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CH5例習題
CH5例習題
1 生物催化劑──酵素 169
飲食中的維生素是許多酵素輔酶的前驅物,例如維生素 B1(thiamine)是硫胺素焦
磷酸(TPP)的前驅物,硫胺素焦磷酸是丙酮酸去氫酶複合體(pyruvate dehydrogenase
complex)的輔酶之一。因為高等生物無法自行合成維生素,所以飲食中所攝取的維生素,
對生物體的生長及發育相當重要,表 5.3 列出常見的輔酶及其相關維生素的種類,與缺乏
時所衍生的病症。相較於對衍生自水溶性維生素相關輔酶的瞭解,脂溶性維生素在輔酶功
能上所扮演的角色,目前並不清楚。
表 5.3 維生素衍生的相關輔酶種類及其反應類型與維生素缺乏症狀
維生素 相關輔酶 輔酶反應類型 缺乏症狀
硫胺素(維生素 B1) 硫胺素焦磷酸(TPP) 去羧反應 腳氣病
[thiamine (vitamin B1)]
例題 5.1
關於酶之活性部位與受質的作用,在 1890 年,Emil Fischer 提出鎖和鑰匙模式,而於
1958 年,Daiel Koshland 提出誘導-嵌合模式,試分別說明之?
答: 1. 鎖和鑰匙模式為解釋酶與受質作用的方式,酶的活性部位類似鎖,而受質就類似
鑰匙,特定的鑰匙只能開啟特定的鎖,故此模式說明了酶與受質的專一性,而把
酶的活性部位比喻成一個剛性且沒有彈性的結構。誘導- 嵌合模式為解釋酶活性
部位與受質結合會產生連續變化,反應前酶的活性部位並不會與受質非常密合,
受質與酶結合後會造成酶的構形發生改變,形成一個可以與受質的大小、形狀及
極性完全相密合的構形,使得受質與酶的作用更好。
例題 5.2
試簡單解釋下列名詞:輔因子、輔酶、輔基、全酶及去輔基酶。
答: 1. 有些酶除了蛋白質主體外,還需要加入其他成分才具有完整活性,這些額外
成分稱為輔因子,輔因子可以是有機分子、有機金屬分子(又稱輔酶)或金屬離
子(Zn2+、Mg2+ 或 Cu2+ 等)。
2. 輔酶是指可協助酶活性的有機化合物或是有機金屬化合物。在反應過程中,輔酶
可以緊密地或是寬鬆地與酶結合。
3. 輔基是輔酶中可以利用共價鍵或是非共價鍵與酶緊密結合且必要的部分。
4. 蛋白質主體與輔因子結合形成具有完整的生物功能的酵素,稱為全酶。
5. 未接上輔因子不具完整功能的酵素稱為去輔基酶。
5.2 酵素反應熱力學
5.2.1 標準自由能變化
反應熱力學與酵素催化反應速率有密切的關係,當化學反應發生時,反應物與生成物
的自由能差值,稱為標準自由能變化(standard free energy-change,ΔG0)(圖 5.5),標
準自由能變化可以作為評估該反應是否可以自發性產生的參數。標準自由能變化 > 0,表
示此反應不會自然發生;反之,若反應的標準自由能變化 < 0,表示此反應會自然發生;
若標準自由能變化等於 0,則表示反應達到平衡(請見 10.2 節)。
但是標準自由能變化小於 0,只是顯示此反應是在熱力學上有利的,但並不表示反應
會即時快速發生。例如常溫常壓下,過氧化氫會自然分解成氧及水,但是在沒有催化劑參
過渡狀態 過渡狀態
(transition state) (transition state)
自由能
自由能
反應物 生成物
反應物
反應方向 反應方向
(a) (b)
圖 5.8 增加反應溫度對反應熱力學的影 加熱
能量
響。加熱可以提升反應物的起始位
能,因此可以增加反應的速率。 室溫
反應物 生成物
反應方向
都有增加反應速率的效應,但兩者不同的是:酵素是蛋白質分子,所以在低於酵素最適反
應溫度的情況下,反應速率會隨著溫度的增加而上升。但是若加熱溫度超過最適反應溫度
後,因為高溫會造成蛋白質的變性,所以反應速率反而會急速下降(圖 5.13),此特徵是
酵素催化與一般化學反應不同的地方。
例題 5.3
為何升高溫度可以增加 H2O2 分解為 H2O 及 O2 之反應速率?
例題 5.4
哪一個反應的熱力學參數,可以應用於評估化學反應是否可以自然發生?
答: 當化學反應發生時,反應物與生成物的自由能差值,稱為標準自由能變化(ΔG0),
標準自由能變化可以作為評估該反應是否可以自發性發生的參數。標準自由能變化
> 0,表示此反應不會自然發生;反之,若反應的標準自由能變化 < 0,表示此反應
會自然發生;若標準自由能變化等於 0,則表示反應達到平衡。
5.3 酵素反應動力學
5.3.1 米曼方程式
早期酵素催化反應的研究發現,在固定酵素濃度下增加反應受質的濃度,酵素的催化
速率會明顯增加。但是隨著受質濃度的增加,酵素的催化速率增加的比例會逐漸下降,最
後即使再增加受質的濃度,酵素的催化速率也不再變化,此時酵素的催化反應速率稱為最
大反應速率(maximum velocity,Vmax)。以受質濃度與酵素催化活性作圖,可以發現圖
形屬於雙曲線(圖 5.9)。
例題 5.5
請畫出在定量酵素下,增加受質濃度對反應速率變化的圖形,並說明何謂最大反應速率。
答: 1.
Vmax
(initial velocity)
反應初速率
(v0)
受質濃度 [S]
(substrate concentration)
2. 在受質濃度相對低時,增加受質濃度會使反應速率有明顯的增加,但若在受質濃
度較高的條件下,由於酵素的數量是固定的,即使增加受質濃度,反應速率幾乎
不再變化或增加,此結果為一雙曲線,此時酵素的催化反應速率已達到最大限
度,以 Vmax 表示。
例題 5.6
在米曼方程式中,K m 的數值大小所代表的生理意義為何?
1
答: Km 是指酵素反應的初速率達到最大反應速率一半( 2 Vmax)時的受質濃度,Km 可以
作為酵素對受質親和力的指標,若受質的 Km 越小,表示酵素對此受質的親和力越
高。
5.4 酵素活性的抑制與調節
細胞內的酵素活性並非固定不變,有許多因素會影響酵素的活性,本節將介紹各種酵
素活性的抑制與調節機制。
5.4.1 抑制劑
抑制劑是指可以透過與酵素的作用,降低或是干擾酵素反應速率的物質。有許多藥
物或毒素的作用,就是透過對酵素活性的抑制。依照抑制劑的作用是否為可逆反應,可以
區分為可逆性抑制劑(reversible inhibitor)及不可逆性抑制劑(irreversible inhibitor)。可
逆性抑制劑與酵素的作用力較弱,當抑制劑被移除後,酵素可以回復原來的活性。不可逆
例題 5.7
藉由研究酵素(酶)之抑制劑,可以獲得哪些資訊及應用,試舉兩例說明之。
答: 1. 研究酵素的天然抑制劑,可以瞭解細胞內的代謝過程與酵素調節作用之相關性。
2. 許多藥物的藥效及毒物的毒性,就是透過抑制劑來抑制酵素的活性而達成。研究
抑制劑的作用,可以瞭解酵素的反應機制及酵素反應時各種胺基酸所扮演之角
色。
例題 5.8
依照抑制劑與酶作用之可逆性及競爭之形式,將酶的抑制劑分類,請簡述其特性。
答: 1. 不可逆性抑制劑:是指會與酶形成共價鍵或很強的非共價鍵之抑制劑,此類抑制
劑結合於酶與其受質連結或作用的胺基酸之官能基,造成酶永久地失去活性。
2. 可逆性抑制劑:是指與酶作用後仍可脫離的抑制劑,當它們與酶結合時才會造成
酶的失活。
(1) 競爭性抑制劑:抑制劑的結構與酶作用的受質之結構類似,且能結合到酶的
活性部位上,因此競爭性抑制劑會與受質競爭酶的同一個活性部位,當抑制
劑與酶結合後,受質便無法再結合上去。
(2) 非競爭性抑制劑:抑制劑和受質可以同時結合到酶上,且兩者會結合在酶的
不同位置,抑制劑的存在並不會影響受質與酶的結合,但是會干擾酶的催化
能力。
(3) 不競爭性抑制劑:是非競爭性抑制劑的一種特例,此抑制劑會讓受質先結合
到酶的活性部位上,然後本身再結合作用於活性部位之外的位置,即此抑制
劑只與 ES 複合體作用。
例題 5.9
在胰臟和胃中所合成的蛋白酶是沒有活性的形式,如何能使其產生活性?為何要有這種
機制?
答: 1. 有些酶剛被合成時並不具有生物活性,這個不具生物活性的酶前驅物稱為酶原,
其必須經過蛋白酶專一性裂解,產生一個或數個胜肽後,才具有活性。在生物體
內有一些重要的酶就是透過蛋白酶的裂解來調節酶的活性,酶原切割的活化作用
是不可逆的反應,裂解會使酶的三級結構發生變化,並使酶原內部的活性部位顯
露出來。
2. 若這些蛋白酶一合成即有活性,則會馬上分解胰臟和胃中其他的酵素及結構蛋
白,並對器官造成傷害。
例題 5.10
試舉出二種利用化學修飾來調節酶活性之方式。
答: 1. 對酶分子中的絲胺酸、酥胺酸或酪胺酸側鏈上的羥基(- OH)進行磷酸化作用。
2. 半胱胺酸上雙硫鍵的還原作用。
5.5 同功酶
同功酶(isoenzyme)是指具有相同催化活性,但是其成分與構造不同的一群酵素,
這群酵素通常具有不同的反應動力學參數(如 Km 或 Vmax),可見每一種同功酶結合受質
的親和力可能不同,催化能力也有所差異。所以在特定的生理需求下,細胞可以藉由不同
組織同功酶的活性變化,來調節代謝反應。由於同功酶特異性的組織分布,從血清中特定
同功酶成分的異常增加,能夠作為偵測器官病變的訊號。
廣泛存在人體組織的乳酸去氫酶(lactate
dahydrogenase;LDH)是目前被研究最清楚, 表 5.4 人體乳酸去氫酶同功酶的次單元
組成及主要分布組織
而且被應用於臨床診斷用途的同功酶之一,細
類型 次單元組成 分布組織
胞內的乳酸去氫酶主要功能是催化丙酮酸與乳
LDH-1 H4(HHHH) 心肌與紅血球
酸之間相互轉換的反應。在構造上,乳酸去氫
LDH-2 H3M(HHHM) 心肌與紅血球
酶是由四個次單元所組成的四聚體蛋白質,組
LDH-3 H2M2(HHMM) 肺臟
成乳酸去氫酶的次單元有兩種類型:H 型與 M
LDH-4 HM3(HMMM) 腎臟與肝臟
型,它們是由不同基因所編譯的具有兩種相似
LDH-5 M4(MMMM) 骨骼肌與肝臟
胺基酸序列的多胜肽鏈,由 H 及 M 次單元所組
成的四聚體,共有五種不同的組合方式:H4、
H3M、H2M2、HM3、M4(表 5.4)。
人體內心肌與紅血球細胞中主要的乳
酸去氫酶為 LDH-1 與 LDH-2,肺、脾和淋
巴結等組織中以 LDH-3 為主,骨骼肌與肝
細胞中則以 LDH-5 為最多,不同組織中乳
酸去氫酶同功酶的成分與濃度存在明顯的
特殊性。通常成人正常血清中濃度最高的
是 LDH-2,發生心肌梗塞時,血清中 LDH-
1 的濃度會上升,使得 LDH-1/LDH-2 的比
值會變大,甚至會大於 1。因此,透過電泳
法分析血清中乳酸去氫酶同功酶的成分與比
例(圖 5.25),據以瞭解組織病變發生的位
置,可以作為臨床診斷的用途。 圖 5.25 不同乳酸去氫酶同功酶以電泳分離
的示意圖。M:標準樣品,A、B、
C:未知物。
例題 5.11
什麼是同功酶?試舉一應用於臨床診斷用途的例子,並敘述其原理。
答: 1. 同功酶是指具有相同催化活性,但是其成分與構造不同的一群酵素,這群酵素通
常具有不同的反應動力學參數(如 Km 或 Vmax)與特異性的組織分布。
2. 乳酸去氫酶是由 H 型或 M 型兩種多胜肽鏈次單元所組成的四聚體蛋白質,包括
H4、H3M、H2M2、HM3、M4 等五種組合。人體內心肌細胞主要的乳酸去氫酶成
分為 H4,骨骼肌細胞則以 M4 為最多,不同組織中乳酸去氫酶同功酶的成分與濃
度存在明顯的差異。通常成人正常血清中濃度最高的是 H3M,發生心肌梗塞時,
血清中 H4 的濃度會上升,使得 H4 / H3M 的比值會變大,透過電泳法分析血清中
乳酸去氫酶同功酶的成分濃度與比例,據以瞭解組織病變發生的位置,可以作為
臨床診斷的用途。
5.6 酵素在臨床上的應用
一般正常的生理狀況下,細胞會不斷地製造及死亡,所以當細胞死亡後,細胞內的酵
素會釋放至血液中。當組織受到傷害造成細胞大量壞死,血液中酵素的含量會明顯上升,
所以分析血液中特定酵素的含量變化,可以作為臨床診斷或疾病監測的指標。
5.6.2 肌酸激酶及乳酸去氫酶
肌酸激酶(creatine kinase;CK)同功酶存在於骨骼肌細胞、心肌細胞及腦細胞,透
過比對血液中肌酸激酶異常,可以協助診斷是何種組織發生病變。當發生心肌梗塞或心肌
炎等心臟病變時,血液中心肌來源的肌酸激酶(CK-MM,M 為兩種次單元之一)會顯著
上升。乳酸去氫酶同功酶也常被應用於臨床診斷,透過分析血液中異常的乳酸去氫酶同功
酶的類型,可以作為診斷心臟、肌肉或腎臟病變的指標。
5.6.3 急性胰臟炎指標:澱粉酶及脂肪酶
澱粉酶及脂肪酶是胰臟所分泌的消化酵素,其中澱粉酶參與飲食中碳水化合物的水
解,脂肪酶參與脂質的分解。當胰臟受損或發炎時,消化食物的外分泌系統受到影響,造
成血液中澱粉酶及脂肪酶的濃度上升。
5.6.4 血糖的測定:葡萄糖氧化酶
血糖測定是糖尿病診斷與治療追蹤的重要檢驗項目,在眾多血糖定量方法中,葡萄糖
氧化酶檢驗法因為靈敏且對葡萄糖專一性高,不易受檢體中其他醣類的干擾,因此常被採
用。
例題 5.12
為何釋放至血液的細胞內酵素含量,可以應用於臨床疾病的診斷?
答: 一般正常的代謝反應,細胞會不斷地被製造及破壞,所以當細胞被破壞後,細胞內
的酵素會釋放至血液中。當組織受到傷害造成細胞大量壞死,血液中酵素的含量會
明顯上升,所以分析血液中特定酵素的含量變化,可作為臨床診斷或疾病監測的指
標。
本章總結
1. 生物體內的代謝反應都需要酵素分子的 3. 反應熱力學與酵素催化反應速率有密切
參與,目前有兩種解釋酵素催化專一性 的關係。反應物與生成物的自由能差稱
的模式被提出:鎖和鑰匙模式及誘導 - 為標準自由能變化,其可以作為評估該
嵌合模式。鎖和鑰匙模式強調的是:受 反應是否可以自發性產生的參數,若反
質與酵素兩者在幾何結構上具有高度的 應的標準自由能變化 < 0,表示此反應
互補性;誘導-嵌合模式則認為受質與 會自然發生。酵素的催化反應並不會改
酵素進行結合時,會誘導酵素產生結構 變標準自由能差,但是可以降低反應的
的變化,使兩者產生互補性的嵌合。目 活化能,因而促進催化反應的進行。
前研究結果發現誘導-嵌合模式比較接 4. 米曼方程式被應用於酵素催化動力學
近實驗的觀察。 研究,此方程式中的 Michaelis 常數:
2. 國 際 生 物 化 學 及 分 子 生 物 學 學 會 1
Km,是指在 2 Vmax 時的受質濃度;Km
(IUBMB)發展了一套依酵素的催化特 可以作為酵素對受質親和力的指標,Km
性作為命名準則的國際名稱,此分類法 越小表示酵素對此受質的親和力越高。
每個酵素有四個碼來代表,其中第一個 萊恩威弗-伯克氏圖是將米曼方程式進
號碼代表酵素的催化類型,依此系統酵 行雙倒數運算,萊恩威弗-伯克氏圖的
素的催化分為六大類型。 直線會在 1/v0 及 1/[S] 產生交會,此直
本章習題
5.1 生物催化劑——酵素 (C) 生物素 (D) NADH
1. 下列有關酶的敘述,何者正確? 4. 下列有關酶與受質結合的敘述,何者
(A) 酶只和特定型態的受質作用 錯誤?
(B) 所有的酶都是由蛋白質所組成 (A) 酶的活性部位只占酶的小部分空間
(C) 酶在催化反應中會被消耗 (B) 鎖和鑰匙模式中酶的結構為剛性構
(D) 酶不能重複跟其他相同的受質分子 形
作用 (C) 酶的活性部位利用非共價性交互作
2. 下列何者是體內合成 NAD+ 的前驅物? 用與受質結合
(A) 核黃素 (B) 泛酸 (D) 誘導-嵌合模式推論受質的構形會改
(C) 菸鹼酸 (D) 硫胺酸 變至可以結合酶活性部位
3. 下列哪一個輔酶常伴隨乙醯輔酶 A 羧化 5. 比較說明鎖和鑰匙以及誘導-嵌合這兩
酶的催化作用? 種酵素與受質的結合模式。
(A) NADPH (B) FAD 6. 在急診室中乙醇常用來治療誤食甲醇的
患者;甲醇在體內會經由去氫酶的催化
選)
(B) (C) (D)
(A) 去磷酸化的肝醣合成酶
V V V
(B) 磷酸化的肝醣合成酶
(C) 去磷酸化的肝醣磷酸化酶
抑制作用、非競爭性抑制作用及不競爭 症」,在臨床上是利用血液中哪個酵素
性抑制作用的差異點。 的含量,作為肌肉組織是否受損的指
標?