Professional Documents
Culture Documents
Fibroza Kistike & Distrofia Muskulare Duchenne (Slides)
Fibroza Kistike & Distrofia Muskulare Duchenne (Slides)
METABOLIZMIT
Trashegimi recesive
autozomike
Hartezimi dhe izolimi i gjenit te FC
▪ Lokusi i FC ne kromozomin 7q31 (1985)
• Dy lokuse marker polimorfike te ADN-se, MET dhe D7S8, ne te dy anet e lokusit
• Marker te rinj te ADN-se shume prane lokusit CF ne disekuiliber lidhje
• Mutacioni FC me nje haplotip te vecante ne 84% te rasteve
• Regjion 500 kb qe permban gjenin ne brendesi
▪ Struktura e CFTR
Proteine 1480 aa me peshe molekulare 168 kDa
www.genet.sickkids.on.ca.cftr
Roli primar i CFTR eshte te veproje si kanal i transportit te Cl-
Aktivizimi nga fosforilimi i domenit regulator R dhe lidhja e ATP-se ne domenet NBF
est
int
dominio-R
N ATP ATP
protein kinasi A C
cAMP-dipendente
Roli primar i proteines CFTR
proces vecanerisht i rendesishem ne nivelin e epiteleve pulmonare
Na+ Na+
Cl- lumeni Cl-
siperfaqja • Hap kanalin per daljen
“apikale” ne mjedisin jashteqelizor
te joneve te Cl
• Ka efekt negativ ne
absorbimin intraqelizor
te Na nga mbyllja e
kanalit epitelial te
natriumit
Efekti
reduktimi i nivelit te Cl
dhe Na intraqelizor, qe
permireson cilesine e
sekrecioneve mukoze
qelizore
Siperfaqja “bazale”
* Ne rastin e epiteleve pulmonare hollon mukusin
duke favorizuar shkembimet respiratore
Gjendra e djerses
• Ne epitelin e gjendrave te djerses transporti
i Cl- ne drejtim te kundert nga lumeni ne
qelize
Danimarka 88%
Hollanda 79%
UK 78%
Irlanda 75%
Franca 75%
USA 66%
Gjermania 65%
Polonia 55%
Italia 50%
Turqia 30%
Mutacionet ne gjenin CFTR
▪ Jane identifikuar me teper se 1500 mutacione
• missense
• frameshift
• te sitit te prerjes
• nonsens
• delecione
WT CFTR
CFTR-DF508
Korrelacioni gjenotip-fenotip
▪ FC klasike e rende
• Homozigotet per mutacionin ∆F508
• Heterozigotet e perbere me ∆F508 dhe G551D ose G542X
• Mbledhja e djerses
• Vleresimi analitik
homozigote
MM
heterozigote
NM
homozigote
NN
RDB i SHUMEFISHTE
analiza e 36 mutacioneve te Fibrozes Kistike (gjeni CFTR)
ANALIZA E NIVELIT II
12 esoni PCR dei 27 esoni 15 esoni
a 57°C a 61°C
DHPLC Sequenziamento
Ex 1,3,4,8,13,14a,15, Ex 2,5,6a,6b,7,9,10,11,
16,18,19,20,22,23 12,14b,17a,17b,21,24
DHPLC:
Kromatografia Likuide Denatyruese me Performance te Larte
1
2
3
35
TABELA ELEKTRONIKE
Paraqitja e produktit te amplifikuar te cdo sonde ne fleten elektronike
• Ne Sx te tabeles ka dy kolona
nje per vlerat e pacientit
tjetra e kontrollit
C5
58kb <
ex13
ex23
ex1
ex14
C19
ex24
C19
ex24
ex2
ex15
C12
ex3
ex16
ex1
ex4
ex17
C19
ex6
ex17
ex12
130-480bp
ex6
ex18
C1
ex7
Elektroforeza kapilare
ex5
ex19
ex8
C13
ex20
ex9
C5
ex21
ex11
C7
ex22
58kb >
Produktet e amplifikimit specifik per cdo sonde kane nje gjatesi ndermjet
C15
ex10
C1P
C17
Analiza Direkte
3 2 3 1
3 3 3 1
2 2 2 2
C5
58kb <
ex13
ex23
ex1
ex14
C19
ex24
ex14
C19
ex24
ex2
ex15
C12
ex3
Delecioni CFTR 17a-17b-18
ex16
ex1
ex4
ex17
C19
ex6
ex17
ex12
ex6
ex18
C1
ex7
ex5
ex19
ex8
C13
ex20
ex9
C5
ex21
ex11
C7
ex22
58kb >
C15
ex10
C1P
C17
NEXT generation sequencing
• Prinder te pacienteve me FC
Pacienti FC
Kerkimi i mutacioneve me te
shpeshta
2 mutacione 0 mutacione
1 mutacion i
te te
karakterizuar
karakterizuara karakterizuara
Te dhenat klinike
• Fitnesi gjenetik 0
▪ Dyfishime
Mutacionet ne gjenin e distrofines
• Ne 1/3 e rasteve mutacione te tipit kodone stop, frameshift, te siteve te
prerjes (splicing) dhe mutacione te promotorit
polimorfike intragjenike
• nese nje marker mikrosatelit lokalizohet ne regjionin e delecionit