Professional Documents
Culture Documents
2 Genetika Studentum Dukcqruc
2 Genetika Studentum Dukcqruc
1
Genetika – doporučená literatura
2
OD SPERMISMU K
historie
MODERNÍ GENETICE
3
Představa o odevzdávání genetické
informace potomkům
Pythagoras
Aristoteles
preformace
Charles Darwin
4
Představa o odevzdávání genetické
informace potomkům
Jean-BaptisteLamarck
Johan Gregor Mendel
5
Představa o odevzdávání genetické
informace potomkům
Hugo deVries
William Bateson
Thomas Morgan
Oswald Avery
Watson, Crick a Franclinová
6
CO NÁS NAUČIL principy dědičnosti
MENDEL?
7
Základní pojmy
diploidie / diploidní buňka, 2n
• chromozomy v somatických eukar. buňkách vždy v párech
• shodují se velikostí, tvarem a vazební skupinou
haploidie / haploidní buňka, n
• v jádrech specializovaných buněk = gametách
• len jedna sada chromozomů
• vznik redukčním dělením jádra = meiózou
• organismy: ♂ blanokřídlých (včely, vosy, mravenci), některé huby a
řasy
polyploidie, >2n
• asi 70% krytosemenných rostlin, cca 5% nahosemenných
• metabolicky výnosnější = vyšší výnos
• 4n: kukuřice, bavlna, brambor, zelí; 6n: pšenice; 8n: jahodník
• u živočichů: některé ryby a obojživelníci
• u člověka: jaterní buňky, osteoklasty, megakaryocyty 8
Základní pojmy
genetika - studium dědičnosti a proměnlivosti
párové založení dědičných vlastností – každý gen ve 2 variantách
alela – konkrétní varianta daného genu (A / a)
homozygotní genotyp – obě alely jsou funkčně shodné (AA / aa)
heterozygotní genotyp – obě alely jsou funkčně odlišné (Aa)
genotyp – soubor alel daného organismu
fenotyp – konkrétní vyjádření daného genotypu v prostředí
dominantní alela – „překryje“ projev druhé (A)
recesivní alela –projeví se jen v nepřítomnosti dominantní (a)
9
Základní pojmy
úplná dominance - dominantní alela úplně překryje recesivní
neúplná dominance – recesivní alela není plně překryta
kodominance –projeví se obě alely (AB0 systém)
genom – souhrn všech genů buňky
genofond – soubor genů v populaci
genotyp AA A0 BB B0 00 AB
fenotyp A A B B 0 AB
10
Mendlovy zákony
Křížení bělokvěté a červenokvěté odrody hrachu setého
a a
P: AA x aa
Aa Aa
A
F1: Aa
Aa Aa
A
11
Mendlovy zákony
Vzájemným křížením heterozygotů vzniká 2. filiální generace F2
A a
- kombinační čtverec:
AA Aa
Aa x Aa → AA Aa Aa aa A
Aa aa
a 12
Mendlovy zákony
• monohybrid = kříženec (hybrid) v jednom páru alel (genu)
AB Ab aB ab
AB AABB AABb AaBB AaBb
Ab AABb AAbb AaBb Aabb
aB AaBB AaBb aaBB aaBb
ab AaBb Aabb aaBb aabb
14
Mendlovy zákony
x
• vznik 4 různých gamet (22)
16
„výjimky“ - o čem Mendel nevěděl
crossing-over = genetická rekombinace
17
„výjimky“ - o čem Mendel nevěděl
síla vazby = pravděpodobnost náhodného crossing-overu v dané
oblasti je tím vyšší, čím dále od sebe dané úseky jsou
AaBb x aabb
AB Ab aB ab
ab AaBb Aabb aaBb aabb
Bateson Morgan
a) volná kombinovatelnost =
1 1 1 1 1 50%
Mendlův zákon
b) úplná vazba 1 0 0 1 0 0%
c) „nějaká“ síla vazby poměry dle síly vazby ? ?
KOMPLEMENTARITA:
• barva květu u hrachoru – dva geny:
1) C – enzym katalyzující vznik bezbarvého prekurzoru barvy
2) R – enzym katalyzující změnu prekurzoru na červený antokyan
20
„výjimky“ - o čem Mendel nevěděl
KOMPLEMENTARITA:
AB Ab aB ab
AB AABB AABb AaBB AaBb
Ab AABb AAbb AaBb Aabb
aB AaBB AaBb aaBB aaBb
ab AaBb Aabb aaBb aabb
AB Ab aB ab
AB AABB AABb AaBB AaBb
Ab AABb AAbb AaBb Aabb
aB AaBB AaBb aaBB aaBb
ab AaBb Aabb aaBb aabb
21
„výjimky“ - o čem Mendel nevěděl
EPISTAZE
• jeden produkt genu (epistatický) potlačuje projev druhého podřízeného
páru alel
dominantní epistáze
• epistatický vlohový pár potlačuje vliv jiných párů účinkem své
dominantní alely (A-)
• barva květu jiřiny
o gen pro žlutou barvu A nadřazený genu pro krémovou B
o fen.š.p. 12 : 3 : 1 AB Ab aB ab
(9:3:3:1) AB AABB AABb AaBB AaBb
recesivní epistáze
• je k potlačení potřeba homozygotně recesivní konfigurace (aa)
• barva květu u šalvěje
o gen A = syntéza antokyanů
o gen B = přeměna červeného barviva na fialové
o fen.š.p. 9 : 3 : 4 AB Ab aB ab
INHIBICE
• jedna alela potlačuje účinek druhé (B = barva, E=inhibitor)
• barva peří u kuřat
gen B = syntéza pigmentu,
gen E = inhibitor pigmentu
všechno bb → bez barvy
všechno E- → bez barvy
černá barva jenom v případě B-ee
EB Eb eB eb
fen.š.p. 13 : 3
EB EEBB EEBb EeBB EeBb
(9:3:3:1)
Eb EEBb EEbb EeBb Eebb
25
JAK SE DĚDÍ typy dědičnosti
NEMOCI?
26
Geneticky podmíněné nemoci
C. Polygenní nemoci
27
A) Nemoci způsobené mutací v genu
1) Autozomálně recesivní dědičnost/nemoci
2) Autozomálně dominantní dědičnost/nemoci
3) Gonozomálně recesivní dědičnost/nemoci
4) Gonozomálně dominantní dědičnost/nemoci
5) Další
28
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A1) Autozomálně recesivní nemoci
Aa Aa
29
aa
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A1) Autozomálně recesivní nemoci
1 rodič postižený
a) druhý přenašeč – kolik (%) potomků postižených?
b) druhý zdraví homozygot – kolik (%) potomků postižených?
Fenylketonurie
Alkaptonurie
Albinismus
Cystická fibróza
30
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A1) Autozomálně recesivní nemoci
Cystická fibróza
• porucha transportu Cl- do buněk → hromadění hlenu v plících a na
sliznicích
• postihuje dýchací a trávicí soustavu
• záněty dýchacího ústrojí bakteriemi
• frekvence výskytu v ČR 1: 2 000 – 1: 3 000 žnd
• každý 25. člověk přenašeč
• 98 % postižených mužů je neplodných
31
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A1) Autozomálně recesivní nemoci
Fenylketonurie
• porucha přeměny fenylalaninu na tyrosin
• mutace nejčastěji v genu pro fenylalaninhydroxylázu
• vysoká hladina fenylalaninu v těle → toxický účinek na mozek ve
vývoji
• neléčené děti – mentální retardace, epileptické záchvaty, apatie,
poruchy chování
• léčba – dieta s nízkým obsahem fenylalanínu
• frekvence výskytu v ČR 1:10 000 žnd
32
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A2) Autozomálně dominantní nemoci
Dominantní alela = vyvolává vznik příslušného znaku i v
heterozygotním stavu (Aa)
• proband se znakem má alespoň jednoho rodiče se znakem
• znak v rodokmenu v souvislým generačním sledu
nemoc zdravý
AA Aa aa
A- aa
Aa aa
33
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A2) Autozomálně dominantní nemoci
Huntingtonova choroba
chondrodystrofie
polydaktylie
34
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A2) Autozomálně dominantní nemoci
Huntingtonova choroba
• neurodegenerativní onemocnění mozku
• mutace v genu pro huntingtin – znásobení kodonu CAG
• nekoordinované trhavé pohyby těla
• snížením mentálních schopností
• incidence asi 7:100 000
35
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A3) Gonozomálně recesivní nemoci
• u ♀kompenzováno druhou, dominantní alelou = přenašečka
• u ♂ jenom jeden X = zdravý/nemocný
ženy muži
zdravá nemocná přenašečka zdravý nemocný přenašeč
X AX A XaXa X AX a X AY Xa Y -
XX X●X● X●X XY X●Y -
Hemofilie
Syndrom fragilního X
Daltonismus
36
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A3) Gonozomálně recesivní nemoci
Hemofilie
• porucha srážlivosti krve
• porušen koagulační faktor VIII, IX nebo XI
• spontánní krvácení
• léčba aplikací chybějícího faktoru
37
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A3) Gonozomálně recesivní nemoci
Daltonismus
• jedna z příčin barvosleposti
• žádná nebo omezená schopnost rozlišit červenou a zelenou barvu
38
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A4) Gonozomálně dominantní nemoci
• projeví se i u heterozygotních žen
ženy
zdravá nemocná
XaXa X AX A X AX a
XX X●X● X●X
39
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A5) Další
Pohlavím ovládané znaky
• geny lokalizované na autozomech, ale projev závisí od pohlaví
sekundární pohlavní znaky nebo předčasná plešatost
AA Aa aa
40
A) Nemoci způsobené mutací v genu
A5) Další
Holandrická dědičnost
• patrilineární – z otce na syna
• vázaná na chromosom Y
• nemoci u člověka velmi vzácné (málo genů na Y)
Mimojaderná dědičnost
• mtDNA v mitochondriích
• neřídí se mendelovskou dědičností
• matroklinita = materální dědičnost
41
A) Nemoci způsobené mutací v genu
Penetrace = „pronikavost“ = uplatnění znaku v populaci
• vyjadřuje % jedinců (z celkového, kde se to očekává podle genetických
pravidel), u kterých se projeví znak
• př.: karcinom prsu – gen BRCA – projev ne u všech nositelek
mutantního genu – pravdepodobnost 80%
42
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
1) Numerické aberace
2) Strukturní aberace
43
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B1) Numerické aberace
• polyploidie
• aneuploidie
o trizomie, tetrazomie, monozomie, nulizomie
Downův syndrom
Edwardsův syndrom
Pataův syndrom
Klinefelterův syndrom
Turnerův syndrom
Syndrom Triple X , Syndrom XYY 44
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B1) Numerické aberace
Downův syndrom
• typický vzhled
45
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B1) Numerické aberace
Edwardsův syndrom
• 47, XXY
• mužský fenotyp
48
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B1) Numerické aberace
Turnerův syndrom
• 45, X
• charakteristický vzhled
• malý vzrůst
• amenorrhea
51
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B2) Strukturní aberace
• balancované vs nebalancované
• delece, duplikace, inverze, translokace
• specifický typ translokace - reciproká translokace
o Philadelphský chromozom (fúzní gen BCR-ABL )
52
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B2) Strukturní aberace
• balancované vs nebalancované
• delece, duplikace, inverze, translokace
• specifický typ translokace - reciproká translokace
o Philadelphský chromozom (fúzní gen BCR-ABL )
53
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B2) Strukturní aberace
• balancované vs nebalancované
• delece, duplikace, inverze, translokace
• specifický typ translokace - reciproká translokace
o Philadelphský chromozom (fúzní gen BCR-ABL )
• závažnost je variabilní
55
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B2) Strukturní aberace
Prader-Willi syndrom
• hypotonie
• strabismus
• psychomotorická retardace
56
B) Nemoci způsobené aberací chromozomů
B2) Strukturní aberace
Angelmanův syndrom
57
C) Polygenní nemoci
• geny s velkým účinkem – monogenní nemoci
• geny s malým účinkem – polygenní nemoci
• multifaktoriální nemoci
• Heritabilita = dědivost
58
PŘEDPOVĚĎ Genetické
BUDOUCNOSTI testování
59
Genetická diagnostika
a) postnatální diagnostika
b) prenatální diagnostika
c) preimplantační diagnostika
60
Genetická diagnostika
A. Cytogenetické vyšetření
• co se vyšetřuje?
• z jakého materiálu?
• jakými technikami?
61
Genetická diagnostika
B. Molekulární genetika
• co se vyšetřuje?
• z jakého materiálu?
• jakými technikami?
62
Metody cytogenetického vyšetření
63
Metody cytogenetického vyšetření
64
Metody cytogenetického vyšetření
65
Metody molekulární genetiky
- mutace v genu XY
- záměna G za A
G A A
G G A
66
Metody molekulární genetiky
• voda + pufr
• templátová / testovaná DNA
• primery
• nukleotidy
• enzym DNA polymeráza
• Mg2+
67
Metody molekulární genetiky
- mutace v genu XY G A A
- záměna G za A G G A
X 68
Metody molekulární genetiky
Bsm I
5‘ … CTTACG|N… 3‘
CTTACG CTTACA CTTACG
822 bp 822 bp
646 bp 646 bp
176 bp 176 bp
69
Metody molekulární genetiky
176 bp
646 bp
822 bp
70
Metody molekulární genetiky
176 bp
646 bp
822 bp
71
Metody molekulární genetiky
72
NEJSME VŠICHNI Populační genetika
STEJNÍ
73
Základy populační genetiky
• populace
• genofond
• autogamická populace
• samooplození = autogamie
• přibývá homozygotů
• genetická rovnováha
• Hardy-Weinbergův zákon
74
Hardyho-Weinbergův zákon
• p = frekvence dominantní alely A
• q = frekvence recesivní alely a
p+q=1
• P = frekvence dominantních homozygotů AA
p2 = P
• Q = frekvence recesivních homozygotů aa
q2 = Q
• H = frekvence heterozygotů Aa
2pq = H
P+Q+H=1 p2 + 2pq + q2 = 1
75
Řešení úloh z populační genetiky
v panmiktické populaci bylo zjištěno 9% recesivních homozygotů (aa)
? vypočítejte frekvenci dominantních homozygotů a heterozygotů
76