Modelové Organizmy V Genetice

Modelové organizmy
v genetice
Modelové organizmy v genetice
Proč se používají?
- většinou využity i v dalších oborech biologie

- zkoumány dlouho, získáno mnoho poznatků
- snadnější možnost detailních výzkumů
- na pozadí velkého množství dat snadnější interpretace
- zobecnění získaných poznatků ??

Jaká byla kritéria výběru?
- historicky používané organizmy
- snadno dostupné organizmy
- dobře se množící organizmy
- náhoda, některé se neosvědčily
Podle čeho výběr?
Dnešní kritéria:
- snadná dostupnost
Dnešní kritéria:
- početné potomstvo
Dnešní kritéria:
- krátký životní cyklus
Dnešní kritéria:
- malé rozměry
Dnešní kritéria:
- snadné pěstování, chov
Dnešní kritéria:
- snadná manipulace
Dnešní kritéria:
- vysoká genetická variabilita
Dnešní kritéria:
- úroveň znalostí
Wikipedia www.biolib.cz
www.ezoo.cz Wikipedia
Dnešní kritéria:
- možnost genetických manipulací
a in vitro kultivací
northcoastvoices.blogspot.com/2009_09_01
Dnešní kritéria:
- snadná dostupnost
- početné potomstvo
- pokud možno malé rozměry
- snadné pěstování, chov
- snadná manipulace
- vysoká genetická variabilita
- úroveň znalostí
- možnost genetických manipulací
Viry a fágy
Bakterie
T fág, bakteriofág lambda a další T4 T4
T
Viry a fágy
Rostliny
TMV virus a další
Wikipedia www.apsnet.org www.mrsec.wisc.edu

Viry a fágy
Živočichové včetně člověka

www.ct24.cz
Virus chřipky - RNA virus
www.ordinace.cz
Polyomavirus (DNA virus)

a další
www.cgl.ucsf.edu www.flickr.com
Bakterie
Haemophilus influenzae
- první volně žijící organizmus s
osekvenovaným genomem - 1995
www.sciencemuseum.org.
Bakterie
Escherichia coli
- tyčinkovitá gramnegativní bičíkatá bakterie
- fakultativně anaerobní
- snad nejčastěji studovaná bakterie
- ve střevě živočichů
- 4,6 x 106 párů bazí, 4288 genů (1997)
- kruhový chromozom, 1,4 mm
cs.wikipedia.org
Bakterie
Bacillus subtilis a další

- tyčinkovitá grampozitivní sporulující bakterie
- velikost 1x4 μm
www.dailytech.com Jeff Errington, 2003

Houby
Saccharomyces cerevisiae
- krátký životní cyklus (90 min)
- rozmnožování pohlavní i nepohlavní
- haploidní i diploidní
cs.wikipedia.org
Houby
Saccharomyces cerevisiae
- malá velikost (10μ), snadná kultivace
- lineární chromozomy (n -16), plazmidy
- 12 Mbp, cca 5800 genů
- mnoho mutant
- vcelku snadná transgeneze
- Studium:
rekombinace
mitochondriální dědičnost
epigenetika
cs.wikipedia.org
Houby konidie
Neurospora crassa
párovací typ A párovací typ α
- snadná kultivace
- krátký životní cyklus (4 týdny)
protoperitecium spojení pohlavních buněk α a A
- rozmnožování pohlavní i nepohlavní jádro typu A
- haploidní i diploidní jádro typu α spojení jader α a A

zygota - 2n 1. meiotické dělení
2. mietické dělení
postmeiotické mitotické dělení
jádro haploidní askospory 8 askospor

4xαa4x A
nové hyfy
Houby
Neurospora crassa
- snadná kultivace
- krátký životní cyklus (4 týdny)
- rozmnožování pohlavní i nepohlavní
Houby
Neurospora crassa
- lineární chromozomy (n -7)
- mnoho mutant
www.stanford.edu
- Studium:
rekombinace a opravy DNA
crossing-over
meioza
biochemická genetika
interakce jádro - mitochondrie
epigenetika
Prvoci
Paramecium aurelia - trepka luční
- snadná kultivace
- jaderný dimorfizmus: makro- a mikronukleus
(makro a mikronukleus)
cs.wikipedia.org www.microbewiki.edu
Prvoci
Paramecium aurelia - trepka luční
- Studium:
telomery
genové přestavby
ribozymy
epigenetické modifikace
Prvoci
Tetrahymena thermophila (vejcovka)
- snadná kultivace
- jaderný dimorfizmus
- makronukleus a
mikronukleus
www.stolaf.edu
Prvoci
Tetrahymena thermophila
- Studium: telomery
ribozymy
genové přestavby
epigenetické modifikace www.drnelson.utmem.edu
www.invitrogen.com www.wikimedia.org
Zelené řasy
Chlamydomonas reinhardtii
- snadná kultivace, malá velikost (10μ)
- rozmnožování
pohlavní i nepohlavní
fáze životního cyklu
Zelené řasy
Chlamydomonas reinhardtii
- Studium:
- jaderný genom
- chloroplastový genom
- sexualita - párovací typy
Rostliny
Arabidopsis thaliana
- huseníček rolní
- snadné pěstování
- malá velikost (10 cm)
(5 - 6 týdnů)
- rozmnožování pohlavní
(samosprašný)
www-ijpb.versailles.inra.fr
Rostliny
Arabidopsis thaliana - huseníček rolní

- diploidní
- lineární chromozomy (n - 5)
- mnoho mutant
- Studium:
regulace genové
exprese,
vývoj rostlin,
epigenetické
modifikace atd.
Rostliny
Nicotiana tabacum
- snadné pěstování, velikost
- životní cyklus nejméně 5 měsíců
- diploidní
Rostliny
Nicotiana tabacum
- B chromozomy
- cca 4500 Mbp
- mnoho mutant www.carolina.com www.rikenresearch.riken.jp
- Studium:
explantátové kultury
regulace genové exprese
vývoj rostlin
epigenetické modifikace
atd.
commons.wikimedia.org
Rostliny
Oryza sativa
- kompletně sekvenována
- samosprašná
- diploidní
www.home.hiroshima-u.ac.jp commons.wikimedia.org
Rostliny
Oryza sativa
- nejmenší gemom z
jednoděložných rostlin
- Studium:
vývoj rostlin
epigenetické modifikace atd.
www.flickr.com
Rostliny
Zea mays
- snadné pěstování, životní cyklus (5 - 6 měsíců)
- rozmnožování pohlavní, samosprašná
- jednodomá, samčí a samičí květenství na jedné rostlině
Rostliny
Zea mays
- 2500 Mbp
- mnoho mutant
- Studium:
transponovatelné elementy
cytogenetika
epigenetické modifikace atd.
Rostliny
Physcomitrella patens
- čepenka odstálá
- mech, snadná kultivace
- snadná transformace
- osekvenován v dubnu 2007 (510 Mbp)
- základní systémy jako u vyšších rostlin
- Studium:
- funkce a diverzita vybraných genů
- umožňuje homologní rekombinace
- evoluce
Další rostlinné modely
Lycopersicon esculentum
- explantátové kultury
- transgeneze
Triticum aestivum
- snadná kultivace v laboratoři
- studium ploidií atd.
Populus trichocarpa
- topol chlupatoplodý
- první strom s osekvenovaným
genomem - 480 Mbp (září 2006)
Živočichové
Caenorhabditis elegans
- snadný chov, průhledný
- malá velikost (1mm)
- krátký životní cyklus (3,5 dne)
- diploidní
♀
hltan vaječník střevo konečník
řitní otvor
vejcovod oocyty sperma vajíčka vulva sperma
♂
střevo
spikuly
hltan
kloaka
varle chámovod
senzorické paprsčité
výběžky
Živočichové
Caenorhabditis elegans
lineární chromozomy (n - 3)
- mnoho mutant
- Studium:
vývoj
mezibuněčná signalizace
programovaná buněčná smrt
miRNA
Živočichové
Drosophila melanogaster
- snadný chov
- malá velikost (2-3 mm)
- krátký životní cyklus (10-12 dnů)
oplozené
- diploidní vajíčko
kukla
larva
1. instaru
larva
3. instaru larva
2. instaru
Živočichové
Drosophila melanogaster
- mnoho mutant
- Studium:
mutace, maternalita,
vazba genů, genetické mapování,
cytogenetika, populační a evoluční genetika,
epigenetické zákonitosti,
nádorová genetika
Živočichové
Danio rerio - danio pruhované

(zebřička)
- snadný chov, malá velikost - 6cm
- krátký životní cyklus (3-4 měsíce)
- průhledné embryo, částečně i potěr
- diploidní
wikipedia.org
Živočichové
Danio rerio
- první osekvenovaná ryba
- 1700 Mbp, cca 23500 genů
- studium vývojových drah
Živočichové
Takifugu rubripes
- čtverzubec rudoploutvý
- cca 70 cm dlouhý
- kompaktní genom
- první osekvenovaný čtverzubec
- jedovatý
bioinformatica.upf.edu
Živočichové
Tetraodon nigroviridis
- čtverzubec černozelený
- cca 10 cm
- kompaktní genom
- třetí osekvenovaný rybí genom
- propojení fyzické mapy chromozomů
se sekvencí DNA
Živočichové
Xenopus laevis
- drápatka vodní
- životní cyklus 1 rok, ve vodě
- velká embrya
- genom lineární
- tetraploid, 4n = 36
- snadné manipulace
www.uea.ac.uk
Živočichové
Xenopus laevis
- drápatka vodní
- Studium:
in vitro manipulace
molekulární genetika,
ploidie
buněčná a vývojová biologie, atd.
Živočichové
Mus musculus
- snadný chov a manipulace
- krátký životní cyklus (10 týdnů)
Živočichové
Mus musculus
- 2644 Mbp, cca 25400 genů
- velké množství mutant
- celkem snadná transgeneze
- Studium:
mutace, chování,
imunitní systém,
vývojové biologie,
různé choroby člověka
- např. rakovina
Živočichové
Sus scrofa
- snadný chov
- genetická variabilita
- blízké člověku
- Studium:
- různé choroby člověka
- imunologie
- rakovina atd.
Živočichové
Ovis ammon
- málo potomků
- ne ideální model
- Studium:
- transgeneze
- Dolly
- Polly a Molly- první trangenní savci
Živočichové
Homo sapiens
- dlouhý životní cyklus
- málo potomků
- nemožnost záměrného křížení a
genových manipulací
- diploidní
- 2782 Mbp, cca 27700 genů
- ke studiu nutné speciální metody

Modelové Organizmy V Genetice

Uploaded by

Document Information

Original Title

Copyright

Available Formats

Share this document

Share or Embed Document

Sharing Options

Did you find this document useful?

Is this content inappropriate?

Copyright:

Available Formats

Modelové Organizmy V Genetice

Uploaded by

Copyright:

Available Formats

Modelové organizmy

- většinou využity i v dalších oborech biologie

- zobecnění získaných poznatků ??

Podle čeho výběr?

Wikipedia www.apsnet.org www.mrsec.wisc.edu

Živočichové včetně člověka

Polyomavirus (DNA virus)

Bacillus subtilis a další

www.dailytech.com Jeff Errington, 2003

- haploidní i diploidní jádro typu α spojení jader α a A

postmeiotické mitotické dělení

jádro haploidní askospory 8 askospor

Arabidopsis thaliana - huseníček rolní

Danio rerio - danio pruhované

You might also like