Ennek soraiban Savoyai Jenő először Petronellnél harcolt, a Bécs ostromára közelgő

törökök ellen (1683. július 7.), majd részt vett az ostromlott Bécs felmentésében,
amiért egy dragonyos ezred tulajdonosává vált.

Részt vett Buda eredménytelen ostromában (1684) és 1685-ben az esztergomi diadal

kivívásában, ahol unokafivére, Lajos badeni őrgróf felismerte hadvezéri tehetségét.
Buda várának végleges visszavívásakor (1686) jobb kezén súlyos sebet kapott,
melyből Velencében felépülve részt vett az 1687. augusztus 12-én a harsányi lejtőn
a török ellen vívott csatában. Lovasaival elsőként törte át az ellenség sáncát. A
győzelem hírét ő vitte Bécsbe.

1688-ban már mint altábornagy harcolt Miksa bajor választófejedelem mellett Belgrád
bevételénél, ekkor újra megsebesült.

1689–96-ban a pfalzi örökösödési háborúban a franciák ellen harcolt változó

szerencsével, előbb a Rajna mellett, majd 1690-től Savoyában viselt hadat
rokonának, II. Viktor Amadé savoyai hercegnek oldalán.

1692-ben Dél-Franciaországba tört be, az ingatag savoyai herceg elpártolása után

pedig újra Észak-Itáliában harcolt. Ekkor, 1693-ban tábornaggyá léptették elő.

Mihelyt az itáliai háború véget ért, Rüdiger von Starhemberg tábornagy javaslatára
I. Lipót császár őt nevezte ki a törökök ellen indított haderő fővezérévé. Savoyai
Jenő először Péterváradot védte meg, majd a visszavonuló törököket üldözve Zentánál
akkor csapott le a nagyvezír hadára, amikor az éppen átkelt a Tiszán (1697.
szeptember 11.) A kettészakadt török sereg két órai harc alatt döntő vereséget
szenvedett. A zentai diadal, amely 30 000 török életébe került, véglegesen megtörte
a törökök magyarországi hatalmát, és egyúttal megvetette Savoyai Jenő európai
hírnevének alapját.

A következő hónapban, október 23-25. között Szarajevó kifosztása és felgyújtása a

herceg kevésbé dicsőséges tettei közé tartozik.[3] Igaz, visszavonuló csapataihoz
sok boszniai katolikus lakos csatlakozott. Megmaradt fővezérnek, amíg a török a
karlócai békében (1699. január 26-án) le nem mondott Erdélyről és a Bánság
kivételével egész Magyarországról.