Chapter 13 Viruses and Prions Summer Sem 2022 20235360 91884d04

Microbiology an Introduction
Thirteenth Edition, Global Edition
Chapter 13
Viruses, Viroids, and Prions
‫الّٰلهم انفعني بما عّلمتني وعّلمني ما‬

‫ينفعني وزدني علًما‬
Hadeel Ahmad 122
Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

General Characteristics of Viruses (1 of
2)
Learning Objective
13-1 Differentiate a virus from a bacterium.

General Characteristics of Viruses (2 of
2) ‫ هنا مش بمعنى طفيلي وانما بدويورجينا انه‬parasites ‫ال‬
‫ متطفل يعني ال يستطيع ان يعيش‬organism ‫الفيروس هو‬
intracellularly ‫اال‬
• Obligatory intracellular parasites e

– Require living host cells to multiply ‫متطفلني اجباريني داخل الخاليا‬
‫ وممكن تكون‬RNA ‫ او‬DNA ‫املادة الوراثية للفيروس اما تكون‬
• Contain DNA or RNA linear nucleic ‫ وممكن تكون‬double strand ‫ او‬single strand
circular DNA‫ من وممكن‬acid
• Contain a protein coatLoading…capsid ‫ او‬coat ‫حوالني املادة الوراثية في غالف بروتيني بنسميه‬
• No ribosomes
• No ATP-generating mechanism

Table 13.1 Viruses and Bacteria
Compared ‫باكتيريا شاذات ولكن‬
arches ‫ليست من ال‬

Host Range
• The spectrum of host cells a virus can infect -)
• Most viruses infect only specific types of cells in one

host
Loading…
– Determined by specific host attachment sites and
cellular factors
‫هو الفايروس يلي بهاجم وبحتل البكتيريا‬
• Bacteriophages—viruses that infect bacteria
• Range from 20 nm to 1000 nm in length

‫— بنحكي دائما انه الفيروسات ‪ host specific‬يعني ال ‪ host‬يلي بتهاجمه‬
‫خصيصا بس هاد ال ‪ host‬يلي بتهاجمه النه الها ‪ specific receptors‬موجودة على سطح هذا‬
‫ال ‪ host‬يعني مثال في فيروس بس يهاجم االنسان او بس الحيوان وهكذا‬
‫— حتى بال ‪ host‬الواحد الفيروس بهاجم ‪specific cell‬‬

‫يعني في فيروس مخصص يهاجم بس خاليا التنفس واشي بس خاليا االمعاء وهكذا‬
‫يعني لو مثال في سؤال‬
‫فيروس التنفس وصل بطريقة ما للكبد هل بيأذيه ؟‬
‫الجواب ‪ :‬ال النه مش مخصص اله وال ‪ receptors‬تاعاته موجودات فقط عخاليا جهاز التنفس‬
Figure 13.1 Virus Sizes
800 × 10 nm
Bacteriophage M13
970 nm
Bacteriophages f2, MS2 24 nm
Ebola virus
Poliovirus 30 nm
Rhinovirus 30 nm
Adenoviru 90 nm
300 nm Chlamydia bacterium
s elementary body
Rabies 170 × 70 nm
virus E. coli
Prion 200 × 20 nm bacterium
3000 × 1000 nm
Human red blood cell
Bacteriophage T4 225 nm 10,000 nm in diameter
Tobacco mosaic virus 250 × 18 nm Plasma membrane

of red blood cell
Viroid 300 × 10 nm 10 nm thick
Vaccinia virus 300 × 200 × 100 nm

Viral Structure (1 of 2)
Learning Objective
-2 Describe the chemical and physical structure of both an
enveloped and a nonenveloped virus.

Viral Structure (2 of 2)
‫فيروس مكتمل النمو‬
• Virion—complete, fully developed viral particle
‫ – الشرط‬Nucleic acid—DNA or RNA can be single- or
‫االساسي‬
‫ عشان يكون‬double-stranded; linear or circular
virion
– Capsid—protein coat made of capsomeres
(subunits)
‫مركبات اضافية‬
‫ –ممكن نالقيها‬Envelope—lipid, protein, and carbohydrate
‫عند بعض ال‬
‫ دون‬virion
coating on some viruses
‫االخر‬
– Spikes—projections from outer surface

ure 13.2 Morphology of a Nonenveloped Polyhedral Virus
Nucleic acid
Capsomere Capsid

ure 13.3 Morphology of an Enveloped Helical Virus
Nucleic acid
Capsomere
Envelope
Spike
s

General Morphology
• Helical viruses—hollow, cylindrical capsid
• Polyhedral viruses—many-sided
• Complex viruses—complicated structures
Loading…
Example on viruses:
- Helical enveloped viruses
- Helical non-enveloped viruses

Figure 13.4 Morphology of a Helical Virus
Nucleic acid
Capsomere
evola virus ‫ممكن يسالك شو شكل ال‬

Capsid
helical : ‫الجواب‬

65 nm
Figure 13.5 Capsid (head)
Morphology of Polyhedral
virus I DNA
Complex Viruses
Sheath
Tail fiber
Complex virus
Pin
Baseplat
e
A T-even bacteriophage
Orthopoxvirus

Taxonomy of Viruses (1 of 2)
Learning Objectives
13-3 Define viral species.
13-4 Give an example of a family, genus, and common
name for a virus.

xonomy of Viruses (2 of 2)
International Committee on Taxonomy of Viruses
(ICTV) classification ‫ اللجنة العاملية لتصنيف الفيروس‬Order
• Genus names end in -virus V
Family
• Family names end in –viridae (e.g. Secoviridae) ~
Genus
• Order names end in –ales (e.g. Picornavirales) W
Species
• Viral species: a group of viruses sharing the same genetic information and
ecological niche (host) host ‫يشبهه بعض كثير الهم نفس املادة الوراثية ونفس ال‬
– Descriptive common names are used for species
– Subspecies are designated by a number
‫تصنيفة جديدة للفيروس‬

Baltimore classification: depends on viral genome
and methods of synthesis of viral mRNA
solation, Cultivation, and Identification
of Viruses
Learning Objectives
13-5 Describe how bacteriophages are cultured.
13-6 Describe how animal viruses are cultured.
13-7 List three techniques used to identify viruses.

Growing Bacteriophages in the
Laboratory
• Viruses must be grown in living cells
• Bacteriophages are grown in bacteria ‫فراغامتم ظسهورحتة فباليبمكنتايرطياق‬
-
– Bacteriophages form plaques, which are clearings
on a lawn of bacteria on the surface of agar
● Each plaque corresponds to a single virus; can
be expressed as plaque-forming units (PFU)

gure 13.6 Viral Plaques Formed by Bacteriophages
Plaques
I

‫خلونا نتذكر شغلة ‪:‬‬
‫اجت فيروس ‪ bacteriophage‬وهاجم خلية بكتيرية ملا يشبك على سطحها شو بدخللها ؟‬
‫اكيد ال ‪ DNA‬تاعه وبعدها بعمل ‪ replication‬لنفسه وبصنع نسخ منه وبس يكثر بفجر الخلية وبتموت‬
‫والفيروسات بصيرو حرة ف بروحو يهاجمو البكتيريا املجاورة وهكذا‬
‫ف اذا انا بدي اعرف هل الفيروس موجود وبيقتل البكتيريا شو اعمل ؟‬

‫بطريقة تسمى ‪lone culture‬‬ ‫بجيب الخلية البكتيريا بزرعها باملختبر ع ‪Petri dish‬‬
‫شو يعني ؟‬
‫بجيب ال ‪ Petri dish‬عليه ‪ media‬بمسك الصحن وبزرع البكتيريا فوق بعض كانه بمسحه مسح وبخليش بينهم‬
‫فراغات وبنحطها بالحاضنة‬
‫الصحن ممسوح بالبكتيريا = ‪lone culture‬‬
‫اجينا اليوم الثاني لقينا في غباش ابيض هاد هو نمو بكتيريا ولكن شفنا انه في كمان فراغات هاد االشي‬
‫بدل انه في بهاي املناطق فيروس بدمر البكتيريا ويقتلها ف لهيك ما طلعت‬
‫لو تركت هاد الصحن كمان ايام رح تضل الفراغات تكبر‬
‫الفراغات = ‪plaques‬‬
Growing Animal Viruses in the
Laboratory (1 of 2) ‫كيف بدي ازرع الفيروسات يلي بتصيب الحيوانات في املختبر ؟‬
‫انا بحاجة انه اجيب نسيج حيواني عشان احقن فيه الفيروس‬
• In living animals ‫طيب انا باملختبر كيف بجيبهم ؟‬

: ‫بطريقتني‬
_embryonated egg
• In embryonated eggs _ tissue cultures
– Virus injected into the egg

– Viral growth is signaled by changes or death of the
embryo

ure 13.7 Inoculation of an Embryonated Egg
Amniotic Chorioallantoic
Shell cavity membrane Chorioallantoic
Air membrane
sac inoculation
Amniotic
inoculation
sis
D. Yolk
sac Allantoic
inoculation
Shell
membrane
Yolk sac
Albumin Allantoic inoculation
cavity

‫في عندي بيضة دجاجة ملقحة يعني البيضة فيها جنني‬
‫والجنني بكون قاعد في سائل امنيوسي وبكيس امنيوسي ومحاطة بعدة ‪membrane‬‬
‫ف هسا انا بروح بجيب فيروس بحقنه ب اي مكان بدي ياه من هاي الطبقات مثال ب ‪chorioallontoic membrane‬‬
‫بعد ما احقنه بصير اراقب البيضه شو بصير عليها من تغييرات وتشوهات‬
‫) ‪ = (cytopathic effect‬التغييرات الي بيعملها الفيروس على البيضه هل بخليها تنقسم ‪ ،‬هل بخليها تموت ‪…،‬‬
‫وهيك بعرف تاثير الفيروس‬

Growing Animal Viruses in the
Laboratory (2 of 2)
• In cell cultures
– Tissues are treated with enzymes to separate
cells
– Virally infected cells are detected via their
deterioration, known as the cytopathic effect
(CPE)
– Continuous cell lines are used 05:5 505 I
-
‫بجيبه من نسيج الخلية يلي بدي افحص‬ -

‫تاثير فيروس عليها‬

‫‪Cell cultures‬‬
‫بجيب نسيج حي من مخلوق حي باخذه عاملختبر بهيأه لظروف خاصة بضيف عليه انزيمات خاصة عشان النسيج‬
‫ينقسم لخاليا‬
‫بعدها بضيف ع هاي الخاليا ‪ certain enzyme‬وهاي االنزيمات بتفصل الخاليا عن بعضها وبعدها باخد هاي الخاليا‬
‫بحطها في ‪ culturemedia‬يعني بحطها في وسط غذائي خاص بحمي هاي الخاليا وبخليها على قيد الحياة‬
‫االن بحقن الفيروس في هاي الخاليا ‪ ،‬الخلية يلي ما بتتاثر في هاي الخاليا وضلت طبيعية بتكاثر وبتنقسم على شكل‬
‫‪monolayer‬‬
‫في حني الخلية يلي هاجمها الفيروس واثر عليها ممكن يعملها ‪ transformerd cell‬يعني يحولها لخلية سرطانية‬
‫فبتصير تنقسم من غير وعي ‪multilayer‬‬
Figure 13.9 The Cytopathic Effect of Viruses
cell
multinucleatid giant cell
Sequames
↑
A
-git
Figure 13.9 The cytopathic effect of viruses. (a) Uninfected human cervical cells; each has one nucleus. (b) After
infection with HHV-2, the red cervical cell has many nuclei that are filled with viruses.

‫ناس مصابة بفيروس بس ما بعرف شو هو‬
‫كيف بدي اعرف؟‬
Viral Identification
‫من التغييرات يلي صايرة عاملريض بنعرف هل هو فيروس او ال‬
‫يعني فحصنا منطقة اللوز ملريض لقيناها حمرة بنعرف انه هاد‬
• Cytopathic effects I ‫فيروس وملا نشوف طالع عليها مدة بيضا بنعرف انه هاي‬
‫بكتيريا‬
• Serological tests Antigen antibody reaction
– Western blotting—reaction of the virus with antibodies
• Nucleic acids ‫ جنتكس‬٣ ‫شابتر‬
– RFLPs (restriction fragment length polymorphism)-

for characterization
– PCR

‫‪Serological tests‬‬
‫على سبيل املثال مريض ايدز ‪-‬عافانا وعافاكم اهلل ‪-‬اكيد عنده بجسمه ‪antibody‬لاليدز النه مدام عندك‬
‫ال‪ antigen‬اذن جسمك كون ضده ال‪antibody‬‬
‫هال كيف بدي اعرف هاد الشخص مصاب بااليدز بشوف دمه وبدور على ال ‪ antibody‬اذا لقيته اذن هو‬
‫مصاب‬
‫من طرق ال ‪ serological test‬اخذنا ال ‪ELISA‬‬

‫وهسا ننحكي عن ‪western blotting‬‬
‫بنحط الفيروس على جل وبعدين بتقسمو بروتيناته بعدين اطبعه على ‪ cellulose filter paper‬وبعدين‬
‫اضيف فوقه ال ‪ serum‬تاع املريض‬
‫اذا صار ‪ agglutination‬يعني صار تفاعل بني ال ‪ antibodies from patient serum‬و ‪ virus‬بعرفه انه‬
‫مصاب‬
Viral Multiplication (1 of 2)
Learning Objectives
13-8 Describe the lytic cycle of T-even bacteriophages.
13-9 Describe the lysogenic cycle of
bacteriophage lambda.
10 Compare and contrast the multiplication cycle of DNA-
and RNA-containing animal viruses.

Viral Multiplication (2 of 2)
• For a virus to multiply:
us
*
– It must invade a host cell -> -
– It must take over the host’s metabolic machinery

• One-step growth curve

‫‪Figure 13.10 A viral One-Step Growth‬‬
‫‪Curve‬‬
‫كل ال ‪ host‬ماتو‬
‫↑‬
‫&‬
‫فش ‪ host‬يعيشو فيه عشان هيك بلش‬

‫الفيروس يموت ف عددهم بنقص >‪-‬‬
‫الفيروس تضاعف وتكاثر وبعدين‬
‫;‪Most infected cells die as a result of infection‬‬
‫طلع من الخلية لهيك بلش العدد يزيد‬ ‫‪-‬‬ ‫‪consequently, new virions won’t be produced.‬‬
‫& جبنا فيروس يهاجم‬

‫يهاجم ال ‪ host‬عالسطح‬
‫↓‬
‫كل الفيروس دخل عالخلية‬
‫ومضلش اشي برا لهيك صفر‬
‫‪Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved‬‬
Multiplication of Bacteriophages
• Lytic cycle
– Phage causes lysis and death of the host cell
W
• Lysogenic cycle Temporat cycle

– Phage DNA is incorporated in the host DNA
‫ملا املادة الوراثية للفيروس تدخل وتشبك مع‬
– Phage conversion ‫الكروموسوم تاع البكتيريا بضل عهاد النحو‬
– Specialized transduction lytic

‫ تخرج من هاد‬.‫ملدة طويلة وبمرة من املرات بتقرر‬
cycles ‫البكتيريا وبترجع تدخل ب ال‬

📝
Animation: Viral Replication: Virulent

Bacteriophages 8 ‫ بشابتر‬transduction ‫اكيد متذكرينه ال‬
Loading…

‫‪Virulent Bacteriophages‬‬
‫‪١- Attachments‬‬
‫الزم يكون في ‪ receptors‬على سطح الخلية لحتى يشبك فيه الفايروس‬
‫‪٢-Penetration‬‬
‫اذا كان الفيروس نوعه ‪ bacteriophages‬بضخ فقط املادة الوراثية للخلية‬
‫ولكن اذا كان ‪ animal virus‬رح يدخل كله للخلية ‪ -‬مادة وراثية ‪- … capsid ،‬‬
‫‪٣-Replication‬‬
‫بصير يضاعف نفسه ويعمل نسخ منه‬
‫‪٤-Assembling‬‬
‫بصير يجمع حاله يعني كل مادة وراثيه بتقعد جوا ‪capsid‬‬
‫وبالنهاية بفجر الخلية وبطلع منها‬

Animation: Viral Replication:
Temperate Bacteriophages

Table 13.3 Bacteriophage and Animal
Viral Multiplication Compared
lysing / Buddings 12S.

Multiplication of Animal Viruses
• Attachment: viruses attach to the cell membrane
• Entry by receptor-mediated endocytosis or fusion
• Uncoating by viral or host enzymes
• Biosynthesis: production of nucleic acid and proteins
• Maturation: nucleic acid and capsid proteins assemble
• Release by budding (enveloped viruses) or rupture

Figure 13.14 The Entry of Viruses into Host Cells
nonenvolbe
envelobe
Host plasma membrane

proteins at site of Fusion of viral
receptor-mediated envelope and plasma
endocytosis membrane
‫ تاع‬plasma membrane ‫جسم ال‬ ‫ تاع الفيروس يلتحم وبتحد‬envelope ‫ال‬

‫الخليةوبروتينات خاصة بتلف عليه‬ host ‫ تاع ال‬plasma membrane ‫مع ال‬
‫وبتحاوطه وبتدخله لجوا‬ ‫ ويلزقون ببعض وبدخل الفيروس‬cell
Entry of pig retrovirus by Entry of herpesvirus by fusion.
receptor-mediated endocytosis.
Viral capsid
Figure 13.20 Budding Host cell plasma membrane
of an Enveloped Viral protein
Virus Bud
Bud
Envelope
Release by budding
Lentivirus

The Biosynthesis of DNA Viruses (1
of 11)
• DNA viruses replicate their DNA in the nucleus of the

host using viral enzymes
• Synthesize capsid in the cytoplasm using host cell
enzymes S
translation ‫ هو حصيلة عملية ال‬capsid ‫النه ال‬
‫ الزم يكمل للنواة‬DNA ‫اذا كان الفيروس يلي داخل عالخلية من نوع ال‬
host ‫ بتتم في نواة ال‬replication ‫يعني عملية ال‬
replication ‫ ف رح يضله بالسيتوبالزم ويعمل هناك‬RNA ‫ولكن اذا كان من نوع‬

UNDATION Figure 13.15 Replication of a DNA-Containing
Animal Virus A papovavirus is a typical
Papovavirus
DNA-containing virus that
ATTACHMENT
Virion attaches
to host cell.
RELEASE attacks animal cells.
Virions are
released. DNA
Host cell
ENTRY and
Capsid UNCOATING
Virion enters cell, and
MATURATION its DNA is uncoated.
Virions Nucleus
mature.
Cytoplasm
Capsid proteins
Viral DNA
Capsid
BIOSYNTHESIS protein
Viral DNA is replicated, s
mRNA
and some viral proteins
are made.
Late translation;
A portion of viral DNA is
capsid proteins are
transcribed, producing
synthesized.
mRNA that encodes
"early" viral proteins.
Viral replication in animals generally follows these steps: attachment, entry,

uncoating, biosynthesis of nucleic acids and proteins, maturation, and release.
Knowledge of viral replication phases is important for drug development strategies,
and for understanding disease pathology.

‫بعض الفيروسات بتستخدم نفس ال‬
‫‪ RNA‬ك ‪ messenger RNA‬ويبلش‬
‫‪no‬‬ ‫عملية ال ‪ translation‬وصناعه‬
‫البروتني مباشرة‬
‫‪Ge‬‬
‫بعض الفيروسات عندها ‪ RNA‬ملا يدخل ال ‪ host‬عالخلية بقدرش ينسخ منه ال‬
‫‪ mRNA‬الزم يعمل نسخة جديدة بنسميها نسخة ‪ mRNA‬ومنها بعمل‬
‫‪ translation‬وصناعه بروتينات‬
‫مش مطلوب منا نعرف تفاصيل‬
‫حسب حكي الدكتورة بالتسجيل انه هاي خطأ مش سيتوبالزم‬ double ‫اعرف انه دخل على شكل‬
produced in the capsid ‫والصح انها‬ double ‫ وخرج على شكل‬strand
&
strand
Double-stranded RNA viruses: ‫ومثال البروتني الي تصنع‬
The capsid containing the double-stranded RNA

Viral mRNA is produced in the cytoplasm, where it’s
used to synthesize more viral proteins.
One of the newly synthesized viral proteins acts as
RNA dependent RNA polymerase to produce more -
strands of RNA
The mRNA and - strand form the double-stranded RNA
that is then surrounded by capsid proteins.
⑦ ⑦
I
‫ بشكل كامل‬capsid ‫ ال‬lysis ‫ في بداية االمر مش رح يصير‬double strand RNA ‫دخل فيروس من نوع‬
mRNA ‫ ف بتم تصنيع ال‬capsid ‫ بضل مخبي حالها تحت باقي اجزاء ال‬double strand RNA ‫وكانه ال‬
‫ وبس يتصنع بخرج عالسيتوبالزم وبجي الرايبرسوم يقرأه ويعمل منه بروتينات‬capsid ‫هان بال‬
‫ وببلش يعمل‬capsid ‫ الى داخل ال‬.‫ بيدخل‬RNA polymerase‫من احد البروتينات هي انزيم ال‬
replication of RNA
‫ وبصير تجميع للفيروسات الجديدة‬capsid ‫وبعدها يتحلل هاد ال‬

Biosynthesis of RNA Viruses That Use
DNA DNA ‫ ويعمل‬RNA ‫دخل‬
• Single-stranded RNA, produce DNA

– Use reverse transcriptase to produce DNA from
the viral genome
● Viral DNA integrates into the host chromosome
‫ العيلة يلي بتستخدم‬as a provirus -f
reverse transcriptase ‫هاد الفيروس يمتلك انزيم اسمه‬
reverse transcriptase
transcription ‫على جينات الفيروس موجود جني مل ًا يصرله‬
&– Retroviridae ‫بنصنع االنزيم‬
eg: ● Lentivirus (HIV) ‫ وهاد‬DNA ‫ ل‬RNA ‫يعني عكسي بحول ال‬reverse ‫االنزيم من اسمه‬
‫ مع‬integration ‫ الناتج بدخل عالنواة تبعت الخلية وبعمل‬DNA ‫ال‬
● Oncoviruses host chromosomes ‫ تبع هاي الخلية وبصبح جزء من‬DNA ‫ال‬

Reverse Capsid Envelope
transcriptase
gure 13.19
Virus Two identical +
strands of RNA
Host cell
Retrovirus enters by fusion
Multiplication and between attachment spikes

and the host cell receptors.
Inheritance Mature retrovirus

leaves the host cell, DNA of one
Uncoating releases the two
viral RNA strands and the
viral enzymes reverse
Processes of the acquiring an of the host cell's transcriptase, integrase,

envelope and chromosomes and protease.
attachment spikes
Viral
as it buds out. Viral DNA
Retroviridae
enzymes
Viral RNA
Reverse transcriptase
copies viral RNA to
81.
.
↓ 5
produce double-
stranded DNA.
Is i
9.
Viral proteins are processed
by viral protease; some of the
viral proteins are moved
to the host plasma membrane.
Provirus
Identical strands
Viral of RNA The new viral DNA
proteins is transported into
the host cell's nucleus,
where it's integrated into
a host cell chromosome
as a provirus by viral
integrase. The provirus
may be replicated when
the host cell replicates.
Transcription of the provirus

may also occur, producing
RNA for new retrovirus
genomes and RNA that
encodes the retrovirus
capsid, enzymes, and
envelope proteins.

Viruses and Cancer (1 of 2)
Learning Objectives
13-11 Define oncogene and transformed cell.
13-12 Discuss the relationship between DNA- and RNA-
containing viruses and cancer.

Viruses and Cancer (2 of 2)
‫كيف الفيروسات ممكن تحول الخلية لخلية سرطانية ؟‬
• Several types of cancer are caused by viruses

‫اذا حدا انصاب بفايروس ممكن من‬
– May develop long after a viral infection ‫تأثيرات الفايروس انه خال الخلية‬
-$5 ‫تتحول لخلية سرطانية بعد فترة طويلة‬
– Cancers caused by viruses are not contagious
• Sarcoma: cancer of connective tissue
• Adenocarcinomas: cancers of glandular epithelial
tissue

The Transformation of Normal Cells into
Tumor Cells
• Oncogenes transform normal cells into cancerous
cells
• Oncogenic viruses become integrated into the host
‫ بع‬E
cell’s DNA and induce tumors ‫ضغاللتخبالتياخلعنيدالهاخلبيجةينسارتهطاانيجةينات اذا تنشطت‬
‫واشت‬
• A transformed cell harbors a tumor-specific

transplantation antigen (TSTA) on the surface and a
T antigen in the nucleus -‫؟‬:‫كيف تعرف انه هاي الخلية صفاريتدالسئرلطامنثيلة‬

-
DNA Oncogenic Viruses
‫ تاعاته بعد ما‬strand ‫ يعني ال‬DNA ‫النه اصل الفيروس‬
‫ لنفسهم مع‬integration ‫ بدخلو وبعمله‬replication ‫بعمل‬
• Adenoviridae host ‫ تاعات ال‬DNA ‫ال‬
• Herpesviridae
– Epstein-Barr virus
• Poxviridae
• Papovaviridae
– Human papillomavirus
• Hepadnaviridae
– Hepatitis B virus

RNA Oncogenic Viruses
• Retroviridae
– Viral RNA is transcribed to DNA (using reverse
transcriptase), which can integrate into host DNA
● (Human T cell leukemia viruses) HTLV-1 and
HTLV-2 cause adult T cell leukemia and
lymphoma

Latent Viral Infections and Persistent
Viral Infections (1 of 2)
Learning Objectives
13-13 Provide an example of a latent viral infection.
14 Differentiate persistent viral infections from latent viral
infections.
Latent viruses :
‫هو فيروس موجود بالخلية ولكنه نايم يعني ما بعمل اشي للخلية وال‬
‫بأذيها‬
Persistent:
‫ بشكل بطيء وبخرج بشكل بطيء‬replication ‫بكون موجود ولكن بعمل‬
‫من الخلية ف تأثيره بطول ليبني هاي االصابة بنسميها‬
(Chronic infections)

➡
Latent Viral Infections and Persistent

Viral Infections (2 of 2)
• Latent virus remains in asymptomatic host cell for long
periods
– May reactivate due to changes in immunity
● ColdBsores, shingles
‫هاتو نشوف قصة هاي الحبة‬
• A persistent viral infection occurs gradually over a

long period; is generally fatal
eg.
– Subacute sclerosing panencephalitis (measles
virus)
Persistent viral infections are caused by conventional viruses; viruses
accumulate over a long period. -

‫‪Cold sores :-‬‬
‫واحد اجت الفيروس على شفته انعدى بتقعد هاي الحبة فترة وبكون سببها فيروس اسمه ‪herpes‬‬
‫‪simplex‬‬
‫وبعد فترة بتالقيه طاب وراحت هاي الحبة بس في الحقيقة الفيروس يلي فيه راح مشى‬
‫بال ‪ nerves system‬وراح نام او قعد في الخاليا العصبية يلي في ال ‪ spinal cord‬كيف قعد؟‬
‫قعد ‪ latent‬يعني هو موجود بس مش عماله بتكاثر وال بعمل اشي‬
‫بضل هيك الي لحظة ضعفت فيها مناعة هاد الشخص هاد الفيروس بتنشط وبمشي بالعقد العصبية‬
‫وبرجع لهاد املكان وبرجع يعمل الحبات‬
‫‪Shingle : -‬‬
‫نفس فكرة يلي قبل ولكن هاد الشخص بكون انصاب فيه وهو صغير وبقعد لفترااات طويلة‬
‫بعدين برجع يتنشط ع كبر بعد ال ‪ ٥٠‬و ‪ ٦٠‬بجي هاد ينتشر بكل جسمه‬
‫بنسميه زنار النار‬

‫نهايات الفيروس ملا تدخل‬
‫هاالنسان‬
‫الفيروس بتدخل عالخلية‬

‫‪ E‬حاد ولكن بطيب‬ ‫>‪-‬‬ ‫وباثر عمادتها الوراثية‬
‫وبحولها لخلية سرطانية‬
‫‪Copyright © 2019, 2016, 2013 Pearson Education, Inc. All Rights Reserved‬‬
Plant Viruses and Viroids (1 of 2)
Learning Objectives
13-15 Differentiate between virus, viroid, and prion.
13-16 Describe the lytic cycle for a plant virus.

Plant Viruses and Viroids (2 of 2)
• Plant viruses must enter plant hosts through wounds or

with invasive parasites, such as insects.
• Some plant viruses also multiply in insect (vector) cells.
• Viroids are infectious pieces of RNA that cause some plant
diseases, such as potato spindle tuber disease
Viroids :
‫ ال يتم ترجمتها او تصنيع بروتينات‬RNA ‫قطعة صغيرة من ال‬
‫منها‬
‫لُيصنع منها نسخ‬copy ‫تستخدم ك‬
‫يعني تُنسخ ولكن ال تُترجم‬

Virusoids
‫بصيب الكبد‬
6. ‫ ؟‬envelope ‫من وين اجا هاد ال‬

‫ عشان‬histon ‫ موجود‬eukaryotic ‫كيف بال‬
‫وهي طالعه اخدت جزء من ال‬
‫ يلف حواليهم‬DNA ‫ال‬
‫ تبع ال‬plasma membrane
‫ في‬histon ‫هان نفس االشي ولكن بدل ال‬
host
RNA ‫ والفف حواليه ال‬delta antigen

‫هاد معندوش اشواك‬
‫كيف بده يدخل طيب ؟‬
‫في خيارين االول انه ال ‪ hepatitis B virus‬بيعطيه من االشواك‬
‫يلي عنده عشان يقدر يدخل‬
‫والخيار الثاني هو ملا ال ‪ hepatitis B virus‬يدخل مهو هي‬
‫‪A‬‬ ‫الطريق انفتح ف هاد يلحقه وبدخل‬
‫في فيروس يصيب الكبد ‪hepatitis B virus‬‬

‫اله مادة وراثية ‪ ،capsid ، envelope ،‬اشواك‬
‫ملا يوصل هالكبد‬
‫كيف يهاجم خليه الكبد ؟‬
‫عن طريق ال ‪ receptors‬الي هو ال‬ ‫‪3‬‬
‫‪ attachment cite‬الي هي االشواك ف بتجي‬
‫بتقرب عالكبد وارتباطها بسمح بدخول‬
‫الفيروس جميعه لداخل الخلية‬

‫سؤال‬
‫لو حكينا في شخص مريض عنده اصفرار بوجهه ‪ ،‬بطنه‬
‫منفوخ ‪ ،،‬عنده وجع في البطن ‪،‬لقينا عنده ‪hepatitis D virus‬‬
‫فاملفروض تلقائًيا نعرف انه برضه عنده ‪ hepatitis B virus‬النه‬
‫‪Ge‬‬
‫لوال وجوده وال يمكن ‪ delta virus‬يصيب الخلية‬
‫ال ‪ D‬مستحيل يدخل اال اذا ‪ B‬موجود‬

Prions (2 of 3)
• Proteinaceous infectious particles
• Inherited and transmissible by ingestion, transplant, and
surgical instruments ‫ يمكن توارثها‬، ‫معدية‬
• These diseases often run in families, which indicates a
possible genetic cause
– Spongiform encephalopathies ‫ملا يصيب الدماغ بنالقي الدماغ زي منطقة االسفنج‬
● “Mad cow disease”
‫سببهم‬ ● Creutzfeldt-Jakob disease (CJD)
abnormal prion
● Gerstmann-Sträussler-Scheinker syndrome
● Fatal familial insomnia
● Sheep scrapie Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved
Prions (3 of 3)
• PrPC: normal cellular prion protein, on the cell
surface
• PrPSc: scrapie protein; accumulates in brain cells,
forming plaques
{ ‫سْر لِي‬ َ ‫شَرْح لِي‬

ِّ ‫صْدِري َوَي‬ ْ ‫با‬
ِّ ‫}َر‬

Prion diseases are caused by the conversion of a
normal host glycoprotein called PrPC (for cellular prion
protein) into an infectious form called PrPSc (for
scrapie protein).
The gene for PrPC is located on chromosome 20 in
humans.
Recent evidence suggests that PrPC is involved in
preventing cell death. ‫مشروح‬
The actual cause of cell damage isn’t yet known.

Fragments of PrPSc molecules accumulate in the
brain, forming plaques.

Figure 13.23 How a PrPS
c
Protein can be PrPS

c
Infectious PrPc produced by cells

is secreted to the cell
surface.
PrPSc may be acquired or
produced by an
altered PrPc gene.
‫ وصنع‬transcription ‫ تبعها صرله‬DNA ‫خلية عصبية ال‬

‫بروتينات عادة هاد الطبيعي انه بصنع بروتينات ومن بني هاي‬
‫ وبطلع ع سطح الخلية ومسؤول عن‬prpc ‫البروتينات بروتني اسمه‬
‫حفظ الخلية‬
‫لكن الحظو في بعض االحيان بيعتقدو انه صار خلل في عمليه ال‬
PrPSc reacts with PrPc PrPSc converts the PrPc
‫ في الجني ف بدل ما تطلعلي‬mutations ‫ او صار‬translation on the cell surface. to PrPSc.
PrPSc ‫ صار يطلعلي بروتني غير طبيعي يلي هو‬PrPc ‫البروتني‬
‫بطلع بقعد هو كمان عالسطح‬
‫كيف طلع ؟‬
‫ يا اخدته من برا مثل عملية جراحية او تلوثات‬mutated ‫يا صارت‬
‫املهم وصل للدماغ عندي‬
‫طبعا هاد تاثيره كثير سيء النه البروتني غير طبيعي رح يشبك مع‬ The new PrPSc converts The new PrPSc is taken
‫الطبيعي ويخليه مش طبيعي‬ more PrPc. in, possibly by receptor-
mediated endocytosis.
Lysosome
engulfment‫هال هاي البروتينات الغير طبيعيه ممكن يصرلها‬
‫يعني الخلية بتدخلها عالداخل‬
‫ وبعدها‬، lysosome ‫بعدها بتضلها بالداخل ويتم تحطيمه بانزيم‬
‫بترجع بتخرجه للخارج‬
Endosome
‫ بتموت وبتعمل‬abnormal protein ‫كل هاي الخاليا ال عندها‬
PrPSc accumulates in PrPSc continues to accumulate
‫ يعني فراغات وهاد السبب انه يكون الدماغ اسفنجي‬plaque endosomes. Some may as the endosome contents are
be transferred back returned to the cell surface or
to the cell surface. are transferred to lysosomes.
The result is cell death.

-‫كل الفيروسات الي مكن تالقيها ع سطح االنسان من برا او‬
The Human Virome ‫جوا‬
Most of the human virome consists of bacteriophage that
infects bacterial members of the microbiome. They can
infect and kill potential bacterial pathogens and protect
the normal microbiome by killing competing bacteria. ↳
‫ هاي البكتيريا فيها فيروسات‬-normal flora - ‫احنا بامعائنا مالن باكتيريا‬
‫بتنتج سموم ملا تخرج ع امعائي بتقتل البكتيريا املمرضة‬
Bacteriophages and Horizental gene transfer
In one type of specialized transduction, the phage codes
for certain toxins produced by their bacterial hosts, such
as:
- diphtheria toxin for Corynebacterium diphtheriae,
-
-
erythrogenic toxin for Streptococcus pyogenes,
Shiga toxin for E. coli O157:H7.
‫بتهاجم الحلق وبتعمل مرض الخناق هاي البكتيريا بتكون خطيرة اذا في بداخلها‬
2
lysogenic Corynebacterium diphtheriae ‫ تاعها فبنسميها‬DNA ‫فيروس شابك مع ال‬
diphtheriae toxin ‫بنتجلنا سم‬
‫اذا هاجمتني بتكون قاتلة‬
Copyright © 2019, 2016, 2013 Pearson Education, Inc. All Rights Reserved

Chapter 13 Viruses and Prions Summer Sem 2022 20235360 91884d04

Uploaded by

Document Information

Copyright

Available Formats

Share this document

Share or Embed Document

Sharing Options

Did you find this document useful?

Is this content inappropriate?

Copyright:

Available Formats

Chapter 13 Viruses and Prions Summer Sem 2022 20235360 91884d04

Uploaded by

Copyright:

Available Formats

Microbiology an Introduction

Thirteenth Edition, Global Edition

Viruses, Viroids, and Prions

‫الّٰلهم انفعني بما عّلمتني وعّلمني ما‬

Hadeel Ahmad 122

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

• Obligatory intracellular parasites e

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

• Most viruses infect only specific types of cells in one

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

‫— حتى بال ‪ host‬الواحد الفيروس بهاجم ‪specific cell‬‬

‫يعني لو مثال في سؤال‬

‫فيروس التنفس وصل بطريقة ما للكبد هل بيأذيه ؟‬

Tobacco mosaic virus 250 × 18 nm Plasma membrane

Vaccinia virus 300 × 200 × 100 nm

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

evola virus ‫ممكن يسالك شو شكل ال‬

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Figure 13.5 Capsid (head)

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

• Order names end in –ales (e.g. Picornavirales) W

‫تصنيفة جديدة للفيروس‬

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

‫ف اذا انا بدي اعرف هل الفيروس موجود وبيقتل البكتيريا شو اعمل ؟‬

‫لو تركت هاد الصحن كمان ايام رح تضل الفراغات تكبر‬

• In living animals ‫طيب انا باملختبر كيف بجيبهم ؟‬

– Virus injected into the egg

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

‫وهيك بعرف تاثير الفيروس‬

‫بجيبه من نسيج الخلية يلي بدي افحص‬ -

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

– RFLPs (restriction fragment length polymorphism)-

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

‫من طرق ال ‪ serological test‬اخذنا ال ‪ELISA‬‬

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

– It must take over the host’s metabolic machinery

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

‫فش ‪ host‬يعيشو فيه عشان هيك بلش‬

‫& جبنا فيروس يهاجم‬

• Lysogenic cycle Temporat cycle

– Specialized transduction lytic

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Animation: Viral Replication: Virulent

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

‫وبالنهاية بفجر الخلية وبطلع منها‬

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

lysing / Buddings 12S.

Copyright © 2021 Pearson Education Ltd. All Rights Reserved

Host plasma membrane

‫ تاع‬plasma membrane ‫جسم ال‬ ‫ تاع الفيروس يلتحم وبتحد‬envelope ‫ال‬

Figure 13.20 Budding Host cell plasma membrane

of an Enveloped Viral protein