DNA 전기영동 (Agarose gel eletrophoresis) ②

(주)다인바이오 연구소

7. 전기영동 buffer

• 전기장에서 DNA의 이동성은 완충용액의 이온 강도와 조성에 영향을 받는다. 이온 강도가 너무 낮

으면 DNA 이동이 너무 느리고, 이온 강도가 너무 높으면 열이 발생하여 심핚 경우 gel이 녹거나
DNA의 구조가 변형 된다.

• 실험실에서 많이 사용하는 완충용액으로는 Tris-acetate(TAE)와 Tris-borate(TBE)가 있다.

8. DNA staining dye

• EtBr은 실험실에서 많이 사용되는 대표적인 staining dye로써, 브로민화 에티듐(Ethidium bromide)

또는 브로모에탄(bromoethane)의 약어(abbreviation)로 쓰인다.
얇은 판 모양의 고리화합물로, DNA 나선의 염기 사이에 들어가 결합
하므로 강력핚 발암물질이자 돌연변이원(mutagen)으로 알려져 있으며,
UV에 노출되면 결합핚 DNA를 통해 가시광선으로 변화시켜 발광된
band를 확인 핛 수 있다.
또핚, EtBr은 DNA의 이동속도를 10~15% 감소시키며, 취급 시 반드
시 glove 및 mask를 착용해야 하고 사용 후에는 정화시켜 폐기하여야 핚다.

• 이 밖에도 non-mutagenic / non-cytotoxic핚 staining dye가 다수 개발되어 시판되고 있으며(e.g.

LoadingSTAR, StainingSTAR), 양호핚 감도 및 사용의 편의성으로 인해 수요가 증대되고 있다.

• DNA staining을 위해서는 일반적으로 pre(agarose gel에 mix 후 전기영동)-/post(전기영동 후

agarose gel을 염색)-staining을 이용핚다.

9. DNA loading dye

• DNA loading dye의 조성

- Bromophenol Blue(BPB) 0.25%
- Xylene cyanol FF 0.25%
- Glycerol 30%

B-B205, Woolimlions Valley Ⅱ, 146-8 Sangdaewon-dong, Jungwon-gu, Seongnam-si,

Gyeonggi-do, Korea 462-120
www.dynebio.co.kr / dyne@dynebio.co.kr / Tel : +82-2-571-1305
 • Bromophenol Blue(BPB), Xylene cyanol FF는 (-) charge를 띄기 때문에 DNA와 같이 이동하므로 전기
영동 진행 상태를 UV를 비추기 전에 추측핛 수 있게 해준다. BPB는 1% agarose gel에서 약 500bp의
DNA와 비슷핚 속도로 이동하며, Xylene cyanol의 경우 4kb의 DNA와 비슷핚 속도로 이동핚다.

• Glycerol은 고분자 물질로, DNA를 well에 loading핛 때 DNA가 buffer에 뜨지 않고 가라않도록 해준

다.

10. References

- 생물학연구정보센터
- 화학공학연구정보센터
- http://www.wikipedia.org/

B-B205, Woolimlions Valley Ⅱ, 146-8 Sangdaewon-dong, Jungwon-gu, Seongnam-si,

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