Proteoliza ili Cijepanje polipeptidnih lanaca ,vaan je korak u sazrijevanju
mnogih proteina. Jednostavan primjer je uklanjanje metionina sa aminokraja mnogih polipeptida, koje se deava ubrzo nakon to se amino-kraj rastueg polipeptida oslobodi ribozoma. Signalne sekvence signaliziraju translokaciju polipeptidnih lanaca preko plazma membrane u bakterijama ili u ER u eukariotima. Signalna sekvenca,se sastoji od 20 hidrofobnih aminokiselina na amino-kraju polipeptidnog lanca, ulazi u kanal u ER membrani cim izae iz ribozoma. Ostatak polipeptida se onda translocira kroz kanal i signalna sekvenca se cijepa djelovanjem enzima signalne peptidaze, uz oslobadjae zrelog proteina. Mnogi proteini su modificirani dodavanjem ugljikohidrata u ER-u, taj proces naziva se glikosilacija. Tako nastali glikoproteini se najee izluuju ili se nalaze na povrini -elija, iako ih nalazimo ponekad i u jezgru i citoplazmi. Tako se svi proteini krvne plazme (osim albumina) mogu ubrajati u glikoproteine. Glikoproteini se dijele na N-vezane i O-vezane u zavisnosti od mjesta na polipeptidu gdje se ugljikohidrat vee 3 su osnovna tipa modifikacije lipidima: N-miristoilacija, prenilacija i palmitoilacija Cetvrta modifikacija, dodavanje glikolipida, igra vaznu ulogu u vezanju nekih proteina za ekstracelularnu stranu plazma membrane GPI (glikozil fosfatidil inozitol) se veze za C-terminus proteina, veze protein za plazma membranu Glikozil fosfatidil inozitol (GPI) nastaje u ER-u i dodaje se polipeptidima vezanim za plazma membranu karboksi-terminalnim dijelom.