Białka wszystkich gatunków są zbudowane z tych samych 20 standardowych aminokwasów białkowych. Wokół asymetrycznego węgla znajdują się: grupa aminowa (NH2), grupa karboksylowa (COOH), ugrupowanie boczne, atom wodoru. Ugrupowanie boczne decyduje nad właściwościami aminokwasów. Aminokwasy niebiałkowe nie wchodzą w skład białek, należą do nich pozostałe aminokwasy. W cząsteczce gliceryny występują dwie takie same grupy (at. wodoru) połączone z węglem. Zawierający siarkę łańcuch boczny cysteiny jest hydrofobowy, ale wysoce reaktywny, zdolny do reagowania z inną cząsteczką tworzy wiązania dwusiarczkowe. (Cys – S – S – Cys = Cystyna)
Organizm człowieka potrafi wytworzyć tylko 11 aminokwasów – aminokwasy endogenne. Pozostałe
9 to aminokwasy egzogenne, które nie mogą powstać w org. człowieka mimo, że są niezbędne, są to: fenyloalanina, histydyna, izoleucyna, leucyna, lizyna, metionina, treonina, tryptofan, walina. W początkowym okresie życia również potrzebna jest arginina.
Funkcja aminokwasów: buforująca – utrzymują stałe pH środowiska. Kiedy ulega zakwaszeniu
przechodzą w kationy, a kiedy alkalizacji w aniony. Aminokwasy hydrofobowe mają zwykle podstawnik zbudowany z węgla lub wodoru (oprócz tryptofan, metionina) 2. Poziom organizacji struktury cząsteczek białek Aminokwasy łączą się ze sobą wiązaniami peptydowymi, w których uczestniczy grupa karboksylowa jednego aminokwasu i grupa aminowa drugiego aminokwasu. Peptydy od 2 do 50 aminokwasów, białka powyżej 50 aminokwasów. Struktura pierwszorzędowa Zależy do liczby i kolejności (sekwencji) aminokwasów występujących w łańcuchu polipeptydowym. Informacja o liczbie i kolejności jest zapisana w materiale genetycznym. Strukturę pierwszorzędową utrzymują wiązania peptydowe (w. kowalencyjne). Struktura drugorzędowa Strukturę drugorzędową stanowią łańcuchy polipeptydowe sfałdowane przestrzennie w alfa-helisę lub B-harmonijkę. Powstaję na wskutek wiązań wodorowych. A-helisa powstaje przez prawoskrętne zwinięcie łańcucha polipeptydowego wokół osi. B-harmonijka powstaje przez ułożenie łańcucha polipeptydowego na płaszczyźnie. Struktura trzeciorzędowa To przestrzenne ułożenie wszystkich aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym. Biologicznie aktywna (natywna) konformacja jest utrzymywana dzięki oddziaływaniom hydrofobowym, siłom elektrostatycznym (wiązania jonowe, liczne oddziaływania van der Waalsa), mostkom dwusiarczkowym i wiązaniom wodorowym. Struktura czwartorzędowa W przypadku gdy w skład wchodzi więcej niż jeden łańcuch polipeptydowy, występuje struktura czwartorzędowa. Dotyczy ona przestrzennego ułożenia, polipeptydowych jednostek, i natury oddziaływań między nimi (siły elektrostatyczne, wiązania wodorowe) 3. Klasyfikacja białek Białka dzielimy na: proste (proteiny) i złożone (składające się z aminokwasu + części niebiałkowej – gr. prostetycznej) Sferoproteiny (białka globularne) – rozpuszczalne w wodzie i rozcieńczonych roztworach soli skleroproteiny (białka fibrylarne) – nierozpuszczalne w wodzie i rozcieńczonych roztworach soli Białka proste: Albuminy – globularne; składnik surowicy krwi, utrzymują właściwe ciśnienie osmotyczne; występują w mleku jajach kurzych i nasionach niektórych zbóż Globuliny – globularne; stanowią składnik odżywczy jaj ptasich oraz nasion kukurydz; obecne w krwi – immunoglobuliny (przeciwciała) biorą udział w reakcjach odpornościowych org; alfa- i beta- globuliny odgrywają rolę w transporcie lipidów roznoszonych przez krew Histony – globularne; wchodzą w skład chromatyny jądrowej – tworzą strukturę umożliwiającą kondensacje i stabilizację DNA Kolageny – fibrylarne, po zagotowaniu przechodzą w żelatynę; występują m.in. w tk. łącznych np. ścięgnach, chrząstce, skórze właściwej Keratyny – fibrylarne; obecne w rogach, piórach paznokciach, pazurach, kopytach, włosach Miozyny – fibrylarne, struktura IV-rzędowa (6 łańcuchów polipeptydowych; występują w mięśniach, warunkują ich skurcz Fibroina – fibrylarne, nierozp. w strukturze B; tworzy nici oprzędu owadów, np. jedwabiu Fibryna (włóknik) – fibrylarne, struktura włókienkowa); krzepnięcie krwi Białka złożone: Metaloproteiny – grupę prostetyczna tworzy/ą atom(y) metalu związane wiązaniami kowalencyjnymi; transferyna: białko osocza krwi transportujące żelazo (Fe 3+); ferrytyna: białko stanowiące formę zapasową żelaza w wątrobie; ferredoksyna: białko odpowiedzialne u fotoautotrofów za transport elektronów. Zawiera żelazo, podobnie jak hemerytryna, barwnik osocza krwi wieloszczetów; plastocyjanina: zawiera miedź, transportuje elektrony u autotrofów; Hemocyjanina: barwnik osocza u m.in. mięczaków. We krwi miedź jest transportowana w postaci ceruloplazminy Chromoproteiny - barwniki skompleksowane z białkiem; hem: czerwony barwnik o budowie porfiryny połączonej z żelazem. Wchodzi w skład hemoglobiny – białko odpowiedzialne za transport tlenu u kręgowców; jest też składnikiem mioglobiny – białko magazynujące tlen w mięśniach; cytochromów – enzymy przenoszące elektrony w łańcuchu oddechowym; katalazy – enzymu rozkładający nadtlenek wodoru; Fosfoproteiny – kwas fosforowy; kazeina – składnik mleka Lipoproteiny – lipidy, głównie lecytyny i kefaliny; we krwi odpowiadają za transport cholesterolu; istotne elementy membran komórkowych , obecne w substancji białej mózgu Glikoproteiny – oligosacharydy, polisacharydy; wchodzą w skład śliny, nadając jej lepkość; znajdują się na powierzchni błon komórkowych (składnik glikokaliksu), gdzie jako receptory odbierają informacje dochodzące do komórki oraz występują w otoczkach erytrocytu Nukleoproteiny – kwasy nukleinowe połączone wiązaniami jonowymi z histonami oraz mostkami wodorowymi z białkami niehistonowymi; chromatyna jądrowa, z której tworzą się chromosomy – struktury powstające w wyniku silnego skondensowania chromatyny przed podziałem komórki 4. Właściwości białek Białka tworzą makrocząsteczki Zdolność aminokwasów do tworzenia jonów obojnaczych warunkuje charakter amfoteryczny białek. Każde białko ma swój punkt izoelektryczny – wartość pH, w którego obecności cząsteczek białka ma tyle samo ładunków ujemnych co dodatnich Białka globularne tworzą w wodzie roztwory koloidalne o normalnej lepkości (zole). Żele o dużej lepkości utworzone są z makrocząsteczek włóknistych Białka mają labilny charakter, ponieważ ulegają denaturacji pod wpływem: o Wysokiej temperatury (50o – 100o) o Bardzo niskiego pH (<2) lub bardzo wysokiego pH (>12) o Mocnych detergentów o Soli metali ciężkich (Hg, Pb) o Promieni UV o Dużego stężenia mocznika Renaturacja – proces przeciwny do denaturacji. Polega na odtworzeniu uprzednio zniszczonej struktury przestrzennej. Informacja dotycząca tworzenia struktury przestrzennej jest zawarta w sekwencji aminokwasów, która podczas denaturacji nie ulega zmianie.
Zmiana sekwencji może nastąpić na skutek mutacji np. anemia sierpowata
5. Biologiczne znaczenie białek Funkcje: strukturalną regulacyjną odpornościową zapasową transportową Zestaw białek występujący w komórce decyduje o jej morfologii i funkcjach fizjologicznych