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项目名称： 遗传代谢病基因检测全套
临床提示：

检测结果： 阳性，检测到一个纯合基因变异。
——————————————————————————————————————————————————
基因 区带 参考序列 位置 cDNA 水平 蛋白水平 状态 变异分类
——————————————————————————————————————————————————
ETFDH 4q32 NM_004453.3 Exon3 c.250G>A p.(Ala84Thr) 纯合 致病
——————————————————————————————————————————————————

结果解释：
1、检测到受检者 ETFDH 基因一个纯合的致病突变。
2、ETFDH 基因如发生致病突变可引起戊二酸血症 2 型，通常以常染色体隐性的方式遗传。晚发型戊二酸
尿症 2 型主要临床表现为脂质沉积性肌病，由于其对维生素 B2 治疗敏感，故又称核黄素反应性脂质沉积
性肌病。致病突变的携带者往往并不发展成为患者。携带致病突变的父母每次生育子女均有 25%的可能
为患者。

所检测到的基因变异的解释：
ETFDH 4q32 NM_004453.3 Exon3 c.250G>A p.(Ala84Thr)
该变异为错义突变（预计会使所编码蛋白质的第 84 位氨基酸由 Ala 变为 Thr）。有文献报道在患者中检测
到该变异，该位点位于热点区域，用分子动态学和建模的方法分析显示该突变会导致 FAD 结合域附近的
结构改变，破坏 FAD 结合域的稳定性；ESP6500、千人基因组和 dbSNP 数据库均有收录(0.0003，0.
000199681，rs121964954)；本地数据库在多个肌病患者中检测到该变异的纯合突变；生物信息学软件
预测其致病可能性较大。综合考虑，认为该变异为致病性变异。[BMC Struct Biol. 2011 Oct 21;1
1:43.//Neuromuscul Disord. 2009 Mar;19(3):212-6.]

其他建议：
患者的家属有可能携带了相同的突变，有需要时可检测患者的家属。
具体可到具有资质的机构进行遗传咨询。

临床意义：
遗传代谢病是因维持机体正常代谢所必需的某些由多肽和（或）蛋白组成的酶、受体、载体及膜泵生物
合成发生遗传缺陷，又称遗传代谢异常或先天代谢缺陷。该类遗传病多为单基因遗传病。临床症状包括
神经系统异常、代谢性酸中毒和酮症、严重呕吐、肝脏肿大或肝功能不全、特殊气味、容貌怪异、皮肤
和毛发异常、眼部异常、耳聋等。多数遗传代谢病伴有神经系统异常，在新生儿期发病者可表现为急性
脑病，造成痴呆、脑瘫、甚至昏迷、死亡等严重并发症。

本检测所涉及到的相关疾病和基因主要包括：
本检测仅对来样负责，如果对结果有疑义，请在收到报告后 7 个工作日内与我们联系，多谢合作！ 报告日期: 2018-10-12 15:41:37

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√铜代谢异常：相关疾病包括：肝豆状核变性、Menkes 综合征、血浆铜蓝蛋白缺乏症。相关基因有：
ATP7B, ATP7A, CP, KRT8, KRT18 等。
√遗传性血色病：相关基因包括：HFE（遗传性血色病 1 型）；HJV 和 HAMP（遗传性血色病 2 型）；TFR
2（遗传性血色病 3 型）；SLC40A1（遗传性血色病 4 型）。
√Bartter 综合征（Bartter syndrome, BS）和 Gitelman 综合征（Gitelman syndrome，GS）均属
于遗传性失盐性肾小管疾病。相关基因包括 SLC12A1, KCNJ1, CLCNKB, BSND, CLCNKA, CLCNKB 等。
√遗传性高脂血症：相关疾病包括：家族性高胆固醇血症、家族性 ApoB-100 缺乏、植物固醇血症、
Wolman 病和家族性脂蛋白脂肪酶缺乏、家族性乳糜微粒血症、家族性混合型高脂蛋白血症、家族性血 β
脂蛋白异常、肝脂肪酶缺乏症、载脂蛋白 A1 缺乏症、丹吉尔病、卵磷脂胆固醇酯酰转移酶缺乏症家族性
高甘油三酯血症。相关基因包括：LDLR, APOB, LDLRAP1, PCSK9, ABCG5, ABCG8, LIPA, LPL,
APOA5, LIPI, USF1, APOE, LIPC, APOA1, ABCA1 等。
√伴 LDL 胆固醇和甘油三酯降低的疾病：相关疾病包括该基因突变引起家族性无 β 脂蛋白血症；家族性
低 β 脂蛋白血症；乳糜微粒潴留性疾病/安徒生病。相关基因包括：MTTP, APOB, SAR1B 等。
√脂肪酸氧化缺陷与肉碱循环缺陷：相关疾病包括：高胆固醇血症（家族性高胆固醇血症，家族性 Apo
B-100 缺乏，植物固醇血症，Wolman 病，家族性脂蛋白脂肪酶缺乏）；高甘油三酯血症（家族性乳糜微
粒血症，家族性高甘油三酯血症）；混合性高脂血症（家族性混合高脂蛋白血症，家族性血 β 脂蛋白异
常，肝脂肪酶缺乏症，载脂蛋白 A1 缺乏症，丹吉尔病/家族性低 α 脂蛋白血症，卵磷脂胆固醇酯酰转移
酶缺乏症）等。相关基因包括 SLC22A5, CPT1A, CPT2, SLC25A20, ETFA, ETFB, ETFDH, ACADVL,
ACADL, ACADM, ACADS, HADHA 等。
√脂质沉积性肌病：大多缓慢起病主要累及骨骼肌。相关基因包括：ETFDH、ETFA、ETFB（戊二酸血症
2 型）；PNPLA2（中性脂肪沉积性肌病）；ABHD5（Chanarin-Dorfman 综合征）；CPT2（肉碱棕榈酰转
移酶 2 缺乏症）；SLC25A20（肉碱/酰基肉碱移位酶缺乏症)。
√苯丙酮尿症（phenylketonuria, PKU）：又称高苯丙氨酸血症，分经典型和非经典型两类。相关基
因包括 PAH, PTS, QDPR, GCH1, PCBD1 等。
√枫糖尿病(maple syrup urine disease, MSUD)该病相关的基因突变都是以微小突变为主，大多可
以通过直接基因测序发现。相关基因包括：BCKDHA, BCKDHB, DBT, DLD。
√尿素循环障碍（Urea Cycle Disorders）相关疾病包括高氨血症、瓜氨酸血症、精氨酸血症。相关基
因包括 CPS1, OTC, ASS1, ASL , ARG1, NAGS, SLC25A15。
√氨基酸代谢障碍：相关疾病及基因包括：酪氨酸血症（FAH, HPD, TAT）；瓜氨酸血症（ASS1,
SLC25A13）；高鸟氨酸血症（OAT）；同型半胱氨酸血症（MTHFR, SLC19A1, CHDH, FOLR1）；高甲硫氨酸
血症（ADK, AHCY, GNMT, MAT1A）；非酮型高甘氨酸血症（AMT, GLDC）；高脯氨酸血症（PROD H,
ALDH4A1）；组氨酸血症（HAL）。
√有机酸代谢缺陷：相关疾病包括：甲基丙二酸尿症、丙酸血症、戊二酸血症、 3-甲基巴豆酰辅酶 A 羧
化酶缺乏症等。相关基因包括：MUT, MMAA, MMAB, MCEE, MMADHC, MMACHC, LMBRD1, HMGCL, AUH,
MCCC1, MCCC2, ACADSB, HLCS, PCCA, PCCB, IVD, GCDH 等。
√糖原累积症：又称糖原贮积症。相关基因包括 ALDOA, ENO3, GAA, LDHA, LDHB, PGAM2, PGM1,
PYGM, GYS2, AGL, GBE1, PYGL, PFKM, GPI, G6PC, SLC37A4, PHKA1, PHKA2, PHKB, PHKG2。
√酶体贮积症：相关疾病和基因主要包括：粘多糖沉积病（IDUA, IDS, SGSH, NAGLU 等）；寡糖贮积
症（MAN2B1, MANBA, NEU1, FUCA1 等）；黏脂症（GNPTAB, GNPTG, MCOLN1, NEU1）；溶酶体鞘脂代

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谢障碍（GLB1, GM2A, ARSA, GALC, GLA, GBA, SMPD1, ASAH1 等）。
√过氧化物酶体病：相关疾病及基因包括：Refsum 病（PEX7, PHYH, AMACR, PEX2）；Zellwege 综合征
（PEX1, PEX3, PEX5, PEX6, PEX10 等）；点状支根软骨发育不良（AGPS, GNPAT, PEX7）；17-β 羟类
固醇脱氢酶 3 型缺陷症（EHHADH, HSD17B4）；肾上腺脑白质营养不良（PEX6, ABCD1, PEX5
等）；高草酸尿症（AGXT, GRHPR, HOGA1）等。
√生物素缺乏：相关基因包括：HLCS 和 BTD。
√先天性糖蛋白糖基化缺陷（Congenital Disorders Of Glycosylation，CDG）：先天性糖基化障
碍 1 型相关基因包括：PMM2, MP1, ALG6, ALG3, DPM1, ALG8, ALG2, ALG1 等；先天性糖基化障碍
2 型：相关基因包括 MGAT2, MOGS, SLC35C1, B4GALT1, COG7, SLC35A1 等。
√神经递质代谢障碍：该类疾病以及相关基因包括：四氢生物蝶呤缺乏症（GCH1, SPR, QDPR, PT
S）；酪氨酸羟化酶缺乏（TH）；葡萄糖转运蛋白缺乏（SLC2A1）；惊跳病（SLC6A5, GLRB, GLRA
1）；多巴胺 β 羟化酶缺乏（DBH）；琥珀酸半醛脱氢酶缺乏（ALDH5A1）；芳族 L-氨基酸脱羧酶缺乏
症（DDC）；单胺氧化酶缺乏（MAOA）。

参考资料：
可能报告的基因突变/变异：
我们会报告可能解释患者的病情的致病变异或者可疑致病变异。
注：根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)对基因变异的分类，基因检测到位点的变异分为以下 5
类：5 类-病理性的(pathogenic)；4 类-可疑病理性的(likely_pathogenic)；3 类-意义不明(
uncertain_significance)；2 类-可能良性(likely_benign)；1 类-良性(benign)。
注：根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)推荐的指南，我们对一个基因变异是否具有致病性至少
会综合这些方面的信息：
● -基因变异的类型，例如：大片段缺失、无义突变、移码、剪接突变、影响翻译起始位点的突变常常 可
作为致病性的极强证据；错义变异如果发生在突变热区（同一位置的其他形式错义突变被证实为致病 突
变），是致病性的弱证据；
● -相关文献、突变数据库中的描述是我们对基因突变进行定性的重要依据（但应注意相当一部分文献
中对突变的定性是不可靠的甚至是错误的，我们会获取全文，仔细甄别，必要时阅读多篇文献）；
● -家族史、患者家属的基因检测结果：例如，一个突变如果确认为新发突变，是致病性的强证据；
● -大样本量调查结果：例如，某变异在大量（>1000）随机正常人中均未检出，是致病性的弱证据；
● -生物信息学软件分析结论，可作为判别是否具有致病性的弱依据。

病理性变异（pathogenic variants）与致病变异（Causal variants）

● -病理性的变异（pathogenic variants）是指那些影响了基因的功能、在特定条件下可引起疾病状
态的基因变异。由于人类基因组的高度复杂性，每个人都会有一些病理性的变异，但是这些变异的存在
对于每一个具体的人而言，大多数情况下并不引起疾病的状态。在过去我们一般使用突变来描述这类变
异，但是 ACMG 指南更推荐使用病理性变异而不是病理性的突变。
● -致病变异（Causal variants）是指那些发生在具体的病人中，引起了疾病状态的病理性变异。
● -举例来说：某进行性肌营养不良症的男性患儿，经过全外显子组测序检测，发现存在 DMD 基因的

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Exon45 缺失（半合子型），以及 GJB2 基因的框移（c.35delG，杂合）。这里的 DMD、GJB2 基因变异都
是病理性的变异；DMD 基因的 Exon45 缺失是这个患儿的致病变异，而 GJB2 的变异对这个患儿来说却不是
致病变异，因为他没有耳聋这种病。“病理性变异”被用来描述变异本身的性质，“致病变异”被用来
描述病理性变异所造成的后果。再假设这个患儿的母亲患有耳聋（而肌肉系统则完全正常），经过全外
显子组测序检测，发现存在 DMD 基因的 Exon45 缺失（杂合子型），以及 GJB2 基因的框移（c.35delG，
纯 合），那么，GJB2 基因的变异对母亲来说就是致病突变，而 DMD 基因的变异则不是母亲的致病突变，
尽 管是一个病理性的变异。

本实验室采用的突变/变异数据库（主要）
● -KMTD，病人突变数据为主，本实验室自主建立的数据库
● -HGMD（专业版），病人突变数据为主，英国卡迪夫大学
● -ClinVar，综合性数据，美国国家生物信息学中心
● -ESP6500，一般人群变异数据为主，美国国家心脏、肺和血液研究所
● -1000genomics，一般人群变异数据为主，千人基因组计划
● -dbSNP，一般人群变异数据为主，美国国家生物信息学中心
● -其他数据库

参考文献：
1. Genet Med. 2015 May;17(5):405-24. [Pubmed ID: 25741868]
2. Nucleic Acids Res. 2010 Sep;38(16):e164. [Pubmed ID: 20601685]
3. J Med Genet. 2012 Jul;49(7):433-6. [Pubmed ID: 22717648]
4. Nat Protoc. 2015 Oct;10(10):1556-66. [Pubmed ID: 26379229]
-文献查找方法：登录 www.pubmed.com，输入 Pubmed ID，点“Search”即链接到文献-

方法学说明：
1，应用过柱法从外周血提取 DNA，通过测序技术，对基因外显子区进行直接测序，与参考序列进行比
较，从而发现可能存在的基因突变。本测序方法覆盖了外显子编码区及内含子-外显子交界处的基因突
变，未能覆盖这些基因的大片段基因缺失或重复突变，以及内含子深部、基因调控区等区域。

2，本实验室依据 ACMG 的相关条款进行基因变异的解释。在具体解释的过程中，检索了每个基因变异在

各大基因变异数据库中的频率，通过一系列的生物信息学软件进行了功能预测，并对这些变异进行了文
献搜索，对以往的研究报道进行了回顾。同时还结合了本实验室所获得的临床信息（患者的临床特点、
家族史）进行分析。本实验室仅报告那些与受检者临床表型有关的致病突变以及可疑致病的突变（含
VUS-倾向于病理性的变异）。而不会报告那些非致病性的基因变异。

3，本检测涉及了 1146 个基因，由于篇幅有限，以下仅列举其中部分：

ATP7B，ATP7A，CP，KRT8，KRT18，HFE，HJV，HAMP，TFR2，SLC40A1，LDLR，APOB，LDLRAP1，

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PCSK9，ABCG5，ABCG8，LIPA，LPL，APOA5，LIPI，USF1，APOE，LIPC，APOA1，ABCA1，LCAT，
MTTP，SAR1B，SLC12A1，KCNJ1，CLCNKB，BSND，CLCNKA，SLC12A3，PAH，PTS，QDPR，GCH1，
PCBD1，SPR，BCKDHA，BCKDHB，DBT，DLD，CPS1，OTC，ASS1，ASL，ARG1，NAGS，SLC25A15，FA
H，TAT，HPD，SLC25A13，OAT，MTHFR，AHCY，GNMT，MAT1A，AMT，GLDC，PRODH，ALDH4A1，HAL，
MUT，MMAA，MMAB，MCEE，MMADHC，MMACHC，LMBRD1，HMGCL，AUH，MCCC1，MCCC2，ACADSB，HLC
S，PCCA，PCCB，IVD，GCDH，ACAT1，BTD，ACAD8，ETFDH，ETFA，ETFB，PNPLA2，ABHD5，CPT2，
SLC25A20，HSD17B10，MLYCD，FH，MVK，GLYCTK，HGD，SLC22A5，CPT1A，ACADVL，ACADL，ACAD
M，ACADS，HADHA，HADH，ETHE1，GALT，GYS2，G6PC，SLC37A4，GAA，AGL，GBE1，PYGM，PYGL，
PFKM，PHKA1，PHKA2，PHKB，PHKG2，PGAM2，LDHA，LDHB，ALDOA，ENO3，PGM1，GPI，IDUA，ID
S，SGSH，NAGLU，HGSNAT，GNS，GALNS，GLB1，ARSB，GUSB，MAN2B1，MANBA，NEU1，FUCA1，NAG
A，AGA，GNPTAB，GNPTG，MCOLN1，GM2A，HEXA，HEXB，ARSA，GALC，GLA，GBA，NPC1，NPC2，
SMPD1，ASAH1，PSAP，PPT1，TPP1，CLN3，CLN5，CLN6，MFSD8，CLN8，CTSD，DNAJC5，CTNS，
SLC17A5，VAMP2，PPGB，CTSC，CTSK，ABCD1，PEX1，PEX3，PEX5，PEX6，PEX10，PEX12，PEX13，
PEX14，PEX16，PEX19，PEX26，PHYH，PEX2，PEX7，AMACR，AGPS，GNPAT，EHHADH，HSD17B4，
ACOX1，CAT，AGXT，GRHPR，TRIM37，PMM2，MPI，ALG6，ALG3，DPM1，MPDU1，ALG12，ALG8，ALG
2，ALG1，ALG9，DOLK，RFT1，DPM3，ALG11，SRD5A3，MGAT2，MOGS，SLC35C1，B4GALT1，COG7，
SLC35A1，COG1，COG8，ATP6V0A2，COG4，COG5，COG6，TH，DDC，DBH，MAOA，ABAT，ALDH5A1，
SLC2A1(GLUT1)，GLRA1，SLC6A5，GLRB。

申明：
本检测结果对本次送检样本负责；
本公司保留对上述结果的最终解释权，如有疑义，请在收到报告后的 7 个工作日内与我们联系。
检测人员： 审核人员： 报告日期：2017-0
主检实验室：广州金域

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