Patrick, An Introduction to Medicinal Chemistry 5e

Chapter 9 – Nucleic acids as drug targets

Answers to end-of-chapter questions

1) Puromycin bắt chước aminoacyl ở phần cuối phân tử aminoacyl-tARN.

Aminoacyl-tRNA là phân tử vận chuyển 1 acid amine đến ribosome để acid amin
gắn vào chuỗi protein ( section 6.2.2)
NH2 NMe2

N N
N N

N N
O Adenosine N N

O P O O HO
O
O-
O O OH MeO NH OH
O
tRNA Aminoacyl
moiety
R NH2 NH2

Aminoacyl-tRNA Puromycin

Vì puromycine giống với nhóm aminoacyl và adenosine của aminoacyl- tRNA, nên
nó có thể vào vùng A của ribosome. Sau khi vào, nó ngăn phân tử aminoacyl-
tRNA bind (gắn) vào. Nó có nhóm amino dễ phản ứng trao đổi và liên kết peptide
bị chuyển từ tARN trong biding site P sang puromycine ở biding site A. Puromycin
rời khỏi ribosom mang theo 1 phần protein ko hoàn chỉnh

Because puromycin resembles the aminoacyl and adenosine moieties of aminoacyl-

tRNA, it is able to enter the A site of the ribosome. By doing so, it prevents
aminoacyl-tRNA molecules from binding. It has the amino group required for the
transfer reaction and so the peptide chain is transferred from tRNA in the P binding
site to puromycin in the A binding site. Puromycin departs the ribosome carrying a
stunted protein along with it.

Adenine Adenine

Phosphate Ribose Puromycin

PhosphateRibose
Puromycin
O NH
NH2
OH
O O
Peptide chain
Peptide chain tRNA
tRNA

© Oxford University Press, 2013. All rights reserved.

2)
X
R

O R
O O R
N
HN N N HN
HN
HN H2N N
N N
2 N H2N N N

O O
O
O O OH2
O
H H
H H
H H H H
H
O O
O
O P OH P
O OH O P OH
O
O O

O O
O
O O
O O OH OH
H H
H
H H
H
H OH
O
P O
O OH OPOH O P OH
O O
O

3) Cấu trúc này được gọi là zidovudine và là tác nhân quan trọng trong điều trị AIDS
(section 20.7.3.1). Nó là 1 chất tương tự deoxythymidine khi đường nhóm 3’-hydroxy
bị thay thế bởi 1 nhóm azido. Giống aciclovir (section 9.5), nó có thể hoạt động như 1
bộ kết thúc chuỗi khi nó bị chuyển đổi thành triphosphate. Nó bị nhầm lẫn với normal
building block trong tổng hợp DNA, và sự hiện diện của vòng thymine cho phép nó
bắt cặp base với adenine. Đơn vị đường có nhóm thế azide ở đầu 3’ thay vì nhóm
rượu, và vì thế chuỗi acid nucleic ko thể kéo dài.
This structure is called zidovudine and is an important agent used in the treatment of
AIDS (section 20.7.3.1). It is an analogue of deoxythymidine where the sugar 3'-
hydroxyl group has been replaced by an azido group. Like aciclovir (section 9.5), it
can act as a chain terminator once it has been converted to a triphosphate. It is
mistaken for a normal building block in DNA synthesis, and the presence of a
thymine ring allows it to base pair to adenine. The sugar unit has an azide substituent
at the 3' position instead of an alcohol group, and so the nucleic acid chain cannot be
extended any further.
4)