Professional Documents
Culture Documents
Goi SV 2023 - ProteinSynth
Goi SV 2023 - ProteinSynth
1
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
Chu trình
phenylalanine
• 1941: Beadle vaø Tatum ñaõ söû duïng moác vaøng baùnh mì
Neurospora crassa ñeå chöùng minh gen kieåm tra caùc phaûn öùng
sinh hoùa.
• Loaøi hoang daïi naøy moïc ñöôïc treân moâi tröôøng toái thieåu (nöôùc,
muoái khoaùng (NPK), glucose vaø biotin)
• Dùng tia phóng xạ và tử ngoại gây đột biến khuyết dưỡng
• Đoät bieán khuyeát döôõng (auxotroph): chæ moïc ñöôïc treân moâi
tröôøng toái thieåu khi coù theâm vaøo chaát maø ñoät bieán khoâng toång
hôïp ñöôïc. Ví duï: arg- khoâng moïc ñöôïc treân moâi tröôøng toái thieåu;
nhöng chuùng moïc ñöôïc khi coù theâm vaøo arginine.
3
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
Thí nghiệm kiểm tra gene mã hóa tổng hợp các chất biến dưỡng
ở mốc vàng bánh mì Neurospora crassa
- MM: môi
trường tối thiểu
- Control: đối
chứng
- Supplements:
Các chất bổ sung
- Mutant: thể
đột biến
4
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
Thí nghiệm kiểm tra gene mã hóa tổng hợp các chất biến dưỡng
ở mốc vàng bánh mì Neurospora crassa
5
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
➢ Söï lieân quan ñoàng tuyeán tính giöõa DNA vaø protein
➢ 1953, moâ hình caáu truùc DNA cuûa Watson - Crick ñöôïc neâu leân
➢ 1953, Sanger laàn ñaàu tieân tìm ra trình töï caùc amino acid cuûa
insulin (51 amino acid).
➢ Caùc möùc caáu truùc khoâng gian khaùc nhau cuûa phaân töû protein
ñöôïc xaùc ñònh moät caùch töï ñoäng bôûi trình töï saép xeáp cuûa caùc
amino acid theo ñöôøng thaúng (caáu truùc baäc moät).
➢ Boán loaïi nucleotide cuûa DNA cuõng xeáp theo ñöôøng thaúng vaø trình
töï saép xeáp cuûa chuùng cuõng phaûn aùnh moät thoâng tin nhaát ñònh.
7
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
8
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
▪ Nghiên cứu hằng trăm ñoät bieán hemoglobine lieân quan ñeán caùc
beänh thieáu maùu: moãi ñoät bieán trên DNA lieân quan vôùi moät
thay ñoåi amino acid nhaát ñònh treân maïch polypeptide cuûa
hemoglobine → laøm saùng toû moái quan heä DNA - protein.
▪ Giöõa DNA vaø protein coù söï lieân quan ñoàng tuyeán tính (söï thay
ñoåi caùc nucleotide treân maïch thaúng cuûa DNA daãn ñeán caùc thay
ñoåi amino acid treân maïch thaúng cuûa phaân töû protein).
9
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
10
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
Replication
➢ H.G. Khorana (1964) tìm ra phöông phaùp taïo mRNA toång hôïp
nhaân taïo vôùi trình töï laäp laïi (nhö AAG AAG AAG...).
➢ Trong 64 codon của baûng maõ di truyeàn , coù 3 codon UAA, UAG,
UGA khoâng maõ hoùa cho amino acid ñöôïc goïi laø voâ nghóa (non-
sense), ñoàng thôøi laø codon keát thuùc (termination).
13
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
1. Học thuyết trung tâm (CENTRAL DOGMA)
15
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
16
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
Điểm khởi sự
1. Khởi sự
phiên mã
Mạch khuôn
DNA RNA
tháo xoắn
RNA hoàn tất
2. Kéo dài
Hướng phiên mã (downstream)
DNA đóng
xoắn trở lại
18
RNA
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
The stages of transcription
19
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
Các bước của quá trình phiên mã
20
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
Tiền mRNA
mRNA
trưởng thành
The 5' UTR is upstream from the coding sequence. Within the 5' UTR is a sequence that is recognized by the
ribosome which allows the ribosome to bind and initiate translation. The mechanism of translation initiation
differs in prokaryotes and eukaryotes.
The 3' UTR is found immediately following the translation stop codon. The 3' UTR plays a critical role in 22
translation termination as well as post-transcriptional modification
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
Spliceosome: phức
hợp của protein và các RNA
nhỏ (small RNA): small
nuclear RNA- snRNA
23
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
24
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
Ribozyme
• Phát hiện khả năng xúc tác của spliceosome dẫn đến sự
khám phá Ribozyme.
• Rybozyme: phân tử RNA có vai trò như một enzyme có
khả năng xúc tác cắt các intron.
• Ở một vài sinh vật, sự cắt xén RNA (RNA splicing) có
thể xảy ra mà không cần có sự tham gia của protein.
25
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
Alternative splicing
Tổng số các loại protein nhiều gấp vài ba lần so với tổng số gen.
Việc cắt bỏ intron và nối các exon thay đổi theo các kiểu khác nhau (alternative
splicing) là cơ chế chủ yếu tạo ra các mRNA khác nhau, và tạo ra dòng các
protein biến thể.
Lý do bộ gen người chỉ có 26.000 gen (phỏng đoán: 100.000). 27
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
Splicing khác nhau của gen α-tropomyosin
mRNA cơ vân
mRNA cơ trơn
mRNA não
RNA polymerase
➢Khuôn cho RNA polymerase là DNA mạch kép,
nhưng chỉ phiên mã một mạch có nghĩa (sense).
➢Ở sinh vật nhân sơ chỉ một loại RNA polymerase
tổng hợp tất cả các loại RNA.
➢Sinh vật nhân thực có 3 loại RNA polymerase tổng
hợp 3 loại RNA khác nhau.
29
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
30
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
33
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
(Py: pyrimidine)
rRNA ribosome
• Nhân tố phiên mã +
trình tự enhancer.
Trình tự tăng
cường → Các nhân tố phiên mã
phiên mã
(enhancer) Nhân tố phiên mã + RNA polymerase.
hình thành vị trí nối → Các nhân tố phiên mã
cho RNA polymerase
+ RNA polymerase +
TATA box.
Hướng của
phiên mã → tách mạch đôi DNA
và khởi sự phiên mã.
Vai trò của 3 loại RNA tham gia vào tổng hợp protein 38
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
rRNA ribosome
RNA coù theå ôû daïng töï do hoaëc gaén vôùi
protein thaønh caùc phöùc hôïp
ribonucleoprotein giöõ nhieàu vai troø
quan troïng trong hoaït ñoäng soáng cuûa
teá baøo.
39
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
rRNA ribosome
rRNA laø thaønh phaàn caáu taïo, chieám phaân nöûa khoái löôïng cuûa
ribosome. Teá baøo coù soá löôïng lôùn ribosome neân rRNA chieám tæ
leä cao, coù theå ñeán 75% cuûa toång RNA.
Caùc ribosome cuûa luïc laïp, ti theå vaø Prokaryotae coù heä soá laéng
khi ly taâm laø 70S, goàm 2 ñôn vò:
- ñôn vò lôùn 50 S: 1 rRNA 23S vaø 1 rRNA 5S,
- ñôn vò nhoû 30S: 1 rRNA 16S.
40
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
rRNA ribosome
Caùc ribosome cuûa Eukaryotae coù heä soá laéng khi ly
taâm laø 80S, goàm 2 ñôn vò:
• - ñôn vò lôùn 60 S coù 1 rRNA 28S, 1 rRNA 5,8S vaø 1
rRNA 5S,
• - ñôn vò nhoû 40S chæ coù 1 rRNA 18S.
43
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription và các RNA)
45
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription) và các RNA
- mRNA chứa vùng mã hóa và vuøng khoâng maõ hoùa cho protein
- Trình töï Shine-Dalgarno sequence (SD) = Ñieåm baùm vaøo ribosome (ribosome Binding
Site (RBS): - Hoã trôï gắn ribosome leân mRNA ñeå khôûi sö dịch maõ; Coù theå baêùt caëp base
vôùi trình töï treân ribosomal rRNA
- Codon AUG sau trình töï SD-sequence laø ñieåm khôûi söï dòch maõ
47
(the start site of translation)
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription) và các RNA
• Các mRNA của vi khuẩn có nửa thời gian (half time) tồn
tại ngắn trung bình 2 phút, trong khi mRNA nhân thực
khoảng 30 phút đến 24 giờ.
48
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
2. Phiên mã (Transcription) và các RNA
50
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
51
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
E. coli coù tRNA khôûi söï cuûa methionin khaùc vôùi tRNA gaén
methionin ôû giöûa phaân töû protein. (methionin ñaàu tieân cuûa
caùc protein E. coli ñöôïc gaén theâm acid formic thaønh N-formyl
methionin ôû ñaàu amin).
52
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
Dieãn bieán dòch maõ ôû ribosome
➢ Khôûi söï (initiation) dịch mã
Thuật ngữ:
- Đầu amin của chuỗi
polypeptide.
- Phức hợp aminoacyl tRNA
- Sự nhận biết codon
- Sự hình thành nối peptide
- Sự dịch chuyển
55
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
Dieãn bieán dòch maõ ôû ribosome
➢ Kết thúc (termination) dịch mã
56
56
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
Dieãn bieán dòch maõ ôû ribosome
➢ Kết thúc (termination) dịch mã
Thuật ngữ:
- Stop codon
- Nhân tố tách mạch, (nhân tố giải phóng)
- Chuỗi polypeptide tự do
- Thủy phân: thủy phân tách aa cuối cùng ra khỏi tRNA
57
- Sự tách ra (tháo rời) của 2 tiểu đơn vị ribosome
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
Polyribosome (polysome)
Khoảng 15 ribosome có thể gắn cùng lúc trên mRNA, cách nhau 80
nucleotide. Nhờ vậy, tốc độ tổng hợp protein tăng nhanh đáng kể.
Hướng dịch mã từ 5’→ 3’
trên mRNA Ribosome
mRNA
Polypeptide
RNA polymerase
DNA
Hướng
Ribosome phiên mã
mRNA Hướng
dịch mã
58
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
Polyribosome (polysome)
59
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
▪ Trong suốt và sau khi tổng hợp, protein cuộn và gấp tạo cấu trúc
bậc 3 (tự phát).
▪ Cấu trúc bậc 1 xác định cấu trúc bậc 2 và 3.
▪ Các protein chaperone hổ trợ sự gấp cuộn đúng của protein.
▪ Các protein đòi hỏi các biến đổi sau dịch mã để đảm bảo chức
năng: thêm đường, lipid, nhóm phosphate vào các aminoacid; enzyme
có thể cắt một vài aminoacid ra khỏi đầu leading của chuỗi
polypeptide.
▪ Một vài trường hợp: 1 chuỗi polypeptide đơn bị cắt bởi enzyme
thành 2 hay nhiều đoạn.
▪ Hai hay nhiều chuỗi polypeptide có thể kết hợp với nhau tạo cấu
trúc bậc 4. 60
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
Các polypeptide được tổng hợp khác nhau ở các vị trí trong tế
bào
▪ Các ribosome tự do trong tế bào chất tổng hợp các protein định vị
trong tế bào chất.
▪ Các ribosome đính ở mạng lưới nội chất nhám (ER) hay màng
nhân tổng hợp các protein của hệ thống nội màng (the nuclear
envelope, ER, Golgi apparatus, lysosomes, vacuoles, and plasma
membrane) và protein tiết ra khỏi tế bào.
61
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
Phân bố protein về các bào quan
Thuật ngữ:
- Trình tự đích
- Peptide tín hiệu
- Trình tự tín hiệu
- Chất nền của
nhân nuclear matrix
proteins
-Ty thể
- Lục lạp
- Màng trong
- Màng ngòai
- Khỏang giữa 2
màng
- Màng nguyên sinh
chất
-Nguyên sinh chất
- Mạng lưới nột chất
62
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
3. Dịch mã (Translation), các biến đổi sau dịch mã và sự di chuyển về mục tiêu
3) SRP liên kết với 4) SRP tách
receptor trên màng ra, quá trình
1) Quá trình ER (receptor này là tổng hợp 6) Phần còn lại
tổng hợp 2) SRP liên cấu phần của phức polypeptide của
polypeptide kết tạm hợp protein hình bắt đầu trở lại, polypeptide rời
bắt đầu ở thời với thành nên lỗ màng, đồng thời sự 5) “Enzyme ribosome và
ribosome tự trình tự thành phần phức dịch chuyển cắt tín hiệu” gấp cuộn
do trong tế peptide tín hợp chuyển vị và có xuyên màng cắt peptide thành cấu hình
bào chất hiệu enzyme cắt tín hiệu) xảy ra tín hiệu cuối cùng.
63
Cơ chế tín hiệu cho các protein định vị trên ER
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
64
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
4. Đột biến gene
Đột biến điểm có thể ảnh hưởng cấu trúc và chức năng của
protein
Sự thay đổi 1 nucleotide của mạch khuôn DNA có thể dẫn đến hình
thành 1 protein bất thường.
Nếu xảy ra ở giao tử có thể truyền cho thế hệ sau.
Đột biến điểm (point mutation): làm thay đổi 1 cặp base của DNA.
➢ Đột biến thay thế
➢ Đột biến mất 1 hay thêm 1 nucleotide
Đột biến có thể xảy ra trong quá trình sao chép, sửa sai và tái tổ hợp
DNA.
65
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
4. Đột biến gene
Thuật ngữ:
-Đầu amin
-Đầu carboxyl
-Đột biến im lặng
-Đột biến nhầm nghĩa
-Đột biến vô nghĩa
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
4. Đột biến gene
ĐỘT BIẾN
THÊM HAY MẤT
NUCLEOTIDE
Thuật ngữ:
-Sự dịch khung
-Đột biến vô nghĩa
-Đột biến nhầm nghĩa
69
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
70 70
Bài 3: Sinh tổng hợp protein
5. Dòng thông tin
73
Câu hỏi
10. Tại sao trình tự gene của rRNA16S được sử dụng trong
phân loại phân tử ở vi khuẩn?
11. Enzyme xúc tác liên kết giữa aminoacid và tRNA?
13. 3 bước của quá trình dịch mã?
14. Polysome là gì?
15. Vai trò của chaperone?
16. Cơ chế nào giúp ribosome đính trên mạng lưới nội
chất?
17. Khái niệm về gene tòan năng.
18. Định nghĩa về gene.
19. So sánh con đường biểu hiện gene ở tế bào nhân sơ và
tế bào nhân thật?
74