BT-01 Igor Gogol

lesson 6 – Bacteriophage

Бактеріофаг
І. Вступ
A. Визначення. Бактеріофаги (фаг) є облігатними внутрішньоклітинними
паразитами, які розмножуються всередині бактерій, використовуючи деякі або
всі механізми біосинтезу хазяїна (віруси, які інфікують бактерії).
Існує багато спільного між бактеріофагами та вірусами клітин тварин.
Таким чином, бактеріофаг можна розглядати як модельну систему для
клітинних вірусів тварин. Крім того, знання життєвого циклу бактеріофага
необхідно для розуміння одного з механізмів, за допомогою якого бактеріальні
гени можуть переноситися від однієї бактерії до іншої.
Свого часу вважалося, що використання бактеріофага може бути
ефективним способом лікування бактеріальних інфекцій, але незабаром
виявилося, що фаги швидко виводяться з організму і, таким чином, не мають
клінічного значення. Проте бактеріофаг використовується в діагностичній
лабораторії для ідентифікації патогенних бактерій (фаготипування). Хоча
фаготипування не використовується в стандартній клінічній лабораторії, воно
використовується в референс-лабораторіях для епідеміологічних цілей.
Останнім часом з’явився новий інтерес до можливого використання
бактеріофага для лікування бактеріальних інфекцій і для профілактики. Чи буде
бактеріофаг використовуватися в клінічній медицині, ще належить визначити.
ІІ. Склад і будова бактеріофагів
A. Склад. Хоч різні бактеріофаги можуть містити різні матеріали, усі вони
містять нуклеїнову кислоту та білок.
Залежно від фага нуклеїнова кислота може бути або ДНК, або РНК, але не
обома, і вона може існувати в різних формах. Нуклеїнові кислоти фагів часто
містять незвичайні або модифіковані основи. Ці модифіковані основи
захищають нуклеїнову кислоту фага від нуклеаз, які розщеплюють нуклеїнові
кислоти господаря під час фагової інфекції. Розмір нуклеїнової кислоти
змінюється в залежності від фага. Найпростіші фаги мають достатньо
нуклеїнової кислоти лише для кодування 3-5 генних продуктів середнього
розміру, тоді як більш складні фаги можуть кодувати понад 100 генних
продуктів.
Кількість різних типів білків і кількість кожного виду білка в фаговій
частинці буде змінюватися в залежності від фага. Найпростіший фаг має багато
копій лише одного або двох різних білків, тоді як більш складні фаги можуть
мати багато різних видів. Білки функціонують при інфекції та для захисту
нуклеїнової кислоти від нуклеаз у навколишньому середовищі.
B. Структура. Бактеріофаг буває різних розмірів і форм.
1. Розмір - Т4 є одним з найбільших фагів; він має довжину приблизно 200
нм і ширину 80-100 нм. Інші фаги менші. Більшість фагів мають розміри від 24
до 200 нм.
2. Головка або капсид. Усі фаги містять структуру головки, яка може
змінюватися за розміром і формою. Деякі з них ікосаедричні (20 сторін), інші —
ниткоподібні. Головка або капсид складається з багатьох копій одного або
кількох різних білків. Всередині головки знаходиться нуклеїнова кислота.
Головка діє як захисне покриття для нуклеїнової кислоти.
3. Хвіст. Багато, але не всі фаги мають хвости, прикріплені до голови
фага. Хвіст — це порожниста трубка, через яку проходить нуклеїнова кислота
під час інфікування. Розмір хвоста може бути різним, а деякі фаги навіть не
мають структури хвоста. У більш складних фагів, таких як Т4, хвіст оточений
скоротливою оболонкою, яка стискається під час зараження бактерією. На кінці
хвоста більш складні фаги, такі як Т4, мають базову пластинку та одне або
кілька хвостових волокон, прикріплених до неї. Основна пластинка і хвостові
волокна беруть участь у зв’язуванні фага з бактеріальною клітиною. Не всі фаги
мають пластинки основи і хвостові волокна. У цих випадках інші структури
беруть участь у зв’язуванні фагової частинки з бактерією.
III. Інфікування клітини-хазяїна
A. Адсорбція. Першим кроком у процесі інфікування є адсорбція фага на
бактеріальній клітині. Цей етап опосередковується хвостовими волокнами або
іншою аналогічною структурою на тих фагах, які не мають хвостових волокон, і
є оборотним. Волокна хвоста прикріплюються до специфічних рецепторів
бактеріальної клітини, і специфічність фага до хазяїна (бактерії, яку він здатний
інфікувати) зазвичай визначається типом хвостових волокон, які має фаг.
Природа бактеріального рецептора різна для різних бактерій. Приклади
включають білки на зовнішній поверхні бактерії, LPS. пілі та ліпопротеїни. Ці
рецептори знаходяться на бактеріях для інших цілей, і фаги еволюціонували,
щоб використовувати ці рецептори для інфекції.
B. Необоротне прикріплення - прикріплення фага до бактерії через
волокна хвоста є слабким і оборотним. Необоротне зв'язування фага з бактерією
опосередковується одним або кількома компонентами базової пластинки. У
фагів, у яких відсутні базові пластини, є інші способи щільного зв’язування з
бактеріальною клітиною.
C. Скорочення оболонки – необоротне зв’язування фага з бактерією
призводить до скорочення оболонки (для тих фагів, які мають оболонку), і
порожнисте хвостове волокно проштовхується через бактеріальну оболонку.
Фаги, які не мають скорочувальних оболонок, використовують інші механізми
для проходження фагової частинки через бактеріальну оболонку. Деякі фаги
мають ферменти, які перетравлюють різні компоненти бактеріальної оболонки.
D. Ін'єкція нуклеїнової кислоти – коли фаг пройшов крізь оболонку
бактерії, нуклеїнова кислота з голови проходить через хвіст і потрапляє в
бактеріальну клітину. Зазвичай єдиним компонентом фага, який фактично
потрапляє в клітину, є нуклеїнова кислота. Залишок фага залишається на
зовнішній стороні бактерії. З цього правила є деякі винятки. Це відрізняється від
клітинних вірусів тварин, у яких більша частина вірусної частинки зазвичай
потрапляє в клітину. Ця різниця, ймовірно, пов’язана з нездатністю бактерій
поглинати матеріали.

1. There are many similarities between bacteriophages and animal cell viruses.
2. The head acts as the protective covering for the nucleic acid.
3. The proteins function in infection and to protect the nucleic acid from
nucleases in the environment.
4. Recently, new interest has developed in the possible use of bacteriophage for
treatment of bacterial infections and in prophylaxis.
5. The simplest phage have many copies of only one or two different proteins
while more complex phages may have many different kinds.
6. This difference is probably due to the inability of bacteria to engulf
materials.
7. Phages lacking base plates have other ways of becoming tightly to the
bacterial cell.
8. This step is meditated by the tail fibers or by some analogous structure on
those phages that lack tail fibers and it is reversible.
9. Examples include proteins on the outer surface of the bacterium, LPS, pili,
and lipoprotein.
10. Phages that don't have contractile sheaths use other mechanisms to get the
phage particle through the bacterial envelope.