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1. Catabolism
分解代謝作用:新陳代謝中分解的部分,可將大分子氧化分解成小分子,過程會
得到能量,而該能量可讓氧化態的小分子還原成還原態的小分子(包括 NADH、
ATP、NADPH、FADH2),以儲存能量。
舉例:吃下澱粉後,經分解代謝作用產生單醣,在體內進一步合成成肝糖儲存。
2. Gibbs free energy
自由能(G):(細胞)恆溫恆壓下,一個反應進行時,可以做功的能量總和,為生物
所能利用的能量,是生物能量學計算的對象。
計算方式:△G =產物-反應物,△G 為負值時,釋放能反應,為正值時,是吸能
反應
△G=△H-T△S,單位為 cal/mol
一般來說,K 值越高,反應越容易進行,自由能越大
標準自由能(△G’。)為 1mol 濃度的反應物在一大氣壓、25。C 下,與產物所需
的能量變化,且可以加成,但實際值仍需視細胞中反應物與生成物的濃度
3. Monosaccharide
單醣:不可再被分解的醣類,碳數通常是 3~8 個。為無色結晶固體,具有良好
的水溶性,但不溶於非極性的溶劑。具有鏡像異構物,分為 D-form 和 L-form,
D-單醣的到數第二個碳的右邊有 OH 基,而 L-單醣的 OH 基則是在左邊
依照官能基的不同可分為酮醣(帶有酮基(CO-))和醛醣(帶有醛基(CHO-));常見
的酮醣有果醣;常見的醛醣有葡萄糖
舉例:葡萄糖(六碳醣)、果醣(六碳醣)、核酸(五碳醣)
單醣可經縮合反應(脫一分子的水)形成雙醣
4. Glycoproteins
醣蛋白:帶有醣的蛋白質(像是抗體),之間以共價鍵連接。依連接方式可分為
O-linked 和 N-linked,像是絲胺酸或蘇胺酸即是用 O-linked 和醣類連接,而
天門冬胺酸則是用 N-linked 和醣類連接
5. Hemiacetal
半縮醛:由醛基和羥基結合形成,為可逆的反應。以葡萄糖閉環的過程為例,一
號碳上的醛基和五號碳上的羥基作用,形成半縮醛的結構,達成閉環。
Part II. Write short answers to the following questions
1. Please explain the ranking of biological phosphate compounds by standard free
energies of hydrolysis
a. Phosphoenolpyruvate b. 1,3-Bisphosphoglycerate c. Phosphocreatine
除了 ATP 水解能產生能量外,其他的磷酸化合物和
硫酯類也擁有大的水解自由能。
而 PEP(a)水解可放出 61.9 kJ/mol
1,3-二磷酸甘油酸(b)水解後可放出 49.3 kJ/mol
磷酸肌酸(c)水解後可放出-43.0 kJ/mol
因此依照水解後產生的能量,a>b>c
而收益階段的第一步(糖解作用的第六步)是去氫酶將預備階
段產生的 3-磷酸甘油醛氧化形成 1,3-二磷酸甘油酸,且讓 NAD+還原成
NADH(此步驟使用的磷酸根為游離態的磷酸根);第二步(糖解作用第七步)是激
酶轉移磷酸根,把 1,3-二磷酸甘油酸上一號碳的磷酸根轉移,使 ADP 變成 ATP(此
步驟產生 2 個 ATP);第三步(糖解作用第八步)是異構酶將三號碳上的磷酸根異構
至二號碳上;第四步(糖解作用第九步)2-磷酸甘油酸經酵素催化脫水,形成 PEP,
最後一步是將 PEP 的磷酸根轉移至 ADP 形成 ATP(共 2 個 ATP),並形成丙酮酸。
此階段共形成 2 個 ATP 和 2 個 NADH。