1. Коензими. Загальна характеристика. Класифікації.

Коензими - це невеликі органічні сполуки, які грають ключову роль у біохімічних реакціях
організму. Вони сприяють перенесенню реакційних груп між різними молекулами. Коензими
можуть бути вітамінами або похідними вітамінів, і вони активують ферменти, що виконують
реакції в клітинах.

Класифікація коензимів включає:

Кофактори: Це неорганічні сполуки, такі як іони металів, які взаємодіють з ферментами для
сприяння реакцій.

Коензими: Це органічні сполуки, які зазвичай є вітамінами або похідними вітамінів.

Прикладами є НАD, ФАД, Коензим А.

Прості кофактори: Це невеликі органічні молекули, які не є вітамінами, але грають важливу
роль у ферментативних реакціях, наприклад, біотин.

Ці коензими і кофактори допомагають ферментам керувати реакціями в клітинах,

забезпечуючи їх оптимальну швидкість та ефективність.

2. Коензими І групи (коензими оксидоредуктаз)

Коензими І групи, також відомі як коензими оксидоредуктаз, відіграють важливу роль у

реакціях оксидоредукції, де відбувається обмін електронів між молекулами. Ці коензими
допомагають ферментам керувати цими реакціями. Деякі приклади коензимів І групи
включають:

НАD (нікотинамідаденіндинуклеотид): Це один з найважливіших коензимів в біохімічних

реакціях. Він може існувати у формах NAD+ (окислена форма) та NADH (зредукована
форма) і відіграє роль у передачі електронів.

ФАД (флавінаденіндинуклеотид): Це інший важливий коензим, який також має

оксидоредукційну активність. Він може бути в формах FAD (окислена) і FADH2
(зредукована).

Ці коензими допомагають ферментам каталізувати реакції, де відбувається передача

електронів, що є важливим для багатьох метаболічних шляхів та енергетичного обміну в
клітинах.

2.1. Вітамінні РР (нікотинамідаденіндинуклеотид або НАД,

нікотинамідаденіндинуклеотидфосфат або НАДФ): структура коензиму, функціональні
групи, приклад окисно-відновної реакції.

Вітамін РР включає нікотинамідаденіндинуклеотид (NAD) і

нікотинамідаденіндинуклеотидфосфат (NADP) як коензими. Ось докладніша інформація
щодо їх структури, функціональних груп і прикладу окисно-відновної реакції:

Структура коензимів:

NAD (нікотинамідаденіндинуклеотид): Цей коензим має структуру, в якій є два

нуклеотидних залишки - аденін і рибоза, з'єднані з нікотинамідом (вітамін В3). Нікотинамід є
основною функціональною групою NAD.
NADP (нікотинамідаденіндинуклеотидфосфат): Це аналогічна структура NAD з додатковим
фосфатним залишком на рибозі.

Функціональні групи:

Функціональна група NAD і NADP: Основна функціональна група - це нікотинамід. Ця група

може взаємодіяти з воднем і електронами під час окисно-відновних реакцій.

Приклад окисно-відновної реакції:

Однією з типових реакцій, в яких використовується NAD, є окислення глюкози під час
гліколізу. У цій реакції молекула глюкози розщеплюється, і NAD виступає як кофактор для
окислення глюкози до піраміноксалоцетової кислоти, утворюючи NADH. Пізніше NADH
може бути використаний у мітохондріях для генерації енергії в ході окислювально-
фосфорилаційного процесу.

NAD і NADP важливі для безлічі біохімічних реакцій в організмі, де вони виступають у ролі
коензимів, які сприяють передачі електронів і пронесенню окисно-відновних процесів.

2.2. Вітаміноподібні (убіхінон (коензим Q), ліпоєва кислота (ЛК), тетрагідробіоптерин

(ТГБП) хінонові коензими: структура коензимів, функціональні групи, окисна та
відновна форми коензимів, приклад реакцій за участі даних коензимів.

Вітаміноподібні коензими включають убіхінон (коензим Q), ліпоєву кислоту (ЛК) і

тетрагідробіоптерин (ТГБП). Ось докладніша інформація щодо їх структури,
функціональних груп, окисних та відновних форм і прикладів реакцій:

Убіхінон (коензим Q):

Структура: Убіхінон має ліпоїдну структуру з довільною кількістю ізопренових одиниць (n).
Зазвичай, у людей Q10 (де n = 10) є найпоширенішою формою.

Функціональні групи: Убіхінон має відсутність традиційних функціональних груп, але його
структура ізопренових одиниць дозволяє ефективно переносити електрони.

Окисна та відновна форми: Убіхінон може існувати у двох формах: окисненій (убіквінон) та
зведеній (убікінол). Ця здатність до циклічного переходу між цими формами дозволяє йому
служити як переносник електронів у дихальному ланцюгу мітохондрій.

Ліпоєва кислота (ЛК):

Структура: Ліпоєва кислота має ліпоїдну групу, яка приєднана до дихлоришнової кислоти.

Функціональні групи: Основна функціональна група - це ліпоїдна група, яка може

акцептувати і передавати електрони та реакційні групи.

Окисна та відновна форми: Ліпоєва кислота може існувати у формах дихлоришнової кислоти
(окисна форма) та дігідроліпоїнової кислоти (зведена форма).

Тетрагідробіоптерин (ТГБП):

Структура: Тетрагідробіоптерин має циклічну структуру, яка містить атому азоту та

чотиригідрогеновані гідрофільні групи.
Функціональні групи: Основна функціональна група - це атом азоту, який може приймати та
передавати електрони.

Окисна та відновна форми: Тетрагідробіоптерин може існувати в різних окисних станах,

включаючи тетрагідробіоптерин (зведена форма) і біоптерин (окисна форма).

Приклади реакцій:

Убікінол (зведена форма убіхінону) в дихальному ланцюзі мітохондрій приймає та передає

електрони під час окислювально-фосфорилаційного процесу.

Ліпоєва кислота взаємодіє з різними ферментами, зокрема в комплексі піруватдегідрогенази,

допомагаючи в переносі реакційних груп у реакціях окиснення пірувату та інших
метаболічних процесах.

Тетрагідробіоптерин бере участь у біосинтезі біологічно важливих сполук, таких як

серотонін, норадреналін і адреналін.

Ці вітаміноподібні коензими відіграють важливу роль у різних біохімічних процесах,

сприяючи передачі електронів та участі в окисно-відновних реакціях в клітинах організму.

2.3. Невітамінні (гем та глутатіон: структурні особливості, функціональні групи,

механізм участі в окисно-відновних процесах)

Невітамінні кофактори, такі як гем та глутатіон, відіграють важливу роль у біохімічних

процесах. Ось докладніша інформація щодо їх структурних особливостей, функціональних
груп та механізмів участі в окисно-відновних процесах:

Гем:

Структурні особливості: Гем є железовмісним пігментом і має плоску структуру з однією

атомною групою кисню, що координується до центрального атома заліза. Він є ключовою
складовою гемоглобіну, міоглобіну та інших гем-протеїнів.

Функціональні групи: Основна функціональна група - це атом кисню, який утворює

комплекс із залізом. Ця група здатна координувати кисень та інші молекули.

Механізм участі в окисно-відновних процесах: Гем властивий до реакцій окисно-

відновлення, оскільки залізо в ньому може переходити між двома окисними станами: Fe2+
(зведений) та Fe3+ (окислений). Цей механізм дозволяє гему зв'язувати та віддавати
молекули кисню у процесах транспорту кисню в організмі.

Глутатіон:

Структурні особливості: Глутатіон - це трипептид, який складається з трьох амінокислот:

глутаміну, цистеїну і гліцину. Він має сульфурну групу (-SH), яка робить його
антиоксидантом.

Функціональні групи: Основна функціональна група - це сульфурна група (-SH) в

амінокислоті цистеїну. Ця група здатна вступати в окисно-відновні реакції та забезпечувати
антиоксидантний захист.
Механізм участі в окисно-відновних процесах: Глутатіон взаємодіє з різними ферментами та
антиоксидантами в клітинах, допомагаючи у відновленні окислених молекул і нейтралізації
вільних радикалів. Його сульфурна група виступає як ключова функціональна група в цих
реакціях.

Як гем, так і глутатіон відіграють важливу роль в різних біохімічних процесах. Гем є
важливим для транспорту кисню, а глутатіон допомагає у збереженні рівноваги окисно-
відновних процесів та захисту клітин від окислювального стресу.

3. Вітамінні коензими ІІ групи класу трансфераз (коензимні форми вітамінів

В1(тіаміндифосфат або ТДФ (тіамінопірофосфат або ТПФ), В6 (піридоксальфосфат
(ПАЛФ), пантотенової кислоти (коензим А (КоА-SH)): структура коензиму,
функціональні групи, приклад реакції.

Вітамінні коензими II групи класу трансфераз включають коензимні форми вітамінів В1

(тіаміндифосфат або ТДФ), В6 (піридоксальфосфат або ПАЛФ) та пантотенової кислоти
(коензим А або КоА-SH). Ось докладніша інформація щодо їх структури, функціональних
груп та прикладу реакцій:

Тіаміндифосфат (ТДФ):

Структура: ТДФ є фосфатованою формою вітаміну В1 (тіаміну). Його структура включає

тіамінову молекулу з двома фосфатними групами.

Функціональні групи: Основна функціональна група - це тіамінова молекула, яка має

сірковмісні атоми і здатна до зв'язування та передачі водню під час реакцій трансфераз.

Приклад реакції: ТДФ використовується у реакціях декарбоксилювання, таких як реакція

транскетолази у циклі пентозофосфату, де він допомагає видаленню вуглекислого газу з
молекули субстрату.

Піридоксальфосфат (ПАЛФ):

Структура: ПАЛФ є фосфатованою формою вітаміну В6 (піридоксину). Вона містить

піридоксальну групу з приєднаною фосфатною групою.

Функціональні групи: Основна функціональна група - це піридоксальна група, яка має

піримідиновий кільцевий фрагмент та аміногрупу. Ця група може донорувати та акцептувати
аміногрупи під час реакцій трансфераз.

Приклад реакції: ПАЛФ використовується у багатьох реакціях трансамінації, де вона

допомагає переносити аміногрупи між амінокислотами.

Коензим А (КоА-SH):

Структура: КоА-SH містить пантотенову кислоту як свою основну структурну частину, яка
приєднана до аденіну та молекули 3'-фосфоаденозин-5'-фосфату.

Функціональні групи: Основна функціональна група - це тіозольна група (-SH), яка здатна до
перенесення ацетильних груп та реакцій трансацетиляції.
Приклад реакції: КоА-SH використовується у реакціях бета-окислення жирних кислот, де він
допомагає відокремлювати ацетильні групи від жирних кислот для подальшого метаболізму
в мітохондріях.

Ці вітамінні коензими II групи класу трансфераз важливі для багатьох метаболічних реакцій
в організмі, де вони допомагають в переносі реакційних груп та забезпечують ефективну
каталізують різні біохімічні процеси.

4. Вітамінні коензими ІІ групи класу трансфераз та ізомераз на прикладі похідних

вітамінів В9 (тетрагідрофолієва кислота (ТГФК)) та В12 (метилкобаламін,
дезоксиаденозилкобаламін): функціональні групи, приклад реакції.

Вітамінні коензими II групи класу трансфераз та ізомераз включають похідні вітамінів В9

(тетрагідрофолієва кислота, ТГФК) та В12 (метилкобаламін та дезоксиаденозилкобаламін).
Ось докладніша інформація щодо їх функціональних груп та прикладу реакцій:

Тетрагідрофолієва кислота (ТГФК, похідний вітаміну В9):

Функціональні групи: Одна з ключових функціональних груп у ТГФК - це

тітерогідрофолатна група, яка забезпечує перенесення одноокисленого водню (H+) у
важливих метаболічних реакціях. Також присутні аміногрупи та карбоксильна група.

Приклад реакції: ТГФК грає ключову роль у метаболізмі одноокисленого водню, який
важливий у синтезі амінокислот, нуклеотидів та інших молекул. Наприклад, вона допомагає
перетворити фоліеву кислоту у форму, яка може брати участь у синтезі ДНК.

Вітамін В12 (метилкобаламін та дезоксиаденозилкобаламін):

Функціональні групи: Метилкобаламін та дезоксиаденозилкобаламін містять великий

кобальтовий іон, який має кобальт-вуглеводень (Co-C) і кобальт-азотний (Co-N)
координаційні зв'язки. Ці функціональні групи дозволяють активувати кобальт для участі в
реакціях трансферу групи метилу (метилкобаламін) або дезоксирибозилового радикалу
(дезоксиаденозилкобаламін).

Приклад реакції: Метилкобаламін використовується у реакціях метилування, де він

допомагає переносити групи метилу на молекули, такі як гомоцистеїн, щоб синтезувати
метіонін. Дезоксиаденозилкобаламін важливий у реакціях дезоксирибозилування для синтезу
нуклеотидів ДНК.

Ці вітамінні коензими II групи важливі для нормального функціонування клітин та

організму, оскільки вони допомагають у трансфері та метаболізмі груп, що є ключовими для
багатьох біохімічних реакцій, включаючи синтез ДНК, РНК, амінокислот та інших молекул.

5. Вітамінні коензими ІІ групи класу лігаз (біотин: утворення N-карбоксибіотину та

його роль в реакція карбокислювання), функціональні групи.

Вітамінні коензими II групи класу лігаз включають біотин і N-карбоксибіотин. Ці коензими

важливі для реакцій карбокислювання, включаючи карбоксилазні реакції, де вони
допомагають приєднувати групу карбоксилу (CO2) до молекул і відіграють ключову роль у
метаболізмі різних сполук. Ось докладніша інформація про біотин та його роль:

Біотин:
Функціональні групи: Головною функціональною групою в біотині є сірковмісний кільцевий
фрагмент, який містить два сульфурні атоми. Ця група може утворювати ковалентні зв'язки з
карбоксилазами, що дозволяє передавати групи карбоксилу в реакціях карбокислювання.

Утворення N-карбоксибіотину: Біотин участь у реакції утворення N-карбоксибіотину, де

сірковмісний кільцевий фрагмент приєднується до аміногрупи лізину в біотинової білка. Це
утворює коензим N-карбоксибіотин, який є активною формою біотину.

Роль в реакціях карбокислювання: Біотин, у формі N-карбоксибіотину, дозволяє ферментам

карбоксилазам (наприклад, піруваткарбоксилазі та ацетилкоензим А карбоксилазі)
передавати групи карбоксилу до молекул, таких як піруват і ацетилкоензим А. Це є
ключовим процесом у багатьох біохімічних реакціях, включаючи синтез глюкози, жирних
кислот та інших важливих молекул.

Біотин є необхідним кофактором для ферментів, які участь в реакціях карбокислювання, і

відіграє важливу роль в регулюванні обміну різних органічних кислот в організмі.

6. Невітамінні коензими ІІ групи: нуклеозидфосфати (похідні пуринів та піримідинів

(АТФ, АДФ, ЦТФ, ЦДФ, УТФ, ЦДФ). Навести приклад хімічної реакції за участі АТФ.

Невітамінні коензими II групи включають нуклеозидфосфати, які є похідними пуринів та

піримідинів. Деякі з них включають АТФ (аденозинтрифосфат), АДФ (аденозиндифосфат),
ЦТФ (цитидинтрифосфат), ЦДФ (цитидиндифосфат), УТФ (уридинтрифосфат) та ЦДФ
(урідиндифосфат).

Приклад хімічної реакції за участю АТФ:

Однією з ключових функцій АТФ є зберігання та передача енергії в клітинах. Однією з

реакцій, в яких вона бере участь, є фосфорилювання глюкози під час гліколізу. Реакція
виглядає наступним чином:

Глюкоза + АТФ -> Глюкоза-6-фосфат + АДФ

У цій реакції АТФ служить донором фосфатної групи, яка приєднується до молекули
глюкози, утворюючи глюкозу-6-фосфат, та при цьому АТФ перетворюється в АДФ
(аденозиндифосфат). Ця реакція є важливою в генерації енергії та обробці глюкози в
клітинах.

7. Вітаміноподібні коензими ІІ групи класу трансфераз на прикладі карнітину:

структура коензиму, приклад реакції.

Вітаміноподібні коензими II групи класу трансфераз включають речовини, такі як карнітин.

Ось інформація про структуру карнітину та приклад реакції, в якій він бере участь:

Карнітин:

Структура: Карнітин є амінокислотним сполуком та має структуру, подібну до амінокислоти.

Його хімічна формула - C7H15NO3. Карнітин є складною молекулою з аміногрупою та
гідроксильною групою, які грають роль у різних метаболічних процесах.

Приклад реакції:
Один з головних процесів, в якому бере участь карнітин, - це транспорт жирних кислот через
мітохондріальну мембрану для їхнього окислення та виробництва енергії. Карнітин виконує
роль переносного коензиму у цьому процесі.

Реакція, в якій він бере участь, виглядає наступним чином:

Ацетилкоензим А (АцК) + Карнітин -> Ацетилкарнітин + Коензим А

У цій реакції молекула карнітину взаємодіє з ацетилкоензимом А для утворення

ацетилкарнітину, який може переносити ацетиловані групи через мітохондріальну мембрану.
Це сприяє транспорту жирних кислот до мітохондрій, де вони можуть бути розщеплені та
використані для отримання енергії.

Отже, карнітин відіграє важливу роль у метаболізмі жирів та сприяє переносу ацетилованих
груп для енергетичних процесів в клітинах.

8. Простетичні групи, загальна характеристика. Похідне вітаміну В2

(флавінмононуклеотиду або ФМН, флавіндинуклеотиду або ФАД) у складі ензиму, його
структура, функціональні групи та приклад реакції.

Простетичні групи - це невеликі молекули або іони, які приєднуються до білків або інших
макромолекул і виконують специфічні функції в біологічних системах. Вони можуть бути
необхідними для активності ферментів, структурною частиною білків або здатними до
переносу певних хімічних груп. Однією з важливих простетичних груп є флавінові коензими,
такі як флавінмононуклеотид (ФМН) та флавіндинуклеотид (ФАД).

Флавінмононуклеотид (ФМН) та флавіндинуклеотид (ФАД):

Структура: ФМН і ФАД є похідними вітаміну В2 (рибофлавіну). Обидва мають схожу

структуру, що складається з железовмісного кільця, яке містить азотисті і карбоксильні
групи.

Функціональні групи: Головною функціональною групою в ФМН та ФАД є флавінова група,

яка може переходити між окисненим (FAD) та зведеним (FADH2) станами, здійснюючи
передачу електронів в окисно-відновних реакціях.

Приклад реакції: Один з прикладів реакцій, в яких бере участь ФАД, - це бета-окислення
жирних кислот. У цьому процесі ФАД допомагає окислювати ацетил-CoA та інші молекули
жирних кислот, що приводить до виробництва енергії.

Флавінові коензими, такі як ФМН та ФАД, важливі для багатьох біохімічних процесів,
оскільки вони здатні до переносу електронів та забезпечують окисно-відновні реакції в
клітинах.

9. Кофактори. Загальна характеристика. Участь у стабілізації структури ензиму та

приєднанні субстрату (на прикладі гексокінази та піруваткінази і Mg2+ іонів).

Кофактори - це невід'ємні складові ферментів, які допомагають в їхній каталітичній

активності. Вони можуть бути органічними молекулами або неорганічними іонами.
Кофактори відіграють важливу роль у стабілізації структури ферментів та приєднанні
субстрату. Ось приклади ролі Mg2+ іонів у ферментах гексокіназі та піруваткіназі:

Гексокіназа:
Кофактор: У гексокіназі, яка каталізує перший крок гліколізу, Mg2+ іони виступають як
неорганічні кофактори.

Роль Mg2+ іонів: Mg2+ іони беруть участь у фосфорилюванні глюкози, перетворюючи її в
глюкоз-6-фосфат. Вони взаємодіють з аденозинтрифосфатом (АТФ) та глюкозою, сприяючи
передачі фосфатної групи з АТФ на глюкозу. Mg2+ іони є катализаторами цієї реакції та
сприяють правильному орієнтуванню субстратів.

Піруваткіназа:

Кофактор: У піруваткіназі, ферменті, що бере участь у фосфорилюванні пірувату, також

використовуються Mg2+ іони як неорганічні кофактори.

Роль Mg2+ іонів: Вони активують фосфоенолпіруват (PEP), допомагаючи в передачі

фосфатної групи на піруват. Mg2+ іони також взаємодіють з молекулою АТФ та PEP,
сприяючи каталізу реакції. Це дозволяє швидкому і ефективному фосфорилюванню пірувату.

У обох цих прикладах Mg2+ іони виступають як кофактори, що полегшують та прискорюють

фосфорилювання субстратів, дозволяючи ферментам виконувати свою каталітичну функцію
з високою ефективністю. Без цих неорганічних кофакторів, багато ферментативних реакцій у
клітинах були б надзвичайно повільними або неможливими.