Professional Documents
Culture Documents
שכפול DNA
תהליך של יצירת גדיל חדש )הגדיל אותו אנחנו מסנתזים( על גבי "תבנית" )הגדיל הישן( -
המידע שבגדיל הישן מכיל את אורך מולקולת ה DNA -שצריך לסנתז ואת סדר חומצות הגרעין שבו -
סובסטרט נוסף הוא הנוקלאוטידים שמהם מסונתז הגדיל החדש על בסיס הגדיל הישן -
בשביל לאתחל את הסינתזה יש צורך בפריימר )רצף קצר של חומצות גרעין שאחוז בקשרי ווטסון וקריק )זיווגים( עם התבנית( -
שכפול DNA
המולקולות המשתתפות בשכפול DNA
הפריימר צריך קבוצת הידרוקסיד בקצה '3שלו )לכיוון הסינתזה( -
פירוק שני הפוספטים ממצב הטרי-פוספט מתבצע לפני הזיווג לגדיל -
הישן
כל אנזימי ה DNA -פולימרז מייצרים גדיל חדש מקצה '5 -
לקצה '3
שכפול DNA
האתר הפעיל של DNAפולימרז
נוקלאוטיד חדש מזווג לנוקלאוטיד החשוף בתבנית הישנה שהיא DNAחד גדילי -
).(ssDNA
האינטראקציה גורמת לאצבעות להיסגר מסביב לזוג הנוקלאוטידים החדש )תזוזה -
של 40מעלות(
קונפורמציה זו מובילה למיקום היון הקטליטי )מגנזיום( במיקום המזרז יצירת -
הקשר הפוספודיאסטרי
ה DNA -פולימרז מושך את הגדיל הישן ומתקדם לנוקלאוטיד הבא -
שכפול DNA
מנגנון פעילות "עבודה מעשית"
מציאות: -
-כל גדיל ה DNA -המשמשים כתבנית "נקראים" מקצה '3
ל'5 -
-כל הגדילים החדשים המסונתזים עליהם מיוצרים מ'5 -
ל'3 -
רק באחד מהם כיוון הסינתזה של הגדיל החדש יהיה זהה לכיוון הדה-נטורציה -
של הDNA -
ככל שתהיה יותר דה-נטורציה ה DNA -פולימרז יוכל להמשיך לסנתז -
את הגדיל החדש.
הגדיל שבו הפולימרז קורא מקצה '3של הגדיל הישן -
בגדיל השני כיוון הסינתזה גם מ '5 -ל '3 -של הגדיל החדש -
מנוגד לכיוון הפתיחה של ה DNA -
הפולימרז צריך להתחיל מהכיוון ההפוך -
כשיש דה-נטורציה ונפתח איזור חד גדילי חדש )תבנית חדשה( הDNA - -
פולימרז נקשר לתבנית מחדש ומסנתז לכיוון ה '5 -של התבנית.
הגדיל שבו כיוון הסינתזה הוא כיוון פתיחת ה DNA -נקרא גדיל מוביל ).(leading -
הגדיל שבו כיוון הסינתזה הפוך לכיוון פתיחת ה DNA -נקרא גדיל מעכב -
).(lagging
צריכים לקרות בו יותר דברים כדי לאפשר סינתזה -
שכפול DNA
פתיחת המבנה הדו-גדילי
RNAפרימאז -
DNAהליקאז -
צריך להוציא אותו מה DNA -כדי להכניס במקומם חומצות גרעין מסוג DNA -
שכפול DNA
הסרת פריימר RNAוהחלפתו ב DNA
באאוקריוטים מספר גדול יותר נקודות התחלת שכפול )מספר כרומוזומים( -
באאוקריוטים שכפול איטי יותר בגלל בקרה ומורכבות המערכת האנזימטית -
DNAליגאז: -
-סוגר ניקים