Professional Documents
Culture Documents
IN INFECTIA HIV/SIDA
1. DIAGNOSTIC SEROLOGIC
TESTE DE TRIAJ- sensibilitate inalta
ELISA
TESTE RAPIDE
TESTE DE TRIAJ
ETAPE
1. Incubare ser pacient 1h la 37C
2. Spalare
3. Incubare conjugat (Ac anti IgG uman x enzima)- 1h la 37C
4. Spalare
Distribuirea probelor cu
pipeta automata
Spalator
automat
Spectrofotometru
TESTE DE CONFIRMARE
WESTERN BLOT
Tehnica
WESTERN BLOT
1. SDS-PAGE
2. BLOT (transfer)
3. DETECTIA
ANTICORPILOR
Antiviral antibody
Stop
color
gp160
gp120
p66
p55
p51
gp41
p31
p24
p17
p10/11
p7/9
Western blot
in infectia HIV
Criteriul minim de
pozitivitate
2 env
+
1 gag
POZITIV IN DUPLICAT
ABSENTA
INFECTIEI HIV
WESTERN BLOT
NEGATIV
POZITIV=
INFECTIE HIV
! Ferestra
serologica
INDETERMINAT
risc rezidual al
transfuziei = 2/1 milion
DIAGNOSTIC SEROLOGIC
IN INFECTIA HIV/SIDA
CONTAGIOZITATE
SCADE CALITATEA VIETII
TRATAMENT
MONITORIZARE
CRESTE CALITATEA
VIETII
Beneficii
AGRAVARE
Temeri
1990
Romania
raporteaza 1094
cazuri de SIDA la
copii,
reprezentnd
jumtate din
totalul de cazuri
de
SIDA pediatric din
Europa
ENCEFALOPATIE HIV
1. DIAGNOSTIC SEROLOGIC
TESTE DE TRIAJ- sensibilitate inalta
ELISA
TESTE RAPIDE
TESTE DE TRIAJ
ELISA INDIRECTA
ETAPE
1. Incubare ser pacient 1h la 37C
2. Spalare
3. Incubare conjugat (Ac anti IgG uman x enzima)- 1h la 37C
4. Spalare
5. Incubare substrat 20 30 min la temp camerei
6. Citire la spectrofotometru DO probe, martori, cut off
Distribuirea probelor cu
pipeta automata
Spalator
automat
Spectrofotometru
ELISA de competitie
ETAPE
TESTE DE CONFIRMARE
WESTERN BLOT
- test imunoblot folosit pentru confirmarea prezentei anticorpilor
in diferite infectii
- se bazeaza pe detectia anticorpilor defalcati pe grupe antigenice
UTILIZARE
Detectia proteinelor virale
Caracterizarea preparatelor de anticorpi
mono- si policlonali
Determinarea specificitatii raspunsului
imun impotriva antigenelor virale
PRINCIPIU
Proteinele dintr-un lizat viral sunt separate
electroforetic dupa greutatea moleculara
prin SDS-PAGE (sodium dodecil sulfat)
Transferate pe o membrana de
nitroceluloza
Detectie prin anticorpi marcati radioactiv
(autoradiografie) sau enzimatic
(COLORIMETRIC)
ELECTROFOREZA
Pe gel de poliacrilamida
Apoi proteinele sunt transferate pe o
membrana de nitroceluloza prin difuzie,
electroforeza sau prin afinitate
Fixarea se face prin simpla absortie
pasiva, prin legaturi covalente pe
membrana diazotata sau prin legare
specifica pe membrana acoperita de
anticorpi
Tehnica
WESTERN BLOT
1. SDS-PAGE
2. BLOT (transfer)
3. DETECTIA
ANTICORPILOR
color
gp160
gp120
p66
p55
p51
gp41
p31
p24
p17
p10/11
p7/9
Western blot
in infectia HIV
Criteriul minim de
pozitivitate
2 env
+
1 gag
POZITIV IN DUPLICAT
ABSENTA
INFECTIEI HIV
WESTERN BLOT
NEGATIV
POZITIV=
INFECTIE HIV
! Ferestra
serologica
INDETERMINAT
risc rezidual al
transfuziei = 2/1 milion
Pacient 15 ani
test de triaj infectie HIV
Diagnostic
molecular in virusologie
AMPLIFICAREA TINTEI
PCR
NASBA (nucleic acid sequenced based amplification)
AMPLIFICAREA SEMNALULUI
b-DNA (branched DNA)
B-DNA
PCR
Amplificarea semnalului
Target Sequence
DNA Strand
Double Helix
DNA Strand
Chromosome
1 ciclu PCR
Biotin
Primer 1
Primer 2
Biotin
Secventa tinta
Secventa tinta
Secventa tinta
Amplificarea tintei
1 cycle = 2 Amplicon
2 cycle = 4 Amplicon
3 cycle = 8 Amplicon
4 cycle = 16 Amplicon
No. of
Cycles
Target
No. Amplicon
Copies of
16
32
64
20
1,048,576
30
1,073,741,822
5 cycle = 32 Amplicon
6 cycle = 64 Amplicon
PCR:
Master Mix
Target DNA
Mg2+
Taq DNA
Polymerase
Mn2+
dNTP
Primers
forward primer
reverse primer
RT- PCR
Reverstranscriere
+ PCR
Real-time PCR
sonde moleculare legate cu doua tipuri de molecule-semnal:
o molecula fluorescenta (reporter) si una de intarziere (quenching).
Unidirectional workflow!
Echipament protectie
Thermal Cycler
Thermal Cycler
with interchangeable blocks
DETECTIA AMPLICONULUI
Electroforeza in gel de agar, colorare
cu bromura de ethidiu si comparare
cu markeri de GM cunoscuta
Hibridizare cu sonde moleculare
marcate complementare si apoi
detectie (+/- spectrofotometrica)
Hibridizare
Avidin-horseradish peroxidase
(Av-HRP conjugate)
Biotin Tetramethylbenzidine
(TMB) Substrate
BSA
Addition
of Substrate
Microwell Plate
Hydrogen
Peroxide
Capture
Probe
Detectie
spectrofotometrica
BSA
GENOTIPAREA VIRALA
Amplicon (ADNc)
Secventiere nucleotidica
pt ampliconii din diferite
zone genomice
Banci de date
RFLP pt
ampliconi
Analiza filogenetica
LiPA ampliconi
Analiza genotipurilor
Arbori filogenetici
Hepatitis C Virus Resource at the Los Alamos National Laboratory (HCV-LANL)
Viral Bioinformatics Resource Center (VBRC)
Immune Epitope Database and Analysis Resource (IEDB)
Secventiere nucleotidica
ER 1
ER 2
ER 3
ER 1
ER 2
ER 3
LiPA
Line Probe Assay
Hibridizare cu sonde
moleculare cu
specificitate pentru
regiuni conservate
din cadrul
genotipurilor si
subtipurilor
evidentierea profilului
specific unui
genotip prezent in
ampliconi
seropozitivi testele serologice sunt pozitive, anticorpii materni trec bariera fetoplacentara;
doar o parte dintre nou-nascuti fac si infectia HIV (transmiterea materno-fetala a
infectiei ~25% sau << cu profilaxie).
Diagnostic molecular in
virusologie
Diagnosticul molecular in
virusologie
AMPLIFICAREA TINTEI
PCR
NASBA (nucleic acid sequenced based
amplification)
AMPLIFICAREA SEMNALULUI
B-DNA (branched DNA)
PCR
POLYMERASE
CHAIN
REACTION
Metoda utilizata pentru detectia ADN-ului de orice tip.
-se bazeaza pe obtinerea unui numar mare de catene
tinta prin repetatea unui nr. n de cicluri, ce contin in
principal 3 etape:
- denaturarea
- aditia primerilor la capetele secventei tinta
- extensia primerilor
DNA Strand
Supercoiled
DNA Strand
Chromosome
Double Helix
DNA Strand
PCR 1- Denaturare
Secventa tinta
Biotin
Primer 2
Primer 1
Biotin
Target Sequence
Secventa tinta
Target Amplification
1 cycle = 2 Amplicon
2 cycle = 4 Amplicon
3 cycle = 8 Amplicon
4 cycle = 16 Amplicon
No. of
Cycles
Target
No. Amplicon
Copies of
16
32
64
20
1,048,576
30
1,073,741,822
5 cycle = 32 Amplicon
6 cycle = 64 Amplicon
PCR:
Master Mix
Target DNA
Mg2+
Taq DNA
Polymerase
Mn2+
dNTP
Primers
forward primer
reverse primer
RT- PCR
Reverstranscriere + PCR
Unidirectional workflow!
Biohazard Container
Vortex Mixer
Incubator (37 0C 2 C)
Analyser Consumables/parts
D-cups
Thermal Cycler
PCR System 9600 or System 2400
DETECTIA AMPLICONULUI
Electroforeza in gel de agar, colorare
cu bromura de ethidiu si comparare
cu markeri de GM cunoscuta
Hibridizare cu sonde moleculare
marcate complementare si apoi
detectie (+/- spectrofotometrica)
Hibridizare
Avidin-horseradish peroxidase
(Av-HRP conjugate)
Biotin Tetramethylbenzidine
(TMB) Substrate
BSA
Addition
of Substrate
Microwell Plate
Hydrogen
Peroxide
Capture
Probe
Detectie
spectrofotometrica
BSA
Diagnostic molecular in
infectia HIV
DIAGNOSTIC SEROLOGIC
TESTE DE TRIAJ- sensibilitate inalta
ELISA
TESTE RAPIDE
Precizati tipul de
reactie
reprezentata
mai sus si
principiul
tehnicii.
In ce viroze
aceasta
tehnica este de
electie?