Professional Documents
Culture Documents
Біохімія Лекція Біохімія Як Наука Ферменти
Біохімія Лекція Біохімія Як Наука Ферменти
Халіл Жибран
Лекція №1
“Біохімія як наука: біомолекули, метаболічні шляхи.
Ферменти: будова, властивості, класифікація.
Механізм дії ферментів. Регуляція ферментативних
процесів. Медична ензимологія.”
План
1. Ферменти: будова, властивості, класифікація.
2. Механізм дії ферментів.
3. Методи визначення активності ферментів.
4. Кінетика ферментативних реакцій.
5. Інгібітори та активатори ферментів, їх застосування в
медицині.
6. Регуляція ферментативних процесів.
7. Медична ензимологія: ензимопатологія,
ензимодіагностика, ензимотерапія.
РОЗДІЛИ БІОХІМІЇ
амфотерність;
рухливість в електричному полі;
в ізоелектричній точці втрачають
свою рухливість;
не здатні до діалізу;
легко осаджуються із водних
розчинів за низьких температур
методом висолювання;
ВЛАСТИВОСТІ ФЕРМЕНТІВ
висока специфічність
(відносна, індивідуальна,
стереоспецифічність),
термолабільність
(температурний оптимум -37-40оС),
оптимум рН.
Вплив температури на активність
ферментів
Правило Вант-Гоффа: для хімічних
процесів, які каталізуються небіологічними
каталізаторами швидкість реакції зростає
вдвічі при підвищенні температури на
кожні 10 ° С.
Температура, при якій швидкість
ферментативної реакції максимальна,
називається температурним оптимумом
37-40 ° С.
Однак, лужна фосфатаза печінки стабільна
Вплив температури на швидкість
реакції, яка каталізується ферментом при температурі 50 ° С, а фермент м’язів
(стрілка – це оптимум температури). міокіназа витримує навіть +100 ° С.
А- підвищення швидкості реакції; Низькі температури інгібують їх дію, не
Б- зниження швидкості реакції руйнуючи структури.
внаслідок денатурації білка-ферменту.
Вплив рН на активність ферментів
Вплив рН на швидкість
реакції, яка каталізується ферментом
(стрілка – це рН оптимум).
ПРОСТІ І СКЛАДНІ ФЕРМЕНТИ
АПОФЕРМЕНТ
білкової природи
СКЛАДНІ
ФЕРМЕНТИ КОФЕРМЕНТ
небілкової природи
КОФАКТОР
небілкової природи
Небілкову частину фермента, яка міцно звязана з
поліпептидним ланцюгом ковалентними зв᾽язками,
називають простетичною групою.
код
• 1 цифра – номер класу,
• 2 – номер підкласу, (уточнює дію ферменту)
• 3 – номер підпідкласу, (вказує на природу субстрату
чи акцептора)
• 4 – порядковий номер ферменту.
1.1.1.1. Алкоголь: НАД-оксидоредуктаза
(Алкогольдегідрогеназа)
МЕХАНІЗМ ДІЇ ФЕРМЕНТІВ
Зміна вільної енергії під час хімічної реакції, що
каталізується і не каталізується ферментом
Електрофільні групи:
NH3 +- групи Арг, Ліз;
іони металів-кофакторів: Mg2+, Fe3+,Mn2+,Cu2+ .
ОСНОВИ КІНЕТИКИ ФЕРМЕНТАТИВНИХ ПРОЦЕСІВ
Швидкість ферментативної реакції виражається у зміні концентрації
субстрату (зменшення) або продукту (збільшення) за одиницю часу:
dS dP
V
t t
ЗАЛЕЖНІСТЬ ШВИДКОСТІ ФЕРМЕНТАТИВНОЇ
РЕАКЦІЇ ВІД ТЕМПЕРАТУРИ
Оптимальні значення рН
для деяких ферментів
Фермент рН
Піруваткарбоксиназа 4,8
Фумараза 6,5
Каталаза 6,8 – 7,0
Уреаза 6,8 – 7,2
Карбоксипептидаза 7,5
Активатори та інгібітори
Активатори:
• HCl - пепсин,
• жовчні кислоти – ліпаза,
• Cu – церулоплазмін,
• Fe – цитохромоксидаза,
• Zn – карбоангідраза.
Інгібітори:
• Неспецифічні – фактори, дія яких непов'язана з
механізмом дії ферментів (нагрівання, концентровані
кислоти та луги, солі важких металів).
• Специфічні – мають вибіркову дію стосовно певних
ферментів або груп ферментів.
ІНГІБУВАННЯ
ФЕРМЕНТАТИВНОЇ АКТИВНОСТІ
Зворотне інгібування
А. Конкурентне інгібування
E S ES E P
E I EI
Конкурентні інгібітори – ліганди,
які за своєю хімічною структурою
близькі до субстрату і
взаємодіють з тим самим
активним центром ферменту, що і
субстрат (антивітаміни,
антиметаболіти).
Інгібування
сукцинатдегідрогеназної реакції малоновою кислотою
Сукцинат зв'язується з активним
центром ферменту сукцинат-
дегідрогенази
Під час ферментативної реакції
відбувається відщеплення двох
атомів водню від сукцинату та
приєднання їх до коферменту FАD. У
результаті утворюється фумарат,
який звільняється з активного
центру сукцинатдегідрогенази
Малонова кислота – структурний
аналог сукцинату, вона також
зв'язується з активним центром
сукцинат-дегідрогенази. При цьому
хімічної реакції не відбувається
Лікарські препарати як конкурентні інгібітори
Схема активного центру ацетилхолінестерази
E S ES E P
E I EI
ES I ESI
Неконкурентні інгібітори не є
структурними аналогами субстратів.
можуть зв'язуватися з ферментом, або з
фермент-субстратним комплексом,
утворюючи неактив-ий комплекс.
Приєднання неконкурентного інгібітора
викликає зміну конформації молекули
таким чином, що порушується взаємодія
субстрату з активним центром ферменту
ІНГІБУВАННЯ
ФЕРМЕНТАТИВНОЇ АКТИВНОСТІ
Незворотне інгібування
НЕЗВОРОТНЕ ІНГІБУВАННЯ спостерігають у випадку
утворення ковалентних стабільних зв'язків між молекулою
інгібітора та ферменту.
Диізопропілфторфосфат
належить до специфічних
незворотних інгібіторів, оскільки
він утворює ковалентний зв'язок
із гідроксильною групою серину,
який знаходиться в активному
центрі та відіграє ключову роль у
процесі каталізу.
Монойодацетат,
парахлормеркурібензоат–
неспецифічні інгібітори, оскільки
вони реагують з будь-якими
вільними SН-групами білків.
Пацієнці з глаукомою
призначили пірофос
(ФОС), який пригнічує
активність
ацетилхолінестерази.
Тип інгібування?
Фосфорорганічні сполуки:
інсектициди - хлорофос, карбофос, тиофос, метафос;
лікарські засоби - фосфакол, фосарбін (пірофос), нібуфін;
бойові отруйні речовини нервово-паралітичної дії - зарин,
зоман, V-гази.
ОСНОВНІ СПОСОБИ РЕГУЛЯЦІЇ АКТИВНОСТІ
ФЕРМЕНТІВ
алостерична регуляція
ковалентна модифікація
аденілатциклазна система
E1 E2 E3 E4
A B C D F
Дія негативного
ефектора (інгібітора)
Дія позитивного
ефектора (активатора)
АЛОСТЕРИЧНА РЕГУЛЯЦІЯ
+
E1 E2 E3 E4
A B C D F
Фосфорилювання
відбувається ферментами
протеїнкіназами, а
дефосфорилювання –
фосфопротеїн-
фосфатазами
РЕГУЛЯЦІЯ ЧАСТКОВИМ ПРОТЕОЛІЗОМ
місце гідролізу
ентеропептидаза
Н2N—Вал—(Асп)4—Ліз—Іле—Вал—... трипсиноген
Н2N—Вал—(Асп)4—Ліз—СООН + Н2N—Іле—Вал—...
гексапептид трипсин
• Від неактивної форми ферменту (проферменту,
зимогену) відщепюється пептидний фрагмент,
відбуваються конформаційні зміни з утворенням
активного центру.
• Приклад – протеолітичні ферменти:
(пепсин, трипсин, хімотрипсин).
АДЕНІЛАТЦИКЛАЗНА СИСТЕМА
ГОРМОН ЗВ'ЯЗУЄТЬСЯ З
РЕЦЕПТОРОМ НА КЛІТИННІЙ
МЕМБРАНІ
активація (інактивація)
аденілатциклази
через G-білки
СИНТЕЗ ц АМФ
АТФ 3,5-АМФ (цАМФ)
+ФФн
АКТИВАЦІЯ ПРОТЕЇНКІНАЗИ
КІНАЗА
ФОСФОРИЛАЗИ
ФОСФОРИЛЮВАННЯ -
ДЕФОСФОРИЛЮВАННЯ
АКТИВАЦІЯ
(ІНАКТИВАЦІЯ)
ФЕРМЕНТІВ
Вплив регуляторних білків
ЕНЗИМОПАТОЛОГІЯ
ЕНЗИМОДІАГНОСТИКА
ЕНЗИМОТЕРАПІЯ
ЕНЗИМОПАТОЛОГІЯ
АЛІМЕНТАРНІ
ТОКСИЧНІ
зумовлені дефіцитом або
зумовлені зміною
дисбалансом
кількості або активності
водорозчинних вітамінів,
ферментів
макро- і мікроелементів
ЕНЗИМОДІАГНОСТИКА
Клітинні
ферменти
Органоспецифічні Органонеспецифічні
ферменти ферменти
(індикаторні, каталізують
маркерні)- універсальні реакції
локалізуються в обміну, локалізуються
одному або кількох в більшості органів і
органах . тканин (гексокіназа).
ЕНЗИМОДІАГНОСТИКА
Печінка
Аланінамінотрансфераза (АлАТ)
Сорбітолдегідрогеназа
Аргіназа
ЛДГ4. ЛДГ5
Підшлункова залоза
Трипсин
Шлунок
Хімотрипстн пепсин
амілаза
ЕНЗИМОДІАГНОСТИКА
Інфаркт міокарду
Лактатдегідрогеназа
(ЛДГ)
ЛДГ1 (Н4)
Креатинфосфокіназа (КФК) ЛДГ2 (Н3М1)
ЕНЗИМОДІАГНОСТИКА
Секреторні
ферменти – Екскреторні
синтезуються в
ферменти –
печінці, виділяються у
синтезуються в
плазму крові:
печінці, підшлунковій
холінестераза,
залозі, слизовій
церулоплазмін,
оболонці кишок,
ліпопротеїнліпаза.
виділяються з жовчю
лужна фосфатаза,
ліпаза.
ЕНЗИМОТЕРАПІЯ
замісна терапія
первинна обробка ран
Фестал, Панзинорм,
Трипсин, Хімотрипсин
Мезим, Креон
2.Ю.І. Губський, І.В. Ніженковська, М.М. Кордатаін. ; за ред. Ю.І. Губського, І.В. Ніженковської.
Біологічна і біоорганічна хімія: у 2 кн.: підручник. Кн. 2. Біологічна хімія – К.: ВСВ “Медицина”,
2016; 544 с.
3.Банк тестових завдань до модуля No1 і модуля No2 з дисципліни «Біологічна хімія» для студентів
2-го і 3-го курсів фармацевтичного факультету. – ДВНЗ «Івано-Франківський національний
медичний університет», ас. Курас Л.Д., ас. Парцей Х.Ю., ас. Мельничук Л.В., 2015.
Допоміжна
2.Біохімія: підручник / за заг. ред. проф. А. Л. Загайка, проф. К. В. Александрової –Х.: Вид-во
«Форт», 2014;728 с.
4.Біохімічні показники в нормі і при патології. Довідник / За ред. Склярова О. Я. –Київ : Здоров’я,
2007;320 с. 62
Дякую за увагу !