Professional Documents
Culture Documents
Tema 2 QOxENGINY - 2022-23 1
Tema 2 QOxENGINY - 2022-23 1
1
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
2.6. Descriptors D i L
2
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
2.6. Descriptors D i L
3
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
4
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
Thalidomide
Sedative Teratogenic
Antiemetic
5
Stereochemistry
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
A carbon with sp3 hybridization has the four substituents around it describing a
geometric figure, a Tetrahedron
Tetrahedron
6
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
2.6. Descriptors D i L
7
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
Conventions to represent
structures with stereochemical information
3D 2D
8
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
D A
B
C
B D
C
9
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
10
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
Always retain the spatial orientation around it, substituents may describe a
tetrahedron according to the wedge convention.
11
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.2. Representacions de Newman
1 s bond referenced
12
dihedral angle (q)
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.3. Projeccions de Fischer The Fischer Projection
Rules:
Choose the main chain
Select the priority carbon (according to nomenclature rules)
Place it at the top of the representation and the rest of the chain aligned vertically.
interpret each carbon from its corresponding appropriate view
B A
FISCHER
A PROJECTION
14
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.3. Projeccions de Fischer
Examples:
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
2.6. Descriptors D i L
16
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
ISOMERISM
17
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
Are the structures in these groups representing exactly the same molecule?
They have the same molecular formula!
ISOMER:
One of several molecules that have the same atomic composition (molecular
formula) but are not identical and therefore may have different chemical and/or
physical properties
Constitution Configuration
Conformation
19
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
CONSTITUTION:
It is the way in which atoms are connected
20
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
2.3.2. Isomeria conformacional.
CONFORMATION
It is the way in which atoms of a molecule are distributed based on degrees of freedom
Ex: turns around s bond
Newman Projections
1 s bond referenced
21
dihedral angle (q)
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
2.3.2. Isomeria conformacional.
CONFORMATION:
We can make turns of different degrees around s bonds.
This will generate different conformations.
For the same bond with carbon sp3 atoms on both sides, we can generate:
3 different staggered conformations and 3 different eclipsed conformations.
22
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
2.3.2. Isomeria conformacional.
CONFORMATION:
23
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
2.3.3. Isomeria configuracional.
CONFIGURATION:
It is the way atoms are distributed around a subspace of the molecule and
that it does not vary by rotating s bonds
X and Y centers have DIFFERENT CONFIGURACIONS
24
Tema 2: Estereoquímica
Isomer classification chart 2. Estereoquímica
2.3. Isomeria.
2.3.3. Isomeria configuracional.
25
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
2.6. Descriptors D i L
26
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
CHIRALITY
27
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
CHIRAL:
Any structure that its:
MIRROR IMAGE is
NON SUPERIMPOSABLE
28
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
Chirality
χειρ (kheir)
29
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
which of
these objects is chiral?
30
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
Chiral
Not chiral
Chiral
Not chiral
31
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.2. Centre estereogènic.
A≠B≠C≠D
not superimposable = CHIRAL
Any sp3 carbon atom with at least two equal substituents presents an internal plane
of symmetry and because of this, is not an stereogenic center, NOT CHIRAL.
In the same way, a MOLECULE with an internal plane of symmetry can’t be CHIRAL
Symmetry plane
33
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre estereogènic.
A B C D
34
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre estereogènic.
If we try to draw all the possible structures for a sp3 carbon bonded to 4 different
substituents, ONLY TWO DIFFERENT STRUCTURES can be given:
A B C D
TWO CONFIGURATIONS are so obtained. Move them, rotate them and you will check, only
2 are different
That is what we call an ASYMMETRIC CARBON or STEREOGENIC CENTER.
And we also say that it is CHIRAL.
35
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre estereogènic.
36
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre estereogènic.
This… or this ??
39
Tema 2: Estereoquímica
40
Tema 2: Estereoquímica
≡
41
Tema 2: Estereoquímica
42
Tema 2: Estereoquímica
43
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre estereogènic.
EXAMPLE:
This structure has 2 stereogenic centers (*) : (22 = 4 stereoisomers)
2-bromo-3-methyl-2-phenylpentan-3-ol
44
Tema 2: Estereoquímica
Nr of stereoisomers: 2n
45
Tema 2: Estereoquímica
configurational isomers they are neither mirror image and are nor
superimposable. 48
Tema 2: Estereoquímica
configurational isomers they are neither mirror image and are nor
superimposable. 49
Tema 2: Estereoquímica
configurational isomers they are neither mirror image and are nor
superimposable. 50
Tema 2: Estereoquímica
configurational isomers they are neither mirror image and are nor
superimposable. 51
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
52
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
Relative & Absolute Configurations
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
Are the
Same molecule
Meso FORM
ABSOLUTE CONFIGURATIONS
53
Tema 2: Estereoquímica
RELATIVE CONFIGURATIONS 54
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.4. Quiralitat.
2.4.7. Configuració en alquens
55
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
2.6. Descriptors D i L
56
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
57
Tema 2: Estereoquímica
1.6. Enantiomeric Purity Determination
High Performance Liquid Chromatography (HPLC):
58
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
OPTICAL ACTIVITY
A property of the substances whose molecules are chiral.
We say that a compound has optical activity when is able to rotate the plane from a beam
of polarized light.
POLARIMETER
Enantiomers will rotate light in the same absolute value but opposite sign
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
T
The Optical Activity is quantified as Specific Rotation [a] :
l
...Where:
a = Observed rotation: Rotation angle measured with a polarimeter ( in degrees and sign)
l = path length of light through the cuvette (in dm)
c= concentration of the analyzed solution (in g/mL)
Convention:
=0
a) If the mixture is 50%, the mixture will not exhibit optical activity, this mixture is
a RACEMATE or RACEMIC MIXTURE.
Tema 2: Estereoquímica
b) If one predominates over the other, we will see a certain deflection and if we
know the specific rotation of each of the 2 pure enantiomers, we can know the
% of the enantiomer in the mixture (OPTICAL PURITY):
Example:
a 74% Optical Purity of dextrorotatory enantiomer means:
In other words:
EXAMPLE:
EXEMPLE:
2. Estereoquímica
2.1. Introducció.
2.2. Convenis per representar estructures 3D en 2D.
2.2.1. Representacions de falques
2.2.2. Representacions de Newman
2.2.3. Projeccions de Fischer
2.3. Isomeria.
2.3.1. Isomeria constitucional.
2.3.2. Isomeria conformacional.
2.3.3. Isomeria configuracional.
2.4. Quiralitat.
2.4.1. Definició.
2.4.2. Centre estereogènic.
2.4.3. Isomeria configuracional en estructures d’1 centre
estereogènic.
2.4.4. Isomeria configuracional en estructures de >1 centre
estereogènic.
2.4.5. Enantio i Diastereoisomeria
2.4.6. Configuració absoluta i relativa
2.4.7. Configuració en alquens
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.5.1. HPLC.
2.5.2. Activitat òptica: Dextro i levorotatori
2.5.3. Rotació específica i puresa òptica.
2.6. Descriptors D i L
66
Tema 2: Estereoquímica
2. Estereoquímica
2.5. Puresa enantiòmerica i quantificació.
2.6. Descriptors D i L
WACHT OUT !!: D & L DESCRIPTORS
(-)-D-ribosa (+)-L-ribosa
Tema 2: Estereoquímica
CARBOHYDRATES, EXAMPLE:
(+)-D-glucose (-)-L-glucose
Tema 2: Estereoquímica
dextrorotatory levorotatory
levorotatory dextrorotatory
Tema 2: Estereoquímica
70