Premena CO2 a O2 v zemskej biosfére

O2

organické
produkty

FOTOSYNTETICKÉ HETEROTROFY
AUTOTROFY

CO2

H 2O
 Premena dusíka v biosfére
Celkové množstvo N fixovaného ̴ 2.1011 kg ročne

Nitrifikačné
baktérie

NO3-
Atmosferický Baktérie NH3
N2 fixujúce N
Clostridium Rastliny
Azotobacter
Živočíchy
Rhizobium
(symbiotická fixácia AMK
s rastlinami)
 Nitrogenázový komplex

- poskytuje e- s vysokou schopnosťou redukcie

- disociuje od nitrogenázy predtým, ako je N2 premenený na NH4+
 Predpokladaná metabolická dráha nitrogenázových reakcií
(Redukcia N2 NH3 je proces striktne anaeróbny)
3 NADPH + 3 H+
6 e-
Feredoxinred
6 e-

Fe bielkovina Fe bielkovina
(redukovaná) (oxidovaná)

12 Mg ATP reduktázová 12 Mg ADP + 12 Pi

zložka

12 Mg ATP 12 Mg ATP
Fe bielkovina Fe bielkovina
(redukovaná) (oxidovaná)
- 6 e-

+ 6 e-
Mo-Fe bielkovina Mo-Fe bielkovina
(oxidovaná) (redukovaná)
nitrogenázová
N2 zložka N2

6 H+
Mo-Fe bielkovina 2 NH3
N2 (oxidovaná)
1. Redukovaný feredoxin prenáša e- na reduktázu.

2. ATP sa viaže na reduktázu, posúva sa redox-potenciál enzýmu

z –0,29 na –0,40 mV v dôsledku zmeny konformácie, čo
umožní prenos e- na nitrogenázu.

3. ATP je hydrolyzované, reduktáza disociuje od nitrogenázy, N2

naviazaný na nitrogenázu je redukovaný na NH3 (NH4+).
Aminokyseliny – prekurzory biomolekúl
- stavebné zložky peptidov
- biosyntéza purínov (6 z 9 atómov)
- biosyntéza pyrimidínov (4 zo 6 atómov)
- reaktívny koniec sfingozínu vznikol zo serínu
H H H
CH3 ( CH2 ) C C C C CH2 OH
12
H OH NH3

- histamin (vazodilatačné účinky) – získaný z histidínu

dekarboxyláciou
+
CH CH2 NH3
2
N
- tyrozín je prekurzorom hormónu tyroxínu (tetrajódtyronín),
epinefrínu, melanínu
I +
I NH3
- tyroxín
HO O CH2 C COO

I H
I
HO
+
HO CH CH2 NH2 epinefrín
OH (adrenalín)
CH3

- tryptofan je prekurzorom 5-hydroxy-tryptamínu (serotoninu)

a nikotínamidového kruhu NAD+
serotonin neurotransmiter
je chemický messenger prenáša-
júci signál z nervových buniek do
cieľového orgánu
BIOSYNTÉZA DUSÍKATÝCH ZLÚČENÍN
U ŽIVOČÍCHOV
esenciálne musia byť prijaté v potrave
Aminokyseliny
neesenciálne sú syntetizované v organizme

1 Zabudovanie NH3 (NH4+) do kyseliny glutamovej

(redukčná aminácia)
COOH COOH

C O CH NH2
CH2
CH2 + NH3 + NAD(P)H + NAD(P)+
CH2 glutamátdehydrogenáza CH2
COOH
COOH
k. 2-O-glutarová k. glutamová !
2 Syntéza neesenciálnych aminokyselín
(transaminácia)

COOH COOH

CH NH2 C O
CH2 CH2
+ α-oxokyselina + aminokyselina
CH2 CH2
aminotransferáza
COOH (pyridoxalfosfát) COOH
k. glutamová k. α-O-glutarová

syntéza purínových
Syntéza dusíkatých báz
nukleových Syntéza
syntéza pyrimidínových bielkovín
kyselín
dusíkatých báz
SYNTÉZA NEESENCIÁLNYCH AMINOKYSELÍN

(transaminačnými reakciami s glutamátom)

1. pyruvát + glutamát alanín + α -O-glutarát

2. oxalacetát + glutamát aspartát + α -O-glutarát

3. aspartát + NH4+ + ATP asparagin + AMP + PPi + H+

cicavce glutamin

fenylalanínhydroxyláza
4. fenylalanín + O2 + NADPH + H+
(monooxygenáza)
tyrozín + NADP+ + H2O
 BIOSYNTÉZA AMINOKYSELÍN SKUPINY
GLUTAMÁTU
α -O-glutarát
NH4+ + H+ + NADPH glutamátdehydrogenáza
NADP+
glutamát
ATP + NH4+
glutaminsyntetáza
ADP + Pi + H+

COO -
+
COO- H3 N C H
H
C CH2
H N CH2
CH2
CH2 CH2 C O
prolin NH2 glutamin
 Glutamín je glutamát
glutamín-
transportovateľná forma
syntetáza
amoniaku v krvi

- amoniak je pre živočíšne tkanivá -glutamyl-

toxický glutamín- fosfát
syntetáza
- pred vylúčením do krvi sa naviaže
na glutamát za vzniku netoxického
glutamínu
- glutamín sa transportuje do glutamín
pečene (alebo obličiek)
- v pečeni sa z glutamínu uvoľní glutamináza
močovina
amoniak, ktorý sa detoxikuje
močovinovom cykle

glutamát
 REGULÁCIA GLUTAMINSYNTETÁZY
KOVALENTNOU MODIFIKÁCIOU

Adenylácia je katalyzovaná komplexom AT (adenylyltransferáza) a

jednej formy regulačného proteínu (PA).
Deadenylácia – komplexom AT a druhej formy regulačného.proteínu (PD)
REGULAČNÝ NÍZKOMOLEKULOVÝ
PROTEÍN

PA PD

neuridylovaná uridylovaná
forma forma
 VZÁJOMNÁ PREMENA OBIDVOCH FORIEM PROTEÍNOVEJ
ZLOŽKY ADENYLYLTRANSFERÁZOVÉHO SYSTÉMU PRE
GLUTAMINSYNTETÁZU

neuridylovaná uridylovaná
forma forma
 BIOSYNTÉZA PROLINU
glutamát
ATP + H+ + NADPH
glutamátkinázadehydrogenáza
+
ADP + NADP + Pi
COO
-
+
H3 N C H
CH2

CH2
glutamyl- ornitin arginín
C O
γ-semialdehyd NH2
H
C NH
H2O spontánne
COO-
NH

H CH2 ornitinový
C cyklus
N 1 5 4CH2 CH2
Δ1-pyrolin- CH2
2 3 5-karboxylát
HC CH2
H C NH2
H+ + NADPH
pyrolinkarboxylátreduktáza COOH
NADP+
COO- COO-
H H
C C
HN CH2 C
tvorí sa priamo
HN
prolinhydroxyláza v bielkovine
H2C CH2 H2C CH OH
prolin hydroxyprolin (kolagén)
 BIOSYNTÉZA SERÍNU A GLYCÍNU

2-oxo-
COOH NAD NADH2 COOH glutamát COOH
glutarát
CH OH C O CH NH2
CH2 O P CH2 O P CH2 O P

kyselina 3-fosfoglycerová kyselina 3-fosfo- fosfoserín

hydroxypyrohroznová

H2O

COOH COOH
β
α
HO CH2 THFA + CH2 NH2 CH NH2
β CH2 OH
glycín

serín

serínhydroxymetyltransferáza
SYNTÉZA CYSTEÍNU Z METIONINU
COOH
+
H3 N C H
CH2

CH2

S
CH3 metionin
H2O + ATP
metioninadenozyltransferáza
PPi + Pi

COOH
+
H3 N C H
CH2
CH2
+
S CH2 adenín
CH3 O ! SAM – donor metylovej skupiny

S - adenozylmetionin
OH OH
 THF
prenos na akceptor !
THF-CH3

COOH
+
H3 N C H
CH2
CH2

S CH2 adenín
O

S - adenozylhomocysteín
OH OH
H2O
THF-CH3 homocysteín-metyltransferáza
adenozín

COOH
+
H3 N C H
CH2

CH2

SH homocysteín
 serín
cystationsyntáza
H2O
-
COO
+
H3 N C H
CH2
CH2

S
CH2
+
H3 N C H cystation
COOH

cystationáza (PLP)
NH3

- COOH
COO +
+ C O + NH4
H3N C H
CH2
CH2 cysteín α - oxo-butyrát
CH3
zo serínu SH
z homocysteínu (metioninu)
Cyklus aktívneho -CH3
 CH3 - cyklus

SAM široké spektrum

akceptorov

(zlúčenina s vysokým
prenosovým potenciálom)

homocysteín-
metyltransferáza
metylcobalamín
(vitamin B 12)

z N5 - metylentetrahydrofolátu
z betaínu – oxidačného produktu cholínu
 ODBÚRANIE AMINOKYSELÍN

1
COOH COOH
R C O R CH NH2
CH NH2 + CH2 aminotransferáza C O + CH2
COOH CH2 COOH CH2
aminokyselina COOH COOH
α - oxo-glutarová kyselina
kyselina glutamová
2

COOH COOH
CH NH2 C O
CH2 + NAD(P)+ glutamát- CH2 NH3 + NAD(P)H
+
dehydrogenáza
CH2 CH2
COOH COOH
kyselina glutamová α- oxo-glutarová kyselina

Odstraňovanie NH3 , ktorý je toxický pre bunku: !

glutamát

NH3 glutamin

močovina
 +
NH 4

vylúčenie vo forme

O
+ H
NH 4 H3N C NH3
N
HN
O
O N N
O H H
amoniak močovina kyselina močová

amonotelné ureotelné urikotelné

živočíchy: živočíchy: živočíchy:
väčšina vodných stavovcov, mnohé suchozemské vtáky, plazy
ako napr. ryby stavovce
 Proteíny v bunke

Proteíny zo stravy Aminokyseliny

Biosyntéza AMK, NH4+

nukleotidov, Uhlíkové kostry
biologických amínov

-ketokyseliny
karbamoylfosfát

Aspartát-
Močovinový argininosukcinátový
Citrátový
CO2+H2O+ATP
cyklus skrat cyklus

Glukóza
Močovina oxalacetát (syntetizovaná v
(vylučovaná forma N) glukoneogenéze)
 mitochondria cytoplazma

+ +
CO2 + NH3 CH2 NH3 CH2 NH3

CH2 CH2
2 ATP karbamoylfosfát-
CH2 CH2
syntetáza +
+
H C NH3
2 ADP H C NH3
+ Pi COO- COO-

O O ornitín ornitín
H2N C O P O
NH2 NH2
karbamoylfosfát O
C O C O
ornitíntrans-
CH2 CH2
karbamoyláza NH NH
CH2 CH2
Pi
CH2 CH2
+ +
H C NH3 H C NH3

COO- COO-

citrulín citrulín
 NH2
cytoplazma NH2 C
+
NH2
C O CH2 NH
H2O COO-
NH2 CH2
CH
CH2
močovina CH fumarát
+
C NH3
argináza H
COO-
+
ornitín CH2 NH3 COO- +
NH2 COO-
CH2 arginín
C NH CH
CH2

H C NH3
+ arginínosukcináza CH2 NH CH2

CH2 COO-
COO-
ornitín NH2 Močovinový CH2
arginíno-
+
C O cyklus H C NH3 sukcinát
CH2 NH COO-
CH2 AMP
citrulín CH2 arginínosukcinát- COO-

H C NH3
+
syntetáza H3N
+
CH

citrulín COO- CH2

ATP
aspartát COO-
PPi
Prepojenie medzi močovinovým cyklom a
citrátovým cyklom

CO2 + NH3

karbamoylfosfát -keto-
kyselina
citrulín aspartát
-amino-
oxalacetát kyselina
ornitín
arginínosukcinát
malát

arginín fumarát

močovina
Glukogénne AMK
Ketogénne AMK