Professional Documents
Culture Documents
Reparacija DNK
Reparacija DNK
MOLEKULA
LEZIJE DNK MOLEKULA
3 1a A A 3 4 1b
A T U A G G G C T G C T C
T A G T C C 2 C A A C G G
T T
1a 5
2. Pirimidinski dimeri
O
N
H
N
H
0
N H 0
0 P 0 CH2 N N
H 0 P 0 CH2 OH
0 0
H2O 0 0
C1
O
N
guanin H depurinisani šećer
N
H
N H
N N
H
DEAMININACIJA
H H
N
o
H N H
H N
0 H O 0 H O
0 P 0 CH2 N H2O
0 P 0 CH2 N
0 0
0 0
NH3
citozin uracil
DIMER TIMINA
P
O
O N H
N O
C C CH3
P H
O N H
O
N O
C C
H CH3
P
O
O N H
N O
H CH3
P
DIMER TIMINA
G G A C A A T A G C
C C T G T T A T C G
A A
G G A C T A G C
C C T G A T C G
T T
TRI STRATEGIJE REPARACIJE
TOLERISATI GREŠKU
DIREKTNA REPARACIJA
FOTOREAKTIVACIJA
DEALKILACIJA METILTRANSFERAZOM
DIREKTNA REPARACIJA PIRIMIDINSKIH DIMERA
FOTOREAKTIVACIJOM
Svetlost
(350-500 nm)
e
timin timin -
DNK-fotoliaza
fotoreaktivacija
UV zračenje
e-
dimer timina
DIREKTNA REPARACIJA METIL-TRANSFERAZOM
H C H
H3C
S-H cistein
P 0
OH
G 6
OH
P
H C H
H3C
S-H cistein
P 0
OH
G 6
OH
P
H C H
S S-
H3C metilcistein
P 0 C OH
G
OH
P
normalno sparivanje G i C
REPARACIJA ISECANJEM
MISMATH REPARACIJA
BER
izmenjena baza
deaminirani
C T A C A U G C A T C
citozin
5’
3’
G A T G T G C G T A G
3’
AP endonukleaza
C T A C A G C A T C
C T A C A # G C A T C
5’
3’
G A T G T G C G T A G
# DNK glikozilaza
C T A C A G C A T C
5’
3’
AP endonukleaza
C T A C A G C A T C
DNK polimeraza b
C T A C A G C A T C
ligaza
C T A C A C G C A T C
REPARACIJA AP MESTA kod Eukariota – long patch BER
nukleaze
C T A C G G T C T A C T A T G G
5’
3’
G A T G C C A G A T G A T A C C
C G G T C T A C T A T G
C T A helikaza
G
5’
3’
G A T G C C A G A T G A T A C C
C T A C G G T C T A C T A T G G
5’
3’
G A T G C C A G A T G A T A C C
ISECANJE NUKLEOTIDA KOD E. coli
Uvr B
Uvr A dimer
5’ 3’
3’ 5’
ATP ADP+P
5’ 3’
3’ 5’
Uvr B
OH Uvr C P
Uvr D
8n 4n
OH P
OH P
DNK polimeraza I
OH P
OH P
ligaza
OH P
ISECANJE NUKLEOTIDA KOD Eukariota
Složeniji reparozom:
+ M
+ +
CH3
5’ GA*TC
5’ GATC
Dam – dezoksiadenozin metilaza - katalizuje dodavanje metil grupe na C-6 poziciju svih
adenina koji su deo 5'GATC3' sekvence
‘’MISMATCH’’ REPARACIJA KOD E. coli
2 MutH
MutS CH3
G G A T C
5’ 3’
3’ 5’
T C T A G
MutL
‘’MISMATCH’’ REPARACIJA KOD E. coli
2 MutH
MutS CH3
G G A T C
5’ 3’
3’ 5’
T C T A G
MutL
2 MutH
CH3
G A T C
3’
5’
C T A G
MutL
T
3’
5’
G
MutS
2 MutH
CH3
G A T C
3’
5’
C T A G
MutL
T
3’
5’
G
MutS
MutH
CH3
G A T C
3’
5’
A G
MutL
3’
5’
G
MutS
CH3
G G A T C
5’ 3’
3’
5’
A G
G G A T C
5’ 3’
3’ 5’
C C T A G
ligaza
CH3
G G A T C
5’ 3’
3’ 5’
C C T A G
MSH2-6
MLH1, PMS1,2
Egzonukleaza 1, Dnaza IV...
POSTREPLIKATIVNA
REKOMBINATIVNA
REPARACIJA
POSTREPLIKATIVNA REKOMBINATIVNA
REPARACIJA
5’
1 5’ 3’
3’
2
3’
5’
lezija
5’ 5’
3’ 3’
5’ 5’
3’ 3’
REPARACIONI MEHANIZMI KOJI
TOLERIŠU GREŠKE
SOS SISTEM
DNK polimeraza III
clamp
b b
transdimerska sinteza
umuD
umu C Umu C
Substituišu beta subjedinicu DNA pol III
umu D Umu D
uvr A Uvr A
Reparacija isecanjem
uvr B Uvr B
uvr C Uvr C
INAKTIVNI SOS SISTEM REPARACIJE
5’
3’
LexA RecA UvrA UvrB
...
mRNK
LexA
represor
5’
3’
neoštećena DNK
5’
3’
AKTIVIRANI SOS SISTEM REPARACIJE
. .
5’
LexA RecA UvrA UvrB
3’
mRNK
LexA represor
recA proteaze