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RNA Granules and Stress Granules in Viru
RNA Granules and Stress Granules in Viru
247 – 254
http://dx.doi.org/10.4167/jbv.2012.42.3.247 Letter to the Editor
Viruses initiate a number of cellular stress responses and modulate gene regulation and compartmentalization of RNA
upon infection to be successful parasites. Virus infections may induce or impair stress granule (SG) formation to maximize
replication efficiency. SGs and processing bodies (PBs) are the RNA granules, which contain translationally inactive
pool of transcripts as the mRNA silencing foci. PBs and SGs, the highly conserved macromolecular aggregates, can
release mRNAs to allow their translations. Unlike constitutively existing PBs that can respond to stimuli and affect
mRNA translation and decay, SGs are specifically induced upon cellular stress and can triggers a global translational
silencing by several pathways, including phosphorylation of the key translation initiation factor eIF2alpha, tRNA
cleavage, and sequestration of cellular components and so on. The dynamics of PBs and SGs are regulated by several
signaling pathways, including histone deacetylase 6, and depend on microfilaments and microtubules, and the cognate
molecular motors myosin, dynein, and kinesin. SGs share features with aggresomes and related aggregates of unfolded
proteins and may play a role in the pathology. The recent advances in understanding the relationship between viruses
and mRNA stress granules are summarized.
Key Words: Virus infections, Stress granules, Processing bodies, Translation silencing, Microtubule transport
Received: July 16, 2012/ Revised: July 17, 2012 산화효소인 PKR, PERK, GCN2 또는 HRI에 의해 eIF2가
*
Accepted: July 23, 2012 인산화되는 것으로 시작한다. 즉, 증식 중간단계에 이중
Corresponding author: Kyongmin Kim. Department of Microbiology,
Ajou University School of Medicine, Woncheon-dong 5, Suwon 443-721, 가닥RNA를 만드는 RNA 바이러스에 의해서는 인터페론
Korea. 반응에 참여하는 PKR이 주로 활성화되고, 막당단백질을
Phone: +82-31-219-5072, Fax: +82-31-219-5079
e-mail: kimkm@ajou.ac.kr 만드는 일부 바이러스(예, 헤르페스바이러스 등)의 경우
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영향을 미치므로 궁극적으로는 바이러스가 이 과정에 대 subvirion particles, ISVPs)의 양(dose)에 따라서 SG 형성을
해 적응(viral adaptation)하게 될 것이다. 또한 바이러스는 유도하므로, 바이러스 진입(감염단계)에서 SG를 유도한
숙주세포의 여러 과정을 선택하거나 방해함으로써 다양 다 (4). SG 형성을 위해 바이러스 유전자가 발현될 필요
한 단계에서의 스트레스 반응을 유도한다. 실제로 RNA 는 없으나 그 대신 바이러스 감염이 진행되면서 SG를
사일런싱(RNA silencing)과 RNA 저장에 SG가 관여하므 억제한다 (4). 이 단계에서는 eIF2α 인산화가 많이 되어
로 여러 RNA 바이러스가 SG를 조작한다고 알려졌으나, 있어 SG 형성을 촉진하는 상태임에도 불구하고, 아비산
DNA 바이러스 역시 SG 반응을 조절한다. 바이러스가 염이나 그 외의 다른 처치를 하였을 경우 여러 종류의
SG 경로와 상호작용한 결과 여러 표현형이 만들어진다 MRV가 SG 형성을 억제하는 것으로 보아 MRV는 eIF2α
(Table 1). 일반적으로 대부분의 바이러스는 감염기간 동 인산화 이후의 SG 형성단계를 억제한다 (5). 또한 외부
안 SG 형성을 억제하지만, 일부 바이러스는 SG 형성을 요인에 의한 스트레스 상태에서도 MRV 감염세포가 단백
유도하여 SG 반응의 일부를 감염과정에 이용하기도 한다 질합성(translation)을 하는 것은 SG가 형성되지 않은 것
(Table 1). 그러나 이와 같은 바이러스와 SG의 상호작용 과 관련된다. 즉, SG 형성 초기에는 세포 및 바이러스 단
기전에 대해 전반적으로는 아직 잘 알려지지 않았으므로 백질합성 모두가 억제되지만, SG가 억제되는 후기에는 바
계속해서 추가되어야 할 것이다. 이러스의 단백질합성은 억제되지 않는다.
반면에 숙주세포의 단백질합성을 억제하는 2종류[clone
감염의 시작 혹은 중간단계에서 바이러스에 8 (c8) and c87]와 억제하지 않는 Dearing strain의 레오바이
의한 SG 억제 기전 러스에서 SG가 감염기간 동안 계속 존재하였다. 또한
SG 형성을 유도하는 레오바이러스에서는 eIF2α 인산화
포유류 오쏘레오바이러스(mammalian orthoreoviruses, 와 숙주세포 단백질합성 억제가 상관관계가 있다는 것이
MRV)는 선별적으로 세포에 침입하는 능력이 서로 다른 밝혀졌다. 즉, Dearing strain은 eIF2α 인산화의 정도를 매
바이러스 종(strain)과 감염 세포형에 따라 eIF2α 인산화- 우 낮추어 SG의 발현을 낮춘다는 것이다 (6). 종합하면,
의존기전을 통해 SG 형성을 유도한다. 자외선 처리에 의 서로 다른 바이러스 종 및 숙주세포에서 SG 반응이 각
해 불활성화된 입자나 중간 서브 비리온 입자(intermediate 각 다른 조절 기전을 통해 나타나므로, 이들을 실험적 도
Table 1. Virus infections may induce or block SG formations (Modified from Thomas et al., Ref. 2)
Figure 1. Several viruses inhibit stress granule (SG) formations (modified from White and Lloyd. Ref. 1). Sequestrations or cleavage
of SG components are illustrated among several mechanisms. The inhibition of SG formations by the interaction of human T-cell
leukemia virus type 1 (HTLV-1) Tax protein and histone deacetylase 6 (HDAC6) (dotted box) is emphasized to demonstrate that HDAC6
is required to localize SG by motor proteins associated microtubule transport. Deacetylase activity of HDAC6 may also function in SG
assembly.
스를 주어도 SG 형성을 억제한다. 돌연변이 리더단백질 단 머리핀구조(stem loop structure, 3'(-)SL)가 TIA-1 또는
(leader protein, L)을 가진 TMEV는 감염기간 동안 내내 TIAR와 특이적으로 결합하여서 TIA-1와 TIAR를 격리하
SG 형성을 유도하기 때문에, TMEV 리더단백질(leader 여으로써 SG 형성을 억제하며 (11), 이 결합은 바이러스
protein, L)이 SG 억제와 관련되어 있다. TMEV 또는 다 증식에 반드시 필요하다(Fig. 1, Table 1). DV의 3' UTR과
른 카디오바이러스(Mengovirus와 Saffold virus)의 L 단백 5' UTR은 SG 단백질인 G3BP1, caprin1, USP10와 PB 표지
질을 발현시키면 SG 형성을 억제한다. 단백질인 DDX6 (RCK/p54)를 끌어내려서 이중가닥 RNA
급성으로 후닌바이러스(Junin virus)에 감염되면 nucleo- (dsRNA)가 위치하는 바이러스증식 부위에 일부가 존재
protein (N)이나 당단백질 전구체(glycoprotein precursor, 하지만, SG 표지단백질이 SG-유사초점에 응집되어 있지
GPC) 발현에 의존하는 것으로 추정되는 기전에 의해서 는 않은 것처럼 보인다. 다른 SG 단백질이 바이러스증
아비산염 처리 시, eIF2α의 인산화를 억제한다. 그러나 지 식 부위에서 하는 역할은 모두 밝혀진 것은 아니지만,
속 감염된 Vero 세포에 일부 잘려진 N 단백질을 발현하 DDX6와 3' UTR의 상호작용은 DV 바이러스의 증식에 필
고 GPC 발현 레벨이 낮은 경우에는 감염되지 않은 세포 요하다.
처럼 SG가 형성된다. 두 종류의 레트로바이러스는 SG 형성을 억제하는
인플루엔자 A 바이러스(influenza A virus)에 감염되면 것으로 알려졌다. 먼저 사람면역결핍바이러스-1(human
세포 내에서 SG 형성을 유도하지 못한다. 그러나 NS1 돌 immunodeficiency virus 1, HIV-1)는 많은 eIF2α가 인산화됨
연변이가 있는 바이러스는 PKR-의존적 경로로 SG가 형 에도 불구하고 아비산염을 처리하였을 때 SG 형성을 억
성되므로, 인플루엔자바이러스 NS1 단백질이 PKR 활성 제하지만, 퓨로마이신을 처리하였을 때는 SG 형성을 억
화를 억제하여 SG 형성을 막는다. 그러나 SG 형성이 바 제하지 않는다(Table 1) (12). 이로써 HIV-1에 의한 SG 형
이러스증식억제와 연관되지만, eIF2α 인산화로 인한 바 성 억제가 eIF2α 인산화 다음 단계에서 일어난다는 것을
이러스 단백질합성의 억제효과와는 연관되지 않는다. 알 수 있다. 또 다른 SG 표지단백질인 Staufen1은 바이러
플래비바이러스과(Flaviviridae family)인 웨스트나일바 스의 Gag 단백질과 상호작용하여서 안정적인 HIV-1 ribo-
이러스(west Nile virus, WNV)와 뎅기바이러스(dengue nucleoproteins (RNPs)가 바이러스 캡시드로 encapsidation
virus, DV)는 외부스트레스가 오면 음성가닥 RNA의 3'-말 되도록 한다(Fig. 1) (12).
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또한 Human T-cell leukemia virus type-1 (HTLV-1)는 Tax 감염되어도 PKR를 녹아웃(knockout)시키면 SG 형성 능
단백질을 발현하여서 SG 형성을 억제한다 (13). Tax가 세 력이 감소된다. 그러나 SG가 없어도 RSV 바이러스증식
포 내 어디에 위치하느냐에 따라 SG 형성이 다르게 조 이 감소되지는 않는다. 반면에 상반되는 결과도 있기 때
절된다. 즉, Tax가 핵에 있으면 스트레스가 없어도 SG가 문에 RSV 증식에서의 SG 역할은 아직 확립되지 않았다.
형성되지만, Tax가 세포질에 있으면 SG가 형성되지 않는 코로나바이러스인 mouse hepatitis coronavirus (MHV)
다. 이 경우에는 또한 SG 형성과 유지에 절대적으로 중 (15)와 gastroenteritis coronavirus (TGEV)는 SG 형성을 유
요한 히스톤 탈아세틸화효소6(HDAC6)와 Tax가 서로 상 도하여 바이러스 유전자가 활발히 발현하는 동안이거나
호작용하여 SG 형성이 억제된다(Fig. 1) (13). 혹은 감염이 지속되는 기간 내내 SG가 지속적으로 존재
마지막으로 단순허피스바이러스 1형(herpes simplex virus 한다(Table 1). MHV는 감염 후 6시간에 SG와 PB 형성을
1, HSV1)와 같은 DNA 바이러스는 돌연변이 바이러스만 유도하여 eIF2α의 일부 인산화와 숙주세포 단백질합성
이 SG 또는 SG-유사구조를 유도한다. 야생주 HSV1에 억제가 동시에 일어나지만, 바이러스 단백질합성을 억제
감염되면 TIA-1와 TIAR은 세포질에 초점으로 위치하지 하지는 않는다. 즉, 활발한 바이러스 단백질합성과 SG가
만, 뚜렷한 SG 형성을 유도하지 않는다. 그러나 숙주세포 함께 존재하지만, MHV가 감염 후기에 SG를 억제하는지
차단(shutoff, Vhs) 단백질이 없는 변이 HSV1 ΔUL41에 감 는 알지 못한다. eIF2α 인산화 및 SG 형성이 되지 않는
염되면 숙주세포에 따라 eIF2α 인산화와 무관하게 SG를 세포에서 MHV 증식이 촉진된다 (15)는 것은 바이러스
형성하게 한다(Table 1) (14). 즉 HSV는 eIF2α 인산화로 가 숙주세포 단백질합성을 억제하기 위해 eIF2α 인산화
숙주세포 단백질합성을 조절하면서도 SG 형성을 강하게 를 유도하지만 이 때문에 바이러스의 단백질합성도 조금
억제한다. 이 결과는 eIF2α 인산화가 SG 형성을 시작하 은 억제되기 때문이다. TGEV는 최소한 16시간 동안 SG
는 유일한 통로가 아니라는 것을 보여 주는 것이다. 가 증가하여 지속하도록 하는데, 이 시간은 자신이 증식
하는데 필요한 시간이다. 이러한 SG에는 TIA-1, TIAR, 핵
SG 반응을 통한 바이러스 관용의 유도 혹은 단백질 PTB가 있으며 이러한 구조형성은 바이러스 RNA
또는 증식에 이용? 가 축적되지 못하도록 하는 것과 관련이 있다. PTB가 바
이러스 RNA에 결합하여 TIA-1와 PTB가 있는 복합체에
바이러스가 세포 내의 여러 과정들을 주도적으로 조작 바이러스의 gRNA와 subgenomic mRNA (sgmRNA)가 있
하기 때문에 앞에서 HCV와 플래비바이러스에서 언급했 지만, 바이러스의 dsRNA나 증식복합체가 있는 초점과
듯이 G3BP와 TIA-1같은 일부 SG 구성성분들이 바이러 PTB가 있는 SG 구조는 구별된다. 이러한 관점에서 PTB
스증식에 이용된다는 것은 놀랄 일이 아니다. 일부 바이 위치조정과 SG 유도는 바이러스 RNA 증식, 바이러스
러스는 자신의 증식을 위해 SG 형성을 유도하는 단계 단백질합성, 바이러스 입자로의 포장을 조절하는 역할을
를 택한다. 일부의 경우에는 바이러스기능에 이용되는 할 수도 있다. 그러나 TGEV mRNA 발현을 SG가 억제하
일부 SG 구성성분의 응집과 eIF2α 인산화가 연관되어 있 는지는 알 수 없고, PTB-양성 SG의 항 바이러스 작용을
지 않다. 배제할 수도 없다.
RNA 바이러스인 호흡기세포융합바이러스(respiratory DNA 바이러스인 백시니아바이러스(vaccinia virus, VV)
syncytial virus, RSV)와 코로나바이러스(coronaviruses) (15) 는 SG 구성성분을 파괴하여 새로운 응집체로 만들어
는 숙주세포의 단백질합성을 억제하는 기전으로 SG 형 서 SG 특성은 남아있지만 단백질합성이 억제된 mRNA
성을 유도한다. RSV의 경우, 감염 후 24시간이 되면 감 는 없는, 근본적으로 다른 SG를 이용한다. VV가 eIF2α
염된 세포의 ~30%가 SG 형성을 유도하여서 바이러스 인산화를 억제하여도, 증식하는 동안에 세포질 증식장소
증식을 촉진한다. SG가 없는 세포와 달리 SG가 있는 (cytoplasmic replication factories, RFs) 내부나 주변에 SG-
세포는 커다란 바이러스봉입체(inclusion bodies)가 생긴 유사구조가 생긴다. G3BP, 세포질의 activation/proliferation-
다. 이 때 G3BP를 감소(knockdown)시켜서 SG 형성을 associated protein-1 (p137 or Caprin1)과 번역개시인자
억제하면 바이러스증식이 10배 감소한다. RSV는 PKR-의 (initiation factors)인 eIF4G, eIF4E가 VV RNA와 함께 이 응
존적인 eIF2α 인산화에 의해 SG를 유도하므로, RSV가 집체에 있다. G3BP는 SG 형성의 필수단백질이고 G3BP:
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기능을 조절할 것이다. 마지막으로 PV, CrPV, HCV 감염 Katze MG, et al. Reovirus induces and benefits from an
integrated cellular stress response. J Virol 2006;80:2019-33.
은 SG와 함께 PB를 파괴한다. 이 경우에 어느 바이러스
7) McInerney GM, Kedersha NL, Kaufman RJ, Anderson P,
가 두 종류의 RNA 과립을 어떻게 억제하는지 혹은 통합
Liljeström P. Importance of eIF2alpha phosphorylation and
적인 조절 기전이 있는지에 대한 연구가 필요하다. SG에
stress granule assembly in alphavirus translation regulation.
의한 항 바이러스 효과 및 SG가 관여하는 세포예정사
Mol Biol Cell 2005;16:3753-63.
경로에서 바이러스가 어떻게 두 경로 사이의 균형을 이
8) White JP, Cardenas AM, Marissen WE, Lloyd RE. Inhibition
루는 지에 대하여 더 연구할 필요가 있다. 예를 들어 세 of cytoplasmic mRNA stress granule formation by a viral
포 내의 여러 인자가 SG에 격리된다고 제안되었으나, 확 proteinase. Cell Host Microbe 2007;2:295-305.
실한 결과가 없으며 또한 일부에서는 SG 유도가 바이러 9) Piotrowska J, Hansen SJ, Park N, Jamka K, Sarnow P, Gustin
스증식을 촉진하므로 항 바이러스의 효과를 나타내지 않 KE. Stable formation of compositionally unique stress granules
는다. 따라서 현재의 가설은 SG가 형성되면 그 다음 단 in virus-infected cells. J Virol 2010;84:3654-65.
계의 스트레스 신호가 전달되어 종합적인 스트레스 반응 10) Montero H, Rojas M, Arias CF, López S. Rotavirus infection
의 일부로서 자연면역의 항 바이러스 기전(innate antiviral induces the phosphorylation of eIF2alpha but prevents the
mechanisms)이 활성화된다는 것이다. 이와 같이 바이러스 formation of stress granules. J Virol 2008;82:1496-504.
는 세포 기능을 연구할 수 있는 훌륭한 탐침자이다. 바이 11) Emara MM, Brinton MA. Interaction of TIA-1/TIAR with
러스가 SG 형성을 억제하는 기전에 대해 더 많이 연구함 West Nile and dengue virus products in infected cells interferes
with stress granule formation and processing body assembly.
으로써 RNA 과립에 관한 세포생물학과 생화학에 관한
Proc Natl Acad Sci U S A 2007;104:9041-6
더 많은 지식을 얻게 될 것이다. 예를 들어 감염 후, 증
12) Abrahamyan LG, Chatel-Chaix L, Ajamian L, Milev MP,
식을 위해 MT 및 MT 모터 단백질을 이용하는 B형 간
Monette A, Clément JF, et al. Novel Staufen1 ribo-
염바이러스(hepatitis B virus, HBV)의 경우, HBV와 PB, SG
nucleoproteins prevent formation of stress granules but favour
또는 HDAC6와의 관계에 관한 연구는 전혀 되어 있지
encapsidation of HIV-1 genomic RNA. J Cell Sci 2010;123:
않으므로, 앞으로 다양한 많은 연구를 할 수 있을 것으로 369-83.
생각된다. 13) Legros S, Boxus M, Gatot JS, Van Lint C, Kruys V, Kettmann
R, et al. The HTLV-1 Tax protein inhibits formation of stress
참 고 문 헌 granules by interacting with histone deacetylase 6. Oncogene
2011;30:4050-62.
1) White JP, Lloyd RE. Regulation of stress granules in virus 14) Esclatine A, Taddeo B, Roizman B. The UL41 protein of
systems. Trends Microbiol 2012;20:175-83. herpes simplex virus mediates selective stabilization or
2) Thomas MG, Loschi M, Desbats MA, Boccaccio GL. RNA degradation of cellular mRNAs. Proc Natl Acad Sci U S A
granules: the good, the bad and the ugly. Cell Signal 2011;23: 2004;101:18165-70.
324-34. 15) Raaben M, Groot Koerkamp MJ, Rottier PJ, de Haan CA.
3) Kwon S, Zhang Y, Matthias P. The deacetylase HDAC6 is a Mouse hepatitis coronavirus replication induces host trans-
novel critical component of stress granules involved in the lational shutoff and mRNA decay, with concomitant formation
stress response. Genes Dev 2007;21:3381-94. of stress granules and processing bodies. Cell Microbiol 2007;
4) Qin Q, Hastings C, Miller CL. Mammalian orthoreovirus 9:2218-29.
particles induce and are recruited into stress granules at early 16) Isler JA, Maguire TG, Alwine JC. Production of infectious
times postinfection. J Virol 2009;83:11090-101. human cytomegalovirus virions is inhibited by drugs that
5) Qin Q, Carroll K, Hastings C, Miller CL. Mammalian disrupt calcium homeostasis in the endoplasmic reticulum. J
orthoreovirus escape from host translational shutoff correlates Virol 2005;79:15388-97.