisms, Proc
Natl Acad Sci U S A. 1972 September; 69(9): 24262428.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC426956/
[167] Singh, S.; Madlala, A. M.; Prior, B. A., Thermomyces lanuginosus: properties of strains and their
hemicellulases. FEMS Microbiology Reviews 2003, 27, (1), 3-16
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T37-481FWG31&_user=303407&_coverDate=04%2F30%2F2003&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=searc
h&_sort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1619039986&_rerunOrigin=google&_acct=C0000166
19&_version=1&_urlVersion=0&_userid=303407&md5=0002c9fee56e661909a8dfdc0572ce0b&searcht
ype=a
[168] Joint Genom Institute Genom portal: http://genome.jgi-psf.org/Spoth1/Spoth1.home.html
[169] Rezessy Sz. J.: Thermomyces lanuginosus
-galaktozidz enzim ellltsa s jellemzse, PhD
disszertci (2003), Budapesti Corvinus Egyetem http://phd.lib.uni-corvinus.hu/478/1/de_1612.pdf
[170] Young, J.; Kuykendall, L.; Martinez-Romero, E.; Kerr, A.; Sawada, H., A revision of Rhizobium Frank
1889, with an emended description of the genus, and the inclusion of all species of Agrobacterium Conn
1942 and Allorhizobium undicola de Lajudie et al. 1998 as new combinations: Rhizobium radiobacter, R.
rhizogenes, R. rubi, R. undicola and R. vitis. Int J Syst Evol Microbiol 2001, 51, (1), 89-103.
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/51/1/89?maxtoshow=&hits=10&RESULTFORMAT=&author1=Yo
ung&fulltext=A+revision+of+Rhizobium+Frank+1889&andorexactfulltext=and&searchid=1&FIRSTIN
DEX=0&sortspec=relevance&resourcetype=HWCIT

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

8. Hivatkozsok

137

[171] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Thiobacillus


[172] Cummings, D. E.; Caccavo Jr., F.; Spring, S.; Rosenzweig, R. F., Ferribacterium limneticum, gen. nov.,
sp. nov., an Fe(III)-reducing microorganism isolated from mining-impacted freshwater lake sediments. In
Archives of Microbiology, ed.; 'Ed.'^'Eds.' Springer Berlin / Heidelberg: 1999; 'Vol.' 171, p^pp 183-188.
http://resources.metapress.com/pdf-preview.axd?code=7hb3yc6qjwmd6h29&size=largest
[173] Reinhold-Hurek, B.; Hurek, T., The Genera Azoarcus, Azovibrio, Azospira and Azonexus. In The
Prokaryotes, ed.; Dworkin, M.; Falkow, S.; Rosenberg, E.; Schleifer, K.-H.; Stackebrandt, E., 'Ed.'^'Eds.'
Springer New York: 2006; 'Vol.' p^pp 873-891. http://www.springerlink.com/content/l3g777m801tl215j/
[174] Salinas, M. B.; Fardeau, M.-L.; Cayol, J.-L.; Casalot, L.; Patel, B. K. C.; Thomas, P.; Garcia, J.-L.;
Ollivier, B., Petrobacter succinatimandens gen. nov., sp. nov., a moderately thermophilic, nitrate-reducing
bacterium isolated from an Australian oil well, Int J Syst Evol Microbiol 2004, 54, (3), 645-649.DOI:
10.1099/ijs.0.02732-0. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/54/3/645
[175] Brune, A.; Ludwig, W.; Schink, B., Propionivibrio limicola sp. nov., a fermentative bacterium specialized
in the degradation of hydroaromatic compounds, reclassification of Propionibacter pelophilus as
Propionivibrio pelophilus comb. nov. and amended description of the genus Propionivibrio. Int J Syst
Evol Microbiol 2002, 52, (2), 441-444. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/52/2/441
[176] Wikipedia, the online enyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Rhodocyclaceae
[177] PFENNIG, N., Rhodocyclus purpureus gen. nov. and sp. nov., a Ring-Shaped, Vitamin B12-Requiring
Member of the Family Rhodospirillaceae, Int J Syst Bacteriol 1978, 28, (2), 283-288. DOI:
10.1099/00207713-28-2-283., http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/28/2/283
[178] A rendszertani (III.) fejezetben bemutatott mikroszkpos kpek mindegyike a Wikipedia
(http://en.wikipedia.org/wiki/Main_Page) szabad felhasznls kpei.

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

138

Ipari mikrobiolgia

BRK, ANIMCIK, VIDEK, TBLZATOK JEGYZKE


brk, animcik, videk
1.1.1. bra: Az ipari mikrobiolgia helye a tudomnyban ................................................................. 7
1.1.2. bra: A lizin kplete ................................................................................................................. 7
1.1.3. animci: A bioautogrf mdszer ............................................................................................ 8
1.1.4. bra: Glutaminsav- s lizinmetabolizmus ................................................................................ 9
1.1.5. bra: Az 1,3-propndiol-elllts alakulsa az utbbi kt vtizedben .................................. 10
1.1.6. bra: A propndiol okozta klnleges szerkezet PTT polimer (PET: polietiln-tereftalt,
PTT: poli-trimetiln-tereftalt, PBT: polibutiln-tereftalt, ET: etiln, PR: propiln, BU: butiln,
TFS: tereftlsav) ............................................................................................................................... 10
1.1.7. animci: 1,3-PD klnleges szerkezete ................................................................................ 10
1.1.8. bra: az 1,3-propndiol-elllt technolgik ....................................................................... 11
1.1.9. bra: Az anaerob glicerin metabolizmus ................................................................................ 12
1.1.10. bra: A glicerinmetabolizmus enzimei: GDH, GDHt, PDOR, (DHA: dihidroxiaceton,
HPA: hidroxipropionaldehid, PD: 1,3-propndiol) .......................................................................... 13
1.1.11. hyperpicture: A rekombinns PD fermentcis technolgia ................................................ 13
1.2.1. bra: Izolls szilrd mintrl ................................................................................................ 15
1.2.1. vide: Izolls......................................................................................................................... 15
1.2.2. bra: Anaerob tenysztrendszerek ........................................................................................ 17
1.2.3. vide: Trzsfenntarts aktv formban ................................................................................... 20
1.2.4. bra: Ferdeagaros, anaerob s szrt tenyszetek, Petri-csszk s oltkacsok....................... 21
1.2.5. bra: Microplate reader HTS szrvizsglathoz ................................................................. 22
1.2.6. bra: Antibiotikum-termelk szrvizsglati tesztje .............................................................. 24
1.2.7. vide: Klasszikus trzsfejleszts ............................................................................................ 26
1.2.8. bra: A modern trzsfejleszts vzlata ................................................................................... 27
1.2.9. bra: E. coli ecetsav kpzsnek elimincija: A) glkz transzfer deficiens mutns,
B) aceBAK gnekkel megnvelt glioxalt- s citrtkr- aktivits. .................................................. 30
1.3.1. bra: A mikrobk centrlis anyagcserje ................................................................................ 31
1.3.2. bra: A pelletkpzdst befolysol tnyezk ....................................................................... 34
1.3.3. Pelletes morfolgia ................................................................................................................. 34
1.3.4. bra: Bolyhos pellet (1-2mm)................................................................................................. 35
1.3.5. bra: ris (1cm) pellet s szablytalan alak pellet ............................................................ 35
1.3.6. bra: Amorf s ris (2-3 cm) pellet....................................................................................... 35
1.3.7. bra: Pelletfelszn mikroszkpos kpe (400-szoros nagyts) ............................................... 35
1.3.8. bra: Forgdobos bioreaktor .................................................................................................. 37
1.3.9. bra: Koji tlcs reaktor ......................................................................................................... 38
2.1.1. bra: Metanol-elllts szn-dioxidbl s metnbl ............................................................. 41
2.1.2. hyperpicture: Az ipari mikrobiolgiban fontos anyagcsereutak sszefoglalsa ................... 41
2.1.3. bra: Cukorkpzds glikoladldehiden keresztl .................................................................. 42
2.1.4. bra: Eritrittl az eritrzig ...................................................................................................... 43
2.1.5. bra: Pentz-foszft ciklus .................................................................................................... 43
2.1.6. bra: Szedoheptuloz ............................................................................................................... 44
2.1.7. bra: D-glicero-D-gluko-heptulz .......................................................................................... 44
2.1.8. bra: Kalkopirit ...................................................................................................................... 45
2.3.1. bra: A szternvzas alapvegylet a koleszterin szerkezete .............................................. 51
2.3.2. bra: Szteroidok csaldfja ................................................................................................ 51
2.3.3. bra: Ipari alapanyagknt hasznostott fitoszterinek .............................................................. 52
2.3.4. bra: Szitoszterinalap hidrokortizon- (bio)szintzis ............................................................. 55
2.3.5. bra: Hidrokortizon biokonverzija prednizolonn s szrmazkaiv ................................... 55
3.1.1. bra: Bergey-fle bakterilis rendszertan ............................................................................... 62
3.1.2. bra: Filogenetikus fa a 3 domn elmlet alapjn ................................................................. 63

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

brk, animcik, videk, tblzatok jegyzke

139

3.1.3. bra: Bakterilis filogenetikus fa az indelmodell alapjn ...................................................... 64


3.2.1. hyperpicture: Rendszertan ...................................................................................................... 65
3.2.2. bra: Methanosarcina metanogn sbaktrium ..................................................................... 66
3.2.4. bra: Sulfolobusvrus-fertzssel ........................................................................................... 68
3.2.5. bra: Bacillus subtilis ............................................................................................................ 69
3.2.6. bra: Listeria monocytogenes ................................................................................................ 70
3.2.7. bra: Lactobacillus acidophilus ............................................................................................. 70
3.2.8. bra: Oenococcus oeni ........................................................................................................... 71
3.2.9. bra: Lactococcus lactis ......................................................................................................... 71
3.2.10. bra: Clostridium botulinum ................................................................................................ 72
3.2.12. bra: Microccus mucilaginosus ........................................................................................... 74
3.2.13. bra: Arthrobacter chlorophenolicus ................................................................................... 74
3.2.14. bra: Corynebacterium diphteriae ........................................................................................ 75
3.2.15. bra: Mycobacterium tuberculosis ....................................................................................... 76
3.2.16. bra: Rhodococcus species ................................................................................................... 77
3.2.17. bra: Propionibacterium acne ............................................................................................... 78
3.2.18. bra: Streptomyces griseus ................................................................................................... 79
3.2.19. bra: Petrotoga sp. ................................................................................................................ 79
3.2.20. bra: Fusobacterium novum ................................................................................................ 80
3.2.21. bra: Deinococcus radiodurans ............................................................................................ 80
3.2.22. bra: Chloroflexus auranticus .............................................................................................. 81
3.2.23. bra: Arthrospira (Spirulina) sp. .......................................................................................... 82
3.2.24. bra: Bacteroides biacutis ..................................................................................................... 82
3.2.25. bra: Planctomyces bekefii ................................................................................................... 83
3.2.26. bra: Aquifex aeolicus .......................................................................................................... 83
3.2.27. bra: Myxococcus xanthus .................................................................................................. 84
3.2.28. bra: Heliobacter pylori ....................................................................................................... 85
3.2.29. bra: Ketogulonicigenium vulgare ....................................................................................... 86
3.2.30. bra: Agrobacterium tumefaciens rpaszveten .................................................................. 86
3.2.31. bra: Burkholderia cepacia .................................................................................................. 87
3.2.32. bra: Alcanivorax borkumensis ............................................................................................ 89
3.2.33. bra: Escherichia coli ........................................................................................................... 89
3.2.34. bra: Pseudomonas sp. ......................................................................................................... 90
3.2.3. bra: Az sbaktriumok csaldfja a rokonsgi tvolsgokkal
(NJ/ML/MP algoritmussal is) .......................................................................................................... 92
3.2.11. bra: Az Actinobacterek csaldfja (Az NCBI taxonomia adatfile alapjn generlva) ....... 94
3.3.1. animci: Gombk letciklusai .............................................................................................. 95
3.3.2. bra: A legjabb gombarendszertan ....................................................................................... 96
3.3.3. bra: Bazidomicetk felptse .............................................................................................. 97
3.3.4. bra: Aszkuszos gombk sprakpzse ............................................................................... 100
3.3.5. vide: leszttenyszet ........................................................................................................ 100
3.3.6. vide: Fonalas gomba sporangium ....................................................................................... 100
3.4.1. bra: Vrs alga ................................................................................................................... 101

Tblzatok
1.1.1. tblzat: Sznkdrendszer a Biotechnolgiai terletek jellsre ............................................ 5
1.2.1. tblzat: Fonalas gombk ipari felhasznlsa ......................................................................... 18
1.2.2. tblzat: Termofil mikroorganizmusok lelhelyei ................................................................. 20
2.1.1. tblzat: Acidiphiliumok tpkzege ....................................................................................... 45
2.3.1. tblzat: A legfontosabb mikrobilis szekunder metabolitok. ................................................ 47
2.3.2. gyakori mikrobilis szteroidkonverzik ................................................................................. 53
3.1.1. tblzat: A rendszertan fejldse ............................................................................................ 57
3.2.1. tblzat: Az sbaktriumok klnleges kpessgei................................................................ 66
3.2.2. tblzat: Bacillusok osztlya .................................................................................................. 93

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

140

Ipari mikrobiolgia

3.3.1. tblzat: Kalapos gombk fermentcis felhasznlsa .......................................................... 99


3.5.1. tblzat: Tejtermkek mikrobiotja ...................................................................................... 103
3.6.1. tblzat Az immunrendszer felptse .................................................................................. 104
3.6.2. tblzat: A magyarorszgi ktelez vdoltsok ................................................................. 104
4.1.1. tblzat: A klnbz BsC szintre sorolt laboratriumokkal szembeni kvetelmnyek ..... 106
4.1.2. tblzat: Mikrobiolgiai eredet lelmiszer-adalkok GRAS-listja ................................... 108

Nmeth ron, BME

www.tankonyvtar.hu

You might also like