Professional Documents
Culture Documents
שיעור – 16קומפלקס פירובט דהידרוגנאז ומעגל קרבס – ד"ר רונית רותם – 29.03.2020
הנשימה התאית:
הנשימה התאית זהו תהליך פירוק מולקולות עתירות אנרגיה ,ליצירת חומרים אחרים,
ולהנעת תהליכים בתא .מתקבל ATPממעבר אלקטרונים מרמת אנרגיה גבוהה לרמת
אנרגיה יותר נמוכה.
הפקת האנרגיה בגוף מתבצעת בשלושה שלבים:
א.גליקוליזה – שלב אנאירובי – מפרקים גלוקוז לשתי טריאוזות של פירובט,
מיקומה בציטוזול .נוצרים 2ATP+2NADHלאחר מכן יש שתי אפשרויות:
תסיסה של פירובט ללקטאט או אתנול .תהליך זה דורש הרבה
חומר מחזר – .NADH
מעבר למיטוכונרידה לקומפלקס פירובט דהידרוגנאז.
* קולט האלקטרונים הסופי אינו החמצן (מימן ,גופרית ,אמוניה ,ניטריט ,ברזל)...
מבחינה אנרגטית :נוצר – ATP + 2 NADH 2בשרשרת הנשימה ה NADH-יומר ל-
.ATP
ב .שלב אירובי – הפירובט נכנס למיטוכונדריה ,ושם הוא פוגש פירובט
דהידרוגנאז ,ובהמשך הופך לאצטיל .CoA
ג .מעגל קרבס – נכנסים למעגל קרבס ומייצרים מולקולות שוות אנרגיה ונשאי מימנים,
שתלכנה לשרשרת הנשימה ,ושם המימנים שיחזרו למטריקס יגרמו ליצירת .ATP
מיטוכונדריה:
המיטוכונדריון -אברון תוך תאי בו הופך המזון לאנרגיה
כימית זמינה בצורת .ATPהמיטוכונדריה היא שם כללי
לבין 200-500מיטוכונדריונים שיש בתא ,לכן היא לא
בדיוק אברון.
המיטוכונדריון מורכב משתי ממברנות:
ממברנה חיצונית – אינה סלקטיבית ,כלומר,
חדירה לחומרים שיגיעו מהציטוזול.
ממברנה פנימית – סלקטיבית .על גביה מתרחש הזרחון החמצוני ושרשרת
הנשימה .יש לה קפלים שנקראים - cristaeשמטרתן להגדיל את שטח הפנים
שלה.
*מטריקס -חלל נוזלי שנמצא בתוך הממברנה הפנימית .כל תהליכי החמצון הסופיים
של המעגלים המטבוליים בגוף – קומפלקס פירובט דהידרוגנאז ,מעגל קרבס ,חמצון
חומצות אמינו וכו' – יתרחשו בתוך המטריקס.
*החלל הבין ממברנלי – נזרקים לשם מימנים מהמטריקס ,ובשרשרת הנשימה נראה שהם
יחזרו חזרה למטריקס ,והם אלה שישמשו את המפל ליצירת ה.ATP-
פירובט דהידרוגנאז קומפלקס (:)PDC
פירובט דהידרוגנאז ( )E1זהו למעשה האנזים הראשון שהפירובט פוגש עם כניסתו
למטריקס של המיטוכונדריה.
שם ,תתרחש שרשרת של 5ריאקציות עוקבות ,שמורכבת מ 3-אנזימים ו 5-קופקטורים
(סייעים לא חלבוניים שעוזרים לפעילות האנזים).
3אנזימים:
Pyrovate dehydrogenase (E1) – 20-30עותקים.
Dihydrolipoyl transacetylase (E2) – 60עותקים.
Dihydrolipoyl dehydrogenase (E3) – 6עותקים.
משמעות העותקים היא ,שניתן להוביל הרבה תהליכים כאלה במקביל.
5קופקטורים:
Lipoate
TPP
+NAD
FAD
CoA
מגיבים ותוצרים :פירובט יהפוך ל acetyl CoA-תוך כדי שחרור CO2
−3.7 lck מבחינה אנרגטית :ריאקציה אקסורגונית ,כלומר ,פולטת אנרגיה .מפיקה
מנגנון הפעולה:
שלב :1דה-קרבוקסילציה –
אנזיםPyruvate dehydrogenase (E1) :
פעולה :תולש CO2מפירובט (בעל 3פחמנים) ,שנפלט מהמערכת.
תוצר :אצטיל מופעל שקשור ל( TPP-תיאמין פירופוספט – נגזרת של ויטמין --- .)B1בעל
2פחמנים.
ברגע שהאצטיל נקשר לחומצה הליפואית ,היא עוברת חיזור והקשרים הדיסולפידיים
שלה נפתחים( .האצטיל נקשר ל.)S1 -
תוצרlipoate-thioester :
***מה לא מסודר כרגע? – האתר הפעיל של ,E2שכזכור ,קשורה אליו במקור חומצה
ליפואית מחומצנת – ובשלב זה היא מחוזרת .השלבים הבאים קשורים אליה.
שלב :4חמצון החומצה הליפואית ע"י FAD
אנזיםDehydrolipoyl dehydrogenase (E3) :
פעולה :באתר הפעיל של האנזים נמצאת מולקולת – FADנשא של מימנים .הוא לוקח
את המימנים מהחומצה הליפואית המחוזרת ( 2מימנים סה"כ – אחד מכל תיאול) ,והוא
הופך ל .FADH2-בכך הוא מחזיר את החומצה הליפואית למצבה המחומצן והמקורי –
נוצרים קשרים דיסולפידיים.
+HDAF
→
¿ ¿2
DAF + 2H
תוצרים :חומצה ליפואית מחומצנתFADH2 ,
HDAF → ¿ 2+
DAF + 2H ¿¿ +
שלב :5
¿¿+ ¿¿ + ¿¿+
DAN + 2H HDAN
→ +H
ה FADH2-מוסר את שני המימנים שלו ל , +NAD-הוא משחרר מימן אחד חזרה וכך
מכל מולקולת פירובט מקבלים .NADHבנוסף ,השתחרר FADבמצב המנוחה שלו.
***נשים לב בגליקוליזה קיבלנו שתי מולקולות פירובט מכל מולקולת גלוקוז .לכן
ממולקולת גלוקוז אחד נקבל בסך הכל .2NADH
מחסור בתיאמין:
תיאמין – הצורה הפעילה של ויטמין ,B1צורכים אותו דרך המזון בלבד.
המוח זקוק לקומפלקס PDHפעיל ,גלוקוז ונשימה אנאירובית .חוסר חמור בויטמין B1
גורם לינדרום שנקרא בריברי .מדובר בשיתוק התחושות של הידיים והרגליים ולעתים של
הגוף כולו ,אובדן תיאבון ,עצירות ,דיכאון ,קשיי ריכוז ,דופק מוגבר ,עייפות ,אבדן זיכרון,
בלבול נפשי ,שיתוקים ,בחילות וכו'.
סוכר ,עישון ואלכוהול גורמים לסילוק תיאמין מהגוף .אצל אלכוהוליסטים
למשל ,הכבד נפגע והיכולת שלו לעכל TPPיורדת.
– TPPקובצה פרוסטטית שנמצאת ב 3-אנזימים שנמצאים במסלולי פירוק של סוכרים:
) – Pyruvate dehydrogenase (E1עושה דה-קרבוקסילציה חמצונית לפירובט.
-αקטוגלוטרט דהידרוגנאז – אנזים של מעגל קרבס שעושה דה-קרבוקסילציה
חמצונית ל -α-קטוגלורט.
טרנסקטולאז -מזרז הפיכת סוכרים C4,5לסוכרים C3,7במסלול
הפנטוז-פוספט .מחסור בו גורם לפגיעה במעגל קרבס.
למה חוסר ב TPP-גורם לנזקים חמורים,
בעיקר במערכת העצבים?
.1מערכת העצבים תלויה אך ורק בגלוקוז
כמקור לאצטיל CoAול-α-קטוגלוטרט,
הנכנסים למעגל קרבס כמקורות אנרגיה
יחידים.
.2הצטברות פירובט הופכת ללקטט,
והתחמוצת הזאת עשויה להיות רעילה מאד
ולהזיק הן למערכת העצבים והן לשרירים.
פרשת רמדיה:
בתחילת 2003פותחה "רמדיה סופר פורמולה צמחית" ,נפלה שגיאה בפענוח
ריכוז הוויטמין B1במוצר .הערך שהתקבל בחישוב השגוי היה גבוה מהקצובה
היומית המומלצת לפעוטות ,כך שלא הוסף תיאמין למוצר החדש.
לאחר כחצי שנה הגיעו פעוטות עם תסמינים נוירולוגיים למרכזים רפואיים ברחבי
המדינה ..התסמינים כללו אפתיה ,פרכוסים ,ועוד .בשל הפיזור ברחבי הארץ לא
בלט המכנה המשותף בין הפונים השונים.
ב 5-בנובמבר , 2003שכבו מונשמים ארבעה תינוקות עם תסמינים דומים.
במקביל ,ולאחר שפורסם בכלי התקשורת שיש בעיה עם הפורמולה הצמחית,
הבחינה ד"ר אביבה פתאל ,נוירולוגית ילדים מהמרכז הרפואי בת"א ,כי תסמיני
הליקויים תואמים לתסמיני מחלת הבריברי והעלתה השערה שהמקור בהיעדר
ויטמין B1בפורמולה .בבדיקות נמצא כי שיעור וויטמין במוצר אכן נמוך מהדרוש.
מעגל קרבס
זהו השלב הסופי בחמצון מולקולות ה"דלק" (תרכובות מוסרות אלקטרונים ומימנים).
תפקידים:
יצירת ATPוכן נשאי אלקטרונים שילכו אח"כ לשרשרת הנשימה.
סיפוק תוצרים ביניים (מטבוליטים) הנדרשים לריאקציות ביוסינתטיות.
מיקום המעגל – המטריקס במיטוכונדריה (פרט לשלב )6 שלבי המעגל:
שלב אנזים סובסטרט תוצר רגולציה
-1דחיסה א.אצטיל Citrate CoA א .ציטראט – חומצת הלימון (6 *מעוכב
synthase ( 2פחמנים) פחמנים). ע"י
בין אצטיל CoA .ATP
ל-אוקסלאוצטא חד כיווני
ט.
***זו תגובה מאוד
אקסותרמית ,לכן חשיבותו – מקור לחומצות שומן ב.
התגובה האחרונה אוקסלואצטאט וסטרואידים ,מקור לחומרים
תהיה מאד ( 4פחמנים) מחזרים.
אנדותרמית
ב .שחרור CoA
*נפלט CO2
+
*NADH+H
-5מעבר Succinyl-CoA סוקצניל CoA סוקצינט ( 4פחמנים) *תלוי
מסוקצניל CoA synthetase ( 4פח') בויטמין
לסוקצינט B2
באתר הפעיל שלו
+זרחון ברמת יושבת חומצת *סוקצינט
האמינו היסטידין ,המצע (יצירת מפעיל
GTPעל חשבון והיא נקשרת
לסוקצינול .CoAשבירת קשר *נפלט CoA *אוקסלו-
בנוסף ,נקשר אליו עתיר אנרגיה עם אצטט
פוספט פוספט ,שמחליף *GDP → GTP מעכב
במולקולה את ה. CoA-
אחרת)
כך נוצר
זהו השלב הסוקצינט ,והוא
היחיד שבו יוצא ,והפוספט
נוצרת אנרגיה נשאר באתר
ישירות הפעיל.
*נוצר NADH
בסה"כ – מעגל אקסותרמי ,זו הסיבה לכך שהוא ספונטני (הוסבר בשיעור ביואנרגיה).
→ Acetyl-CoA + oxaloacetate → citrate → isocitrate → α-ketoglutarate
succinyl-CoA → succinate → fumarate → malate → oxaloacetate
דרך לזכור את התוצר של כל שלב:
מבחינת תהליכים:
דחיסה >>> איזומריזציה (דהידרציה והידרציה) >>> דה-קרבוקסילציה >>>
דה-קרבוקסילציה >>> זרחון ברמת המצע >>> דהידרוגנציה >>> הידרציה >>>
דהידרוגנציה
מבחינה אנרגטית ,בסך הכל:
acetyl-CoA yields 3 NADH+ 1 FADH2 + 1 GTP + 2 CO2 1
→ATP (from 3 NADH)+ 2 ATP (from 1 FADH2) 9
+ 1 ATP (from 1 GTP) = 12 ATP
אך נשים לב שבסופו של דבר מגלוקוז אחד מקבלים שתי מולקולות אצטיל ,CoAלכן
מפירוק גלוקוז וכניסת התוצרים למעגל קרבס לאחר קומפלקס הפירובט דהידרוגנאז –
נקבל 24מולקולות .ATP
***נשים לב שזהו מסלול קטבולי ,כלומר ,מייצר אנרגיה בעיקר כאשר הגוף זקוק
לאנרגיה נוספת .לכן ,כאשר יש הרבה אנרגיה הוא יואט ,כאשר יש מחסור באנרגיה הוא
יואץ – אך הוא לעולם לא פוסק באופן מלא.
פירוט על הרגולציות של מעגל קרבס:
ישנן רגולציות שונות לאנזימים שונים במעגל קרבס .אך נשים לב ,שלאחר שהגענו
לסוקציניל – CoAלא ניתן להאט יותר את המעגל ,זהו מצב מחייב.
א .תחילת המעגל – דחיסת אציטיל CoA-עם אוקסאלואצטט – האנזים ציטראט סינתאז
מעוכב אלוסטרית על ידי ,ATPהיות שבמצב של עודף אנרגיה – אנחנו פחות זקוקים
למסלולים יוצרי אנרגיה .במצב של עודף אנרגיה ,האצטיל CoAיילך לסינתזה של
חומצות שומן ,ובכך המעגל יעוכב.
ב .איזו-ציטרט דהידרוגנאז (האנזים של שלב – )3
מעכבים – ATP,NADH :מאותה סיבה שצוינה לעיל.
מפעיל – ADP :כזכור ADP ,הוא חיישן האנרגיה של התא .אם הוא נוצר בקצב
גבוה ,סימן שיש מחסור באנרגיה – לכן הוא יאקטב את פעילות האנזים.
ג α-KG .דהידרוגנאז (האנזים של שלב – )4מעוכב על ידי NADHוכן על ידי סוקציניל
– CoAכלומר ,על ידי התוצריפ שלו עצמו– מעיד על עודפים.
*** למותר לציין שהויסות על קומפלקס פירובט דהידרוגנאז משפיע גם הוא על מעגל
קרבס .בעודפי אנרגיה ו ATP-מיוצר פחות אוקסאלואצטט.
***יצירת Acetyl CoAזהו תהליך בלתי הפיך.
שאלה לדוגמה:
איזה מהריאקציות הבאות היא ריאקציה אנפלרוטית?
א .היפוך פוספואנול פירובט לפירובט
ב .היפוך פירובט לפוספואנול פירובט
פסלנו את התשובות האחרות היות שאלו בכלל
היפוךהמעגל.
אוקסלואצטט לפירובט לא תוצרי
ג.
ד .היפוך פירובט לאוקסלואצטט
ה .היפוך פירובט ללקטט
היבט קליני – חוסר בפומראז:
חוסר בפומראז -מחלה תורשתית ,שני ההורים נשאים ומכילים רמות מופחתות בחצי
של האנזים ,אך נורמליות מבחינה קלינית .נובעת ממוטציה בגן המקודד לאנזים.
לחולים קשת רחבה של תסמינים :אפילפסיה ,אי יכולת ללכת או לשבת זקוף ,קשיים
בדיבור ,עיוותים גופניים .חסרים אזורים שונים במוח .לרבים מהילדים יש רמת IQשל 25
בלבד .אין מרפא.
***המחסור הפומרז ,כפועל יוצא ,יוצר מחסור במלט.
המאזן האנרגטי של מעגל קרבס:
כפי שכבר ראינו ,במעגל קרבס ,קיבלו מגלוקוז אחד – 24מולקולות 12 ATP( ATPעבור
כל אצטיל .)CoA
בשקלול עם ה ATP-שהתקבל בגליקוליזה ובקומפלס פירובאט דהידרוגנאז ,קיבלנו סה"כ
36-38מולקולות .ATP