Machine Translated by Google

Tymoczko • Berg • Gatto • Stryer

Hóa sinh: A
Khóa học ngắn hạn

Ấn bản thứ tư

CHƯƠNG 2
Nước, Trái phiếu yếu và
Tạo ra trật tự

Sự hỗn loạn

© 2019 Macmillan Learning

Machine Translated by Google

CHƯƠNG 2

Nước, Trái phiếu Yếu và

Tạo ra trật tự thoát khỏi sự hỗn loạn
Machine Translated by Google

Chương 2: Dàn ý

2.1 Chuyển động nhiệt Năng lượng Tương tác sinh học

2.2 Tương tác sinh hóa diễn ra trong dung dịch nước
Dung dịch

2.3 Tương tác yếu là các đặc tính sinh hóa quan trọng

2.4 Cụm phân tử kỵ nước kết hợp với nhau

2,5 pH là một thông số quan trọng của hệ thống sinh
hóa
Machine Translated by Google

Giới thiệu Chương 2

• Các liên kết yếu cho phép các tương tác động tạo nên
cơ sở của bản thân sự sống và hóa sinh.
Machine Translated by Google

Phần 2.1 Chuyển động nhiệt Năng lượng

Tương tác sinh học

• Chuyển động Brown (chuyển động Brown) là chuyển động của các
phân tử được cung cấp bởi các dao động ngẫu nhiên của năng
lượng môi trường.

• Chuyển động nâu của nước khởi đầu nhiều tương tác sinh
hóa.
Machine Translated by Google

Phần 2.2 Tương tác sinh hóa diễn ra

trong dung dịch nước

Mục tiêu học tập 4: Mô tả tính chất hóa học của nước và
giải thích ảnh hưởng của nước đến các tương tác sinh hóa
như thế nào.

• Nước là phân tử phân cực: Ôxy là nguyên tử có độ âm điện,

các điện tử của liên kết dành nhiều thời gian hơn ở gần
nguyên tử ôxy. Bởi vì sự phân bố điện tích không đồng đều,
phân tử nước được cho là phân cực với nguyên tử oxy mang
điện tích hơi âm và nguyên tử hydro mang điện tích hơi
dương.
Machine Translated by Google

2.2 Tương tác sinh hóa diễn ra trong

dung dịch nước

• Sự phân cực của nước cho phép hình thành các liên kết
hydro giữa các phân tử nước và tạo ra
tính kết dính của nước.

• Tính phân cực của nước cũng tính đến khả năng hòa tan
nhiều chất hóa sinh quan trọng.

• Nước không có khả năng hòa tan các phân tử không phân
cực dẫn đến một nguyên tắc tổ chức quan trọng được gọi
là hiệu ứng kỵ nước.
Machine Translated by Google

Sơ đồ liên kết hydro trong nước

Các liên kết hydro (được thể hiện dưới dạng đường đứt nét màu xanh lá cây) được
hình thành giữa các phân tử nước để tạo ra một cấu trúc mở và có trật tự cao.
Machine Translated by Google

Liên kết cộng hóa trị (công thức hóa liên kết)

• Liên kết cộng hóa trị được hình thành khi hai nguyên tử

chia sẻ một cặp electron (liên kết “đơn”) hoặc nhiều cặp
electron (liên kết “đôi”, liên kết “ba”, v.v.).
• Liên kết giữa các nguyên tử giống hệt nhau hoặc tương tự

độ nhạy điện được cho là không phân cực (không phân

cực) (liên kết CC và CH)
• Nếu hai nguyên tử khác nhau về độ âm điện, liên kết giữa
chúng được cho là có cực. (Một đầu của liên kết phân cực
có một phần điện tích âm (δ ) và đầu kia mang một phần
điện tích dương (δ +)).
• Ví dụ: Do độ âm điện của nguyên tử oxi lớn hơn độ âm
điện của hiđro nên các electron ở xung quanh nguyên tử
oxi nhiều hơn so với hiđro. Do đó liên kết OH có một
lưỡng cực điện.
Machine Translated by Google

Các loại liên kết và độ âm điện

• Độ âm điện (độ âm điện): Khả năng hút electron của
nguyên tử. Giá trị độ âm điện lớn cho thấy lực hút
electron mạnh hơn giá trị độ âm điện nhỏ.

• Sự khác biệt về độ âm điện (ΔEN) của hai nguyên tử

liên kết xác định loại liên kết của chúng.
• Khi sự khác biệt rất nhỏ hoặc bằng không, liên kết là liên
kết cộng hóa trị và không phân cực. Khi nó lớn, liên kết là
cộng hóa trị có cực hoặc ion.
• Chênh lệch độ âm điện càng lớn thì liên kết càng
phân cực.
Machine Translated by Google

Các loại liên kết và độ âm điện

• ΔEN ≤ 0,4: liên kết cộng hóa trị không cực

• ΔEN 0,5 - 2: liên kết cộng hóa trị có cực

• ΔEN> 2: liên kết ion

Ví dụ: H – H, H – Cl và Na – Cl lần lượt là 0 (không cực), 0,9 (cộng

hóa trị có cực) và 2,1 (ion).

Liên kết ΔEN Phân cực

CN 0,5 C δ + Nδ

NH

CO

0-H
Machine Translated by Google

Các loại liên kết và độ âm điện

Machine Translated by Google

Phần 2.3 Tương tác yếu là các

đặc tính sinh hóa quan trọng

• Ba liên kết không hóa trị cơ bản:

• (1) Liên kết ion, hoặc tương tác tĩnh điện; • (2) Liên

kết hiđro; và • (3) Tương tác Van der Waals.

Machine Translated by Google

Tương tác tĩnh điện (liên kết ion)

Tương tác tĩnh điện là giữa các điện tích

• Tương tác tĩnh điện, còn được gọi là liên kết ion hoặc cầu
muối, là tương tác giữa các điện tích riêng biệt trên nguyên
tử.
• Tương tác tĩnh điện là kết quả của lực hút của một ion tích điện
dương - một cation - đối với một ion tích điện âm - một anion.
Trong natri clorua (NaCl), điện tử liên kết do nguyên tử natri
đóng góp được chuyển hoàn toàn sang nguyên tử clo.
Machine Translated by Google

Phần 2.3 Tương tác yếu là các

đặc tính sinh hóa quan trọng

• Năng lượng của tương tác tĩnh điện giữa hai điện tích
được cho bởi định luật Coulomb:

• E là năng lượng, q1 và q2 là điện tích của các ion, D

là hằng số điện môi (hằng số điện môi), r là khoảng cách
giữa hai ion và k là hằng số tỉ lệ.

• Hằng số điện môi (D) là 1 trong chân không và 80 trong

nước. Do đó, nước làm suy yếu các tương tác tĩnh điện.
Machine Translated by Google

Sơ đồ hòa tan natri clorua trong

Nước uống

Khi các ion natri phân tán, các điện tích dương của chúng bị trung hòa bởi
các điện tích âm một phần của các nguyên tử oxy trong nước. Các ion clorua
được bao quanh bởi các điện tích dương một phần trên các nguyên tử hydro.
Machine Translated by Google

Liên kết hydro hình thành giữa một độ âm điện (độ

âm điện) Nguyên tử và Hydro
• Liên kết hydro là sự tương tác của một nguyên tử hydro tích
điện dương một phần trong một lưỡng cực phân tử (ví dụ, nước)
với các điện tử chưa ghép đôi từ một nguyên tử khác, trong cùng
một phân tử (nội phân tử) hoặc trong một phân tử khác (giữa các
phân tử) .

• Một nguyên tử hydro liên kết cộng hóa trị với một nguyên tử cho độ
âm điện (N) có thể tạo thành liên kết hydro, với một nguyên tử nhận
(O).
Machine Translated by Google

Liên kết hydro hình thành giữa một độ âm điện (độ

âm điện) Nguyên tử và Hydro
• Hai nguyên tử có độ âm điện phổ biến nhất có trong liên kết
hydro là oxy và nitơ.

• Liên kết hiđro yếu hơn nhiều so với liên kết cộng hóa trị.

• Nước phá vỡ liên kết hydro giữa hai phân tử bằng cách cạnh
tranh khả năng liên kết hydro.
Machine Translated by Google

Sơ đồ trái phiếu hydro bao gồm

Nguyên tử nitơ và oxy

Vị trí của các điện tích riêng phần ( + và

- ) được hiển thị.
Machine Translated by Google

Sơ đồ về sự phá vỡ liên kết hydro do nước

Cạnh tranh từ các phân tử nước phá vỡ liên kết

hydro trong các phân tử khác.
Machine Translated by Google

van der Waals Tương tác Phụ thuộc vào

Sự bất đối xứng thoáng qua trong điện tích

• Các phân tử không phân cực (không phân cực) và không tích
điện có thể tương tác tĩnh điện với tương tác van der
Waals .

• Cơ sở của tương tác van der Waals là

sự phân bố điện tích xung quanh nguyên tử thay đổi theo thời
gian, sự phân bố điện tích không hoàn toàn đối xứng: sẽ có
những vùng mang điện tích dương một phần và một phần điện
tích âm.

• Sự bất đối xứng thoáng qua này trong điện tích xung quanh
nguyên tử hoạt động thông qua tương tác tĩnh điện để tạo ra
sự bất đối xứng bổ sung trong phân bố điện tử xung quanh các
nguyên tử lân cận của nó.
Machine Translated by Google

van der Waals Tương tác Phụ thuộc vào

Sự bất đối xứng thoáng qua trong điện tích
• Lực hút giữa hai nguyên tử
tăng lên khi chúng đến gần
nhau hơn, cho đến khi chúng
cách xa nhau bởi khoảng cách
tiếp xúc van der Waals

• Ở khoảng cách ngắn hơn,

lực đẩy rất mạnh trở nên
ưu thế do các đám mây
electron bên ngoài chồng
lên nhau.
Machine Translated by Google

Trái phiếu yếu cho phép tương tác lặp lại

• Liên kết hydro góp phần vào sự ổn định của DNA

chuỗi xoắn kép. Tuy nhiên, các liên kết này đủ yếu để bị
phá vỡ bởi các enzym của quá trình chuyển hóa DNA, do đó
cho phép truy cập thông tin di truyền.
Machine Translated by Google

Sơ đồ ổn định các cặp cơ sở trong vòng

xoắn kép
Machine Translated by Google

Phần 2.4 Cụm phân tử kỵ nước kết

hợp với nhau

• Không phải tất cả các phân tử sinh học đều là phân cực
(phân cực) hoặc ion. Các phân tử như vậy được gọi là

các phân tử không phân cực (không phân cực) hoặc kỵ

nước (kỵ nước) vì các phân tử này đơn giản là

không thể tương tác với nước.

• Liên kết cộng hóa trị giữa hai cacbon

nguyên tử và giữa nguyên tử cacbon và nguyên tử

hydro là những liên kết không phân cực phổ biến nhất

trong các hệ thống sinh học.

Hydrocacbon — các phân tử chỉ được tạo thành từ cacbon

và hydro hầu như không hòa tan trong nước.

Machine Translated by Google

Phần 2.4 Cụm phân tử kỵ nước kết

hợp với nhau
• Các phân tử kỵ nước như
benzen có xu hướng tụ lại với nhau
trong dung dịch nước.

• Nhóm kỵ nước này

các phân tử trong nước được gọi

là hiệu ứng kỵ nước.

• Hiệu ứng kỵ nước được hỗ trợ bởi

sự gia tăng entropi của nước tạo
ra khi các phân tử kỵ nước kết hợp
với nhau.

• Hiệu ứng kỵ nước là một lực lượng tổ

chức mạnh mẽ trong các hệ thống sinh
học.
Machine Translated by Google

Sơ đồ về Hiệu ứng kỵ nước

Sự kết tụ (tụ tụ) của các nhóm không phân cực trong nước dẫn
đến sự gia tăng entropi do giải phóng các phân tử nước thành
dạng nước lớn.
Machine Translated by Google

Sự hình thành màng được cung cấp bởi

Hiệu ứng kỵ nước

• Phospholipid có tính ưa nước và kỵ nước

đặc tính. Một phân tử như vậy, với hai đặc tính hóa học
riêng biệt , được gọi là chất lưỡng tính hoặc lưỡng tính
phân tử. Khi tiếp xúc với nước, phospholipid tạo thành
màng.
Machine Translated by Google

Protein gấp được cung cấp bởi tính kỵ nước

Hiệu ứng
Machine Translated by Google

Các nhóm chức năng có hóa chất cụ thể

Đặc tính

• Mặc dù có nhiều phân tử sinh học khác nhau, chỉ có một

số nhóm chức hạn chế được tìm thấy trong các phân tử
này.

• Nhóm chức là những dãy nguyên tử có

tính chất hóa học.
Machine Translated by Google

Bảng 2.1 Một số nhóm chức năng chính

trong Hóa sinh
Machine Translated by Google

Phần 2.5 pH là một thông số quan trọng

của các hệ thống sinh hóa

• pH là thước đo nồng độ H + của dung dịch.

• Kiểm soát độ pH là một chức năng quan trọng trong hệ thống sinh học.
Machine Translated by Google

Nước ion hóa đến một mức độ nhỏ

• Hằng số cân bằng Keq đối với sự phân ly của nước

được cho bởi

cho bởi sản phẩm ion của nước, là • Kw , được

KW = Keq × [H2O]

• Điều này có thể được đơn giản hóa thành

KW = [H + ] [OH ]
Machine Translated by Google

Nước ion hóa đến một mức độ nhỏ

KW = [H + ] [OH ]

• Độ pH của bất kỳ dung dịch nào được định nghĩa là

Machine Translated by Google

Một axit là một nhà tài trợ proton, trong khi một

Cơ sở là một chất chấp nhận Proton

• Axit ion hóa để tạo thành một proton và một bazơ.

• Hóa chất được hình thành khi ion hóa một axit là

được gọi là cơ sở liên hợp của nó.

• Ngược lại, axit hình thành khi một bazơ liên kết với a

proton được gọi là axit liên hợp của nó.

Machine Translated by Google

Axit có khuynh hướng ion hóa khác nhau

• Cân bằng ion hóa của một axit yếu được cho bởi

• Hằng số cân bằng của phản ứng này là

• Ka càng lớn thì axit càng mạnh.

Machine Translated by Google

Axit có khuynh hướng ion hóa khác nhau

• Trước tiên, chúng ta có thể suy ra mối quan hệ giữa pH và

tỷ lệ axit so với bazơ bằng cách thao tác công thức ion
hóa axit.

• Lấy logarit của cả hai vế cho

Machine Translated by Google

Axit có khuynh hướng ion hóa khác nhau

• log (1 / Ka ) được gọi là pKa của axit.

• Thay thế pH cho log (1 / H + ) và pKa cho log của (1 /

Ka ) thu được phương trình Henderson – Hasselbalch:
Machine Translated by Google

Axit có khuynh hướng ion hóa khác nhau

• Khi [A– ] = [HA], log ([A– ] / [HA]) bằng 0 và pH = pKa .

(pKa đơn giản là độ pH mà tại đó axit bị phân ly một nửa)

• Đối với bất kỳ axit nào, ở pH> pKa , [A– ] chiếm ưu thế.

• Ở pH < pKa , [HA] chiếm ưu thế.

Machine Translated by Google

Sơ đồ mô tả nhiều loại liên hợp

Cặp axit-bazơ
Machine Translated by Google

Chất đệm chống lại sự thay đổi độ pH

• Một cặp cộng hợp axit-bazơ chống lại sự thay đổi độ pH của
dung dịch.

• Nói cách khác, nó hoạt động như một bộ đệm. Một bộ đệm là hiệu quả nhất

ở pH gần pKa của nó .

Machine Translated by Google

Đường cong chuẩn độ cho axit axetic

Machine Translated by Google

Hành động đệm hiển thị biểu đồ

Machine Translated by Google

Đường cong chuẩn độ của ba đường quan trọng

Axit yếu
Machine Translated by Google

Bộ đệm là rất quan trọng trong các hệ thống sinh học

• Độ pH của máu được đệm bởi cặp axit-bazơ liên hợp

của axit cacbonic và bicacbonat (H2CO3 / HCO3 - ).

• CO2 sinh ra trong quá trình hô hấp hiếu khí (Chương 19)
phản ứng với nước tạo ra axit cacbonic có tính axit
yếu. Sau đó, axit cacbonic sẽ ion hóa để tạo ra một proton
và bicacbonat.
Machine Translated by Google

Làm đệm là một phòng thí nghiệm thông thường

Thực tiễn

• Chất đệm chống lại sự thay đổi pH trong một loạt các giá trị pH
có thể được tạo ra bằng cách sử dụng Henderson – Hasselbalch
phương trình và hóa học đơn giản.