Professional Documents
Culture Documents
Szerzk:
1. fejezet: Lszl Valria
2., 3., 4., 6.,7. fejezetek: Tth Sra
5. fejezet: Pap Erna
8., 9.,10.,11.,12.,13.,14. fejezetek: Szalai Csaba
15. fejezet: Falus Andrs s Oberfrank Ferenc
Typotex Kiad
2013
COPYRIGHT: Falus Andrs, Lszl Valria, Oberfrank Ferenc, Pap Erna, Dr. Szalai
Csaba, Tth Sra, Budapesti Mszaki s Gazdasgtudomnyi Egyetem
5.5.2.1. Fenilketonria........................................................................................................... 75
5.5.2.2. Klasszikus albinizmus ............................................................................................ 75
5.5.2.3. Congenitlis adrenalis hyperplasia................................................................... 76
5.5.2.4. Xeroderma pigmentosum ..................................................................................... 76
5.5.3. Ciszts fibrzis ............................................................................................................................ 76
5.5.4. Hemoglobinoptik ........................................................................................................... 77
5.5.4.1. Sarlsejtes anmia................................................................................................... 77
5.5.4.2. Thalassemik ............................................................................................................. 77
5.6. Gnek s tumorok ......................................................................................................................... 77
5.7. Gnek s gygyszerek ................................................................................................................. 78
5.8. Konklzi ......................................................................................................................................... 79
5.9. Krdsek ........................................................................................................................................... 79
6. A nem szerepe az rkldsben ........................................................................................................ 81
6.1. X-kromoszmhoz kttt rklds ..................................................................................... 81
6.1.1. X-hez kttt dominns (XD) rklds ..................................................................... 81
6.1.2. X-hez kttt recesszv (XR) rklds ....................................................................... 82
6.2. Y-kromoszmhoz kttt (holandrikus) rklds ........................................................ 84
6.3. Nem ltal befolysolt rklds .............................................................................................. 84
6.4. Nemre korltozd rklds ................................................................................................. 84
6.5. Genomilis imprinting ................................................................................................................ 85
6.6. Citoplazmatikus rklds ........................................................................................................ 85
6.6.1. Anyai hats ............................................................................................................................ 85
6.6.2. Mitokondrilis rklds ................................................................................................ 85
6.7. Az X-kromoszma inaktivcija .............................................................................................. 86
6.8. A fejezethez tartoz krdsek .................................................................................................. 87
7. Biolgiai folyamatok genetikja ......................................................................................................... 88
7.1. Fejldsgenetika............................................................................................................................ 88
7.1.1. Morfognek ........................................................................................................................... 89
7.1.2. Homeobox gnek ................................................................................................................ 89
7.2. A nem genetikja ........................................................................................................................... 89
7.2.1. A hmnem kialakulsa emlskben ............................................................................. 90
7.2.2. A ni nem kialakulsa emlskben ............................................................................. 92
7.3. ssejtbiolgia ................................................................................................................................. 93
7.4. Onkogenetika .................................................................................................................................. 94
7.4.1. Onkognek ............................................................................................................................ 94
7.4.2. Tumorszuppresszor gnek ............................................................................................. 95
7.4.3. Anti-apoptotikus gnek.................................................................................................... 95
7.4.4. Telomerz .............................................................................................................................. 96
7.5. Immungenetika .............................................................................................................................. 96
7.6. A fejezethez tartoz krdsek ................................................................................................100
8. Bevezets a genomikba .....................................................................................................................101
8.1. Genomika .......................................................................................................................................101
8.2. Humn Genom Projekt ..............................................................................................................102
8.3. DNS-szekvenls .........................................................................................................................103
8.4. Rsztvevk a humn genom projektben ............................................................................105
8.5. A HGP nhny eredmnye .......................................................................................................105
8.6. A humn genom varicii ........................................................................................................107
8.7. Junk DNS a humn genomban ............................................................................................110
8.8. Komparatv genomika ...............................................................................................................112
1.1. bra. A sejtciklus fzisai (G1, S, G2, M) s ellenrzsi pontjai (G1, G2, M). Az irnyt
rendszer csak abban az esetben engedi folytatni a sejtciklust, ha az ellenrz pontokon
semmilyen hiba nem lltja meg a folyamatot
p16, p15, p18 s p19 s jellemzjk, hogy specifikusak, kizrlag a Cdk4 s a Cdk6
mkdst gtoljk, oly mdon, hogy megakadlyozzk a D ciklin ktdst, de a mr
kialakult a komplexnek az aktivitst is gtoljk. Az aktv Cdk4/6-D ciklin komplex
legfontosabb szubsztrtja a pRb (retinoblasztoma, a retina tumoros megbetegedst
okoz gn termke) s a p107, valamint a p130 fehrjk. Foszforillatlan llapotban
ezek mindegyike megkti az E2F-eket, a folyamatban kzponti szerepet betlt transz-
kripcis faktor csald tagjait. A pRb s a msik kt fehrje trszerkezete a foszforillds
hatsra gy vltozik meg, hogy elengedik az trst serkent E2F proteineket. Ez a
foszforillds jelenti a sejtciklus restrikcis pontjn val tlpst. Az E2F csald
tagjai ezutn szmos, az S fzisba lpshez szksges, illetve arra jellemz gn
transzkripcijt indukljk. Ilyenek pl. az E ciklin, az A ciklin, a timidin kinz, a DNS
polimerz stb. Az E ciklin a Cdk2-vel kapcsoldik s a Cdk4/6-D-ciklinhez hasonlan az
Rb proteint foszforillja elssorban (pozitv visszacsatols). Az A ciklin a Cdk2-vel
kapcsoldva viszont nlklzhetetlen az S fzis beindtshoz (1.2. bra).
1.3. bra. Az aktv MPF kialakulsa. A Cdk1-hez elszr a B ciklin kapcsoldik, majd a
komplexet kt, egy aktivl s egy inaktivl kinz foszforillja. A mg mindig inaktv
MPF-rl egy foszfatz lehastja az inaktivl foszftcsoportot s gy ltrejn az aktv MPF
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK28366/figure/A4636/?report=objectonly; 2013. 02. 20.
1.1.4. M-fzis
Az M-fzis, csakgy, mint az interfzis, egy sszetett folyamat, egymst kvet lpsek,
esemnyek sorozatbl ll, de nhny jellegzetes, morfolgiailag is elklnthet sza-
kaszra szoktk bontani. A mitzis alatt a sejt DNS-nek kromoszma formjban val
kettosztdsa, az azt kvet citokinzisben pedig a citoplazma felezdse trtnik.
Kohezin Kondenzin
ssze. Krlttk egy amorf, szerkezet nlkli terlet, a pericentriolris mtrix van,
amelyben sok klnbz fehrje tallhat. A centrilumok 9x3, szlkerkszeren
elrendezd mikrotubulusbl llnak. A pericentriolris anyagbl nnek ki csillagszeren
a mikrotubulusok, ezrt nevezik ezt a rgit aszternek (1.7. bra). A mikrotubulusok
vge a centriolumok fel, a vge pedig kifel ll. Minden eukaritasejtben van mikro-
tubulus-organizl centrum (MTOC), de ez nem felttlenl jelent centrilumot. Kimu-
tattk, hogy a mikrotubulusok organizlshoz, a tubulinmonomerek polimerizcijhoz
nem a centriolumra van szksg, hanem a tubulinnak egy formjra, a -tubulinra,
amely llati sejtekben a centroszmamtrixban, mint -tubulin-gyr, tallhat.
1.2. A meizis
A genetikai informcinak genercirl genercira trtn tadsnak kt formja van.
Az evolci sorn elszr az ivartalan szaporods alakult ki, amely elssorban az alacso-
nyabb rendekre jellemz. Meglehetsen egyszer folyamat, egyetlen szl kell hozz,
s mivel mitotikus osztdssal kialakul szomatikus sejtekbl, sejtcsoportokbl lesznek
az utdok, ezrt genetikailag azonosak lesznek a szlegyeddel.
Az ivaros szaporodsnak, amelyhez kt szlegyed kell, az a lnyege, hogy ennek a
kt szlnek a genomja keveredik egymssal, gy az utdok klnbznek mind a szleik-
tl, mind pedig egymstl. Az ivaros szaporodsnak egyik fontos evolcis elnye, hogy
egy adott faj egyedeinek genetikai vltozkonysgval lehetv vlik az elre nem
jsolhat, vratlan krnyezeti tnyezkhz val alkalmazkods. Nagyon fontos teht a
fajok fennmaradsa szempontjbl. A folyamat fontossgt az is bizonytja, hogy mg
azoknl az alacsonyabb rend llnyeknl is, ahol az ivartalan szaporods a jellemz
(pl. a baktriumoknl, az egysejteknl), elfordul az n. genetikai rekombinci,
amellyel idegen DNS, informci jut a sejtekbe, s gy a genetikai vltozatossg biztost-
hat.
Ez a rekombinci az ivarosan szaporod llnyeknl egy specilis sejtosztds, a
meizis sorn trtnik, amikor kialakulnak az ivarsejtek, ill. a gamtk, a nvnyekben
pedig a sprk.
Az ivarosan szaporod llnyeknl lnyegben a sejteknek kt nemzedke vlto-
gatja egymst: egy diploid sejtekbl ll, amely meizissal haploid sejteket hoz ltre, s a
haploid sejtekbl ll, amely pl. alacsonyabb rend nvnyeknl dominl lehet, de
magasabb rendeknl mr ersen redukldott, st llatokban egyetlen sejtre, az ivar-
sejtre korltozdik.
A haploid gamtk egyeslsvel (megtermkenyts), a zigta kialakulsval helyre-
ll a fajra jellemz diploid kromoszmaszm, s kezdett veszi egy j egyed lete.
Hogyan alakulnak ki ezek a haploid sejtek? A folyamat lnyege az elzek alapjn
ketts: a meizis sorn egyrszt felezdik a kromoszmaszm, msrszt pedig keveredik
a genetikai informci.
Meizis I
Non-
diszjunkci
Meizis II
Non-
diszjunkci
gamtk
1.2.2. Oogenezis
A legtbb llat esetben a petesejt igen nagy a testi sejtekhez kpest, ugyanis annyi
tartalk tpanyagot, sziket (lipid, fehrje, sznhidrt) kell tartalmaznia, ami elegend
az embrinak addig, amg nll tpllkozsra lesz kpes. A madaraknl pl. a tojsbl
val kikelsig kell a sziknek tpllni az embrit, ezrt nekik polilecitlis, sok sziket
tartalmaz petesejtjk van, mg az emlsk kis sziktartalm, oligolecitlis petesejt.
Ezzel egytt az emlsk s termszetesen az ember petesejtje is sokkal nagyobb mret,
mint a szomatikus sejtek.
Az sivarsejtek, az embri fejld gondjban oogoniumm (46 kromoszma) ala-
kulnak s mitzissal osztdnak. A meizis els osztdsba lpve primer oocitv (46
kromoszma) alakulnak, s a profzis diplotn szakaszban maradnak vekig, esetleg
vtizedekig. Kzben egy burok, a zona pellucida alakul ki krlttk, megjelennek ben-
nk az n. kortiklis granulumok, amelyek tartalma a spermium behatolsa utn rl
ki, s a felsznt megvltoztatva megakadlyozza jabb spermiumok behatolst a sejtbe.
A pubertskortl kezdve, hormonlis hatsra, ciklusonknt egy-egy sejt folytatja a
meizist. A citokinzisben a citoplazma aszimetrikusan vlik kett, a nagyobbik sejt a
msodlagos oocita (23 kromoszma), mg a kisebbik sejt a polocita (sarki sejt 23
kromoszma) lesz. A citoplazma egyenltlen sztvlst valsznleg a mitotikus ors
aszimetrikus elhelyezkedse biztostja. Mindkt sejt jbl osztdik, ez a meizis
msodik osztdsa: a sarki sejtbl kt sarki sejt (23 kromoszma) lesz, a msodlagos
oocita pedig, ismt egyenltlenl osztdva, ltrehozza a nagy petesejtet (23 kromo-
szma), s egy kis polocitt (23 kromoszma). Emberben, de ltalban a gerincesekben,
ez a msodik osztds szintn felfggesztdik itt, a metafzisban. Az ovulci alkal-
mval a sejt ebben a stdiumban kerl ki a petefszekbl, s csak a megtermkenyts
hatsra fejezdik be a meizis msodik osztdsa (1.15. bra).
1.2.3. Spermatogenezis
Mg a legtbb faj esetben a petesejt az adott llny legnagyobb, nll mozgsra nem
kpes sejtje, addig a msik gamta, a spermium a legkisebb, mozgsra is kpes sejt.
A spermatogenezis a pubertsban kezddik, a herecsatornk kls falt alkot sper-
matogniumok egy rsze folyamatosan mitzissal osztdik. Egy msik csoportja a
sejteknek ugyanakkor primer spermatocitv alakul, s belp a meizis els oszt-
dsba, amelynek a vgn kt haploid sejt, az n. msodlagos spermatocita keletkezik.
A msodik meiotikus osztdssal jnnek ltre a spermatidk.
Ezutn egy differencildsi folyamat kezddik, amelynek eredmnyeknt a kerek,
mozgskptelen sejtekbl aktv mozgsra kpes spermiumok lesznek. Ezt a differen-
cildsi lpst nevezik spermiohisztogenezisnek. A folyamat a Sertoli sejtekbe (dajka
sejtek) begyazdva trtnik. Innen a spermiumok a herecsatornk lumenbe kerlnek
(1.15. bra).
Puberts
kortl
vgein belsejben
A szinaptonms komplex
rvidebb hosszabb
vgein belsejben
A kiazmk szma
kevesebb tbb
csak egy, vagy bizonyos szervekben alakul ki, gy a korbbi heterozigta llapot elvsz,
s a homozigta mutns tumor szupresszor gn miatt kialakul a daganat. A jelensget a
heterozigtasg elvesztsnek = loss of heterozygosity = LOH-nak nevezik, s a mai
molekulris biolgiai vizsglmdszerekkel feldertve alkalmas lehet a rkmegelz,
prekancerzus llapot kimutatsra.
A csravonal (germinlis) mutcik az sivarsejtekben vagy a gametogenezis sorn
az ivarsejtekben bekvetkez mutcik, melyek az utdokra trktdnek, s ppen
ezrt orvosi szempontbl dnt fontossgak.
Eredetk szerint lehetnek spontn, a hibs DNS-replikci sorn ltrejv, s
klnbz krnyezeti hatsok (sugrzs, kemiklik stb.) induklta mutcik.
A mutcis gyakorisg fgg az evolcis szinttl, a DNS-hibajavts (repair) hinya
miatt prokaritkban jval magasabb a mutcis rta, mint az eukaritkban. Ennek
megfelelen a prokarita jelleg DNS-sel br mitokondriumokban is magas mutcis
gyakorisgot figyelhetnk meg. Ennek rtke mintegy tzszerese!! a nukleris DNS
mutcis rtjnak, ami gnenknt s genercinknt kb. 10-5.
2.2. Gnmutcik
A gnmutcik rinthetik az adott gn egyetlen bzist ekkor beszlnk szkebb
rtelemben vett pontmutcirl s rintheti a gn kisebb vagy nagyobb hnyadt is.
Az egyetlen bzisra korltozd mutci lehet bzisbetolds = addci; bziskiess =
delci, illetve bziscsere = szubsztitci. Az els kt esetben, ha a betoldott, illetve
kiesett bzisok szma nem egyenl hrommal vagy annak egsz szm tbbszrsvel
(6, 9, 12 stb.), akkor gynevezett frame-shift azaz kereteltolsos mutci jn ltre. Ez
azt jelenti, hogy a mutci helytl a transzkripcis leolvass irnyban a kdolt
informci megvltozik (lsd az albbi pldt).
Eredeti szekvencia:
slyosabbak a kvetkezmnyek is, azaz annl inkbb hibs, megvltozott vagy funkci-
kptelen lesz a fehrjetermk is.
A gnmutcik, pontosabban az addcik egy klnleges esete, amikor Alu szek-
vencik vagy LINE elemek transzpozcival vagy retrotranszpozcival beplnek
egy gn kdolszakaszba. Ekkor az ugrl elem (transzpozon vagy retropozon) be-
toldsa megszaktja az eredeti exonszekvencit, s gy megvltozott informcitartalm
RNS s fehrje kialakulshoz vezet. A hemoflia A nhny esetben egy Alu szekvencia
betolds a betegsg oka.
Hasonlkppen gnmutcit eredmnyezhet egy adott gnrekombinci eredmnye-
knt ltrejv megkettzdse is. Ez bekvetkezhet meizisban, amikor a nem test-
vrkromatidk kztti egyenltlen crossing over vezet gnduplikcihoz, vagy
mitzisban, amikor a nagyon ritkn mitotikus rekombinci (crossing over) zajlik
le a testvrkromatidk kztt. Ez utbbi esetben a mutci szomatikus, s pl. tumor-
kpzdshez vezethet, olyan utdsejtek ltrehozsval, amelyek egyikben a hetero-
zigtasg elvsz. (A msik utdsejtben a gn hrom kpiban fordul el, az egyik homo-
lgon gnduplikci van, a msikon egy kpiban lesz jelen az adott lkuszon.)
1.) a mutcit okoz kmiai reakcit fordtja-e meg, ez a direkt repair vagy
2.) a hibs bzis/oka/t vgja-e ki, s helyettesti jval, ez az n. exczis (kivgsos) repair.
1.) A direkt repair legjobb pldja az UV-sugrzs induklta timin dimerek elt-
voltsa. Az elssorban prokaritkra s nhny eukaritra (pl. leszt) jellemz folya-
mat a fotoreaktivci. Ennek sorn a lthat fny energijnak felhasznlsval a piri-
midin bzisok kztt ltrejtt ciklobutn gyr felhasad, s mivel a bzisok maradnak az
eredeti helykn, a korbbi szerkezet visszall.
Br az UV-sugrzs az egyik leggyakoribb mutagn (gondoljunk csak az egyre
nvekv zonlyuk miatt a Fld felsznt egyre intenzvebben r UV-sugrzsra),
sajnlatos mdon sok faj, kzte az ember sem kpes erre a fotoreaktivcis repairre.
Vajon ez magyarzhat az ember ksi azaz a vd zonpajzs, s gy a fldfelsznt elr
kisebb mennyisg UV-sugrzs megjelenst kvet evolcijval?
A msik direkt hibajavtsi mechanizmus az alkillt bzisok eltvoltsra szolgl. Az
O -metilguanin metiltranszferz enzim eltvoltja a guanin metilcsoportjt gy, hogy azt
6
2.) Az exczis repair a direkt hibajavtsnl sokkal gyakoribb. Hrom tpusa van:
a) bzis kivgsos
b) nukleotid kivgsos
c) mismatch (hibs illesztses) hibajavts
a) A bzis exczis repair sorn az egyetlen hibsan beplt bzis kivgdik, majd a
rst a DNS-polimerz a megfelel, immr j bzissal betlti, az p komplementerszlat
hasznlva templtknt.
b) A nukleotid exczis repair sorn nemcsak a mutlt rsz, pl. a timin dimer
vgdik ki, hanem az azt megelz s kvet nhny msik nukleotid is, azaz egy
rvidebb oligonukleotid. Ezutn a hinyt a DNS-polimerz betlti a srtetlen komple-
menterszl alapjn, s a DNS-ligz sszekti a rgi s a kijavtott szakaszt. E folyamathoz
emberben 7 klnbz gn termke szksges, melyek brmelyiknek hibja az UV-
A NHEJ sorn egy specilis DNS-ligz enzim egy kofaktor segtsgvel egyesti a trt
vgeket. Ha a ktszl trs terletn a ltrejtt darabokon az egyik szl tlnylik,
hosszabb, s mikrohomolg szakaszt is tartalmaz, a repair nagy valsznsggel pontos.
Ha a darabok vgein a szlak egyforma hosszak, nagyobb az esly nem sszetartoz
darabok egyestsre, s ezltal szerkezeti kromoszma rendellenessgre is.
A homolg rekombincin alapul javts vagy a homolg kromoszma megfelel
szakaszt, vagy a sejtciklus G2 fzisban a mr ltrejtt testvr kromatidt hasznlja fel
templtknt a hibajavtshoz egy, a crossing over sorn hasznlthoz hasonl enzimrend-
szer rvn.
Az SOS hibajavts vagy error-prone repair csak prokaritkban ismert (br felt-
teleznek hasonl mechanizmusokat eukaritkban is), s csak olyan extrm esetekben
mkdik, amikor a sejt tllse a tt. Ha igen ers sugrzs vagy ms mutagn tnyez a
DNS jelents rszt krostja, akkor nincs id a korbban emltett precz, mde
idignyes javt mechanizmusokra, hanem ha meglehetsen pontatlanul is, de vissza
kell lltani a DNS psgt, elkerlve ezzel az azonnali sejthallt. Knnyen belthat,
hogy ilyen mechanizmusra a tbbsejt eukaritkban nincs szksg, hiszen ott egyetlen
sejt pusztulsa nem jelenti az llny hallt; a tbbi sejt tveszi a kiesett sejt funkcijt.
Termszetesen a genom intaktsgnak megvsra nemcsak a klnbz hibajavt
mechanizmusok llnak rendelkezsre, hanem olyan inaktivcis rendszerek is, melyek a
mutagn hats anyagokat kzmbsteni, inaktivlni kpesek. Ilyen az oxidatv s ezrt
mutagn szuperoxidokat eliminl peroxiszomlis rendszer, amelyben a szuperoxid-
dizmutz a peroxidokat H2O2-v alaktja, majd azt a katalz bontja, s gy neutralizlja.
az angliai nyrfaaraszol lepke fehr, illetve fekete pigmentcij vltozatainak esete (ld.
http://biologiaievolucio.blogspot.hu/2012/01/nyirfaaraszolo-lepkek-evolucio-mukodes.html).
Ez egyben arra is figyelmeztet, hogy nemcsak a genetikai anyag, hanem ettl
fggetlenl a krnyezet is vltozik, s ami az egyik krnyezetben hasznos vagy
kzmbs volt, az a msik krnyezetben kros lesz, vagy fordtva.
Ezzel kapcsolatban meg kell emlteni azt is, hogy a vad/mutns gnvltozat, alll
megklnbzets mindig egy adott krnyezetre, populcillapotra vonatkozik: mindig
az a mutns jelenti a vad tpust, amelyik a leggyakoribb.
Hasznos webhelyek:
www.genomic.unimelb.edu.au/mdi/
www.hvgs.org/mutnomen/
http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/hahaha.php
http://decipher.sanger.ac.uk/
www.ncbi.nlm.nih.gov
3.1.1. Delcik
Ha egy kromoszma eltrik, s a letrt darab elvsz, delcirl beszlnk. Ekkor az
rintett sejtbl hinyozni fog a letrt darab ltal hordozott genetikai informci, aminek
kvetkeztben a sejt vagy nem normlisan mkdik, vagy elpusztul. Miutn a delcik
kvetkeztben bizonyos funkcik kiesnek, bizonyos fehrjk, pl. enzimek nem terme-
ldnek. A delcik segtsgvel fel lehet trkpezni a kiesett gn helyt ez volt a
gntrkpezs egyik legkorbbi mdja, a delcis trkpezs.
Ha a trs a kromoszma vghez kzel van, terminlis delci jn ltre. Ebben az
esetben egyb gnek mellett a telomra is elvsz, s ez is hozzjrul a tnetek slyos-
sghoz, a korai letalitshoz. A legismertebb plda a terminlis delcira a cri du chat
vagy macskanyvogs-szindrma: itt az 5-s kromoszma rvid karja deletl (5p-). A
betegsg az ilyen rendellenessget hordoz csecsemk jellegzetes, nyvog srsrl
kapta a nevt.
Az intersticilis delci sorn egy kromoszmn bell kt trs van, s a kztes
darab kiesik, majd elvsz. Az ilyen elvltozsok is ltalban igen slyos testi s szellemi
fogyatkossggal jrnak, spontn vetlshez, korai hallhoz vezethetnek az rintett
kromoszmtl fggen. A legismertebb intersticilis delci a 15-s kromoszma
hossz karjt rinti: del15(q11-13). Ez a PraderWilli-, illetve az Angelman-szindrma
3.1.2. Duplikcik
A duplikci sorn egy adott kromoszmarszlet megkettzdik. Ez vagy replikcis
hiba vagy a meizisban bekvetkez egyenltlen crossing over kvetkezmnye. Mindkt
esetben az rintett rgiban elfordul repetitv szekvencik magyarzhatjk a replik-
cis appartus elcsszst, illetleg a homolgok nem pontos prba llst (skipping).
A delcikhoz hasonlan a duplikcikat is felhasznltk egy gn, illetve gncsoport
kromoszmlis helynek azonostsra, vagyis gntrkpezsre.
3.1.3. Transzlokcik
A transzlokcik kialakulshoz egynl tbb, ltalban 2 vagy 3 trs kell. A letrt
rsz/ek thelyezdnek egy msik kromoszmra. Aszerint, hogy a letrt darab honnan
szrmazik, illetve hny darab cserl helyet, tovbbi alcsoportokat klntenek el a
transzlokcikon bell.
3.1.3.1. Reciprok transzlokcik
A reciprok transzlokci sorn legalbb kt trsponttal kell szmolni, amelyek lehetnek
kt homolg kromoszmn vagy kt teljesen eltr, nem homolgon is. A letrt
kromoszmadarabok kicserldnek, majd az j helyre forrnak vissza.
Ennek eredmnyeknt kt megvltozott szerkezet kromoszma jn ltre. Ez
azonban az esetek legnagyobb rszben nem okoz fenotpusos vltozst, azaz tneteket
vagy betegsget. Ilyenkor n. kiegyenslyozott transzlokcirl van sz. A jelensg
azzal magyarzhat, hogy csak az rintett gnek helyzete vltozik, maguk a gnek nem.
A trspontok ltalban a nem kdol szakaszokra esnek, ugyanis a kdol rgik
arnya az emberi genomban mindssze <2%.
Azokban az esetekben, amikor a trspont gnen bell van, az thelyezds nyomn
maga a gn srl, gy termke is hibs eltr funkcij vagy aktivits, mennyisg,
vagy esetleg funkcikptelen lesz, ami kros jellegek megjelenshez, pl. tumor-
kpzdshez vezethet.
Erre a legjobb plda a Philadelphia kromoszma (Ph1) kpzdshez vezet, a 9-es
s a 22-es kromoszmk kztti reciprok transzlokci, amelynek citogenetikai
rvidtse t(9;22)(q34;q11).
Ez a transzlokci a krnikus mieloid (CML), illetve az akut limfoid leukmiban
(ALL) fordul el. A 22-es kromoszmn a trspont a BCR (breakpoint cluster region)
gnben van, mg a 9-es kromoszma trspontja az ABL (Abelson murine leukemia)
protoonkognt rinti. Mivel az ABL gn egy tirozin-kinz enzimet kdol, a transzlokci
nyomn egy olyan BCR/ABL fzis fehrje keletkezik, amelynek nemcsak a molekula-
tmege nagyobb az eredeti enzimnl, hanem nagyobb az aktivitsa is. Ugyanis a
transzlokci rvn elvsz az ABL sajt, jl szablyozott promotere, ezrt folyamatosan
trdik. Vgl ez vezet a sejt ellenrizetlen szaporodshoz, azaz a tumor kiala-
kulshoz.
Egy msik, orvosi szempontbl fontos plda a tbbnyire EpsteinBarr-vrus ltal
okozott Burkitt-limfma. Ebben a betegsgben a 8-as kromoszmn kdolt cMYC
protoonkogn transzlokldik, vagy a 14-es, vagy a 2-es, vagy a 22-es kromoszmra
t(8;14) vagy t(8;2), illetve t(8;22), ahol vagy az immunglobulin nehzlnc (14-es kro-
moszma) vagy az Ig knnylnc gnjei (-lnc 2-es kromoszma, illetve -lnc 22-es
kromoszma) tallhatk. Mivel az Ig lncokat kdol gnek folytonosan trdnak, ezrt
az ide transzlokldott cMYC is amely egy heterodimer formban hat transzkripcis
faktort kdol llandan trdva tltermeldik, s a sejtproliferci fokozdshoz,
vgeredmnyben tumorkpzdshez vezet. A fenti kt eset jl pldzza a transzlokcik
s a protoonkognek kapcsolatt, ahol vagy a normlis fehrje tltermeldse (Burkitt-
limfma) vagy egy fzis br norml funkcij fehrje szablyozstl fggetlen
termelse (CML) felels a daganat kialakulsrt.
Ha 2 trspont helyett 3 fordul el, n. inzercis transzlokci, rviden inzerci j-
het ltre. Ekkor az egyik kromoszmbl kitrt darab (2 trs) bepl, inzertldik a
msik kromoszmba (1 trs).
Mivel az emberi kromoszmaszerelvny 46 kromoszmbl ll, s ezek brmelyik-
nek brmelyik darabja helyet cserlhet, gy nyilvnval, hogy a transzlokcis lehets-
gek szma szinte korltlan.
A transzlokcik egy specilis esete a Robertson-fle transzlokci vagy centrikus
fzi (3.2. bra). Ebben a szerkezeti kromoszma-rendellenessgben csak akrocentri-
kus kromoszmk vesznek rszt, teht emberben csak a 13-as, a 14-es, a 15-s, a 21-es
s a 22-es kromoszmk valamelyike lehet rintett. Nemcsak a rszt vev kromoszmk
tpusa, de a trspontok helye is szigoran megszabott: mindig a centromra kzelben
vagy a centromra terletn van a trs.
gy vagy olyan rendellenes fzionlt kromoszmk jhetnek ltre, amelyek egyike
kezdetben akr kt centromrt is tartalmazhat (dicentrikus), vgl azonban csak egy
centromra marad aktv; msik pedig centromra nlkli, ami a ksbbi osztdsok
alatt elvsz, s ezzel a kromoszmaszm is cskken.
Ha a trspont pontosan a centromra terletn van, kt egycentromrs, br tren-
dezett kromoszma kpzdik. Az trendezds kvetkeztben az eredeti akrocentri-
kusokbl kt eltr mret, egy nagyobb s egy kisebb, szubmeta- vagy metacentrikus
kromoszma jn ltre.
Kromoszma trsek
Fzi
Robertson-fle transzlokci
3.1.4. Inverzik
Az inverzi (megforduls) olyan szerkezeti kromoszmaaberrci, melynek sorn
ugyanaz a kromoszma ktszer trik el, s a trspontok kz es darab 180o-kal
megfordul. Kt tpusa van:
1.) pericentrikus
2.) paracentrikus inverzi
Mind a para-, mind pedig a pericentrikus inverzira igaz, hogy a trspontok ltal-
ban a nem kdolrszben vannak, ezrt az ilyen rendellenessget hordozk is normlis
fenotpusak.
A jelenlegi ismereteink szerint az inverziknak is szerepe lehetett az emberi
kromoszomlis evolciban, mivel nhny humn kromoszma szerkezete levezethet
az emberszabs s a keskenyorr (Catharrinae) majmok kromoszmibl. St ilyen
trendezdsek meglte vagy hinya alapjn (inv2) soroltk a szumtrai s bornei
orngutnokat kt kln alfajba, st ma mr kln fajnak tekintik ket.
3.1.6 Izokromoszma
Az izokromoszma olyan rendellenes szerkezet kromoszma, amely mindkt karjn
ugyanolyan gneket tartalmaz. Kialakulsakor a testvrkromatidk nem a kromoszma
hossztengelyre prhuzamosan vlnak szt, s kezdenek a sejt kt plusra vndorolni,
hanem a hossztengelyre merleges a sztvlsuk skja.
gy olyan utdkromoszmk, s vgl olyan ezeket tartalmaz utdsejtek alakulnak
ki, amelyek mindkt karjukon vagy csak a rvid karnak, vagy csak a hossz karnak
megfelel informcit hordozzk, a msik kar informcija elvsz. Mivel egy kromosz-
makaron sok-sok gn tallhat, ezrt akr ezek tbblete, akr ezek hinya igen slyos
elvltozsokhoz vezet, gyakran letlis. Kivtelt kpez az X- s az Y- kromoszma, a
legtbb ismert izokromoszms eset ilyen. Ennek oka, az Y-kromoszma viszonylagos
gnszegnysge, illetve az X-kromoszma inaktivci kompenzl hatsa.
A duplikci kivtelvel, a fenti szerkezeti rendellenessgek ltalban a DNS
megkettzdst megelzen (G1 fzisban) alakulnak ki, ezrt a replikci mr a srlt
DNS-t rinti, s azonos testvrkromatidk kialakulshoz vezet. Ezek sztvlsa az oszt-
ds vgn azonos kromoszmaaberrcit hordoz utdsejtek ltrejttt eredmnyezi.
Br az ilyen tpus elvltozsok mind mitzisban, mind pedig meizisban kialakulhat-
nak, orvosi szempontbl felttlenl az utbbi a fontosabb, hiszen a hibs gamta rvn
hibs kromoszmamutcit hordoz utd szlethet.
Kt bivalens
Kvadrivalens
Trivalens
szor mhen belli hallhoz, teht spontn abortuszhoz, halvaszlshez vezethetnek. En-
nek magyarzata a szerkezetileg hibs kromoszmk s normlis homolgjuk els meio-
tikus osztdsbeli prba llsnak nehzsgeiben rejlik (3.3. bra).
A reciprok transzlokcik esetn, a meizisban, a szoksos bivalens helyett, kvadri-
valens, a centrikus fziban trivalens, az inverzikban hurok alakul ki (3.4. bra), mely
megnehezti, nha megakadlyozza a normlis szegregcit, klnsen, ha figyelembe
vesszk a homolgok kztti rekombincit, a crossing overt is, s nagy valsznsggel
rendellenes kromoszmkat hordoz kiegyenslyozatlan ivarsejtkpzdshez vezet.
A spontn abortumok 10%-ban fordul el triploidia. rdekes mdon ezek 90%-a apai
eredet, vagy diploid spermium ltali megtermkenytsbl, vagy pedig ketts megter-
mkenytsbl szrmaznak. Csak kisebb hnyad ered diploid petesejt fertilizcijbl.
Gyakorisg (%)
16 22 21 15 18 13 9 14 4 20 7 8 17 2 nemi 3 12 6 10 11 5 1 19
kr.-k
3.4.1. Mozaicizmus
A genetikban mozaiknak nevezzk az olyan llnyt, melynek szervezetben kt el-
tr kromoszmaszm, de azonos eredet sejtvonal tallhat. Ezek vagy aneuploid
vagy poliploid mozaikok.
Az elbbiben a barzdlds sorn lezajlott mitotikus non-diszjunkci eredmnye-
knt, vagy anafziskss miatt kt olyan, eltr kromoszmaszm sejtvonal alakul ki,
ahol az egyik normlis, a msik aneuploid, ltalban triszmis. Pldul ktsejtes
embrit felttelezve, ha az egyik sejt normlisan osztdik, a msik pedig nem, akkor
vgl 2 normlis, 1 triszmis s 1 monoszmis sejt lesz. Mivel a monoszmis sejtek
nem letkpesek, vgl 2:1 lesz a normlis s a triszmis sejtek arnya.
3.4.2. Kimrizmus
A grg mitolgia oroszlnfej, madrkarm, kgyfark szrnye utn kimrnak nevez-
zk azt az llnyt, amely kt eltr eredet ms-ms zigtbl szrmaz sejtvonalat
tartalmaz. A kimra ktpetj ikrek sszeolvadsbl, a petesejt s a sarki sejt (polocita)
ketts megtermkenytsbl vagy leggyakrabban ktpetj ikrek kztti mhen bell,
transzplacentlisan zajl hemopoetikus ssejt-kicserldsbl (vrcsoport-kimrizmus)
szrmazik.
jabban kimrnak nevezik azokat a transzgnikus llatokat/nvnyeket is, melyek
vagy klnbz eredet sejteket tartalmaznak, pl. nhny sejtes embrik fzijbl
erednek, vagy idegen gnek bevitelvel, pl. megtermkenytett petesejtbe val mikro-
injektlsval hoztk ket ltre.
Az utbbi vekben tbb kzlemny foglalkozott a mikrokimrizmus jelensgvel.
Mr kb. 20 ve ismert, hogy az anyai szervezetben, vrkeringsben fimagzattal val ter-
hessg utn akr a szlst kveten, akr terhessgmegszakts utn Y-kromo-
szmt hordoz, azaz Y-test pozitv sejtek is kimutathatk. Mostanra azonban kiderlt,
hogy ezek az anyai szervezettl idegen sejtek sok vvel (vtizeddel!) ksbb is
kimutathatk, teht nemcsak tlltek, hanem valsznleg szaporodtak is. Ez azt jelenti,
hogy a magzatbl ssejtek kerltek t az anya szervezetbe, ahol a vrram tjn eljutva
bizonyos szervekbe, megtapadhattak, s sejtklnokat formltak. Ezrt az a hipotzis is
felmerlt, hogy nmely autoimmunnak vlt betegsg valjban nem is autoimmun, ha-
nem az anya, azaz a ni szervezet szmra 50%-ban idegen (immunolgiailag ssze-
frhetetlen) sejtek elleni immunreakcirl van sz. Ez egyben arra is magyarzattal
szolglna, hogy mirt gyakoribbak az autoimmun betegsgek nkben.
Ugyanakkor az ellenkez irny (anybl magzatba) transzplacentlis sejtvndorls
sem kizrt, s szerepe lehet az utd alloatignek elleni tolerancijban, br ennek mecha-
nizmusa s kvetkezmnyei kevss ismertek.
Hasznos webhelyek:
www.nlm.nih.gov/medlineplus/geneticsbirthdefects.html
www.mayoclinic.com/health-information
www.rarechromo.org/html/ChromosomesAndDisorders.asp#ANAL
www.livingwithtrisomy13.org
www.trisomy18support.org
www.t21online.com
www.williams.org
www.turnersyndrome.org
www.klinefeltersyndrome.org
www.pwsausa.org
4.1.1. DNS-metilci
A DNS epigenetikus mdosulsa a citozin metilcijt jelenti, amikor is 5-metil-citozin
(5MeC) jn ltre. Ebben az esetben a metilld citozinok majdnem kizrlag az n.
CpG-dinukleotidokban tallhatk. A CpG-dinukleotidok a DNS valamelyik szln kova-
lensen sszekapcsolt citozin- s guaninbzisokbl llnak. A metillt citozin ugyangy
guaninnal prosodik, mint a metillatlan, teht a DNS ltal kdolt informci vltozatlan
marad. Ugyanakkor az 5MeC metilcsoportja a DNS nagy rka fel nz, ezrt hozzfrhet
a klnbz DNS-kt fehrjk szmra. CpG-dinukleotidokat elssorban a gnek
promoter rgijban tallhatunk, de gntl fggen a gn belsejben, az exonokban,
illetve az intronokban is megtallhatak lehetnek. Nem minden CpG metillt, az adott
sejttl, illetve annak metabolikus llapottl is fgg, hogy ezek a CpG-dinukleotidok
mennyire metilltak, vagyis hogy milyen a metilcis mintzat. A promoter CpG-inek
metilltsga egy alapvet gnexpresszis szablyozst biztost: itt a metilci
ltalban (de vannak kivtelek) a gnexpresszi gtlshoz vezet. Mivel az epige-
netikus jelek sejtosztdsrl sejtosztdsra tovbbaddnak, de genercirl generci-
ra mr ltalban nem, ez azt jelenti, hogy a DNS-metilcit vgz enzimrendszer ennek
megfelelen specializldott. Kt f metilcis enzimet ismernk: a fenntart DNS-
metiltranszferzt (DNMT1) s a de novo DNS-metiltranszferzt (DNMT3). A DNMT1 a
DNS-replikci sorn, a rgi szlnak megfelelen, a komplementer j DNS-szl CpG-iben
megtallhat citozinokra teszi fel a metilcsoportot, ezltal fenntartja az eredeti metil-
cis mintzatot. A DNMT3 a korbban mg nem metillt citozinokat kpes metillni. En-
nek pedig a gametogenezis sorn van jelentsge, amikor az eredeti rklt szli min-
tzat letrldik, majd egy j, az llny nemnek megfelel metilcis mintzat pl fel.
A metilcis mintzat eltvoltsban a DNS-demetilzok vesznek rszt.
4.1.3. Hisztonmdosulsok
A DNS-metilci mellett a hisztonmdosulsok szerepe is alapvet az epigenetikus
folyamatokban. A hisztonok evolcisan ersen konzervatv, DNS-hez kapcsoldni
kpes, bzikus lizinben s argininben gazdag fehrjk. A H2A, H2B, H3 s H4 hiszto-
4.3.1. X-kromoszma-inaktivci
Az emlsk diploid organizmusok, ennek kvetkeztben egy bizonyos tulajdonsgrt fe-
lels autoszomlis gnlkusz mindkt alllja mkdik, vagyis a biallles gnexpresszi
a jellemz. Ha az autoszmk valamelyike kromoszmamutci kvetkeztben kiesik,
teht gy egy-egy lkuszon csak egy alll marad, ez ltalban letlis vagy slyos
tneteket eredmnyez. Ezzel szemben a nemi kromoszmk csak nkben alkotnak
homolg prokat (XX), mg a frfiakban az Y-kromoszma nem funkcionlis homolgja
letek sorn azt tapasztaltk, hogy ha egy egrpetesejtbe ugyanannak az egrnek egy
msik petesejtjbl szrmaz sejtmagot juttattak be, akkor az ily mdon ltrehozott
diploid sejt, egy gynogenota ugyan elkezdte az embrionlis fejldst, de hamarosan el-
pusztult, ugyanis a fetalis membrnok nem alakultak ki. Amikor a ksrleteket megism-
teltk oly mdon, hogy egy enuklelt petesejtbe kt spermiumbl szrmaz sejtmagot
juttattak, akkor, br szintn nem volt normlis az embrionlis fejlds, az elbbitl
eltr jelensget tapasztaltak. Az ilyen androgenotban embri nem, csak tlburjnz
fetalis membrnok alakultak ki. Vagyis az egrksrletek nyomn arra a kvetkeztetsre
jutottak, hogy az anyai s az apai genomfl funkcionlisan nem egyenrtk. Erre utaltak
olyan ritka emberi betegsgek is, mint a komplett mola hydatidosa. Ebben az esetben
csak apai eredet kromoszmkat talltak az szkterhessgbl szrmaz egybknt
diploid mintban. Vagyis egy res petesejtet valsznleg vagy egy diploid, vagy kt
spermium termkenytett meg, amire az is utal, hogy tovbbi vizsglatokkal minden
lkuszra homozigtnak bizonyultak. Ennek fordtottjt tapasztaltk a teratocarcino-
mk elemzsekor, amikor a kros szvetben csak anyai eredet kromoszmkat
talltak. Ezeknek a kezdeti megfigyelseknek alapjn gy vltk, minden kromoszmnk
hordoz valamilyen jelet, ami a szli eredetre utal. Ez a jel valamikor a gametogenezis
sorn rgzl, azaz valahogy bevsdik az rktanyagba. A genom szli eredetre
utal megjellst genomikus imprintingnek neveztk el.
Az imprinting mechanizmusnak tisztzsra tovbbi ksrletek trtntek. Amikor
az egrksrleteket oly mdon ismteltk meg, hogy csak egy kromoszmapr vagy egy
kromoszma distalis vagy proximalis rsze volt tisztn apai vagy anyai eredet, akkor
kiderlt, hogy nem a teljes genom, hanem csakbizonyos kromoszmaszakaszok, bizo-
nyos gnek hordoznak szli eredetre utal jelet. Ilyen jelensg az uniparentlis disz-
mia (UPD) is (lsd a 3. Citogenetika fejezetben), amikor ritka kromoszma szegregcis
anomlik nyomn olyan, a kromoszmaszmot tekintve normlis diploid szervezetek
jnnek ltre, ahol bizonyos kromoszmk/kromoszma rszek mindkt pldnya
ugyanattl a szltl szrmazik, s amik/akik az rintett kromoszmktl fggen slyos
tneteket, krkpeket mutatnak. Mivel a DNS bzissorrendje szempontjbl kzmbs,
melyik szltl szrmazik, a jellds epigenetikus. Ha egy apa egy olyan imprintlt
gnt ad tovbb gyermeknek, amit az desanyjtl rklt, akkor az adott gn
az apban anyai imprintinget hordoz, de az gyerekbe mr apai imprintinggel
kerl t. Ez azt jelenti, hogy az imprinting reverzibilis. Vagyis az X-inaktivcihoz
hasonlan, a szomatikus sejtekben az imprintinget eredmnyez epigenetikus jel, illetve
mintzat vltozatlan formban rkldik tovbb, de a csrasejtekben az eredeti
rklt mintzat letrldik, s az egyed nemnek megfelel j, ni vagy frfi epige-
netikus mintzat, imprinting pl fel. Eddigi ismereteink szerint emberben mintegy 100
imprintlt gnt ismernk, amelyek ltalban az egyedfejldsben klnsen a begya-
zds krli idszakban , a nvekedsben, illetve a viselkedsben jtszanak szerepet.
Ezek a gnek nem teljesen sztszrtan helyezkednek el a genomban, hanem csoportokat,
n. differenciltan imprintlt rgikat (clustereket) alkotnak. Egrben a 7. kromo-
szma, emberben a 11. s 15. kromoszma klnsen gazdag imprintlt rgikban.
4.3.2.1. Imprintinggel sszefgg betegsgek
Az imprintinggel kapcsolatos betegsgek kutatsa mg mindig gyerekcipben jr, hiszen
sok, nagyon finoman szablyozott mechanizmus vezethet ezek kialakulshoz. A legis-
mertebb, imprintingre visszavezethet betegsg a PraderWilli- s az Angelman-
szindrma, ahol a 15q11-q13 rgi rintett. Mg a PraderWilli vagy a fenti rgi apai
delcijnak vagy anyai UPD-jnek ksznhet, addig az Angelman-szindrma oka lehet
az anyai delci, az apai UPD, illetve az ebben a rgiban elhelyezked UBE3A (ubiquitin
ligz) mutcija is. St, mindkt esetben elfordulhat a magrt az imprintingrt felels
centrum (IC) mutcija is. A PraderWilli-szindrmt obezits, a kis kezek s lbak, a
kls nemi szervek fejletlensge, enyhe rtelmi fogyatkossg jellemzik. Az Angelman-
szindrmban egszen eltr tneteket figyelhetnk meg. Ekkor fejldsi visszamara-
dottsg, knyszeres mozgs, nevets, gyenge beszdkpessg vagy beszdkptelensg a
jellemzk.
Tovbbi ismert, ritka, imprintinggel kapcsolt betegsgek:
a. a BeckwithWiedemann-szindrma, ahol a 11p15.5 rgiban kt, differenciltan
imprintlt rgi (cluster) is megtallhat a H19, az IGF2 s a KCNQ10T gnekkel.
Az elbbire kisgyermekkori vesetumorral jr krkpek (Wilms-tumor, Beckwith
Wiedemann-szindrma) hvtk fel a figyelmet. A tumor kialakulsakor a vese-
szvetben a heterozigtasg elvesztse trtnik (LOH; lsd a mutcikat trgyal
2. fejezetben), de ekkor szinte mindig (tbb mint 90%-ban) az anyai alll vsz el.
b. a SilverRussell-szindrma (7p11.2 vagy 11p15.5);
c. a pszeudo-hipoparatiroidizmus (20q13.2)
d. a tranziens neonatlis diabetes mellitus (6q24).
4.3.2.2. Az imprinting clja
Szmos elmlet szletett az imprinting evolcis eredetnek magyarzatul. Az egyik
legismertebb az n. szli rdekellentt teria. Eszerint az apk akkor tudjk gnjeiket
a legjobban elterjeszteni, ha sok utdjuk van. Ha a sok szls kvetkeztben az anyai
szervezet kimerl, vagy az anya meghal, az apa egy msik partnerrel tovbbi utdokat
produklhat, s mg jobban elterjesztheti gnjeit. Ezzel szemben az anyk rdeke er-
forrsaik kmlse, vagyis azzal, hogy nem egyetlen utdba fektetik az sszes erforrst,
tovbbi reprodukcis ciklusokat is tllhetnek, s gy vgl is sikeresen adjk tovbb
sajt gnjeiket. Azaz az apai gnek serkentik mg az anya krra is a magzati nveke-
dst, mg az anyaiak korltozzk a magzat ltal hozzfrhet erforrsokat. Ez az elkp-
zels jl illeszkedik a mola hydatidosa s az ovarilis teratomk esetben megfigyeltek-
kel, illetve azzal a tnnyel, hogy az IGF2 (inzulinszer nvekedsi faktor 2 = insulin-like
growth factor 2) s receptornak (IGFR) gnje is imprintlt. E kt gn imprintingje
specilis: az apai IGF2 gn gyengn, mg az IGFR gn ersen metillt, az anyban ez pont
fordtva van. Ennek jelentsge abban ll, hogy ily mdon a kt szlbl szrmaz ha-
tsok kiegyenltdnek: hiba van tbb nvekedsi faktor, ha kevs a receptor. Mivel a
PraderWilli- s az Angelman-szindrma nem ersti meg a fenti terit, ezrt valsz-
nleg mg ms, nem ismert oka is lehet az imprintingnek. Az egyik ilyen jabb teria a
felegyenesedett testtartsnak s a terhessg alatti slyponteltoldsnak tulajdont sze-
repet. Eszerint az anyai imprinting korltozza a magzati nvekedst, s ezltal a sly-
pont elmozdulst, gy stabilabb tve a felegyenesedett testtartst s a jrst, ami let-
ment lehetett a korai embereldk szmra.
Hasznos webhelyek:
www.geneimprint.com
http://atlasgeneticsoncology.org/Deep/GenomImprintID20032.html
http://teach.genetics.utah.edu/content/epigenetics/
http://epigenie.com/
5.1. Bevezets
A mendeli rklds a klasszikus genetika alapja, s br mra jelentsen bvltek isme-
reteink e trgykrben, mindmig egyfajta viszonytsi pontknt szolgl a humn beteg-
sgek / jellegek rkldsnek vizsglathoz.
A mendeli rkldshez tartoznak leegyszerstve azok az rkldsi tpusok
sorolhatk, amelyek megfelelnek kt fontos kritriumnak. Egyfell alkalmazhatak rjuk
Mendel trvnyei, msfell a krnyezet nincs az rkldsre hatssal. Ily mdon a
klasszikus feloszts a kvetkez: autoszomlis dominns s recesszv, kodominns, X-
hez kttt dominns s recesszv, ill. Y-hoz kttt rklds.
A fenti kt kritrium merev rvnyessge s rtelmezhetsge az elmlt vtizedek
sorn azonban igencsak megkrdjelezdtt. Szmos olyan jelensg figyelhet meg
monognes betegsgek megjelensekor, amelyek nem rtelmezhetek a szigor beso-
rols szerint: vagy a dominancia elve akadozik egy-egy generciban, vagy a betegsg
slyossgi foka eltr, ill. a krnyezet befolysa sem teljesen mellkes ugyanazon gn
mutcijnak eltr manifesztldsakor. Mra mr egyrtelmv vlt, hogy az egy gn
egy lkusz genotpus csak rszben meghatrozja a betegsg klinikai tneteinek, s sz-
mos msodlagos genetikai faktor kombincija, valamint a krnyezet egyttesen alaktja
a kr manifesztldst, lefolyst. E jelensgek kz tartozik tbbek kztt a penetran-
cia, az expresszivits, az n. oligognes befolys, ill. egyb gn-gn klcsnhats, az
epigenetikus tnyezk kzl nkben az X-inaktivci, de a szmos egyb feltrt s mg
felfedezsre vr epigenetikai hats is.
Az emberi jellegek genetikjt nehezebb tanulmnyozni, mivel nincs md a visszake-
resztezsre, a genercik kzt eltelt id (genercis id) sokkal hosszabb, mint a klasszi-
kus modellek esetben (pl. baktriumok, lesztgomba, drosophila, egr, patkny) s
vgl a csaldok mrete is lnyegesen kisebb, mint a modellllatoknl.
Mig 6000-nl tbb monognes jelleget / betegsget ismernk. Fontos hangslyozni,
hogy mindezen monognes betegsgek htterben nem pontosan ugyanannyi teht kb.
6000 gn ll, hanem kevesebb. Ennek egyik oka az, hogy egyes gnek mutcii a kr-
nyezeti s egyb genetikai tnyezk (ld. lejjebb: modifiktor gnek) hatsra klnbz
betegsgekhez vezethetnek, s hasonlt tapasztalhatunk akkor is, ha ugyanabban a
gnben a mutcik a kdolt fehrje egy msik funkcionlis domnjt rintik. Msrszt
egyes betegsgeknl mikrodelcik, kromoszmaduplikcik okozzk a tneteket, mivel
azonban a mendeli szablyok szerint rkldnek, a humngenetikban a monognes
betegsgek kz soroljk ket. Radsul becslsek szerint a mendeli betegsgek kb.
10%-t nem a gnek kdol rgiiban elfordul mutcik okozzk. Ezek is mutatjk,
hogy az rklsmenet meghatrozsa nem a gnre, hanem a tulajdonsgra pl. A
mendeli rklds szerinti humn betegsgek elfordulsi gyakorisga a populcikban
Monognes
Huntington chorea AD 1:10 000
Osteogenesis imperfecta AD 1:10 000
Familiris hiperkoleszterinmia AD 1:500
Policiszts vese AD 1: 800
Ciszts fibrzis AR 1:3600
Fenilketonria AR 1:12 000
Albinizmus AR 1:100010 000
Duchenne-Izomdisztrfia XR 1: 4500 (fikban)
Mitokondrilis
Leber-fle optikus neuroptia 1:50 000
Kromoszmlis
PraderWilli szindrma Delci 1:30 000
Down-szindrma Triszmia 1:500 (lt. nem rkldik)
Multifaktorilis (Komplex)
Skizofrnia 1: 100
Diabetes mellitus II.* 7: 100
Diabetes mellitus I. 4: 1000
Mnis depresszi 1: 10
Emlkarcinma* 1: 10 (nkben)
Allergia 2: 10
Asztma 1: 10
Magas vrnyoms* 3: 10
Obezits* 1: 10
* Felntt-, illetve idskorban lnyegesen gyakoribb
5.1. tblzat. Nhny betegsg gyakorisga
A dominns letlis alll hallt okozhat mg azeltt, hogy utdokat hozna ltre az rintett
beteg (pl. HutchinsonGuilford-progeria http://ghr.nlm.nih.gov/condition/hutchinson-
gilford-progeria-syndrome). Ezltal kiszrdhetne a gn a populcibl, az jonnan
megjelen mutcik azonban jratermelik a letlis gnt. A Huntington Chorea esetben
pp ellenttes a helyzet: a hallos kimenetel betegsg ksn manifesztldik, vagyis
van ideje az rintett betegnek utdokat ltrehozni s trkteni a mutlt alllt.
Modifiktorgnek: azok a gnek, amelyek befolysoljk egy msik gn manifeszt-
ldst. Ilyenkor kt vagy tbb, klnbz lkuszon lv gnek kztti interakci tr-
tnik. Amennyiben egy eredetileg monognesnek vlt betegsg enyhbb vagy slyosabb
tneteket mutat, a httrben sok esetben az adott mutlt gn expresszijt befolysol
ms gnek llnak. Ezen, n. modifiktorgnek szma ltalban egy vagy kett. Valjban
ltezskre s befolysukra akkor irnyult figyelem, amikor a konkrt betegsggn
mellett ms, olyan mutlt gnt is talltak, amelynek a mkdse a betegsggn mani-
fesztcijra bizonythatan hatssal volt. Ezzel rtelmezhet, hogy ugyanaz a betegsg
eltr lefolys lehet az egyes egyedekben. (lsd expresszi, penetrancia feljebb). Az
episztzist sokig kln jelensgnek tekintettk, mra azonban vilgoss vlt, hogy nem
msrl van sz, mint a mr ismert s eddig ismeretlen modifiktorgnek s egyb gnek
kapcsolatrl. Jelenleg kevs modifiktorgnt ismernk mg, de felttelezhet, hogy a
gnek expresszijt, ill. egy betegsg manifesztldst nem pusztn egyetlen gn
irnytja, hanem sok esetben ezek a bizonyos modifiktorgnek is kzremkdnek (ld.
14. fejezet, Rendszerbiolgia). Tovbb rnyalja s bonyoltja a kpet, hogy a modifi-
ktorgnek is kvetnek valamilyen rkldsmenetet, teht azok mutcii is krdsesen
jutnak rvnyre, ugyanakkor a nem mutlt, egszsges modifiktorgnek egyni poli-
morfizmusaik szerint is eltren befolysolhatjk a betegekben a kr slyossgt. Azon
betegsgek rkldst, amelyeknl megtalltk mr a modifiktorgnt, teht bizonyt-
hatan nem egyetlen gn jtszik szerepet a betegsg kialakulsban, oligognes rkl-
dsnek nevezik. Ilyen pl. a ciszts fibrzis, vagy a policiszts vese. Mindkt betegsget
eddig klasszikusan a monognes rkldsek kz soroltuk. Azonban a teljes genom,
vagy az exom szekvenls olcsbb vlsval (10. fejezet), a rendszerbiolgiai szeml-
letnek megfelelen (14. fejezet) gyakorlatilag minden monognes betegsgrl ki lehet
mutatni, hogy az adott betegben a tnetekhez a f gn mutcija mellett szmos ms
gn mutcii, hatsai is hozzjrulnak.
Heterozigta elny (ld. mg 11. fejezet): az autoszomlis recesszven rkld be-
tegsgek esetben bizonyos krnyezeti tnyezknek ksznheten a heterozigtknak
reprodukcis elnye van/volt a homozigta egszsgesekkel szemben. Ez az adott be-
tegsg gyakorisgt az egyes populcikban jelentsen megvltoztatja. Brmilyen
krnyezeti hats befolyst vizsgljuk is a heterozigta elny kialakulsakor, valsz-
nsthet, hogy modifiktorgn-interakcik is szerepet jtszanak.
A nem befolysol hatsa: nhny betegsg megjelense vagy slyossga eltr a
frfi s ni nemben. (Rszletesen lsd a 6. fejezetben.) A nem ltal befolysolt jellegek
esetben egyes autoszomlis gnek az egyik nemben jobban expresszldnak (pl. ko-
paszsg), ill. a congenitalis adrenalis hyperplasia (CAH) esetben eltr fenotpus alakul
ki a kt nemben. Az n. nemre korltozd betegsgek esetben az rklds autoszo-
mlis, de specifikus hormonok szksgesek az expresszijukhoz, normlisan csak az
egyik nemben jelennek meg (pl. pubertas praecox.) A fenti esetben a nemi hormonok
mennyisge, ill. hatsa a f irnyt tnyez.
A krnyezet befolysol hatsa (ld. rszletesen a 12. fejezetben): egyes monognes
betegsgek a mutlt genotpus ellenre csak akkor manifesztldnak, ha meghatrozott
indukl hatsok rik a szervezetet. A kivlt ok sokszor gygyszer vagy lelmiszer.
Apai letkorfggs
expresszivits
heterogenits
heterogenits
Heterozigta
penetrancia
Anticipci
Inkomplett
Pleiotrpia
Fenokpia
alllizmus
Multiplex
Lkusz-
Vltoz
elny
Alll-
Achondro plasia X X
Marfan sz. X X X X
Osteogenesis ? X X X
imperfecta
Familiris X X
hiperkolesz-
terinmia
Polydactylya X X X
Huntington Chorea X
Siketsg X
Ciszts fibrzis X X X X
Fenilketonria X
Albinizmus X X
(albinjelleg)
CAH X X X X
Xeroderma X X
pigmentosum
Sarlsejtes anmia X X
5.5.2. Enzimoptik
A mutlt alllok mr heterozigtkban is cskkent enzimaktivitst eredmnyeznek. Ez
az aktivits heterozigtkban eshet pontosan a homozigta betegek s a homozigta
egszsgesek aktivitsrtkei kz, st, a hibs anyagcseretermk jelentsen emelked-
het is a szervezetben, ennek ellenre ltalban mgsem mutatkozik jele a betegsgnek.
A pleiotrpia jelensgt ezen betegsgeknl is knny rtelmezni, hiszen az enzimek
sokszor kaszkdreakcik valamely lpst katalizljk. Ha az enzim a kaszkd elejrl
vagy valamely elgazsi pontrl hinyzik, nagyobb a valsznsge, hogy tbb anyag-
csere-talakuls is krt szenved.
5.5.2.1. Fenilketonria
A fenilketonrit (PKU) a fenilalanin-hidroxilz hinya idzi el, tirozin helyett toxikus
hats fenil-piroszlsav keletkezik. A deficiencia a tirozin talakulsi kaszkdjt is
befolysolja. A tpllkkal kerl ugyan a szervezetbe tirozin, ez azonban alatta marad a
szervezet normlis tirozinignynek, ezrt kevesebb DOPA s melanin szintetizldik.
Mg a PKU fenilalanin-mentes vagy fenilalanin-szegny ditval kezelhet, ill. a mani-
fesztci kikszblhet, a vilgos br, kk szem, vilgos haj, mint fenotpus, megmarad
az rintettekben. jabban kiderlt, hogy a fenilalanin-hidroxilz tbbszzfle mutcij-
nak rvnyre jutst modifiktorgnek is befolysoljk.
5.5.2.2. Klasszikus albinizmus
Az n. klasszikus albinizmus kialakulsnak oka a tirozinkinz gn mutcija, minek
kvetkeztben a melaninszintzis elmarad. Ez az enzim is a fent emltett enzimkaszkd
egyik szereplje, gy a pleiotrp hats az albinkban is rvnyesl. Fontos azonban
megjegyezni, hogy szmos ms gn mutcija igen hasonl albin jelleget eredmnyez
fenotpust alakt ki. Ezek htterben hibs melanintranszport ll, a transzportban rszt
vev fehrjk gnjeinek meghibsodsa vgs soron ugyanazt a problmt idzik el, a
melaninszekrci hinyt. Mr szmos gn mutcijt azonostottk, s a betegsget is
ms-ms nvvel illetik (lkusz heterognia) (Ld. 5.3. tblzat.).
5.3. tblzat
5.5.4. Hemoglobinoptik
5.5.4.1. Sarlsejtes anmia
A sarlsejtes anmit okoz mutci az egyik legkzismertebb. A btaglobin lnc 6.
aminosavcserje glutaminrl valinra, egy transzverzis szubsztitcira vezethet vissza,
az ilyen hemoglobin az n. hemoglobin S. Ez az oka a sarl alak sejt ltrejttnek s az
abbl kvetkez szmtalan pleiotrp hatsnak. A malrival szembeni heterozigta-
elny kialakulsa is erre vezethet vissza (11. fejezet).
5.5.4.2. Thalassemik
A thalassemikat tbbfle mutci okozhatja, a hemoglobin alfa s bta lncban is ke-
letkezhetnek frameshift, delcis s splicing mutcik. Ez magyarzza, hogy a thalasse-
mik fldrajzi elterjedtsgkben s a slyossg mrtkben is jelentsen eltrhetnek
egymstl. A malria ellen szintn vdettsget lveznek a heterozigtk.
5.8. Konklzi
5.1. bra. A monognes rkldst befolysol tnyezk s azok egyms kzti kapcsolata
5.9. Krdsek
1. Hogyan szl Mendel I., II. s III. trvnye?
2. Mit jelentenek az albbi fogalmak? gn, alll, multiplex alllizmus, komplex hetero-
zigtk, lkusz heterogenits, alll heterogenits, dominancia, recesszivits, kodomi-
nancia.
3. Mely jelensgek miatt nem alkalmazhatak egyrtelmen minden monognes beteg-
sgre a Mendel-trvnyek?
4. Mit jelentenek az albbi fogalmak? Trstson pldabetegsgeket mindegyikhez!
pleiotrpia, expresszivits, penetrancia, anticipci, fenokpia, komplex heterozig-
tasg, heterognia, szubletlis/letlis gn, j mutci, modifiktorgnek
5. Mit jelent, hogy az letkor, ill. a nem befolysolja egy jelleg manifesztcijt? Milyen
pldabetegsget tud ezekhez a befolysol tnyezkhz trstani?
6. Hogyan osztlyozhatk a monognes rkldsi tpusok?
Ajnlott irodalom
http://ebooks.thieme.com
http://omim.org/
Nemnk egyrszt kzvetlenl a nemi kromoszmk, azaz az azok ltal kdolt gnek
rvn, msrszt indirekten a gametogenezis s megtermkenyts sajtossgai rvn is
hatssal van az rkldsre, a tulajdonsgok megjelensre.
1./ cikk-cakk rkldsmenet: a betegsg anyrl fira, a firl annak lnyra addik t
2./ a betegek szinte kizrlag frfiak (sokkal tbb rintett frfi van, mint n)
3./ beteg n beteg aptl s obligt heterozigta anytl szlethet
4./ beteg frfi rendszerint egszsges szlktl szrmazik, ahol az anya obligt hordoz
5./ nincs frfirl frfira val trkts
tpushoz kttt, ott a tnetek mozaikos formban jelennek meg. Ilyen a hipo-
hidrotikus ektodermlis diszplzia, ahol a mutci verejtkmirigy-hinyt s a fogazat
hinyt vagy rendellenes kialakulst okozza.
Hasznos webhelyek:
www.hemophilia.org
www.mda.org
Strachan and Read (2004) Human Molecular Genetics (2nd edition, Garland)
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=books
a. Fejldsgenetika
b. Onkogenetika
c. Immungenetika
7.1. Fejldsgenetika
A biolgia s a genetika szmra sokig megmagyarzhatatlan maradt az a tny, hogy
egyetlen megtermkenytett petesejtbl hogyan szrmazhat a szervezetre jellemz
annyifle sejt. Egy felntt szervezetben tbb mint 200-fle sejttpus tallhat, amelyek
genetikai anyaga, DNS-e azonos, ugyanakkor funkcionlisan jelentsen eltrnek. Csak az
epigenetikai szemlet (ld. 4. fejezet) tette/teszi lehetv az egyedfejlds sorn bekvet-
kez vltozsok pontosabb rtelmezst.
Az egyedfejlds sorn a fejldsi potencik fokozatosan beszklnek s gy a toti-
potens zigttl, a blasztociszta pluripotens embricsomjn t, eljutunk a csra-
lemezek multipotens sejtjeiig, s vgl a specifikus unipotens sejtekig, amelyek mr
csak sajt magukhoz hasonl sejtek ltrehozsra kpesek. A sejtsors-meghatrozs
vgeredmnyben egy naiv, sok mindenre kpes sejttel indul, amely genetikailag elkte-
lezdik egy meghatrozott irny differencildsra, s ezt kveten elszr reverzibilis,
majd irreverzibilis vltozsok eredmnyeknt eljut a vgdifferencildott llapotba,
amikor a sejt mr mindazokat jellegeket mutatja, amelyek az eredeti genetikai program-
bl megvalsultak.
Azonban mr korn nyilvnvalv vlt, hogy az egyedfejlds tulajdonkppen
nem ms, mint sejtsors- (cell fate) meghatrozs. Ennek sorn a differencild sejt-
nek egyarnt informcit kell kapni leszrmazsrl (lineage) s pozcijrl, azaz
sajt identitsrl. Mg az elbbiben elssorban intrinsic, bels (pl. az osztds szim-
metrikus vagy aszimmetrikus volta), addig az utbbiban kls, extrinsic tnyezk sejt-
sejt s sejt-mtrix klcsnhatsok vagy szolubilis morfognek jtszanak szerepet.
Az osztds aszimmetrijra pl. a neurogenezisben (neuroblast neuron + glia)
vagy a frfi, illetve ni gametogenezisben is tallunk pldt. Az elbbiben a spermatogo-
niumA s -B, az utbbiban a polocita s a petesejt ltrejtte egyarnt aszimmetrikus
osztds eredmnye. Az aszimmetria nem felttlenl jelent morfolgiai eltrst,
sokszor csak funkcionlis klnbsgek vannak az gy ltrejtt sejtekben (s aztn
az ebbl ered tbbi sejtben is). Br az aszimmetria oka nem teljesen tisztzott minden
esetben, felttelezik, hogy bizonyos gnek termkei nem egyenletesen oszlanak meg a
kiindulsi sejtben, s ez vezet az osztdsi ors tengelynek befolysolsn keresztl az
aszimmetrihoz. A msik lehetsges aszimmetriaok a magorst alkot mikrotubulus
tpusok (kinetokor, asztrlis, polris) eltr stabilitsn, s az ltaluk generlt hzerk
eltrsein alapul.
7.1.1. Morfognek
A sejtes differencildsban szerepet jtsz szolubilis molekulk, a morfognek,
amelyek hatsa a koncentrcigradiensktl fgg. Ilyen morfogn pl. az aktivin,
amely koncentrcijtl fggen kpes a klnbz sejttpusok meghatrozsra (pl.
~0,1 ng/ml koncentrciban mesenchima, mg 1,0 ng/ml koncentrciban harntcskolt
izom differencildst vltott ki in vitro).
Egy msik morfogn a sonic hedgehog, amelynek a velcs differencildsban
vagy a szemtelepek elklnlsben van szerepe. A velcsben a ventrlis, centrlis
sejtek ltal termelt sonic hedgehog fokozatosan diffundlva mr elenysz koncentrci-
ban jut el dorzlis sejtekhez, gy ezekbl rz neuronok jnnek ltre, mg a nagy(obb)
koncentrci hatsra a ventrlis s a laterlis sejtek mozgat neuronokk diffe-
rencildnak.
Az SRY egy olyan fehrjt ezt korbban TDF-nek, testis determinl faktornak
neveztk kdol, amely a korbbi elkpzelsekkel ellenttben, nem egy szokvnyos
transzkripcis faktor, hanem egy olyan fehrje, ami a DNS-hez ktdve azt meghajltja,
ezltal tve a klasszikus transzkripcis faktorok szmra hozzfrhetv a kzelben
lv DNS-szakaszokat, gneket.
Az SRY ltal beindtott differencildsi kaszkd kvetkez lncszeme a fejld
here Sertoli-sejtjeinek anti-Mller hormon (AMH) vagy MIS (Mullerian inhibiting
substance) termelse. Ezltal a ni nem fel val differencilds, vagyis a Mller-
vezetk fejldse gtldik. Ezutn nem sokkal megindul a Leydig-sejtek tesztoszteron-
termelse, s ezzel kialakulhatnak a gondok s a kls nemi szervek is.
Az SRY szerepre a korbban emltett ksrleteken tl emberi, a nem kialakulsnak
zavaraival jr betegsgek is utaltak. Ilyen a szexreverzi, amikor vagy XX nemi
kromoszmk mellett frfi fenotpus, vagy XY-genotpus mellett ni fenotpus
alakul ki. Ezek gy jhetnek ltre, hogy az apai meizis sorn a ktelez crossing
over helye nem a PAR1-ben van, hanem attl proximlisan, a centromra fel. gy
az SRY gn tkerl az X-kromoszmra, s ezzel egy rekombinns, hibs X s egy
mikrodeletlt Y jn ltre.
Olyan szexrevertnsok is vannak, ahol azrt alakul ki ni fenotpus, mert az SRY mu-
tlt. Ilyenkor sok esetben a fehrje HMG (high mobility group) rsze, vagyis a DNS k-
tdomnje hibs, s a DNS-kts elmaradsval a differencildsi kaszkd sem indul el.
Br az SRY nmagban elgsges a frfi nemi determincihoz, azaz a differen-
cilds elindtshoz, azonban szmos ms, autoszmlis (pl. a 17-es kromosz-
mn lokalizlt SOX9 [SRY HMG box related genes] transzkripcis faktort kdol gn) s
X-kromoszmra lokalizlt gn is szksges az SRY bekapcsolshoz, illetve a nemi
differencilds teljes folyamathoz.
A normlis nemi differencildshoz nemcsak az induktorok megfelel minsge s
mennyisge szksges, hanem az adekvt receptorok is. Ezek mutcija esetn is za-
vart szenved a nemi fejlds.
Az androgn inszenzitivitsi szindrma (AIS), korbbi nevn tesztikulris femi-
nizci (X-hez kttt, recesszv mdon rkld betegsg) hvta fel a figyelmet egy X-
kromoszmn lokalizlt gnre, melynek szerepe van a hm nemi differencildsban.
Ugyanis ebben a krkpben XY-genotpus s normlis szrumtesztoszteron-szint mellett
ni kls nemi jellegek alakulnak ki, holott a hasregben herk tallhatk! Mivel sem a
petefszek, sem az uterus nem fejldik ki, az ilyen betegek sterilek. A tnetekbl arra
lehetett kvetkeztetni, hogy a hiba a differencildsi kaszkd tesztoszteron utni
lpseiben keresend (vagy a receptor, vagy annak jeltvitele, esetleg a clgnek lehet-
nek hibsak). Vgl a tesztoszteronreceptor mutci(i)t azonostottk a szindrma
okaknt.
A hipofzis eredet nemi hormonoknak a nemi differencildsban betlttt szerept
bizonytjk a Kallman-szindrms betegek tnetei. E krkpben XY nemi kromosz-
mk mellett a herefunkcik hinya s a teljes szaglskptelensg (anosmia) a legjellem-
zbb tnet. A betegsg oka az X-kromoszma PAR1 rgijtl proximlisan elhelyezke-
d gn delcija. A gn egy olyan sejtadhzis fehrjt kdol, amelynek az idegsej-
tek vndorlsban van szerepe. Ezek az sidegsejtek az egyedfejlds sorn rszben a
szaglidegbe, rszben a hipotalamuszba vndorolnak. Ez utbbi helyen a gonadotrp
hormon releasing hormont (GHRH) termelik, s gy kzvetve a hipofzis gonadotrp
hormontermelsn keresztl a gondok differencildsra hatnak. Ezzel rthetv
vlnak a szokatlan tnetek: a herefunkcik s a szagls hinya. A KAL1 gnnek van Y-
kromoszms homolgja is, az azonban egy inaktv pszeudogn.
7.3. ssejtbiolgia
A fejldsbiolgiai ismeretek gyarapodsa tette lehetv az 1980-as vek elejn az egr
embrionlis ssejtjeinek tenysztst, majd ezt kveten a transzgnikus egerek ltre-
hozst is. Azta e kt terlet egymsra hatva fejldik, az ssejtekrl val ismetereink
gyarapodsa nagyban hozzjrult a fejldssel s a differencildssal kapcsolatos
genetikai tuds bvlshez, aminek nyomn 1996-ban sikerlt az els emberi embrio-
nlis ssejtvonal-alapts is, innen pedig az t elvezetett az induklt pluripotens
ssejtek (iPS=induced pluripotent stem sejtek) ltrehozshoz. A blasztociszta
embricsomjbl szrmaz pluripotens embrionlis ssejtekben rejl lehetsgeket
mr korn felismertk, s a tenysztsi krlmnyek megfelel megvlasztsval az egy
adott sejttpus irnyba trtn differenciltatsval pl. inzulintermel -sejtekk
vagy dopaminerg neuronokk a terpis alkalmazsuk is elrhet kzelsgbe kerlt.
Azonban az emberi embrionlis ssejtek felhasznlsa mindig slyos etikai problmt
jelentett. Honnan szrmazzanak a felhasznlt embrik? Szabad-e pusztn ksrleti clbl
emberi embrit ltrehozni? Az in vitro megtermkenytsbl szrmaz, beltetsre nem
kerlt, n. szmfeletti embriknak mi legyen a sorsuk? Ezekre a krdsekre a klnbz
orszgokban klnbz vlaszok szlettek, melyeket az adott orszgok trvnykezse
kodifiklt. (Haznkban j emberi ssejtvonalat nem lehet ltrehozni, csak a korbban,
klfldn ltrehozott nhny vonallal lehet megfelel engedlyek birtokban dolgozni.)
ppen ezrt fogadta a nemzetkzi tudomnyos kzssg nagy elismerssel Shinya
Yamanaka 2012-ben vgl Nobel-djjal jutalmazott ttr eredmnyeit. Az ltala ki-
dolgozott mdszer segtsgvel sikerlt felntt, differencildott (unipotens) sejteket
visszakldeni az embricsom vagy az epiblaszt pluripotens sejtjeinek megfelel
llapotba. Az gy ltrehozott sejttpust nevezzk induklt pluripotens ssejtnek. A
visszaprogramozshoz a fejldsgenetikbl mr ismert szerep, n. pluri-
potencia faktorok kombinciit hasznltk gy, hogy az ezeket kdol gneket tartal-
maz plazmidokkal transzfektltk a clsejteket. Mivel ezek kztt (LIF, SOX2, KLF4,
cMYC) onkogn is szerepelt (cMYC), az gy ltrehozott sejtek terpis cl alkalmazsa
nem lett volna biztonsgos, ezrt ma reprogramozsra szmos ms mdszert, pl. onko-
gnmentes kombincit vagy csak a pluripotencirt felels fehrjk keverkt, alkal-
maznak. Br az gy ltrehozott sejtek, az embrionlis ssejtekhez hasonlan, irnytottan
differenciltathatk, s br terpis alkalmazsuk esetn immunolgiai sszefrhetetlen-
sggel sem kellene szmolni, hiszen a sejtdonor s a recipiens ugyanaz a szemly lenne,
sajnos a differencilds s termszetesen a reprogramozs sorn zajl epigene-
tikus vltozsokat mg mindig nem ismerjk minden rszletkben. Legfkppen
az epigenetikus mintzat felplst s tkletes letrldst nem sikerlt
minden rszletben megismerni, s irnytottan befolysolni sem tudjuk mg.
Mindezekkel egytt az iPS sejtek mind fejldsgenetikai, mind terpis cl kutatsa
risi jelentsggel br, hiszen ezltal szmos betegsg gygytsa vlna lehetv s a
donorhinybl add nehzsgeket is lekzdhetnnk ltaluk.
7.4. Onkogenetika
Br a karcinogenezis folyamatairl s kialakulsuk okairl szmos ms tantrgy keret-
ben is hallanak, ebben a fejezetben a daganatkpzds fbb genetikai trtnseit foglal-
juk ssze, hiszen sejtszinten a tumorok genetikai betegsgnek tekinthetk.
A daganatos betegsgek 3-bl 1 embert rintenek vilgszerte, vagyis egy embernek
~ 33%-os eslye van a daganat kialakulsra. Mr ez a nagy gyakorisg is arra utal, hogy
a tumorok ltrejtte ltalban nem monognes eredet. Kivtelt kpeznek az olyan
ritka monognes tumorok, mint pl. a retinoblastoma vagy a Li-Fraumeni-szindrma.
Kialakulsuk htterben szmos genetikai eredet hajlamost tnyez (mut-
cik) s krnyezeti hatsok llnak.
A rkot olyan betegsgcsoportknt rhatjuk le, amelyet mutns sejtek korlt-
lan prolifercija s a szervezetben val sztterjedse jellemez.
A mutcik mind spontn, mind pedig valamilyen krnyezeti tnyez ltal indukl-
tan jhetnek ltre a 2. fejezetben (Mutcik s polimorfizmusok) trgyalt mechanizmu-
sok rvn. A legtbb mutagn anyag egyben karcinogn is.
A karcinogenezisben hrom nagy gncsaldot rint mutcik jtszanak
kulcsszerepet. Ezek az onkognek, a tumorszuppresszor gnek s az n. muttor-
gnek. A muttorgnek a DNS-hibajavtsban vesznek rszt (lsd 2. fejezet), teht ezek
hibs mkdse rvn rgzlhetnek a genomban a tumorkpzdshez vezet mutcik.
7.4.1. Onkognek
Az onkognek tulajdonkppen megvltozott funkcij, normlis gnek (protoonko-
gnek), amelyek alapveten a sejtciklus-szablyozsban jtszanak szerepet. Az ilyen
gnek kz tartoznak a nvekedsi faktorokat (pl. EGF), ezek receptorait (pl. EGFR), a
szignltranszdukcijukban rintett komponenseket (pl. Ras, Raf,) s transzkripcis fak-
torokat kdol gnek. Ezek mutcii vezethetnek el a nvekedsi faktoroktl fggetlen,
korltlan szaporodshoz pl. ez a mutns receptor tirozin kinzok konstitutv aktiv-
cijnak eredmnye is. Az onkognek aktivldst nemcsak a fenti szereplk pont-
mutcii, hanem gnamplifikci, illetve kromoszma-transzlokcik (pl. a krni-
kus mieloid leukmia esetben lert a Ph1 kromoszma ltrejtthez vezet t(9;22)
transzlokci (ld. 3. fejezet), amely egy fokozott tirozin-kinz aktivits fzis fehrjt
eredmnyez) is okozhatjk.
A klasszikus genetikai vltozsok mellett epigenetikai eltrsek epimutcik
is onkogn aktivldst vlthatnak ki. Ismeretes hogy az letkor elrehaladtval
fokozd genom hipometilci gyakran rint onkogneket. Ezzel nemcsak az on-
kognek nagyobb aktivitst tudjuk magyarzni, hanem azt az ismert jelensget,
hogy bizonyos daganatok gyakorisga az letkorral nvekszik. Az onkognek s az
7.4.4. Telomerz
Ismert, hogy az eukarita-DNS, a replikci sajtossgai miatt, a szomatikus sejtekben
osztdsrl osztdsra rvidl. Ez a kromoszmk telomrikus s szubtelomerikus
repetitv szakaszain jelentkezik, s kb. 5070 osztdst kveten a sejt elnyugvshoz, az
osztds lellshoz, regedshez vezet. A csravonal sejtjeiben a telomerz enzim,
amely egy reverz transzkriptz rszbl s egy telomerikus, DNS-komplementer
RNS-szakaszbl ll, kpes a telomra hosszt visszalltani. Ez a genom genercirl
genercira vltozatlan hosszban trtn tadsa szempontjbl alapvet fontossg.
Ugyanakkor a tumorsejtek is rendelkeznek telomra-helyrellt kpessggel. Ez
vagy a telomerz enzim indukcijval, vagy egy rekombincin alapul, alternatv
telomrahosszabbtssal lehetsges.
Ha egy sejt, klnbz mutcik miatt, elkerli az extrm rvid telomrk miatti
sejtpusztulst, genomja instabill vlik, ami a korbban mr emltett mutcikon (ampli-
fikci, transzlokcik) t a sejt onkogn transzformcijhoz vezet. Ezt csak tovbb
erstheti a mutlt gnek ltal induklt telomerz (pl. c-MYC kpes a telomerz promo-
terhez ktdve azt aktivlni!).
7.5. Immungenetika
Az immunolgia tantrgy keretben szmos, az immunrendszer mkdse szempontj-
bl alapvet genetikai folyamatrl is sz esett. Ezek kzl taln a legklnlegesebb az a
folyamat, amely az immunglobulinok (B-sejt receptorok) s a T-sejt receptorok risi
diverzitshoz vezet. Minden ember kb. 1011-fle ellenanyagot kpes ellltani,
holott az emberi haploid genom mrete csak 3x109 bzispr.
Ennek az ellenmondsnak a feloldst a szomatikus gntrendezds s szoma-
tikus mutcik teszik lehetv.
Az emberi genomban csak 3 immunglobulin (Ig)/B-sejt receptor (BCR) lkusz (IGH,
IGK s IGL) van, amelyek a nehz- s a ktfle knnylncot ( s ) hatrozzk meg,
valamint 4 T-sejt receptor (TCR) lkusz (TRA, TRB, TRG s TRD) tallhat, amelyek a 4
(,, s ) TCR lnc szintzist teszik lehetv.
Az risi diverzits ellenre minden egyes B- s T-sejt monospecifikus, azaz csak
egyfle Ig-t vagy TCR heterodimert kpes ellltani, amelyek csak egyetlen antignre
specifikusak. A klnbz B- s T-sejtek ms-ms antignre specifikus, ms-ms Ig-t s
TCR heterodimert expresszlnak, gy az e sejtek millirdjaibl ll populci egyttese
teszi az immunrendszert gyakorlatilag brmilyen antign felismersre kpess. A
diverzits a megfelel gnek sajtos jelrendezdsnek s expresszijnak ksznhet.
Emlkeztetl tekintsk pl. az Ig-okat. Minden Ig 4 lncbl ll, 2 nehz- (H) s 2
knny-(L)lncbl. Minden lnc pedig egy variblis (V) s egy konstans (C) rgit tartal-
maz. Az emberi genomban nincsenek komplett gnek a nehz s a knny Ig lnc meg-
hatrozsra, hanem minden egyes H s L lnc szmos egymstl szeparlt gn ltal meg-
hatrozott. A nehzlnc varibilis rgija 3 domnbl: a V(variable), a D (diversity) s J
(joining) ll. A knnylnc esetben a D szegmens hinyzik. A H lkuszon kzel 200 V,
Hasznos webhelyek:
www.imgt.org
www.p53.iarc.fr6index.html
www.methylgene.com
www.cancer.org
www.isscr.org
8.1. Genomika
Br a genomika tudomnya mr tbb vtizedes mltra tekint vissza, tulajdonkppen
csak az elmlt kt vtizedben vlt mg az l termszettudomnyokkal foglalkozk
kztt is igazn ismertt. Annak ellenre azonban, hogy jelenleg is a leggyorsabban
fejld tudomnygak kz tartozik, a htkznapi emberek tlnyom tbbsge, st
pldul a rgebben vgzett orvosok, gygyszerszek szmra is gyakorlatilag ismeretlen
fogalmat takar. ppen ezrt a bevezetben nhny fogalmat definilunk.
Elszr is: Mi az a genom? A genom: Egy szervezet rkld informciinak sszes-
sge, mely DNS vagy egyes vrusokban RNS formjban troldik. A genom magba
foglalja mind a fehrjket kdol gneket, mind a nem-kdol DNS/RNS szekvencikat.
Emberben a genom egy diploid sejt teljes haploid DNS-tartalma, plusz a mitokondrilis
DNS. Mivel a frfiak s a nk genomja klnbzik abban, hogy a frfiaknak ktfle nemi
kromoszmjuk van (X s Y), a genom meghatrozsnl ezt is figyelembe kell venni. A
kvetkez fontos krds, hogy mivel foglalkozik a genomika? Igazbl erre tbbfle
defincit is lehet adni, ezek kzl taln a legegyszerbb: A genom mkdsnek, szer-
kezetnek, klcsnhatsainak vizsglata s az ezekhez tartoz mdszerek. A DNS vizsg-
latn tl azonban ide tartoznak az RNS-ek vizsglatai (transzkriptomika), a fehrjk
vizsglatai (proteomika), s a bioinformatika is. Mivel angolul a genomika s a hozzkap-
csold tudomnyok j rsze omics-ra vgzdik, ezekre sszefoglal nven omics-
knt, magyarul omika-knt is szoktak utalni, s nll szv, st tudomnygg ala-
kult (http://en.wikipedia.org/wiki/Omics; http://www.omicsworld.com/).
Egyes meghatrozsokban a genomikt a molekulris rendszerbiolgia szinonimj-
nak is definiljk, amelyben a genomszint szervezdsek alapjn ismerjk meg a vil-
got. Valjban a genomika inkbb a rendszerbiolgia rsznek tekinthet. A genomika
vizsglatnak trgya alapjn klnbz alcsoportokra oszthat. Lehet pldul: struktu-
rlis genomika; komparatv genomika; funkcionlis genomika; humn genomika; farmako-
genomika; orvosi genomika stb. Ebben a knyvben fleg az utols hrommal foglalkozunk.
Van mg egy fontos krds, ami sokak szmra problmt jelent. Mi a klnbsg a
genetika s a genomika kztt? Igazbl nem hzhat les hatrvonal a kt tudo-
mnyg kz, mindenesetre ltalnossgban elmondhat, hogy ha egy gnt vagy geneti-
kai varicit vizsglunk, akkor genetikrl szoktunk beszlni, ha tbb gnt vagy az egsz
genomot mint rendszert vizsgljuk akkor genomikrl beszlnk. Ebbl kvetkezik,
hogy a genomika, mivel a rendszerbiolgia tmakrbe tartozik, ltalban jval ssze-
tettebb mdszereket ignyel. Azonban, mg a tudomnyos szhasznlatban is, a kt sz
hasznlata ers tfedst mutat.
alaktottak ki. Mindezek hatsra 1999-tl 15 hnap alatt 10%-rl 94%-ra ntt a meg-
ismert humn szekvencia arnya. A szekvenlsokat nagy, gyrszer pletekben vgez-
tk. A szekvenls sebessgre jellemz, hogy 1999-ben a HGP havonta 7 milli mintt
dolgozott fel, s msodpercenknt 1000 nukleotidot szekvenlt meg. A Celera teljestm-
nye mg lenygzbb. A mindssze 65 fs szemlyzetbl ll szervezet 1999. szeptem-
ber 8-a s 2000. jnius 17-e kztt 14,9 millird bzist szekvenlt meg, ami a teljes hu-
mn genom kzel 5-szrs lefedst tette lehetv. A Celera s a HGP vgl egymssal
megegyezve, egyszerre, 2001 februrjban, ugyanazon a hten kzltk eredmnyeiket
a vilg kt vezet tudomnyos lapjban, a Nature-ben s a Science-ben [2, 3]. A kzlt
eredmnyek mg csak a humn genom n. draft szekvencijt tartalmaztk, azaz
szmos lyuk (gap) volt mg benne, illetve sok szekvenlsi hibt tartalmazott. Ebben egy
szekvencia 4-5-szrs lefedssel volt megszekvenlva. A HGP hivatalosan 2003 prili-
sban zrult, amikorra elkszlt a magas minsg, jval kevesebb lyukat tartalmaz, 8-
9-szeres lefedettsg humn genom szekvencija [4].
8.3. DNS-szekvenls
A DNS-szekvenls fejldse a HGP befejezse ta is tretlen. A humn genom szek-
vencijt a HGP-ben Sanger mdszervel a didedoxi-szekvenlssal hatroztk meg. A
HGP sszkltsge 3 millird $ volt, Craig Venter genomjnak megszekvenlsa sszesen
70 milli $-ba kerlt. 2001-ben egy humn genom megszekvenlsa minimum egy vbe
tellett. Nyilvnval, hogy ekkora kltsg s ennyi id nem alkalmas arra, hogy a genom-
szekvenls a mindennapi rutinn vljon, de mg arra sem, hogy sok ember genomjt
megismerjk, sszehasonltsuk. Az is lassan vilgoss vlt, hogy ennek a mdszernek a
tovbbfejlesztsvel nem lehet jelentsen cskkenteni a kltsgeket, illetve az idt.
Azonban a szakrtk szmra nyilvnval volt, hogy ha olcsv s gyorss lehetne tenni
a szekvenlst, az risi elrelpst jelentene pldul a gygyszerkutatsban vagy a
szemlyre szabott gygyszatban, de a felhasznlsi lehetsgek szma szintn vgtelen.
Hogy a fejlesztseket elsegtsk, ltrehoztk az Archon X-djat a genomikrt (8.1.
bra) [5]. Ezt a djat, 10 milli $-ral egytt, az a cg kapja, amelyik kpes 100 emberi
genomot, maximum 10 nap alatt, maximum 1 hibval 100 ezer bzisonknt, s nem
tbbrt, mint 10 ezer $/genom kltsgrt megszekvenlni. Ez a felhvs 2006-ban sokak
szmra mg kicsit utpisztikus vgylomnak tnt, azonban hamarosan kiderlt, hogy a
clt valsznleg hamarabb fogjk elrni, mint ahogy azt sejtettk. Abban mindenki
egyetrtett, hogy nem is a kitztt 10 milli $ az igazi tt, hiszen, ha egy cg jelents
piaci elnyhz jut ezen a piacon, az ennl nagysgrendekkel nagyobb hasznot fog elrni.
Mindenesetre szmos cg, illetve szervezet egymssal prhuzamosan olyan radiklisan
j fejlesztsekbe, jtsokba fogott, hogy rvidesen tbben is a cl kzelbe kerltek. A
didedoxi-szekvenls helyett olyan mdszereket fejlesztettek ki, mint pl. a szekvenls
liglssal (solid technolgia, Applied Biosystem), a piroszekvenls (454 technolgia,
Roche) vagy a szekvenls reverzibilis termintorral (Solexa technolgia, Illumina). A
mdszerek annyira sikeresek voltak, hogy a szekvenlst 2007-ben megvlasztottk az
v mdszernek [6]. Az j mdszerek kzl elszr 2007-ben, a 454 technolgival,
James Watson genomjt szekvenltk meg 2 hnap alatt, 1 milli $-rt, ami mg ugyan
messze volt a kitztt cltl, de mris risi elrelpst jelentett a korbbiakhoz kpest.
St az sszes cg folyamatos fejlesztsben van, s egyre lejjebb szortjk mind az idt,
mind a kltsgeket. Pldul az Applied Biosystem 2008-ban 6 ezer $-rt szekvenlt meg
egy genomot. 2011-ben az Illumina HiSeq 2000 rendszervel 30x-os lefedettsggel kt
emberi genom megszekvenlsa 8 nap alatt trtnik, 6 ezer $ dollr/genom kltsggel. A
Complete Genomics nev cg egy cikkben 40x-es lefedettsggel mr 1500 $-rl rt. De a
verseny tovbb folyik, j technikkkal vagy a rgiek tkletestsvel szinte havonta
jelennek meg jabb hrek a szekvenls rnak cskkensrl s sebessgnek nveke-
dsrl (8.2. bra).
A szekvenls fejldst kihasznlva olyan projektek indultak, mint pl. az 1000
genom projekt, amely klnbz etnikum populcikhoz tartoz, sszesen 2500 ember
megszekvenlst tervezi. A projekt 2008-ban indult, s els eredmnyeit mr 2010
oktberben kzltk [7, 8]. De ilyen projektek pldul a Genome 10k projekt, amely
10 ezer gerinces faj megszekvenlst tervezi (http://genome10k.soe.ucsc.edu/), vagy a
2011 mrciusban indult i5k projekt, amely 5000 rovar megszekvenlst tzte ki clul
http://www.arthropodgenomes.org/wiki/i5K).
Legnagyobb gn: DMD, mely a Dystrophint kdolja: 2,2 Mb (2 221 182 bp)
Leghosszabb kdolszekvencia: titin: 104 076bp, < 34 500 aminosav)
Leghosszabb exon: titin: 17 106 bp
Becslsek szerint a teljes genom 12%-t rintik ezek a varicik, s eddig 2900 gnt
(a gnek 13%-a) talltak, amely rintett. Ez azt jelenti, hogy egyes emberek klnbz-
hetnek abban, hogy egy gnbl hny kpia tallhat meg bennk. Az esetek tbbsgben
ez semmilyen lthat tnetet nem okoz, de mr szmos betegsgben igazoltk a CNV-k
szerept. Ilyen pl. a skizofrnia, a HIV/AIDS hajlam, a Crohn-betegsg, vesebetegsgek,
Alzheimer-kr vagy az obezits. Az SNP mintjra, ahol a polimorfizmus sz arra utal,
hogy a varici gyakorisga nagyobb, mint 1%, bevezettk a copy number polymor-
phism (CNP) kifejezst is a gyakori CNV-kre.
A betegsgek mellett pl. a transzplantciban is szerepet jtszhatnak a CNV-k.
Pldul, vannak populcis szinten is gyakori, egsz gneket rint delcik. Ilyenkor,
ha a beltetst kap szervezetbl hinyzik egy gn, s gy az abbl expresszld fehr-
je, akkor, ha a donorszervben megtallhat ez a fehrje, az akceptor szervezet immun-
vlaszt adhat a beltetett szerv ellen az MHC-egyezs ellenre, pl. csontveli ssejt
tltetsnl graft versus host betegsg lphet fel [11].
A CNV-kkel kapcsolatban mg egy rdekes felfedezst tettek. ltalnosan elfogadott,
hogy az egypetj ikrek genetikailag teljesen egyformk. Ezt a dogmt vltoztathatja
meg az a felfedezs, hogy klnbsget talltak a CNV-k tekintetben egypetj ikrek
kztt [12]. Ez utbbi azt is mutatja, hogy szomatikusan is keletkezhetnek, pl. a magzati
fejlds sorn.
A CNV-k kimutatsa szempontjbl fontos, hogy a CNV-k egy rsznl tallhat olyan
SNP, amely kapcsoltan rkldik, azaz ezeknek a CNV-knek a kimutatshoz elgsges a
sokkal egyszerbben (ld. mdszerek fejezet) kimutathat SNP-ket detektlni.
A CNV-ket is figyelembe vve egy ember kt genomja (itt a kt szltl kapott kro-
moszmakszlete) tlagosan 0,5%-ban klnbzik egymstl, azaz a CNV-k krlbe-
ll 4x akkora klnbsgrt felelnek, mint az SNP-k. Ezt az elsnek megszekvenlt ember,
Craig Venter genomjbl llaptottk meg ([13] 8.2. tblzat). Azonban a klnbsg trt-
nelmileg rgen elvlt embercsoportok kztt akr a 3%-ot is elrheti. rdekessg, hogy
ezek a klnbsgek egy rsze vletlenszer mutcik rvn alakult ki (s n. random
drift, azaz vletlen sodrds sorn halmozdhat fel loklisan), msik rszk kialakuls-
ban viszont a termszetes szelekci jtszott szerepet. Ide tartoznak pl. a brsznt, vagy
az immunvlaszt befolysol (baktriumok, vrusok ltal formlt) genetikai varicik,
melyek egy rszt mr sikerlt beazonostani (ld. gn-krnyezet fejezet).
SNP-k szma
J. Craig Venter genomja 3 213 401
James Watson genomja 3 322 093
zsiai genom 3 074 097
Yoruban (afrikai) genom 4 139 196
Szerkezeti varinsok Venter genomjban
Darab Hossz (bp)
CNV 62 8 8551 925 949
Inzerci/delci 851 575 182 711
Blokkszubsztitci 53 823 2206
Inverzi 90 7670 345
8.2. tblzat. Genetikai varicik arnya klnbz megszekvenlt humn genomokban [13]
Fehrjekdol rgik
RNS-kdol (fehrjre nem rdik t) rgik
Transzkripcis faktor kthelyek (kb. 70 000)
Enhancer rgik, tvoli szablyozrgik (kb. 400 000)
Tvoli hats kromatin-interakcik
DNS-metilci
Hisztonmdosts
A sok fontos eredmnyt itt mind nem lehet ismertetni, csak nhny rdekesebbet
emltek meg. Tbb vizsglatban is DN-z hiperrzkeny helyeket vizsgltak (angolul:
Deoxyribonuclease I (DNase I) hypersensitive site (DHS)). Ezekhez azrt tud hozzfrni
a DNS-t emszt enzim, mert a DNS-kt fehrjk a nukleoszmkat elmozdtjk. N-
hny ers ktds transzkripcis faktor ktdse helyet csinl a gyengbb ktds
(alacsony affinits) transzkripcis faktoroknak, ami lehetv teszi a transzkripcit. Az
eredmnyek alapjn a transzkripcis faktorok ktdse gtolja a DNS-metilcit, s
nem fordtva, ami nagy jelentsg az epigenetikai eredmnyek magyarzata szem-
pontjbl.
Az egyik vizsglatban DN-z I enzim segtsgvel 125 sejtvonalat hasonltottak ssze.
2,9 milli DN-z hiperrzkeny helyet detektltak sszesen, amelynek durvn 1/3-a
csak egyetlen sejttpusban volt megtallhat, s csak 3700 volt megtallhat mindegyik
sejttpusban. Ezek az eredmnyek mutatjk, hogy milyen risi klnbsgeket lehet ta-
llni abban, hogy az egyes sejtekben hogyan szablyozdik a genom mkdse.
Egyetlen sejtvonalban (K562), 127 417 promterkzpont kromatin-klcsnhatst
detektltak, amelynek 98% intra-kromoszomlis volt (gncsknak (gene kissing) is ne-
vezik). A gnek 90%-nl multign-interakcit lehet tapasztalni, amely tbb megabzi-
sig nylhat, szmos promter-promter s promter-enhancer klcsnhatst magban
foglalva. Ezeknek a klcsnhatsoknak jelents rsze sejtspecifikus.
Az eredmnyek azt is mutatjk, hogy a betegsgekhez kapcsolt, nem kdol rgik-
ban tallhat helyek kzl szmos valamilyen funkcionlis (szablyoz) rgiban van.
De a funkci szempontjbl a sejttpus fontos! Ki lehetett mutatni, hogy az egyes
betegsg-specifikus variciknak csak bizonyos sejtekben van funkcija. Az
ENCODE projekt ltal feltrt j funkcionlis rgik gy lehetsget nyjtanak, hogy az
egyes betegsgekben detektlt, eddig ismeretlen funkcij rgikhoz sejtspecifikus tu-
lajdonsgokat rendeljnk, megrtve gy szerepket a betegsgben.
A genom 3 dimenzis szerkezetnek s kromatinstruktrjnak is fontos jelentsge
van. Ez utbbira is trtntek vizsglatok. Eszerint, ha olyan algoritmussal hasonltottk
ssze a klnbz fajok genomjt, hogy az azokat alkot nukleinsavak milyen 3D-szer-
kezetet vesznek fel, akkor a humn genom 12%-t talltk konzervltnak [20]. Egyes el-
mletek szerint, ptipari hasonlatot hasznlva, a genomban kdolt fehrjket nevez-
hetjk ptkveknek, mg az azon kvli rszek tartalmazzk azt az informcit, hogy
ezeket a kveket hogyan kell gy sszerakni, hogy azokbl egy mkdkpes szervezet
jjjn ltre. Erre egyfajta bizonytk az is, hogy br az let mr 4 millird vvel ezeltt
kialakult a Fldn, a tbbsejt llnyek mindssze 525 milli vvel ezeltt jelentek
meg. Valsznnek tnik, hogy ez a 3,5 millird ves evolci kellett ahhoz, hogy egy
olyan szablyoz mechanizmus alakuljon ki, amely lehetv tette a bonyolultabb letfor-
mk ltrejttt. Nyilvnval, hogy a szablyozshoz szksges informci nem a fehrj-
ket kdol gnekben tallhat, azaz elvileg minl tbb ilyen szekvencia van egy genom-
ban, annl tbb szablyozmechanizmus frhet bele [18].
Az alacsony gnszmbonyolult szervezet ellentmondst nmileg feloldja az a fel-
fedezs is, hogy gnjeink 94%-a nemcsak egy fehrjt kdol, azaz pldul alternatv
splicing tjn a klnbz szvetekben ugyanabbl a gnbl ms-ms szerkezet s
funkcij fehrjk rdnak t. Egyszerbb szervezeteknl ilyen mechanizmus nincs, vagy
csak jval kisebb mrtk. Tovbb a fehrjk poszttranszlcis mdostsaival renge-
teg klnbz fehrje jhet ltre. Egyes becslsek szerint az ember fehrjinek szma el-
ri a 2 millit.
2001-ben mg gy gondoltk, hogy a genom f funkcionlis rszei a fehrjket k-
dol gnek. Az RNS-eket egyfajta segdszereplknek gondoltk, azaz f funkcijuk, hogy
(mRNS, t-RNS, rRNS formban) a fehrjre val trdsban segdkezzenek. Azonban az
utbbi vekben egyre msra fedezik fel, hogy az RNS-eknek milyen funkciik vannak
mg, fleg a szablyozsban. A leghresebb plda az RNS-interferencia s a mikro-RNS-
ek (miRNS) felfedezse, amelyrt 2006-ban Nobel-djat is adtak [21]. Kiderlt, hogy a
gnek > 60%-nak a szablyozsban jtszanak szerepet, egy miRNS akr tbb szz
gnben is, lehetv tve egy igen bonyolult, sszehangolt szablyozst. De ide tartoz-
nak a fleg a spermatogenezis szablyozsban, a transzpozonok elleni vdelemben sze-
repet jtsz piwi-interacting (pi) RNS-ek, vagy a pszeudgenrl trd competitive
endogenous RNS-ek (ceRNS), vagy antisense termini-associated short RNS-ek (aTASRs),
Large intervening noncoding RNS (lincRNS) stb. [22]. ltalban ezek f szerepe a transz-
kripcin, ritkbban a transzlcin keresztli gncsendests.
Az ENCODE projekt azonostott 8800 kis RNS-t, 9600 hossz, nem-kdol RNS-t
(long noncoding RNA), amelyek mind legalbb 200 bp hosszak. Azt figyeltk meg, hogy
ezek az RNS-ek meghatrozott sejtkompartmenekbe mennek, mintha meghatrozott
cmk lenne. Van, amelyik a sejtmagba, van, amelyik a nukleoluszba, van, amelyik a cito-
plazmba. Ez arra utal, hogy szerepk a szablyozsban igen szofisztiklt lehet.
8.9. Irodalom
1. http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/home.shtml 2009.
2. International Human Genome Sequencing Consortium: Initial sequencing and
analysis of the human genome. Nature 2001; 409:860921.
3. Venter JC et al. The sequence of the Human Genome. Science 2001; 291:130451.
4. International Human Genome Sequencing Consortium: Finishing the euchromatic
sequence of the human genome Nature 431, 931945 (21 October 2004)
5. http://genomics.xprize.org/
6. Rusk N, Kiermer V. Primer: Sequencing the next generation. Nature Methods
2008;5:15.
7. http://www.genome.gov/10005107; 2009.
8. Pennisi E. 1000 Genomes Project Gives New Map Of Genetic Diversity. Science 2010;
330: 5745.)
9. http://www.epigenome.org/; 2009.
10. Redon R. s mtsai.:Global variation in copy number in the human genome. Nature
2006; 444: 444454.
11. Armour JA. Copy number variation and antigenic repertoire. Nat Genet.
2009;41(12):12634.
12. Bruder CE, s mtsai.: Phenotypically concordant and discordant monozygotic twins
display different DNA copy-number-variation profiles. Am J Hum Genet.
2008;82:76371.
13. Ng PC, et al. Genetic variation in an individual human exome. PLoS Genet. 2008 Aug
15;4(8):e1000160.
14. Reich D, et al. Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in
Siberia. Nature. 2010 Dec 23; 468 (7327):105360.
15. Green RE, et al. A draft sequence of the Neandertal genome. Science. 2010 May 7; 328
(5979):71022.
16. Reich D, et al. Denisova admixture and the first modern human dispersals into
southeast Asia and oceania. Am J Hum Genet. 2011 Oct 7;89(4):51628.
17. Burbano HA, et al. Targeted investigation of the Neandertal genome by array-based
sequence capture. Science. 2010 May 7; 328 (5979):7235.
18. Gibbs W.W. (2003) "The unseen genome: gems among the junk", Scientific American,
289(5): 46-53.
19. The ENCODE Project Consortium. Identification and analysis of functional elements
in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project. Nature 2007; 447:799
816.
20. Parker SC, Hansen L, Abaan HO, Tullius TD, Margulies EH. Local DNA Topography
Correlates with Functional Noncoding Regions of the Human Genome. Science. 2009;
324: 389392.
21. Fire A, Xu S, Montgomery M, Kostas S, Driver S, Mello C (1998). "Potent and specific
genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans". Nature 391
(6669): 80611.
22. Swami M. RNA world: A new class of small RNAs Nature Reviews Genetics 2009;10,
425.
23. Waterston RH. Et al. Initial sequencing and comparative analysis of the mouse
genome. Nature 2002; 420 (6915) 520562.
24. Kirkness EF et al. The Dog Genome: Survey Sequencing and Comparative Analysis.
Science. 2003; 301:18981903
25. Krause J et al. The Derived FOXP2 Variant of Modern Humans Was Shared with
Neandertals. Current Biology 2007; 17: 19081912
tsok mdosthatjk a krnyezeti hatsok kzl. Ismert pldul, hogy a koraszls hajla-
most szmos ksbbi betegsg (pl. T2DM) kialakulsra, vagy a nagy szletsi testsly
pl. T1DM-re. Illetve, egy kutatsban kimutattk, hogy pl. az intelligenciban (IQ-ban) az
rkld hnyad mellett a legersebbek az anyamhben rt hatsok. Mindezek ellenre
j nhny betegsgben szlettek rtkes eredmnyek ilyen tpus vizsglatokban, ami-
hez nagyban hozzjrult az is, hogy Dniban a msodik vilghbor krnykn, amikor
nagyon sok volt az rva gyerek, az volt a szoks, hogy a testvreket, mg az egypetj ik-
reket is, kln nevelszlkhz adtk rkbe. Emiatt relatv sok olyan testvrpr adata
llt rendelkezsre, akik kln nevelkedtek [1].
9.1. bra. A. Populci eloszlsa, ha egy lkusz, kt, egyenl gyakorisggal elfordul, s
egyenl hats alllja hatrozza meg a mrhet tulajdonsgot (QT-t). Ha az egyik alll
cskkenti az rtkt a msikhoz kpest, akkor hromfle populcit kapunk. B. s C.
brkon ugyanez lthat 2, illetve 3 lkusz esetn. Mint lthat, 3 lkusznl mr 7-fle
rtkkel rendelkez populcit kapunk, s egy adott rtkkel jellemezhet populcit akr
7-fle genotpus is adhat. D. A multifaktorilis s polignes betegsgeknl viszont akr tbb
100 vagy ezer lkusz is befolysolhat egy QT-t, gy a populci gyakorlatilag folytonos
eloszlst mutat a QT szempontjbl.
Problma Magyarzat
Genetikai heterogenits Klnbz alllkombincik ugyanahhoz a betegsghez
vezetnek.*
Fenokpia Kizrlag krnyezeti hatsok ugyanazt a klinikai kpet
eredmnyezik, mint a genetikai tnyezk.
Pleiotrpia Ugyanaz a mutci vagy polimorfizmus a krnyezet
hatsra ms klinikai kpet eredmnyezhet.*
Inkomplett penetrancia A magas genetikai hajlammal rendelkez egyn nem
beteg.
Nehz a pontos diagnzis Sokszor nincs standard diagnzis. Lehet klinikai tnet
vagy biokmiai paramter.
letkorral vltozhat a klinikai kp.
A tnetek epizdokban jelentkezhetnek.
Ms betegsg hasonl tnetekkel.
A klnbz betegsgek gyakran egytt fordulnak el.
*eltr a monognes betegsgeknl megfogalmazott defincitl (ld. 5. fejezet)
9.1. tblzat. A multifaktorilis betegsgek meghatrozst nehezt jellemzk
1020%-kal emelik meg hordozjukban a betegsgre val hajlamot. Ez azt jelenti pl-
dul, hogy annak az eslye, hogy a varicit hordoz beteg legyen 1,11,2-szer magasabb,
mint annak, aki nem hordozza. Az ilyen gyenge hats gnek detektlsa pedig nagyon
nehz. Radsul a vizsglt betegek genetikailag heterognek, azaz egy azon betegsgre
szmos (gyakorlatilag szinte vgtelen szm) genetikai httr hajlamosthat. Statisztikai
szempontbl pl. elnys, ha minl nagyobb populcit vizsglunk, genomikai szempont-
bl azonban egyre n a populci genetikai heterogenitsa, gy az egyes genetikai vari-
cik hatsa felhgul.
Egy msik problma ezzel kapcsolatban a megfelel statisztikai mdszer hinya.
Problma pldul a tbbszrs teszt okozta statisztikai hiba kikszblse. Szzezer va-
rici mrse egyetlen chippel statisztikai szempontbl azt jelenti ugyanis, hogy 100
ezer fggetlen mrst vgznk. Ilyenkor az egyes asszociciknl a hamis llts valsz-
nsge sszeaddik (1-es tpus statisztikai hiba). Ennek az egyik megoldsa, ha a sta-
tisztikai hibahatrt elosztjuk a vizsglatok szmval. Ezt Bonferroni-korrekcinak hv-
juk. Pldul 100 ezer SNP vizsglatnl p = 0,05 helyett 5x10-7 rtket hasznlunk. Azon-
ban a fggetlen vizsglatok tnyleges szma nemcsak az SNP szmtl, hanem szmos
ms krlmnytl is fgg, gy pl. a mintaszmtl, a teszttl, vagy a vizsglt klinikai para-
mterek szmtl is. Azonban a Bonferroni-korrekci tl konzervatv, hiszen csak a
nagyon ers asszocicit mutat faktorokat tudja detektlni. Ezzel szemben a multifak-
torilis betegsgeknek ppen az az egyik legfbb jellemzje a CD/CV hipotzis alapjn,
hogy a betegsgre val megnvekedett hajlam sok, nmagban csak nagyon gyenge
hats genetikai varici klcsnhatsbl ered. Radsul ezek a betegsgek populcis
szinten genetikailag heterognek, azaz az egyes emberekben ms-ms genetikai fak-
torok lehetnek felelsek a betegsgrt. Ennek az lesz a kvetkezmnye, hogy a legtbb
genetikai varici eloszlsa csak nagyon kis mrtkben fog klnbzni a beteg s az
egszsges populci kztt, s a fent lert statisztikai mdszerrel nem lehet detektlni
ket. Radsul a helyzetet tbb ms tnyez tovbb bonyoltja, illetve a statisztikai r-
tkelhetsget rendkvli mrtkben megnehezti. Az egyik legnagyobb, hogy nem elg a
100 ezer varicit egyenknt vizsglni, hanem a varicik klcsnhatsait is, hiszen
elfordulhat, hogy az egyes varicik nmagukban nem, csak ms varicikkal, vagy
esetleg valamilyen krnyezeti faktorral egytt hatva okozzk a vizsglt fenotpust. Ilyen-
kor a vizsgland klcsnhatsoktl fggen az elvgzend elemzsek szma csillag-
szati magassgokban van. Pldul, 1,8 milli varici esetn csak a pros, elemzend
gn-gn klcsnhatsok szma 3,2 billi, s ismert, hogy ilyen klcsnhatsokban sok-
szor akr tbb szz szerepl is lehet.
9.13.1.Takarkosgn-hipotzis
A takarkos gn (angolul thrifty gene) hipotzis azt lltja, hogy az emberisg evolcija
sorn, illetve az elmlt vszzadokban is alkalmazkodni kellett a periodikus hezsek-
hez. Ezek az hezsi idszakok sokszor vekig is eltartottak, s komoly szelekcis nyo-
mst gyakoroltak. Akinek a szervezete nem tudott elg takarkosan bnni a bevitt tellel
(energival), vagy a jobb idszakokban nem tudott megfelel mennyisget elraktrozni,
az kiszelektldott (meghalt, vagy nem tudott szaporodni), s azok a gnek maradtak
fenn, amelyek hordozi takarkosan tudtak bnni a bevitt kalrikkal [8]. A mai, fejlett
orszgokban l npessg, legtbbszr mg a szegnyek is, nincsenek kitve nagyobb
hezsi peridusnak, rengeteg, energiban ds lelmiszert vesznek magukhoz, ami a
trsulva a jellemz mozgsszegny letmddal obezitshoz, s a hozz kapcsolhat be-
tegsgekhez vezet. Ebbl az is kvetkezhet, hogy a mai fejlett (civilizlt) vilgban a
kisebb-nagyobb tlsly szmthat termszetesnek (a vad tpusnak), s az, aki ilyen
krlmnyek kztt nem hzik el, szmthat a mutnsnak, azaz a ritkbb genetikai va-
ricikat hordoznak.
Ide tartozik az a felttelezs is, hogy a mai relatv jlt epigenetikai szinten is tprog-
ramozza a szervezetet, ami mr kora gyermekkortl elhzshoz vezethet. Erre az egyik
bizonytk abbl a korbban mr emltett svd tanulmnybl szrmazik, amelyik azt ta-
llta, hogy azoknak a 20. szzad elejn lt azoknak a frfiaknak, akik serdlkoruk eltt
jltben ltek (nem heztek), a fi unoki nagyobb valsznssggel haltak meg cukor-
betegsgben, mint azok, akik heztek [3]. rdekes mdon ezzel szemben az hezs kife-
jezetten vdett a fi-unokk diabtesszel kapcsolt hallval szemben. Ezt a frfigon to-
vbbmen transzgenercis hatst patknyokban is megerstettk.
Hasonl, s valsznleg ersebb epigenetikai hatst gyakorol a nk viselkedse, do-
hnyzsa, tpllkozsa a terhessgk alatt a magzat tovbbi sorsra. Mivel a ma felnv
generciknak ltalban mr a szlei, nagyszlei sem heztek, magyarzhatja a tlsly,
s a hozz kapcsold betegsgek jrvnyszer elterjedst mr gyermekkorban is.
A takarkos gn hipotzishez tartozik mg a svisszatartshoz kapcsolhat elm-
let [9]. Rgebben, pl. a meleg Afrikban, a nagyfok izzads mellett, a hozzfrhet s
mennyisge is messze alatta volt a mainak. Ezrt alakult ki az, hogy az emberek tbbsge
szereti a st, a ss teleket, gy knyszertve tudat alatt magt arra, hogy minl tbb,
amgy ltfontossg st (konyhast, NaCl) juttasson folyamatosan a szervezetbe. Ez
rgebben, a snsg idszakban egy fontos szelekcis tnyez volt, hiszen a shiny
9.13.2. Tisztasghipotzis
Az allergis betegsgek gyakorisgnak nvekedst magyarzza a tisztasghipotzis,
amelyre szmos bizonytk is van. Ez azt lltja, hogy a mai, relatv tiszta vilgban az j-
szlttnek nem engedjk, hogy kialakuljon a normlis immunrendszere, s ez vezet oda,
hogy az amgy rtatlan allergnekre (pl. virgporok, poratka) adjon IgE tpus immun-
vlaszt. Az elmlet szerint, a magzat immunvlasza el van toldva az n. Th2 tpus im-
munvlasz fel. Az jszltteket r fertzsek (kiegsztve az anyatejes tpllkozssal)
ezt az immunvlaszt toljk el Th1-es irnyba. A tiszta, betegsgek esetn antibiotiku-
mokkal kezelt jszlttben ez a folyamat nem zajlik le, megmarad a magzati, Th2 fel
eltoldott immunvlasz, s ez, allergis, atpis betegsgek kialakulsra hajlamost.
Ehhez hasonl folyamat ksbb is, akr felnttkorban is lejtszdhat. A Th2-es immun-
vlasz eredetileg a klnbz parazitk ellen alakult ki. Az elmlet szerint, mivel a fejlett
vilgban ltalban (szerencsre) nem kell a szervezetnek parazitk (pl. blfrgek) ellen
harcolnia, az immunvlasz unatkoz Th2-es karja j ellensget keres magnak, s
reagl az amgy rtatlan allergnekre. Ezekre az elmletekre szmos bizonytk van. A
hasonl genomikai httrrel rendelkez populcik tisztbb helyen l rszben ltal-
ban kimutathatan, szignifiknsan nagyobb az allergis betegsgek gyakorisga.
Steril krlmnyek kztt l egereken megfigyeltk, hogy sokkal nagyobb valsz-
nsggel alakul ki nluk asztma vagy 1-es tpus cukorbetegsg.
Meg kell azonban jegyezni, hogy ez nem jelenti azt, hogy kontrolllatlanul piszkosab-
ban kell lnnk, gyereket nevelnnk, hogy megelzzk az allergia kialakulst. Ugyanis
azt is megfigyeltk az ilyen populcikban, hogy a tisztbb krnyezetben l populcik-
ban lnyegesen magasabb volt a vrhat lettartam, mint a kevsb higinikus krlm-
nyek kztt lkben.
A korai antibiotikum-hasznlat is szmos ksbbi betegsggel asszocilhat. Pldul
egy vizsglatban megllaptottk, hogy gyakrabban lesznek kvrek azok, akiknl cse-
csemkorban antibiotikumot hasznltak. Ezt arra vezettk vissza, hogy ezeknek a gyer-
mekeknek megvltozott a blflrja, s ezzel a tpllk felszvdsa.
Ehhez kapcsoldik a tisztasghipotzis elmlet egy msik irnya, a Th1-rs (matu-
ration) hipotzis. Ez azt lltja, hogy a cskkent csecsemhalandsg ll az allergis
betegsgek megnvekedett prevalencijnak htterben. Ismert, hogy mg a XX. szzad
polignes betegsgek gyakorisgt. Itt azt felttelezik, hogy egyes alllok egyms mell
kerlhetnek, s az amgy semleges hats alllok klcsnhatsa betegsghez vezethet.
9.14. Irodalom
1. Srensen TI, et al. Childhood body mass index--genetic and familial environmental
influences assessed in a longitudinal adoption study. Int J Obes Relat Metab Disord.
1992 Sep; 16(9):70514.
2. Manolio TA, et al. Finding the missing heritability of complex diseases. Nature. 2009
Oct 8; 461(7265):74753.
3. Kaati G, et al. Cardiovascular and diabetes mortality determined by nutrition during
parents' and grandparents' slow growth period. Eur J Hum Genet. 2002 Nov;10
(11):682-8.
4. Eldar A, Elowitz MB. Functional roles for noise in genetic circuits. Nature. 2010 Sep
9; 467(7312):16773.
5. Moore JH, Asselbergs FW, Williams SM (2010) Bioinformatics challenges for genome-
wide association studies. Bioinformatics 26: 445455.
6. Yang J s mtsai. Genomic inflation factors under polygenic inheritance. Eur J Hum
Genet. 2011;19(7):80712.
7. Torkamani A, Topol EJ, Schork NJ. Pathway analysis of seven common diseases
assessed by genome-wide association. Genomics. 2008 Nov; 92 (5):26572.
8. Johnson RJ, Andrews P, Benner SA, Oliver W. Theodore E. Woodward award. The
evolution of obesity: insights from the mid-Miocene. Trans Am Clin Climatol Assoc.
2010; 121:295305;
9. Lev-Ran A, Porta M. Salt and hypertension: a phylogenetic perspective. Diabetes
Metab Res Rev. 2005 Mar-Apr; 21(2):11831.
10. Franceschi C, et al. Inflamm-aging. An evolutionary perspective on immuno-
senescence. Ann N Y Acad Sci. 2000 Jun;908:24454.
11. Capri M, et al. Human longevity within an evolutionary perspective: the peculiar
paradigm of a post-reproductive genetics. Exp Gerontol. 2008 Feb; 43(2):5360.
12. Candore G, et al. Inflammation, longevity, and cardiovascular diseases: role of
polymorphisms of TLR4. Ann N Y Acad Sci. 2006 May; 1067:2827.
F elnyei:
Htrnyai:
Ezrt egy-egy vizsglatba csak nhny szz mikroszatellitt tudtak bevonni, ami azt
jelentette, hogy az egyes mikroszatellitk egymstl nagyon tvol (ltalban kb. 10
cM-ra) estek. Ebbl kifolylag viszonylag kicsi volt az esly, hogy egy betegsg l-
kusszal egy mikroszatellita kapcsoltsgban legyen, azaz vele egyszerre rkldjn.
Ebbl kifolylag a legtbb betegsghez kapcsolhat varici elveszett. A drgasgon s a
nagy munkaignyen kvl mg olyan problmk is voltak pl., hogy nehz volt a minta-
gyjts (nehz megfelel szm, egyttmkdsre is hajlamos szlkkel rendelkez be-
teg testvrprt gyjteni).
10.2.2. GWAS
A 2000-es vek fejlesztsei sorn kiderltek, hogy az SNP-k kimutatsa automatizlhat,
s risi mennyisgben lehet ket egyszerre meghatrozni. Prhuzamosan tbb cg is
olyan rendszereket fejlesztett ki, amelyekben egyetlen chippel, vagy array-vel tbb 100
ezer SNP-t lehet meghatrozni. A versenyben a meghatrozsok rt is sikerlt ersen
leszortani. Ma mr a tbb 100 ezer varicit kimutatni kpes chipek ra 100 $ nagysg-
rend. A chipfejlesztsek sorn derlt ki, hogy az SNP-k mellett nagy jelentsgk van a
CNV-knek is. A cgek gyorsan reagltak. Az idkzben felfedezett CNV-kre jellemz
markerek pillanatok alatt belekerltek a vizsglatokba.
Jelenleg kt vezet cg van a piacon. Az egyik az Affymetrix, melynek a 6.0 array-e
906 ezer SNP-t s 946 ezer CNV-re jellemz markert tartalmaz. A msik az Illumina,
melynek jelenleg legfejlettebb termke a HumanOmni5BeadChip, amely 4,3 milli l-
kuszt jellemez, mely SNP-ket s CNV-ket is tartalmaz, radsul egy chippel egyszerre 8
mintt, mindssze 200 nanogramnyi DNS-bl kpes mrni. Kzben ms technikkban,
gy pldul a DNS-szekvenlsban is risit fejldtt a tudomny. Ennek folyomnya-
knt olyan projektek indultak, mint pl. az 1000 genom projekt, amely klnbz etniku-
m populcikhoz tartoz, sszesen 2500 ember megszekvenlst tervezi [4]. A pro-
jekt mr rengeteg j genetikai varicit trt fel (10.1. bra). Ezeknek a felhasznlsval
kszlt a fent emltett Illumina chip, amely gyakorlatilag minden olyan varicirl tartal-
maz informcit, melynek a populcis gyakorisga (a megszekvenlt afrikai, zsiai s
eurpai populcikban) nagyobb, mint 1%.
A GWAS-vizsglatok ltalban gy trtnnek, hogy a fenotpusos jellel (pl.
beteg) rendelkez, illetve kontrollpopulcit genotipizlnak, azaz a fent emltett
chipek segtsgvel >100 ezer SNP-t meghatroznak, majd megkeresik, hogy
melyik marker gyakorisga klnbztt a kt populci kztt. A statisztikai md-
szerek fejldsvel mr folytonos vltozkat is fel lehet hasznlni GWAS-okban. Pldul
a vrcukorszinttel, vagy vrnyomssal asszocil genetikai markerek keressnl mr
nincs szksg kt jl elklnthet populcira. Ha statisztikailag szignifikns sszefg-
gst tallnak, akkor azt mondjk, hogy a marker kapcsolt a jelleghez. Ez legtbbszr kt
dolgot jelenthet: [1] a marker a funkcionlisan befolysolja a jelleget (pl. fehrjefunkcit
vagy struktrt, genom 3D-struktrt, gnexpresszit); [2] a markerhez genetikailag
kapcsolt (vele ltalban egytt rkld) szekvenciavarici a jelleg funkcionlis oka
(ld. mg 11. fejezet). A mdszer a hipotzismentes mdszerek kz tartozik, azaz vg-
rehajtsa nem ignyel elzetes genetikai tudst a jellegrl.
Napjainkban a GWAS risi lehetsgeket nyjt a multifaktorilis jellegek genomikai
htternek tisztzsra, amit a klnbz kutatcsoportok gyakorlatilag rgtn ki is
hasznltak. Mivel ezek az eredmnyek nagy valsznsggel vals sszefggseket mu-
tatnak, pl. a betegsgek patomechanizmusnak j aspektusait mutatjk be, ltrehoztak
egy weboldalt is, amelyre sszegyjtve felkerlnek az eredmnyek (A Catalog of
nek, s azt nzik, hogy az egyes gnszettekben hny gn asszocil az adott fenotpussal,
s eszerint rangsoroljk az egyes gnszetteket.
Ezeknl a vizsglatoknl felmerl, hogy az olyan SNP-k, amelyek nem gnben tallha-
tak, hov sorolhatk? Itt az egyes statisztikusok ms-ms stratgit kvetnek. Az egyik
ilyen, hogy a nem gnben tallhat SNP ahhoz a gnhez tartozik, amelyik az SNP-tl 20
kilobzison (kb) bell tallhat. Ha tbb ilyen gn is van, akkor mindegyikhez tartozik.
Ha nincs ilyen gn, akkor az SNP kiesik ebbl az elemzsbl.
Ezekkel a mdszerekkel tbb, mr a hagyomnyos mdszerrel elemzett GWAS-t rt-
keltek jra, s pl. magas vrnyomsban szmos addig ismeretlen, a vrnyoms szablyo-
zsban addig nem ismert anyagcsere-tvonalat fedeztek fel.
stb.). rtestst kaphatunk, ha velnk rokonsgban llkat talltak; klnbz hres em-
berekkel hasonltjk ssze a genomunkat; a jelenlegi tudomnyos ismeretek birtokban
198 betegsgrl becslst kapunk, hogy az tlagpopulcihoz kpest nagyobb vagy ki-
sebb kockzattal rendelkeznk; vagy a genomunk hogyan befolysolja klnbz gygy-
szerekre val reaglsunkat stb.
Cg Szolgltats r
23andMe Kb. 1 milli SNP meghatrozsbl 178 betegsg 399 $, vagy 99 $ +
genetikai kockzatrl egy becsls, illetve 9$/ hnap
szrmazs- s rokonsgelemzs elfizets az
jabb
eredmnyekre
deCODEme Illumina Human 1M BeadChip, mely >1 milli SNP- 2000 $
t detektl, 47 betegsg, szrmazs
Knome Illumina genomszekvenl platform; az 39 500 $
eredmnyek rtelmezse
Existence Sajt fejleszts chip; 700 betegsg s jelleg; 350 $
Genetics javaslatok a betegsgek megelzsre
Navigenics Affymetrix 6.0; 900 000 SNP; szigor tudomnyos 999 $
kvetelmnyek, 28 betegsg, 12 gygyszerre val
reagls
10.1. tblzat. Jelentsebb cgek, melyek orvosi s ms clokbl genomikai tesztek
elvgzst, s az eredmnyek rtkelst knljk
latos felmrsek semmi ilyesmit nem mutattak ki. Valsznleg ez kicsit hasonlt ahhoz,
mint amikor a dohnyos vagy elhzott ember is tudja, hogy szmos betegsgre megn a
hajlama. St, mivel feltehetleg az tlagosnl egszsgtudatosabb emberek krnek ilyen
informcikat, inkbb pozitv hatsokat tapasztaltak. Azaz, a kapott eredmnyek hats-
ra egyes emberek tudatosan megelz lpseket tettek, vagy egszsgesebb letformra
trtek t.
10.2.8. Gnexpresszi-mrs
A harmadik nagy jelentsg mdszer, amely alkalmas a genom vizsglatra, amelynek
fontos szerepe van a gygyszerkutatsban, s itt rviden ismertetjk, az a gn-
expresszi-mrs. Mint tudjuk, a klnbz sejtjeink genomja megegyezik egymssal.
Amiben mgis klnbznek, az az expresszlt, vagyis mkd gnek halmaza. A sejtek
mkdsrl sok informcit kaphatunk, ha ismerjk a bennk mkd gneket,
azaz melyik gn milyen arnyban rdik t, expresszldik. Ez egy adott szvet esetn
is eltrhet, attl fggen, hogy ppen milyen llapotban van, milyen hatsok rik.
Pldul egy asztms tdben, vagy egy atherosclerotikus plakkban ms a gnexpresz-
szis mintzat, mint egy egszsges szvetben. Ugyangy a sejtekre hat kls hatsok,
pl. a gygyszerek is, megvltoztatjk a sejt gnexpresszis mintzatt.
A fejlds itt is azt az utat jrta be, mint a DNS-variciknl. Elszr egyesvel, elg
bonyolult mdon prbltk meg kvantifiklni a gnek mkdst, majd a magyar
szrmazs Stephen Fodor rvn az Affymetrix cg 1996-ban kezdte el forgalmazni gn-
expresszis chipjeit (mikroarray). Azta ms cgek (pl. az Agilent, Illumina) is megje-
10.3. llatmodellek
10.3.1. llatmodellek elnyei
A multifaktorilis betegsgek genomikai htternek, patomechanizmusnak megismer-
sben nagyon fontos szerepet tltenek be az llatksrletek, llatmodellek. Vannak olyan
betegsgek (pl. asztma, atherosclerosis), amelyek patomechanizmusban a molekulris
s sejtszint tudsunk nagy rszt llatksrletek rvn nyertk.
itt az egr egy gnjt (vagy esetleg a genom egy msik funkcionlis egysgt) valamilyen
mdszerrel inaktvv teszik.
Rszletesebben: http://en.wikipedia.org/wiki/Knockout_mouse. 2006-ban 9 orszg-
ban 33 kutatkzpont megalaktotta az International Knockout Mouse Consortium-
ot (IKMC), majd 2011 jniusban az International Mouse Phenotyping Consortium-
ot (IMPC), amelyek azt a clt tztk ki maguk el, hogy az sszes gnre ellltanak KO
egeret, majd fenotipizljk ket.
KO llatok segtsgvel vizsglni lehet, hogy egy gn hinynak milyen fenotpusos
jegyei vannak, gy a gn funkcijrl jval tbbet megtudhatunk, mintha csak in vitro
krlmnyek kztt tanulmnyoznnk. Az ismert gnek tbbsgrl mr kaphat KO
egr, illetve meg is rendelhetnk cgektl ilyen egereket. gy derlt ki pl., hogy az
APOA5 gn hinya magas szrumtriglicerid-szintet okoz. Egy msik lehetsg, hogy
gn-KO segtsgvel el lehet lltani az egren valamilyen betegsget. Pl. ismert, hogy a
vad egren nem alakul ki atherosclerosis. Azonban, ha az LDL-receptor (LDLR), vagy
az APOE gnjket kitjk, s megfelel, n. Western-tpus ditval etetjk ket, az em-
berhez igen hasonl atherosclerotikus lzik alakulnak ki az ereik falban.
A msik tpus genetikailag mdostott llat, ahol fleg egeret hasznlnak, a transz-
genikus egr. Itt, szemben az elzekkel, egyes gnek mkdst felerstik, tl-
expresszltatjk. Ennek vgs cljai ugyanazok, mint a KO egrnl elmondottak.
Mindkt technikt akr szvetspecifikusan is alkalmazhatjuk. Pl. transzgenikus
esetben a gnt egy olyan gn promtere utn illesztjk be, ami csak az egyik szvetben
expresszldik. Pl. a SCGB1A1, korbban CC16 gn fleg a tdben expresszldik, ott
viszont nagyon ersen. Amikor egrbe az IL5 gnjt raktk mg, az IL5 a tdben mu-
tatott igen ers expresszit, s az llatban tdeozinoflia s asztma alakult ki. Ezzel bi-
zonytottk, hogy az IL-5 citokin az eozinoflek mkdsben fontos szerepet jtszik, s
a tdeozinoflia kzvetlenl asztmt okozhat.
Sokig problmt okozott a magzati letben letfontossg gnek tanulmnyozsa,
hiszen azok hinya vagy esetleg tlexpresszija magzati korban letlis. Ezrt fejlesztet-
tk ki a Cre-lox-rekombinci segtsgvel (ld. http://en.wikipedia.org/wiki/Cre-
Lox_recombination) az olyan KO llatokat, ahol pl. valamilyen indukci (pl. antibiotikum-
evs) segtsgvel idztetten lehet in vivo kivgni a krdses gnt vagy genomszakaszt.
Ezek az n. kondicionlis KO llatok.
Ms in vivo technikkkal is lehet mg gneket idlegesen inaktivlni. Ezek kzl a
legjelentsebbek az RNS-interferencia jelensgt felhasznl technikk. Pl. a fonalfreg
Caenorhabditis elegans-ban minden gnnek tanulmnyoztk az RNSi-vel inaktivlt hat-
st. De a mdszer pl. egrben is mkdik.
10.4. Irodalom
1. International HapMap 3 Consortium, Altshuler DM, et al. Integrating common and
rare genetic variation in diverse human populations. Nature. 2010; 467(7311):528.
2. International HapMap Consortium, Frazer KA, et al. A second generation human
haplotype map of over 3.1 million SNPs. Nature. 2007; 449(7164):85161.
27. Mi az a CGH?
28. Hogyan lehet metilcis mintzatot meghatrozni?
29. Milyen elnyei lehetnek betegsgek tanulmnyozsnl llatmodellek alkalmazsnak?
30. Milyen tpus genetikailag mdostott llatmodelleket ismer?
31. Mire lehet hasznlni KO llatokat?
32. Mi az a transzgenikus egr?
33. Mi aza kondicionlis KO llat?
34. Milyen htrnyai vannak humn betegsgek tanulmnyozsa esetn az llatmodel-
leknek?
35. Hogyan lehet betegsgekre genetikailag hajlamos egrtrzseket ellltani?
36. Mondjon pldt monognes llatmodellre!
37. Mondjon pldt polignes llatmodellre!
11.1. Populcigenetika
A populcigenetika az alllfrekvencik eloszlsnak s vltozsnak vizsglata
klnbz populcikban. Ez a betegsgek genetikai s genomikai htternek vizsg-
latban az egyik legtbbet hasznlt kutatsi. A fejezet els felben az ezekhez a vizsgla-
tokhoz tartoz fogalmakkal s mdszerekkel ismerkedhetnk meg.
11.1.3. HardyWeinberg-eloszls
Hogy megbzhat eredmnyeket kapjunk, minden populcigenetikai vizsglatnl el kell
vgezni a HardyWeinberg-egyensly (HWE) vizsglatt. A HWE a genotpusok vrha-
t eloszlst rja egy random populciban.
Az alllok relatv gyakorisgt kt alll esetn kt egyenlettel rhatjuk le.
p + q = 1 s p + 2pq + q = 1
Ahol:
p a gyakoribb (major) alll frekvencija
q a rika (minor) alll frekvencija
p s q a homozigta egyedek gyakorisga
2pq a heterozigta egyedek gyakorisga
A HWE elmletvel itt csak annyiban foglalkozunk, hogy mit jelenthet ltalban
ezekben a vizsglatokban, ha a kapott eloszls szignifiknsan klnbzik a vrttl. Az
eltrs tbb okra vezethet vissza:
11.1. bra. Rekombinci, vagy crossing over meiziskor. Pldul az emberi frfi
meiziskor sejtenknt tlag 49 rekombinci trtnik. A folyamatban a homolg, kt szli
kromoszma genetikai anyaga kicserldik. Eredmnyekppen, az eredetileg egyms
mellett tallhat alllok (pl. A1 s B1) elkerlhetnek egyms melll.
A fenti okok kzl itt kettt rszleteznk (a statisztikai hibkrl, ld. pl. a 8. fejezetet).
Az egyik a populcis rtegzds, ami az egyik legnehezebben korriglhat problmt
okozza. Ez azt jelenti, hogy ilyen tpus populcis vizsglatoknl fontos szempont, hogy
az sszehasonltand kt populci populcis (pl. etnikai) sszettele megegyezzen
egymssal. Hogy milyen problmt okozhat, ha ez nem teljesl, a legismertebb elmleti
pldzat az evplcika-gn esete. Ez a pldzat rviden azt mondja: tegyk fel, hogy azt
akarjuk, kiderteni, hogy van-e annak a kpessgnek, hogy valaki tud-e evplcikval en-
ni, genetikai httere? Gyjtnk hozz kt populcit, amelyek kzl az egyik tud evpl-
cikval enni, a msik nem (kontrollpopulci). Abban az esetben, ha az els populci
fleg knaiakbl ll, a msik pedig nem, akkor azt fogjuk tallni, hogy a knaiakban gya-
kori (s eurpaiakban ritkbb) bizonyos HLA-A2-es alll ers asszociciban ll az ev-
plcikval evs kpessgvel. Ez nyilvnvalan hamis asszocici, amit a kt populci
helyes megvlasztsval el lehet kerlni. Azonban ez nem mindig ilyen egyrtelm. Fleg
a mai, globalizlt vilgban, gyakran lnek egytt klnbz etnikai csoportok, rszben ke-
vert, sokszor vegyes genetikai httrrel (pl. USA-ban afroamerikaiak, hispn-amerikaiak,
eurpai eredet amerikaiak stb., vagy Magyarorszgon a romk s nem-romk stb.), s
az etnikai besorols, sokszor pl. etikai okok miatt nagyon nehzkes, vagy akr lehetetlen.
Amikor kt, eredetileg ms etnikumhoz tartoz populci genomszinten keveredik egy-
mssal, population admixture-nek nevezzk, s ezt a jelensget egyes genetikai vizs-
glatoknl fel is lehet hasznlni (ld. http://en.wikipedia.org/wiki/Admixture_mapping).
A populcirtegzdsbl add hibknak az elkerlsre szmos mdszert
dolgoztak ki. Pl. a bels kontrollmdszerek. Ilyen a transmission disequilibrium test
(TDT) alkalmazsa. Ez ugyan 50%-kal tbb munkval jr, hiszen beteg + szlk is
kellenek hozz. Azokat a szlket vlasztjk ki, akik heterozigtk a betegsggel
asszocil M1 markerre, s azt vizsgljk, hogy hny szl adja t az M1 alllt a beteg
gyerekbe vs. hny nem. Ha az M1 marker nem asszocil a betegsggel, annak eslye,
hogy a beteg megkapja a szltl 50%, ha asszocil, akkor ennl nagyobb. Ld.:
http://en.wikipedia.org/wiki/Transmission_disequilibrium_test.
Egy msik mdszer a discordant sib pair analzis. Itt olyan testvrprokat vizsgl-
nak, melyek kzl az egyik beteg, a msik nem.
Manapsg a genomikai mdszerek fejldsvel egyszerre rengeteg markert tudunk
vizsglni. Ezzel kapcsolatban mr kifejlesztettek olyan statisztikai mdszereket, amelyek
korriglni kpesek az eltr etnikai httrrel rendelkez populcik sszehasonltsbl
ered statisztikai torztsokat.
A msik tma, amit itt mg ki kell emelni, hogy a vizsglt alll LD-ben van a felels al-
lllal. Ez azrt fontos, mert pozitv asszocici esetn a legnagyobb valsznsggel ez
kvetkezik be. Az egyik fontos feladat annak megllaptsa, hogy a marker direkt hatsa,
vagy az LD-ben lev alll felels a kapott asszocicirt. A legjobb mdszer, ha laborat-
riumi krlmnyek kztt, in vitro, vagy in vivo mdszerekkel, llatksrletekkel igazol-
juk a funkcionlis hatst. Manapsg annak is megntt az eslye, hogy in silico mdsze-
rekkel tallunk valamit. Az interneten szmos olyan adatbzis (ld. ENCODE projekt),
szoftver tallhat, amelyekkel egy alllhez funkcionlis hatst lehet kapcsolni. Pldul, a
varici megvltoztatja egy transzkripcis faktor kthelyt, megvltoztatja a kdolt
protein szerkezett, a miRNS-szekvencit, vagy kthelyet befolysol, szablyoz szek-
vencit vltoztat meg stb. A vizsglt allllal LD-ben lv felels alll azonostsa trtn-
het direkt szekvenlssal, vagy a populci haplotpustrkpe alapjn keresnk marke-
rnkkel szoros LD-ben lv msik polimorfizmust. Ez utbbihoz olyan SNP-adatbzisok
llnak rendelkezsre, mint a dbSNP, vagy a haplotpusblokkok feltrkpezsre a
Haploview szoftver.
11.1.7. Kockzatszmts
Asszocicis vizsglatoknl szmszersteni szoktk a tallt sszefggsek erssgt. Az
egyik ilyen jellemez a p-rtk, amely azt mutatja, hogy mekkora a valsznsge a ha-
mis asszocicinak. A szignifikanciahatr ltalban p = 0,05. Az ennl kisebb rtkeket
fogadjuk el szignifikns, azaz statisztikailag igazolt asszocicinak. Ld. mg Bonferroni-
korrekci (2. fejezet).
A kockzatszmolsnl hasznlt p-rtkkel sszefggsbe hozhat fogalom retrospek-
tv vizsglatoknl az odds ratio vagy OR-rtk. OR jelentse: az esly, hogy az illet alll
(vagy lkusz) asszocil a betegsggel a betegekben, osztva az esllyel a kontrollcsoport-
ban. Rszletesebben: http://en.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio.
Ezzel rokon a prospektv vizsglatoknl hasznlt relative risk, vagy RR-rtk. RR
jelentse: az asszocici valsznsge a betegcsoportban osztva az asszocici valsz-
nsgvel a kontrollcsoportban. Ld.: http://en.wikipedia.org/wiki/Relative_risk.
Mindkt rtk azt mutatja, hogy az adott genetikai varins hordozsa hnyszorosra
nveli meg az illet kockzatt a betegsg kialakulsra. Az 1-nl nagyobb rtk kock-
zatnvekedst, a kisebb rtk kockzatcskkenst jelent. Fontos mg megadni az rtk
95%-os konfidencia- (95%CI) hatrt is. Ez azokat az rtkhatrokat mutatja, amelye-
ken bell az sszefggs 95%-os valsznsggel igaz. Az sszefggs akkor fogadhat
el ltalban, ha a kt szm kztti rtk nem lpi t az 1-et. Pl. az OR = 3,2 (2,4-4,8) nem
lpi t, gy elfogadhat az sszefggs, mg pl., OR = 1,8 (0,8-3,6) tlpi, gy nem vals az
sszefggs. Egy marker vizsglatnl p = 0,05 az a hatr, amely fltt tlpi, alatta nem
lpi t az OR 95%CI-je az 1-et. Ez mutatja, hogy a szignifikanciahatr s a kockzatrt-
kek kztt sszefggs van.
11.2. Evolcigenetika
A modern evolcigenetika a darwini evolci, a genetika s a molekulris genetika
szintzisbl szrmazik. Az evolcigenetikt itt most fleg humn, orvosi szempon-
tokat figyelembe vve trgyaljuk, s leginkbb arra szortkozunk, hogy milyen tnyezk
jtszhattak szerepet a mai ember genomjnak kialakulsban.
Termszetes (vagy tisztt) szelekci (az elnytelen mutci nem rkldik to-
vbb).
Pozitv szelekci (az elnys mutci feldsul).
Kiegyenslyoz szelekci: pl. a heterozigtasg valamilyen krnyezeti tnyez-
vel szemben elnyt jelenthet.
Az ember az llatvilgban klnleges helyet foglal el, ami a genomjn is nyomot hagy,
illetve hagyott (1). Pldul az ltzkds, klnbz eszkzk, mezgazdasg, gygysze-
rek, gy ltalban a civilizci, lehetv tettk, hogy az egybknt toxikus varinsok fel-
dsuljanak. Ez a mai, fejlett orvostudomnnyal rendelkez korunkban klnsen fel-
gyorsult. Sokszor nagy penetrancij, kros mutcij emberek is tudnak szaporodni,
tovbbadva a toxikus varinsokat. Ez ugyan az emberisg nagyobb diverzist, komp-
lexitst is lehetv tette, kiszolgltatott lett viszont a technikai innovciknak.
Az emberi genomot forml krnyezeti tnyezk kzl kiemelked fontossgak s
hatsak a mikroorganizmusok, illetve az embert r fertzsek. Ennek a szelekcis
tnyeznek mg trtnelemforml hatsait is ismerjk, illetve mg manapsg is tapasz-
taljuk. Gondoljunk bele, hogy a klnbz hatalmas jrvnyokban (pestis, kolera, tfusz,
himl stb.) az arra rzkenyek meghaltak (kiszelektldtak), s nem rktettk tovbb
genomjukat. Aki valami miatt ellenll volt, letben maradt, s tovbbrktette a beteg-
sgrezisztens genomjt. Pldul Amerika meghdtsban az eltren szelektld po-
pulcik tallkozsa oda vezetett, hogy az amerikai slakosok tlnyom tbbsge a h-
dtk ltal behurcolt fertzsekbe halt bele, de az eurpaiak is vittek haza j nhny
slyos betegsget okoz fertzst. A ma l populci azoknak az utda, akik tlltk
ezeket a nagy jrvnyokat, s termkeny utdokat hoztak ltre. Itt azonban meg kell je-
gyezni, hogy az, hogy valaki hogyan reagl egy fertzsre, a genomjn kvl termsze-
tesen mstl is fgg. Ilyenek lehetnek pl. a korbbi s egyidej fertzsek, ltalnos fizi-
kai llapot, vagy az adott epigenetikai llapot.
Az elmlt vekben a humn genom megismersvel ezeknek a mikroorganizmus-
emberi genom klcsnhatsoknak szmos nyomt fedezhettk fel. Pl.:
AIDS betegsg sokkal lassabban alakul ki bennk a vad alll homozigtkhoz kpest
(kezeletlenl 68 v vs. 24 v). A kutatsok alapjn a mutci tbb ezer ve keletkezett
(7000 v (290015 750)). Gyakorisga Eurpa szaki feln nagyobb s dl fel cskken,
teht valsznleg valamelyik szaki npben keletkezett, s onnan terjedt dl fel. Nem
eurpaiakban (afrikai, zsiai) a mutci nem fordul el, kivve, ha az seik kztt volt
eurpai. Feltehetleg az eurpai populci tesett HIV-1-hez hasonl fertzseken,
valsznleg tbbszr is, ami szintn a CCR5-t hasznlta a sejtekbe val bejutshoz. A
CCR532 szelekcis elnyt biztostott ebben az esetben is. Ezt a fertzst eddig mg nem
sikerlt egyrtelmen bizonytani. Elszr a pestisre gyanakodtak (baktrium), majd a
himlre, hiszen ez a HIV-hez hasonlan szintn vrus (7), de a bizonytkok nem voltak
meggyzek. 2013-ban egy, Nature-ben megjelent publikciban lertk, hogy a Staphy-
lococcus aureus leukotoxin ED citotoxikus hatshoz is szksges a CCR5 receptor,
a CCR5 KO egerek rezisztensek a fertzsre, gy ez nagy valsznsggel hozzjrulhatott
a CCR532 alll populcis feldsulshoz.
Az elz fejezetben nhny pldt lthattunk arra, hogy a krnyezeti tnyezk hogyan
alaktottk a humn genomot. Ebben a fejezetben a gn-krnyezet klcsnhatst abbl
a szempontbl mutatjuk be, hogy az egyes krnyezeti faktorok hatst az egynre
hogyan befolysolhatja az egyn egy-egy genetikai varicija.
Termszetesen az tmenet a ktfle mutci kztt folytonos. Az, hogy ki hogyan fog
egy krnyezeti hatsra reaglni, nagyban fgg az illet genomikai httertl. A 12.1.
brn a fny-, illetve sugrzsrzkenysg alapjn lthat a populci eloszlsa. A 12.1.
brn lthat eloszls a legtbb gn-krnyezet klcsnhatsban felrajzolhat.
12.2. bra. Y-tengely: A cigaretta utni vgyds vltozsa egy stresszes szituci utn.
Az egyes oszlopokban a DRD2 A1 s az SLC6A3 9R polimorfizmusokat klnbz
mrtkben hordoz populcik. Azok, akik mindkt varinst hordoztk (utols oszlop),
12-szeres vgydst mutattak azokhoz kpest, akik egyik varinst sem hordoztk
(els oszlop) [12].
Dohnyosok Nem-dohnyosok
kockzatt is. Az APOE4 ezeket a hatsokat felersti, azaz ez az alll sebezhetbb teszi
az embereket a krnyezeti tnyezkkel szemben [25].
Erre plda a 11. fejezetben lert vizsglat, amelyben az let kzps idszakban a
dohnyzs 4,93-as OR-rel asszocilt Alzheimer-krral, amelyet mdostott az apoE4 hor-
dozi sttusz. Az apoE4 hordoz dohnyosokban az OR = 6,56 volt, s az sszefggs
csak ebben a csoportban maradt szignifikns [26].
Az APOE4 alll gyakorisgt is magyarzzk szelekcis elnnyel. A magasabb LDL-C-
szinttel asszocil E4 nagyobb affinitssal ktdik az LDL-receptorhoz. Ez a koleszterin
jobb felszvdst segti el. A gyjtget letmdot folytat, fleg nvnyi eredet tp-
llkot fogyaszt, kevs vagy alacsony koleszterintartalm lelemhez jut populcik-
ban ez egy szelekcis elnyt jelenthetett. Ez a gyakorlatban is bizonytott, hiszen ezek-
ben a populcikban az E4 alll gyakoribb.
Az APOE alllok befolysoljk a vrhat lettartamot is. A legmagasabb vrhat let-
tartammal az APOE2 alll-hordozk, a legalacsonyabbal az APOE4 hordozk rendelkez-
nek. Az elzek alapjn ez taln arra vezethet vissza, hogy az APOE4 rzkenyebb tesz
a kros krnyezeti tnyezkkel szemben. Ezt figyelembe vve az APOE4-hordozknak
fokozottan gyelni kellene az letmdjukra. Ezzel kapcsolatban rdekes megfigyelst
tettek. Mivel ezek az alllok leginkbb idskorban hatnak, azt gondolnnk, hogy nincse-
nek szelekcis nyoms alatt. Az egyik vizsglatban ennek az ellenkezjt figyeltk meg. A
mai, modern vilgban, amikor egyre idsebb embereknek is szletik gyermekk, azt le-
het megfigyelni, hogy az E2 s E3 alllok gyakorisga enyhe, de konzekvens emelkedst
mutat az E4 alll rovsra. Ez az emelkeds az E2 alll esetben mg erteljesebb [27].
A CAD-kockzatot jelent magas koleszterinszintet sokszor lehet cskkenteni megfe-
lel ditval. Azonban ez nem mindenkinl mkdik. Egy vizsglatban ennek kerestk a
genetikai httert. nkntes frfiakat etettek koleszterinben gazdag ditval. 9%-uk
egyltaln nem reaglt (hyporesponder), 9%-uknak az tlagosnl sokkal jobban meg-
emelkedett a szrumkoleszterin-szintje (hyperresponder). Ez egy reproduklhat jel-
lemznek bizonyult, s a koleszterincskkent ditra is ugyangy reagltak. A leger-
sebb hatsa az APOE-varinsoknak volt erre a jellemzre. Az apoE2-hordozk voltak a
hyporesponderek. Mg a koleszterinszint-cskkent ditra az apoE 3/4 genotpussal
rendelkezk reagltak a legjobban (23% cskkens). Ez utbbi eredmny azt is mutatja,
hogy egy genotpusnak ugyanannl az egynnl a krnyezeti hatstl fggen lehet
negatv, s lehet pozitv hatsa is.
Mind az atherosclerosis, mind az asztma kialakulsban s tneteiben komoly szere-
pet jtszanak a leukotrinek. Ezek lipid tpus gyulladsos meditorok, melyek szintj-
nek cskkentse mindkt betegsg tneteit mrskli. Az antileukotrinek az egyik leg-
gyakrabban hasznlt antiasztmatikus gygyszercsaldba tartoznak.
Az 5-lipoxigenz (ALOX5, 10q11.2) a leukotrin szintzis egyik kulcsenzimje. Szubsztrt-
jai az llati zsrokban megtallhat arachidonsav s a linolnsav. A gnnek van egy gya-
kori polimorfizmusa, a promter rgiban tallhat ismtld szakaszon. Ez egy tan-
dem, ismtld szekvencia, amelyben egy 5GGGCGG3 szakasz ismtldik, s amely egy
Sp1- (transzkripcis faktor) kt motvum is. A vad tpusban ebbl 5 van, a varinsban 3
(12 bp delci). A Los Angeles-i populciban a homozigta hordozk arnya 6% volt
(28/470), teht gyakorinak tekinthet a varins homozigtasg. Egy vizsglatban az
arachidonsav s linolsav fogyasztsa megnvelte a karotisz intima mdia vastags-
got az ALOX5 promter varins alll (3 ismtlds) homozigtkban, a vad alll hordo-
ziban nem [28]. Tbbszrsen teltetlen omega3 zsrsavakban gazdag tpllkozs
(pl. halolaj fogyasztsa) a varins homozigtkban megakadlyozta a karotisz inti-
ma mdia vastagsgnak nvekedst. Azaz, a halolaj fogyasztsa csak a homozigta
A dohnyzs mellett egy msik jl mrhet, ers krnyezeti hats az alkohol. Az al-
kohol lebontsnak els lpst az alkohol-dehidrogenzok vgzik. Ezek kzl az ADH3
izoformnak 2 gyakori alllja van. A 1 alll 40% gyakorisg, s gyors metabolizmussal
asszocil. A 2 60%-os gyakorisg, lassabban mkdik (2,5x-es klnbsg). A 22 ho-
mozigtk hajlamosak alkoholizmusra, mg a 11 hordozk alkohol okozta szervkro-
sodsra. Egy nagy vizsglatban 4084 ves USA frfi orvosok vettek rszt [33]. Kiindul
ltszm 14 916, a kvetsi id 12 v volt. Ez alatt az id alatt a rsztvevk kzl 396 ka-
pott infarktust. Azokban, akik ADH3 22 genotpusak voltak, s naponta legalbb 14 g
alkoholt ittak, (kb.1 pohr sr), az MI kockzata 0,14 re cskkent, azaz 7,1x kisebb es-
lyk volt az MI kialakulsra (12.7. bra). Ez sszevg azzal a megfigyelssel, hogy kis-
mrtk alkoholfogyaszts (kb. napi egy-kt kors srnek vagy pohr bornak megfelel
alkohol) cskkenti a kardiovaszkulris betegsgek kockzatt. Ha brzoljuk a CAD-
mortalits kockzatt az elfogyasztott alkohol fggvnyben, egy J alak grbt kapunk,
melynek minimuma 2 kors srnek megfelel alkoholmennyisgnl van.
12.8. bra. A napi tbb mint egy italt (14 g alkohol) elfogyaszt, ADH3 22 genotpus
frfiaknak (nknek is) magasabb a HDL-szrum-szintjk, mint a msik kt genotpussal
rendelkezknek [33]
vel. Kivtelt jelentett az arab populci, ahol ilyen sszefggst nem talltak. Ezutn azt
vizsgltk, hogy a dohnyzs, fizikai aktivits vagy a dita befolysolja-e az SNP-k kock-
zatnvel hatst. A dohnyzs s a fizikai aktivits nem befolysolta, a ditk kzl a
prudens dita viszont befolysolta mind a 4 SNP kockzati rtkt. A legersebb dita-
SNP hatst az rs2383206 SNP-nl mrtek. Abban a csoportban, akik a legalacsonyabb
prudens rtket kaptk (azaz a legkevesebb ilyen telt fogyasztottk) az SNP OR rtke
1,32 (p = 6x10-7) volt, mg a legmagasabb prudens rtkkel rendelkez csoportnl az
SNP nem asszocilt MI-vel (OR = 1,02; p = 0,68). A dita-SNP klcsnhats mrtke
etnikumonknt klnbztt. Legersebb volt a dl-zsiaiaknl, szignifikns volt az eur-
paiakban s a latin-amerikaiakban, a szignifikanciahatron volt a knaiakban, s nem
volt tapasztalhat az arabokban. Ha a prudens ditt tovbb elemeztk, akkor a nyers-
zldsg-dita volt a meghatroz. A tbbi, a prudens dithoz tartoz lelmiszerrel val
korrekci nem befolysolta a szignifikanciartket. Az eredmnyek replikcijhoz a
prospektv FINRISK study populcijt is megvizsgltk. Ez a populci 19 129 egynbl
llt, melyek kzl 1014-ben alakult ki a nyomon kvets ideje alatt CVD. Ebben a po-
pulciban a 9p21 rs2383206 SNP-je emelkedett CVD-kockzattal asszocilt. Cskkent
kockzattal asszocilt a magas zldsg- s gymlcstartalm trend (HR = 0,79).
Ezeknek az teleknek az alacsony fogyasztsa itt is megemelte az SNP kockzati rtkt
(OR = 1,221,35), mg a magas zldsg- s gymlcsfogyaszts eltntette az SNP kock-
zati rtkt. Az INTERHEART study rsztvevin az SNP-dita klcsnhats legmagasabb
s legalacsonyabb kockzati csoportja kztt ktszeres kockzatklnbsg volt MI-re
(12.9. bra). Ugyanez a FINRISK study rsztvevin CVD-re 1,66 volt [36].
sszefoglalva, ez a nagy vizsglat azt mutatta ki, hogy a 9p21 rgi kockzati alllj-
nak hatst MI-re, illetve CVD-re az n. prudens ditval cskkenteni lehet. A dita meg-
hatroz eleme a nyers zldsg volt. Az az trend, amiben alacsony a prudens dita, de
fleg a nyerszldsg-tartalom, a 9p21 rgi kockzati allljnak hatst ersti. Hozz
kell mg tenni, hogy ez a hats etnikumfgg volt, gy pl. arab etnikumaknl nem lehe-
tett mrni. Ez utbbi mutatja, hogy ms genomikai s krnyezeti hatsok is befolysoljk
ezeket a hatsokat.
Az alacsony prudens ditt fogyaszt csoportban a 9p21 rgi kockzati allljra ho-
mozigtknak van a legmagasabb MI-kockzatuk (OR = 1,98), sszehasonltva a msik
alllra homozigta (AA), s magas prudens ditt fogyasztkkal [36].
Az elzhz hasonl vizsglatot vgezek el obezitssal kapcsolatban [37]. A vizsg-
latba tbb mint 20 ezer eurpai eredet embert vontak be. A rsztevk krdvet tltt-
tek ki, amelyben krdsek szerepeltek arra vonatkozlag, hogy a munkahelyn milyen
fizikai ignybevtelnek van kitve (pl., l- vagy llmunka, fizikai munka, nehz fizikai
munka), illetve szabad idejben milyen s mennyi fizikai aktivitst folytat. A fizikai akti-
vits alapjn 4 csoportra osztottk a rsztvevket. Korbbi GWAS-ok alapjn azonostot-
tak 12 gnben (NEGR1, SEC16B, TMEM18, ETV5, GNPDA2, BDNF, MTCH2, FAIM2, SH2B1,
FTO, MC4R, s KCTD15) egy-egy, azaz sszesen 12 BMI-vel s obezitskockzattal asszo-
cil SNP-t. Mindegyik alll 0,154 kg/m2 BMI-rtk-nvekedssel asszocilt, ami egy 170
cm magas embernl 445 g testtmeg-nvekedst jelent. A kockzati alllok hordozsa
kumulatv volt. Amikor az inaktv csoportba soroltakat vizsgltk, a BMI-nvel alllok
0,205 kg/m2 nvekedssel asszociltak (592 g/alll testtmeg-nvekeds), ez az aktv
csoportban csak 0,126 kg/m2 (364 g) (12.10. bra) volt. Hasonl sszefggst figyeltek
meg az obezitskockzat vonatkozsban is. Ezek alapjn az aktv letmd szignifikn-
san cskkentette (40%-kal) a 12 SNP-vel asszocil obezitskockzatot, azaz mozgssal
a htrnyos genetikai httr negatv hatst cskkenteni lehet.
betegsgekben is. Ezen tlmenen, taln mg nagyobb jelentsge van, hogy a GRIN2A
genotipizls segthet eldnteni, hogy PD-s betegek kzl kinek, milyen kezels
lenne optimlis. A jelenleg hasznlt L-DOPA tneti kezels, a betegsg romlst nem
tudja megakadlyozni. A glutamtreceptor-blokkolkkal trtnt klinikai vizsglatok ku-
darccal vgzdtek. Taln, ha a GRIN2A genotpus alapjn csoportostani lehetne a bete-
geket, lenne olyan alcsoport, mely pozitvan reaglna erre a kezelsre.
Vannak egynek, akik egyes telekre a genetikai htterk miatt klnsen rzke-
nyek. Erre plda a glkz-6 foszft dehidrogenz- (G6PD) hiny kvetkeztben fellp
tlrzkenysg a lbabra (vicia faba). Az X-kromoszmn tallhat gn mutcija miatt
a hordoz frfiak vagy homozigta nk egy rszben a lbab fogyasztsa utn slyos
hemolitikus anmia alakulhat ki. A lbab egyik elnevezse (fava bean) miatt a betegsget
favizmusnak is hvjk. A G6PD hiny a leggyakoribb enzimhiny a vilgon, kb. 400 milli
embert rint. Fleg a malrival fertztt terleteken gyakori, mivel a mutci vdelmet
nyjt a betegsggel szemben (ld. mg: http://en.wikipedia.org/wiki/Favism). A mut-
cit hordozk szmos gygyszerre vagy pldul a hennra is tlrzkenyek. Ezekben az
esetekben a genetikai httr ismerete akr letment is lehet.
Termszetesen a nutrigenomikai vizsglatok drgk s az eredmnyek csak megfele-
l kritikval, ms vizsglatokkal, szemlyes tapasztalatokkal egytt, szakemberek bevo-
nsval hasznosthatk optimlisan. Ide is vonatkoznak termszetesen a genomikai ered-
mnyek jsolhatsgnak korbban trgyalt korltai. Pldul, ha valakinl korbban
valamilyen krnikus betegsg alakult ki (pl. reflux vagy telallergia), akkor az is ersen
12.8. Irodalom
1. Laland KN, OdlingSmee J, Myles S. How culture shaped the human genome: bringing
genetics and the human sciences together. Nat Rev Genet. 2010 Feb;11(2):13748.
2. International Human Genome Sequencing Consortium: Initial sequencing and
analysis of the human genome. Nature 2001; 409:860921.
3. Venter JC et al. The sequence of the Human Genome. Science 2001; 291:130451.
4. Barreiro LB, Quintana-Murci L. From evolutionary genetics to human immunology:
how selection shapes host defence genes. Nat Rev Genet. 2010 Jan; 11(1):1730.
25. Kivipelto M, et al. Apolipoprotein E epsilon4 magnifies lifestyle risks for dementia: a
population-based study. J Cell Mol Med. 2008 Dec; 12(6B):276271.
26. Rusanen M, et al. Midlife smoking, apolipoprotein E and risk of dementia and
Alzheimer's disease: a population-based cardiovascular risk factors, aging and
dementia study. Dement Geriatr Cogn Disord. 2010; 30(3):27784.
27. Drenos F, Kirkwood TB. Selection on alleles affecting human longevity and late-life
disease: the example of apolipoprotein E. PLoS One. 2010 Apr 2; 5(4):e10022.
28. Dwyer JH, et al. Arachidonate 5-lipoxygenase promoter genotype, dietary
arachidonic acid, and atherosclerosis. N Engl J Med. 2004 Jan 1; 350(1):2937.
29. Zhang G, et al. Opposite gene by environment interactions in Karelia for CD14 and
CC16 single nucleotide polymorphisms and allergy. Allergy. 2009 Sep; 64(9):1333
41.
30. Alam MA, et al. Association of polymorphism in the thermolabile 5, 10-methylene
tetrahydrofolate reductase gene and hyperhomocysteinemia with coronary artery
disease. Mol Cell Biochem. 2008 Mar; 310(1-2):1117.
31. Bufalino A,. Maternal polymorphisms in folic acid metabolic genes are associated
with nonsyndromic cleft lip and/or palate in the Brazilian population. Birth Defects
Res A Clin Mol Teratol. 2010 Nov; 88(11):9806.
32. Chen L, et al. Alcohol intake and blood pressure: a systematic review implementing a
Mendelian randomization approach. PLoS Med. 2008 Mar 4; 5(3):e52.
33. Hines LM, et al. Genetic variation in alcohol dehydrogenase and the beneficial effect
of moderate alcohol consumption on myocardial infarction. N Engl J Med. 2001 Feb
22; 344(8):54955.
34. Capri M, et al. Human longevity within an evolutionary perspective: the peculiar
paradigm of a post-reproductive genetics. Exp Gerontol. 2008 Feb; 43(2):5360.
35. Candore G, et al. Inflammation, longevity, and cardiovascular diseases: role of
polymorphisms of TLR4. Ann N Y Acad Sci. 2006 May; 1067:2827.
36. Do R et al. The Effect of Chromosome 9p21 Variants on Cardiovascular Disease May
Be Modified by Dietary Intake: Evidence from a Case/Control and a Prospective
Study. PLoS Medicine 2011; 9 (10)
37. Li S, et al. Physical activity attenuates the genetic predisposition to obesity in 20,000
men and women from EPIC-Norfolk prospective population study. PLoS Med. 2010
Aug 31; 7(8). pii: e1000332. PubMed PMID: 20824172; PubMed Central PMCID:
PMC2930873.
38. Lu Y, Feskens EJ, Dolle ME, et al. Dietary n-3 and n-6 polyunsaturated fatty acid
intake interacts with FADS1 genetic variation to affect total and HDLcholesterol
concentrations in the Doetinchem Cohort Study. Am J Clin Nutr 2010; 92:258265.
39. Ordovs JM, Robertson R, Clirigh EN. Gene-gene and gene-environment interactions
defining lipid-related traits. Curr Opin Lipidol. 2011 Apr; 22(2):12936.
40. Hamza TH, et al. Genome-wide gene-environment study identifies glutamate
receptor gene GRIN2A as a Parkinson's disease modifier gene via interaction with
coffee. PLoS Genet. 2011 Aug; 7(8):e1002237.
13.1.2. Gygyszermellkhatsok
Ennek a fejezetnek a clja elssorban a farmakogenomiknak a msik fontos terletrl
szrmaz eredmnyeknek a bemutatsa. A farmakogenomiknak ez az ga azzal foglal-
kozik, hogy az emberek kztti genetikai klnbsgek hogyan befolysoljk a kezel-
sekre, gygyszerekre adott vlaszt. ltalban, amikor farmakogenomikrl vagy far-
makogenetikrl beszlnk, akkor ez utbbira gondolunk.
Ezeknek a vizsglatoknak, legalbb olyan nagy jelentsgk van, mint az j gygy-
szerclpontok keressnek. Egyrszt az emberek kztti genetikai klnbsgek miatt
egyes gygyszerek bizonyos emberekben hatstalanok. gy pldul a vrnyoms keze-
lsre hasznlt -blokkolk az emberek 30%-ban, mg az antidepressznsok a kezeltek
50%-ban hatstalanok. Az asztma terpijban is hasonl a helyzet. Becslsek szerint
az asztmsok ktharmadnl nem kontrollljk teljesen a betegsget. Kortikoszteroid-
inhalcival a kezeltek egyharmadnl nem rnek el a lgti funkcikban vagy a lgti
reaktivitsban objektv javulst. A leukotrin antagonistkkal val kezels statisztikja
mg rosszabb.
Ennl is nagyobb problmt jelent, hogy egyes embereknl bizonyos gygyszerek
slyos mellkhatsokat okoznak. Statisztikai adatok alapjn pldul az USA-ban vente
tbb 100 000 ember hal meg a gygyszerek mellkhatsai miatt, s Eurpban a krhzi
beutalsok 10%-rt felelsek a gygyszerek nem kvnatos hatsai. Az asztmban pl-
dul az orlis kortikoszteroiddal kezeltek egyharmadban alakul ki osteoporosis, mg az
5-lipoxigenz-gtlkkal kezeltek 35%-nl megemelkednek a mjenzimrtkek. Ritkn
asztmsoknl, akik inhalcis kortikoszteroid-kezelst kapnak, katarakta s/vagy
glaukma alakulhat ki, st egy nagyon kis szzalkuknl, akik nyjtott hats -agonista
kezelst kapnak, nvekszik a mortalits kockzata. Becslsek szerint a gygyszerekre
adott vlaszokban mutatott egynek kztti klnbsgek 6080%-rt a geneti-
kai klnbsgek a felelsek.
Br egyre tbb farmakogenetikai informcival rendelkeznk, ezek csak nehezen
mennek t a gyakorlatba, mg akkor is, ha az FDA ltal elfogadott informcikrl van
sz. Egy retrospektv felmrsben, amelyben 53 ezer beteget, s 99, az FDA javaslatra
farmakogenetikai informcival elltott gygyszert vizsgltak, kimutattk, hogy 300
600 slyos mellkhats lett volna elkerlhet, ha a javasolt farmakogenetikai tesztet el-
vgzik, s az eredmnynek megfelelen jrnak el.
A farmakogenomiknak a fent emltett kt ga, a gygyszerfejleszts s a gygysze-
rekre adott vlaszok genetikai klnbzsgnek vizsglata termszetesen tfedsben
van egymssal. Ha mr egy kifejlesztett gygyszer tjut a toxikussgot vizsgl I-es f-
zis vizsglatokon, a hatkonysgt vizsgljk a II-es fzisban. Mivel az emelked fzis
klinikai vizsglatok emelked kltsgekkel jrnak, azokat a szereket, amelyek csak a be-
tegek egy kis hnyadnl hatsosak, ltalban tl kockzatosnak talljk, hogy tovbb
vizsgljk. Ha a farmakogenomika be tudn azonostani azokat, akiknl a gygyszer ha-
tsos, a kvetkez klinikai vizsglatok clzottan ezekre irnyulhatnnak, gy kisebbek s
olcsbbak lehetnek (13.1.A. bra). Vagy a mr forgalomban lev gygyszereknl is ki
lehetne vlasztani azt az alpopulcit, akiknl a kezels hatsos lesz. rdekes s tanuls-
gos plda erre az az eset, amikor az FDA visszautastotta egy szvelgtelensg kezelsre
kialaktott kombinci engedlyezst (BiDil, NitroMed), mert a klinikai vizsglatok nem
igazoltk statisztikailag a szer hatsossgt egy ltalnos (etnikailag kevert) populci-
ban. Amikor azonban a gygyszert 1050, nmagt afrikai-amerikainak definil betegen
prbltk ki, a randomizlt klinikai vizsglat olyan marknsan pozitv eredmnyt hozott,
hogy a vizsglatot etikai okok miatt 2004 jliusban meg kellett szaktani, mivel a place-
13.1.A. bra. Az j gygyszer klinikai vizsglatnak II-es fzisban elvgzett GWAS-sal meg
lehet hatrozni azt az SNP-kszletet, amely jelzi, hogy a gygyszer kiben lehet hatsos. A
ksbbi fzisokban ennek az SNP-kszletnek a segtsgvel ki lehet vlasztani azokat az
embereket, akiket rdemes bevonni vizsglatokban, amivel nagyfok megtakarts rhet
el, s a gygyszer hatsossgnak sikert is nveli.
Az utbbi idben is szmos plda volt arra, hogy egy, mr engedlyezett gygyszert
kivontak a forgalombl, mivel egyeseknl slyos, sokszor hallos mellkhatsokat
okozott. Ezekrt a mellhatsokrt sokszor genetikai okok tehetk felelss. Ezek a
visszavonsok amellett, hogy a gygyszergyraknak okoznak sokszor tbb millird dol-
lros krt, a betegek egy rszt is megfoszthatjk egy esetleg a forgalomban maradknl
jobb gygyszertl. Ha a slyos mellkhatsokrt felels genetikai varicikat sikerlne
beazonostani, egy genetikai teszttel ki lehetne azokat szrni, akiknl az egyes gygysze-
rek nem kvnt mellkhatsokat okoznak (13.1.B. bra). Egyes szakrtk szerint a j-
vben valra vlhatna az a mg kiss futurisztikusnak tn kp, hogy mindenkirl egy
genetikaipolimorfizmus-adattr, vagy esetleg teljes genomszekvencia ll rendelkezsre,
mondjuk a hziorvosnl, az berja a komputerbe, hogy milyen hats gygyszert sze-
retne felrni az adott betegnek. Ezutn egy szoftver megadja, hogy melyik konkrt gygy-
szer vagy gygyszerek a leghatsosabbak, vagy lesz a legkevesebb s legkevsb vesz-
lyes mellkhatsuk az adott genetikai mintzattal rendelkez betegnl.
13.6.1.1. Clopidogrel
A gygyszert aterszklerzisban trombus-kpzds megelzsre hasznljk, gtolja a
P2Y12-t, ami egy ADP kemoreceptor. vente a vilgon kb. 40 millian szedik [13]. A clo-
pidogrel-t a szervezetnek t kell alaktani, hogy biolgiailag aktv metabolit kpzd-
jn. Ezt a CYP2C19 vgzi, melynek funkcivesztses mutcijval rendelkezkben gya-
koribbak a kardiovaszkulris komplikcik. A fehrpopulci 3-4% homozigta, 24%-a
heterozigta a gn inaktv vltozatra [10, 11].
GWAS-t vgeztek amish populciban, amelyben egy SNP-t azonostottak a CYP2C19
gnben, ami cskkent clopidogrel vlasszal asszocilt, s a gygyszervlasz-varicik
12%-rt volt felels. A hagyomnyos faktorok (BMI, letkor, koleszterinszint) a vari-
cik csak >10%-rt voltak felelsek. Ezt ksbb ms vizsglatokban is megerstettk,
st egy 12 ves nyomon kvetses vizsglatban a CYP2C19 sttusz volt az egyetlen fg-
getlen kockzati tnyez, amikor kardiovaszkulris hallt, nem-fatlis MI-t, vagy koron-
ria revaszkularizcit hasznltak vgpontknt. Egy msik vizsglatban a CYP2C19 mel-
lett mg a gygyszer felszvdsban szerepet jtsz ABCB1 gn kt varins allljnak
hordozi mutattak emelkedett mellkhats-kockzatot.
A CYP2C19-nek van egy ultragyors metabolizmussal asszocil funkcinyerses
alll-varinsa (CYP2C19*17), melynek hordozi az tlagosnl jobban reagltak a gygy-
szerre.
Jelenleg az FDA azt ajnlja, hogy a clopidogrelre rosszul reaglknl alternatv
terpit kell alkalmazni, s 2010 mrciusban a gygyszertjkoztatba is bekerlt a
CYP2C19 genotpusokkal kapcsolatos figyelmeztets.
13.8. Irodalom
1. http://www.fda.gov/
2. http://www.fda.gov/downloads/AboutFDA/Transparency/Basics/UCM247465.pdf
3. http://www.fda.gov/Drugs/ScienceResearch/ResearchAreas/Pharmacogenetics/uc
m083378.htm.
4. Erdelyi DJ, Kamory E, Zalka A, Semsei AF, Csokay B, Andrikovics H, Tordai A,
Borgulya G, Magyarosy E, Galantai I, Fekete G, Falus A, Szalai C, Kovacs GT. The role
of ABC-transporter gene polymorphisms in chemotherapy induced immuno-
suppression, a retrospective study in childhood acute lymphoblastic leukaemia. Cell
Immunol. 2006 Dec; 244(2):1214.
5. Erdlyi DJ, Kmory E, Cskay B, Andrikovics H, Tordai A, Kiss C, Fln-Semsei ,
Janszky I, Zalka A, Fekete G, Falus A, Kovcs GT, Szalai C. Synergistic interaction of
ABCB1 and ABCG2 polymorphisms predicts the prevalence of toxic encephalopathy
during anticancer chemotherapy. Pharmacogenomics J. 2008 8: 321327.
6. Semsei AF, Erdelyi DJ, Ungvari I, Csagoly E, Hegyi MZ, Kiszel PS, Lautner-Csorba O,
Szabolcs J, Masat P, Fekete G, Falus A, Szalai C, Kovacs GT. ABCC1 polymorphisms in
anthracycline induced cardiotoxicity in childhood acute lymphoblastic leukemia. Cell
Biol Int. 2011 Sep 20. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21929509.
7. Tan GM, Wu E, Lam YY, Yan BP. Role of warfarin pharmacogenetic testing in clinical
practice. Pharmacogenomics. 2010 Mar; 11(3):43948.
8. Gasche Y, et al. Codeine intoxication associated with ultrarapid CYP2D6 metabolism.
N Engl J Med. 2004 Dec 30; 351(27):282731.
9. http://en.wikipedia.org/wiki/Statin
10. Mangravite LM, Wilke RA, Zhang J, Krauss RM. Pharmacogenomics of statin response.
Curr Opin Mol Ther. 2008 Dec; 10(6):55561.
30. Tantisira, K.G., et al. TBX21: a functional variant predicts improvement in asthma
with the use of inhaled corticosteroids. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004;101:18099
18104.
31. Tantisira, K.G., et al. Molecular properties and pharmacogenetics of a polymorphism
of adenylyl cyclase type 9 in asthma: interaction between beta-agonist and
corticosteroid pathways. Hum Mol Genet. 2005, 14, 16711677.
32. Tantisira KG, et al. Genomewide association between GLCCI1 and response to
glucocorticoid therapy in asthma. N Engl J Med. 2011 Sep 29; 365(13):117383.
33. Palmer, L.J., et al. Pharmacogenetics of asthma. Am J Respir Crit Care Med.. 2002,15,
861866.
34. Distefano JK, Watanabe RM. Pharmacogenetics of Anti-Diabetes Drugs.
Pharmaceuticals (Basel). 2010 Aug 1; 3(8):26102646.
35. Konoshita T; Genomic Disease Outcome Consortium (G-DOC) Study Investigators. Do
genetic variants of the Renin-Angiotensin system predict blood pressure response to
Renin-Angiotensin system-blocking drugs?: a systematic review of pharmaco-
genomics in the Renin-Angiotensin system. Curr Hypertens Rep. 2011 Oct;
13(5):35661.
36. Manunta P, et al. Physiological interaction between alpha-adducin and WNK1-
NEDD4L pathways on sodium-related blood pressure regulation. Hypertension. 2008
Aug; 52(2):36672.
37. Turner ST, et al. Genomic association analysis suggests chromosome 12 locus
influencing antihypertensive response to thiazide diuretic. Hypertension. 2008 Aug;
52(2):35965.
38. Chung CM, et al. A genome-wide association study identifies new loci for ACE
activity: potential implications for response to ACE inhibitor. Pharmacogenomics J.
2010 Dec; 10(6):53744.
39. Corvol JC, et al. The COMT Val158Met polymorphism affects the response to
entacapone in Parkinson's disease: a randomized crossover clinical trial. Ann Neurol.
2011 Jan; 69(1):1118.
40. Arbouw ME, et al. Novel insights in pharmacogenetics of drug response in
Parkinson's disease. Pharmacogenomics. 2010 Feb; 11(2):1279.
41. Roses AD. Pharmacogenetics and the practice of medicine. Nature. 2000 Jun 15;
405(6788):85765.
14.1. Bevezets
Az elz fejezetekben tbbszr utaltunk r, hogy a genomikai mdszerek, a szmt-
gpek s a bioinformatika fejldsvel megnylt a lehetsg arra, hogy az llnyeket a
valsghoz jobban kzelten, komplex rendszerekknt modellezzk s rtelmezzk. A
nagy tereszt kpessg mdszerek (mikroarray gnexpresszi-mrs, GWAS stb.)
elterjedsvel soha nem tapasztalt mennyisg adatokhoz juthatunk, s az is nyilvn-
valv vlt, hogy az egyes mrsi eredmnyek, adatpontok nem fggetlenek egymstl,
hanem egymssal kapcsolatban, klcsnhatsban llnak. Pldul egy SNP, amely egy gn
szablyozrgijban helyezkedik el, nemcsak annak a gnnek az expresszijt vltoz-
tathatja meg, hanem azokt is, amelyekkel az a gn, vagy termke klcsnhatsban ll.
Tovbb, egy msik SNP befolysolhatja ennek az SNP-nek a hatst pozitv s negatv
irnyban is. Egy l szervezeten bell ezeket a klcsnhatsokat tbb szinten is tapasz-
talhatjuk, s mra vilgoss vlt, hogy egy szervezet mkdst, vagy pldul egy mut-
ci hatst csak akkor tudjuk rtelmezni, ha figyelembe vesszk ezeket a klcsn-
hatsokat. A biolgin bell azt a tudomnygat, amely ezeknek a hlzatszeren b-
rzolhat klcsnhatsoknak a feltrkpezsvel, s rtelmezsvel foglalkozik, rend-
szerbiolginak hvjuk. Definci szerint a rendszerbiolgia a biolgiai rendszerek
komponenseinek klcsnhatsnak tanulmnyozsa, s annak a vizsglata, hogy
ezek a klcsnhatsok hogyan befolysoljk a rendszer mkdst, funkcijt.
Az elmlt vekben a rendszerbiolgia, amelyet angolul systems biology-nak ne-
veznek, a fent emltett okok miatt is hatalmas fejldsen ment keresztl. Az albbiakban
a betegsgekre koncentrlva biolgiai hlzatok tulajdonsgait mutatjuk be, s rend-
szerbiolgiai alapfogalmakkal ismerkednk meg, illetve bemutatunk nhny pldt,
hogy hogyan alkalmazhatjuk, hasznosthatjuk a rendszerbiolgit.
14.1. bra. Az emberi gnek kevesebb, mint 10%-a, 1777, asszocil valamilyen betegsggel.
1565 gnnk van, amelyik in utero, azaz az embrionlis fejldsben esszencilis. A kt
halmaz csak rszben fed t egymssal [1]
14.5. Betegsghlzatok
A humn interaktom kapcsn lertakbl kvetkezik, hogy a teljes emberi interakcis h-
lzatot fel lehet rajzolni egyetlen nagy, bonyolult hlzattal. A betegsgek kialakulst
ebbl a hlzati megkzeltsbl gy lehetne magyarzni, hogy egy betegsg akkor jn
ltre, ha a hlzatot valamilyen mdszerrel elrontjuk, megzavarjuk a mkdst, szak-
szval, perturbljuk (14.4. bra). Ilyen perturbci lehet egy csompont eltvoltsa
(pl. fehrje kiesse null-mutci miatt), vagy hatsnak megvltoztatsa, pldul, ha egy
gnmutci miatt egy recetor ligandkt rgija mdosul (lmdosts). Viszont, mivel
a hlzat minden tagja valamilyen szint kapcsolatban ll egymssal, a hlzat perturb-
cijnak hatsa nem maradhat loklis, azaz az egyes betegsgek nem lehetnek teljesen
fggetlenek egymstl. Ez a gyakorlatban is bebizonyosodott. Az egyes betegsgmodu-
lok egymssal tfedsben vannak, gy egy perturbci, amely elvezet az egyik betegsg-
hez, befolysolhatja a msikat is. Ha egy olyan hlzatot rajzolunk, amelyekben a csom-
pontokban az egyes betegsgek llnak, s kzttk az lek a betegsgekkel asszocilt
cellulris komponensek kztti klcsnhatsokat brzoljk, betegsgtrkpeket ka-
punk melyet angolul a genome sz mintjra s a disease szbl diseasome-nak is
hvnak. Ennek segtsgvel megrthetjk egyrszt azt, hogy klnbz fenotpusok (be-
tegsgek) milyen molekulris kapcsolatban llnak egymssal, msrszt azt, hogy egyes
betegsgek mirt fordulnak el egyszerre. Az egyes betegsgek kztti kapcsolat j
utakat nyithat a betegsgek megelzsben, diagnzisban s kezelsben. Hozzjrul-
hat j gygyszerek felfedezshez, klnskppen, amikor olyan gygyszerekrl van
sz, amelyek tbb betegsgben is alkalmazhatk. Illetve alkalmat ad annak a vizsg-
latra, hogy egy betegsgben bevlt gygyszer hasznlhat-e egy msik betegsgben is.
A humn mutci adatbzisban tallhat ~50 ezer mendeli alll krlbell fele lm-
dost hats. Olyan gneknl, amelyek klnbz betegsgekkel is asszocilnak, s
amelyeknl a fehrje domn interakcii is rendelkezsre llnak, azt lehetett kimutatni,
hogy a klnbz betegsgekhez tartoz lmdost alllok klnbz interakcis do-
mnekben vannak, s ezrt vezetnek klnbz betegsgekhez, fenotpusokhoz.
14.6. bra. Ha kt betegsgnek kzs gnjei vannak (msodik oszlop), akkor ktszer
akkora esly van arra, hogy ha az egyik betegsg kialakul, akkor a msik is kialakuljon,
mintha nem lennnek kzs gnek. Azok a betegsgprok, amelyek mutcija a fehrje
ugyanazon funkcionlis domnjt rinti (harmadik oszlop), nagyobb komorbiditst
mutatnak, mint azok a betegsgek, ahol a mutcik klnbz funkcionlis domnban
vannak (utols oszlop) [1]
14.12. Irodalom
1. Barabsi AL, Gulbahce N, Loscalzo J. Network medicine: a network-based approach
to human disease. Nat Rev Genet. 2011 Jan; 12(1):5668.
2. Vidal M, Cusick ME, Barabsi AL. Interactome networks and human disease.
Cell.2011 Mar 18; 144(6):98698.
3. Barabasi AL, Albert R. Emergence of scaling in random networks. Science. 1999 Oct
15; 286(5439):50912. PubMed PMID: 10521342.
4. Jeong H, Tombor B, Albert R, Oltvai ZN, Barabsi AL. The large-scale organization of
metabolic networks. Nature. 2000 Oct 5; 407(6804):6514.
5. Albert R, Jeong H, Barabasi AL. Error and attack tolerance of complex networks.
Nature. 2000 Jul 27; 406(6794):37882.
6. Duarte NC, et al. Global reconstruction of the human metabolic network based on
genomic and bibliomic data. PNAS. 2007; 104:17771782.
7. Ma H, et al. The Edinburgh human metabolic network reconstruction and its
functional analysis. Molecular Systems Biology. 2007; 3:135.
8. Chen Y, et al. Variations in DNA elucidate molecular networks that cause disease.
Nature. 2008 Mar 27; 452(7186):42935.
9. Goh KI, Cusick ME, Valle D, Childs B, Vidal M, Barabsi AL. The human disease
network. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 May 22; 104(21):868590.
10. Lee D-S, et al. The implications of human metabolic network topology for disease
comorbidity. PNAS. 2008; 105:98809885.
11. Lu M, et al. An Analysis of Human MicroRNA and Disease Associations. Plos ONE.
2008; 3:e3420.
12. Hidalgo C, et al. A Dynamic Network Approach for the Study of Human Phenotypes.
Plos Computational Biology. 2009; 5 e1000353.
13. van Driel MA, et al. A text-mining analysis of the human phenome. European Journal
of Human Genetics. 2006; 14:535542.
14. Edwards YJ, et al.Identifying consensus disease pathways in Parkinson's disease
using an integrative systems biology approach. PLoS One. 2011 Feb 22; 6(2):e16917.
15. Gao S, Wang X. Predicting Type 1 Diabetes Candidate Genes using Human Protein-
Protein Interaction Networks. J Comput Sci Syst Biol. 2009 Apr 1; 2:133.
16. Menon R, Farina C. Shared molecular and functional frameworks among five complex
human disorders: a comparative study on interactomes linked to susceptibility
genes. PLoS One. 2011 Apr 21; 6(4):e18660.
17. Binder CJ, et al. (2004) IL-5 links adaptive and natural immunity specific for epitopes
of oxidized LDL and protects from atherosclerosis. J Clin Invest 114: 427437.
18. Taleb S, Tedgui A, Mallat Z (2010) Adaptive T cell immune responses and
atherogenesis. Curr Opin Pharmacol 10: 197202.)
15.1. Elzmnyek
Az elmlt vtizedekben rohamosan bvltek genetikai ismereteink. Ezt elsdlegesen a
korszer orvosbiolgia fejldse hozta magval, amit azonban jelentsen felgyorstott az
USA s a brit kormnyzat tmogatsa, amit a Human Genome Project s kapcsold
programjai mkdtetshez nyjt. A program az eredetileg tervezettnl sokkal
gyorsabban teljestette els szakasznak f clkitzst, nevezetesen az emberi
gnllomny genom molekulris szint lerst. Ez tbb tnyeznek volt ksznhet:
15.3. A biobankok
A biobankok az llnyek testbl eltvoltott biolgia mintk (szerv, szvet, sejt, DNS
stb.) sszegyjtst, megfelel krlmnyek kztti trolsnak, megrzsnek s
adatvdelmnek feladatait ltjk el. A biobank ltalnos rtelm sz. Az egyes bio-
bankok megklnbztethetek egymstl aszerint, hogy milyen llnybl (ember-,
kutya-, bza-, leszt-biobank stb.) vagy az adott llny szvetbl (emberivr-, embe-
rivesedaganat-, emberi-DNS-biobank stb.) szrmaz mintkat trolnak.
A DNS-biobankok (genetikai-biobank) olyan gyjtemnyek, amelyek nem szerveket,
szveteket, hanem az adott llny genetikai informcijt (genomi DNS-t) troljk.
A biobankok azonban tbbek egyszer gyjtemnynl. Minden egyes trolt biolgiai
minthoz tartozik egy adathalmaz, amely a biolgiai mintt ad llnyt jellemzi. Kln
jogszablyok vonatkoznak az eltr llnyekbl szrmaz, biolgiai mintt gyjt bio-
bankokra. rtheten leginkbb az emberi biobankokat szablyozzk.
Az emberi biobankoknl minden egyes biolgiai mintrl lehet tudni, hogy ki. Az
emberi biobankok rszletes klinikai (orvosi) adatokat tartalmaznak, ha az illet sze-
mlyhez betegsg is tartozik vagy tartozott. A biolgiai mintt ad szemlynek minden
esetben al kell rnia egy tjkoztat (a biobankrl, a biolgiai mintavtel mdjrl, az
esetleges mintavtellel jr mellkhatsokrl informcit ad lap) s egy beleegyez
nyilatkozatot. A biolgiai mintt ad ember szemlyi adatait s esetleges klinikai adatait
papralapon vagy elektronikus formban adatvdelmi szempontbl, trvny ltal
kodifiklt mdon, biztonsgosan troljk a biobankban.
Az emberi biobankokban szigoran anonim mdon troljk a biolgiai mintkat.
Minden egyes szemlybl szrmaz biolgiai minta kap egy nyilvntartsi szmot,
amely alapjn rendszerezik ket. A biolgiai minta tartjn nem lehet feltntetni olyan
adatot (nv, szletsi v vagy lakcm), amelybl egyszeren ki lehetne kvetkeztetni a
szemlyazonossgot. A biolgiai mintkhoz tartoz nyilvntartsi szmok, valamint a
szemlyi s klinikai adatok elektronikus formban kerlnek sszerendezsre. Az
elektronikus adattrols szigoran szablyozott, megfelel vdelmi svokkal rendelke-
zik annak rdekben, hogy az adatok ne kerljenek illetktelen kezekbe. Egyes esetek-
ben az anonimizls vgleges (pl. nagy populcik genetikai jellemzse esetn), teht so-
ha senki nem lesz kpes mr a biolgiai mintt egy donor individuumhoz ktni. Gyako-
ribb azonban a pszeudomizls, ahol kddal, esetleg tbbszrs kddal vdett a donor
szemlyazonossga, s azt csakis a hippokrteszi esk hatlya alatt ll orvos ismerheti
meg, akkor is csak a gygyts rdekben.
A betegsgek s sok egyb biolgiai folyamat tudomnyos tanulmnyozshoz
elengedhetetlen a nagyszm biolgiai minta (pl. ritka, de nagy hats alllok vizsglata
esetn). Ha a kutatsok elindulsakor kezddik csak a biolgiai minta gyjtse (a
betegek behvsa, biobankok felptse stb.), akkor a kutats lelassul, mert hnapok,
vek szksgesek a megfelel szm (nhny szz vagy ezer) minta sszegyjtshez. A
gondosan ltrehozott, gyakran nemzetkzi biobankok felgyorstjk a kutatsokat, mert a
vizsglat kezdetekor rendelkezsre ll a megfelel szm, megfelel httradattal (pl.
klinikai adatokkal) elltott biolgiai minta.
A tudomnyos kutatsokhoz csak kln etikai engedllyel rendelkez biobankokat
lehet hasznlni. Ebben az esetben ugyanis a biolgiai mintkon tervezett vizsglatok
nem tartoznak a szorosan vett gygytsi cl vizsglatok kz.
A biobankok specilis tpusai a vrbankok, ahol az nkntesek (donorok) ltal
adomnyozott vrt gyjtik, s mtteknl hasznljk fel ket; a szvetbankok, ame-
lyeket szvettltetsnl hasznlnak fel (pl. szaruhrtyabankok szaruhrtya-tltet-
sekhez). Ezekre a biobankokra jellemz, hogy viszonylag rvid ideig troljk a
szveteket, mert a sejtek letkpessge vges. A laboratriumi diagnosztikai vizsg-
latokhoz vett biolgiai mintkat is biobankokban troljk, ahol a vizsglat elvgzse
utn (diagnzis fellltsa utn) meg kell semmisteni a tanulmnyozott mintt, amely
trvnyileg szintn szigoran szablyozott.
15.8. Konklzi
Nyilvnval, s a genetika, a genomika korszakban tudnunk kell, hogy az emberi tuds
sohasem vlaszthat el a trsadalom egsznek szellemi s fizikai trtnseitl. Meg-
julsra s megersdsre trekv nemzetnk szmos szfrjban (gazdasg, jog, etika,
hitlet) kell alkalmazkodni tudsunk fejldsnek kvetkezmnyeihez. A vilgossg fel
kell haladnunk a tudomnytalan sttsggel szemben. Ez egyrtelm prioritsokat, r-
tkrendet s elktelezettsget, valamint a szemlyes felelssg pontos kijellst is szol-
glja.
15.9. Irodalom
Bernice Elger, Nikola Biller-Andorno, Alexandre Mauron and Alexander M. Capron (ed.):
Ethical Issues in Goberning Biobanks Global Perspectives; Ashgate (2008)
Ferencz Antal, Kosztolnyi Gyrgy, Falus Andrs, Kellermayer Mikls, Somfai Bla,
Jelenits Istvn, Hmori Antal: Biogenetika s etika (Sapientia fzetek 4.); Viglia
Kiad (2005)
The Advisory Committee on Health Research: Genomics and World Health; World Health
Organization (2002) Jan Helge Solbakk, Soren Holm, Bjorn Hofmann: The Ethics of
Research Biobanking; Springer (2009)