Professional Documents
Culture Documents
WĘGLOWODANY (CH2O)n:
• monosacharydy (cukry proste):
ú cechy:
› małe cząst. zawierające 3-9 at. C z przyłączona gr. OH
› różnią się wielkością i konfiguracja stereochemiczną w >=1 centrum węglowym
› można je łączyć w różnorodne struktury oligosacharydowe
ú funkcje:
› paliwo energetyczne
› podstawowy składnik org. żywych (np. szkielet DNA)
› zmodyfikowane mogą sluzyc jako czast. sygnalowe
ú podział:
› ze wzgl. na grupę funkcyjną:
– ketozy (np. dihydroksyaceton)
– aldozy (np. aldehyd D/L-glicerynowy)
› ze wzgl. na liczbę at. C:
– triozy, tetrozy, pentozy, heksozy, heptozy
› ze wzgl. na formę izomeryczną:
– konstytucyjne (gr. funkcyjne przyłączone do różnych at. C)
– stereoizomery (gr. funkcyjne przyłączone do tych samych at. C, ale ich układ
przestrzenny się różni; 2^n – n to liczba asymetr. at. C):
(a) enancjomery (lustrzane odbicia; D/L)
(b) diastereoizomery (nie sa lustrzanymi odbiciami)
(i) epimery (roznica w konf. w liniowym węglowodanie)
(ii) anomery (roznica w konf. w pierścieniowym węglowodanie; /)
ú heksozy w formie cyklicznej:
› cyklizacja dzięki faktom, że:
– aldehyd+alkoholhemiacetal
(a) np. glukoza
(b) szescioczlonowy pierscien to piranoza
– keton+alkoholhemiketal
(a) np. fruktoza
(b) piecioczlonowy pierscien to furanoza (może tez być szescioczlonowy – to
zależy z którym C się polaczy)
› anomery (at. C1 – anomeryczny):
– w piranozowej strukturze:
(a) -jeśli gr.OH przy at.C1 jest po przeciwnej stronie pierścienia w stos. do
at.C6
(b) -jeśli gr.OH przy at.C1 jest po tej samej stronie pierścienia co at. C6
– w furanozowej strukturze (at. C2 – anomeryczny)
› konformacje:
– piranoza: krzesełkowa (podstawniki w orient. aksjalnej i ekwatorialnej),
łódkowa
– furanoza: forma kopertowa (w zal. od tego, który at. C jest poza płaszczyzną:
C3-endo/C2-endo)
› roztwor Fehlinga:
– glukoza jest cukrem redukującym, redukuje Cu2+ do Cu+ i utlenia się do
kwasu glukonowego
– roztwor używany do sprawdzenia obecności cukrow redukujących
– ma znaczenie w monitorowaniu zmian ilości glikozylowanej hemoglobiny
(tym samym w leczeniu cukrzycy); więcej glikozylowanej hemoglobiny u
cukrzykow, co zmienia prawidlowa funkcje biochemiczna zmodyf. bialek (te
modyfikacje to AGE – advanced glycation end products)
ú łączenie się w. glikozydowymi z alkoholami i aminami:
› anomeryczny at. C + at. O alkoholu = wiązanie O-glikozydowe
– dominuje, kiedy weglowod. są polaczone ze sobą w dlugi polimer i kiedy
przylaczaja się do bialek
› anomeryczny at. C + at. N aminy = wiazanie N-glikozydowe
– np. kiedy zasady azotowe sa przyłączone do jednostek rybozy tworząc
nukleozydy
› inny at. C niż anomeryczny – tez możliwa modyfikacja
ú fosforylacja:
› sprawia, ze cukry staja się anionami – ujemny ladunek chroni je przed
samorzutnym uwolnieniem z komórki poprzez blony i zapobiega oddziaływaniu z
transporterami niemodyfikowanego cukru
› dzięki niej powstają reaktywne związki pośrednie, które latwo tworza polaczenia z
innymi czasteczkami
• węglowodany złożone:
ú kierunki oligosacharydów zdefiniowane przez redukujące i nieredukujace końce
› jednostka na końcu redukującym ma wolny anomeryczy at. C (który ma char.
redukujący bo może tworzyć postac otwartego lancucha
› koniec redukujący jest tak nazywany nawet po polaczeniu z inna czast. (np. z
białkiem)
ú disacharydy (2 cukry polaczone w. O-glikozydowym):
› sacharoza – glukoza (w. glikozydowe ) + fruktoza (w. glikozydowe ); hydroliza
przeprowadzana przez sacharaze
› laktoza – glukoza + galaktoza (przez w. -1,4-glikozydowe); hydroliza u ludzi
przeprowadzana przez laktazę, u bakterii przez -galaktozydaze
› maltoza – 2*glukoza (przez w. -1,4-glikozydowe); powstaje w wyniku hydrolizy
skrobii i glikogenu; hydroliza przeprowadzana przez maltaze
ú polisacharydy (wolne czast. glukozy nie mogą być przechowywane, bo zaklociloby to
rownowage osmotyczna); glikogen i skrobia sa hydrolizowane przez -amylaze:
› glikogen (homopolimer) – zapasowa forma glukozy:
– kluczowe występowanie: miesnie i watroba
– większość reszt glukozy polaczona w. -1,4-glikozydowym, rozgałęzienia w
miejscach wiazan -1,6-glikozydowych (co 10 reszt glu)
› skrobia (homopolimer) – roslinna subst. zapasowa; mniej rozgalezien niż w
glikogenie; wystepuje w dwóch formach:
– amyloza – bez rozgalezien, zbudowana z glu polaczonych -1,4-
glikozydowymi
– amylopektyna – rozgaleziona, jedno w. -1,6-glikozydowe na ok. 30 w. -1,4-
glikozydowych
› celuloza (homopolimer) – pełni funkcje strukturalna jako składnik sciany kom.:
– jeden z najobficiej występujących zw. org. w biosferze
– nierozgaleziona
– reszty glu polaczone w. -1,4-glikozydowymi – dzięki konf. celuloza może
tworzyć długie, proste lancuchy
– rownolegle lancuchy oddzialowuja ze sobą przez w. wodorowe i tworza
sztywne, podtrzymujące struktury wlokien (fibryli); wykazują wytrzymalosc
na rozciąganie
– mimo braku celulaz u ssakow, celuloza i inne wlokna pochodzenia roślinnego
sa ważnym skl. diety
(a) rozpuszczalne wlokna, np. pektyna – spowalniają ruch w ukl.
pokarmowym, ulatwiajac trawienie i wchłanianie skl. odżywczych
(b) nierozpuszczalne wlokna, np. celuloza – przyspieszaja przesuwanie się
produktów trawienia w jelicie grubym
ú synteza oligosacharydów:
› powstają w wyniku aktywnosci specyf. enzymow – glikozylotransferaz, które
katalizują tworzenie wiazan glikozydowych
› najpowszechniejsze donory weglowodanow dla glikozylotransferaz: zaktywowane
kompleksy cukier-nukleotyd
– np. UDP-glukoza
› akceptorem może być jedna z wielu bioczasteczek (np. bialka, węglowodany)
ú sekwencjonowanie oligosacharydów:
› uzycie enzymow które przecinają oligosacharydy w specyf. punktach
› 1. etap: odlaczenie oligosacharydu od bialka
– np. oligosach. przyłączone w. N-glikozydowymi mogą być uwalniane z bialek
przez enzym – N-glikozydaza peptydowa F
› 2. etap: izolacja oligosach. i jego analiza
– np. uzycie MALDI-TOF i innych technik spektrometrii mas (pozwala na
określenie masy danego fragmentu)
– aby uzyskac więcej informacji możemy poprzecinać oligosach. z uzyciem
enzymow o roznych specyf. substratowych, np. -1,4-galaktozydazy (przecina
w. -glikozydowe tylko przy resztach galaktozy)
› otrzymany produkt ponownie analizujemy przy uzyciu spektrometrii mas
• tworzą glikoproteiny:
ú lacza się kowalencyjnie z białkami
ú klasy:
› glikoproteiny:
– składnik białkowy dominuje pod względem masy
– funkcje:
(a) w blonie kom. uczestniczą w adhezji kom. i oddziaływaniu plemnikow z
kom. jajowymi
– mogą powstawać w wyniku przyłączenia weglowodanow przez bialka
rozpuszczalne
– wiele spośród bialek uwalnianych z kom. ulega glikozylacja lub modyfikacji
na skutek przyłączenia się weglowodanow
› proteoglikany
– skl. białkowy sprzężony z polisacharydem – glikozaminoglikanem
(a) składa się z powtarzających się jednostek disacharydowych, zawierających
pochodną cukru – glukozaminę lub galaktozamine
(b) co najmniej 1 z 2 cukrow w każdym disacharydzie ma ujemnie naladowana
gr. COO- lub OSO3-
(c) glikozaminoglikany u zwierzat: heparyna, hialuronian, siarczan
chondrointy, siarczan keratanu, siarczan dermatanu
(d) mukopolisacharydozy – grupa chorob spowodowanych niemoznoscia
rozkładu glikozaminoglikanow
– węglowodany stanowią większość masy
– funkcje:
(a) elementy strukturalne i smar
– przykład: proteoglikan – agrekan i bialko – kolagen to elementy chrząstki
(a) potrojna helisa kolagenu daje odp. strukturę i odporność na rozciąganie
(b) agrekan amortyzuje wstrząsy (dzięki ujemnie naladowanym grupom
glikozaminoglikanow, które absorbują wode, a ta woda umozliwia
proteoglikanowi powrot do poprzedniego kształtu po zdeformowaniu)
(c) białkowy składnik agrekanu ma 3 domeny globularne
› mucyny/mukoproteiny
– zawierają glownie węglowodany
– skl. białkowy obficie glikozylowany w obrebie Ser i Thr
– urgupowanie węglowodanowe laczace się z białkiem – N-
acetylogalaktozamina (aminocukier – gr. aminowa zastepuje gr. OH)
– mogą tworzyć duże polimeryczne struktury
– ich char. cecha jest obecność w białku VNTR (rejonu zmiennej liczby
tandemowych powtorzen) bogatego w Ser i Thr, które ulegaja O-glikozylacji
– funkcje:
(a) podstawowy składnik sluzu, pelniacego funkcje smaru
(b) tworza bariere ochronna na powierzchni kom. nablonkowych
ú glikozylacja zwieksza zlozonosc proteomu – dane bialko z kilkoma potencjalnymi
miejscami glikozylacja ma wiele form glikozylowanych (glikoform), z których kazda
może powstawać tylko w określonym typie kom. i stadium rozwojowym
ú weglowodan + Asn przez w. N-glikozydowe
› do Asn może przylaczyc się cukier tylko kiedy jest ona czescia sekw.:
Asn-X-Ser/Thr (gdzie X to dowolny aa oprócz Pro)
ú weglowodan + Ser/Thrprzez w. O-glikozydowe
ú to czy miejsca w białku sa glikozylowane zależy od roznych aspektow budowy bialka
i od typu komórki
ú wszystkie oligosacharydy w glikoproteinach (polaczone w. N-glikozydowym)
zawierają wspólny rdzen:
› 3*mannoza
› 2*N-acetyloglukozamina
ú do rdzenia sa przyłączone inne cukry zapewniające roznorodnosc cukrow
ú erytropoetyna (EPO) – glikoproteinowy hormon
› obecna w surowicy krwi
› stymuluje wytwarzanie krwinek czerwonych (dzięki temu jest uzyteczna w
leczeniu anemii)
› aminokwasy+3*Asn(N-glikozylowane)+Ser(O-glikozylowana)
› glikozylacja zwieksza stabilność bialka we krwi
• lektyny (białka specyficzne, wiążące węglowodany):
ú naleza do większej grupy bialek wiazacych glikany
ú ulatwiaja oddziaływania miedzy komorkami:
› lektyna zawiera >=2 miejsca wiazania jednostek węglowodanowych
› lektyny na pow. jednej kom. oddzialuja z szeregiem weglowodanow
eksponowanych na pow. drugiej kom.
› lektyny i węglowodany sa polaczone słabymi oddz. niekowalencyjnymi, co
zapewnia specyficzność ale także pozwala na ich rozlaczenie w razie potrzeby
ú klasy:
› typu C – wymagające wapnia
– wspolna cecha – domena odpowiedzialna za wiązanie weglowodanow
(konkretnie to ca2+ wiaze)
– Ca2+ jako pomost miedzy białkiem a węglowodanem, przez oddz. z gr. OH
cukru
– 2*reszta Glu wiaze zarówno Ca2+ i cukier
– inne lancuchy boczne tworza w. wodorowe z innymi gr. OH węglowodanu
– biora udział w endocytozie zależnej od receptora i uczestniczą we wzajemnym
rozpoznawaniu komorek
› selektyny (naleza do typu C):
– podczas odpowiedzi zapalnej wiaza kom. ukl. immunologicznego w miejscu
urazu
– L, E i P wiaza się specyficznie z węglowodanami wystepujacymi:
(a) L – na pow. naczyń wezlow chłonnych
(b) E – na pow. srodblonka
(c) P – na aktywowanych plytkach krwi
› typu L:
– kalneksyna i kalretikulina – ważne chaperony w ER
– nasiona roślin strączkowych sa w nie bogate
– maja właściwości owadobojcze
GLIKOZYLACJA:
• szczególnie wazna reakcja - kowalencyjne przyłączenie N-acetyloglukozaminy (GlcNAc)
do Ser lub Thr w białkach kom. (GlcNAcylacja)
ú katalizowana przez transferazę GlcNAc
ú stęż. GlcNAc odzwierciedla metabolizm składników odżywczych wskazując, ze sa
obfite
ú bialka poddawane GlcNAcylacji to m.in. czynniki transkrypcyjne i el. szlakow
sygnałowych
ú miejsca GlcNAcylacji to tez potencjalne miejsca fosforylacji (wiec transferaza O-
GlcNAc i kinazy białkowe modulują wzajemnie swoje funkcje sygnalizacyjne)
ú odwracalna – N-acetylo-D-glukozaminidaza katalizuje usuwanie cukrow
• zachodzi w swietle retikulum endoplazmatycznego i aparatu Golgiego
ú bialko jest syntetyzowane na rybosomach zwiazanyvh z blona ER
ú rosnący lancuch polipeptydowy jest wprowadzany do swiatla ER
ú w ER rozpoczyna się przylaczanie weglowodanow w. N-glikozydowymi
ú oligosacharyd, który ma być związany z Asn w białku jest przylaczany do końcowej
gr. fosforanowej fosforanu dolicholu (specyf. cząst. lipidowej wystepujacej w blonie
ER i zawierającej ok. 20 jednostek izoprenowych)
ú taka postac oligosacharydu (bogata w en.) jest przenoszona na Asn rosnącego
lancucha polipeptydowego przez enzym
ú bialka w swietle ER i w blonie ER sa transportowane do AG
ú w AG wiązanie N-glikozydowe jest kontynuowane (a cukry już dolaczone do bialka
ulegaja modyfikacjom), a O-glikozydowe się zaczyna i odbywa tylko tam
ú AG jest centrum sortującym – bialka przechodzą stad do lizosomów, pecherzykow
sekrecyjnych lub do blony plazmatycznej, w zaleznosci od sygnalow zakodowanych w
sekw. aa. i trzeciorzędowej struktury bialek
• grupy krwi wynikają z roznych schematow glikozylacji bialek:
ú okreslona grupa krwi oznacza obecność jednego z trzech weglowodanow (A, B, O) na
powierzchni erytrocytów
ú A, B i O maja wspólny rdzen oligosacharydowy – antygen O
ú antygeny A i B roznia się od antygenu O obecnoscia dodatkowego monosacharydu,
polaczonego w. -1,3-glikozydowym z reszta galaktozy w obrebie O
› N-acetylogalaktozaminy (A)
› galaktozy (B)
ú te dodatkowe monosacharydy sa dodawane do antygenu O przez specyficzne
glikozylotransferazy
ú kazdy dziedziczy gen kodujący jedna glikozylotrasferaze danego typu
› transferaza A – przylacza N-acetylogalaktozamine
› transferaza B – przylacza galaktozę
› transferaza nieaktywna (powstala w wyniku mutacji) – nic nie przylacza, jest
grupa krwi O
WIRUS GRYPY:
• rozpoznaje reszty kwasu sjalowego (polaczone z resztami galaktozy) które wystepuja w
glikoproteinach na pow. kom.
• bialko wirusa wiazace się z tymi cukrami to hemaglutynina
• po związaniu hemaglutyniny wirus zostaje wchloniety przez kom. i zaczyna się
replikować
• zlozenie wirusa powoduje paczkowanie czastki wirusowej z komórki
• po kompletnym zlozeniu czastka wirusowa nadal jest przylaczona do kw. sjalowego
• inne bialko wirusa (neuraminidaza/sjalidaza) rozcina w. glikozydowe miedzy kw.
sjalowym i pozostala czescia kom. glikoproteiny
• uwolnione wirusy mogą infekować kolejne komórki
ZARODZIEC SIERPOWATY:
• pasożytniczy pierwotniak wywolujacy malarie
• tez wykorzystuje wiązanie glikanu aby zainfekować kom. gospodarza
• bialka wiazace glikan wstrzykniętego przez komara pasożyta wiaza się w wątrobie z
glikozaminoglikanem – siarczanem heparyny, inicjując wejście pasożyta do kom.
• po wyjściu z wątroby pasożyt atakuje erytrocyty za pomocą innego bialka wiazacego
glikan żeby zwiazac się z weglowodanowa jednostka glikoforyny (ważna glikoproteiny
blonowej erytrocytów)
LISTA 8: