ROLA MIKROBIOMU

1. Mikrobiom- ogół mikroorganizmów i ich genów obecnych w danym środowisku.

Mikrobiota- mikroorganizmy obecne w danym środowisku zazwyczaj znamy pozycję
taksonomiczną mikroorganizmów.
Metagenom- geny mikroorganizmów występujących w danym środowisku odniesienie
również do funkcji genów.
Metatranskryptom- pełen zestaw transkryptów obejmujący głównie mRNA, ale też tRNA,
rRNA i ncRNA.
Probiotyki
 żywe organizmy, które podawane w odpowiedniej ilości wywierają korzystny wpływ
na zdrowie gospodarza
 bakterie probiotyczne są poddawane liofilizacji
 dzienna dawka to minimum 1x 109 CFU bakterii probiotycznych

Prebiotyk

 powinien być odporny na kwaśne pH żołądka, nie może być hydrolizowany przez
enzymy ssaków ani wchłaniany w przewodzie pokarmowym
 może być fermentowany przez mikrobiotę jelitową
 może selektywnie stymulować wzrost i/lub aktywność bakterii jelitowych, co
poprawia zdrowie żywiciela
 przykład: inulina, fruktooligosacharydy, laktuloza, pochodne galaktozy i β-glukanów.
2. Nazewnictwo i systematyka bakterii:
Escherichia coli
Bacillus sp.
Bacillus spp.
Candidatus Methylomirabilis oxyfera
Carl Woese (1928-2012)
Wskazał SSU rRNA jako marker molekularny odpowiedni do odzwierciedlania pokrewieństwa
organizmów. W 1990 r. przedstawił uniwersalne drzewo filogenetyczne organizmów
żyjących, wskazujące na trzy odrębne domeny: Archaea, Bacteria i Eucarya.

Kryteria podziału bakterii:

Systemy klasyfikowania bakterii uwzględniają różne kryteria: morfologiczne, biochemiczne,

fizjologiczne, filogenetyczne oraz genetyczne;

 oparte na patogenności
 oparte na relacjach z gospodarzem
 oparte na metabolizmie bakterii
 wykorzystujące pH środowiska
 bazujące na tolerancji wobec tlenu