Pinatakbo ng Commission of Edukasion, Health, and Public Welfare nong 1942 at Minitry of Edukasyon noong 1943 ang sistema ng edukasyon sa panahon ng pananakop ng mga hapon. Naging sentro ng kurikulum ang wikang Filipino, ang kasysayan ng Philipinas,at Character Education ng nakasentro sa pagmamahal sa marangal na trabaho. Mapapansin na katulad ng ginagawa ng mga Amerikano na tuluyang pagpapalit ng sistema ng edukasyon ng mga kastila ay binago rin ng mga Hapones ang sistema ng mga Americano. Subalit bagaman binigyan ng pokus sa edukasyon ang mga bagay ng Philipino ay maraming mga Philipino ang tinalikuran ang pag aaral dulot sa sunod sunod na mga digmaan, Ang paghuli sa mga Philipinong pinagdududahang mga rebelde, at ang mga kababaihang ginagawang comfort women ay nagdulot ng takot sa mga Philipino upang umiwas na magkaroon ng interasksiyon sa mga Hapon Edukasyon Sa Ilalim ng Republika ng Pilipinas Sa paglaya ng Philipinas mula sa mga Amerikano noong 1946 ay naibalik sa mga Pilipino ang piagpapatakbo sa sistema ng edukasyon sa Pilipinas. Noong 1947 ay binuo ang Department of Education at naging kaagapay nito sa pagbalangkas ng regulasyon para sa mga paaralan ang Bureau of Private ang Public Schools. Noong 1972 ay naging Department of Edukasyon, Culture and Sports ang ahensiya at muli itong binago upang maging Minitry of Edukasyon noong 1978. Noong 1982 sa bisa ng Edukasyon Act ay naging Minitry of Edukasyon , Culture and Sports ang ahensiya at noon 1987 ay muli itong tinawag na Demapart ment of Edukasyon, Culture and Sports. Taong 1994 nang ihiwalay ang regulasyon para sa mga kolehiyo at pamantasan nang itatag ang Comission on Higher Edukasyon (CHED), at para sa mga kursong bokasyonal ay ang Technical Edukasyon and Skill Development Authority (TESDA). Dahil dito ay naging pokus sa Department of Edukasyon, Culture and Sports ang regulasyon ng mababa at mataas na paaralan. Muling binago ang ahensiya noong 2001 nang muli itong tawaging Department of Edukasyon na kasalukuyan pa rin nitong pangalan. Sa mahabang panahon, ang estruktura ng edukasyon sa Pilipinas ay nahahati sa anim na taon sa mababang paaralan, apat na taon sa mataas na paaralan at apat hangang limang taon sa kolehiyo, depende sa kurong kukunin. Kabilang sa kurikulum para sa mababa at mataas na paaralan ay ang Matematika, Siyensiya, Ingles, Filipino, HEKASI o Araling Panlipunan, Edukasyong Panteknolohiya at Pantanan, Edukasyon Pangkatawan, Pangkalusugan, at Musika at Edukasyong Pangkabutihang Asal. Ang asignaturang relihiyon ay kasama sa kurikulum ng mga sektaryong pribadong paaralan o yaong pinatatakbo ng relihiyon gayunman ay maari itong isama sa kurikulum ng pampublikong paaralan kung ito ay hihingin ng mga magulang.Samantala, ang kurikulum sa olehiyo ay kinabibilangan ng mga kursong general education, professional edukasyon at major subjects, Ang pinakabagong pagbabago sa kurikulum at estruktura ng edukasyon ng Pilipinas ay ang pagpapatupad ng programmang K to 12 noong taong pampaaralan 2012-2013