Khám phá thế giới vi sinh vật

Thế giới vi sinh vật

Quần thể vi sinh vật

Microbial cells
 Vi sinh vật và sinh quyển

Sự phong phú của vi sinh vật:

- Số lượng trên trái đất:~ 2 X 1030
- Tổng lượng nitrogen và phosphus: cao
hơn động vật và nấm men 4 lần
- Chiếm 31% tổng lượng DNA trong sinh
quyển
Lược sử của sự sống
Tác động của vi sinh vật đến cuộc sống con người

Vi sinh vật là tác nhân gây bệnh

Tỷ lệ chết do các nguyên nhân khác nhau ở Mỹ

Tác động của vi sinh vật đến cuộc sống con người

Vai trò trong nông nghiệp

Tác động của vi sinh vật đến cuộc sống con người

Vai trò trong dinh dưỡng

Hệ tiêu hoá của con người

Tác động của vi sinh vật đến cuộc sống con người
Mối quan hệ giữa vi sinh vật và thực phẩm

Foodborne pathogens Foodborne illness

Food spoilage

Fermented food
Tác động của vi sinh vật đến cuộc sống con người

Vi sinh vật và công nghiệp

Nhiên liệu sinh học

Kính hiển vi

The van Leeuvenhoek microscope (1676)

Robert Hook, early microscopy,

and Micrographia (1665)
Pasteur và thuyết tự sinh
Nguyên tắc Koch
Các phát hiện khác của Koch
Koch and Pure Cultures

A hand-colored photograph taken

by Walther Hesse of colonies
formed on agar.

Koch and Tuberculosis

Rrobert Koch’s drawings of
Mycobacterium tuberculosis.
(a) Section through infected lung tissue
showing cells of M. tuberculosis (blue).
(b) M. tuberculosis cells in a sputum
sample from a tubercular patient. (c)
Growth of M. tuberculosis on a glass
plate of coagulated blood serum stored
inside a glass box to prevent
contamination. (d) M. tuberculosis cells
taken from the plate in c and observed
microscopically; cells appear as long,
cordlike forms.
Bản chất phân tử của sự sống

Early evidence that DNA is the molecular basis of heredity. (a) Griffith’s experiment, (b) The Avery–
MacLeod–McCarty experiment.
Cây phân loại

Early efforts to depict the universal tree of life.

 Cây phân loại

Evolutionary relationships and the phylogenetic tree of life. (a) The technology behind ribosomal RNA gene
phylogenies, (b) The phylogenetic tree of life.
Cấu trúc và chức năng
của tế bào vi sinh vật
Cấu trúc của tế bào vi sinh vật
Vi khuẩn và cổ vi khuẩn
Hình thái tế bào

The major morphologies of Prokaryotic cells

Kích thước tế bào

Epulopiscium fishelsoni. Thiomargarita namibiensis

Two very large bacteria Surface-to-volume ratio

Màng tế bào
Màng tế bào

Màng đôi phospholipid

Các dạng lipid chính và

cấu trúc của màng cổ vi
khuẩn
Vách tế bào: peptidoglycan
Vách tế bào: peptidoglycan
Lipopolysaccharide (LPS)
Vách tế bào cổ vi khuẩn

Pseudomurein The S-layer

Các cấu trúc trên bề mặt tế bào

VOL. 190, 2008

been rep
Fimbriae riety of
nomes.
located
of TadA
proteins
analysis
DUF361
sus sequ
FlaK/Pib
only in t
a specia
substant
ditional
VOL. 190, 2008 MINIREVIEW Very
first tim
been reported yet. The FlaFind program (75) predicted a variety
Pili Methano
riety of possible pilin-like proteins in sequenced archaea
nomes. The genes of many of these predicted gene proteinde
located in operons together with genes encodinglished homolo d
of TadA and TadC. This suggests that these operons en servatio
proteins that assemble pili or pilus-like structures.sessedThe Fla p
analysis also identified a group of putative pilins were iso w
DUF361 domain which have a different cleavagecells siteand
co
sus sequence than the other prepilins that are dodecyl processe
FlaK/PibD-like proteases. These putative pilins are prt vealed
only in the euryarchaeota, and they appear to be was pres
process
a specialized class III signal peptidase, EppA (75). analysis
EppA
substantially larger protein than FlaK, as it contains (MMP0 fou
ditional predicted transmembrane domains. In-frame
Very recently, several reports have appeared rendere that, fo
Bacterial capsules and slime formation first time, address the structure, function, and geneticstoration
of
a variety of archaea, including Methanococcus, Sulfolobusthe gene
FIG. 5. (a) Electron micrograph of a platinum-shadowed SM1 eu- An in
Methanothermobacter.
100 hami emanateInradially
Methanococcus maripaludis, a
Hami ryarchaeal coccus. About
surface. (b) Electrongene deletionofmutant
micrographs was
grappling
from the cell
constructed
hooks located at(S.
way to t
theNg et al., un
distal ends of the hami.
lishedArrowheads
data). Thisindicate
mutant locations of barbs.
is nonmotile Deletion
and(c)nonflagellated
Electron micrographservations
of high-level-structured SM1 hami.revealed
by electron microscopy The hami thesis
that this of
strain
 SHAPE Size Amount Function
FLAGELLA Whip-like 15-20 µm one to several locomotion
filamentous hundred
structures
Fimbriae Bristle-like 0.03-0.14 µm 200-400 Surface
short fibers attachment
Pili Long hair like 0.5-2 µm 1-10 Gene transfer
tube and attachment
Cell inclusions

Polyphosphate and sulfur storage products

Magnetosome

Carbon storage polymer:

Poly-ß-hydroxyalkanoates (PHAs)
Gas vesicles

Buoyant cyanobacteria and gas vesicles

Bào tử vi khuẩn

The life cycle of an endospore-forming bacterium Endospore structure

Sự di chuyển của tế bào
Di chuyển theo dạng bơi

Flagella Archaella

Di chuyển dạng bò trườn

Di chuyển hướng hoá và hướng quang
Di chuyển hướng hoá (chemotaxis)

Measuring chemotaxis using a capillary tube assay

Di chuyển hướng quang (Phototaxis)

Phototaxis of an entire colony of the purple phototrophic

bacterium Rhodospirillum centenum.
Tế bào vi sinh vật nhân thực
Nhân
Ti thể Hydrogenosomes

Lục lạp
Mạng lưới nội chất Thể golgi

Lysosome
Bộ xương tế bào Flagella và Cilia
Biến dưỡng
Nhu cầu dinh dưỡng của vi sinh vật

Nguyên tố đa lượng: C (50%); O, H (25%), N (13%); P, S, Se, Na, K,… (<5%)

Nguyên tố vi lượng: trace metals, growth factors (vitamins, amino acids…) à enzyme cofactors
Vận chuyển chủ động

Group translocation
Mechanism of the phosphotransferase system of E. coli

The 3 classes of active transport systems

Simple transport ABC system

Nhu cầu năng lượng

Dị dưỡng Tự dưỡng
 Năng lượng sinh học
Năng lượng tự do (Gf0): năng lượng được phóng thích hoặc cần thiết cho sự hình thành một
phân tử từ các nguyên tố tạo ra nó.

Sự biến đổi năng lượng tự do (ΔG0’):

Phản ứng:
ΔG0’ âm: phản ứng toả nhiệt
ΔG0’ dương: phản ứng thu nhiệt
 Hoạt tính xúc tác của enzyme

Một số yếu tố không phải protein cần cho hoạt tính

của enzym:
- Prosthetic groups: gắn chặt với enzyme (liên kết
cộng hoá trị và vĩnh viễn)
- Coenzymes: liên kết yếu với enzyme và có thể
phóng thích khỏi enzyme
Biến dưỡng năng lượng: quá trình đường phân
Biến dưỡng năng lượng: lên men
Biến dưỡng năng lượng: hô hấp tế bào

Tên:
Citric acid cycle (CAC)
Tricarboxylic acid (TCA) cycle
Krebs cycle

Chức năng:
- Kết hợp với chuỗi truyền
điện tử để tạo năng lượng
- Tạo ra các tiền chất cho
quá trình sinh tổng hợp
các chất chuyển hoá quan
trọng
Biến dưỡng năng lượng: hô hấp tế bào
Chu trình Glycoxylate
Chuỗi truyền điện tử
ATP synthase
Sinh tổng hợp: đường và polysaccharides
Sinh tổng hợp đường

Pentose phosphate pathway

Sinh tổng hợp: Amino acids và nucleotides
Amino acid

Purines và pyrimidines
Sinh tổng hợp: acid béo

ACP: acyl carrier protein

The biosynthesis of the C16 fatty acid palmitate