Professional Documents
Culture Documents
rta:
NMETH RON
Lektorlta:
IPARI MIKROBIOLGIA
Egyetemi tananyag
2011
Tartalom
TARTALOM
ALAPISMERETEK, IPARI MIKROBIOLGIAI MDSZEREK ................................................ 5
1.1. Bevezets az ipari mikrobiolgiba ............................................................................................. 5
Vrs biotechnolgia .................................................................................................................. 5
Fehr biotechnolgia ................................................................................................................... 6
Zld biotechnolgia .................................................................................................................... 6
Esettanulmny 1. Lizingyrts ................................................................................................ 7
Esettanulmny 2. 1,3-propndiolgyrts .................................................................................. 9
1.2. (Ipari) Mikrobiolgiai mveletek ............................................................................................... 14
Trzsizolls ............................................................................................................................. 14
Trzsfenntarts .......................................................................................................................... 20
Trzs-screening ......................................................................................................................... 21
Identifikci .............................................................................................................................. 25
Trzsfejleszts........................................................................................................................... 26
1.3. Mikroorganizmusok ipari alkalmazsa ...................................................................................... 31
Az oxign szerepe ..................................................................................................................... 31
Aerobok tenysztse ................................................................................................................. 32
Anaerob fermentcik (erjesztsek) .......................................................................................... 32
Szubmerz kontra felleti fermentci ....................................................................................... 37
2. AZ IPARI MIKROBIOLGIA BIOKMIAI S FIZIOLGIAI HTTERE ............................. 40
2.1. Sznforrsok hasznosulsa, klnleges metabolizmusok .......................................................... 40
C1-forrsok hasznosulsa ........................................................................................................ 40
C2-metabolizmus ...................................................................................................................... 41
C3-metabolizmus ...................................................................................................................... 42
C4-metabolizmus ...................................................................................................................... 43
C5-metabolizmus ...................................................................................................................... 43
C6-metabolizmus ...................................................................................................................... 44
C7-metabolizmus ...................................................................................................................... 44
Specilis energianyer metabolizmusok (biometallurgy) ......................................................... 44
2.2. Primer metabolitok ..................................................................................................................... 46
2.3. Szekunder metabolitok ............................................................................................................... 46
De novo szekundermetabolit-termels ...................................................................................... 46
Szteroid- (szekunder metabolit) konverzi ............................................................................... 50
3. AZ IPARI MIKROORGANIZMUSOK S TECHNOLGIK TRGYALSA
TRZSRENDSZERTANBA ILLESZTVE .................................................................................. 57
3.1. Mikrobilis rendszertan .............................................................................................................. 57
Klasszikus rendszertan .............................................................................................................. 58
Filogenetikus rendszertan ......................................................................................................... 58
Bakterilis filogentika .............................................................................................................. 59
A baktriumok trzsnek elgazsi sorrendje ........................................................................... 60
Az indelmodell megbzhatsga s prediktv lehetsgei ........................................................ 61
3.2. Ipari szempontbl fontos (s)baktriumok ................................................................................. 65
1. Archek ................................................................................................................................. 65
2. Firmicutes ............................................................................................................................. 68
3. Actinobacterek ...................................................................................................................... 72
4. Thermotoga ........................................................................................................................... 79
5. Fusobacteriumok ................................................................................................................... 80
6.-7. Deinococcus-Thermus ...................................................................................................... 80
8. Chloroflexi ............................................................................................................................ 81
9. Cyanobacterek ....................................................................................................................... 81
10. Spirohaetk ......................................................................................................................... 82
11., 12,. 13. Chlorobik, Fibrobacterek, Bacteroidesek .............................................................. 82
1.
www.tankonyvtar.hu
www.tankonyvtar.hu
1.
www.tankonyvtar.hu
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
O
NH2
HO
NH2
www.tankonyvtar.hu
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
www.tankonyvtar.hu
10
Ipari mikrobiolgia
PD [t/v]
200.000
150.000
100.000
50.000
0
1990
1995
2000
2005
2010
www.tankonyvtar.hu
11
H
Degussa:
50-70C
H2, Ni
O
HO
135bar, 75-140C
Akrolein
Shell Chemicals:
kataliztor
CO
Etilnoxid
Dupont+Tate&Lyle:
kukorica
mag
H2
HO
OH
1,3-propndiol
100C, 100bar
25-30C
55-90C
glicerin
kemnyt
glkz
E.coli
www.tankonyvtar.hu
12
Ipari mikrobiolgia
dihidroxiacetonn alaktja; 2) glicerin dehidratz (GDHt, EC 4.2.1.30, amely B12 koenzim segtsgvel
gyks reakciban vizet hast le a glicerinrl); 3) 1,3-propndiol-oxidoreduktz (PDOR, EC 1.1.1.202,
amely reduklt NADH2 koenzim segtsgvel reduklja a vzkilpssel kapott 3-hidroxipropionaldehidet 1,3-propndioll (1.1.10. bra). Ezltal a sejten bell a glicerin diszproporcija
valsul meg.
www.tankonyvtar.hu
H2C OH
O
H2C OH
DHA-foszft
Glikolzis
13
GDH
H2C OH
HC OH
H2C OH
DHA
Glicerin
NAD+
NADH2
H2O
H2C OH
HC OH
H2C OH
Glicerin
GDHt
HC O
CH2
H2C OH
PDOR
H2C OH
CH2
H2C OH
HPA
PD
www.tankonyvtar.hu
14
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
15
www.tankonyvtar.hu
16
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
17
www.tankonyvtar.hu
18
Ipari mikrobiolgia
Msodlagos metabolitok
Enzimek ellltsa
Tradicionlis lelmiszerek
Egyb
Fonalas gomba
Aspergillus terreus
A. niger
A. niger, Yarrowia lipolytica
Eremothecium ashbyii
Aureobasidium pullulans
Saccharomyces cerevisiae
Penicillium chrysogenum
Cephalosporium acremonium
Aspergillus fumigatus
Claviceps purpurea
Penicillium sp.
A. niger
A. oryzae
A. awamori
Mucor sp.
Mucor, Rhizopus
kevert tenyszet
Trichoderma polysporum
Rhizopus, Fusarium
Termk
Itakonsav
glkuronsav
citromsav
riboflavin
pullulan
etanol
penicillinek
cefalosporinok
fumagillin
ergot alkaloidok
griseofulvin
lipz
-amilz
glucoamylase
rennin
ragi
shoyu
ciklosporinok
szteroidkonverzik
4. lesztgombk izollsa
Elforduls: fermentatv fajaik, amelyek cukrok felhasznlsval nyerik a szksges energit,
cukortartalm gymlcskn, bogykon, virgokon tallhatk meg. Ezek esetben
tbbnyire a terminlis elektronakceptor nem a lgkri oxign, hanem a cukormolekula
degradcis termkei (gy keletkeznek az elsdleges metabolitok.)
aerob fajaik: nehezen fermentlhat C-forrsokon tallhatk fleg meg, mint pldul
C4-C5, metanol, etanol, s klnbz poliolok (nvnyeken, gombkon, rovarokon,
kevs a talajban, nmely azonban csak ott).
Mintavtel: steril zacskba, vegbe kell gyjteni a mintt, amely nem trolhat jl. Talajminta esetn
a fels 10 cm-bl clszer az izollst vgezni.
Nmeth ron, BME
www.tankonyvtar.hu
19
Alkalofilek izollsa
fonalas gombk: mivel 55-60C kztt szmos gomba izollhat, de 62C-on mr egy sem,
gy tnik, hogy az eukaritk nvekedsnek 60C krl korltja van, amelynek oka
felteheten, hogy nem tudnak termostabil jl funkcionl bels membrnokat ltrehozni
[166]. Termofil fonalas gombra plda a Thermomyces lanuginosus (50C optimummal
[167]), a Sporotrichum thermophile (45-50C [168]), s a Rhizomucor miehei (35-45C
[169]).
baktriumok: thiobacillusok (acidophilek), bborbakt: (fotoszint), cianobakt, actinomicetk.
tovbb algk, protozok, sbaktriumok
Elforduls: geotermikus hforrsok (gejzrek), spontn meleged szubsztrtok (sil), fttt krnyezet
(ermvi htvz), talaj, desvzi s tengeri ledkek (1.2.2. tblzat)
Mintavtel: gyakran obligt anaerobok (pl.: Thermotoga maritima), hiszen vagy az lhelyk
levegtl elzrt, vagy a magas hmrskleten nem olddik be az oxign a vizes kzegbe,
ezrt a mintavtelhez Hungate-technika (ld. Anaerobok izollsa) javasolt.
Elkszts: prologtat szksges, hogy ne szradjon ki a tenyszet a magas hmrskleten
Tpkzeg: komplex tpkzeg ajnlott, amelynek sszettele az eredeti lhelynek megfelel
(mlytengeri, vulkanikus stb.). A szoksos szilrdt gens (agar-agar) legfeljebb 65C-ig
hasznlhat, efelett gelln gumi (100C) vagy gelrite (+Ca2+ s Mg2+ sk) hasznlata
javasolt a magasabb olvadspont miatt.
Inkubls: prologtat, esetleg anaerob kamra lehet szksges.
www.tankonyvtar.hu
20
Ipari mikrobiolgia
faj
Thermoproteus spp.
Thiobacillus spp.
Clostridium spp.
Thermoanaerobium spp.
Thermus spp.
Bacillus spp.
Thermotoga spp.
Bacillus spp.
Thermoactinomyces spp.
Streptomyces spp.
Thermomyces spp
Talaromyces spp.
Thermoascus spp.
Clostridium spp.
Thermomonospora spp.
Thermus spp.
Dactilarya spp.
Methanospirillium spp.
Methanogenium spp.
Thiobacillus spp.
Bacillus spp.
Lactobacillus spp.
Clostridium spp.
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
sbaktriumok
baktrium
baktrium
fonalas baktriumok
fonalas gomba
fonalas gomba
fonalas gomba
baktrium
baktrium
baktrium
fonalas gomba
sbaktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
baktriumok
Trzsfenntarts
A termszetbl izollt s/vagy mutcikkal nyert szntenyszetek fenntartsa szintn kiemelked
fontossg terlete az ipari mikrobiolginak. Gondoljuk csak meg, hogy egy mkd zemnl, ahol
lehetleg sajt izolls vagy fejleszts termel mikrobt alkalmaznak, micsoda kvetkezmnye
lenne a termel trzs elvesztsnek, tnkremenetelnek. Ennek szem eltt tartsval teht a
trzsfenntarts clja, hogy eredeti llapotban, azaz ugyanolyan szaporod s termelkpessg
formban tartsa fenn a termel trzset az zem indtstl a bezrsig, kedvez esetben akr
vtizedekig (persze kzben mindig kicsit jabb s jabb fejleszts sejtvonalat hasznlnak, de a trzs
ltalban azonos marad).
Az izoltumok eltartsra ktfle md ltezik: A) inaktv, s B) aktv formban.
Az aktv formban trtn trzsfenntartst mutatja be az 1.2.3. vide.
www.tankonyvtar.hu
21
aktv formja a liofilezst (fagyasztva szrtst) kveten kapott sejtpor. Az eljrs lnyege, hogy
kmletes fagyasztst kveten a tpkzegbl s a sejtekbl egyre nagyobb vkuum alkalmazsval
elszublimltatjk a jeget, s vgl csak a szrazanyag-tartalomnak megfelel por marad vissza. A
kmletes fagyaszts kvetkeztben azonban a sejtmembrn nem srl, gy steril folyadk (vz,
fiziolgis soldat, puffer vagy tpkzeg) hozzadsval a sejtek rehidratlhatak, s ismt
tenyszhetek. Ezt az eljrst hosszabb tv (vtizedes) trols esetn alkalmazzk, pldul a
trzsgyjtemnyekben, gy az onnan beszerzett mikrobk rendszerint ilyen formban kerlnek a
megrendelhz.
A mindennapi hasznlat sorn azonban aktvan nv tenyszeteket hasznlnak, amelyek
szaporodsi sebessge a htszekrny 6-10C-os krnyezetben rendkvl lelassul, gy ltalban kb. 1
hnapig eltarthatk tlregeds nlkl. Ehhez Petri-csszbe nttt, megszilrdtott (pl.: agaros)
tpkzeget lehet alkalmazni, vagy helytakarkossg okn, illetve anaerob esetekben kmcsben s
esetenknt ferdn szilrdtott tpkzegen trtnik az eltarts. Az anaerob esetekben a tenyszet fl
paraffinolaj rtegezse is bevett szoks, illetve gyakran a szoksos agarfelsznre olts helyett olttvel
szrt tenyszeteket hoznak ltre (1.2.4. bra).
www.tankonyvtar.hu
22
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
23
www.tankonyvtar.hu
24
Ipari mikrobiolgia
Egy japn gygyszergyrban j enzimtermel mikrobt kerestek szrvizsglattal. A cl a 7aminocephalospornsav (7-ACA) oldallnc-mdostsval flszintetikus cephalosporinszrmazkok ellltsa volt, amihez 7-ACA-deacetilz enzimre volt szksg. A 7-ACADA
enzimtermelk kivlogatsa rdekben a tptalajba 7-ACA-t adtak egyedli sznforrsknt,
gy csak az ennek hastsra kpes mikrobk szaporodhattak el. A vizsglt klnbz fajok
kzl a Rhodotorula glutinis leszt kerlt ki gyztesen a feladatra.
3.
www.tankonyvtar.hu
25
www.tankonyvtar.hu
26
Ipari mikrobiolgia
Trzsfejleszts
A fermentcis iparban kevs termszetbl izollt eredeti mikrobt hasznlnak. Mivel egy
fermentcin alapul technolgia kltsgt alapveten befolysolja a termel mikrobatrzs
hatkonysga (hozam, produktivits, vgtiter), ezrt klnsen a rgebbi technolgik az eredeti
termel trzset mra mr jelentsen tovbbfejlesztettk. Noha a felsorolt 3 kulcsparamter (hozam,
produktivits vgtiter) jelentsen javthat technolgiaoptimlssal (pH, oldott oxign, hmrsklet,
kevers, lptk stb.), de csak bizonyos korltokig, m jobb termel trzzsel optimls utn mg sokkal
jobb hatkonysg rhet el.
Mivel a fenotpusos tulajdonsgokat a genom (genotpus) hatrozza meg, ezrt ezt kell megvltoztatni a fejleszts rdekben.
Klasszikus trzsfejleszts
www.tankonyvtar.hu
27
www.tankonyvtar.hu
28
Ipari mikrobiolgia
Mivel ezen a terleten gyakran esik sz egy szervezet valamilyen tpus molekulinak
sszessgrl, ezrt ezekre a kszletekre a gngenom analgijra -om vgzdssel (angolban
omics) bevezettek tovbbi fogalmakat. A gngenom fell indulva az RNS-kszlet kvetkezik
transzkriptom elnevezssel, majd a proteom (fehrjekszlet), illetve az ezek regultorainak sszessge,
az interaktom (klcsnhatk). Bevezettk tovbb a metabolitok sszessgre a metabolom s a
fluxusok sszessgre a fluxom elnevezseket is.
A biolgia kzponti alapelve (central dogma of biology), hogy az informci a DNS-en
troldik, onnan rdik t az RNS-re, amirl pedig a fehrjk szintetizldnak. Kiderlt azonban, hogy
szmos olyan szablyozsi funkci ltezik, amelyek miatt egy-egy gnhez nem lehet egyrtelmen
funkcit rendelni. Ezrt ltre jtt egy j kutatsi terlet a funkcionlis genomika (functional genomics),
amelynek feladata, hogy egy adott gn ltal kdolt fehrje funkciit feltrkpezze. Ehhez azonban
szksges volt a sejten belli folyamatok analitikjnak fejldsre.
Az anyagcsere-mrnksg legfbb clja, hogy genetikai manipulcikkal fejlessze a termel trzs
metabolikus fenotpust. A kapott fenotpusok ennek ellenre gyakran szuboptimlisak s nem
kielgtek a genetikai mdostsok kzvetett hatsai vagy ismeretlen szablyoz klcsnhatsok
miatt. Ezrt ersen ajnlott a teljes metabolikus szablyozst figyelembe venni az anyagcseremrnksg sorn.
A metabolizmus szablyozsa vagy enzim, vagy gn szinten fordul el. Utbbi globlis
szablyozk s/vagy szigmafaktorok hatsa alatt ll. A gnszablyozsok vltoznak az idvel a
tenysztsi felttelektl vagy a sejt llapottl fggen. A klasszikus metabolikus mrnki
megkzeltsek egyik htrnya, hogy ezt nem veszik figyelembe, vagy kevs figyelmet tulajdontanak
ennek.
Bsges informci ll rendelkezsre a loklis genetikai szablyozsrl s a sejtmetabolizmus
biokmijrl, illetve fiziolgijrl, de meglepen keveset tudunk a teljes anyagcsere tfog
szablyozsrl. St, noha a HTS technikkban benne van a lehetsg, hogy a transzkriptomok,
proteomok, metabolomok s fluxonomok kztti mehanizmust feltrja, tbbsgk csak pillanatkpet
ad egy llapotrl, s az a mdszer, ami a klnbz szint informcikat egysgbe foglaln mg
ismeretlen. gy mg mindig messze vagyunk a szablyozsi elvek sejtszint megrtstl. Br mr
sikerlt megalkotni az Escherichia coli teljes sejtmodelljt, mg fontosabb vlt az in vivo vizsglatok
analzise s a posztgenomikai kutatsokhoz a sejtek egsz rendszernek egyttes kezelse. Ezen cl
elrshez fontos az anyagcsere tfog szablyozsnak vizsglata a klnbz szintek (genom,
transzkriptom, proteom stb.) informciinak integrlt figyelembe vtelvel
A legfontosabb informci a komplex anyagcsere-szablyozs mechanizmusnak megrtsben a
centrlis anyagcsere fluxusainak eloszlsa lehet, mivel ez a gn- s fehrjeexpresszi (vagy
enzimaktivits) s az intracellulris metabolitok kifejezdse. A metabolikus fluxus analzise a kulcsmetabolitok anyagmegmaradsi elvn alapszik. A sejten belli fluxusokat a mrt fluxusokbl
anyagmrlegek segtsgvel hatrozzk meg. A mrhet kls fluxusok szma korltozott, s a
szthiometriai korltok miatt gyakran alulhatrozott algebrai rendszert kapunk. Ezrt kofaktor
anyagmrlegeket is nha be kell vonni a szthiometriai modellbe, vagy egy optimalizland objektv
fggvnyt kell bevezetni. A centrlis anyagcsere anabolikus s katabolikus funkcikat is ellt (felpt
s lebont is), hiszen kofaktorokat s ptkveket szolgltat a makromolekulk szintzishez
(anabolizmus), csakgy, mint az energiatermelshez (katabolizmus). Az optimlst a katabolizmus
vagy az anabolizmus, vagy mindkett szempontjbl el lehet vgezni a szthiometriai korltok
mellett. A fluxusmrleg-analzist szleskren hasznljk a steady state (llandsult llapot)
metabolikus fluxusainak becslsre a sejtnvekeds maximalizlsnak rdekben. Az E. coli szinte
optimlisan hasznostja a sznforrst, ami ennek a trzsnek a klnleges elnye. Ennek ellenre a
fluxusszmtsok pontossga a kofaktorbecslsek megbzhatsgtl fgg, s a megfelel objektv
fggvnyvlasztstl. Ismeretlen reakcik jelenlte, amely kofaktort generl vagy fogyaszt,
rvnytelentheti azt a megkzeltst, hogy a kofaktor koncentrcija egyenslyban marad, s a
kivlasztott objektv fggvny nem lesz megfelel, vagy a megbzhatsga csak bizonyos sejtllapotokra fog korltozdni.
Egy alternatv megkzelts az izotp-nyomkvets, ami mrhet mennyisgeket hatroz meg az
intracellulris fluxuseloszlshoz kapcsoldan. Izotppal jelzett szubsztrtot lehet adni a sejtnek, s a
www.tankonyvtar.hu
29
www.tankonyvtar.hu
30
Ipari mikrobiolgia
piruvt-oxidz) is ecetsavat llt a sejt el, elbbi esetben ATP is keletkezik. A glkz elfogysa utn
az ecetsavat visszaalaktja a sejt ATP segtsgvel acetil-CoA-v, s a citrtkrn s a terminlis
oxidcin keresztl energiatermelsre fordtja. Mivel az ecetsavkpzds jelents szubsztrthnyadot
elhasznl, illetve citotoxikus metabolitknt a sejtnvekedst gtolja, a kikszblse alapvet
fontossg az E. coli-val vgzett rekombinns (heterolg) fehrjeexpresszi s -elllts sorn.
Az egyik lehetsg, hogy cskkent aktivits glkztranszferrel rendelkez mutnsokat kell
ltrehozni a piruvt akkumlcijnak elkerlsre, vagy lehet a glkzkoncentrcit rtpllsos
technika segtsgvel alacsony rtken tartani, illetve lehet a foszfotranszferz rendszer (PTS) glkzspecifikus enzimnek expresszijt cskkenteni egy represszor molekula expresszltatsval. Ezeken
fell lehetsg van a citrtkr s a glioxilt ciklus intenzifiklsra is. Ez utbbi enzimeit az aceBAK
gn kdolja az izocitrt-dehidrogenzzal egytt. Ez a gn ecetsavon vagy zsrsavakon trtn
nvekedskor aktv, glkzon, glicerinen s piruvton represszlva van. A regulon transzkripcis
faktorai kzl a fadR mutcijval elrhet, hogy az utbbi sznforrsokon is aktv legyen az aceBAK
gn. gy teht a citotoxikus s szubsztrtvesztesget okoz ecetsav kpzdse kikszblhet az E.
coli-nl (1.2.9. bra)
1.2.9. bra: E. coli ecetsav kpzsnek elimincija: A) glkz transzfer deficiens mutns,
B) aceBAK gnekkel megnvelt glioxalt- s citrtkr- aktivits.
www.tankonyvtar.hu
31
A tejsav fermentatv ellltsnak rgta ismert problmja, hogy a jl termel lactobacillustrzsek igen sszetett tpanyagforrsokat (pl.: lesztkivonat) ignyelnek, amelyek viszonylag
kltsgesek, s feleslegk drgtja, illetve nehezti a downstream folyamatokat.
Ezrt E. coli-t is mdostottak gy, hogy elfogadhat tejsavtermelv vljon. Ehhez a trzs
glkz- specifikus PTS fehrjjnek, illetve a piruvt-formit-liz enzimnek, valamint a sajt lakttdehidrogenznak gnjt inaktivltk, s egy lactobacillus eredet L-LDH (laktt-dehidrogenzt)
expresszltattak vele. gy az E. coli alkalmass vlt tbb mint 70 g/L koncentrciban tejsavat
termelni 77%-os hozammal ecetsav, etanol, formit s D-tejsav nlkl.
G
L
I
K
O
L
Z
I
S
Terminlis
oxidci
1.3.1. bra: A mikrobk centrlis anyagcserje
A kzponti anyagcseret sorn a sznforrs lebontsa (pl.: cukrok) a glikolzissel kezddik s a
piroszlsavig tart. Az ebbl kpzd acetilcsoport lp be a citrtkrbe, ahol az oxlecetsavval
sszekapcsoldik, s a kpzdtt citromsav kt lpsben dekarboxilezdik, s CO2 kerl kibocstsra
(ld. 1.1.4. bra). A citrtkr sorn a szn-dioxid-tvozs mellett reduklt koenzimek is keletkeznek
(NADH2), amelyek a terminlis oxidciban a lgkri oxign segtsgvel a respircinak nevezett
folyamatban regenerldnak jelents ATP energia keletkezse kzben. Ha a mikroba lgkri oxignt
hasznl, akkor gyakran tallkozik peroxigykkkel, amelyek igen reaktvak, s gy krtkonyak a
sejtekre. Ezek kzmbstsre az aerotolerns s/vagy aerob mikrobk katalz enzimeket termelnek
(gyakran peroxiszmban), amelyek a kros peroxidgykket rtalmatlantjk.
A fermentatv anyagcsere esetben azonban nincs lehetsg a lgkri oxign felhasznlsra a
reduklt koenzimek regenerlsa cljbl gy energianyersre sem, ezrt klnbz szerves vegyletek (metabolitok) segtsgvel trtnik meg az oxidci s a kisebb mrtk, de nlklzhetetlen
3
Lsd Sevella Bla: Biomrnki mveletek s folyamatok. Budapest, Typotex Kiad, 2011
www.tankonyvtar.hu
32
Ipari mikrobiolgia
Lsd Sevella Bla: Biomrnki mveletek s folyamatok. Budapest, Typotex Kiad, 2011
www.tankonyvtar.hu
33
www.tankonyvtar.hu
34
Ipari mikrobiolgia
Szilrd
rszecskk
Trzs
Kevers
Spra kora
Polimerek
Tpkzeg
pH
Spra konc.
Pellet kpzds
1.3.2. bra: A pelletkpzdst befolysol tnyezk
www.tankonyvtar.hu
35
www.tankonyvtar.hu
36
Ipari mikrobiolgia
5. Butanolos erjeds
Butanol fermentcis ton ktfle anyagcservel is keletkezhet: A) hexzok bontsbl a
glikolzisben piroszlsav keletkezik, amelynek acetilcsoportjt a koenzim-A (CoA) a
citrtkrbe szokta vinni, m kt acetil-CoA-bl aceton keletkezhet, illetve hrombl butirilCoA, majd abbl butanol, s emellett kzvetlenl a piroszlsavbl etanol (=ABE), valamint
a citrtkrben szn-dioxid; B) izopropil-alkohol kpzdik egy dehidrogenz-enzim segtsgvel az acetonbl a butanol s az etanol mellett (=IBE)
A technolgia nehzsge, hogy a butanol ersebb sejtmreg mg az etanolnl is, ezrt csak
igen kis koncentrciban halmozzk fel a termel mikroorganizmusok (0,5-1,0% ~10 g/L).
Emiatt desztillcis, extrakcis s kihajtsos (strippels) technolgik szksgesek a feldolgozsi mveletek sorn, amelyek viszonylag magas fajlagos kltsget eredmnyeznek.
A legltalnosabb butanoltermel mikroba az anaerob mezofil Clostridium acetobutylicum.
Ipari butanolos fermentcik az I. vilghbor utni nmet hadiipar szmra termeltek
butanolt, a ksbbiekben a kolajalap technolgik alacsonyabb kltsgei miatt a butanolfermentcis zemeket bezrtk. Napjainkban azonban a bioetanol analgijra szintn
energiahordozknt li renesznszt biobutanol elnevezssel immr a genetikai ismeretek
kiaknzsval a butanol fermentcis ellltsa.
6. Diolok, triolok, poliolok erjesztses ellltsnak ttekintse
A) etilnglikol: toxikussga ellenre a borhamists kulcsvegylete, szintetikusan olcsbb az
ellltsa
B) 1,3-propndiol: (bvebben: 1.1.fejezet 1,3-propndiol elllts) az enterobakterek,
klosztridiumok, egyes tejsavbaktriumok s egyes citrobakterek fajai kpesek anaerob
krlmnyek kztt a glicerinbl (a bels redox egyensly megrzsnek rdekben) 1,3propndiolt ellltani, mikzben a reduklt NADH2 koenzimet visszaoxidljk. Az 1,3propndiol minden esetben heterofermentatv anyagcservel keletkezik, azonban a
mellktermkek a termel mikrobra jellemzek (pl.: 2,3-butndiol a Klebsiellkra, vajsav
a Clostridiumokra stb.). Glkz kofermentcija gyakran segti az 1,3 propndiol
kpzdst (mert tbb NADH2 keletkezik a glkz lebontsakor, amit a propndiol tnak
kell regenerlni.)
C) 2,3-butndiol: az enterobakterek jellegzetes termke, amely 2 piroszlsavbl keletkezik.
Gumigyrtsra s metil-etil-keton (MEK) ellltsra hasznljk, amely utbbival az
zemanyagok oktnszmnvelse rhet el.
D) Glicerin (triol): lesztk glkzbl termelhetik akr ftermkknt is. A bor erjedsekor is
keletkezik pl.: Saccharomycesek, Pichik kzremkdsvel. A glicerin felel a bor testessgrt, ppen ezrt a bor glicerines feljavtsa borhamistsnak minsl. A glicerin
rgen a szappanfzs mellktermke volt, napjainkban egyes biodzeltechnolgik
(metanollal trtn nvnyolaj tszterezse estn) mellktermkeknt keletkezik nagy
mennyisgben nmileg szennyezett (metanol, kataliztor, lg stb.) formban.
E) Xillit: xiln hidrolzisvel xilz nyerhet, amelybl pl. Pichik segtsgvel xillit llthat
el, s destszerknt forgalmazhat.
F) Szorbit(ol): lesztk (pl.: Zymomonas mobilis) kpesek glkzbl az etanol mellett
szorbitot (az ol vgzds az angolbl ered, magyarul enlkl is hasznlatos, ez esetben
szorbit) ellltani.
Fentiekben teht klnbz anaerob fermentcit, erjesztst soroltunk fel. A levegztets
problematikja a szubmerz (folyadk fzis, szuszpenzis) fermentcik ta ll fent, s egy msik
klasszikus fermentcis technikval a felleti vagy szilrd fzis fermentcival rszben
kikszblhet.
www.tankonyvtar.hu
37
www.tankonyvtar.hu
38
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
39
A fenti reaktorokat mind azzal a cllal fejlesztettk ki, hogy a lehet legegyenletesebben szolgljk ki
a tenyszet ignyeit, s ugyanezen clbl legyen beavatkozsi lehetsg, azaz bizonyos paramtereket
szablyozni lehessen. Szablyozni lenne rdemes a pratartalmat, oxignkoncentrcit, pH-t,
hmrskletet.
Az albbiakban nhny pldt sorolunk fel ipari szilrdfzis fermentcira.
A) lelmiszerek ellltsa: Penicillium camember, Aspergillus sojae
B) Enzimek ellltsa: -amilzok, protezok Aspergillus oryzae-vel, cellulzok, pektinzok
Aspergilus niger.
C) Nvnyvdszerek: bioinszekticid Beauveria bassiana (ld. ksbb), biopeszticid
Fusariumok- ellen antagonista gomba (Trichoderma harzianum) termelse SSF technikval.
D) Csiperke (Agaricus bisporus) s laska (Pleurotus ostreatus) gombk termesztse.
E) Komposztls kevert tenyszettel, szabadban. Fontos a leveg arny s a pratartalom.
nmeleged folyamat. Alkalmas technika a szennyvziszapok (veszlyes hulladk)
kezelsre.
www.tankonyvtar.hu
40
2.
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
41
ismert volt, hogy metn oxidcijval hangyasav vagy formaldehid keletkezik, de az j reakcimechanizmussal e kt termk reakcijt is lehetett magyarzni, amely reakci viszont metanolt termel
(2.1.1. bra).
www.tankonyvtar.hu
42
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
43
www.tankonyvtar.hu
44
Ipari mikrobiolgia
OH
OH
OH
HO
OH
OH
OH
OH
OH
OH
OH
D-gluco
OH
OH
D-glicero
www.tankonyvtar.hu
45
1) savas kiolds (pl.: Zn), 2) lgos kiolds (pl.: Al), 3) magas hmrsklet kiolds (pl.: S2-), 4)
kiolds komplex kpzssel (Au).
Ilyen kioldsi folyamatot kpesek a mikrobk is elidzni (bioleaching), pldul a kalkopirit
(2.1.8. bra, legelterjedtebb rzsvny, CuFeS2)-bl a rz kioldsra kpesek az Acidiphilium-trzsek
(A. multivorum, A. cryptum, A. organovorum) a 2.1.1. egyenlet szerint. Az Acidiphiliumok az alfaproteobakterek kz tartoz valdi baktriumok.
2.1.1. egyenlet
Ezeket a szokatlan s nemrgiben felfedezett mikrobkat Peng s mtsi [16] a kvetkezkkel jellemezte: Gram-negatv sprtlan plck, amelyek hmrskleti optimuma 40C, pH optimuma 3,5 (!).
A tenysztskhz hasznlhat tpkzeget a 2.1.1. tblzat mutatja be, amelyen 40 ra alatt lezajlik a
fermentci.
2.1.1. tblzat: Acidiphiliumok tpkzege
Komponens
(NH4)2SO4
MgSO4*7H2O
K2HPO4
KCl
Ca(NO3)2
Szerves anyag
leszt kivonat
Koncentrci
(g/L)
3
0,5
0,5
0,1
0,01
2
0,01%
A tenyszetet FTIR-rel vizsglva megllaptottk, hogy polihidroxibutyrate-ot termel. J nvekedst tapasztaltak ramnz, xilz, mannit, fruktz, glutaminsav s glicerin sznforrsokon, de ntt szaharzon, laktzon, hisztidinen, glutaminon s etanolon is.
Tetraciklinnel s ampicillinnel szemben rzkenynek talltk ezeket a mikrobkat, mg a sejtfalszintzist gtlkkal (penicillinek cefalosporinok) szemben nem.
Nmeth ron, BME
www.tankonyvtar.hu
46
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
47
www.tankonyvtar.hu
48
Ipari mikrobiolgia
Antagonizmusok kialaktsa
1A) gomba s baktrium kzdelme sorn a Cephalosporium gramineaum fonalas gomba a
baktrium sejtfalszintzist gtl antibiotikumot termeli, de csak az szi bza felsznn (in
vitro Petri csszn nem)
1B) mikoparazitizmus: egyik gomba a msik lskdje. Pl.: az szaki feny parazitja egy
rozsdagomba (Monocillin nordinii), amelyen lskdik a Cronartium coleosporioides gomba,
s ezt antibiotikum termelssel ri el. Ezt az antibiotikumot fel lehet hasznlni a fenykrtev ellen.
1C) bakterilis predci ll fenn a Mixobaktriumok s ldozataik kztt, amely utbbiakat
antibiotikum segtsgvel lik el
Olykor elfordul olyan is, hogy sajt fajtrsai ellen termel antibiotikumot egy mikroba, pl.:
Pseudomonas phenazinium (fenazin tpus antibiotikumot termel), s az antibiotikumot nem
termel fajtrsaikat alaposan tlnttk.
1D) bakterilis kompetci: az ambk ltalban baktrimokat esznek, de egyes baktriumok (pl.:
Serratia marcescens) piros pigmentanyagot termelnek, ami elli a protzot (az albino, azaz
pigmentmentes fehr baktrium nem vltott ki cisztsodst, sprakpzst pusztulst az amba
rszrl)
1E) mikroorganizmus klcsnhatsa magasabb rend llnyekkel: gyakran toxintermels
(nvny ellen fitotoxin, ami gyakran ms mikrobkra is antagonizmussal hat, mintegy
antibiotikum), amire a nvny fitoalexin (~nvnyi antibiotikum) kivlasztsval vlaszol.
1F) mikrobk inszekticid hatsra plda a Beauveria bassiana (fonalas gomba) rovarok ellen,
illetve a Bacillus thringiensis endosprjnak ciklikus -toxinja a sznyogok ellen.
A kullancsok is rendelkeznek letalitssal jr gombs parzitval. A kullancsok termszetes
ellensgeinek felhasznlsa a kullancspopulci visszaszortsa rdekben a Biokontroll.
Mivel 4 ellensgt ismerjk a kullancsoknak, k a potencilis jelltek a biokontroll-funkci
betltshez.
sisakos guineai madr kullancsokkal tpllkozik, m ha sikerlne vele kullancsltszmot
cskkenteni, akkor a madrpopulci is cskkenne, ettl megint nhetne a kullancsok
szma, ekkor a madarat jra kellene telepteni
b) kullancsok rovar parazitja az Ixodiphagus, amely a darzsflkhez tartozik, s 0,1-5
mm-es nagysg. Petit a kulllancsba rakja, amelyek kikelskkor meglik a kullancsot
c) fonalfreg- (nematda) parazitval, de ez csak a vrrel magt jl teleszvott nstny
kullancson hat
d) fonalas gombk parazitizmusa: Metarhizium anisopliae (zld mszkr), Beauveria
bassiana (fehr mszkr), Lecanicillium psalliotae, Paecilomyces fumoroseus).
A Metharizium anisopliae [18] mr rendelezik ipari felhasznlssal a malriasznyog,
kullancs- s termeszirtsok sorn. Az imperfect gombk aszkomiceta csoportjba
tartozik. 2007 ta ipari lipztemel is, mert az indiai biodzelgyrts sorn
szobahmrskleti optimummal rendelkez lipzokra volt szksg. Inszekticid hatsnak
kifejtsekor megkapaszkodik a konidiosprja a rovar felsznn, s kutikulumbont
enzimekkel hift nveszt a rovar kltakarjba. Amint tr a rovar pncljn, tallkozik
annak immunrendszervel, ezrt vagy maszkroznia kell magt, hogy az immunrendszer
ne tasztsa ki, vagy immunszupressznsok termelsvel cskkenti az immunrendszer
hatkonysgt.
A M. anisopliae metabolitjai a destruxinok, amelyek 5 aminosavbl s hidroxisavbl
felpl cirkulris fehrjk. Ez lehetsget teremt a rekombinns biopeszticid termelsre.
A destruxinok egybknt citotoxikusak, mert Ca2+ transzportot vgeznek, s gy az
izmokat is blokkoljk. Mr tbb mint 30-fle destruxin szerkezett dertettk fel s rtk
le.
a)
www.tankonyvtar.hu
49
1G) Mikrobk antagonizmusa magasab rend latok (s ember) fel: pldul a fuzriumos bza
nem alkalmas mg takarmnyozsi clra sem, mert a krost fuzriumok mikotoxinokat
termelnek, amelyek mind a haszonllatot, mind az embert veszlyeztetik. A ragadozk is a
mikrobk temelte mikotoxinok miatt esznek ltalban friss hst, kivve a dgevk. A poshadt
vz ivsakor a vzben lv algk termelte toxinok okoznak rosszulltet.
2) Fmionszllt metabolitok
A fmionok (fleg kationok) fiziolgiai szerepe meghatroz, mivel az enzimkatalzis
kofaktorai, ezrt egyes esszencilis fmionok elszvsa a konkurencia ell komoly elnyhz
juttatja a fmionszllt metabolit termeljt. A nitrognfixl baktriumok esetben pldul
a nitrogenz- enzim Mo2+ jelenltben a legaktvabb, ms fmionokkal cskkent aktivits.
A fmionszllt metabolitok ltalban ionofrok, azaz olyan transzmembrn gensek
(tbbnyire peptidek), amelyek az ionok (elssorban alkli, s alklifldfm) ramlst a
sejtmembrnon keresztl meghatrozzk vagy aktv transzporttal, vagy csatornakpzssel.
A vasszllt faktorok (=sziderofrok) sok esetben antibiotikus hatsak. A primer s
szekunder metabolitok hatrn helyezhetk el, mert ugyan nem szksgesek a nvekedshez,
de vashinyos krlmnyek kztt stimulljk a nvekedst. A mikrobasejteknek ktfle
fmszllt rendszere van: egy kis s egy nagy affinits. Utbbihoz tartoznak a sziderofrok
is. Amg van elegend fmion jelen, addig a kis affinits rendszer mkdik. m a fmion
cskkense (pl.: valamilyen keltkpz megjelense miatt) aktivlja a sziderofrtermelst.
Szmos Streptomyces, Nocardia s Micromonospora faj termel sziderofr faktorokat. A
sziderofrok antibiotikus hatsa abban nyilvnul meg, hogy termeljk kihezteti a
konkurencit vas szempontjbl, mivel az nem kpes a vas-szideramin komplex felvtelre,
s gy nem jut vashoz. A sziderofr termelje pedig komplex formban lv vasat veszi fel.
Ilyen antibiotikum a nocardamin s a desferritriacetilfusigen.
Az ionofrok feladata mikrobkban, hogy segtsenek fenntartani a magas intracellulris
K+/Na+ arnyt is, azaz a koncentrci gradiens miatt kijutott kliumionokat visszapumpljk
a sejtbe, mikzben a szintn koncetrcigradiens miatt bejutott ntriumionokat kipumpljk a
kzegbe.
Az ionofr antibiotikumok kz tartoznak az enniatinok is, amelyek a destruxinokhoz
hasonlan ciklikus peptidek s a K+/Na+ transzportban vesznek rszt [20]. Piacon lv
ionofr antibiotikumok a calcimycin, ionomycin, lysocellin s a lasalocid, amelyek a Grampozitv mikrobk ellen hatsosak.
3) Mikroba s nvny szimbizisa szekunder metabolitok segtsgvel
3A) Tipikus plda a nvny-fonalas gomba szimbizisra az ektomikorhiza, ahol a nvnyi
tpanyagfelvtelt a gykr krl elhelyezked fonalas gomba segti. Ilyenkor gyakran (pl.:
fenyflknl) termelnek a nvny vdelme cljbl antibiotikus hats szekunder
metabolitokat a baktriumok ellen, cskkentve a betegsgveszlyt, s elnyhz juttatva a
szimbizist a tpanyagversenyben.
3B) Sziderofrok segtsgvel baktriumok is lhetnek nvnyekkel szimbizisban, ahol a
sziderofrt termel baktrium segti a nvny nvekedst. A pszeudobaktin termel
Pseudomonas fluorescens vagy Pseudomonas putida pldul elszvja a vasat a krokozk
ell egy lineris hexapeptid (sziderofr) segtsgvel.
4) Mikroba -nematda szimbizisa szekunder metabolit segtsgvel
Xenorhabdus luminescens baktrium s rokonai a Xenorhabdus fonalfrgek endoszimbioniti. Ez a szimbizis egytt tmadja meg a rovarokat, amelyeket a baktrium ltal termelt
antibiotikum pusztt el, s amely antibiotikum a tbbi baktriumot is tvoltartja a rovartetemtl.
www.tankonyvtar.hu
50
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
51
www.tankonyvtar.hu
52
Ipari mikrobiolgia
HO
HO
HO
Szitoszterin
Sztigmaszterin
Kampeszterin
www.tankonyvtar.hu
53
17--oxidci
Penicillium crustosum, P.chrysogenum
B. stearothermophilus, B. obtusa,
P. blakesleeanus
Botrytis cinerea, Rhizopus stolonifer
Absidia glauca
Cephalosporium aphidicola, R. stolonifer
A. glauca, B. obtusa
Bacillusok
A. glauca, Aspergillus fumigatus, B. obtusa
www.tankonyvtar.hu
54
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
55
Mycobacterium smegmatis
, 85% H3PO4
HO
+H2O
OH
HO
HO
H2O
Szitoszterin
9-hidroxi-androsztndion
O
HO
HO
HO
OH
O
CH
CH
HO
HO
Klium+acetiln
HO
HO
-hidroxi-androsztndion
O
Hidrokortizon
11-hidroxi-etiszterol
OH
O
HO
HO
OH
HO
HO
HO
Arthrobacter simplex
O
O
Hidrokortizon
O
Deperzolon
Prednizolon
OH
O
HO
O
O
O
Triamcinolon-acetenonid
(Ftorocort kencs)
www.tankonyvtar.hu
56
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
3.
57
www.tankonyvtar.hu
58
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
59
megvizsglni az tvolsgukat a kzs ponttl, majd a tbbi vizsgland faj tvolsgt ugyanettl a
ponttl, azutn kezddik ellrl, de az elbb felismert szomszdokat egyknt kell kezelni az j
tvolsgi mtrix felrsakor. Egy msik algoritmus a maximum likelihood (ML legnagyobb valsznsg mdszere) mdszer, amely standard statisztikai megkzeltssel vizsglja a legvalsznbb
elgazsokat [30]. Egy harmadik szleskren hasznlt mdszer a maximum parsimony (MP legnagyobb takarkossg mdszere), amely a legkevesebb evolcis esemnyt keres algoritmus.
A filogenetikus analzis eredmnyeknt rajzolhat fel a filogenetikus fa, amelyen az elgazsok
tvolsga egyenesen arnyos az elgazs vgpontjain lv mikrobk genomazonossgval. Egy filogenetikus ft mutat a 3.1.2. bra (lsd mg a 63. oldalon).
Az els fontos lps a mikrobk trzsfejldsnek megrtsben a megfelelen objektv kritriumok keresse a fbb rendszertani csoportok definilshoz. Jelenleg a baktriumokat mintegy 23
fbb csoportba, azaz trzsbe soroljk, a 16S rRNS fik alapjn. Nmely ezen trzsek kzl csupn nhny fajt tartalmaz (pl.: Thermomicrobia, Chrysiogenetes, Fibrobacteres, Deferribacters), mg msok
mint pldul a Proteobaktriumok, Bakteroidk, Cianobaktriumok, Actinobacterok (nagy G+C
tartalm Gram-pozitvak) s a Firmicutes (kis G+C tartalm Gram-pozitvak) nagyon nagyok, s
fajok ezreit szmlljk, idertve az ismert baktriumok tbb mint 90-95%-t. A kisebb trzsek (pl.:
Fibrobakterek, Chlorobi) valamikor valamelyik nagyobb bakterilis csoport rszeknt kerltek besorolsra a kzs morfolgiai/fiziolgiai jellemziknek megfelelen, de ksbb levlasztottk ket a
16S rRNS trkp alapjn.
Bakterilis filogentika [27]
A mikrobiolgiai rendszertanban a Woese-fle reformok (1990) ta a besorolsokat a kvetkez
csoportokba teszik meg: domn (domn)>kingdom (kirlysg)>phyla (trzs)>class (osztly) >order
(rend)>family (csald)>genus (nemzetsg)>species (faj). Az ipari mikrobiolgiban hasznlatos
trzs kifejezs gyakran nem a fenti rendszertani csoportra utal, hanem arra, hogy egy adott faj sejtvonalrl van sz (valamely egyed leszrmazottai). Minimlis eltrsek (pl.: termk hozamban) lehetnek egy adott faj sejtvonalai kztt is. Azoknl a mikrobknl, amelyeket alaposan tanulmnyoztak
mr, elfordulnak a fajon bell alfajok (v. fajtk vagy varinsok), s azoknak is lehetnek klnbz
sejtvonalaik, trzseik.
Azt, hogy milyen tulajdonsgok hatrozzk meg a trzs besorolst alacsonyabb rend csoportokba, mint pldul osztlyba, rendbe vagy csaldba, sosem definiltk egyrtelmen a tudomnyos
vilgban. ppgy, mint azt a krdst, hogy mi alkot egy aldivzit vagy osztlyt egy trzsn bell.
Pldul, a Proteobakterek trzst jelenleg 5 aldivzira (vagy osztlyra) osztjk, nvszerint , , , s
proteobakterek. Ezek mindegyike fbb csoportokat alkot a baktriumokon bell, s tbbsgk
vilgosan megklnbztethet egymstl, illetve ms baktriumdivziktl, mind filogenetikus
fjukban, mind szmos ms forrsban. Az alacsonyabbrend kategrikba (alkategrik) val
besorols objektv felttelei nlkl nem vilgos, hogy mirt pont ezek a fbb bakterilis csoportok
kerltek aldivziknt (vagy osztlyknt) meghatrozsra, mg ms alig jellemzett csoportok nhny
ismert fajjal fbb trzsknt kerltek lersra. gy a rendszertani besorolsa a klnbz bakterilis
csoportoknak jelenleg teljesen nknyes.
Az a krds, hogy hogyan lehet a legalacsonyabb rendszertani beosztst a baktriumokon bell
definilni, kezdetben egy idelis szempontbl kzelthet meg. Egy idelis osztlyoz rendszerben a
trzs a leszrmazs fbb vonalait mutatja be, s a gykr egy kzs bakterilis st reprezentl. Minden
nagyobb elgazs, amely a trzsbl ered, a fa fbb csoportjait (vagy (mikrobilis) trzseit) jelenti
meg. Egy idelis osztlyoz rendszerben ezen elgazsok sorrendje a trzsn bell ismert, s a rendszer relatv nemzedkeken alapszik. Fontos, hogy ezek a trzsek (vagy elgazsok) vilgosan elklnljenek egymstl a fn val helyk alapjn. Minden szervezetnek, ami egy elgazst alkot,
rendelkeznie kell olyan tulajdonsgokkal, amelyek alapjn ms gak szervezeteitl megklnbztethet. Kisebb gak s gallyacskk, amelyek a fbb gak hajtsai, egyre kisebb rend rendszertani
fokokat reprezentlnak, pldul kisebb gak az osztlyok, rendek, csaldok, gallyak a nemzettsgek,
fajok. Az azonos kisebb gakon lv szervezeteknek tbb kzs tulajdonsga is kell legyen egymssal, mint a f g ms gainak szervezeteivel.
Az eddig f ismertetjegy alapjn meghatrozott fbb csoportok szma minimlis. Mivel azonban
a fajok klnbz elklntett csoportjai, amelyek ugyanazon ponton gaznak el mg akkor is, ha
www.tankonyvtar.hu
60
Ipari mikrobiolgia
nincs egyedlll kzs tulajdonsguk, jelenleg provizrikus altrzseit kpviselik valamely trzsnek.
Ugyanakkor, amint tovbbi ismertetjegy vagy ms informci (ami elklnti ezeket az altrzseket,
vagy egyrtelmv teszi elgazsuk sorrendjt) elrhetv vlik, ezek az altrzsek egyedi trzsekk
lpnek el, vagy kt elklntett trzsre osztjk az eddigit. A legtbb fbb trzs jelenleg is valamilyen
csoportspecifikus ismertetjegy alapjn klnthet el. Ezen kritriumok alapjn a Proteobaktriumok
legalbb 3 f trzsre oszthatk, mindegyikk jl elklnthet a tbbitl, s az elgazsuk sorrendje is
egyrtelm. A -proteobakterek tvolrl rokonai az -proteobaktereknek, de ez a kapcsolat mg
tovbbi finomtsra szorul. A ,-proteobakterek szmos kzs ismertetjeggyel rendelkeznek. Noha
nhny ismertetjegy a -proteobaktereket megklnbzteti, s ksbbi elgazsra utal, a kapcsolat e
kt aldivzi (vagy altrzs) kztt tovbbi tanulmnyozst ignyel. Az ismertet szekvencikon
alapul fabra azt is jelzi, hogy a jelenleg f trzsknt jegyzett Bakteroidk (vagy Citofgok,
Flavobakterek Bakteroida csoport), Chlorobi s Fibrobakterek megbzhatan ugyanazon pontbl
gaznak el, s szmos megklnbztet tulajdonsggal rendelkeznek, amelyek egyedi trzsekk teszik
ket. gy a fentiekben kikttt kritriumoknak megfelelen ezeket a csoportokat egy trzsbe kellene
helyezni, s vagy osztlyokat, vagy rendeket kellene alkossanak ebben a f trzsben. A relatv
elgazsuk ezeknek az alcsoportoknak az FCB trzsn bell szintn jl megllapthat szmos
alcsoport-specifikus ismertet szekvencia alapjn.
A baktriumok trzsnek elgazsi sorrendje
A bakterilis filogenetika kzponti problmja, hogy megrtsk, hogy a klnbz bakterilis trzsek
hogyan kapcsoldnak egymshoz, s hogyan gaznak el a kzs stl. A 16S rRNS vagy ms
fehrje/gn alap filogenetikus csaldfk nem tudtk megoldani ezeket a kritikus aspektusokat, ms
jelents krdssel (pl.: fotoszintzis eredete, eukarita sejt eredete) egytt. Fontos betekintseket nyjtott ebben a tekintetben a konzervlt indelek (=inszercik s delcik) felfedezse s analzise szmos
univerzlisan elterjedt fehrjben. Ezek a konzervlt indelek tulajdonkppen a fvonal ismertetjegyei. Az ezekhez vezet genetikai esemnyeket ltalnosan gy tekintik, mint fontos evolcis
elgazsi pontokat, s ezek eloszlsnak mintzata a fajokban rtkes informcikat szolgltat a fajok
elgazsnak sorrendjrl, s a klnbz trzsek kztti kapcsolatrl.
Az indel modell alapjn fellltott bakterilis filogenetikus fa lthat a 3.1.3. brn (lsd mg a 64.
oldalon).
Egy ilyen indelmintzat-plda tallhat az RNS-polimerz -alegysgn (RpoB). Ez a magja az
RNS polimerznak, s minden fajban univerzlisan konzervldott. Az RpoB homolgok a klnbz
proteobakterekben ppgy, mint az Aquifex, Klamidik, Verrucomikrobk, Planctomycetk s BCF
esetben egy nagy inszertet tartalmaznak a fenti fajokra jellemz konzervlt rgiban, amely inszertet
a tbbi trzs (Spirohtk, Deinococcus-Thermusok, Chloroflexik, Fusobaktriumok, Actinobacterok,
Thermotogk, Firmicutesek) nem tartalmazza. Az inszert hinya az archek (sbaktriumok) RpoB
homolgjaiban egyrtelmen arra utal, hogy amely baktriumokbl hinyzik, azok az sibbek. Fajok
kztti eloszlsmintzata alapjn ez az inszert valsznleg az elbbiek kzs snl keletkezett, gy
ezek (proteobakterek, Aquifex, Klamidik, Verrucomikrobk, Planctomyceszek, s BCF) ksbb
gaztak le a fgrl.
Hasonlan ehhez egy msik prominens indelt azonostottak a DNS-girz B-alegysgn. Ebben az
esetben egy konzervlt, tbb mint 150 aminosavbl ll inszert tallhat a klnbz proteobakterek
s Aquifex, Klamidik, Verrucomikrobk, valamint Planktomiceszek DNS-girz B alegysgn, de nem
tallhat meg a tbbi baktriumtrzs kztk a BCF tagjai kztt. Ez az inszert az archek homolg fehrji kztt sem tallhat meg. Az Rpo s a girz fajok kztti eloszls-mintzatainak sszehasonltsa alapjn megllapthat, hogy a girz indelje az evolci ksbbi fzisban keletkezett, a Fibrobakterek-Chlorobi-Bakteroidk elgazsa utn. A fajok kztti eloszls-mintzat alapjn ez a kt indel
egyrtelmv teszi, hogy a Fibrobakter-Chlorobi-Bakteroidk (BCF) csoportok a Spirohtk,
Deinococcus-Thermus, Chloroflexek, Actibobakterek, Thermotog, s a Firmicutes trzsek utn, de a
proteobaktriumok, Aqificales, Klamidik, Verrucomikrobik s Planktomiceszek eltt gaztak el. A
fenti kt indelhez hasonlan szmos ms fvonalismertet-jegyet fedeztek fel tovbbi univerzlisan
elterjedt fehrjkben, amely ismertetk segtik a baktrium- trzsek elgazsi sorrendjnek megrtst.
Az indelek fajok kztti eloszlsi mintzata alapjn majdnem minden baktriumcsoportot egyrtelmen el
lehet klnteni, s lehetsges logikusan kikvetkeztetni a kzs stl val elgazsaik sorrendjt.
www.tankonyvtar.hu
61
www.tankonyvtar.hu
62
Ipari mikrobiolgia
Gram (-)
baktriumok
(1. Divzi)
Gram (+)
Baktriumok
(2. Divzi)
1.
Coccusok
2.
Plck
1.
Gram aerob
1.
2.
Pseudomonas Legionella
nemzettsg nemzettsg
Plck
Coccusok
2. Gram
- Fak.
anaerob
1.
Enterobacter
csald
Merev sejtfal
nlkli baktriumok
(3. Divzi)
3.
Gram anaerob
2.
Nem
enterobacterek
1.
Bacteroides
nemzettsg
Gram
+
4.
Gram +
endosprs
5.
Gram +
sprtlan
sbaktriumok
(4.
Divzi)
1. Spirlis
2.
3.
4.
s hajtott Spirohtk Riketsia Mycoplasma
bakt.
flk
flk
6. Gram +
sprtlan
szablytalan alak
1.
2.
3.
Staphylococcus Micrococcus Streptococcus
1. Bacillus 2. Clostridium
1.
2.
1.
2.
3.
4.
5.
nemzettsg nemzettsg nemzettsg
nemzettsg nemzettsg Lactobacillus Listeria Corynebacterium Actinomicetk StreptomicetkMycobaktriumokNocardia
(aerob)
(anaerob)
nemzetsg nemzetsg
nemz
1.
2.
7.
1.
2.
Escherichia Salmonella
Proteus
Vibrio
Haemophilus
nemzetsg nemzettsg nemzettsg nemzettsg nemzettsg
www.tankonyvtar.hu
63
www.tankonyvtar.hu
64
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
65
www.tankonyvtar.hu
66
Ipari mikrobiolgia
termoaalkalofil
barofil
(nyomskedvel)
barofil
(nyomskedvel)
Wolfram mint kofaktor
tg=37min
kemnyttranszport-fehrjk
Tartomny
Faj
Pyrolobus fumarii
<113C
<110C
<0C
60-90C
pH 0-4
aerobok
anaerobok
(kevsb savas)
85C
pH 8,5-9
20-30 MPa [32]
20 MPa
103C
Methanopyrus kandleri
Methanogenium frigidum
Acidianus,
Ferriplasma,
Picrophilus,
Sulfolobus,
Thermoplasma
Methanogenium frigidum
Thermoproteus, tenax
Methanothermus fervidus
Thermococcusok
Paleococcus ferrophilus
Thermococcus barophilus
Paleococcus ferrophilus
Thermococcus barophilus
Pyrococcus furiosus
www.tankonyvtar.hu
67
www.tankonyvtar.hu
68
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
69
modellszervezeteknt hasznlnak fel, s 1959-ben volt az els sikeres gntranszfer egy Bacillus
subtilis trzsbe [58].
Gilman A, Goodman LS, Hardman JG, Limbird LE. Goodman & Gilman's the pharmacological basis of
therapeutics. New York: McGraw-Hill (2001). ISBN 0-07-135469-7
6
www.tankonyvtar.hu
70
Ipari mikrobiolgia
Staphylococcuceae (pl.: S. aureus) s a Listeriak tallhatak meg (L. monocytogenes, 3.2.6. bra) a
Bacilliales rendben [64].
www.tankonyvtar.hu
71
www.tankonyvtar.hu
72
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
73
www.tankonyvtar.hu
74
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
75
www.tankonyvtar.hu
76
Ipari mikrobiolgia
-> Golgi), vagy az iker-aginin (Tat > aktv formban membrnon keresztl) transzlokcis ton lehet
elrni.
Egyes Corynebacteriumok lipofilek, azaz zsrban szeretnek szaporodni. A nemlipofileket fermentatvakra s nemfermentatvakra szoks osztani.
Fermentative Corynebacterium-ok:
Corynebacterium diphtheriae group
Corynebacterium xerosis and Corynebacterium striatum
Corynebacterium minutissimum
Corynebacterium amycolatum
Corynebacterium glucuronolyticum
Corynebacterium argentoratense
Corynebacterium matruchotii
Nem fermentative Corynebacterium-ok:
Corynebacterium afermentans subsp. afermentans
Corynebacterium auris
Corynebacterium pseudodiphtheriticum
Lipofilek:
Corynebacterium jeikeium
Corynebacterium urealyticum
Corynebacterium afermentans subsp. lipophilum
Corynebacterium accolens
Corynebacterium macginleyi
CDC coryneform groups F-1 and G
A Corynebaktriumok legkzelebbi rokonai a Mycobacteriumok (Mycobacteriaceae), idertve a
szteroidkonverziban hasznlt M. phlei s a tuberkulzis krokozjt (M. tuberculosis), valamint a
lepra krokozjt (M. leprae) is. Egy rszk lassan szaporodik (fleg a krokozk: marhatuberculzis
(M. bovis), humn tbc (M. tuberculosis 3.2.15. bra), lepra M. leprae)), msok pedig gyorsan (M.
phlei, M. smegmatis). A mikobaktriumok se nem Gram-pozitvak, se nem negatvak, hanem a Gramfestsre furcsn reaglnak, mivel a festkek savas/alkoholos lemossnak ellenllnak (acid-fast). Ezen
kpessgket s mg tovbbi nhnyat (pl.: antibiotikumrezisztencik egy rsze, csak a makrolid
antibiotikumok hatnak) a klnleges mikolsavas sejtfaluknak ksznhetik.
www.tankonyvtar.hu
77
www.tankonyvtar.hu
78
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
79
www.tankonyvtar.hu
80
Ipari mikrobiolgia
Egy hasonl faj az anaerob Petrotoga (3.2.19. bra) olajtartlyokbl izollhat, ami felveti a krdst
mind a mly felszn alatti tllskrl, mind pedig az shonossgukrl ezen a klnleges koszisztmban.
5. Fusobacteriumok
Anaerob, heterotrf, fonalas szervezetek, noha a humn felslgti (torok, garat) szervek norml
flrjhoz is tartothatnak, szmos fertzs krokozi (Fusobacterium necrophorum), ezrt minden
Fusobaktert fertz gensknt kell kezelni. Ennek ellenre bacteriocineket [73], s -laktamzt [74] is
termeltethetnek velk.
www.tankonyvtar.hu
81
8. Chloroflexi
Zld, nem knbaktriumok csoportja, ltalban fonalas morfolgival. A fnyt hasznljk
energiaforrsknt a zld pigmentjeik segtsgvel (nem kloroplaszt!), siklssal (gliding) mozognak.
A fnyhasznost rendszerk a magasabb rend llnyeknl megszokott II-tpus fotoszintetikus
reakcikzpontot hasznlja bakterioklorofillal, a Chlorobi fajaihoz hasonlan. Mg a magasabb rend
fotoszintetizl llnyek vizet hasznlnak elektron- donorknt, addig a Chloroflex-ek H2S-t (mint a
Chlorobi-k) vagy H2-t. A szoksos Calvin-ciklus helyett pedig egy sajtos, 3-hidroxi-propiont ciklust
hasznl a szerves anyagok beptsre. Szemben a szigoran anaerob Chlorobi fajokkal, kpesek aerob
heterotrf anyagcserre vagy anerob fotoheterotrf, illetve anaerob fotoautortf anyagcserre is [78].
Egy tpusfaj a Chloroflexus auranticus (3.2.22. bra), amely termofil baktrium sttben, oxign
jelenltben is szaporodik, s narancsszn. Fny mellett fotoszintetizl, s zld szn telepeket alkot
[76]. Ipari potencilt specilis amilzai jelentenek, amelyek a kemnytt nem maltzra vagy glkzra,
hanem maltotrizra s maltotetrazra (3, illetve 4 tag oligoszaharidokra) bontja, amelyeknek jabban
nagy jelentsge van az lelmiszeripar, gygyszeripar s a finomvegyipar szmra [77]. Ugyanezen
mikroba klnleges 3-hidroxi-piruvt- termel kpessge szintn ipari potencilt rejt, mivel a 3hidroxipiruvt s szrmazkai egy fontos platformot alkotnak, amelyek ellltshoz j megkzeltst
s j enzimeket szolgltathat a Chloroflexus auranticus [79].
www.tankonyvtar.hu
82
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
83
www.tankonyvtar.hu
84
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
85
hatsa, mint a paclitaxel), antibiotikus (pl.: orangicin), illetve sziderofr (Myxochellin) hats
anyagok [147], amelyek komoly (gygyszer)ipari lehetsgeket rejtenek.
Az epszilon-proteobacterek kztt a Campylobactereket s a Heliobactereket talljuk. Mindkt
nemzettsg emsztrendszeri megbetegedseket okoz, a Heliobacterekrl az utbbi vekben derlt ki,
hogy a gyomorfekly krokozja (Heliobacter pylori, 3.2.28. bra), amely fekly utn 6x nagyobb a
gyomorrk kialakulsnak eslye [142]. Ipari alkalmazs vagy annak lehetsge egyiknl sem ismert.
www.tankonyvtar.hu
86
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
87
lehetnek, s cspsk sorn vagy szkletkkel kerlnek t a parazitk az emberbe, ahol a hajszlereket
fertzik meg, s trombzist, szervi mkdszavart eredmnyeznek lz s kitses tnetek mellett
[103]. Mivel obliglt opportunistk, nmagukban nem tenyszhetk mestersges krnyezetben
(fermentorban), csak szveteken. A Brucellzis abortv betegsg, amely a szarvaslb nev betegsget okozza pldul teheneken, ahonnan tejjel vagy srlt brfelleten kerlhet t az emberbe, s
slyos lzas megbetegedst okoz.
A bioetanol-gyrts bakterilis jelltje a Zymomonas mobilis is alfa-proteobcter. Klnlegessge,
hogy sejtfalban hopaninsavat tartalmaz, amely az eukarita szterinekhez hasonlt. Ennek
ksznheten jl tolerlja a magas (13%) etanolkoncentrcit is. Emellett nagyobb etanolhozam s
kisebb biomassza-kpzds tapasztalhat a Z. mobilis etanolos fermentcijban [160].
Beta-proteobacterek
A Hydrogenophilaceae csald tagjai kz tartoznak a Thiobacillus nemzetsg fajai, amelyeket
biokontrollra lehet felhasznlni (pl.: T.denitrificans), mivel knporral trtn egyttes kiszrsuk utn
a krumplifldn a kenet knsavv oxidlja, melyet a krumplibogarak lrvi nem viselnek el [104]. A
Thiobacillus ferrooxidans a piriteloxidlst segti Acidophilumokkal egytt aerob krnyezetben
(respirl mikrobk). Nhny Thiobacillust 2000-ben tneveztek Acidithiobacillus, Halothiobacillus
s Thermithiobacillus nven a gammaproteobakterek kz soroltk. A Thiobacillusok igazi ipari
jelentsgt a szulfit svnyokbl trtn fmfelszabadts (=bioleachig) adja, amelyre plda az
autotrf kemolitotrf Thiobacillus ferrooxidans [105]. A Thiobacillus denitrificans klnleges
metabolikus repertorral rendelkezik: szervetlen kn- vegyletek oxidcijval vagy aerob FeIIoxidcival kapcsolja ssze a denitrifikcit (NO3->NH4+). Fakultatvan vlaszt az aerob respirci
s a denitrifikci kztt, s mezofill, illetve neutrofill hmrskleti s pH-tartomnyokban szaporodik szemben a termo- s acidofil knoxidl baktriumokkal. Az a klnleges mehanizmus, ahogy
az oldhatatlan szilrd svnyt hasznostani kpes mg pontosan nem ismert [106].
A Thiobacillusok kzvetlen rokonai a Hydrogenophilus nemzetsg tagjai, amelyek klnlegessge, hogy energiaszksgletket hidrogn oxidcijval nyerik [171].
A kvetkez csoportot az aerob, fonalas Sphaerotilusok alkotjk, tpusfajuk a Sphaerotilus
natans, ipari alkalmazsuk nem ismert.
ket kvetik a Neisserik, amelyek tipikus krokozk: Neissria gonorrhea (nemi betegsg), N.
meningitidis (agyhrtyagyullads) [107]. A Spirillumok felhasznlsrl nem ll rendelkezsre
informci, viszont a Burkholderia nemzettsg tagjai alkalmazhatk [108] a mezgazdasgban
biokontroll clokra, rhizobilis adalkknt, illetve biodegradciban, valamint xilanztermel is
tallhat kzttk [109]. A nagyobb felhasznlsi kr jobban megrthet, ha figyelembe vesszk,
hogy szinte valamennyi Burkholderia faj a Pseudomonasok jrabesorolsakor kerlt lersra, s
amelyek vizsglata nagyobb mltra tekint vissza, gy alkalmazsuk is szlesebb kr. Plda erre a
Burkholderia cepacia (3.2.31. bra) s B. gladioli, amelyek rendre a Pseudomonas cepacia s a P.
gladioli gamma-proteobacterekhez trtn tsorolsakor kerltek elszr lersra Yabouchi s
munkatrsai (1992) munkssga nyomn. Mindkt trzs lipzforrsknt hasznlatos [110].
www.tankonyvtar.hu
88
Ipari mikrobiolgia
A Burkholderia rendbe tartoznak az Alcaligenaceae csald fajai is, amelyek kztt a Bordatella
pertusis, vagyis a szamrkhgs krokozja is megtallhat. Ennek biotechnolgiai jelentsge a
gyermekkori vakcina (DiPaTe, korbban DiPerTe) ellltsban s alkalmazsban van. A korbbi
DiPerTe vakcina gyakran vltott ki lzas olttsi mellkreakcikat, mita azonban a pertusis inaktivlt
sejtjei helyett antigneket alkalmaznak (acellulris azaz sejtmentes ksztmny), kevesebb a
mellkreakci. Egy msik klnleges nemzetsg az Alcaligenes, amelyeket ipari aminosav ellltsra hasznlnak, illetve az A. eutrophust PHB-termelsre is hasznljk.
Korbban szintn a Pseudomonas csaldba soroltk a Zoogloea fajokat, majd elklntettk a
tbbi obligt aerob, Gram-negatv sprtlan plciktl (=Pseudomonasok), mert sajtos zselatinszer
mtrixot kpeznek [111]. Ennek megfelelen biotechnolgiai alkalmazsra szinte kizrlag a
zoogloea gum, vagyis a klnleges extracellulris poliszaharid ellltsa esetn hasznljk e fajokat, kztk leggyakrabban a Zoogloea ramigerat.
A Ferribacterium limneticum szerves savak oxidcijval reduklja a Fe3+-t Fe2+-v [172]. Ennek
kzeli rokona szmos nitrognfixl nemzetsg (Azoarcus, Azovibrio, Azospira stb.), amelyek a
denitrifikcival egytt szmos szennyezanyag lebontst katalizljk (pl.: aroms szennyezk)
[173]. Aerob vagy anaerob heterotrf, nem-szulft-redukl, mrskelten termofildenitrifikl
baktriumok az olajmezk Petrobacter succinatimandens baktriumai, amelyek borostynksavon is
szaporodnak [174]. Klnleges fermentatv mikroba a Propionivibrio limicola), amely sem
sznhidrtokon, sem szerves savakon, de mgcsak szerves szennyez anyagokon sem kpes nni,
viszont kinik-savon s sikimik-savon propionsavat, szn-dioxidot ecetsavat termel [175]. A
Rhodocyclus nemzetsg tagkai anoxikus fototrfok, s a nevket a sejtek gyrs alakjrl kaptk,
aminek kvetkeztben a sejt kt plusa kzel kerl egymshoz [176, 177].
Gamma-proteobacterek
Fajokban meglehetsen gazdag proteobacter-csoport, amely szmos slyos betegsg (pl.: kolera)
krokozja mellett nhny biotechnolgiailag
jelents mikrobt (egyes Pseudomonas-okat,
Enterobacter-eket) is magba foglal.
A Beggiatoak nagymret (200 m!) fehr fonalas szervezetek, amelyek a nhny szintetikus
szervezet kz tartoznak. Ezek kpesek a lgkri szn-dioxidbl s a tengervzbl szervetlen
vegyletek energijnak felhasznlsval sznhidrtokat szintetizlni (autotrfok). Noha katalz
negatvak, lgkri oxign felhasznlsval heterotrf anyagcserre is kpesek, mivel az oxign okozta
nem kvnatos oxidcis folyamatokat kn segtsgvel kzmbsteni tudjk [112]. Tengeri szennyezdsek eltvoltsakor megjelennek (indiktor), s nagy mretk miatt szabad szemmel is lthatan
megjellik a szennyezst.
A msik autotrf gamma-proteobacter csoport a bborkn-baktriumok csoportja. Fotoszintziskhz nem vizet hasznlnak, mint a legtbb fotoszintetizl szervezet (cianobaktriumok, algk,
nvnyek), hanem knhidrognt, gy oxign helyett kenet szabadtanak fel [113]. Kt csaldra
oszthatak aszerint, hogy a kenet extracellulrisan (Ectothiorhodospiraceae) vagy intracellulrisan
(Chromaticeae) vlasztjk ki. A Chromaticae csald legjobban lert tagja a Thiocapsa roseopersicina,
amely ltal termelt hidrogenzenzim biotechnolgiai (biogz-termelsi) potencillal rendelkezik,
mivel a Thiocapsa alacsony nvekedsi hmrskleti optimuma (20-25C, szaki-tengeri izoltum(!))
ellenre a hidrogenza hstabil (>80C), protezoknak ellenll, s jl tolerlja az oxignt (a Thiocapsa
roseopercicina fakultatv anaerob) [114].
A gamma-proteobacterek specilis alkalmazssal br nemzettsge az Alcanivorax (pl.: A.
borkumensis, 3.2.32. bra), amely tengeri olajszennyezsek eltvoltsnl hasznosthat, amennyiben
kn s nitrogn is rendelkezsre ll [115].
www.tankonyvtar.hu
89
www.tankonyvtar.hu
90
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
91
mg nem teljesen ismert, de valsznleg sziderofrok, fitohormonok segtsgvel s az svnyianyagfelvtellel segtik a nvny nvekedst [133].
A Cellvibrio nemzettsg fajai a nevkbl is lthatan cellulzbontk. Kztk a legintenzvebben
vizsglt faj a Cellvibrio japonicus, amelyet japn talajmintbl izolltak 1952-ben. Ennek megfelelen
klnbz a megszokottaktl valamiben eltr enzimeiket vizsgljk (arabinz [134], xilanz
[135] stb.), ezek jelents alkalmazsi potencillal rendelkeznek a bioipar szmra.
A gamma-proteobacterek kvetkez csoportja a Pasteurella-flk, ahov a humnpatogn
Haemophilus influenzae s a hzi baromfit fertz Pasteurella multocida kerlt tbbek kztt
besorolsra. Utbbi biotechnolgiai jelentsge, hogy az llattenysztk szmra vakcinaknt
inaktivlt Pasteurella-sejteket vagy azok antignjeit forgalmazzk. Hasonl a helyzet az
Actinobacillus pleuropneumoniae esetben, amely a sertsllomnyt fertzi, s vres habz szj/orr,
valamint magas lz mellett az llatok elhullst okozza [136].
A C1-metabolizmusnl mr bemutattunk olyan mikrobkat, amelyek a metanol, metn
hasznostsra kpesek. A gamma-proteobacterek ezen csoportja a Methylococcus-flk. A csoport
valamennyi nemzetsge metilotrf, metnhasznost. A nvad nemzettsg, amely a metilotrf
kutatsok kzppontjban ll nhny archeval egytt, a termofil Methylococcus capsulatus [137].
Iparilag tbb vtizede hasznlt mikrobk a gamma-proteobacterek kvetkez csoportjba sorolt
Xanthomonas-flk, kztk a Xanthomonas campestris, amellyel a szleskren (fleg azonban
lelmiszer-ipari clra) hasznostott xantn gumi fermentcis ellltst valstjk meg [141].
A jelen jegyzetben trgyalt utols gamma-proteobacter csoport a Succinivibrio-flk csoportja.
Az idesorolt Anaerobiospirillum succiniproducens okozhat megbetegedseket (baktermia) [138], de a
platformalkot borostynksav ellltsra is felhasznlhat [139]. A Succinimonas amylolytica
szintn nagy mennyisg borostynksav ellltsra kpes, kzvetlenl kemnytbl kiindulva
[140]. A nvad Succinivibrio dextrinosolvens segtsgvel heterofementatv tulajdonsgnak
ksznheten glkzalapon llthatk el borostynksav- s tejsav- stb. metabolitok.
www.tankonyvtar.hu
92
Ipari mikrobiolgia
3.2.3. bra: Az sbaktriumok csaldfja a rokonsgi tvolsgokkal (NJ/ML/MP algoritmussal is) [163]
www.tankonyvtar.hu
93
Bacilliales
rendje
(katalz
pozitv)
Bacillusok
csaldja
B.subtilis,
B.licheniformis,
B.thringiensis,
B.coagulans
B. antraxis
Staphylococcusok
csaldja
S. aureus
Listrik csaldja
Baktriumok
domnje
Firmicutes
trzs
(alacsony
G+C tart.)
Bacillusok
osztlya
Lactobacillusok
csaldja
Lactobacilliales
rend
(katalz
negatv)
Pediococcus
nemzetsg
Leuconostoc
nemzetsge
Strpetococcus
nemzetsge
Enterococcus
nemzetsge
Clostridiumok
osztlya
Mollicutes
osztly
Lactobacillus
nemzetsg
www.tankonyvtar.hu
Listeria
monocytogenes
L. casei
L. rhamnosus
L. delbrueckii
L. helveticus
L. coryneformis
Pediococccus
acidilactici
L.
mesenteroides
S. bovis,
S. pyogenes,
S. thermophilus
E. faecalis
94
Ipari mikrobiolgia
3.2.11. bra: Az Actinobacterek csaldfja (Az NCBI taxonomia adatfile alapjn generlva)
www.tankonyvtar.hu
95
www.tankonyvtar.hu
96
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
97
Basidomycotak
A basidomycota-k az ascomycotkkal egytt alkotjk a Dikarya alkirlysgot, amelynek neve a stabil
dikarion llapotra utal, amelyben e kt trzs tagjai ltalban elfordulnak. A basidomycotk
legismertebb formi a kalapos gombk, amelyek felptst mutatja a 3.3.3. bra.
www.tankonyvtar.hu
98
Ipari mikrobiolgia
2) terpenoidok
A terpenoidok izoprnszrmazkok. Nevket a terpnrl kaptk, amely tulajdonkppen izoprn dimer.
A(z) (bio) izoprn j perspektvkat kapott az utbbi vtizedben, mivel a hagyomnyos
kolajkrakkols mellett rekombinns technikval biolgiailag is elllthat polimerizcis s
zemanyagclra is [158]! Mivel biolgiailag elllthat, megjul nyersanyagokbl is lehet gyrtani,
s platformvegylet, teht szrmazkait egyszer, konvencionlis mdszerekkel lehet szintn
ellltani. Ha megfelel technolgival olcsn el lehet lltani, zemanyagclra is kivl lehet, mert
magasabb energiatartalommal br mind a dzelolajnl, mind a benzinnl. A polimer- s zemanyagcl
felhasznlsn kvl is nagy volumen alkalmazsnak rvend a gumiipar elasztomerjei, illetve a
ragasztk krben.
Az izoprnszrmazk terpenoidokat a sznlnc hossza s az azzal arnyos fizikai tulajdonsgaik
alapjn csoportostjk: illkony mono s szeszkviterpnek (sesquiterpenoids, C10-15, esszencilis
olajok), kevsb illkony triterpnek (C20), nem illkony terpenoidok s szterolok (C30), illetve
karotenoid pigmentek (C40). A pecstviaszgomba (Ganoderma lucidum) ltal termelt terpneket
szintn ebben a csoportostsban trgyaljuk. A ganodermasav A, B, C1, s C2 molekuli az emberi
mjsejtek nvekedst gtoljk, illetve antioxidnsknt vdik az eritrocitkat s a mjsejteket. A
termtest tbbi triterpnjvel egytt (ganoderiol B, ganodermanontriol) Anti-HIV1 s Anti-HIV1protez aktivitsak (elbbi a burokfehrje ktdsnek gtlst, utbbi pedig a virion fehrje
proteolitikus aktivlsnak gtlst jelenti). A diterpnek kztt a ciatnokat amelyek nevket a
Cyathus helenae madrtollrl izollt parazita gombrl kaptk szmos gomba termtestjbl
kimutattk, a sphaeroane tpusak pedig algkban is elfordulnak. Idetartozik mg a Drosophyla
subatratbl ellltott antimikrobilis hats tintinnadiol. A diterpnekre ltalban is jellemz, hogy
antimikrobilis hatsak, idegsejt-nvekedsi faktort induklnak (NGF), s opioid receptor agonsitk,
aminek a fjdalomcsillaptsban van szerepe. A szeszkviterpenoidok s monoterpenoidok szintn NGF
induktorok, inszekticidek s nematicidek.
3) ergoszterol
Az ergoszterol a D-vitamin prekurzora, UV hatsra kortizon s progeszteron keletkezik belle. A
gombknl a funkcija, hogy a sejtmembrn rszeknt segtse az integritst s a membrn fehrjk
aktivitst, illetve a sejt energiahztartst. A kereskedelmi forgalomba kerl termkeket lesztbl
vagy hulladkmiclium extrakcijval lltjk el.
4) ceramid
Kozmetikumokban nedvest gensknt alkalmazzk, de trend-kiegsztnek is kitn (lelmiszeripar), mivel immunerst, rkmegelz hatst is tulajdontanak neki.
A bazidomicetk (magasabb rend gombk) fermentcijnak clja, hogy a termtestekben
megtallhat rtkes anyagokat hatkonyan lltsk el. Ehhez ltalban talajtenyszeteket alkalmaznak, ami azonban 60-70 napig is eltart, s kevss kontrolllt. A szubmerz fermentci fonalas
gombk esetn (kalapos!) a megnveked viszkozits miatt nehzsgekbe tkzik, mert oxigntadsi
problmk s magasabb nyrer lp fel.
A Ganoderma lucidum esetn 50 g/L alatti (szubsztrt inhibci miatt) laktzzal vagy szaharzzal
vgzik a szekundermetabolit- (termk)ellltst, amely sznforrsok azonban a nvekedsnek nem
kedveznek. Ekzben az oldott oxign szintjt 20-30% krl clszer tartani, s gy a vgs sejt szrazanyagtartalom 22 g/L, az elrhet EPS(extracellulris-poliszaharid) 0,87 g/L, IPS (intracellulrispoliszaharid) 2,5 g/L, amely mellett mintegy 300 mg/L GA (ganodermasav) keletkezik. Az optimlis
Kla rtkt 781/h-ban llaptottk meg. A 10% krli oxignszint az aggregtumokban oxignlimithez
vezet, ami kisebb mrtk biomassza-kpzdst, m magasabb EPS-, IPS-, GA- koncentrcikat
eredmnyez gyenge produktivitssal. Mr 20% oxignszintnl mindez megfordul. A nyrer hatst
0,5-1 m/s cscssebessg tartomnyban rtk le, s megllaptottk, hogy a pelletmret gyorsabban n
az alacsonyabb kevers esetn, s ez az IPS-kpzdsnek kedvez, mg a magasabb keversebessg
hatsra a vgs sejt-szrazanyagtartalom (teht a biomasszahozam is) lecskent (14->10 g/L-re).
www.tankonyvtar.hu
99
Termk
Poliszaharid
Ergosterol
Agrocybe cylindracea
Extracellulris
poliszaharid (EPS)
__________EPS_______
Poliszaharid
Teljes polifenol
tiszta triterpenoid
Antrodia camphorata
Auricularia polytricha
Collibybia maculate
Cordyceps militaris
Exobiopolimer
EPS
Cordycepin
Cordyceps sinensis
Cordycepin
Adenozin
Grifola frondosa
EPS
Inonotus obliquus
Exopolimer
Endopoliszaharid s EPS
Phellinus sp
EPS
Sarcodon aspratus
EPS
Schizophyllum
commune
Almasa (L-malonsav)
Lptk
5 L kevert reaktor, 2
db 6 lapt
turbinakevervel
3 L/5 L fermentci
Eredmny
1,67 g/L
25 mg/g sz.a.
_5 L BBraun
fermentor__
_______148
mg/L______
23,3% hozam
71 mg/g
108 mg/g
3,1 g/L
3,94 g/L
188,3 mg/L
350/500 L fermentor
3L/5 L fermentor
3L/5 L fermentor
21/30 L centrifugl
kever
3g/L
3L/5 L fermentor
5 L kevert reaktor
5 L air lift reaktor
15 L BBraun reaktor
300 L kevert
bioreaktor
3 L/5 L kevert
fermentor
3L/5 L kevert
fermentor
10/12 L
buborlkkolonna
7,2/8 L hurokreaktor
5 L airlift
5,3 g/L
4,53 g/L
1,252 g/L
0,495 g/L
3,59-5,3 g/L
2,68 g/L
Y<20%
Y>40%
3,05 g/L
Ascomycotak
Az Ascomycota osztly nevt a szaporods kzben kpzd aszkusz utn kapta (magyarul: tml, azaz
tmlsgombk, 3.3.4. bra.)
Az aszkuszos gombk esetben a dikarion llapot rvid ideig tart, gy nincs dikarion llapotban
ivartalan szaporodsuk. Az ivartalan szaporods sorn a hifn kpzdik konidiumtart, abban
konidiospra, amely mitzissal keletkezik, gy mitosprnak is hvjk. Ha azonban 2 heterotallikus
(azaz klnbz ivar) hifa vge sszeolvad (plazmogmia), ltrejn a dikarion, amelyben a magok
elbb mitzissal osztdnak, kivlasztdik az anyasejt, s a magok egyeslnek (kariogmia), ami
diploid llapothoz vezet, majd elbb meizissal, majd mitzissal osztdnak, s elrendezdnek a
tmlben, mg kialakul a jellemz 8 haploid aszkospra a tmlben.
A legtbb iparilag is hasznlt gomba az aszkuszos gombk kz tartozik.
www.tankonyvtar.hu
100
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
www.tankonyvtar.hu
102
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
Megnevezs
Mikrobk
Vajkultra
Str. lactis
Str. cremoris
Str. diacetilactis
Leuc. citrovorum
Joghurtkultra
Kefrkultra
Str. thermophilus
Lb. bulgaricus
Str. lactis
Str. cremoris
Lb. casei
Lb. caucasicus
Saccharomyces fragilis
Torula kefyr
Tenysztsi T
20-25 oC
42-45 oC
18-22 oC
Alvadsi id
12-18 ra
2-3 ra
14-20 ra
Kultra savfoka
36-38 SHo
40-45 SHo
38-40 SHo
Felhasznlsi
terlet
aludttej, tejfl
joghurt
kefr
www.tankonyvtar.hu
104
Ipari mikrobiolgia
Funkci
evolcis httr:
antignspecifits
elzetes aktivls
reakci
memria
Emls immunrendszere
Adaptv (szerzett)
Veleszletett
A vdelem els vonala,
A vdelem msodik vonala
fleg: patogn rzkels
fleg: patogn eltvoltsa,
(Antign feldolgozsa,
antign eltvoltsa a
prezentlsa, az adaptv vlasz
veleszletett rendszer
indukcija)
segtsgvel
mellesleg: patogn eltvoltsa
mellesleg: patogn felismers
si, konzervatv
fiatalabb
kevss specifikus
nagyon specifikus
nem szksges
szksges
azonnali
ksleltetett
nincs
van
vakcina
neve
betegsg
krokoz
baktrium
/vrus
0-6 ht
BCG
gmkr, tuberkulzis
Bacillus Calmette-Gurin
Mycobacterium tuberculosis
baktrium
Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus
bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus
Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus
bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus
Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus
bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus
2 hnap
DTPa
+Hib
+IPV
3 hnap
DTPa
+Hib
+IPV
4 hnap
DTPa
+Hib
+IPV
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
www.tankonyvtar.hu
15 hnap
MMR I.
18 hnap
DTPa
+Hib
+IPV
6 v
DTPa
+IPV
11 v
DT
11 v
14 v
MMR
revakcinci
Hepatitis B
kanyar (morbili)
mumpsz (paroitis)
rzsahiml (rubeola)
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+Haemophilus influenzae
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
szamrkhgs (pertusis)
+inaktivlt poliomyelitis
vrus
torokgyk(diftria),
merevgrcs (tetanusz),
kanyar (morbili)
mumpsz (paroitis)
rzsahiml (rubeola)
mjgyullads
vrus
vrus
vrus
Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
H. influenzae
polio vrus
bakt.
bakt.
bakt.
bakt.
vrus
Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Bordatella pertusis
polio vrus
bakt.
bakt.
bakt.
vrus
Corynebacterium diphteriae
Clostridium tetani
Morbili virus (Paramyxo)
Mumps vrus
Measles virus (Paramyxo)
Hepatitis B virus
bakt.
bakt.
vrus
vrus
vrus
vrus
www.tankonyvtar.hu
106
4.
Ipari mikrobiolgia
A MIKROORGANIZMUSOK IPARI
FELHASZNLSNAK ETIKAI S KOCKZATI
KRDSEI
A biolgiai gensek hasznlatnak kockzata kt nagy terletre oszthat: 1) patogn mikrobkkal val
munkavgzs (elssorban egszsggyi s egyes kutatlaboratriumok esetben), 2) rekombinns
llnyek hasznlatval kapcsolatos kockzatok. Elbbi esetben kzvetlen egszsgkrost
kockzatrl beszlnk, mg a transzgenikus szervezetek (GMO) alkalmazsakor a kzvetett
(kolgiai) kockzat dominl. A kockzatok felmrse s minimlisra cskkentse mellett mindkt
terlet szmos etikai krdst is felvet (fertztt humn mintk kezelse, megbzhat GMO termel
farmerek stb.).
ltalnosan elfogadott az az elv, hogy minden mikroorganizmust potencilis patognknt kell
kezelni. Ennek oka az, hogy mg a legrtalmatlanabb ehet mikrobk is a vrbe kerlve szepszist
okozhatnak. A mikrobkat az Egszsggyi Vilgszervezet (WHO) 4 Biosafety Class-be (BsC Level
1-4) sorolta, s a besorolst kln-kln fellltottk a vrusokra, gombkra s a baktriumokra is. Az
1-es szint mikrobk kz az lelmiszer-ipari mikrobk s a normlflra mikrobi tartoznak
(Lactobacillu-sok, influenzavakcina), a 2-es szint mikrobk (Clostridium tetani, Candida albicans,
Hepatitis) mr patognek, de hatkony vdekezsi eszkz van ellenk, illetve nem terjednek
jrvnyszeren; a 3-as jelzs mikrobk (Bacillus anthracis, Paracoccoidioides brasilensis, HIV) mr
komoly megbetegedst okozhatnak, s terjedni is kpesek, de a jrvny hatkonyan megelzhet. A 4.
szintre sorolt mikrobk (Myoplasma mycoides, Ebola vrus) a legveszlyesebbek, mivel
gygythatatlan betegsget okoznak, s jrvnyszeren terjednek. A besorolsbl rgtn kitnik, hogy
idrl idre fell kell vizsglni a besorolst, mivel a tudomnyos ismertek bvlsvel elfordulhat,
hogy a korbban kezelhetetlennek mondott betegsg ellen idkzben kidolgoztak hatkony
vdekezst. Tipikus plda erre a HIV vrus, amely ma mr nem a legveszlyesebb 4., hanem a 3.
osztlyba tartozik.
A mikrobk kockzatval prhuzamosan a velk dolgoz laboratrimokat is hasonl elvek alapjn
osztlyokba soroljk. A 4.1.1. tblzatban a javasolt s elrt kockzatcskkent feltteleket foglaltuk
ssze.
4.1.1. tblzat: A klnbz BsC szintre sorolt laboratriumokkal szembeni kvetelmnyek
BsC szint:
labor izollsa
hermetikus
lezrs lehetsge
szellztets be
szellztets az
plet
rendszervel
szellztets
elklntve
kimen HEPAszr
duplaajts bejrat
(zsilip)
lgzrzuhany
eltr, ltz
eltr zuhannyal
elfoly anyagok
kezelse
1.
-
2.
-
3.
~
4.
+
+
~
+
-
www.tankonyvtar.hu
107
Szerencsre a piacorientlt trsadalom tlnyomrszt olyan gnmdostsokat vgzett eddig, amelyek a termk
minsgt s/vagy hozamt nveltk. Ez azonban a termel szervezet szmra plusz teher, azaz inkbb evolcis
htrny, semmint elny.
7
www.tankonyvtar.hu
108
Ipari mikrobiolgia
172.325
172.590
172.620
172.655
172.695
172.725
172.896
172.898
173.110
173.120
173.130
173.135
173.140
Mucor miehei var. Cooney et Emerson eredet lipzok mint sajtok, zsrok, olajok s tejtermkek
zfokozi
173.145
Morteirella
vinaceae
szaharzgyrtshoz
173.150
173.160
173.165
173.280
var.
raffinoseutilizer
alfa-galaktozidza
cukorrpa-alap
www.tankonyvtar.hu
5. Kitekints
5.
109
KITEKINTS
Taln nem szksges tovbb bizonygatni, hogy a biotechnolgia egy interdiszciplinris, szertegaz,
intenzven kutatott tudomnyterletbl napjainkra a mindennapokat is meghatroz fogalomm vlt.
Azt is bemutattuk e jegyzet elejn, hogy a biotechnolgia szertegaz terleteinek kzs pontja a
mikroorganizmus, gy az ipari mikrobiolgia szorosan sszefgg a biotechnolgival. E kt terlet
jvjrl is csak egymsra utaltsguk mellett lehet gondolkodni, azaz az ipari mikrobiolgia jvje a
biotechnolgiai terletek s irnyok ltal determinlt, ugyanakkor a biotechnolgia lehetsgeit a
mikroorganizmusok vilga hatrozza meg. Kzs jvjk mg mindig kt szlon fut, hiszen a
termszetben megtallhat mikrobk s azok klnleges tulajdonsgainak felkutatsa mg vtizedekig
eltarthat, figyelembe vve az ismert s a vlt mikrobk szmt a Fldn, ugyanakkor a rekombinns
termel trzsek nyjtotta flexibilis s knyelmes lehetsgek nyilvn egyre nagyobb teret fognak
hdtani.
Azt gondolhatnnk, hogy a biotechnolgiai forradalom vgt fogja jelenteni, ha a termszetben
tallhat sszes tulajdonsgot s enzimet (azaz az sszes ltez mikrobt s azok genomjt)
feltrkpezzk, s a kapott informcikszletbl gazdlkodva azok vgtelen kombincijval vges
szm tulajdonsgbl szinte vgtelen kombincij rekombinns fajt lehet ltrehozni, amelyekkel
minden fontos vegyipari eljrs kivlthatv vlna. Ugyanakkor a protein engineering tbb vtizedes
gyakorlata jelzi, hogy van lehetsg meglv tulajdonsgok talaktsra, s j tulajdonsgok (j
enzimek) ltrehozsra, ma mg fleg meglv peptidek teljes tszerkesztsvel, de idvel taln de
novo ellltsval is.
Az a krds, hogy a fenti nagy lehetsgekbl mi valsul meg a jvben, aligha vlaszolhat
meg, hiszen javban tart egy olyan biotechnolgiai hzgazat keresse, amely fenn tudn tartani az
eddigi fejldst, s tovbbi fejlesztseket generlni. Ilyen potencilis hzgazat lehet a gygyszergyrts, a biozemanyagok ellltsa, a fehr biotechnolgia, hogy nhny pldt emltsnk.
A biotechnolgia szkeptikusai napjainkban mg knnyen tallnak fogst a fejlesztsi
trekvseken, hiszen a kolajalap energiaszektor s a vegyipar energia- s anyagignyeinek megjul
alapokon trtn kivltshoz az egsz Fld felsznnek megmvelse is kevs lenne. Az is biztos
azonban, hogy a kolajkszletek majdani elfogysa utn szksg lesz az alternatv lehetsgekre mind
az energia-, mind a nyersanyag-felhasznls terletn. Szerencss esetben az energiaignyt ms
tovbbi alternatv utakon is ki lehet elgteni (szl, vz, nap, geotermikus stb.), teht csak a nyersanyagignyre kell ms biomassza-alap megoldst tallni.
A jv rdekes krdse, hogy a fnyhasznost tengeri algk az eddig ki nem hasznlt tengerek
felsznn mennyi biomassza-alap nyersanyagot, illetve zemanyagot tudnak majd ellltani. Az
algkkal kapcsolatban is hallani olyan kritikkat, hogy nem elg hatkonyak, ezrt a Fld sszes
tengere is kevs a jelenlegi s a nvekv energiaignyek algkkal trtn kielgtshez.
Ma mg csak remlhetjk, hogy a korltlannak ltsz lehetsgek kiaknzsval sikerl olyan
fejlesztseket realizlni, amelyekkel elrhetek az emberisg nagy volumen ignyeinek
kielgtshez szksges termelsihatkonysg-nvels, s a szkeptikusok bnatra hozzjrul majd a
biotechnolgia s a vele szorosan sszekapcsold ipari mikrobiolgia az emberisg energia- s
nyersanyag-problminak megoldshoz.
www.tankonyvtar.hu
110
6.
Ipari mikrobiolgia
SZSZEDET
acid-fast
savll
aerob
Oxignignyes faj.
anaerob
anaerob lgzs
anaplerotikus
antimetabolit rezisztencia
Arisztotelsz
Bakteriocin
biobnyszat
biokontroll
citokin
COSY-NMR
www.tankonyvtar.hu
6. Szszedet
111
crabtree effektus
destruxinok
diszaharidok
Kt monomercukor-egysgbl felpl
cukormolekulk, pl.: laktz (1db glkz+ 1db
galaktz), maltz, cellobiz, szaharz stb.
diszproporci
diverzits
=sokflesg
ektomikoriza
elre/vissza csatols
enniatinok
expressziszint szablyozs
expresszis rendszer
extrm termofil
Extrmofilek
www.tankonyvtar.hu
112
Ipari mikrobiolgia
mikroorganizmusok.
Extrmozim
fakultatv anaerob
fehr biotechnolgia
fehrjeszint szablyozs
Fenotipizls
fermentatv anyagcsere
fermentatv faj
filogenetika
fitoalexinek
fitonematdk
fitotoxin
fittsg
formzreakci
GC, HPLC
halotolerns
www.tankonyvtar.hu
6. Szszedet
113
heterofermentatv
hexzok
hifa
homofermentatv
hozam
idiofzis
A mikrobilistermk-elllts hanyatl
sejtnvekedssel, s nvekedshez nem kapcsolt
termkkpzssel jellemezhet szakasza.
Inclusion body
Indel
inszekticid
=rovarl
ionofr
izotopomer
katabolit represszi
kemolito-autotrfok
kenet
kofermentci
klsav
www.tankonyvtar.hu
114
Ipari mikrobiolgia
kommenzalista
leaky mutns
magnetotaktikus
makrolid antibiotikum
malo-laktikus fermentci
metabolit
metanognek
metilotrfok
mezofill
mezofill
MIC
microarray technika
mikolsav
mutagnek
www.tankonyvtar.hu
6. Szszedet
115
obliglt anaerob
oligotrp
Tpanyagszegny lhely
opportunista patogn
Pasteur-effektus
pentzok
t sznatombl ll cukorvegyletek
(szaharidok), pldul xilz, arabinz stb.
peszticid
=krtevrt szer
poliextrmofil
polifilatikus
porozits
Pregnnok
Szteroidok egy csoportja, amelyek a C1-en s C21en szubsztitultak. Pregnnokra (teltett pregnn
szrmazkok) s pregnadinekre (teltettlen
pregnnszrmazkok) oszthatk , utbbiak ketts
ktst is tartalmaznak. Elbbiekhez tartoznak a
kortizon, hidrokortizon, progeszteron.
primer metabolit
prodigiosin
www.tankonyvtar.hu
116
Ipari mikrobiolgia
produktivits
propagula
proteinogn aminosav
Fehrjefelpt aminosav.
Proteus
random mutagenezis+screening
Reichstein szubsztrt
= 17,21-dihidroxi-progeszteron
rendszertan (taxonmia)
replika mdszer
respirci
retroaldol eliminci
reverzi
RGCs
SCP
szaprofita
szekunder metabolit
www.tankonyvtar.hu
6. Szszedet
117
szigmafaktor
szubsztrt/termk inhibci
TCA
termofil
termotolerns
tetrd
trofofzis
A mikrobilistermk-elllts sejtszaporodssal,
nvekedssel jellemezhet tenysztsi szakasza.
ubiquiter
Szles kr elforduls.
vegetatv sejt
vgtiter
www.tankonyvtar.hu
118
7.
Ipari mikrobiolgia
Az alkalmazott sznkdrendszer
A technolgia, mivel mindkett e fogalomra fkuszl
A kt terleten alkalmazhat mveletek halmaza.
A mikroorganizmus, amelynek ipari alkalmazsaival az ipari mikrobiolgia foglalkozik.
www.tankonyvtar.hu
119
biokonverzi,
-laktamz-inhibtor
www.tankonyvtar.hu
120
Ipari mikrobiolgia
21. Mitl fgg, hogy a tejsavas erjeds sorn a termel mikroba melyik enantiomert termeli?
A)
B)
C)
D)
www.tankonyvtar.hu
121
2. fejezet
27. rjon pldt C1-szubsztrtra!
A) metanol
B) mentol
C) metil-acett
D) metil-akrilt
28. Ismertesse a metanolgazdasg mkdst! Mi lehet a biotechnolgia s ipari
mikrobiolgia szerepe benne?
(szintetikus lehetsgek, sznkrforgs, metabolikus lehetsgek)
29. Jellemezze a 2 leggyakoribb C2 szubsztrtot!
A)
B)
C)
D)
www.tankonyvtar.hu
122
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
123
41. rja fel a szthiometriai mtrixot s a sebessgvektort egy olyan reakcihlra, ahol A-bl
keletkezik B (1. reakci), B-bl keletkezik C (2. r.), s C-bl keletkezik A (3. reakci). Milyen
vektort lehet ezekkel kiszmolni?
1
1
v A
r1
0 , v vB r r2 reakciosebessgekvektora
0 1 1
vC
r3
1 0 1
v1
rA
T 1 1 0 , v v2 r rB reakciosebessgekvektora
0 1 1
v3
rC
0
1 1
v1
rA
T 0 1 1 , v v2 r rB kpzodesisebessgekvektora
1
v3
rc
0 1
1 0 1
v1
rA
T 1 1 0 , v v2 r rB kpzodesisebessgekvektora
0 1 1
v3
rC
A) T 1
B)
C)
D)
42. Rajzoljon fel a koleszterint! Mutassa meg a mikrobilisan leggyakrabban mdostott pontokat!
A)
B)
C)
D)
M. phlei, M. smegmatis
M. cholesterus, M. tuberculosis
M. pelli, M. smaragdus
M. bovis, M. leprae
www.tankonyvtar.hu
124
Ipari mikrobiolgia
3. fejezet
47. Ismertesse a klasszikus mikrobilis rendszertan legutols csoportostsait!
(Hogyan nevezik az egyes csoportokat, melyik redszertan hny csoportra oszt stb.)
48. Mirt nem lehet az sbaktriumokat a Gram-fests szerint egyrtelmen besorolni?
A)
B)
C)
D)
www.tankonyvtar.hu
125
55. Mutasson be 2 ipari termket, amelyet kalapos gombk fermentcijval is el lehet lltani!
A)
B)
C)
D)
mlytengerekben
hforrsokban, lgos-ss vizekben
tengeri ledkben
talajvzben
festkiparban (vzfestk)
indiktor nvnynek (krnyzetvdelem)
agar-agar, karragn, (lelmiszer-elllts)
szennyvztisztts (krnyezetvdelem)
www.tankonyvtar.hu
126
Ipari mikrobiolgia
68. Ismertesse, hogy milyen anyagcserj mikrobk ptik fel a szennyvziszap-alap biogzelllt mikrobapopulcit!
(szerves savakecetsavmetnstb.))
69. Soroljon fel 2 krtkony s 2 hasznos mikrobt a szl mikroflrjbl!
A)
B)
C)
D)
tartsts, zests
savanyts, pcols, erjedsek
szs, fstlt z
aroma, savanyts
patogn eltvoltsa
az els vdelmi vonal fellbrlsa
az els vdelmi vonal rtestse
vrsvrtestek indukcija
www.tankonyvtar.hu
127
4. fejezet
77. Mi az elsdleges vdelmi vonal a biolgiai biztonsgtechnika terletn?
A)
B)
C)
D)
steril flke
laboratrium
gumikeszty+munkaruha
vdszemveg
steril flke
laboratrium
gumikeszty+munkaruha
vdszemveg
www.tankonyvtar.hu
128
Ipari mikrobiolgia
Tesztmegold kulcs
1.D
2.A
3.C
4.B
6.B
7.B
10.B
11.D
13.B
17.A
18.B
19.C
20.B
21.C
22.B
23.B
24.C
25.D
27.A
29.C
30.B
31.B
33.D
34.B
35.C
38.C
40.B
41.C
42.D
44.D
45.A
46.B
48.C
49.B
50.D
52.A
54.D
55.A
57.D
59.C
60.B
61.B
62.C
65.A
66.C
67.A
69.C
70.B
71.D
72.A
74.A
75.D
76.B
77.A
78.B
79.D
80.C
www.tankonyvtar.hu
8. Hivatkozsok
129
8.
HIVATKOZSOK
[1]
[2]
[3]
[4]
[5]
[6]
[7]
[8]
[9]
[10]
[11]
[12]
[13]
[14]
[15]
[16]
[17]
[18]
[19]
[20]
[21]
[22]
[23]
[24]
[25]
www.tankonyvtar.hu
130
Ipari mikrobiolgia
[26]
[27]
http://davesgarden.com/guides/articles/view/2051/
Bacterial (Prokaryotic) Phylogeny Webpage (March 2007).
http://www.bacterialphylogeny.com/index.html
Ciccarelli, F. D., Doerks, T., von Mering, C., Creevey, C. J., Snel, B., and Bork, P. (2006). Toward
automatic reconstruction of a highly resolved tree of life. Science 311, 1283-1287.
Lake, J. A., Herbold, C. W., Rivera, M. C., Servin, J. A., and Skophammer, R. G. (2007). Rooting the tree
of life using nonubiquitous genes. Mol.Biol.Evol.24, 130-136.
Computational phylogenetics, Wikipedia, the free encyclopedia
http://en.wikipedia.org/wiki/Computational_phylogenetics 2010. oktber 26.
Ksenia Egorova and Garabed Antranikian: Industrial relevance of thermophilic Archaea, Current Opinion
in Microbiology 2005, 8:649655
COSTANZO BERTOLDO AND GARABED ANTRANIKIAN: The Order Thermococcales,
Prokaryotes (2006) 3:6981, Chapter 5. DOI: 10.1007/0-387-30743-5_5
http://www.springerlink.com/content/v20wq8765k62167x/fulltext.pdf
N. Dogra and G.N. Qazi: Biotransformation of cholesterol by Micrococcus species mediated by plasmid
DNA, World Journal of Microbiology & Biotechnology 15: 411415, 1999.
http://www.springerlink.com/content/u5546k47448h4p36/
Kazuaki Yoshimune, Yasuo Shirakihara, Mamoru Wakayama, Isao Yumoto: Crystal structure of salttolerant glutaminase from Micrococcus luteus K-3 in the presence and absence of its product lglutamate and its activator Tris, FEBS Journal, Volume 277, Issue 3, pages 738748, February 2010
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1742-4658.2009.07523.x/abstract
R.G. Saratale, G.D. Saratale, J.S. Chang, and S.P. Govindwar, Ecofriendly degradation of sulfonated
diazo dye C.I. Reactive Green 19A using Micrococcus glutamicus NCIM-2168, Bioresource Technology
Volume 100, Issue 17, September 2009, Pages 3897-3905
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6V24-4W386XT3&_user=10&_coverDate=09%2F30%2F2009&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=search&_s
ort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1521854297&_rerunOrigin=google&_acct=C000050221&_
version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=f333166c8a0e4b58df8db08291149fef&searchtype=a
MEENA LAKSHMAN and M.R. RAGHAVENDRA RAO: Excretion of lysine by Micrococcus
glutamicus J. Biosci., Vol. 3 Number 1, March 1981, pp. 51-55
http://www.ias.ac.in/jarch/jbiosci/3/51-55.pdf
I. Sunitha, K. Jagannadha Rao and C. Ayyanna: Coimmobilized whole cells of Pseudomonas reptilivora
and Micrococcus glutamicus in calcium alginate gel for the production of L-glutamic acid. Bioprocess
and Biosystems Engineering, Volume 18, Number 1, 55-58, DOI: 10.1007/PL00008974 (1997)
http://www.springerlink.com/content/b32gujlh4pj7l2rl/
GANGULY S. ; BANIK A. K. ; Induced mutation and selection of High Yielding Strain of
Micrococcus glutamicus for glutamic acid production, Journal of the Indian Chemical Society,
2010, vol. 87, no6, pp. 717-721
http://cat.inist.fr/?aModele=afficheN&cpsidt=22991226
N. Gardner, C.P. Champagne: Production of Propionibacterium shermanii biomass and vitamin B12
on spent media, Journal of Applied Microbiology, Volume 99, Issue 5, pages 12361245, November
2005
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2672.2005.02696.x/full
A. Quesada-Chanto, A. S. Afschar and F. Wagner: Optimization of a Propionibacterium acidipropionici
continuous culture utilizing sucrose, Applied Microbiology and Biotechnology Volume 42, Number 1, 1621, (1994) DOI: 10.1007/BF00170217
http://www.springerlink.com/content/jj4124461174p833/
Edward J. Wawszkiewicz: Erythritol metabolism by Propionibacterium pentosaceum. Role of Lerythrulose 1-phosphate, Biochemistry, 1968, 7 (2), pp 683687,
DOI: 10.1021/bi00842a025, http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/bi00842a025
Maria L. W. Gent-Ruijters, Francisca A. Meijere, Wijtske Vries and A. H. Stouthamer: Lactate
metabolism in Propionibacterium pentosaceum growing with nitrate or oxygen as hydrogen acceptor,
Antonie van Leeuwenhoek Volume 42, Number 3, 217-228, (1976) DOI: 10.1007/BF00394118
http://www.springerlink.com/content/lk3j875h85v44244/
[28]
[29]
[30]
[31]
[32]
[33]
[34]
[35]
[36]
[37]
[38]
[39]
[40]
[41]
[42]
www.tankonyvtar.hu
8. Hivatkozsok
[43]
[44]
[45]
[46]
[47]
[48]
[49]
[50]
[51]
[52]
[53]
[54]
[55]
[56]
[57]
[58]
[59]
131
www.tankonyvtar.hu
132
Ipari mikrobiolgia
[60]
T. Payot, Z. Chemaly and M. Fick Lactic acid production by Bacillus coagulanskinetic studies and
optimization of culture medium for batch and continuous fermentations , Enzyme and Microbial
Technology, Volume 24, Issues 3-4, 3 February 1999, Pages 191-199[61]
Vaughan A. Hilder and Donald Boulter: Genetic engineering of crop plants for insect resistance a
critical review (1999), Crop Protection, 18, 177-191
http://www.cib.espol.edu.ec/Digipath/D_Papers/42684.pdf
Boer, A. S.; Priest, F.; Diderichsen, B. r., On the industrial use of Bacillus licheniformis: a review. In
Applied Microbiology and Biotechnology, ed.; 'Ed.'^'Eds.' Springer Berlin / Heidelberg: 1994; 'Vol.' 40,
p^pp 595-598. http://www.springerlink.com/content/n6t3p7112042v146/fulltext.pdf
ENTerococci Industrial Platform http://imol.vub.ac.be/IMDO/projects/ENTIP.html
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Bacillus
Garbayo, I.; Vlchez, C.; Vega, J.; Nava-Saucedo, J.; Barbotin, J., Influence of immobilization
parameters on growth and lactic acid production by Streptococcus thermophilus and Lactobacillus
bulgaricus co-immobilized in calcium alginate gel beads. In Biotechnology Letters, ed.; 'Ed.'^'Eds.'
Springer Netherlands: 2004; 'Vol.' 26, p^pp 1825-1827.
http://www.springerlink.com/content/kj81u15234j1g452/fulltext.pdf
Application of Leuconostoc Mesenteroides Strains Isolated from Chinese Food Sources to Produce
Oligosaccharides to Be Used as Prebiotics (2009) web article, (2011. janur 4.) http://www.latestscience-articles.com/Basic_Sciences/Application-of-Leuconostoc-Mesenteroides-Strains-Isolatedfrom-Chinese-Food-Sour-763.html
Henne A. et al.: The genome sequence of the extreme termofil Thermus thermophilus, Nat. Biotechnol.
22 (5), 547-553, 2004
Nature Biotechnology (2004), 22(5), p.547 http://www.nature.com/nbt/journal/v22/n5/full/nbt956.html
A. A. SALYERS,* J. R. VERCELLOTTI, S. E. H. WEST, AND T. D. WILKINS: Fermentation of
Mucin and Plant Polysaccharides by Strains of Bacteroides from the Human Colon, APPLIED AND
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, (1977), Vol. 33, No. 2, p. 319-322,
Zs. Lang: Who has first observed Planctomycetes, (2005), Acta Microbiologica et Immunologica
Hungarica, 52(1), p.73-84 http://www.akademiai.com/content/qu476r5626227075/
Wikipedia, the onlyne Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Pediococcus_acidilactici (2010.12.31)
Wikipedia, the onlyne Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Lactococcus (2010.12.31)
A.A.E Oliveira, L.M. Farias, J.R. Nicoli, J.E. Costa and M.A.R. Carvalho: Bacteriocin production by
Fusebacterium isolates recovered from the oral cavity of human subjects with and without periodontal
disease and of marmosets Res. Microbiol. (1998), 149, 585-594
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VN3-3XXDWSF6&_user=303407&_coverDate=09%2F30%2F1998&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=searc
h&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000016619&_version=1&_urlVersion=0&_userid=303407
&md5=8c40601af3e32d2b2165cdecca539853&searchtype=a
Kononen, E.; Kanervo, A.; Salminen, K.; Jousimies-Somer, H., beta -Lactamase Production and
Antimicrobial Susceptibility of Oral Heterogeneous Fusobacterium nucleatum Populations in Young
Children. Antimicrob. Agents Chemother. 1999, 43, (5), 1270-1273.
http://aac.asm.org/cgi/reprint/43/5/1270
Anna Zdzieb_o, Jo zef Synowiecki : New source of the thermostable a-glucosidase suitable for single
step starch processing Food Chemistry 79 (2002) 485491
Wikipedia, the online Encyclopedia http://en.wikipedia.org/wiki/Chloroflexus (2010.12.31)
Khanok Ratanakhanokchai, Jun Kaneko, Yoshiyuki Kamio, and Kazuo Izaki: Purification and Properties
of a Maltotetraose- and Maltotriose-Producing Amylase from Chloroflexus aurantiacus, Appl Environ
Microbiol. 1992; 58(8): 24902494
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC195809/pdf/aem00049-0158.pdf
M T Madigan and T D Brock: Photosynthetic sulfide oxidation by Chloroflexus aurantiacus, a
filamentous, photosynthetic, gliding bacterium. J Bacteriol. 1975 May; 122(2): 782784.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC246117/?tool=pmcentrez
Hugler, M.; Menendez, C.; Schagger, H.; Fuchs, G., Malonyl-Coenzyme A Reductase from Chloroflexus
aurantiacus, a Key Enzyme of the 3-Hydroxypropionate Cycle for Autotrophic CO2 Fixation,
DOI: 10.1128/JB.184.9.2404-2410.2002. J. Bacteriol. 2002, 184, (9), 2404-2410.
http://jb.asm.org/cgi/content/short/184/9/2404
[61]
[62]
[63]
[64]
[65]
[66]
[67]
[68]
[69]
[70]
[71]
[72]
[73]
[74]
[75]
[76]
[77]
[78]
[79]
www.tankonyvtar.hu
8. Hivatkozsok
[80]
[81]
[82]
[83]
[84]
[85]
[86]
[87]
[88]
[89]
[90]
[91]
[92]
[93]
[94]
[95]
[96]
[97]
133
J G Holt and R A Lewin: Herpetosiphon aurantiacus gen. et sp. n., a new filamentous gliding organism.
J Bacteriol. 1968; 95(6): 24072408.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC315177/pdf/jbacter00588-0459.pdf
Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Cyanobacteria
Prokaryotes (2006), Chapter 4.1, 7:195-210: Free living saccharolytic Spirohetes: The genus Spirohaeta
http://resources.metapress.com/pdf-preview.axd?code=g50hph505208ltu1&size=largest
Ghasem D Najafpour, Lim Jit Kang: Evaluation and isolation of ethanol producer strain SMP-6, The
Proceedings of RSCE and 16th SOMChE, 28-30 Oct 2002 Malaysia
http://www.andrew.cmu.edu/user/jitkangl/Fermentation%20of%20Ethanol/Fermentation%20of%20Ethan
ol.htm
Peter H. Janssen and Hugh W. Morgan: Glucose Catabolism by Spirochaeta thermophila RI 19.B1,
JOURNAL OF BACTERIOLOGY,(1992), Vol. 174, No. 8 p. 2449-2453
http://jb.asm.org/cgi/reprint/174/8/2449.pdf
The Prokaryotes: Handbook of Microorganism (2006) 7:757-793 Chapter 8.1.: The order
Planctomycetales including the genera Planctomyces, Pirellula, Gemmata, and Isosphaera, and the
candidatus genera Brocadia, Kuenenia, and Scalindua
http://books.google.hu/books?id=LcCqW4IVj0C&pg=PA757&dq=The+prokaryotes+chapter+8.1&hl=hu&ei=7RAjTdDhJsqZOqjbyPsI&sa
=X&oi=book_result&ct=result&resnum=2&ved=0CC0Q6AEwAQ#v=onepage&q=The%20prokaryotes
%20chapter%208.1&f=false
Stackebrandt, E.; Murray, R. G. E.; Truper, H. G., Proteobacteria classis nov., a Name for the
Phylogenetic Taxon That Includes the "Purple Bacteria and Their Relatives" Int J Syst Bacteriol 1988, 38,
(3), 321-325. DOI: 10.1099/00207713-38-3-321. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/38/3/321
Lee, K.-B.; Liu, C.-T.; Anzai, Y.; Kim, H.; Aono, T.; Oyaizu, H., The hierarchical system of the
'Alphaproteobacteria': description of Hyphomonadaceae fam. nov., Xanthobacteraceae fam. nov. and
Erythrobacteraceae fam. nov. Int J Syst Evol Microbiol 2005, 55, (5), 1907-1919. DOI:
10.1099/ijs.0.63663-0. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/55/5/1907
Labrat.com: http://www.thelabrat.com/restriction/sources/Brevundimonasdiminuta.shtml
Silva, J. A.; Tobella, L. M.; Becerra, J.; Godoy, F.; Martnez, M. A., Biosynthesis of poly-[beta]hydroxyalkanoate by Brevundimonas vesicularis LMG P-23615 and Sphingopyxis macrogoltabida LMG
17324 using acid-hydrolyzed sawdust as carbon source. Journal of Bioscience and Bioengineering 2007,
103, (6), 542-546. http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VSD-4P5RTMP7&_user=10&_coverDate=06%2F30%2F2007&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=search&_s
ort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1598408746&_rerunOrigin=google&_acct=C000050221&_
version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=c09ab5dd7a8153a8d705eccf4490a012&searchtype=a
Production of heterologous polypeptides from freshwater caulobacter, United States Patent 6861245
http://www.freepatentsonline.com/6861245.html
CAULOBACTER S-LAYER KITS: For Recombinant Protein Secretion AND Peptide/Protein Display
http://www.flintbox.com/public/project/1487/
Yasuhiro et al.:Production of thiotropocin by a marine bacterium, Caulobacter sp. and its antimicroalgal
activities. Journal of Marine Biotechnology, (1997); 'Vol.' 5, pp 225-229.
http://www.springerlink.com/content/0hja15c5dgc3ew1l/
Microbe wiki: http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Hyphomonas_neptunium
van Aalst-van Leeuwen, M. A.; Pot, M. A.; van Loosdrecht, M. C. M.; Heijnen, J. J., Kinetic modeling of
poly(-hydroxybutyrate) production and consumption by Paracoccus pantotrophus under dynamic
substrate supply. Biotechnology and Bioengineering 1997, 55, (5), 773-782.
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/(SICI)1097-0290(19970905)55:5%3C773::AIDBIT7%3E3.0.CO;2-8/abstract
Young Tae Kim, Keunho Ji and Tae Hyug Jeong: Improved production of astaxanthin of the Paracoccus
haeundaensis by mutagenesis FASEB J. April 2010 24 (Meeting Abstract Supplement) 682.3
http://www.fasebj.org/cgi/content/meeting_abstract/24/1_MeetingAbstracts/682.3
Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Paracoccus_denitrificans
Kranz, R.; Gabbert, K.; Locke, T.; Madigan, M., Polyhydroxyalkanoate production in Rhodobacter
capsulatus: genes, mutants, expression, and physiology. Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, (8), 30033009. http://aem.asm.org/cgi/content/short/63/8/3003
www.tankonyvtar.hu
134
Ipari mikrobiolgia
[98]
Uyar, B.; Schumacher, M.; Gebicki, J.; Modigell, M., Photoproduction of hydrogen by Rhodobacter
capsulatus from thermophilic fermentation effluent. In Bioprocess and Biosystems Engineering, ed.;
'Ed.'^'Eds.' Springer Berlin / Heidelberg: 2009; 'Vol.' 32, p^pp 603-606.
http://www.springerlink.com/content/r628k6535t8kw72g/
Sang Seo Lib et al: Bacteriocin from Purple Nonsulfur Phototrophic Bacteria, Rhodobacter
capsulatus, Journal of Bacteriology and Virology 2009. Vol. 39, No. 4 p.269 276, DOI
10.4167/jbv.2009.39.4.269
http://synapse.koreamed.org/Synapse/Data/PDFData/0079JBV/jbv-39-269.pdf
Taro Miyazaki,* Teruhide Sugisawa, and Tatsuo Hoshino : Pyrroloquinoline Quinone-Dependent
Dehydrogenases from Ketogulonicigenium vulgare Catalyze the Direct Conversion of l-Sorbosone to lAscorbic Acid Appl Environ Microbiol. 2006; 72(2): 14871495. doi: 10.1128/AEM.72.2.14871495.2006.
Galata 3 : Roseobacter bacteria the oceans stars project, Dnia
http://130.226.56.246/uk/Menu/Science/Roseobacter+bacteria+%E2%80%93+the+ocean%E2%80%99s+
stars
Roseobase, Genomic resource for marine Roseobacters: http://www.roseobase.org/roseo/och114.html
Sulinet, Digitlis tudstr: http://sdt.sulinet.hu/Player/Default.aspx?g=954cccbf-ed5b-47dd-bb7328761eae299b&cid=ad91047e-4823-4393-b137-5f3cb2b945e9
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Hydrogenophilaceae
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Acidithiobacillus
Joint Genom Institute Genom portal: http://genome.jgi-psf.org/thide/thide.home.html
Wikipedia, the online encyclopedia: http://de.wikipedia.org/wiki/Neisseria#Neisseria_meningitidis
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Burkholderia
Mohana, S.; Shah, A.; Divecha, J.; Madamwar, D., Xylanase production by Burkholderia sp. DMAX
strain under solid state fermentation using distillery spent wash. Bioresource Technology 2008, 99, (16),
7553-7564.
Anke Baselin: Optimization of lipase production in Burkholderia glumae, PhD-disszertci (2005), Ruhr
Universitaet (Bochum).http://deposit.ddb.de/cgibin/dokserv?idn=978412117&dok_var=d1&dok_ext=pdf&filename=978412117.pdf
Dugan, P.; Stoner, D.; Pickrum, H., The Genus Zoogloea. In The Prokaryotes, ed.; Dworkin, M.; Falkow,
S.; Rosenberg, E.; Schleifer, K.-H.; Stackebrandt, E., Springer New York: 2006; 'Vol.' p^pp 960-970.
http://www.springerlink.com/content/m202714852322t01/
MicrobeWiki: http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Beggiatoa
Wikipedia, the online Ecyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Purple_sulfur_bacteria
Fodor Barna: Hidrogenz rs a Thiocapsa roseopersicina baktriumban, PhD disszertci (2003),
Szegedi Tudomnyegyetem, http://doktori.bibl.u-szeged.hu/37/3/tz_hu937.pdf
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Alcanivorax
Van Trappen, S.; Tan, T.-L.; Yang, J.; Mergaert, J.; Swings, J., Glaciecola polaris sp. nov., a novel
budding and prosthecate bacterium from the Arctic Ocean, and emended description of the genus
Glaciecola Int J Syst Evol Microbiol 2004, 54, (5), 1765-1771. DOI: 10.1099/ijs.0.63123-0.
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/citmgr?gca=ijs;54/5/1765
Gauthier, M. J.; Lafay, B.; Christen, R.; Fernandez, L.; Acquaviva, M.; Bonin, P.; Bertrand, J.-C.,
Marinobacter hydrocarbonoclasticus gen. nov., sp. nov., a New, Extremely Halotolerant, HydrocarbonDegrading Marine Bacterium, Int J Syst Bacteriol 1992, 42, (4), 568-576. DOI: 10.1099/00207713-42-4568
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/42/4/568
Joint Genome Institute: http://genome.jgi-psf.org/micde/micde.home.html
Assyrian International News Agency (2008): http://www.aina.org/news/20081201063837.htm
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Francisella
Wikipedia, the online Encyclopedia: http://hu.wikipedia.org/wiki/Tular%C3%A9mia
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Tetrodotoxin
Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Photobacterium
[99]
[100]
[101]
[102]
[103]
[104]
[105]
[106]
[107]
[108]
[109]
[110]
[111]
[112]
[113]
[114]
[115]
[116]
[117]
[118]
[119]
[120]
[121]
[122]
[123]
www.tankonyvtar.hu
8. Hivatkozsok
135
www.tankonyvtar.hu
136
Ipari mikrobiolgia
[150] Smith MT, van Grinsven AM. Dekkera anomala sp. nov., the teleomorph of Brettanomyces anomalus,
recovered from spoiled soft drinks. Antonie Van Leeuwenhoek 1984,50:143-148
http://www.springerlink.com/content/q62764570q553565/
[151] Susanne Prinz,1 Iliana Avila-Campillo,1 Christine Aldridge,1 Ajitha Srinivasan,1 Krassen Dimitrov,1
Andrew F. Siegel,1,2 and Timothy Galitski1,3: Control of Yeast Filamentous-Form Growth by Modules in
an Integrated Molecular Network, Genome Res. 2004, 14(3): 380390.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC353223/pdf/0140380.pdf
[152] Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Fungus#Taxonomy
[153] Hibbett DS, et al. (2007). "A higher level phylogenetic classification of the Fungi". Mycological Research
111 (5): 50947
http://www.clarku.edu/faculty/dhibbett/AFTOL/documents/AFTOL%20class%20mss%2023,%2024/AFT
OL%20CLASS%20MS%20resub.pdf
[154] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Basidiomycota
[155] Maszlavr Petra: A PECSTVIASZ GOMBA, GANODERMA LUCIDUM (CURT.: FR.) KARST
HAZAI TERMESZTEHETSGNEK LEHETSGEI, PhD disszertci, Budapesti Corvinus
Egyetem (2008) http://phd.lib.uni-corvinus.hu/319/
[156] M. Zhang, S.W. Cui, P.C.K. Cheung and Q. Wang: Antitumor polysaccharides from mushrooms: a
review on their isolation process, structural characteristics and antitumor activity, Trends in Food Science
& Technology 18 (2007) 4-19
[157] Ya-Jie Tang*, Li-Wen Zhu, Hong-Mei Li and Dong-Sheng Li: Submerged Culture of Mushrooms in
Bioreactors Challenges, Current State-of-the-Art, and Future Prospects, Food Technol. Biotechnol. 45
(3) 221229 (2007) http://www.ftb.com.hr/45/45-221.pdf
[158] World Congress on Industrial Biotechnology and Bioprocessing, 2009.07.22, Montrel, Kanada
[159] BIODIDAC -A bank of digital resources for teaching biology:
http://biodidac.bio.uottawa.ca/thumbnails/filedet.htm?File_name=ASCO005B&File_type=GIF
[160] Wikipedia, the online encyclopedia:
http://www.albertschatzphd.com/?cat=articles&subcat=streptomycin&itemnum=001
[161] Wikipedia, the online encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Streptomyces#Biotechnology
[162] Wikipedia, the online encyclopedia: http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Phylogenetic_tree_hu.svg
[163] Beile Gao and Radhey S Gupta: Phylogenomic analysis of proteins that are distinctive of Archaea and its
main subgroups and the origin of methanogenesis, BMC Genomics 2007, 8:86, pp1-23,
http://www.biomedcentral.com/1471-2164/8/86
[164] Discovery Health Webpage:
http://health.howstuffworks.com/wellness/men/how-to-get-rid-of-foot-odor1.htm
[165] Wikipedia, the online Encyclopedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Deinococcus_radiodurans
[166] Michael R. Tansey and Thomas D. Brock: The Upper Temperature Limit for Eukaryotic Organisms, Proc
Natl Acad Sci U S A. 1972 September; 69(9): 24262428.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC426956/
[167] Singh, S.; Madlala, A. M.; Prior, B. A., Thermomyces lanuginosus: properties of strains and their
hemicellulases. FEMS Microbiology Reviews 2003, 27, (1), 3-16
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T37-481FWG31&_user=303407&_coverDate=04%2F30%2F2003&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_origin=searc
h&_sort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1619039986&_rerunOrigin=google&_acct=C0000166
19&_version=1&_urlVersion=0&_userid=303407&md5=0002c9fee56e661909a8dfdc0572ce0b&searcht
ype=a
[168] Joint Genom Institute Genom portal: http://genome.jgi-psf.org/Spoth1/Spoth1.home.html
[169] Rezessy Sz. J.: Thermomyces lanuginosus
-galaktozidz enzim ellltsa s jellemzse, PhD
disszertci (2003), Budapesti Corvinus Egyetem http://phd.lib.uni-corvinus.hu/478/1/de_1612.pdf
[170] Young, J.; Kuykendall, L.; Martinez-Romero, E.; Kerr, A.; Sawada, H., A revision of Rhizobium Frank
1889, with an emended description of the genus, and the inclusion of all species of Agrobacterium Conn
1942 and Allorhizobium undicola de Lajudie et al. 1998 as new combinations: Rhizobium radiobacter, R.
rhizogenes, R. rubi, R. undicola and R. vitis. Int J Syst Evol Microbiol 2001, 51, (1), 89-103.
http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/51/1/89?maxtoshow=&hits=10&RESULTFORMAT=&author1=Yo
ung&fulltext=A+revision+of+Rhizobium+Frank+1889&andorexactfulltext=and&searchid=1&FIRSTIN
DEX=0&sortspec=relevance&resourcetype=HWCIT
www.tankonyvtar.hu
8. Hivatkozsok
137
www.tankonyvtar.hu
138
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu
139
Tblzatok
1.1.1. tblzat: Sznkdrendszer a Biotechnolgiai terletek jellsre ............................................ 5
1.2.1. tblzat: Fonalas gombk ipari felhasznlsa ......................................................................... 18
1.2.2. tblzat: Termofil mikroorganizmusok lelhelyei ................................................................. 20
2.1.1. tblzat: Acidiphiliumok tpkzege ....................................................................................... 45
2.3.1. tblzat: A legfontosabb mikrobilis szekunder metabolitok. ................................................ 47
2.3.2. gyakori mikrobilis szteroidkonverzik ................................................................................. 53
3.1.1. tblzat: A rendszertan fejldse ............................................................................................ 57
3.2.1. tblzat: Az sbaktriumok klnleges kpessgei................................................................ 66
3.2.2. tblzat: Bacillusok osztlya .................................................................................................. 93
www.tankonyvtar.hu
140
Ipari mikrobiolgia
www.tankonyvtar.hu