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Smith À Âè ÇÐ 7ÆÇ 30àå (¿Â óÀÎ
Smith À Âè ÇÐ 7ÆÇ 30àå (¿Â óÀÎ
Metabolism
O R G A N I C C H EM I S TR Y
30
–
–
–
30.1▶ ATP 및 짝진 반응
30.2▶ 대사 개요
30.3▶ 대사에서 주요 산화제 및
환원제
30.4▶ β-산화에 의한 트라이아
실글리세롤의 분해 대사
30.5▶ 탄수화물의 분해 대사—
해당 작용
30.6▶ Pyruvate의 운명
30.7▶ Citric acid 회로와 ATP
생산
Samuel Borges Photography/Shutterstock
1345
30.1 ATP 및 짝진 반응
대사에 대한 자세한 논의를 시작하기 전에 아데노신 5'-삼인산(ATP)과 에너지 생산에서 ATP의 중
심 역할에 대해 배워야 한다.
O O O N O O N
O NH2 H2O O N NH2
P P P N P P
O O O O O O O
O O O O O
N 발열 N N
N
HO OH 가수 분해 HO OH
adenosine 5'-triphosphate adenosine 5'-diphosphate
ATP ADP
HPO42– + H+
흡열
인산화
2− +
H2O에 의한 ATP의 가수 분해는 아데노신 5'-이인산(ADP)과 HPO4 + H 를 생성한다. 결합
절단에서 흡수되는 것보다 결합 생성에서 더 많은 에너지가 방출되기 때문에 반응은 발열이다.
• ATP 가수 분해 과정에서 상당한 양의 에너지가 방출되기 때문에 ATP는 생물학적 계의 우수한 에너지원이다.
30.1B 짝진 반응
6.5절에서 배운 것처럼 저에너지 생성물을 생성하는 반응이 선호된다. ATP 가수 분해에서 방출된
에너지는 두 반응을 함께 결합함으로써 에너지적으로 불리한 반응을 유도하는 데 사용될 수 있다.
HO ATP ADP
2–O PO
3
O O
HO OH HO OH
문제 30.1 ATP는 ADP로부터 합성될 수 있다. 이 반응은 에너지적으로 불리하기 때문에 creatine phosphate의 creatine으
로의 가수 분해와 짝을 지어야 한다. 수평 및 곡선 화살표를 사용하여 이 반응을 쓰라.
O NH2 NH2
P O O
O N N H2N N
O H
O O
creatine phosphate creatine
30.2 대사 개요
대사는 유기체에서 일어나는 모든 화학 반응의 총합이다. 분해 대사(catabolism)는 큰 분자를 더 작
은 분자로 분해하여 종종 에너지를 방출하는 반응이다. 합성 대사(anabolism)는 작은 분자로부터
큰 분자를 합성하는 반응으로서, 종종 에너지를 흡수한다.
휘발유가 대부분의 자동차에 동력을 공급하는 연료인 것처럼, 음식은 에너지를 제공하기 위해
신체에서 대사되는 연료이다. 분해 대사는 음식의 탄수화물, 단백질, 지질을 더 작은 분자로 분해하
여 신체에 필요한 것을 공급하기 위해 에너지를 방출한다. 신체는 식사의 칼로리를 한꺼번에 사용
할 수 없다. 에너지는 에너지가 필요할 때 언제든지 신체 어느 곳에서나 사용할 수 있도록 쉽게 접근
할 수 있는 분자에 저장되어야 한다.
이 과정에는 그림 30.1에 설명된 것처럼 4단계로 구성될 수 있는 수많은 분해 대사 경로가 포함
된다.
단계 1
분해 대사는 소화로 시작된다. 트라이아실글리세롤의 에스터는 glycerol과 세 가지 지방산으로 가
그림 30.1 분해 대사의 네 단계
지질 탄수화물 단백질
단계 1
Stage hydrolysis
가수 분해 hydrolysis
가수 분해 hydrolysis
가수 분해 단계 1
음식의 분해 대사는 타액,
지방산 +
단당류 아미노산 위, 소장의 효소에 의해
glycerol 촉매되는 소화로 시작된다.
해당 작용
ATP
O
Stage
단계 2 O 단계 2
지방산 산화
아미노산 단계 1에서 생성된 지방산,
O
pyruvate 분해 대사 단당류, 아미노산은 아세틸기
(CH3CO‑)로 분해되어
조효소 A와 결합하여
아세틸 CoA를 생성한다.
O
SCoA
acetyl CoA
CO2
Stage
단계 3 ATP citric acid 단계 3
회로 Citric acid 회로에서 아세틸
CO2
CoA의 아세틸기는 CO2로
산화된다. 뉴클레오사이드
삼인산과 환원된 조효소
환원된 조효소 (30.3절)도 생성된다.
O2
단계 4
Stage 단계 4
전자전달계와 산화적 인산화
전자전달계(electron transport
chain)와 산화적 인산화는 대사
경로에서 주요 에너지 운반 분자인
+
ATP + H2O ATP를 생성한다. 산소는 H 및
전자와 결합하여 H2O를 생성한다.
• 분해 대사의 최종 결과는 생체 분자가 CO2와 H2O로 변환되어 에너지가 생산되고 ATP 분자에 저장되는 것이다.
단계 2
지방산, 단당류 및 아미노산은 조효소 A (HSCoA)에 결합된 아세틸기(CH3CO–)로 분해되어 싸이
오에스터 아세틸 CoA를 생성한다(20.16절).
O OH O O N
H H O NH2
N N P P N
S O O O O
O O
아세틸기 O O N N =
O OH SCoA
P O acetyl CoA
조효소 A로부터 O
O
O O O
+
H H 의of
loss 손실
H+ E+
– E
α SCoA SCoA SCoA
α
acetyl CoA α
친핵성 α 탄소
nucleophilic two-carbon
붉은색으로unit 표시된 from
α carbon 아세틸acetyl
CoA의CoA2-탄소
in red단위
O O O
Nu
+ SCoA
SCoA SCoA Nu
Nu
electrophilic
친전자성 two-carbon
아세틸 CoA로부터unit good leaving
좋은 이탈기
carbonyl
카보닐 carbon
탄소 from acetyl
2-탄소 단위CoA group
acetyl
아세틸 CoA
단계 3
아세틸 CoA의 아세틸기는 citric acid 회로에서 CO2로 산화된다(30.7절). 이 단계에서는 분해 대사
의 마지막 단계에 들어가는 뉴클레오사이드 삼인산과 환원된 조효소(30.3절)가 생성된다.
단계 4
+
전자전달계와 산화적 인산화는 아데노신 5'-삼인산(ATP)을 생성한다. 산소는 H 및 전자(환원된
조효소로부터)와 결합하여 물을 생성한다. 지방, 탄수화물, 단백질에서 얻은 대부분의 에너지는 이
단계에서 생성된 ATP 분자에 저장된다.
O
H2N
H O O
여기에 N
O P P O
첨가한다. N N NH2
O O O
O O
N N
HO OH HO OH
NAD+
생물학적 산화제
O
H2N
H O O
H N
기질에 H O P P O
N N NH2
기부된다. O O O
O O
N N
HO OH HO OH
NADH
생물학적 환원제
O NAD+ NADH + H+ O
O O
O O
malate
O OH dehydrogenase O O
malate oxaloacetate
+
문제 30.3 (a) Isocitrate를 NAD 로 처리하면 어떤 생성물이 생성되는가? (b) 수평 및 곡선 화살표를 사용하여 반응식을 쓰라.
(c) 이 반응을 촉매하는 효소의 가능한 이름을 쓰라.
O O
O O
O O
OH
isocitrate
N N O
OH
O O
N
P P O
HO O O O N NH2
O O
OH
N N
HO OH
FAD
biological
생물학적 oxidizing
산화제agent
O
H
N
NH
N N O
H
OH
O O
N
P P O
HO O O O N NH2
O O
OH
N N
HO OH
FADH2
biological
생물학적 reducing
환원제agent
FAD 산화는 기질과 효소에 따라 다양한 메커니즘을 따르는 것 같다. 지방산 대사의 한 단계
(30.4절)는 FAD를 사용하여 지방 아실 CoA에서 두 개의 수소를 제거하여 α,β-불포화 지방 아실
CoA를 생성하는 것이다.
O FAD FADH2 O
R β SCoA R β SCoA
α α
fatty아실
지방 acylCoA
CoA α,β-불포화 지방
α,β-unsaturated CoACoA
아실acyl
fatty
O O
O O H
H H H H O N N
1 NH 2
α + NH
R SCoA R β SCoA +
R β SCoA α
H H N N O N N O
B H α,β-unsaturated
α,β-불포화 H
fatty
지방 아실 acyl CoA
CoA enolate
엔올 음이온 H A fatty
지방 아실 acyl CoA
CoA
+ A
+ HB + FADH2
FAD
+
우리는 이제 산화에 사용할 수 있는 두 가지 조효소인 NAD 와 FAD와, 환원에 사용할 수 있는
+
두 가지 조효소인 NADH와 FADH2를 살펴보았다. 어떤 반응이 NAD /NADH를 사용하고 어떤
반응이 FAD/FADH2를 사용하여 산화 또는 환원을 수행하는지 어떻게 알 수 있을까? 다음 가이드
를 사용하면,
+
• 카보닐기와 관련된 산화환원 반응은 일반적으로 NAD /NADH를 사용한다.
• 다른 작용기의 산화환원 반응에서는 FAD/FADH2를 사용한다.
• 단계 [4]에서 전자전달계에 들어가는 각 NADH는 2.5당량의 ATP를 합성하는 데 필요한 에너지를 제공한
다.
• 각 FADH2는 1.5당량의 ATP를 합성하는 데 필요한 에너지를 제공한다.
문제 30.4 (a) FAD에 의한 지방 아실 CoA의 산화와 비슷하게, succinate가 FAD와 반응할 때 생기는 생성물을 그려라. (b) 수
평 화살표와 곡선 화살표를 사용하여 반응식을 쓰라. (c) 이 반응을 촉매하는 효소의 가능한 이름을 쓰라.
O
O
O
O
succinate
문제 30.5 메커니즘 30.1의 제거 순서는 이전 장에서 배웠던 제거 메커니즘—E2, E1, E1cB—과 어떻게 비교되는가?
문제 30.6 다음 반응을 산화 반응 또는 환원 반응으로 분류하고, 사용된 것으로 보이는 보조효소를 밝혀라. 여러분의 추론을 설명
하라.
O O
HS O
O
SH S S
30.4A 글리세롤 분해 대사
트라이아실글리세롤 가수 분해로 생성된 glycerol은 두 단계를 거쳐 dihydroxyacetone phosphate
+
로 전환된다. Glycerol의 인산화는 glycerol 3-phosphate를 생성한 다음 NAD 로 산화된다.
This –C 결합은
이 CC–C bond is cleaved.
절단된다.
O O
O
R
β α Z R +
SCoA SCoA
α
βThe
C는 β산화된다.
C is oxidized. acetyl CoA
Z = OH fatty acid
지방산
Z = SCoA fatty
지방 아실 acyl CoA
CoA
+ HSCoA
R OH R SCoA
fatty
지방산 acid fatty
지방 아실 acyl CoA
O FAD FADH2 O H2 O
1 2 OH O
R SCoA R SCoA
conjugate R SCoA
oxidation
산화 α,β-unsaturated
α,β-불포화
콘쥬게이션
fatty
지방 아실 acyl CoA
CoA
addition
첨가 β-hydroxy acyl
β-하이드록시 아실CoA
CoA
acyl
아실 CoA
NAD+
oxidation
산화 3
NADH
HSCoA
O O O O
4
+
R SCoA SCoA reverse Claisen R SCoA
역 Claisen
fatty
C가 acyl CoA
2개 적은 acetyl
아세틸 CoACoA reaction
반응
β-keto
β-케토 아실acyl CoA
CoA
with
지방 two
아실fewer
CoAC's
• FAD를 사용한 지방 아실 CoA의 산화(단계 [1])에 이어 H2O의 콘쥬게이션 첨가(단계 [2])는 β-하이드록시 아실 CoA를 생성한다. OH기를 카보닐로 산
화(단계 [3])한 후 Claisen 반응을 역으로 수행(단계 [4])하면 두 가지 생성물, 즉 아세틸 CoA와 초기 기질보다 탄소 수가 2개 적은 지방 아실 CoA가 생
성된다. 이 과정은 지방 아실 CoA의 모든 탄소가 아세틸 CoA로 분해될 때까지 반복된다. 이러한 반응은 이 교재의 본문에서 더 자세히 논의된다.
β-산화의 단계 1 과 단계 2
지방산 분해 대사의 첫 번째 단계는 아실 CoA 탈수소효소를 사용하여 지방 아실 CoA의 FAD-매개
산화를 통해 α,β-불포화 아실 CoA와 FADH2를 생성하는 것이다. 이 반응은 메커니즘 30.1에 나타
난 메커니즘에 의해 α 및 β 탄소에서 카보닐기로 H 원자를 제거한다.
단계 [2]에서 enoyl CoA hydratase 효소를 사용하여 α,β-불포화 아실 CoA에 물을 콘쥬게이션
첨가하면 β-하이드록시 아실 CoA가 생성된다. 물은 이중 결합의 친전자성 β 탄소에 추가되고, 중간
체 엔올 음이온은 α 탄소에서 양성자 첨가된다.
A H OH
O OH O OH O
β
α
R SCoA R S SCoA + A
R SCoA
H
α,β-unsaturated
α,β-불포화
H A β-hydroxy acyl
β-하이드록시 아실CoA
CoA
acyl
아실 CoA
β-산화의 단계 3 과 단계 4
+
단계 [3]에서는 탈수소효소에 의해 β-하이드록시 아실 CoA의 OH기가 NAD 에 의해 산화되어 β-
+
케토 아실 CoA와 NADH가 생성된다. NAD 산화 메커니즘은 12.14절에 나와 있다.
지방산 분해 대사의 마지막 단계에서는 22장(메커니즘 22.5)에서 배운 Claisen 축합의 역반응
으로 탄소‑탄소 결합이 절단된다. 메커니즘 30.2에 표시된 것처럼 조효소 A (HSCoA)의 친핵성
싸이올기를 추가하는 것이 핵심 특징이다.
H A
O O O O O O O
1 2 3
R SCoA R SCoA +
R SCoA SCoA SCoA
SCoA 붉은색으로
표시한 C–C C가 2개 적은 resonance-stabilized
공명안정화된 acetyl
아세틸CoACoA
A H SCoA + HA 결합을 절단한다 지방 아실 CoA enolate
엔올 음이온 + A
H2O
O HSCoA O O
+ FAD + + FADH2
R SCoA R SCoA SCoA
+ NAD+ + NADH + H+
fatty
지방 아실acyl CoA β-산화의 C가 2개 적은 acetyl
아세틸 CoA
전반적인 과정 지방 아실 CoA
O
붉은색으로 표시된 모든 결합은
OH 각 β-산화 회로마다 하나씩 끊어진다.
myristic acid
SCoA
C
C1414 acyl
아실 CoA
β-oxidation
β-산화
O O
+
SCoA SCoA
C12 acyl CoA
12 아실
acetyl
아세틸 CoA
O
4 cycles
β-산화의of
β-oxidation
4회 회로 4
SCoA
acyl CoA
C44 아실 CoA acetyl
아세틸 CoA
Myristic acid는 육두구나무 Myris-
tica fragrans의 씨앗에서 얻은 향신 β-oxidation
β-산화
료인 육두구에서 추출된 트라이아실글
리세롤의 주성분이다. Myristic acid O
는 야자핵기름과 코코넛 오일에서도
2
발견된다. NationalGeographic Image SCoA
Collection/Alamy Stock Photo acetyl
아세틸 CoA
결과적으로:
• 14개 탄소로 구성된 지방 아실 CoA는 2개 탄소로 구성된 아세틸 CoA 분자 7개로 분해된다.
• Myristic acid의 탄소‑탄소 결합 6개를 절단하려면 총 6회의 β-산화 회로가 필요하다.
Lauric acid [CH3(CH2)10CO2H]의 경우: (a) 완전 산화로 인해 몇 개의 아세틸 CoA 분자가 생성되는가? (b) 몇 번의
β-산화 회로가 필요한가? (c) 몇 개의 NADH와 FADH2 분자가 생성되는가?
풀이
• 아세틸 CoA의 분자 수는 원래 지방산에 있는 탄소 수의 절반과 같다.
• 최종 β-산화 회로에서는 2개의 아세틸 CoA 분자가 생성되므로 회로 수는 생성된 아세틸 CoA 분자의 수보다 하
나 적다.
• 각 회로마다 NADH 분자 한 개와 FADH2 분자 한 개가 생성되므로 회로의 수는 생성된 NADH 및 FADH2 분자
수와 같다.
Lauric acid의 12개 탄소는 5회로의 β-산화를 통해 6개의 아세틸 CoA 분자를 생성한다. NADH와 FADH2도 각각 5
개의 분자가 생긴다.
O
O
OH 6 + 5 NADH + 5 FADH2
SCoA
lauric acid
Bonds 표시된
붉은색으로 in red are
결합이 cleaved.
끊어진다.
문제 30.7 각 지방산에 대해 (a) 완전 산화로 인해 몇 개의 아세틸 CoA 분자가 생성되는가? (b) β-산화에는 몇 번의 회로가 필요
한가?
O
O
OH
OH
OH
O
O 10 steps
10단계
HO OH 2 O
해당 작용
O
HO OH
pyruvate
glucose
그림 30.3 OH OPO32–
해당 작용 단계 [1]−[5] OPO32–
ATP ADP
O O O OH
1 2
HO OH HO OH OH
phosphorylation
인산화 isomerization
이성질화
HO OH
HO OH HO OH
glucose fructose
glucose 6-phosphate
6-phosphate
ATP
phosphorylation
인산화 3
ADP
O OPO32–
OPO32–
1
5 2 4 6 O
2–O 6 + 2–O 1
3PO H 3PO OH
4 3 5 2 OH
retro-aldol
역-알돌 반응 4 3
OH O
glyceraldehyde dihydroxyacetone HO OH
3-phosphate phosphate
fructose
5 1,6-bisphosphate
isomerization
이성질화
• 해당 작용의 [1]−[5] 단계는 glucose를 두 분자의 glyceraldehyde 3-phosphate로 전환한다. 단계 [1]과 [3]은 ATP를 사
용한 인산화를 포함하는 반면, 단계 [2]와 [5]는 이성질화를 포함한다. 핵심 단계는 6-탄소 기질을 두 개의 3-탄소 생성물로
분해하는 단계 [4]의 역‑알돌 반응이다. 반응에서 변화된 기질의 원자는 회색으로 강조 표시되어 있다.
O OH 케토‑엔올
keto–enol OH
H H A
HO 토토머화
HO OH H A HO OH
1 O
HO OH HO H OH HO O H B
enediol
엔다이올
glucose 6-phosphate B
B
acyclic
비고리형 form of
glucose 6-phosphate enol–keto
엔올‑케토
tautomerization
토토머화
A
OPO32–
OPO3 2–
O OH OH
OH HO OH
2
HO OH
HO O
fructose 6-phosphate acyclic
비고리형 form of
D fructose 6-phosphate
C
문제 30.9 ATP의 구조를 그리고 곡선 화살표를 사용하여 해당 작용의 [1]단계에서 glucose가 어떻게 ATP와 반응하여 glucose
6-phosphate와 ADP를 생성하는지 보여라.
OPO32–
OPO3 2– OPO32–
OPO32– B
O H OH 역-
retro- OH OPO32–
OH O 4 OPO32– aldol
알돌 3
4 3 O 4 + HO 3 OPO32–
HO OH
3 H HO O H B 엔올‑케토 O
HO O H A 토토머화
glyceraldehyde H A F dihydroxyacetone
This bond is
이 결합이 cleaved.
끊어진다. fructose 1,6-bisphosphate의
acyclic form of phosphate
fructose 1,6-bisphosphate 3-phosphate
비고리형 구조
fructose
1,6-bisphosphate E
해당 작용의 단계 5 : 이성질화
Glyceraldehyde 3-phosphate와 dihydroxyacetone phosphate는 모두 해당 작용의 단계 [4]에서 생
성되지만, glyceraldehyde 3-phosphate만이 계속해서 pyruvate를 생성한다.
결과적으로, dihydroxyacetone phosphate는 triose phosphate isomerase에 의해 이성질화되
어 glyceraldehyde 3-phosphate의 두 번째 분자를 생성한다. 이 반응은 엔다이올 중간체를 통해 일
어나며 두 번의 토토머화를 포함한다.
H B
O
B
2–O
H
2–O PO
3PO OH O 2–O
keto–enol
케토‑엔올
3 3PO H
enol–keto
엔올‑케토
O tautomerization
토토머화 OH tautomerization OH
H A 토토머화
H A enediol glyceraldehyde
3-phosphate
dihydroxyacetone
phosphate
문제 30.10 각 화합물 쌍은 어떻게 연관되어 있는가? (a) glucose 6-phosphate 및 fructose 6-phosphate; (b) glyceralde-
hyde 3-phosphate 및 dihydroxyacetone phosphate; (c) glyceraldehyde 3-phosphate 및 enediol F. 서
로의 거울상 이성질체, 부분 입체 이성질체, 구조 이성질체 또는 이성질체 아님 중에서 선택하라.
그림 30.4 해당 작용 단계 [6]−[10]
HPO42– +
O NAD + NADH + H + O ADP ATP O
6 7
2–O 2–O PO
3PO H 3 OPO32– 2–O PO
3 O
oxidation,
산화,
OH phosphorylation
인산화 OH OH
glyceraldehyde
1,3-bisphosphoglycerate 3-phosphoglycerate
3-phosphate
이성질화
isomerization 8
ATP ADP O O
O
10 9
O HO O
O
2–O dehydration
탈수 OPO3 2–
O 3PO
O O O
2–O
P O 2–O
3PO O 3PO O
O
OH O O N OH
1,3-bisphosphoglycerate O N NH2
P P 3-phosphoglycerate
O O O
+ O O +
N N
HO OH O O O N
ADP P O N NH2
P P
O O O O
O O O
N N
HO OH
ATP
해당 작용의 단계 8 와 단계 9 : 이성질화와 탈수
O O 단계 [8]에서, 3-phosphoglycerate
O
2–O 는 phosphoglycerate mutase에 의
3PO O 2–O
3PO O HO O
OH OPO32–
하여 촉매화되어, 2-phosphoglycer-
OPO32–
3-phosphoglycerate 2,3-bisphosphoglycerate 2-phosphoglycerate
ate로 이성질화된다. 이 반응은 단순
히 C3에서 C2로 인산기가 이동하는
것이 아니다. 대신, 3-phosphoglycerate는 2,3-bisphosphoglycerate로 전환되고 그 다음에 C3에서
2−
PO3 를 잃고 2-phosphoglycerate를 생성한다.
O O
O 2-phosphoglycerate는 enolase
HO O HO O 를 사용하여 phosphoenolpyruvate
O + H2O
H OPO32– OPO32– 2–O 로 탈수된다. 탈수는 엔올 음이온
3PO
B enolate
phosphoenolpyruvate 중간체가 형성되는 2단계 E1cB 메
2-phosphoglycerate
H A
커니즘(메커니즘 22.3)을 따른다.
전체적인 결과는 물이 손실되어 엔올 인산염(enol phosphate)이기도 한 α,β-불포화 카보닐 화합물
을 생성하는 것이다.
해당 작용의 단계 10 : 인산염 전달
2−
Phosphoenolpyruvate가 ADP로 PO3 를 전달하여 ATP와 pyruvate가 생성되면 해당 작용이 완료
된다. 이 반응은 pyruvate kinase에 의해 촉매된다.
O O
H A O O N
O
P O N NH2
phosphoenol- O O + P P
O O O O O
pyruvate O O O O
O P O N
N
pyruvate HO OH
O
ATP
O O N
O N NH2
P P
O O O
O O
N N
HO OH
ADP
OH
2 ADP 2 ATP O
O
HO OH + 2 NAD + 2 O + 2 NADH + 2 H+
해당 작용의 O
HO OH 전반적인 과정
glucose pyruvate
문제 30.11 1,3-Bisphosphoglycerate에는 두 인산염기가 있음에도 불구하고 ADP는 해당 작용의 단계 [7]에서 표시된 위치에
서만 반응한다. 이 특이성에 대하여 설명하라.
O O O
O P P O ADP reacts
ADP는 여기에서 here.
반응한다.
O O
O O
OH
1,3-bisphosphoglycerate
문제 30.12 해당 작용의 다음 중간체 각각에 대해 어떤 C 원자가 glucose의 C6와 상관관계가 있는지 표시하라: (a) fructose
6-phosphate; (b) glyceraldehyde 3-phosphate; (c) 2-phosphoglycerate.
30.6 Pyruvate의 운명
Pyruvate는 해당 작용의 최종 산물이지만 glucose 대사의 최종 산물은 아니다. Pyruvate에 일어나
는 일은 기존 조건과 유기체에 따라 다르다. 세 가지 생성물이 가능하다.
O O O
O SCoA or O or OH
O OH
acetyl CoA ethanol
pyruvate lactate
[호기성(aerobic)
(formed under [혐기성(anaerobic)
(formed under (발효
(formed
과정에서in
aerobic
조건에서 conditions)
생성됨] anaerobic
조건에서conditions)
생성됨] fermentation)
생성됨)
O NAD + NADH + H + O
문제 30.13 Pyruvate가 아세틸 CoA로 전환될 때 glucose의 어떤 탄소가 CO2 탄소로 변하는가?
O O NADH + H + NAD +
O H OH
pyruvate alcohol
O decarboxylase + dehydrogenase ethanol
pyruvate CO2
OH
2 ADP 2 ATP
O
HO OH 2 OH + 2 CO2
발효 ethanol
HO OH
glucose
+
문제 30.14 두 과정에서 조효소 NADH와 NAD 의 역할을 비교하라: (a) pyruvate → acetyl CoA; (b) pyru-
vate → lactate.
발효는 빵, 맥주, 치즈 생산에 핵심적인
역할을 한다.
Antony Lynn-Hill/Shutterstock 문제 30.15 혈액 공급이 제한된 각막에서 pyruvate는 어떻게 대사될 수 있는가?
O
8단계
2 CO2 + HSCoA
SCoA
citric acid 회로
acetyl
아세틸 CoA
Citric acid 회로는 트라이카복실산 그림 30.5는 citric acid 회로의 8단계를 보여준다. 모든 중간체는 다이카복실산과 트라이카복
회로(tricarboxylic acid cycle) 또 실산에서 파생된 카복실산 음이온이다. Citric acid 회로의 주요 특징은 다음과 같다.
는 1937년에 이러한 반응의 세부사항
을 연구한 독일 화학자이고 노벨상 수
상자인 Hans Krebs의 이름을 따서 • Citric acid 회로는 아세틸 CoA가 oxaloacetate와 반응하여 단계 [1]에서 6-탄소 생성물을 생성할 때 시
Krebs 회로라고도 한다. 작된다.
• 단계 [3]과 [4]에서 두 개의 탄소가 CO2로 손실된다.
• 4개의 환원된 조효소(NADH 및 FADH2) 분자가 단계 [3], [4], [6] 및 [8]에서 생성된다. 환원된 조효소는
전자전달계에 들어가 궁극적으로 많은 양의 ATP를 생성한다.
• ATP와 유사한 뉴클레오사이드 삼인산인 GTP 한 분자가 단계 [5]에서 합성된다.
SCoA HSCoA
O O O
1 O HO
O OO
O
NADH + H + H2O 알돌 O O
oxaloacetate O
citrate
8 2
NAD +
산화
이성질화 O O
O O O
O
O O O
O OH OH
malate isocitrate
첨가 산화
7 NAD +
H2O 탈카복실화
3
CO2 NADH + H +
O
O 탈카복실화, O O
O 산화,
O fumarate 싸이오에스터 생성 O O
HSCoA
산화 O
가수 분해,
CO2 α-ketoglutarate
FADH2 6 인산화
O 4 NAD +
O
FAD HSCoA HPO42–
O CoAS NADH + H +
O O
O succinate 5 O
GTP GDP
succinyl CoA
• Citric acid 회로는 oxaloacetate에 아세틸 CoA가 첨가하면서 시작되어 8단계 후에 oxaloacetate가 재생될 때 끝난다.
• 회로가 한 바뀌 돌 때마다 CO2 분자 2개, 환원된 조효소 분자 4개(NADH 3개 + FADH2 1개), GTP 1개가 생성된다.
• 각 단계에서 반응하는 탄소는 회색으로 강조 표시되어 있다.
• 각 단계는 효소에 의해 촉매된다: [1] citrate synthase; [2] aconitase; [3] isocitrate dehydrogenase; [4] α-ketoglutarate dehydrogenase; [5] succinyl CoA
synthetase; [6] succinate dehydrogenase; [7] fumarase; 그리고 [8] malate dehydrogenase.
H A
O O
O
O
+ O
H A
H B O H2O HSCoA
O O O
O HO OO O HO OO
B H
SCoA tautomerization
토토머화 SCoA aldol
알돌 O SCoA hydrolysis
가수 분해
reaction
반응 O O
acetyl CoA
아세틸 nucleophilic
친핵성 엔올enol (S)-citryl CoA citrate
새로운 –C 결합(붉은색)
newCC–C bond in red
O O O O O
O O O O
O HO OO – H 2O H2O
O O O O O O
OH
citrate cis-aconitate (2R,3S)-isocitrate
O O O O
NAD+ NADH + H + O O CO2
O O O O O O
β
O α O
O O oxidation
산화 O O O O
decarboxylation
탈카복실화
OH O H A O
O
isocitrate β-keto
β-케토 carboxylate
카복실산 enolate
엔올 음이온 α-ketoglutarate
이 단계는 탄소‑탄소 결합을 절단하여 5개의 탄소로 구성된 중간체를 생성하고 CO2 1몰을 생
성한다.
O O NAD+ NADH + H+ O
H2O
O O O
O O O
conjugate
콘쥬게이션 oxidation
산화
O addition
첨가 O OH O O
fumarate (S)-malate oxaloacetate
문제 30.17 Citric acid 회로의 단계 [2]에서 citrate를 cis-아코니트산으로 전환시키는 E1cB 메커니즘의 단계를 쓰라.
문제 30.18 Citric acid 회로의 속도는 신체의 에너지 요구량에 따라 달라진다. 이 회로는 각 상황에서 활성화될까, 아니면 억제될
까?: (a) 높은 에너지 수요; (b) 높은 NADH 농도; (c) ATP 공급이 부족.
2 H2O
O HPO42– HSCoA
+ 3 NAD+ + 3 NADH + 3 H+
SCoA + GDP 2 CO2 + GTP
+ FAD + FADH2
acetyl CoA
아세틸 citric acid 회로 내쉬는 에너지원
가스 전자전달계에 들어가는
환원된 조효소
• Citric acid 회로의 주요 기능은 전자전달계에 들어가 궁극적으로 ATP를 생성하는 환원된 조효소를 생성
하는 것이다.
30.3절에서 우리는 전자가 풍부한 환원된 조효소의 전자가 ADP에서 ATP를 합성하는 데 에너
지를 제공한다는 것을 배웠다.
• 단계 [4]에서 전자전달계에 들어가는 각 NADH는 2.5당량의 ATP를 합성하는 데 필요한 에너지를 제공한다.
• 각 FADH2는 1.5당량의 ATP를 합성하는 데 필요한 에너지를 제공한다.
• Citric acid 회로에 들어가는 각 아세틸 CoA의 완전한 분해 대사는 10개의 ATP 분자가 합성되는 결과를 준다.
문제 30.19 Citric acid 회로에서 어떤 반응이 (a) CO2를 제거하는가; (b) 탄소‑탄소 결합을 생성하는가; (c) 탄소‑탄소 σ 결합을
깨는가; (d) 유기 기질을 산화시키는가?
1 O O 3
O 해당 작용 2 citric acid 회로
HO OH 2 2 4 CO2
O SCoA +
O acetyl CoA 6 NADH 2 FADH2
2 NADH 2 NADH 2 GTP
HO OH pyruvate +
glucose + 2 CO2 전체 ATP
Total yield==
ATP 수율
5 ATP 2 ATP 5 ATP 15 ATP 3 ATP 2 ATP 32 ATP
각 경로에서 생성된 ATP를 더하면 각 glucose 분자의 완전한 분해 대사에서 총 32개의 ATP
분자가 생성된다. Glucose 대사로 생성된 대부분의 ATP는 Citric acid 회로와 분해 대사의 단계 [4]
에서 나온다.
문제 30.20 각 변환에서 생성되는 ATP의 양은 얼마인가 (a) glucose → 2 아세틸 CoA; (b) 2 pyruvate → 6 CO2?
문제 30.21 Glucose가 CO2로 전환하는 호기적 산화와 glucose가 lactate로 전환되는 혐기성 변환 사이에서 ATP 생성의 차이
는 무엇인가?
예를 들어, 예제 30.1에서 우리는 lauric acid (C12H24O2)의 완전한 분해 대사로 6개의 아세틸
CoA, 5개의 NADH, 5개의 FADH2가 생성된다는 것을 확인하였다. 예제 30.2는 이 데이터를 사용
하여 lauric acid에서 얻어지는 ATP의 양을 결정한다.
O
O
OH 6 + 5 NADH + 5 FADH2
SCoA
lauric acid
붉은색으로
Bonds in표시된 결합이
red are 끊어진다.
cleaved.
풀이
각 작업에서 사용되거나 생성된 ATP를 합산한다.
• Lauric acid를 아실 CoA (C11H23COSCoA)로 전환하려면 2 ATP에 해당하는 에너지가 필요하므로 최종 결과
는 −2 ATP이다.
• 분해 대사의 단계 [4] 이후 환원된 조효소로부터 생성된 ATP를 결정한다.
환원된 조효소로부터
문제 30.22 Stearic acid (C18H36O2)의 완전한 분해 대사로 생성된 ATP 분자의 수를 계산하라.
Chapter 30 복습
핵심 개념
[1] 대사의 주요 유기 성분(30.1-30.3)
+
1 조효소 A 및 아세틸 CoA (30.2) 2 ATP 및 ADP (30.1) 3 NAD /NADH 및 FAD/FADH2 (30.3)
+
• 조효소 A (HSCoA)는 아세틸기와 결합하여 아세틸 • ATP와 ADP의 상호 변환은 세포 내 에너지 전달 • NAD 와 FAD는 생물학적 산화제이다.
CoA (CH3COSCoA)를 생성하는 친핵성 싸이올이다. 의 핵심 방법이다. • NADH와 FADH2는 생물학적 환원제이다.
• 아세틸 CoA는 지질, 탄수화물 및 아미노산의 분해 대 • ATP가 ADP로 가수 분해되면 에너지 입력이 필 • 카보닐기와 관련된 산화환원 반응은 일반적으로
+
사 단계 [2]의 산물인 싸이오에스터(thioester)이다. 요한 반응을 유도하는 데 사용할 수 있는 에너지를 NAD /NADH를 사용한다.
• 아세틸 CoA의 α 탄소는 α H가 제거되면 친핵체가 된 방출한다. • 다른 작용기의 산화환원 반응은 FAD와 FADH2를
다. • ATP는 에너지 입력이 필요한 인산화 반응을 통해 사용한다.
• 아세틸 CoA는 좋은 이탈기가 있으므로 친핵성 아실 ADP에서 합성된다. • 분해 대사의 단계 [4]에 들어가는 각 NADH는 2.5
치환을 수행한다. • 지질, 탄수화물, 단백질에서 얻은 대부분의 에너지 ATP를 합성하는 에너지를 제공한다.
• 아세틸 CoA의 아세틸기는 citric acid 회로에서 CO2 는 분해 대사의 단계 [4]에서 생성된 ATP 분자에 • 분해 대사의 단계 [4]에 들어가는 각 FADH2는 1.5
로 산화된다(30.7). 포장되어 있다. ATP를 합성하는 에너지를 제공한다.
H2O
O HSCoA O O
+ FAD + + FADH2
R SCoA R SCoA SCoA
+ NAD+ acetyl + NADH + H+
fatty
지방 아실 acyl CoA
CoA β-산화의 fatty
C가 두acyl CoA
개 줄어든 아세틸 CoA
한 회로 with
지방 two fewer
아실 CoAC's
• β-산화의 각 4단계 순서는 아세틸 CoA, FADH2 및 NADH 각각의 한 분자를 생성한다.
2 해당 작용(30.5)
OH
2 ADP 2 ATP O
O
HO OH + 2 NAD+ 2 O + 2 NADH + 2 H+
해당 작용의 O
HO OH 전반적인 과정
pyruvate
glucose
O SCoA O OH
pyruvate pyruvate alcohol
O acetyl
아세틸 CoA O decarboxylase dehydrogenase
dehydrogenase ethanol
pyruvate
complex pyruvate
+ CO2 + CO2
+ HSCoA
O NADH + H+ NAD+ O
O O
lactate
O OH
dehydrogenase
pyruvate lactate
2 H2O
O HPO42– HSCoA
+ 3 NAD+ + 3 NADH + 3 H +
SCoA + GDP 2 CO2 + GTP
+ FAD + FADH 2
acetyl
아세틸 CoA citric acid 회로 내쉰 에너지
가스 원
• Citric acid 회로는 CO2 분자 2개, GTP 분자 1개, 그리고 분해 대사의 단계 [4]에 들어가 궁극적으로 많은 양의 ATP를 생성하는 환원된 조효소 분자 4개를 생성하는
8단계 순환 경로이다.
핵심 기법
[1] 지방산의 β-산화 생성물 결정(30.4); 예: 데칸산(decanoic acid) (C9H19CO2H)
• 아세틸 CoA의 분자 수는 지방산의 C 수의 절반이다. • β-산화의 회로 수는 아세틸 CoA 분자의 수보다 하나 더 적다.
• 회로 수는 생성된 NADH 및 FADH2 분자 수와 같다.
O
4 NADH + 4 FADH2
C10H20O2 5
SCoA
acetyl
아세틸 CoA
1 지방 아실 CoA를 생성하는 데 사용된 ATP를 2 환원된 조효소에서 생성되는 ATP를 결정한다. 3 각 아세틸 CoA로부터 생기는 ATP의 양을 결
결정한다. 정하고 결과를 합산한다.
• 아실 CoA를 생성하려면 2 ATP에 해당하는 에너지 • β-산화는 4 NADH와 4 FADH2를 생성한다. • Citric acid 회로의 각 회로는 10 ATP를 생성한다.
가 필요하다. • 10-C 지방산에서 5개의 아세틸 CoA 분자가 생성된
4 NADH x 2.5 ATP/NADH = 10 ATPs 다.
C10H20O2 4 NADH
C9H19COSCoA x NADH
4 2.52ATP/NADH
4 FADH x 1.5 = 10 2ATPs
ATP/FADH
x 2.5 ATP/NADH = =6 10
ATPs
ATPs 5 acetyl CoA x 10 ATP/acetyl CoA = 50 ATPs
C10H20O2C H O –2 ATPC9H19COSCoA 4 FADH 4 x FADH
1.5 ATP/FADH 2 = 6 ATPs 5 acetyl CoA
6 ATPs x 10CoA
ATP/acetyl CoA = 50 ATPs
10 20 2 C9H19COSCoA 2From 2 x 1.5조효소로부터:
reduced
환원된 ATP/FADH
coenzymes: = ATPs
2 16 5 acetyl x 10 ATP/acetyl CoA = 50 ATPs
–2 ATP –2 ATP From reduced coenzymes: 16 ATPs
From reduced coenzymes: 16 ATPs
• 총 ATP 생산량: (−2) + 16 + 50 = 64 ATPs.
문제
삼차원 모형을 이용하는 문제
30.23 (a) 공‑막대 모형으로 표시된 palmitic acid의 완전한 분해 대사에 의해 생성되는 ATP 분자 수를 계산하라. (b) Palmitic acid가 완전히 분해되면
몇 개의 CO2 분자가 생성되는가?
palmitic acid
30.24 (a) 해당 작용 동안 A를 생성하는 화합물은 무엇인가? (b) 해당 작용 동안 A로부터 어떤 생성물이 생성되는가? (c) Glucose의 C3에 해당하는 A의 탄
소는 어느 것인가?
− −
산화 및 환원 반응
+
30.26 6-Hydroxyheptan-2-one이 다음 조효소로 처리될 때 생성될 수 있는 생성물을 그려라: (a) NAD ; (b) FAD; (c) NADH.
OH O
6-hydroxyheptan-2-one
대사 경로
30.27 각각의 지방산 A와 B에 대해: (a) 완전 산화로 인해 몇 개의 아세틸 CoA 분자가 생성되는가? (b) 몇 번의 β-산화 회로가 필요한가? (c) 몇 개의
NADH와 FADH2 분자가 생성되는가?
CH3(CH2)20CO2H CH3(CH2)28CO2H
A B
30.28 (a) 주어진 트라이아실글리세롤에서 유래된 지방산의 완전한 분해 대사로 생성되는 아세틸 CoA 분자 수는 몇 개인가? (b) 몇 번의 β-산화 회로가 필요
한가?
O
O
O
O O
OH
O O
O O
HO OH a. HO b. c.
O O SCoA
H OPO32– OH
HO OH
glucose
30.30 Glucose는 6개의 CO2 분자로 완전히 분해된다. 각각의 CO2 분자를 생성하는 구체적인 반응은 무엇인가?
30.31 Glucose가 발효 과정에서 ethanol로 전환할 때와 비교하여 glucose가 CO2로 전환할 때 생성되는 ATP의 양은 어떠한 차이가 있는가?
30.33 (a) Glucose가 CO2로 분해될 때 ATP(또는 GTP)를 직접 생성하는 반응은 무엇인가? (b) Glucose 한 분자당 직접적으로 몇 개의 ATP 분자가 생성
되는가? (c) 이 값을 분해 대사에서 생성된 환원된 조효소가 전자전달계와 산화적 인산화로부터 ATP를 생성하는 양과 비교하라. Glucose가 대사될
때 대부분의 ATP는 어디에서 나오는가?
30.34 Citric acid 회로의 단계 [3]에서 oxalosuccinate는 탈카복실화되어 α-ketoglutarate로 전환된다. Oxalosuccinate에 제거될 수 있는 세 가지 다
른 카복시기가 있을 때 특정 카복시기가 CO2로 떨어지는 이유는 무엇인가?
O O
O O O O
O O O O
O O
oxalosuccinate α-ketoglutarate
O
O
OH
OH
A
B
30.37 완전히 분해 대사될 때 각 화합물의 탄소당 생성되는 ATP 분자의 수를 결정하여 glucose와 stearic acid의 에너지 함량을 비교하라. 이러한 데이터
에 따르면 지질이 탄수화물보다 더 효과적인 에너지 저장 분자인가?
메커니즘
O O
30.39 30.7절에서 우리는 아세틸 CoA와 oxaloacetate의 반응이 citric acid 회로의 첫 번째 단계에서 citric acid를 생성한다는 것을 배웠다. 이 두 가지
출발물의 또 다른 가능한 반응은 X를 생성할 수 있다(이 반응은 일어나지 않음). 이 반응에 대한 단계적 메커니즘을 그려라.
O O O
O O
+ O
O
SCoA O
O
acetyl CoA O O O
oxaloacetate
X
30.40 지방산 생합성의 한 단계는 아세틸 CoA와 말로닐 CoA의 반응으로 아세토아세틸 CoA를 생성하는 것이다. 이 과정에 대한 단계별 메커니즘을 그려라.
O O O O O
+ + CO2
SCoA O SCoA SCoA
30.41 Citric acid 회로의 단계 [2]에서 cis-아코니트산을 isocitrate로 전환시키는 콘쥬게이션 첨가 반응의 단계별 메커니즘을 그려라.
도전 문제
O
O
O
O O
30.43 만노스(mannose)는 크랜베리와 건포도 같은 과일을 통해 섭취되는 단당류이다. 만노스의 분해 대사는 mannose 6-phosphate가 해당 작용의 중
간체인 fructose 6-phosphate로 전환되어 일어난다. 이 과정에 대한 단계별 메커니즘을 그려라.
OH OPO32–
OPO32–
O O O OH
HO OH HO OH OH
HO OH HO OH
HO OH
30.44 수용성 염기가 존재하면 프룩토스는 단당류 A와 B를 생성할 수 있는데, 둘 다 6개의 탄소로 이루어진 골격의 C3에 카보닐기가 있다. 이 과정에 대한
단계별 메커니즘을 그려라.
HO
O OH –OH O OH O OH
OH OH OH
+
H2O HO 3 HO 3
HO OH OH OH OH OH
fructose A B
자가-시험 해답
1. d 2. a 3. c 4. c 5. a 6. b 7. b 8. c