‫מטלת חובה ‪ – 1‬ביוכימיה – החוג לביוטכנולוגיה ‪2022‬‬

‫לתלמידים שלום‪,‬‬

‫מצורפת מטלה ‪ 1‬שהיא מטלת חובה לה ינתן ציון שישוקלל בציון הסופי של הקורס‪.‬‬

‫שימו לב‪:‬‬
‫א‪ .‬יש להגיש את העבודה במערכת ה‪ Moodle-‬בלבד‪.‬‬
‫ב‪ .‬יש להגיש את העבודה על טופס ה‪ Word-‬המצורף‪ .‬לא תבדק עבודה שתוגש בקובץ ‪ PDF‬או עבודה‬
‫שתוגש בכל סוג אחר של קובץ מלבד קובץ ‪.Word‬‬
‫ג‪ .‬אין למחוק את השאלות‪ .‬יש לכתוב תשובות אחרי כל שאלה‪.‬‬
‫ג‪ .‬יש להגיש את העבודה בזמן שנקבע‪ .‬לא יבדקו עבודות שיוגשו באיחור‪.‬‬

‫בהצלחה‬

‫‪1‬‬
 ‫שאלה ‪ – 1‬שים לב‪ ,‬המשך השאלה בעמוד הבא‬

‫נתון‪ :‬שלוש תמיסות של שלוש חומצות האמינו חומצה גלוטמית (גלוטמט)‪ ,‬איזולויצין וטירוזין המהוות אבני‬
‫בניין בחלבונים‪.‬‬

‫נקודת ‪pKR‬‬ ‫נקודת ‪pK2‬‬ ‫נקודת ‪pI‬‬ ‫נקודת ‪pK1‬‬

‫‪4.25‬‬ ‫‪9.67‬‬ ‫‪3.22‬‬ ‫‪2.19‬‬ ‫גלוטמט‬
‫‪9.68‬‬ ‫‪6.02‬‬ ‫‪2.36‬‬ ‫איזולויצין‬
‫‪10.07‬‬ ‫‪9.11‬‬ ‫‪5.66‬‬ ‫‪2.2‬‬ ‫טירוזין‬

‫א‪ .‬חשב את נקודת ה‪ pKR-‬של גלוטמט‪ .‬הראה את החישוב _)‪pkr=2pi-pk1= 4.25_ (4‬‬

‫ב‪ .‬מה יהיה המטען נטו של רב חומצות האמינו חומצה גלוטמית (גלוטמט) ב‪pH=1?___+1_ (4)-‬‬

‫ג‪ .‬האם ניתן לחשב נקודת ‪ pKR‬לחומצת האמינו איזולויצין? נמק את תשובתך‪ pkr_ .‬מדבר על רמת ה‪ph‬‬
‫שבה הקבוצה הצדדית קולטת או פולטת פרוטון ולכן לא כי הקבוצה הצדדית שלה לא יכולה להיתיינן‬
‫(המולקולה נטרלית) _ (‪)4‬‬

‫ד‪ .‬שרטט את צורת ‪ /‬צורות החומצה האמינית טירוזין ב‪ pH=2.2 (4)-‬ניתן לצרף צילום השרטוט‪.‬‬

‫‪2‬‬
‫ה‪ .‬השלם‪ :‬ב‪ __ pH=11.7, _0%-‬מהקבוצות הצדדיות של חומצות האמינו גלוטמט יהיו קשורות לפרוטון‪( .‬‬
‫‪)4‬‬
‫(אף פעם לא מאה אחוז מהמולקולות יהיו בפרוטונציה חסרה אבל האחוז כל כך קטן שהמספר שווה לאפס)‬
‫ניתן אם כך לבחור "פחות מ‪"50%-‬‬
‫(‪ ,50%‬יותר מ‪ ,50%-‬פחות מ‪)0% ,100% ,50%-‬‬

‫ו‪ .‬באיזו נקודת ‪ pH‬יהיו ‪ 100%‬ממולקולות החומצה האמינית איזולויצין מנוטרלות חשמלית (מטען כולל‬
‫אפס)? ב‪ ph‬של ‪ )4( _ 6.02‬כיצד נקראת צורה זו? __צוויטריון (נקודה איזואלקטרית)_ (‪)1‬‬

‫ז‪ .‬מבין שתי חומצות האמינו‪ ,‬גלוטמט וטירוזין‪ ,‬לאיזו חומצה אמינית זיקה גבוהה יותר לפרוטון בקבוצה‬
‫הצדדית? נמק‪)6( .‬‬
‫טירוזין‪ ,‬מכיוון שה‪ pkr‬שלה גבוהה בהרבה כלומר צריך ריכוז פרוטונים נמוך מאוד כדי שהיא תוותר על‬
‫הפרוטון שלה מה שמעיד על כך שהזיקה שלה חזקה יותר‪.‬‬
‫ח‪ .‬גלוקוז הוא חומר מסיס בקלות במים‪ .‬בחלבון טרנס‪-‬ממברנלי המשמש כטרנספורטר לגלוקוז‪ ,‬איזו חומצה‬
‫‪ /‬אלו חומצות מבין השלוש תצפה לראות יותר נפוצה ‪ /‬נפוצות בחלל החלבון דרכו עוברות מולקולות‬
‫הגלוקוז? הסבר ונמק‪)10( .‬‬
‫גלוטמט וטירוזין כי הקבוצות הצדדיות שלהן הידרופיליות ולכן הגלוקוז שהוא גם כן הידרופילי יוכל לעבור‬
‫בתעלה בקלות‪ .‬מדוע? ‪-2‬‬

‫‪3‬‬
‫ט‪ .‬בחלבונים הקושרים חומצות שומן (מולקולות הידרופוביות) ומובילים אותן בדם‪ ,‬איזו חומצה ‪ /‬אלו חומצות‬
‫מבין השלוש תצפה לראות יותר נפוצה ‪ /‬נפוצות בחלק הקושר את חומצות השומן? הסבר ונמק את‬
‫תשובתך‪)10( .‬‬
‫איזולויצין מכיוון שהיא הידרופובית וכך גם מולקולת השומן כך שהיא תקשור אותה בצורה יעילה‬
‫מדוע? ‪-2‬‬
‫י‪ .‬בנה את הטריפפטיד הבא‪ )10( :‬ניתן לצרף צילום השרטוט‬

‫‪N - Isoleucine – Tyrosine – Glutamate – C‬‬

‫‪4‬‬
 ‫י"א‪ .‬בונוס לא חובה‪ ,10( :‬תשובה לא נכונה‪)-5 :‬‬
‫לקבוצה הצדדית של חומצת האמינו טירוזין יכולת לאבד פרוטון ולהיפך לטעונה במטען חשמלי שלילי (‬
‫‪ ,) pKR=10.07‬מדוע‪ ,‬אם כן‪ ,‬לא קיימים במבנה השלישוני של חלבוני התא קשרים יוניים בהשתתפות‬
‫הקבוצה הצדדית של טירוזין? בתשובתך חובה להתייחס לזיקת הפרוטון‪ ,‬לנקודות ‪ pKR‬של חומצות אמינו‬
‫היכולות ליצור קשר יוני וכן לתנאים הפיסיולוגיים בתאי הגוף‪.‬‬
‫על מנת לגרום לחומצה האמינית טירוזין לשחרר את הפרוטון צריך להגיע ל ‪ ph‬מאוד גבוה של ‪ 10.07‬בגלל‬
‫שזיקת המולקולה לפרוטון היא מאוד מאוד גבוה והוא לא משתחרר בקלות‪ Ph .‬זה גבוה בהרבה מה‪ph‬‬
‫הסטנדרטי בגוף (‪ ) PH=7‬שבו המולקולה במצב נטרלי ללא הפרשי מטענים שחיוניים ליצירת קשר יוני ואין‬
‫שום דרך להגיע ל‪ ph‬הדרוש ליצירת קשר יוני בתנאים הפיזיולוגיים של הגוף לכן לא ניתן ליצור קשר יוני עם‬
‫טירוזין בגוף האדם‪+10 .‬‬
‫שאלה ‪:2‬‬
‫החלבון כלורלין פועל במערכת העיכול וקושר יוני כלור שליליים (‪ .)-Cl‬בדומיין הקישור בחלבון הקושר את יוני‬
‫הכלור‪ ,‬יש שייר חומצת אמינו אספרטית (אספרטת) ושייר חומצה אמינו ליזין‪ .‬לחלבון יכולת לקשור יוני כלור‬
‫שליליים רק כאשר שייר החומצה האמינית ליזין טעון חיובית ואינו קשור‬
‫בקשר יוני עם שייר חומצת האמינו אספרטת‪.‬‬

‫החלבון לא קושר יוני כלור שליליים בשני מצבים‪:‬‬

‫‪ )1‬כאשר שיירי שתי חומצות אמינו אלו (ליזין וחומצה אספרטית) נקשרות בקשר יוני (מתרחש כאשר‬
‫הקבוצות הצדדיות של שתיהן טעונות)‬
‫‪ )2‬כאשר שייר חומצת האמינו ליזין אינו טעון במטען חיובי‪.‬‬
‫כדי שהליזין יקשור יוני כלור צריך שהליזין יהיה חיובי והאספרטת לא טעון‬

‫נתון‪:‬‬
‫נקודת ‪pK2‬‬ ‫נקודת ‪pKr‬‬ ‫נקודת ‪pI‬‬ ‫נקודת ‪pK1‬‬
‫‪9.60‬‬ ‫‪3.65‬‬ ‫‪2.77‬‬ ‫‪1.88‬‬ ‫אספרטת‬

‫‪5‬‬
 ‫‪8.95‬‬ ‫‪10.53‬‬ ‫‪9.74‬‬ ‫‪2.18‬‬ ‫ליזין‬

‫באלו מדרגות ה‪ pH-‬הבאות יקשרו רב חלבוני הכלורלין יוני סידן טעונים שלילית? בהסברך‪ ,‬חובה להתייחס‬
‫לנקודות ה‪( pK-‬שים לב‪ ,‬ישנם נתונים בטבלה שאינם רלבנטיים מכיוון ומדובר בחלבון שלם)‬

‫‪ )1‬בדרגת ‪ ,pH=2.5‬רב חלבוני הכלורלין __יקשרו_ (יקשרו ‪ /‬לא יקשרו) יוני כלור (‪)3‬‬

‫הסבר‪ )10( :‬ב‪ ph‬זה שייר החומצה האמינית ליזין מתחת לנקודת ה‪ pkr‬שלו לכן הוא טעון חיובית‬
‫בהתאם לתנאים ושייר חומצת אמינו אספרטית גם מתחת לנקודת ה‪ pkr‬שלו וטעון גם הוא חיובית‬
‫לא נכון לכן לא יכול להווצר בינו לבין שייר החומצה האמינית ליזין קשר יוני‪ ,‬ושייר החומצה האמינית‬
‫ליזין יכול לקשור את חלבוני הכלורלין‪.‬‬
‫‪-2‬‬
‫‪ )2‬בדרגת ‪ pH=7,‬רב חלבוני הכלורלין __ לא יקשרו __ (יקשרו ‪ /‬לא יקשרו) יוני כלור (‪)3‬‬

‫הסבר‪ )10( :‬ב‪ ph‬זה אומנם שייר החומצה האמינית ליזין מתחת לנקודת ה‪ pkr‬שלו ולכן טעון‬
‫חיובית אך שייר חומצת אמינו אספרטית נמצא מעל לנקודת ה‪ pkr‬שלו ולכן טעון שלילית‪ .‬הפרשי‬
‫המטענים גורמים לקשר יוני להווצר בין שייר חומצת אמינו אספרטית לשייר החומצה האמינית ליזין‬
‫ולכן הליזין שייר החומצה האמינית ליזין לא יכול לקשור את חלבוני הכלורלין‪.‬‬

‫‪ )3‬בדרגת ‪ pH=13,‬רב חלבוני הכלורלין _לא יקשרו_ (יקשרו ‪ /‬לא יקשרו) יוני כלור (‪)3‬‬

‫הסבר‪ )10( :‬ב‪ ph‬זה שייר החומצה האמינית ליזין מעל לנקודת ה‪ pkr‬שלו וטעון שלילית ולכן לא יכול‬
‫לקשור את חלבוני הכלורלין‪ .‬הקשירה היא ליוני כלור ולא לחלבוני הכלורלין‬

‫חסרה התייחסות לנקודות ‪ + pKR‬השייר ניטרלי ‪-6‬‬

‫ציון‪98 :‬‬
‫אלי‬

‫‪6‬‬