Professional Documents
Culture Documents
MOLEKULARNA BIOLOGIJA
Molekularna biologija
NUKLEINSKE KISELINE
NUKLEINSKE KISELINE
Dezoksiribonukleinska
kiselina (DNK) i
Ribonukleinskakiselina (RNK)
Nukleinske kiseline su
makromolekuli, POLIMERI
koji se sastoje iz sitnijih
jedinica NUKLEOTIDA
(MONOMERI), koji su
međusobno povezani u
polinukleotidni lanac.
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
Jedino je kod jedne podgrupe virusa ( RNK virusi), nosilac genetičke informacije RNK
a ne DNK.
Molekularna biologija
DEZOKSIRIBONUKLEINSKA KISELINA - DNK
DNK je NASLEDNA SUPSTANCA i nosilac naslednih informacija u ćeliji.
DNK SADRŽI GENETIČKE ŠIFRE ZA SINTEZU PROTEINA I SVIH VRSTA RNK.
Najveća količina DNK se nalazi u jedru gde zajedno sa proteinima obrazuje hromozome.
Znatno manja količina nalazi se u mitohondrijama a kod biljnih ćelija i u hloroplastima.
Jednoprstenasti pirimidini
Dvoprstenasti purini
Molekularna biologija
DEZOKSIRIBONUKLEINSKA KISELINA - DNK
Azotne baze predstavljaju specifični deo svakog nukleotida tako da od njih zavisi i kakav će nukleotid biti.
Razlikujemo dve grupe azotnih baza:
DVOPRSTENASTI PURINI
JEDNOPRSTENASTI PIRIMIDINI
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
Azotna baza
(npr.timin)
FOSFAT
DEZOKSIRIBOZA
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
Nukleotid DNK je izgradjen od pentoznog šećera dezoksiroboze za čiji je C1 atom vezana azotna baza a za
C5 atom fosfatna grupa.
DVOPRSTENASTI JEDNOPRSTENASTI
PURINI PIRIMIDINI
BAZA
FOSFAT
3
ADENIN ( A ) TIMIN ( T )
DEZOKSIRIBOZA
GUANIN ( G ) CITOZIN ( C )
Azotne baze predstavljaju specifični deo svakog nukleotida tako da od njih zavisi i kakav će nukleotid biti.
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
Baza Baza
Šećer Šećer
NUKLEOZID NUKLEOTID
NUKLEOZID NUKLEOTID
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
NH2
N
azotna
baza
=O
N
-
O CC55
fosfatna -
O - P - O -CH2
grupa O
O- CC11
H H
H H
OH H
šećer
nukleozid
nukleotid
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
HOCH2 OH
O
H H dezoksiriboza
H
H C2
C 5’
O OH H
4’ 1’
3’ 2’ HOCH2 OH
O
pentoza
H H riboza
H
H C2
OH OH
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
C-NH2
HC N
C
HC C=O
NH C=O
4 citozin HC NH
5 3 N
U
6
1
2 HC C=O
N C=O NH
H3C-C NH uracil
P I R I M I D I N
T
HC C=O
NH
timin
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
N C-NH2
C
N
HC A
CH
C
N NH N
7 6 N
5 1 adenin
8
4 2
9 3
N N N C=O
C
NH
P U R I N
HC G
C-NH2
C
NH N
guanin
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
dezoksiadenozin 5’-monofosfat
(dAMP)
dezoksiguanozin 5’-monofosfat
(dGMP)
dezoksicitidin 5’-monofosfat
(dCMP)
dezoksitimidin 5’-monofosfat
(dTMP)
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
Baza
5
Fosfo-
diestarske Fosfodiestarska veza se gradi izmedju fosfatne
veze
grupe na C5 atomu novog nukleotida i hidroksilne
grupe na C3 atomu prethodnog nukleotida.
To znači da novi polinukleotidni lanac uvek mora
5 da raste u 5’ – 3’ smeru.
Baza
5
3 Fosfatna
Na početku lanca nalazi se slobodna fosfatna
grupa grupa na C5 atomu prvog nukleotida , pa se
početak lanca označava kao 5’ kraj.
Fosfo-
diestarske Na kraju lanca nalazi se slobodna hidroksilna
veze grupa na C3 atomu poslednjeg nukleotida, pa
se taj deo lanca naziva 3’ kraj.
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
5’ kraj
O
O-P=O
-
S
O
O P
C5H2 O
T E
K C
O I
F
S O H I
O-P=O Č
N
-
N
I O I
CH2 O G
C
D
A E
O H
O
L
-
O-P=O
L
A O A
N T N
CH2 O
C C
A
A C3
OH H
3’ kraj
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
5’ kraj
baza baza
O-
O-
5’
-
O - P - O -CH2
O -
O - P - O -CH2
O
O
- O
C3 -
OH
3’ O
+ baza
-
O - P = O
baza
fosfodiestarska O
O- veza
-
O - P - O – C5 H2 5’ CH2
O O
O
-
OH 3’ kraj 3’ OH
Molekularna biologija
PRIMARNA STRUKTURA DNK
Baza
Dezoksiriboza
Fosfatna
grupa
Fosfo-
diestarske
veze
Ervin Čargaf
Rosalind Franklin
Molekularna biologija
SEKUNDARNA STRUKTURA DNK
Strukturu dvolančane zavojnice su 1953. god. rasvetlili James Watson i Francis Crick
Molekularna biologija
SEKUNDARNA STRUKTURA DNK
Molekularna biologija
SEKUNDARNA STRUKTURA DNK
5’ kraj 3’ kraj
3’ kraj 5’ kraj
Molekularna biologija
SEKUNDARNA STRUKTURA DNK
dezoksiriboza
dezoksiriboza
GUANIN CITOZIN
dezoksiriboza
dezoksiriboza
Komplementatne baze
ADENIN
ADENIN TIMIN
TIMIN
adenin – timin vezani su sa 2 vodonične veze
guanin – citozin vezani su sa 3 vodonične veze Čargafovo pravilo A=T
G=C
5’ kraj 3’ kraj
3’ kraj 5’ kraj
Molekularna biologija
SEKUNDARNA STRUKTURA DNK
Veliki
Veliki zavoj
zavoj
Mali
Mali
zavoj
zavoj
DNK spirala uvijena je u desno i širine je 2 nm. U jednom zavrtnju spirale nalazi se 10 nukleotidnih parova
ukupne dužine 3,4nm.
Molekularna biologija
Broj nukleotidnih parova u genomu različitih vrsta
Saccharomyces cerevisiae 12 x 10 6
Molekularna biologija
SEKUNDARNA STRUKTURA DNK
Kod prokariota DNK je kružnog oblika i ‘’gola’’ (nije udružena sa proteinima) ili ima samo malu količinu
proteina koji je okružuju.
Plazmid
Bakterijska
DNK
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
Najveći deo genetičkog materijala eukariotske ćelije nalazi se u jedru gde izgrađuje hromatin
( hromozome), ali jedan znatno manji deo postoji i u mitohondrijama (ili u hloroplastima kod biljnih ćelija).
Jedarna DNK je linearnog oblika, dok je mitohondrijalna i hloroplastna DNK kružnog oblika.
Jedarna
opna
Jedarce
Euhromatin
nekondezovani
hromatin
Heterohromatin
kondezovani
hromatin
Jedarna
opna
Heterohromatin
kondezovani
hromatin
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
Kod eukariota, DNK je uvek udružena sa proteinima, tako da postoji i njena tercijerna struktura , a
to je hromatin.
U sastav hromatina ulaze bazni pozitivno naelektrisani proteini histoni koji imaju gradivnu ulogu i
nehistonski proteini koji imaju funkcionalne karakteristike.
DNK
Negativno naelektrisana
fosfatna grupa
Histoni
pozitivno naelektrisani bazni proteini
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
Histoni su bazni pozitivno naelektrisani proteini zbog prisustva veće količine baznih aminokiselina (najviše
lizina i arginina). Razlikuju se pet klasa (vrsta) histona koji se obeležavaju kao H1, H2A, H2B, H3 i H4.
D.N.K.
D.N.K.
Nukleozom je oktamer sastoji od 8 histonskih molekula molekula 2H2A, 2H2B, 2H3 i 2H4 i DNK, koja je
namotana oko oktamera skoro 2 puta.
Nukleozomi su povezani histonom H1.
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
Amino
D.N.K. završni kraj histona
Ve
za
2
nu
k leo
zo
m a
Histon H1
11 n
m
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
Nukleozomalno vlakno
D.N.K.
D.N.K.
Obrazovanjem nukleozoma, odnosno, namotavanjem DNK oko 2 puta oko oktamera, ukupna dužina DNK
se smanjuje oko 7 puta što još uvek nije dovoljno da bi se ona mogla smestiti u jedro. Dalja spiralizacija
DNK predstavlja obrazovanje tzv. solenoidnih struktura. One se sastoje od gusto upakovanih
nukleozoma tako da se dobijaju hromatinske niti debljine 30 nm.
Nukleozomski paketi
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
DNK dupli
heliks
2H2A
2H2B
DNK dupli heliks Histon H1 2H3
2H4
Nukleozomski paketi
Petlje
Nukleozomski paketi
Metafazni hromozom
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
N
U
K
L
E 11 nm
O
Z
O
M
A
L
N D.N.K.
30 nm
O
Nukleozom
Histon H1
V
L
A
K
N Nukleozomski
paketi
O
Molekularna biologija
TERCIJARNA STRUKTURA DNK
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
RNK
su JEDNOLANČANE
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
Jednoprstenasti pirimidini
Dvoprstenasti purini
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
Osnovna gradivna jedinica RNK je, kao i kod DNK, nukleotid. Nukleotidi DNK i RNK razlikuju se po:
RNK DNK
Riboza Dezoksiriboza
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
DVOPRSTENASTI JEDNOPRSTENASTI
PURINI PIRIMIDINI
BAZA
FOSFAT
ADENIN ( A ) URACIL ( U )
RIBOZA
GUANIN ( G ) CITOZIN ( C )
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
adenozin 5’-monofosfat
(AMP)
guanozin 5’-monofosfat
(GMP)
citidin 5’-monofosfat
(CMP)
uridin 5’-monofosfat
(UMP)
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
Fosfatna grupa
Riboza
Baza
RNK
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
Sekundarna struktura formira se tako što komplementarne baze A, U i G,C grade kraće ili duže zavojnice
unutar istog lanca vezujući se vodoničnim vezama.
Antikodon
Mesto za
vezivanje
A.K.
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
DNK RNK
DNK Dvolančani molekul Jednolančani molekul
Dezoksiriboza Riboza
Timin Uracil
RNK
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
Tipovi RNK
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
Molekuli iRNK su prenosioci genetičke informacije sa DNK na protein i služe kao matrica za sintezu
polipeptida. Nastaju prepisivanjem genetičke šifre sa DNK u jedru (transkripcija) i tu šifru prenose do
ribozoma u citoplazmi.
tRNK Ribozomi
Molekuli tRNK prenose amino kiseline do ribozoma Molekuli rRNK učestvuju u građi
gde se povezuju sa iRNK i učestvuju u prevođenju ribozoma gde se odvija sinteza
genetičke šifre u redosled aminokiselina u proteina.
polipeptidu.
Molekularna biologija
STRUKTURA I TIPOVI RNK
H O
H
H
N–C-C
COOH
H OH
R
C
NH2
R
Amino - kiseline
Amino grupa
Karboksilna grupa
Promenjivi
bočni niz
Molekularna biologija
Proteini
α-C atom
Molekularna biologija
Proteini
Nepolarne Polarne
Leucin Leu
Molekularna biologija
Proteini
bočni niz
Molekularna biologija
Proteini
Molekularna biologija
Proteini
Naelektrisane; hidrofilne
Pozitivno naelektrisane; bazne
Molekularna biologija
Proteini
Leucin Izoleucin
Metionin
Molekularna
Molekularna biologija
biologija
Proteini
Fenilalanin Triptofan
Tirozin
Obrazovanje
peptidne veze
Dipeptid
Peptidna veza (amidna veza) je kovalentna hemijska veza koja se formira između dva molekula kad
karboksilna grupa jednog molekula reaguje sa amino grupom drugog molekula, uz otpuštanje molekula vode
(H2O)
Molekularna biologija
Proteini
H R
H O H O
N–C-C
+ N–C-C
H OH H H OH
R
- H2 O
peptidna veza
H O R O
H
N-kraj N–C-C -N–C-C C-kraj
H OH
R H H
DIPEPTID
Molekularna biologija
Proteini
DIPEPTID
Molekularna biologija
Proteini
U sastav čovekovog organizma ulazi ukupno 20 aminokiselina. 9 od njih se mogu izgraditi u samom organizmu,
dok je preostalih 11 neophodno uneti kroz ishranu. Aminokiseline koje čovekov organizam nije u stanju
napraviti, a neophodne su za njegovo funkcioniranje se nazivaju esencijalne aminokiseline.
Esencijalne:
Neesencijalne:
Valin
Leucin Glicin
Izoleucin Alanin
Metionin Prolin
Fenilalanin Asparaginska kiselina
Treonin Glutaminska kiselina
Triptofan Serin
Lizin Asparagin
Histidin Glutamin
Cistein*
Molekularna biologija
Proteini
Polipeptidni niz
N-kraj C-kraj
Molekularna biologija
Proteini
Molekularna biologija
Proteini
N - KRAJ
C - KRAJ
Molekularna biologija
Proteini
Promena samo jedne aminokiseline u polipeptidu može da dovede do gubitka biološke aktivnosti
tog proteina.
Normalna
Normalna crvena
crvena
krvna
krvna zrnca
zrnca
Normalni hemoglobin
Srpaste
Srpaste ćelije
ćelije
Hemoglobin S
Tako je na primer promena jednog jedinog nukleotida na genu za beta-globinski lanac, koja
dovodi do promene jedne jedine aminokiseline (glutamin - valinom) u tom polipeptidu, dovoljna
da normalni hemoglobin pretvori u patološki hemoglobin S, usled čega nastaje srpasta anemija.
Molekularna biologija
Proteini
Svaki polipeptidni lanac dobija dalje određenu prostornu strukturu: sekundarnu, tercijarnu i kvatenernu.
OVE STRUKTURE ZAVISE OD PRIMARNE.
Beta ploča
Alfa zavojnica
Strukturu održavaju vodonične veze koje
Nastaje tako što se između atoma koji se obrazuju između različitih delova
pripadaju svakoj četvrtoj amino kiselini polipeptidnog lanca
obrazuju vodonične veze
Molekularna biologija
Proteini
Sekundarna struktura
Prostornu strukturu proteina čine sekundarna, tercijarna a kod složenih proteina i kvaternarna
struktura
Molekularna biologija
Proteini
Tercijarna struktura
Postizanjem tercijerne strukture polipeptidni lanac postaje biološki aktivan te se tek tada može nazvati
protein.
Beta ploče
Grade je spirale,
ploče i neuređeni
delovi lanca.
Rezultat je
savijanje lanca Neuređeni delovi
čime se uspostavlja
loptast (globularan)
oblik proteina
Alfa zavojnice
Molekularna biologija
Proteini
Grade je spirale,
ploče i neuređeni
delovi lanca.
Rezultat je
savijanje lanca
čime se uspostavlja
loptast (globularan)
oblik proteina Beta ploče
Neuređeni delovi
Alfa zavojnice
Molekularna biologija
Proteini
Fibrilarni proteini
imaju izdužen oblik
Npr. strukturni
proteini kao što su :
kolagen,
a-keratin i b-keratin,
elastin
Struktura kolagena
Molekularna biologija
Proteini
Molekul kolagena je izgradjen od tri polipetidna lanca koja su medjusobno spiralno uvijena.
molekul kolagena
fibril
kolagensko vlakno
polipeptid
Više molekula kolagena u snopu čini fibril a više fibrila u snopu čine kolageno vlakno.
Molekularna biologija
Proteini
Molekularna biologija
Proteini
Molekularna biologija
Proteini
Molekularna biologija
Proteini
β lanci
Molekularna biologija
Proteini
Enzimi – 2,000
Toksini
Molekularna biologija
Proteini
Molekularna biologija