veba: Praenje toka enzimske hidrolize oligosaharida DNS metodom i
odreivanje enzimske aktivnosti 5.1. Uticaj hidrolize viih eera na redukujuu mo Zajednika karakteristika reakcija hidrolize razliitih oligosaharida i polisaharida je da se zasnivaju na raskidanju glikozidnih veza, pa dovode do oslobaanja redukujuih grupa. Poto se time poveava redukujua mo reakcione smee, metode koje omoguavaju merenje redukujue moi omoguavaju efikasno praenje toka ovih hidrolitikih reakcija. Iz tog razloga, DNS metoda za odreivanje koncentracije redukujuih eera moe vrlo efikasno da se koristi za praenje toka enzimskih reakcija i odreivanje enzimske aktivnosti. U ovoj vebi DNS metoda bie primenjena radi odreivanja aktivnosti tri industrijski znaajna enzima: invertaze, -galaktozidaze i -galaktozidaze.
5.2. Odreivanje aktivnosti invertaze Saharoza je disaharid koji se sastoji iz ostataka molekula -D-glukoze i molekula -D- fruktoze (-glukopiranozido--fruktofuranozid). Hidrolizu saharoze katalizuje enzim invertaza (-D-fruktofuranozid-fruktohidrolaza), koji na saharozu deluje sa strane fruktoze (slika). To je grupno specifian enzim, koji osim to deluje na supstrate u kojima se nalazi -fruktoza u furanoznom obliku, deluje i na one koji sadre i -glikozidnu vezu. Naziv inverzija je izveden zbog toga to posle hidrolize saharoze dolazi do promene smera obrtanja ravni polarizovane svetlosti. Ekvimolarna smea glukoze i fruktoze koja nastaje u ovoj reakciji naziva se invertni eer.
Poto je glikozidna veza nastala izmeu poluacetalnih hidroksilnih grupa C-1 atoma glukoze i C-2 atoma fruktoze, saharoza nije redukujui eer. Meutim, hidrolizom se oslobaaju obe redukujue poluacetalne hidroksilne grupe, pa smea koja nastaje posle hidrolize ima redukujua svojstva. Ova karakteristika reakcije hidrolize saharoze se esto koristi radi praenja toka reakcije. U ovoj vebi tok enzimski katalizovane hidrolize saharoze bie praen pomou DNS metode za odreivanje koncentracije redukujuih eera.
5.2.1. Enzimska hidroliza saharoze
5.2.1.1. Hemikalije Na-acetatni pufer (0,1M; pH 4,5) 10%-ni rastvor saharoze Invertaza (0,01 mg/ml) Osnovni rastvor invertnog eera (5 mM glukoze + 5 mM fruktoze)
5.2.2. Postupak
5.2.2.1. Odreivanje standardne prave invertnog eera Poto je proizvod reakcije hidrolize saharoze ekvimolarna smea glukoze i fruktoze (invertni eer), neophodno je pre izvoenja reakcije hidrolize saharoze konstruisati standardnu pravu za odreivanje koncentracije invertnog eera DNS metodom. Za konstruisanje standardne prave neophodno je pripremiti po 0,5 ml razliitih rastvora invertnog eera (koncentracije 0,025-5 mM) i dodati 0,5 ml DNS reagensa. U epruvete obeleene rednim brojevima treba dodati sledee zapremine supstanci: Redni broj epruvete Zapremina osnovnog rastvora invertnog eera (ml) Zapremina pufera (ml) Zapremina DNS reagensa (ml) Koncentracija invertnog eera (mM) 0 0 0,5 0,5 0 1 0,025 0,475 0,5 0,25 2 0,05 0,45 0,5 0,5 3 0,1 0,4 0,5 1 4 0,2 0,3 0,5 2 5 0,3 0,2 0,5 3 6 0,4 0,1 0,5 4 7 0,5 0 0,5 5 Epruvete se zatim ostave 5 minuta u kljualom vodenom kupatilu, razblae sa 4 ml vode, vorteksiraju se i meri se apsorbanca rastvora na 540 nm u odnosu na slepu probu. Nacrta se standardna kriva zavisnosti apsorbance od koncentracije invertnog eera (mmol dm -3 ).
5.2.2.2. Hidroliza saharoze Pripremanje supstrata: Rastvor supstrata priprema se tako to se u epruvetu prenese 3 ml acetatnog pufera i 1 ml 10 %- nog rastvora saharoze. Zatim se epruveta sa supstratom i enzimski preparat (invertaza) inkubiraju na temperaturi reakcije (45 o C) u toku 15 minuta. Svrha ovog koraka je da obe komponente reakcione smee dostignu temperaturu reakcije pre meanja u sledeem koraku, ime se obezbeuje da od poetka eksperimenta reakciona smea bude na eljenoj temperaturi.
Reakcija: Zatim se u epruvetu doda 1 ml rastvora invertaze, smea se promea na vorteksu i inkubira na 45 o C da bi se odigrala reakcija hidrolize saharoze. Iz ove epruvete se svakih 5 min uzimaju uzorci zapremine 0,5 ml radi odreivanja koncentracije redukujuih eera i praenja toka hidrolize saharoze. (Treba obratiti panju da se tokom uzorkovanja reakciona smea minimalno zadrava van termostata!)
Odreivanje koncentracije invertnog eera: Ovi uzorci u daljem toku prolaze kroz jednak tretman kao rastvori invertnog eera pri odreivanju standardne krive. Dakle, u 0,5 ml uzorka doda se 0,5 ml DNS reagensa Epruvete se zatim ostave 5 minuta u kljualom vodenom kupatilu, razblae sa 4 ml vode, vorteksiraju se i meri se apsorbanca rastvora na 540 nm u odnosu na slepu probu. Nakon merenja apsorbance uzorka, izraunati koncentraciju invertnog eera u rastvoru na osnovu standardne krive odreene sa invertnim eerom.
5.3. Odreivanje aktivnosti -galaktozidaze Laktoza je disaharid koji se sastoji iz ostataka molekula -D-galaktoze i molekula -D- glukoze povezanih -(14)-glikozidnim vezama pa ima sistemsko ime -galaktopiranozido- (14)-glukopiranoza. Hidrolizu laktoze katalizuje enzim -galaktozidaza, ije je sistemsko ime -D-galaktozid- galaktohidrolaza. Ovaj enzim je grupno specifian jer katalizuje hidrolizu -glikozidnih veza izmeu galaktoze i drugih organskih liganda, a primeena je aktivnost i u hidrolizi arabinozida i fukozida. Ipak, primarna uloga ovog enzima u prirodi je hidroliza laktoze pa se esto u literaturi moe nai i trivijalni naziv laktaza. Laktoza je redukujui eer, poto poseduje slobodnu poluacetalnu hidroksilnu grupu na ostatku glukoze. Ipak, hidrolizom laktoze (slika) se poveava redukujua mo jer se oslobaa i poluacetalna grupa na galaktoznom ostatku pa se tok ove reakcije moe pratiti metodama za odreivanje redukujuih eera. U ovoj vebi tok reakcije pratiemo pomou DNS metode.
Poto je u ovoj reakciji supstrat (laktoza) redukujui eer, praenje reakcije hidrolize DNS metodom neto je sloenije nego u sluaju hidrolize saharoze (5.2.2.) ili hidrolize rafinoze (5.4.2.). Naroito se to odnosi na odreivanje standardne prave jer se ne moe konstruisati koristei samo proizvod reakcije (ekvimolarnu smeu glukoze i galaktoze), nego se mora dodati i neproreagovali supstrat (laktoza) jer utie na redukujuu mo rastvora. Iz tog razloga, sastav smee koja se koristi za odreivanje standardne prave zavisi od poetne koncentracije supstrata i ista standardna prava ne sme da se koristi pri drugaijim poetnim koncentracijama laktoze!
5.3.1. Enzimska hidroliza laktoze
5.3.1.1. Hemikalije Na-acetatni pufer (0,1M; pH 4,5) Rastvor laktoze (20 mM) Rastvor -galaktozidaze (0,5 mg/ml) Osnovni rastvor laktoze (4 mM) Osnovni rastvor potpunog hidrolizata laktoze (4 mM glukoze + 4 mM galaktoze)
5.3.2. Postupak
5.3.2.1. Odreivanje standardne prave hidrolizovane laktoze Proizvod reakcije hidrolize laktoze je ekvimolarna smea glukoze i galaktoze, ali poto i neproreagovala laktoza daje odreenu redukujuu mo eeru, pri konstruisanju standardne prave koriste se smee ova tri eera, koje se u daljem tekstu nazivaju hidrolizati laktoze. Sastav hidrolizata laktoze zavisi od poetne koncentracije laktoze u reakcionoj smei. Poto e hidroliza laktoze u ovom eksperimentu biti izvedena u rastvoru koji sadri 4 mM laktoze svi hidrolizati se pripremaju meanjem, u razliitim odnosima, 4 mM rastvora laktoze i rastvora koji se dobija potpunom hidrolizom laktoze (4 mM glukoze i 4 mM galaktoze). Za konstruisanje standardne prave neophodno je pripremiti po 0,5 ml razliitih hidrolizata laktoze i dodati 0,5 ml DNS reagensa. Hidrolizati laktoze su definisani i domaajem reakcije, odnosno stepenom hidrolize laktoze koji odgovara takvom sadraju smee.
Epruvete se zatim ostave 5 minuta u kljualom vodenom kupatilu, razblae sa 4 ml vode, vorteksiraju se i meri se apsorbanca rastvora na 540 nm u odnosu na slepu probu. Nacrta se standardna kriva zavisnosti apsorbance od stepena hidrolize laktoze (mmol dm -3 ).
5.3.2.2. Hidroliza laktoze Pripremanje supstrata: Rastvor supstrata priprema se tako to se u epruvetu prenese 3 ml acetatnog pufera i 1 ml rastvora laktoze (20 mM). Zatim se epruveta sa supstratom i enzimski preparat (-galaktozidaza) inkubiraju na temperaturi reakcije (45 o C) u toku 15 minuta. Svrha ovog koraka je da obe komponente reakcione smee dostignu temperaturu reakcije pre meanja u sledeem koraku, ime se obezbeuje da od poetka eksperimenta reakciona smea bude na eljenoj temperaturi.
Reakcija: Zatim se u epruvetu doda 1 ml rastvora -galaktozidaze, smea se promea na vorteksu i inkubira na 45 o C da bi se odigrala reakcija hidrolize laktoze. Iz ove epruvete se svakih 5 min uzimaju uzorci zapremine 0,5 ml radi odreivanja koncentracije redukujuih eera i praenja toka hidrolize laktoze. (Treba obratiti panju da se tokom uzorkovanja reakciona smea minimalno zadrava van termostata!)
Odreivanje koncentracije redukujuih eera i stepena hidrolize laktoze: Ovi uzorci u daljem toku prolaze kroz jednak tretman kao rastvori razliitog stepena hidrolize laktoze pri odreivanju standardne krive. Dakle, u 0,5 ml uzorka doda se 0,5 ml DNS reagensa Epruvete se zatim ostave 5 minuta u kljualom vodenom kupatilu, razblae sa 4 ml vode, vorteksiraju se i meri se apsorbanca rastvora na 540 nm u odnosu na slepu probu. Nakon merenja apsorbance uzorka, izraunati koncentraciju razliitih eera (laktoze, glukoze i galaktoze) u uzorku i stepen hidrolize laktoze na osnovu standardne krive odreene u 5.3.2.1. 5.4. Odreivanje aktivnosti a-galaktozidaze Enzim a-galaktozidaza katalizuje hidrolizu -(16)-glikozidnih veza koje su formirane izmeu poluacetalnih hidroksilnih grupa galaktoze i hidroksilnih grupa na C-6 atomu drugog monosaharida, obino glukoze ili manoze. Ovaj enzim nije strogo specifian, pa katalizuje hidrolizu razliitih oligosaharida (rafinoza, melibioza, stahioza i verbaskoza) i polisaharida (galaktomanani i galaktoglukomanani). Katalitika aktivnost a-galaktozidaze u ovoj vebi bie primenjena u hidrolizi rafinoze. Rafinoza je trisaharid ije su monasaharidne jedinice galaktoza, glukoza i fruktoza (slika ). Glukoza i fruktoza su povezane kao u molekulu saharoze, glikozidnom vezom izmeu poluacetalnih grupa, a hidroksilna grupa na C-6 atomu glukoze povezana je glikozidnom vezom sa -galaktozom. Poto su poluacetalne hidroksilne grupe monosaharidnih jedinica blokirane u ovom trisaharidu, rafinoza je neredukujui eer. Iz ovog razloga se hidroliza rafinoze pomou a-galaktozidaze moe lako pratiti pomou DNS metode jer se hidrolizom, pored neredukujue saharoze, oslobaa redukujui eer galaktoza. Stoga, standardna prava se konstruie pomou rastvora koji sadre razliite koncentracije galaktoze, poto drugi proizvod reakcije, saharoza, ne utie na redukujuu mo rastvora.
5.4.2.1. Odreivanje standardne prave galaktoze Proizvod reakcije hidrolize rafinoze je ekvimolarna smea saharoze i galaktoze, ali poto saharoza nije redukujui eer praenjem sadraja redukujuih eera se ustvari prati samo nastala galaktoza. Zato e u ovoj vebi standardna prava biti odreena pomou rastvora galaktoze razliitih koncentracija. Za konstruisanje standardne prave neophodno je pripremiti po 0,5 ml razliitih rastvora galaktoze i dodati 0,5 ml DNS reagensa, prema uputstvu iz tabele. Redni broj epruvete Zapremina osnovnog rastvora galaktoze (ml) Zapremina pufera (ml) Zapremina DNS reagensa (ml) Koncentracija galaktoze (mM) 0 0 0,5 0,5 0 1 0,025 0,475 0,5 0,5 2 0,05 0,45 0,5 1 3 0,1 0,4 0,5 2 4 0,2 0,3 0,5 4 5 0,3 0,2 0,5 6 6 0,4 0,1 0,5 8 7 0,5 0 0,5 10
Epruvete se zatim ostave 5 minuta u kljualom vodenom kupatilu, razblae sa 4 ml vode, vorteksiraju se i meri se apsorbanca rastvora na 540 nm u odnosu na slepu probu. Nacrta se standardna kriva zavisnosti apsorbance od koncentracije galaktoze (mmol dm -3 ).
5.4.2.2. Hidroliza rafinoze Pripremanje supstrata: Rastvor supstrata priprema se tako to se u epruvetu prenese 3 ml acetatnog pufera i 1 ml rastvora rafinoze. Zatim se epruveta sa supstratom i enzimski preparat (-galaktozidaza) inkubiraju na temperaturi reakcije (45 o C) u toku 15 minuta. Svrha ovog koraka je da obe komponente reakcione smee dostignu temperaturu reakcije pre meanja u sledeem koraku, ime se obezbeuje da od poetka eksperimenta reakciona smea bude na eljenoj temperaturi.
Reakcija: Zatim se u epruvetu doda 1 ml rastvora -galaktozidaze, smea se promea na vorteksu i inkubira na 45 o C da bi se odigrala reakcija hidrolize rafinoze. Iz ove epruvete se svakih 5 min uzimaju uzorci zapremine 0,5 ml radi odreivanja koncentracije redukujuih eera i praenja toka hidrolize rafinoze. (Treba obratiti panju da se tokom uzorkovanja reakciona smea minimalno zadrava van termostata!)
Odreivanje koncentracije redukujuih eera i stepena hidrolize rafinoze: Ovi uzorci u daljem toku prolaze kroz jednak tretman kao rastvori razliitog stepena hidrolize laktoze pri odreivanju standardne krive. Dakle, u 0,5 ml uzorka doda se 0,5 ml DNS reagensa Epruvete se zatim ostave 5 minuta u kljualom vodenom kupatilu, razblae sa 4 ml vode, vorteksiraju se i meri se apsorbanca rastvora na 540 nm u odnosu na slepu probu. Nakon merenja apsorbance uzorka, izraunati koncentraciju galaktoze u uzorku i stepen hidrolize rafinoze na osnovu standardne krive odreene u 5.4.2.1.