Professional Documents
Culture Documents
0012
A modellszervezetek által feltárt mechanizmusok zöme általános, azaz érvényes a rokon fajok
nagy csoportjára. Egyetlen szervezetben nem vizsgálható minden biológiai kérdés, ezért van
szükség több, az egyes nagyobb taxonómiai csoportokat képviselő modellszervezetre.
Előnyös, ha a választott élőlény kis testméretű, könnyen fenntartható, rövid a generációs ideje,
sok utódot hoz létre és a kontrollált keresztezések könnyen kivitelezhetőek.
Az első genetikai modellszervezet a Mendel által tanulmányozott veteményborsó
(Pisumsativum). Segítségével Mendel az élővilág nagy részére általánosan érvényes
öröklődési szabályszerűségeket tárt fel.
Vírusok, ezen belül bakteriofágok (T4); prokarióták (E. coli); eukarióták (élesztők, fonalas
gombák, lúdfű, ecetmuslica, fonalférgek, egér)
F2 9 A– B– színes
3 aa B– színes
3 A– bb színes
1 aabb fehér
3. Rajzoljon fel egy olyan négygenerációs családfát, amelyben egy monogénes, X-hez kötött
recesszív jelleg öröklődése látható! Írja fel a személyek genotípusát is!
XX, vagyis homozigóta nő
XX*, vagyis heterozigóta hordozó nő
XY, vagyis egészséges férfi
X*Y, vagyis beteg férfi
4. Képzelje el, hogy rendelkezésre áll a vad típus, és belőle mutagenezissel előállított négy
szárazságtűrő tiszta vonalú burgonya.
a, Milyen genetikai kísérlet (milyen eredménnyel) igazolná azt, hogy egy mutáns vonalban
egyetlen gén változata okozza a nagyobb szárazságtűrő fenotípust, valamint azt, hogy a
szárazságtűrő fenotípust eredményező allél domináns vagy recesszív-e a vad génváltozathoz
képest?
b, Tegyük fel, hogy mind a 4 mutánsvonalban egy-egy gén recesszív allélja felel a nagyobb
szárazságtűrésért. Hogyan állapítani meg, hogy a vonalakban ugyanazon gén, vagy más gének
változatai okozzák a szárazságtűrő fenotípust? Mutassa be a megoldáshoz vezető genetikai
analízist mindkét lehetséges kimenetellel! Hogyan értelmezi azt a kijelentést, hogy a négy
mutáns vonal három komplementációs csoportba sorolható?
Ha a kódolt fehérje eredeti működése gátlódik vagy elvész akkor funkcióvesztéses, vagy loss
of function (LoF) mutáció lép fel. Amennyiben a génműködés teljesen kiesik, „nulla allél”
jön létre. Ha a vad típusú funkcióból valamennyi megmarad, azt homozigóta formában leaky
(magyarul sántának nevezett) fenotípus jelezheti. A funkcióvesztéses mutációk általában
recesszívek. A gén egyetlen sértetlen példánya ugyanis legtöbbször a vad fenotípus
kialakításához elegendő terméket termel. Azon ritka esetekben, amikor egyetlen ép
génpéldány nem elegendő a vad fenotípus kialakításához(recesszív), a funkcióvesztéses allél
domináns fenotípust okoz (haplo-elégtelenség, haploinsufficiency).
Léteznek ún. domináns negatív mutációk is. Ezek olyan funkcióvesztéses mutációk,
amelyeknél a vad alléllal szemben mutatott dominancia oka az, hogy a funkcióvesztett
géntermék gátolja az ép géntermék működését.
Funkciónyeréses:
A mutáció a sejtben megváltozott működésű génterméket is eredményezhet. Megemelkedhet
például a fehérje eredeti aktivitása, vagy teljesen új reakciókban is részt vehet. A megváltozott
működés a heterozigótákban is megjelenik, és általában domináns fenotípust okoz.
7. Az 5’-CGTATGAATGGCGTT-3’ példáján mutassa be, mit jelent az, hogy a DNS egyik
és másik szála eltérő kódot jelent! Adja meg a lehetséges RNS és peptid szekvenciákat!
Hisztonvíriánsok:
Az alap hiszton fehérjék kicserélődhetnek hiszton
változatokra, valamint kovalens módosulásokon
eshetnek át. Ezek a mechanizmusok hatással vannak
a lokális kromatinszerkezetre, így jelentős szerepük
van a génátírás szabályozásában.
A H2A.Z fehérje a H2A hiszton egyik változata,
mely inaktív gének promóter régiójában fordul elő.
Kicserélődésével aktiválódhat a gén.
Egy másik hisztonvariáns a CENP-A ,egy H3
hisztonváltozat. A hiszton változatok egyedi,
nukleoszómából kinyúló „farkai” lehetővé teszik
egyedi regulátor fehérjék kötését.
Magyarázza a fogalmakat!
primer: A primer körülbelül 8–12 nts hosszú RNS-szakasz, melyet a primáznak nevezett RNS-
polimeráz szintetizál. A DNS szintézishez szükséges rövid kezdőszakasz.
5’-UTR:a képződő RNS-transzkriptumnak van egy olyan 5’ végi szakasza, mely nem kerül
transzlációra.
háztartási gének: Olyan gének, melyek termékeire állandóan szüksége van az élőlénynek, ezért
expressziójuk állandó
anyai imprinting: az anyától származó génpéldány inaktív, az imprintinget szenvedő génekre nézve
az egyed hemizigótaként viselkedik
homológ rekombináció:
a homológ kromoszómák tagjain belüli allélkicserélődés vezet új allélkombinációk kialakulásához
operon: Baktériumokban az egy folyamatsorban részt vevő fehérjék génjei általában csoportokba
rendeződnek a kromoszómán, ún. operonokat alkotnak
2014. december 19.
1.
2. Mi a célja a genetikai térképezésnek? Mutassa be a kétpontos térképezés lépéseit
tetszőleges genetikai szimbólumokkal, és fűzzön hozzá magyarázatot is! Rajzolja fel a
példában szereplő allélok elrendeződését sematikus kromoszómális szinten is! Milyen
adatokból és hogyan számoljuk a lókuszok közti távolságot (számolja ki a tetszőleges
példa alapján)?
A géntérkép megadja a lókuszok egymáshoz viszonyított távolságát, amelytől függ, hogy két
lókusz között a meiózisok hány százalékában történik rekombináció. 50%-nál nagyon
rekombináns frekvencia nem kapcsolt génre jellemző.
Kis távolságon belül kisebb, nagyobb távolságon belül nagyobb valószínűséggel megy végbe
rekombináció. Kis géntávolságok esetén, melyeknél a kapcsoltság kimutatható (50%-nál
kevesebb rekombináns termék), a keletkezett rekombináns termékek aránya a gének közötti
viszonylagos távolság jó mérőszáma. Ha két lókusz olyan távol helyezkedik el egymáshoz
képest a kromoszómán belül, hogy közöttük minden meiózisban történik legalább egy (de akár
több) ponton rekombináció, akkor a rekombináns termékek 50%-ban keletkeznek, vagyis
pontosan olyan arányban, mintha a két lókusz külön kromoszómán helyezkedne el. Ezt
ismerte fel Sturtevant, és használta ki elsőként muslicában gének egymáshoz viszonyított
helyzetének meghatározására, azaz géntérképezésre. A módszer általánosan használható. Egy
géntérképegység (map unit, rövidítve m.u.) az a génpárok közötti távolság, amikor 100
meiotikus termékből 1 rekombináns.
kétpontos térképezés:
A legegyszerűbb térképezés során egyszerre két lókusz távolságát határozzuk meg, ezt az
eljárást kétpontos térképezésnek nevezzük. A kétpontos térképezés sémája:
3. F2 utódok számolása
F2 fenotípusok: (1:1:1:1-t várnánk)
vad szem, vad szárny pr+ vg+ 157 vártnál kevesebb
vad szem, csökött szárny pr+ vg 965 vártnál több
lila szem, vad szárny prvg+ 1067 vártnál több
lila szem, csökött szárny prvg 146 vártnál kevesebb
összesen: 2335 utód
,
4. A fehérjék elsődleges szerkezetére nézve milyen típusú pontmutációkat ismer? Sorolja
fel azokat, és a megadott kódszótár segítségével minden típust mutasson be egy konkrét
példán keresztül!
Pontmutációk kialakulása:
Szubsztitúció esetén egy bázis egy másik bázisra cserélődik ki
Tranzícióról beszélünk, ha egy bázis hozzá hasonló kémiai tulajdonságú bázisra
cserélődik. Ez esetben egy purinvázas bázis purinvázas bázisra (A → G vagy G → A), vagy
egy pirimidin vázas bázis pirimidin vázas bázisra cserélődik ki (T → C vagy C → T).
Transzverzió esetén egy purin bázis változik pirimidinre (A → C, A → T, G → C, G
→ T), vagy egy pirimidin purinra (C → A, C → G, T → A, T → G).
A mutációk által izolált két gént (melyek neve lacZés lacY) térképezték, és
megállapították, hogy ezek egymáshoz igen közel helyezkednek el a kromoszómán.
A DNS másolása szemikonzervatív (félig konzervatív) módon történik. Ez azt jelenti, hogy a
kettős szálú DNS molekula másolásakor az egyik és a másik régi (szülői) szál mellé is
szintetizálódik egy-egy új szál, így a létrejövő két kópia egyik szála régi, a másik pedig új
lesz.
A szemidiszkontinuus azt jelenti, hogy a replikáció az origótól mindkét irányban halad, ez
két replikációs villát és négy újonnan szintetizálódó szálat jelent.
7. Sorolja fel és röviden jellemezze az eukarióta transzkripcióban részt vevő cisz- és transz
elemeket!
Cisz elemek:
Silencer:
Transzkripciót gátló távoli cisz elemeket is ismerünk, ezeket silencereknek nevezzük. A silenceren
keresztül ható szabályozó fehérjék gátolják a transzkripciót.
válasz elemek: (response elements, RE) a szabályozó promóter vagy az enhancer régiókban
helyezkednek el. Néhány példa: hősokk válasz elem – HRE, ösztrogén válasz elem – ERE,
glükokortikoid válasz elem – GRE, fém válasz elem – MRE.
Transz elemek:
Transzkripciós faktoroknak nevezzük a transzkripcióban részt vevő szabályozó fehérjéket,
melyek diffúzibilis molekulák, minden jelen lévő DNS-molekulán képesek hatni.
A bemutatott cisz szabályozó elemekhez kapcsolódva befolyásolják a génátírást. A TF-ok a
transzkripciót pozitívan vagy negatívan befolyásolhatják.
A TF-ek moduláris szerkezetű fehérjék, s az alábbi domének kombinációit hordozhatják:
-DNS-kötő domén, mely által a DNS specifikus szakaszaihoz kötődnek
-fehérjekötő domén, mely által kapcsolatot teremtenek más TF-ekkel, vagy az RNS-polimerázzal
-a kromatinszerkezetet befolyásoló domén
-a különféle fiziológiai hatásokat érzékelő domén (például hormonkötő domén a nukleáris
hormonreceptoroknál, melyek valamely hormon kötésével aktív transzkripciós faktorként
működnek)
A DNS-kötő domén szerkezete alapján négy fő csoportba, funkcionális szempontok szerint pedig
számos családba sorolják.
hélix-fordulat-hélix (helix-turn-helix)
cink-ujj (zink-finger
leucin cipzár (leucinezipper)
hélix-hurok-hélix (helix-loop-helix
8. Magyarázza a fogalmakat!
3+3 leolvasási keret: Három lehetséges olvasási keret létezik, melyek egyenként a három
nukleotidról indulnak ki. PL: ,G,C,UAGCU
domináns episztázis: A domináns episztázisban két gén között olyan episztatikus viszony áll
fenn, melyben az episztatikus gén domináns allélja akadályozza meg a másik gén alléljainak
fenotípusos kifejeződését.
hisztonok: a DNS tömörítésében résztvevő konzervált fehérjék, rájuk tekeredik fel a DNS,
oktamereket alkotnak
mutációs forrópont:egy génnek azon része, amely nagy valószínűséggel válik mutáns hellyé
ortológ gének: két gén ortológ, ha két különböző fajban találhatóak, és egy
közös ős-génből származnak, mely a két faj közös ősében volt jelen.
Ugyanazt a funkciót szolgálják, a két fajban. Példa: laktát dehidrogenáz (ill.
génje) az emberben és az egérben.
Ames teszt: bakteriális reverzmutagenitási teszt.
1.
2.
3. Egy családban az apa AB az anya pedig 0-s vércsoportú. 4 gyermekük van,
vércsoportjuk a következő: AB, A, 0, B. Az egyik gyerek adoptált, egy másik pedig az
anya előző házasságából van. Állapítsa meg, melyik gyerek az adoptált és melyik van az
előző házasságból!
Az AB vércsoport domináns jelleg, a 0-s pedig recesszív, tehát 0-s vércsoport csak úgy jöhet
létre, ha 0,0 a genotípus. Az apa vagy A-t vagy B-t ad, így neki nem lehet nullás gyereke.
Viszont az anyának nem lehet AB-s gyereke, mivel ő csak 0-át tud adni.
Ezeket összegezve az apa sajátjai az A-s és B-s gyerekek, örökbefogadott az AB-s gyerek és
az anya előző házasságából származik a 0-s gyerek.
A mRNS-nek ki kell jutnia a sejtmagból, ami előtt több módosításon is átesik, ez a pre-mRNS
érése.
A lépések a következők:
1. az 5’ vég egy „sapkát” (cap) kap,
2. a 3’ végre adenin tartalmú nukleotidokból álló szakasz (poliA) kapcsolódik a
poliadenilációnaknevezett folyamat során
3. meghatározott szakaszai, az intronok kivágásra kerülnek, ez a splicingnevű folyamat,
2. A 3’ részen egy enzim elvágja az RNS-t, és az elvágott 3’ véghez egy 150–200 adenint
tartalmazó nukleotidfüzér, poliA-farkot szintetizálódik. Ezt poliadenilációs szignálnak
nevezzük.
8. Magyarázza a fogalmakat!
visszamutató mutáció (reevz): vad típusú allél létrejötte a mutáns allélból egy véletlenszerű,
ugyanazon a helyen történő második mutációval
alternatív szigma faktorok: Azok aszigma faktorok, amelyek különböző környezeti tényezők
hatására vagy regulációs kaszkádok aktiválódásakor jelennek meg, és speciális, eltérő
promóterszerkezettel rendelkező gének átíródását biztosítják a coreRNS-polimerázhoz
kapcsolódva.
frameshift mutáció: egy vagy több nukleotid inszerciója vagy deléciója egy kódoló régióban,
ami a leolvasási keret eltolódását eredményezi. A kodonok más fehérje szekvenciát
határoznak meg mint az eredeti szekvencia.
2014. május 30.
1.
2.
3. Fentebb.
Az intrinsic terminációs mechanizmus direkt út, külső faktor nem szükséges hozzá. A
terminációs szignál – ahogy a mechanizmus neve is utal rá – a DNS-ben kódolt. Ez egy kb.
40 nukleotid hosszú szekvencia, mely rendelkezik
két egymással komplementer, GC-gazdag
szakasszal, melyet minimum hat A nukleotid követ
(7.6. ábra). Ez a DNS-templátra jellemző
szekvencia a róla átíródó mRNS-ben, az ellentétes
irányultságú komplementer szakaszoknak
köszönhetően, ún. hajtű szerkezet kialakulását
idézi elő (7.6. ábra). Ezt követi egy A-U hibrid
szakasz, mely laza DNS-RNS párosodást okoz.
Feltételezhető, hogy a transzkripció során az RNS-
polimeráz érzékeli, ha túl laza a „mögötte hagyott”
DNS-RNS hibrid szakasz, ekkor visszalép, és
megpróbálja stabilizálni azt. A terminációs
szakaszon kialakuló laza A-U kapcsolódás ezért
leállásra és visszalépésre késztetheti az RNS-
polimerázt, a stabil, GC-párok által összetartott
hajtű struktúra pedig útját állja, melynek hatására
a polimeráz és az RNS leválik a DNS-ről.
9. Magyarázza a fogalmakat!
mutációs ráta: Mutációs sebesség. A mutációs események száma génenként időegység alatt.
Az időegységet általábangenerációkban mérik
A genetikai boncolás egy biológiai folyamat részekre bontható, az adott biológia kérdésben
érintett mutánsok vizsgálatáavl pedig az egyes részek genetikai háttere feltárható. Úgy
működik, hogy a folyamatot elrontó összes mutációt (telítési mutagenezissel) egyenként
azonosítják és jellemzik.
Az előrehaladó genetikai analízis a kérdéses tulajdonságot kialakító gént és mechanizmust
vizsgálja.
A fordított genetikai analízis egy ismert genetikai változás hatását vizsgálja.
2.
3. Mit jelent a genetikai kapcsoltság? Hogyan jelentkezik a kapcsoltság a Mendeli
számarányokban? Vázoljon fel egy olyan keresztezést, amelyben két gén kapcsoltan
öröklődik! Hogyan keletkeznek a rekombinánsok kapcsolt gének esetén? Az
ivarsejtképződés mely fázisában és milyen mechanizmus szükséges a rekombináns
utódok kialakulásához? Rajzolja fel ezt a genetikai jelenséget a kromoszómák szintjén!
Mit mutat meg a rekombináns utódok aránya?
Ezen gének lókuszai azonos kromoszómán, egymáshoz közel helyezkednek el, ezért a
kromoszómák szegregálása során a két gén együtt mozog.
Az eredeti (szülői P) tulajdonságok kombinációja (azaz allélkombinációk) jelennek meg a
vártnál nagyobb arányban az F2 generációban
A meiózisok első osztódásának profázisában történik a rekombináció, amikor a homológ
kromoszómapárok párosodnak, tetrádot hoznak létre. Részében a homológok szakaszokat
cserélnek ki, melynek következményeként új allélkombinációjú kromoszómák
keletkeznek.
A rekombináns szülői arányból következtethetünk a lókuszok közti távolságra, ezt
használják fel a kapcsoltsági térképeknél.
2 lókusz közötti crossing over átlagosan 50% rekombináns utódot eredményez.
3. F2 utódok számolása
F2 fenotípusok: (1:1:1:1-t várnánk)
vad szem, vad szárny pr+ vg+ 157 vártnál kevesebb
vad szem, csökött szárny pr+ vg 965 vártnál több
lila szem, vad szárny prvg+ 1067 vártnál több
lila szem, csökött szárny prvg 146 vártnál kevesebb
összesen: 2335 utód
Fentebb
5. Milyen génexpressziós szabályozás jellemző baktériumokban a lebontó és a felépítő
folyamatokban résztvevő operonokban? Hozzon egy-egy példát, és röviden mutassa be a
szabályozási mechanizmusokat!
fentebb
7. Magyarázza a fogalmakat!
episztázis: A gének közötti kölcsönhatás azon fajtája, amikor egy gén által befolyásolt
fenotípus megjelenése egy másikgén genotípusától függ. Az az oka, hogy mindkét gén
terméke ugyanazon folyamat egymást követő lépéseiben játszik szerepet
kondícionális mutáció: feltételes mutáció Olyan mutáció, amely csak bizonyos környezeti
körülmények között mutat mutáns fenotípust. Permisszív körülmények között vad, restriktív
körülmények között mutáns a fenotípusa.
RNS interferencia: A mRNS-el homológ rövid kettős szálú RNS darabkák (siRNS) által
előidézett géncsendesítés, ami azon alapszik, hogy az siRNS a RISC komplexhez kapcsolódva
a mRNS degradációját okozza
2012. 01. 10.
Egy ivarsejtben 23 kromoszóma van, mely tartalmazza az összes gén-t de a testi sejtekkel
ellentétben csak egy példányban, egy alléljával.
A génpár tagjai a meiózis során szétválva jutnak a gamétákba: a gaméták egyik fele a génpár
egyik tagját, másik fele a génpár másik tagját hordozza. Ez Mendel első törvénye, melyet az
egyenlő szegregáció törvényeként is ismerünk.
Az ivarsejtek tehát minden génnek csak egy allélját tartalmazzák.
Megtermékenyítéskor a gaméták véletlenszerűen fuzionálnak, függetlenül attól, hogy mely
allélokat hordozzák.
A kód három betűs (triplet) voltát kísérletesen Watson Crick és SeymourBenzer igazolta
1961-ben klasszikus genetikai eszközökkel az E. coli T4 fágjának rII lókusza segítségével.
Attenuációval:
Ha sok a triptofán(van elég
trp-tRNS), a riboszóma
fennakadás nélkül beépíti a két
egymást követő triptofánt a
leaderpeptidbe, tehát gyorsan
végighalad az mRNS 1-es
szakaszán, és eléri a 2-es
szakaszt. Emiatt a
szintetizálandó mRNS 2-es
szakasza fizikailag nem képes a
3-as szakasszal komplementer
párosodást kialakítani. A 3-as
szakasz így a legutóbb képződő
4-es szakasszal alakít ki
bázispárosodással egy hurok
(hajtű, hairpin) szerkezetet,
amelyet U-füzér követ. Ezzel
kialakul egy transzkripció terminációs szignál (-függetlentermináció). Ennek hatására az
RNS-polimeráz leválik, nem viszi végbe a mRNS további szintézisét, tehát az enzimek
kódoló szakaszait már nem írja át. Leáll a triptofán bioszintézis enzimeinek termelése.
Ha kevés a triptofán(nincs elég trp-tRNS), a riboszóma a mRNS 1-es szakaszánál
stagnál, vár az érkező trp-tRNS-re. Ekkor a 2-es és 3-as szakaszok párosodnak, és nem
alakul ki a 3+4-es szakaszok általi transzkripció terminációs jel. Az RNS-polimeráz
tovább halad, átírja a struktúrgéneket egy policisztronosmRNS-be, melyről a triptofán
bioszintézis enzimei képződnek.
Az attenuáció tehát egy transzkripció termináció általi szabályozási forma. A
triptofánoperonon kívül több más, aminosavszintézisben részt vevő operonon is
érvényesül hasonló regulációs mechanizmus.