OBJASNITE STRUKTURU DNA?

DVOLANČANA UZVOJNICA – sastoji se od dvaju isprepletenih lanaca kojima je šećerno-fosfatna okosnica s

vanjske strane, dok su baze s unutarnje strane uzvojnice. Ključna značajka joj je stvaranje specifičnih parova
baza povezanih s vodikovim vezama

NACRTAJTE STRUKTURU ČETIRIJU BAZA KOJE MOGU BITI SPOJENE NA DEOKSIRIBOZU?

DEFINIRAJTE PRIMARNU STRUKTURU PROTEINA?

Redosljed aminokiselina u polipeptidnom lancu
NACRTAJTE I OBJASNITE STRUKTURU AMINOKISELINA NA OPĆOJ FORMULI AMINOKISELINE?
svaka aminokiselina sastoji se od središnjeg ugljikovog atoma
na njega su vezani – amino skupina, karboksilna skupina, vodikov atom te specifična skupina R
(bočni ogranak),

NAVEDITE TIPOVE BOČNIH OGRANAKA KOD AMINOKISELINA?

nepolarne, polarne i električki nenabijene skupine, polarne i negativno nabijene skupine, polarne i pozitivno
nabijene skupine

NACRTAJTE STRUKTURNE FORMULE NEPOLARNIH ILI HIDROFOBNIH AMINOKISELINA?

NACRTAJTE STRUKTURNE FORMULE AMINOKISELINA S ALIFATSKIM BOČNIM LANCIMA?

NACRTAJTE STRUKTURNE FORMULE AMINOKISELINE S AROMATSKIM BOČNIM PRSTENOM?

NACRTAJTE STRUKTURE POLARNIH ALI ELEKTRIČNIH NENABIJENIH AMINOKISELINA?

NACRTAJTE STRUKTURE POLARNIH I NEGATIVNO NABIJENIH AMINOKISELINA?

NACRTAJTE STRUKTURE POLARNIH I POZITIVNO NABIJENIH AMINOKISELINA?

DEFINIRAJTE POJAM ENZIMA TE KOJA JE NJIHOVA FUNKCIJA? NAPIŠITE REAKCIJU KOJU KATALIZIRA
Enzimi su katalizatori u biološkim sustavima. Gotovo svi enzimi su proteini. Enzimi su vrlo specifični, a ujedno i
jako dobri katalizatori. povećavaju brzinu reakcije

ugljicna anhidraza

NAVEDITE GLAVNU KLASIFIKACIJU ENZIMA?

Oksidoreduktaze, transferaze, hidrolaze, liaze, izomeraze, ligaze

OBJASNITE KAKO NASTAJE AKTIVNO MJESTO ENZIMA?

nabiranjem malobrojnih aminokiselinskih ostataka iz različitih dijelova primarne strukture

NAVEDITE MODELE VEZANJA SUPSTRATA NA AKTIVNO MJESTO ENZIMA?

Model kljuca i brave, model induciranog pristajanja

NAVEDITE FAKTORE KOJI UTJEČU NA ENZIMSKU AKTIVNOST?

Koncentracija enzima, Koncentracija supstrata,, Temperatura (aktivnost nekog enzima najviša je pri optimalnoj
temp), Koncentracija vodikovih iona, Optimalni pH

PRIKAŽITE OVISNOST BRZINE ENZIMSKE REAKCIJE O TEMPERATURI I ŠTO JE OPTIMALNA TEMPERATURA?

 Optimalna temperatura - temperatura pri kojoj je aktivnost
nekog enzima najviša.

NACRTAJTE STRUKTURE PURINSKIH I PIRIMIDINSKIH BAZA?

DEFINIRAJTE POJAM ATP-A I NACRTAJTE NJEGOVU STRUKTURU?

ADENOZIN TRIFOSFAT - važan nukleotid jer služi kao najčešća energijska valuta,
energija otpuštena kidanjem trifosfatne skupine iskorištava se za pogon mnogih staničnih procesa.

DEFINIRAJTE TEMPERATURU MEKŠANJA KOD MOLEKULE DNA?

definira se kao temperatura kod koje je izgubljeno pola strukture uzvojnice

OBJASNITE SINTEZU RNA?

u nekoliko aspekata nalikuje sintezi DNA, Mehanizam produljenja lanca je sličan: 3´-OH skupina na kraju
rastućeg lanca nukleofilno napada unutarnji fosfat dolazećeg nukleozid –trifosfata, Sintezu pokreće hidroliza
pirofosfata - RNA polimeraza ne zahtjeva početnicu. RNA polimeraza ne može izrezati krivo ugrađene
nukleotide.

NAPIŠITE OPĆU REAKCIJU KATABOLIZMA?

NAPIŠITE OPĆU REAKCIJU ANABOLIZMA?

NACRTAJTE STRUKTURU ADP-A?

NACRTAJTE STRUKTURU AMP-A?

PRIKAŽITE FORMULAMA KAKO MG2+ STABILIZIRA STRUKTURU ATP-A ODNOSNO ADP-A?

NAVEDITE I NACRTAJTE KOJI SPOJEVI U BIOLOŠKIM SUSTAVIMA IMAJU VIŠI POTENCIJAL PRIJENOSA
FOSFORILNIH SKUPINA NEGO ATP?

GDJE SE ZBIVA GLIKOLIZA KOD EUKARIOTA?

U citoplazmi

NAPIŠITE/NACRTAJTE PRVIH 4 REAKCIJA GLIKOLIZE?

NAPIŠITE/NACRTAJTE 5-10 REAKCIJE GLIKOLIZE?

NAVEDITE VRSTE KEMIJSKIH REAKCIJA KOJE MOŽEMO RAZLIKOVATI U REAKCIJAMA GLIKOLIZE?

1. Razgradnju ugljikovog skeleta glukoze u piruvat
2. Fosforilaciju ADP u ATP pomoću spojeva koji imaju visoki potencijal za prijenos fosforilnih skupina,
fosforilacije na razini supstrata;
3. Prijenos hidronijevog iona (:H-) na NAD+, kako bi nastao NADH

NAPIŠITE SUMARNU REAKCIJU GLIKOLIZE?

glukoza + 2NAD+ + 2ADP + 2Pi → 2piruvata + 2NADH + 2H+ + 2ATP + 2H2O
8

NAVEDITE REAKCIJU KOJU KATALIZIRA FOSFOFRUKTOKINAZA (PFK) I NAVEDITE TIPOVE OVOG ENZIMA?
FOSFOFRUKTOKINAZA (reakcija 3) katalizira odlučujući korak u glikolizi, te kontrolira brzinu glikolize. PFK1 i
PFK2

KADA JE ENZIM FOSFOFRUKTOKINAZA (PFK) INAKTIVAN?

kada je u stanici puno ATP ili kada u stanici ima mnogo masnih kiselina
NAVEDITE KOJI ENZIM KATALIZIRA RAZGRADNJU FRUKTOZA-1,6-BISFOSFATA NA DVIJE RAZLIČITE TRIOZE?
DA LI JE REAKCIJA REVERZIBILNA?
Aldolaza. Gotovo je reverzibilna

NAPIŠITE REAKCIJU KOJU KATALIZIRA PIRUVAT-DEHIDROGENAZA?

NAVEDITE I NAPIŠITE TRI KORAKA KOJIM SE PREVODI PIRUVAT U ACETIL-KOENZIM A?

DEKARBOKSILACIJA, OKSIDACIJA, PRIJENOS NASTALE ACETILNE SKUPINE NA CoA

KOJI ENZIM KATALIZIRA ALDOLNU KONDENZACIJU OKSALOACETATA I ACETIL-KOENZIMA A? NAPIŠITE

NAVEDENU REAKCIJU?
Sintaza.

OBJASNITE STRUKTURU CITRAT-SINTAZE KOD ŽIVOTINJA, TE PRINCIP NJEZINOG DJELOVANJA?

CITRAT-SINTAZA kod sisavaca je dimer jednakih podjedinica molekulske mase 49 kDa,
Aktivno mjesto smješteno je u šupljini između velike i male domene podjedinice, blizu dodirnog područja
podjedinica,
Citrat-sintaza katalizira kondenzacijsku reakciju dovodeći supstrate blizu jedan drugome, orijentirajući ih i
polarizirajući odgovarajuće veze,
Pretvara acetil-CoA u enolni međuprodukt.

NAVEDITE KOJI ENZIM KATALIZIRA REAKCIJU IZOMERIZACIJE CITRATA U IZOCITRAT, TE NAPIŠITE NAVEDENU
REAKCIJU?
Akonitaza

OBJASNITE STRUKTURU ENZIMA AKONITAZE?

protein željezo-sumpor ili protein s nehemskim željezom (nema hem skupine),
Četiri željezova atoma vezana su u kompleks s četiri anorganska sulfida i s tri cisteinska sumporova atoma –
jedan željezov atom je slobodan za vezanje citrata preko jedne od njegovih COO- skupine i preko –OH skupine,
Klaster Fe-S sudjeluje u dehridratiranju i rehidratiranju vezanog supstrata

CIKLUS LIMUNSKE KISELINE (CLK) JE IZVOR KOJIH BIOSINTETSKIH PRETEČA?

α-ketoglutarat i oksaloacetat, sukcinil-CoA, citrat

GDJE SE PROVODI Β-OKSIDACIJA MASNIH KISELINA?

U matriksu mitohondrija

NAVEDITE PROCESE OKSIDACIJE MASNIH KISELINA?

Proces 1.: Dugolančana masna kiselina (u ovom primjeru palmitinska kiselina) se oksidira u acetilne ostatke u
obliku acetil-CoA. Proces se naziva β-oksidacija.
Proces 2.: Acetilne skupine se oksidiraju do CO2 u citratnom ciklusu.
Proces 3.: Elektroni oslobođeni u procesima 1. i 2. prenose se na O2 pomoću mitohondrijskog respiracijskog
lanca što oslobađa dovoljno energije za sintezu ATP pomoću oksidacijske fosforilacije

NAPIŠITE NIZ OD ČETIRIJU REAKCIJA KOJIMA SE RAZGRAĐUJE SVAKA ZASIĆENA MASNA KISELINA?
OKSIDACIJA FLAVIN-ADENIN-DINUKLEOTIDOM (FAD), HIDRATIRANJE, OKSIDACIJA POMOĆU NAD+,
TIOLIZOM KOENZIMOM A

NAVEDITE 1. REAKCIJE CIKLUSA UREJE?

Sinteza karbamoil fosfata – mitohondrijski proces

NAVEDITE 2. REAKCIJU CIKLUSA UREJE?

Sinteza citrulina – mitohondrijski proces

NAVEDITE 3. REAKCIJU CIKLUSA UREJE?

Sinteza argininosukcinata – citoplazmatski proces

NAVEDITE 4. REAKCIJU CIKLUSA UREJE?

Sinteza arginina i fumarata – citoplazmatski process

NAVEDITE 5. REAKCIJU CIKLUSA UREJE?

Sinteza ureje – citoplazmatski process

NAVEDITE KAKO SE MOŽE REGULIRATI CIKLUS UREJE?

Protok dušika kroz ureja ciklus varira obzirom na prehranu.
Kada je hrana meso, ugljikovi skeleti aminokiselina koriste se kao metaboličko gorivo te se zbog viška amino
skupina proizvodi mnogo ureje.
Slično se dešava prilikom dugotrajnog gladovanja jer se razgrađuju proteini mišića
a) dugoročna regulacija – regulacija brzine sinteze enzima – svih pet enzima brže se sintetizira kad životinje ili
gladuju ili se hrane isključivo proteinima.
b) kod sisavaca, karbamoil fosfat sintetazu alosterički regulira N-acetilglutamat. N-acetilglutmat sintetizira se iz
acetil CoA i glutamata.
Reakciju katalizira N-acetilglutamat sintaza pri čemu je arginin aktivator.
Na ovaj način arginin je i indirektni aktivator ciklusa ureje.