Professional Documents
Culture Documents
Seminarium 2
Temat: Od genu do białka. Mutacje i ich skutki.
LITERATURA
1. Alberts B., Bray D., Hopkin K., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K., Walter P.:
Podstawy biologii komórki. PWN, Warszawa 2018.
2. Drewa G. Ferenc T: Genetyka medyczna. Podręcznik dla studentów. Elsevier &Partner,
Wrocław 2018.
3. Fletcher H.L., Hickey G.I., Winter P.C.: Genetyka. PWN, Warszawa 2010.
4. Bal J.: Genetyka medyczna i molekularna. PWN, 2017.
Gen - to każda sekwencja DNA, która ulega transkrypcji jako oddzielna jednostka i
wytwarza funkcjonalny tRNA, rRNA lub mRNA kodujący białko.
Ekspresja („wyrażenie’) genu - to proces prowadzący do powstania funkcjonalnej
cząsteczki białka i funkcjonalnych cząsteczek tRNA i rRNA.
1
1. Transkrypcja
2
Dojrzały mRNA
Typy splicingu:
• składanie konstytutywne (ang. constitutive splicing): eksony są zawsze składane w
taki sam sposób, co prowadzi do powstania tylko jednego mRNA i w konsekwencji
jednego białka,
• składanie alternatywne (ang. alternative splicing): eksony są składane na różne
sposoby, dzięki czemu powstaje wiele wariantów mRNA i w konsekwencji wiele
wariantów białek, różniących się właściwościami biologicznymi i biochemicznymi.
Pętla D (dihydrourydynowa)
Pętla T (rybotymidynowa)
4
Translacja - to tłumaczenie sekwencji nukleotydowych mRNA na aminokwasy (elementy
składowe białka). Sposób w jaki sekwencje nukleotydów cząsteczki mRNA zostają
przekształcone w sekwencje aminokwasowe opisuje kod genetyczny.
Kodon AUG (koduje metioninę) sygnalizuje początek informacji kodującej białko. Trzy
kodony (UAA, UAG i UGA) – to kodony nonsensowne = kodony „stop”.
5
Translacja zachodzi na rybosomach (polisomach). Mała podjednostka rybosomu przyłącza
mRNA i dopasowuje antykodony tRNA do kodonów mRNA. Duża podjednostka
katalizuje powstawanie wiązań peptydowych, które łączą poszczególne aminokwasy w
łańcuch białkowy.
Etapy translacji:
inicjacja: powstaje kompleks preinicjacyjny , składający się z małej podjednostki
rybosomu, inicjatorowego tRNA (niesie metioninę) i czynnika inicjatorowego (eIF-
2). Kompleks ten przyłącza się do końca 5’ mRNA, a powstały kompleks
inicjacyjny skanuje cząsteczkę mRNA aby znaleźć kodon inicjacyjny 5’- AUG-3’
(nukleotydy te są komplementarne względem antykodonu w tRNA). Następnie
przyłącza się duża podjednostka rybosomu (proces ten wymaga energii z rozpadu
GTP). Inicjatorowy tRNA znajduje się w miejscu P.
elongacja : aminoacylo-tRNA wiąże się z miejscem A; podjednostka duża, dzięki
obecności enzymu, peptydylotransferazy, katalizuje tworzenie wiązania
peptydowego pomiędzy nowym aminokwasem w miejscu A i końcem
karboksylowym rosnącego polipeptydu w miejscu P. Następuje odcięcie
polipeptydu od tRNA w miejscu P i przyłączenie go do aminokwasu związanego z
tRNA w miejscu A. Rybosom przesuwa się o trzy nukleotydy tak, że następny
kodon wchodzi w miejsce A, Polipeptydylo - tRNA przesuwa się z miejsca A do P;
pusty tRNA jest usuwany z rybosomu (miejsce E). Cykl ten powtarza się aż do
momentu pojawienia się w mRNA kodonu STOP.
terminacja - przyłączenie czynnika terminacyjnego do miejsca A, odłączenia od
tRNA kompletnego polipeptydu znajdującego się w miejscu P oraz demontaż
kompleksu translacyjnego. mRNA jest degradowany, natomiast uwolnione
6
podjednostki rybosomów stają się częścią puli cytoplazmatycznej i są
wykorzystywane w kolejnej rundzie translacji.
7
Mutacje indukowane – są spowodowane działaniem czynników fizycznych (np.
promieniowanie UV, promieniowanie jonizujące), substancji chemicznych (np.
nitrozaminy, policykliczne węglowodory aromatyczne, dioksyny, aktywne formy tlenu
powstające wyniku metabolizmu tlenowego), oraz czynników biologicznych (np.
aflatoksyny; niektóre wirusy).
o tranzycja - zmiana puryny w purynę (A→G, G→A) lub pirymidyny w pirymidynę (C→T,
T→C)
o transwersja - zmiana puryny w pirymidynę (np. A→C, G→C)
o delecja - utrata jednego lub kilku nukleotydów
o insercja - wstawienie jednego lub kilku dodatkowych nukleotydów
8
• mutacje ciche (milczące): zmiany dotyczą trzeciej zasady kodonu; nie wywołują
zmian w kodowanym białku i w fenotypie; nagromadzają się w DNA powodując
polimorfizm;
• mutacje nonsensowne: zmieniają kodon na kodon stop i powodują powstawanie
krótszych polipeptydów;
• mutacje zmiany ramki odczytu: insercja lub delecja w rejonie kodującym powoduje
przesunięcie ramki odczytu; zmieniają wszystkie kodony i tym samym sekwencje
aminokwasowe w białku; często powodują powstanie zmutowanego fenotypu;
• mutacje transkrypcyjne: występują w regionie genu związanym z regulacją
transkrypcj,i np. w sekwencji promotora (np. TATA) lub w sekwencjach
wzmacniających – mogą wywoływać obniżenie transkrypcji genu ze spadkiem
produkcji mRNA i w efekcie białka;
• mutacje splicingowe: mogą powodować usunięcie eksonu lub zatrzymanie intronu w
czasie obróbki pre-mRNA; powodują zmianę sekwencji nukleotydowej w dojrzałym
mRNA i tym samym zmianę sekwencji aminokwasowej w białku.
9
Fenyloketonuria - może być spowodowana różnymi mutacjami punktowymi (substytucje,
delecje, insercje, mutacje splicingowe) w genie kodującym hydroksylazę fenyloalaniny
(PAH). Mutacja powoduje niedobór tego enzymu, co prowadzi do wzrostu poziomu
fenyloalaniny i jej metabolitów we krwi (np. kwasu o – hydroksyfenylooctowego - wpływa
na „mysi” zapach moczu) oraz uszkodzenia ośrodkowego układu nerwowego.
10
stężenia LDL, w tym cholesterolu we krwi, co przyczynia się do przyśpieszonego rozwoju
miażdżycy i wczesnego występowania incydentów sercowo-naczyniowych.
2. Mutacje chromosomowe
11
Kariotyp komórki człowieka (mężczyzna). Wg U.S. National Library of Medicine.
Chromosomy człowieka
Ramię q – poniżej
centromeru
12
Inwersje - chromosom ulega złamaniu w 2 miejscach, a fragment pomiędzy złamaniami
ulega odwróceniu o 180 stopni. Inwersja paracentryczna nie obejmuje centromeru,
inwersja pericentryczna obejmuje centromer.
Izochromosomy - powstają w wyniku nieprawidłowego poprzecznego podziału
chromosomu w obrębie centromeru; każdy izochromosom składają się z dwóch
identycznych ramion: długich lub krótkich.
Chromosomy dicentryczne - powstają w wyniku fuzji dwóch fragmentów
chromosomów; każdy chromosom dicentryczny zawiera dwa centromery.
Translokacje - powstają w wyniku złamania jednego chromosomu i przyłączenia się
złamanego fragmentu do terminalnej części innego chromosomu lub równoczesnego
złamania się dwóch chromosomów różnych par i wzajemnej zamiany fragmentów
pomiędzy tymi chromosomami (translokacja wzajemna; zrównoważona).
Fuzja centryczna (translokacja robertsonowska) - to złamanie w rejonie centromerów
chromosomów akrocentrycznych i wzajemne połączenie się dwóch ramion długich;
krótkie ramiona obu chromosomów zostają utracone (krótkie ramiona chromosomów
akrocentrycznych zawierają nieaktywną genetycznie heterochromatynę). Fuzje centryczne
u człowieka dotyczą najczęściej chromosomów 13 i 14 oraz 14 i 21.
13
i 22 : t (9;22); miejsca pęknięć obu chromosomów: q34;ql1; kariotyp: 46, XX (XY), t (9;22)
(q34;q11). Powstaje mniejszy chromosom 22, nazywany chromosomem filadelfijskim (Ph).
Występuje on u 95% chorych na przewlekłą białaczkę mieloblastyczną (CML).
Aneuploidia
14
Homologiczne chromosomy nie rozdzielą się, Zachodzi w wyniku błędu rozdziału
co prowadzi do aneuploidii wszystkich chromatyd siostrzanych; niektóre gamety
komórek jajowych lub plemników zawierają dodatkowe lub brakujące
chromosomy
Połączenie prawidłowego plemnika (n) z nieprawidłową gametą żeńską (n+1 lub n-1)
prowadzi do powstania odpowiednio: zygoty trisomicznej (47 chromosomów) lub zygoty
monosomicznej (45 chromosomów). Wszystkie komórki rozwijającego się zarodka mają tę
samą nieprawidłową liczbę chromosomów.
15
mozaikowości; np. zespół Turnera (45X0): niektóre komórki mają 45 chromosomów,
pozostałe komórki zawierają 46 chromosomów.
Poliploidia
16
17