A piruvát-dehidrogenáz

komplex
PDC
Csala Miklós
 szénhidrátok fehérjék lipidek

glukóz aminosavak zsírsavak

glikolízis acil-KoA
szintetáz

e-

piruvát acil-KoA

citoszol
légz.
lánc
H+ piruvát acil-KoA
H+
e- acetil-KoA
H+
O2 H2O e-
ADP + Pi citrát
H+ ciklus e-
ATP CO2 mitokondrium
ATP
szint.
 A piruvát oxidatív dekarboxilációja

H+ -2H
oxidáció
ionizáció
CO2 H2O -H+

Piruvát Acetaldehid Acetaldehid- Acetát

hidrát

Spontán, irreverzibilis
 A piruvát oxidatív dekarboxilációja
ahogy a PDC katalizálja
Nettó reakció:
Piruvát A felszabaduló szabadenergia
CH3-CO-COO- egy része hasznosul:

NAD+ KoA-SH 1. A PDC elektronszállítóval

oxidál (az oxidatív foszforilációt
táplálja), és
NADH CO2 2. A PDC hozzákapcsolja az
ecetsavat KoA-hoz (nagy
CH3-CO-S-KoA energiájú tioészter kötést hoz
Acetil-KoA létre).
Acetaldehid és acetát nem keletkezik szabad formában, végig
kötésben marad a katalízis során.
 A PD komplex
• Három metabolikus és két szabályozó enzimet tartalmaz:
E1: piruvát-dehidrogenáz (TPP)
E2: dihidrolipoil-transzacetiláz (liponsavamid)
E3: dihidrolipoil-dehidrogenáz (FAD)
(részt vesz a folyamatban két koenzim: NAD+ és KoA-SH)
PDH-kináz
PDH-foszfatáz.
• Mindhárom enzim több (12-60) példányban (E2 fehérjék középen).
• Mérete a riboszómáéhoz hasonló.
 Prosztetikus csoportok: TPP

Savi disszociációval alakul kitűnő

nukleofil reagenssé (karbo-anion).

TPP-t tartalmazó enzimek:

- piruvát-dekarboxiláz (élesztő pituvát-fermentációja
- piruvát-dehidrogenáz (PDC E1 enzime)
- α-ketoglutarát-dehidrogenáz (αKGDC E1 enzime)
- elágazó ketosav-dehidrogenáz (BKADC E1 enzime)
- transzketoláz
 Prosztetikus csoportok: TPP
A TPP mindig aldehid
csoportot szállít aldol
kötésben.

TPP-t tartalmazó enzimek:

- piruvát-dekarboxiláz (élesztő pituvát-fermentációja
- piruvát-dehidrogenáz (PDC E1 enzime)
- α-ketoglutarát-dehidrogenáz (αKGDC E1 enzime)
- elágazó ketosav-dehidrogenáz (BKADC E1 enzime)
- transzketoláz
 Prosztetikus csoportok: liponsav
A diszulfid di-tiollá redukálható,
amely tioésztert képezhet. Amid kötést alkot az enzim
lizil oldalláncának ε-amino
csoportjával.

liponsav

liponsavamid (prosztetikus csoport)

dihidroliponsav

Liponsavat tartalmazó enzimek:

E2 (transzaciláz) a PDC, αKGDC és BKADC komplexekben
 E1: piruvát-dehidrogenáz

Tiamin-pirofoszfát
(TPP)

Dekarboxilálás

Hidroxietil-
Piruvát tiamin-pirofoszfát
(HETPP)
 E1: piruvát-dehidrogenáz

acetil-TPP TPP karboanion

Oxidáció Transzfer

Liponsavamid Dihidro-
liponsavamid
Acetil-
dihidro-liponsavamid
 E2: dihidrolipoil-transzacetiláz

HS-KoA S-KoA
Transzfer

Acetil- Dihidro- Acetil-KoA

dihidro-liponsavamid liponsavamid
 E3: dihidrolipoil-dehidrogenáz

(Re-)Oxidáció
Dihidro- Liponsavamid
liponsavamid

Elektrontranszfer
mobil szállítóra

NADH + H+ NAD+
 A PDC által katalizált reakció(k)
A lizil-lipoamid csoportok lengőkarként mozognak a TPP-
k és a FAD-ok között.
 Mi lesz a NADH és az acetil-KoA sorsa?
NADH
A mitokondrium mátrixban termelt NADH a légzési láncot
táplálja. Más reakció nem tudja jelentősen újraoxidálni a
NADH-t ebben a kompartmentben.
Ezért a PDC által katalizált reakció a légzéshez van kapcsolva,
és csak aerób körülmények között működhet (bár közvetlenül
nem használ oxigént).

acetil-KoA
Tovább oxidálódhat a citrátkörben, vagy felhasználódhat lipidek
szintéziséhez, de szénhidráttá (pl. glukóz) már nem alakulhat.
Más irreverzibilis folyamatoktól eltérően, a PDC reakciót nem
lehet visszacsinálni.
 A PDC szabályozása

Allosztérikus szabályozás:
Magas acetil-KoA és NADH szint gátolja az E2 és E3 enzimeket.

PDC
Piruvát
dehidrogenáz
(E1)

+ Dihidrolipoil
transzacetiláz
(E2) -
+ Dihidrolipoil
dehidrogenáz
-
(E3)
Piruvát + HS-KoA + NAD+ NADH + Acetil-KoA + CO2
 A PDC szabályozása
Kovalens módosítás: E1 enzim foszforilációja/defoszforilációja
NAD+, piruvát
ADP, AMP NADH, acetil-KoA

ATP ADP
- +
Piruvát- PDC-kináz Piruvát-
dehidrogenáz dehidrogenáz
(E1) (E1) P
Dihidrolipoil-
PDC-foszfatáz Dihidrolipoil-
transzacetiláz transzacetiláz
(E2) (E2)
Pi
+ H2O
Dihidrolipoil- Dihidrolipoil-
dehidrogenáz dehidrogenáz
(E3) (E3)
Ca2+
Aktív Inzulin Inaktív
 A PDC szabályozása
Aktiválja:
[ NADH ] [ ATP] [acil  KoA]
alacsony 
, alacsony , alacsony ,
[ NAD ] [ ADP] [ KoA]

inzulin és
Ca2+ (izommunka)

Gátolja:
[ NADH ] [ ATP] [acil  KoA]
magas 
, magas , magas
[ NAD ] [ ADP] [ KoA]
 Összefoglalás
• A piruvát irreverzibilis átalakítása acetil-KoA-vá
(oxidatív dekarboxiláció, amely a NAD+-ot elektronokkal tölti fel).

• Egy szénhidrát-prekurzor átalakítása olyan vegyületté, amely

lebomolhat vagy felhasználódhat lipidek (zsírsavak,
koleszterin) és ketontestek szintéziséhez.

• A mitokondriális mátrixban
(minden mitokondriummal rendelkező sejtben megtalálható).

• Csak AERÓB viszonyok között működik.

• Három metabolikus és két szabályozó enzimet tartalmaz:

E1: piruvát-dehidrogenáz (TPP)
E2: dihidrolipoil-transzacetiláz (liponsavamid)
E3: dihidrolipoil-dehidrogenáz (FAD)
(részt vesz a folyamatban két koenzim: NAD+ és KoA-SH)
PDH-kináz
PDH-foszfatáz.
A citrátkör
 szénhidrátok fehérjék lipidek

glukóz aminosavak zsírsavak

glikolízis acil-KoA
szintetáz

e-

piruvát acil-KoA

citoszól
légzési
lánc
H+ piruvát acil-KoA
H+
e- acetil-KoA
H+
O2 H2O e-
ADP + Pi citrát
H+ ciklus e-
ATP CO2 mitokondrium
ATP
szint.
A teljes
citrát
ciklus
 Citrát-szintáz

IRREVERZIBILIS

A második lépés (tioészter hidrolízise) teszi a reakciót irreverzibilissé.

 Akonitáz

Az enzimek sztereo-szelektivitását ezen fedezték fel:

A nem-enzimatikus reakció négy sztereoizomer keverékét állítaná elő, de
az akonitáz csupán 2R,3S izocitrátot termel.

A citrát prokirális, és az akonitáz képes megkülönböztetni a pro-S és pro-R

csoportokat.
 Izocitrát-dehidrogenáz

Oxidatív dekarboxilálás IRREVERZIBILIS

A citoplazmai izocitrát-dehidrogenáz NADP+-t használ

(a kevés NADPH-termelő enzim egyike).
 α-Ketoglutarát-dehidrogenáz komplex

Oxidatív dekarboxilálás IRREVERZIBILIS

A komplex nagyon hasonlít a PDH-hoz, sőt közös az E3.

 Szukcinil-KoA-szintetáz

Szubsztrát szintű foszforiláció

A keletkező GTP átadhatja foszforil csoportját ADP-nek.

 Szukcinát-dehidrogenáz

Membránhoz kötött flavoprotein.

Része a szukcinát-CoQ reduktáz komplexnek (a légzési lánc

II. komplexe).
A komplex vas-kén fehérjéi a két elektront KoQ-ra helyezik át.
 Fumaráz

Sztereospecifikus hidratálás: mindig L-malát keletkezik.

 Malát-dehidrogenáz

Ez a reakció standard körülmények között nem spontán:

ΔGo’ = +29,7 kJ/mol.

Csak alacsony [NADH]:[NAD+] arány esetén megy végbe.

A teljes
citrát
ciklus
 A citrát ciklus nettó reakciója

CH3CO-S-KoA + 3NAD+ + KoQ + GDP + Pi + 2H2O

2CO2 + HS-KoA + 3NADH + 2H+ + KoQH2 + GTP

A citrátkör „amfibolikus” / elosztó szerepe
Glikolízis
Glukóz Piruvát PD C xi dáció Zsírsavak
β-O
Acetil-KoA

PC
Asp Koleszterin
Asn
Oxálacetát
Glukoneo- Citrát
genezis
Malát

Asp Izocitrát
Phe
Tyr Fumarát

Szukcinát
Ile
Met α-Ketoglutarát
Val Szukcinil-KoA
Glu
Páratlan Gln
szénatomszámú His Arg
zsírsavak Porfirin Pro
(hem)
 GLUKOPLASZTIKUS KETOPLASZTIKUS

glikogén Leu és
ketontestek ketoplasztikus
aminosavrészek
glukóz
egyéb glicerolipidek
mono-
szaharidok PDC
piruvát acetil-KoA
zsírsavak
glukoplasztikus
aminosavak és oxálacetát
koleszterin
aminosavrészek
citrát

epesavak
szteroidok
CO2
A citrátkör Acetil-KoA
szabá-
[NADH] Oxálacetát
lyozása [NAD+]
CISZI
Citrát
MD
Malát

Izocitrát
Fumarát NADH ADP
ICD
Ca2+
Szukcinát

GTP α-Ketoglutarát
Szukcinil-KoA αKGD

ATP Ca2+

A ciklust aktiválja:
[ NADH ] [ ATP]
alacsony 
, alacsony , és Ca2+ (pl. izomösszehúzódás)
[ NAD ] [ ADP]