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教育

教育 因
因 合
合 教育
合因 育
育 教
教 合因
合因 育 育
SNV致病性分析国内现状
合因

合因教育
合因教
教育

因教 合因
合 育

合因 张 括 教育
国家卫生健康委临床检验中心
因 育 因教育
2021.2.1合 教 合
合因
基因检测与遗传咨询实践能力培训
教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教

合因 育 合 育
教 育

运用NGS,整合临床和实验室的遗传病诊断流程
教 因
因 合
合 教育
合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合因 因 教 因
合 育 合
育 因 教
因教 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 因ACMG
合 指南的 合因

教 育 应用 教

Wright CF, FitzPatrick DR, Firth
合因 育

HV.Paediatric genomics: diagnosing rare disease in children.

Nat Rev Genet. 2018 May;19(5):253-268.
教 育
教 育 因
变异的致病性判断对遗传病诊断、咨询和治疗起着决定性作用
因 合
合 教育
合因
遗传变异的致病性判断一直存在巨大的挑战 育
育 因 教
因 教 合
11%合 (12,895/118,169) of
育 育
variants have因教 教 育 教

≥2 submitters in合ClinVar 合 因
育 合
育 因 教
因 教 合
合 育
因 教
17% (2229/12,895) 育 育
合differently
are interpreted 因教 育 因 教
合 因 教 合
影响临床决策
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 因 教 教 教
合 合因 因
关键问题
育 如何对某个给定变异的临床意义进行分级解读?合 育
教 因 教
合 因 如何促进实验室间变异分类解读的一致化? 合 育

教育
教育 因
因 合
合 教育
2007年
2013年
合因 育
育 教
2015年 教 合因
合因 教育 育 教育
合因 合因教
合因
教育

因教 合因
合 育
教 育 育
合因 因教 育 因教
合 教 合
合因 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 合 因 育
合美国医学遗传学与基因组学学会(The American College
育 of Medical Genetics and Genomics,
下调 上调
教育
教育 因
因 合
人群数据合
教育
合因 育
育 教
计算预测数据 教 合因
合因 教育 育 教育
合因 合因教
合因
教育


功能数据
因 合因
合 育
教 育 育
共分离数据
合因 因教 育 因教
合 教 合
合因
新发数据

教育
教育 因
等位基因数据
因 育 育 育 合
合 因教 教 教
合 合因 因
其他数据
育 合 育
教 因教
合因 育 合 育
教 育

教 证据汇总进行序列变异五级分类解读 因
因 合
合 教 育
合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合 因 因 教 因
合 育 合
育 因 教
因 教 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 因
合 育Mutation. 2018;39:1531–1541 合
Reference: Genet Med. 2015 ; 17(5): 405–424. Human 育
教 育
教 育
ACMG指南的发布和应用在一定程度上促进了实验室间遗传变异分类解 因
因 读的标准化和一致化

合 教 育
合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合 因 因 教 因
合 育 合
育 因 教
因 教 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
Nine因
laboratories in the Clinical Sequencing Exploratory Research(CSER) 合因 育
合 育
教 育
教 育 因
ACMG指南的发布五年后——仍不能完全达到一致
合 因 育


合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育
54% (86/158)complete 育 concordance
教affect medical
合 因 因 教 11% (17/158) may

合 育 合management
育 因 教
因 教 合
合 育 84% (118/140) complete concordance
因 教 育 5% (7/140) may 育 affect medical
合 因 教 育 教
management

合 因 教 合
合 教 育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教

Nine laboratories in the Clinical Sequencing Exploratory Research(CSER) 合
The American Journal of Human
因 育
Genetics 107,1-19,November 5
合 育
教育
教育 因
合因 变异分类解读不一致的原因



合因 • 育
Different applications of evidence codes
育 • Variation 因 教
in laboratory protocol for
教 合evidence(different AF cutoff)
合因
applying
教育 育• ClinGen guidance(gene-specific, 育 evidence

合因 合因教 code-specific) 合 因
• Errors:data育 entry, variant nomenclature,
育 wrong因 教
gene-disease pair
因教 合 since classification
合 • Time
教育 • Use of internal laboratory data
育 育
合因 因教 • Variant type
育 因 教
合 • 因 教
Low-penetrance 合
variants(only 49.2%

reached consensus for pathogenicity) 育

教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因
合因

教 育 教

The American Journal of Human Genetics 107,1-19,November 5,202
合因 育Genet Med.2017.19:1118-1126 合 育
教育

教 ACMG指南翻译成中文并逐渐应用于临床 因
因 合
合 教 育
合因 育

2017年 2018年
因 教 2019年
因 教 合
合 教 育 育 育
因 教 因 教

ClinGen survey:95%实验室使用该指南 因
临检中心组织第一次
合全国变异解读质评
临检中心召开变异解读培训及研讨会

ACMG指南翻译成中文
教育
并组织第二次全国变异解读质评

教 育 因
因 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合 因 育
合 育
教 育

教 国内并非所有实验室均使用ACMG指南 因
因 合
合 教育
合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合因 因教 因
合 育 合
育 因 教
因教 合
合 育
因 教 育 育
合 因教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合因 育
合 育
教 育

教 国内实验室变异解读能力存在差异性 合 因
合因 育

合因
NM_014251.2(SLC25A13):c.852_855del(p.Met285fs) 瓜氨酸血症

II型 育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合 因 因 教 因
合 育 合
育 因 教
因教 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 合因 育
合 育
教 育

国内实验室普遍缺乏可操作性的变异解读标准操作程序
教 因
因 合
合 教 育
合因 育
育 因
• 1.Literature and

database search
因 教 合
合 教 育 •

2.Allele frequency data(BA1/BS1/PM2)

因 教 • 3.Variant type and location data 教
合 因 ( 合 因
合 育
PVS1/PP2/BP1/PP3/BP4/PS1/PM5/BP7/PM4/BP3)
育 教
因 data(PM1/PS3/BS3)
因教 • 4.Functional

合 育 • 5.Patient and segregation data
因 教 (BS2/PS4/PM3/BP2/BP5/PS2/PM6 / PP4/PP1/BS4)
育 • 6.Evidence summary 育
合 因教 育 因 教
合 因 教 合
合 教 育
教 育 因
因 育 育  ACMG指南
育 合
合 教 教 教 ClinGen:https://clinicalgenome.org/
合因

合因
不足5%
合 因  ACGS操作指南(2019/2020版)
育 教 育
因 教  其它文献

合 育 合 育
教育
教 育 因
因 合
合 部分实验室仍过度依赖“可靠来源致病性信息”
教育
合因 育
育 因 教
因 教 合
国内至少10%的实验室仍在使用
合 教 育 育 育
因 教
PP5/BP6
因 教
合 合 因 合
教 育
教 育 因
因 合
合 育
因 教 育 育
合 因教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合因 育
合 育
教育
育 因
合因教
证据的“double counting”


问题总是存在

合因 育
育 教
教 合因
合因 教育 育 教育
合因 合因教
合因
教育

因教 合因
合 育
PVS:LOF
因 教 PP3: in silico 育 育

evidence
因 教 育 因教

Canonical ±1,2 splice variants 因教 合
合 教育
教育 PM4:protein length change PP3: in silico 因
因 evidence 育 育 育 合
合 教 教 教
合因
mRNA分析已证明该变异影响剪接
合因 合 因

教育PS3:functional test PP3: in silico evidence 教
因 合因 育
合 育
教育

教不同的证据针对不同变异类型的错误使用 因
因 合
合 教育
合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教育
合因 因教 因
合 育 合
育 因 教
因教 合
合 育
因 教 育 育
合 因教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 因 教 教 教
例如:PVS1+PP3

合 合因 因
至少13%
PVS1+PS1

育 合 育
教 因 教
合因 合 育

教 育

未关注并使用ClinGen特定疾病和基因的建议
教 因
因 合
合 教育
合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合因 因教 因
合 育 合
育 因 教
因教 合
合 育
因 教 育 育
合 因教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合因 育
合 育
教 育
教 育 因
因 未关注并使用ClinGen特定疾病和基因的建议 合
合 教育
合因 育
育 因 教
教 合NM_000277.1(PAH):c.1197A>T
合因 教 育 育
(p.Val399=)
教 育
合因 因教  9.5%实验室使用PVS1,23.8%实验室未升

合 育
120μmol/ L)

级PP4_Moderate(苯丙氨酸浓度大于

育 因 教
因教 合 NM_000277.1(PAH): c.728G>A
合 育 (p.Arg243Gln)
因 教 育 育
 4.5%实验室未使用PS3(体外苯丙氨酸羟
合 因教 育 因 教
化酶酶活性<50%),25%实验室未使用
合 因 教 合
PP3 (REVEL=0.94), 25%实验室使用了
合 PM1(根据建议不使用) 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 合 因 育
合 育
教育
教 育 使用建议并非不加入思考 因
因 合
合 教 育
NM_000277.1(PAH): c.728G>A (p.Arg243Gln)
合因 育
育 因 教
因 教 合
合 教 育 育 育
新华医院:
因 教 因 教
合 合 因 合
教育
教育 因
因 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合因 育
合 育
教 育
育 因
https://www.clinicalgenome.org/working-groups/sequence-variant-

因 合
interpretation/
合 教 育
合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合 因 因 教 因
合 育 合
通用建议 育 因 教 特定疾病和基因的建议
因 教 合
合 育
因教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 合 因 育
合 育
教 育

教 关注疾病-基因关系和疾病致病机制 合 因
合 因 育

合因 育
Very strong 育 evidence of pathogenicity(PVS1) 因 教
因 教 合
• Gene-disease 教
合 育
validity 育 育
因 教 因 教

At least moderate(strong/moderate)合
因 合
教 育
教 育 因
•因Disease mechanism(Is LOF a mechanism?) 合
合 Published in the literature;育
因 教 育 育
HI score of 3 in
合 ClinGen dosage 教
sensitivity map;
育 教
Tolerant of LOF Variants – Population因 Data: 教 因

For dominant disorders, PLI score>0.9 (ExAC)or o/e ratio 因 <0.35

(gnomAD)and HI index ranks (0%-10%);
合 教育
教 育
However, pLI and oe are predictors – will not always be accurate 因
因 育 育 育 合
合• Assessing 教 教
合因molecular 合因 consequences(Does
合 因 教 variant truly

cause 育
PVS1 ACMG/AMP
教 LOF?) variant criterion
因 教
合因https://clinicalgenome.org/docs/recommendations 合 育

教育
教育 因
因 关注疾病-基因的关系 合
合 教育
合因 育
育 教
教 合因
合因 教育 育 教育 P

合因 合因教
合因
教育 LP

因教 合因
合 育
教 育 育
合因 因教 育 因教
合 教 合
合因 教育
vus

教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因https://clinicalgenome.org/curation-activities/gene-disease-validity/ 合因 育
合 育
教 育
教 育 因
实验室在panel设计和变异解读时未充分关注疾病-基因关系
因 合
合 教 育
基因
合 因 基因与听力障碍的关系

教 育
CDH23, CIB2, CLDN14, COCH, DIAPH1, ESRRB, EYA4, GRXCR1, ILDR1, KCNQ4, 明确的(definitive)

LHFPL5, LOXHD1,LRTOMT,
教 MARVELD2, MY H9,MY O15A, MY O6,MY O7A,

OTOA,OTOG,OTOGL, PJVK, PTPRQ,POU4F3, RDX, SLC26A4, STRC, TECTA,
因TMIE,TMPRSS3, TRIOBP,育 合

TMC1,

TPRN, USH1C, WHRN,PCDH15, ESPN
育 育
教某测序机构听力
CABP2, MYO3A, S1PR2,因 CDC14A 教 因
合 HGF, MSRB3, SERPINB6,
CLIC5, COL11A2, EPS8,
合 因
SYNE4,
强的(strong)

中等的(moderate) 障碍基因检测
ADCY1, DCDC2, ELMOD3, KRAS, MET, PNPT1, SLC26A5, TBC1D24
教 育 panel基因列表
教 育KCNJ10, TSPEAR
FOXI1, 因
有限的(limited)
有争议的(Disputed) (61%)
因 GJB6 合 否定的(refuted)
合 ATP2B2, AUNX1, DFNA5, FAM65B,
育 GIPC3, PDS
因 教 育
未经ClinGen专家组评估

合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教 育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 合 因 育
合 育
教育
教育 因
因 合
合 教育
合因 育
育 教
教 合因
合因 教育 育 教育
合因 合因教
合因
教育

因教 合因
合 育
教 育 育
合因 因教 育 因教
合 教 合
合因 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因
合因

教 育 教

合因 育 合 育
教育
教育 未关注疾病致病机制 因
因 合
合 教 育
NM_006662.2 (SRCAP) :c.7303C>T (p.Arg2435Ter)
因 Floating-Harbor syndrome (OMIM
合136140) 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合 因 因 教 因
合 育 合
育 因 教
因 教 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教 育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 显性负效应:体外功能实验/非随机聚集(E33/E34)/普通人群中存在缺
合 因 育
合 失/ExAC人群中存在靠前的截断突变

教育
教育 因
因 注意证据的错误理解问题 合
合 育 教
合 因 用于评价错义变异致病性;
Other variants in育
same codon (PS1 and PM5) 教 育
教 合 因
使用此两个证据时,之前报道的变
合因 教 育 育
异的致病性必须是经过评级后确定
教 育
合 因 因教 是致病的,且证据不可循环使用;

合 育 合
该待分类的错义变异不能用于评价
育 教
因 教 合因自身致病性的证据,因为该变异仍
然不是“致病的”;
合 育
因 教 育 例如:在ClinVar 数据库 育
合 因 教 育 因 教 数据
(RCV000411778.1)和HGMD
合 因教 合
库(CM074541)均标注为致病性变
合 异,因此使用PS1(SLC26A4:c.281C>T)教育
教 育 因
因 育 育 育
PS1和PM5彼此误用 合
合 因教 教 教
合 合因 因

不需要使用但使用的证据 合 育
教 因 教
合因 育 合 育
教育
教育 因
因 证据的升降级使用时易犯糊涂 合
合 育 教
PP1 and BS4-segregation data 合因 育
育 教
教 合因
合因 教 育 育 教育
W E S 检 测 患 儿 携 带 N因M _ 0 0 1 1 2 3 2 2 6 ( M T O教
合 因
1):
合因
c.1411C>T (p.Arg471Trp)/ NM_001123226合 (MTO1): 育
育 因教
因 教
c.1510C>T (p.Arg504Cys) 复合杂合变异(联合氧化磷酸化

合 缺陷 10 型 OMIM 614702,AR),父母健康,曾生育两个男

因 教
孩均在幼儿期夭折,前两个孩子留存的样本做WES检测均携带 育 育
该复合杂合变异。合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合因 育
合 育
教育
教育 因
因 注意证据的升降级使用 合
合 育 教 本家系中,三名患儿同时检
PP1 and BS4-segregation data
合因 育 NM_001123226.1(MTO1):c.[1411C
育 教 >T];[1510C>T]复合杂合变异,符
教 合因 合家系共分离 (2 affected
合因 教育 育 育
segregations, 0 Unaffected

合因 教 Segregations,eLOD=1.20)。可
因 合
用中等证据

合 育
育 教
因教 合因 该家系发生2次共分离,LOD
score=1.45;
合 育
教 育
该家系验证符合。Segregation

合因 因教 育 因教
data Z(LOD score)=1.81(3次共
分离),符合PP1-Strong
合 教 合
合因 此案例为2次感染性分离,LOD
教育
值为1.2,考虑用为Supporting强
教 育 度的证据。 因
因 育 育 育 合
合 因 教 教 教
合 合 因 因
育 合 育

LOD>0.6时,PP;LOD>1.5时,PS;介于两者之间PM 因教
合因 合 育

教育
教育 因
因 注意证据的升降级使用 合
合 育 教
PM3-count proband (recessive) 因

• SVI revision to PM3: For recessive disorders, detected in trans with 育a pathogenic or likely
pathogenic 育variant in an affected patient 因 教
教 合Considerations:
合因 教 育 育 ● Allele Frequency 教 育
合 因 因 教 因
● Phasing合
合 育Classification
育 教 ●
因 ● Homozygous occurrences
因 教 合
合 育
因 教 育 NM_000441.1 (SLC26A4): c.919-2A>G:

合 因 教 育17家实验室使用PM3;
因 教
合 教 this variant has
合 been detected in 16
合因 patients with hearing loss in trans with
more than 4 pathogenic variants 教育
教 育 (PM3_VeryStrong; PMID: 23151025)因
因 育 育 育 合
合 因 教 教 NM_000441.1

(SLC26A4): c.281C>T:
合 合 因 因 7家实验室使用PM3;

育 合 (PM3_VeryStrong; PMID:育 25372295)


教 因 教
因 Recommendation for in trans Criterion PM3 (Version 1.0)
合PM3: 合 育

教育
教育 因
因 注意证据的升降级使用 合
合 育 教
合因 育
育 de novo data
PS2 and PM6- 教
教 合因
合因 教育 育 教育
合因 合因教
合因
教育

因教 合因
合 育
教 育 育
合因 因教 教
育 X-linked因conditions
合 因 教 ●
合 recessive
合 Autosomal

conditions: 教育
教 育 因
因 育 育 育
Mosaicism:


合 教 教 教
合因 合因
合因

教 育 教

合因 育 合 育
教育
教育 因
因 注意证据的升降级使用 合
合 育 教
合因 育
育 教
教 合因
合因
患儿,男性,6岁6个月,因“身材矮小,
教 育 身高增长缓慢 ”
育 教 育
合 因
就诊。自幼即发现生长缓慢,近来身高比同龄儿童明显落后, 因 教 因
合 育 合 de novo
现患儿身高95cm,位于P3以下,骨龄不足3周岁,语言发育
育 因教 • Trio WES confirmed de novo

因 教
落后,特殊面容。 ((1)身材矮小(<-2 SD),(2)骨龄 合 • PMID:2296468 (1例/assumed)
合 延迟,(3)语言缺陷,(4)畸形特征。) 育 • PMID:2296468 (1例/assumed)

因 教 育 •

PMID:2296468 (1例/assumed)
T r i o 全 外合
因教 育 • 教
>4 points(PS2_very_strong)
•因文献不全/假定or确定新发/表型
检测发现患儿存在NM_006662.2

(SRCAP) :c.7303C>T (p.Arg2435Ter)杂合变异,父母该位 因
教 合 非特异
合 教 育

点均为正常基因型,提示该变异可能为新发变异。

Floating-


Harbor 综合征 (OMIM 136140)育
AD;de novo 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合 因 育
合 育
教育
教育 因
因 对表型的判断能力存在差异 合
合 育 教
合因 育
育 教
教 合因
合因 教育 育 教育
合因 合因教
合因
教育

因教 合因
合 育
教 育 育
合因 因教 育 因教
合 教 合
合因 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因
Floating-
Harbor
PKU 联合氧化
磷酸 化缺 合因
眼皮肤白 X-连锁重症
联合免疫缺
合因

教 育 陷 10 型
化病 II
型 陷1 型


合因 育 合 育
ACGS
教 育
教 育 因
因 内部数据的差异对变异解读的影响 合
合 教 育
PM2+PP3 = VUS 合因 育
• AD/XLD 育+ PS2(PS4)====LP(share variant) 因 教
因 教 合
教 育
•合AR/XLR + PP1_S(PM3+PP1_M)====LP(share 育 variant) 育
因 教 因 教
合 合 因 合
教 育
教 育 因
因 合
合 育
因 教 育 育
合 因 教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合 因

教 育 教
因 因
育 Inherited Cardiomyopathy合
合 Reference: MYH7 recommendations by ClinGen’s Expert Panel 育
教 育

教 国内实验室普遍缺乏数据共享意识 合 因
合因 育

合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合因 因教 因
合 育 合
育 因 教
因教 合
合 育
因 教 育 育
合 因教 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因 合因

教 育 教
因 合因 育
合 育
教育
教 育 因
因 缺乏中国人群基因型-表型数据库 合
合 教育
合 因
基因组数据的解读高度依赖于对对照群体和患者群体变异数据库的运用 教

教育 因

合因 教 育 文献:获得既往的变异和病例信息
育 育
教 表型数
合因 教
现有患者:表型、遗传模式等信息
因 因
合 育 合 据
育 因 教
因 教 合
基因型和表型数据库:收集既往个体基因
基因型
合 育 型和表型数据,建立二者之间的关系,记

因 教 育
录遗传变异的功能和致病意义,从而实现 数据

合 教
对候选变异的快速精准解读
因 育 因 教
合 因 教 合
合 教育
教 育 因
因 育 育 育 合
合 教 教 教
合因 合因
合因

教 育
基于表型的变异评级和解读 教
因 合因 育
合 育
教 育

教各因素造成我国实验室变异解读不一致合 因
合因 育

合因 育
育 因 教
教 合
合因 教 育 育 教 育
合因 因教 因
2018年第一次全国质评结
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2019年第二次全国质评结
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教 培训可促进变异解读准确性和一致性 合 因
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需使用但没有使用的证据
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教 育 不需要使用但使用的证据

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因 如何促进我国变异解读标准化和一致性 合
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• 1.个人(实验室人员和临床医生):专业知识和技能/ 因 教
“强”的职业意识/“认真”
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• 合2. 因
实验室: 育 育
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• 通过外部和内部培训缩小实验室间/实验室内对ACMG解读标准的主观理解差异和解
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读能力差异人员变异解读能力差异; 合 育
• 教 育 因 教
针对ACMG指南提供的是“framework”,实验室应建立可操作性的变异解读sop ,
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合 明确本实验室变异分类的标准,根据研究进展对SOP进行更新并记录更新内容;

• 加强与临床的交流;因 教 育 育
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• 建立实验室内部数据库累积数据并通过实验室间交流共享数据;
合 教 合
• 3. 行业 合因 育
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• 教最理想的是未来建立我国人群基因型表性数据库 合
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合 • 4. 准确的变异解读建立在准确的检测和数据分析基础上。
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我国变异解读标准化和一致化仍然有很长的路要走
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教 合因
合因 育 育
合因

感谢聆听!
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合因 kzhang@nccl.org.cn
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010-58115053
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