Professional Documents
Culture Documents
שיעור 7 19.3
שיעור 7 19.3
20 7
] [S
V= Vxam משוואת מיכאליס מנטן – לפי המשוואה המתארת את עקומת מיכאליס-מנטן:
∗ [S
m] K
כאשר ריכוז הסובסטרט קטן משמעותית מ Kmנקבל [ – Km = Km+]Sנראה שמהירות הריאקציה תלויה בו
ביחס ישר ,וכאשר ריכוז הסובסטרט גבוה משמעותית מ Kmנקבל [ – Km = [S]+]Sכך ניתן לצמצם את []S
מהמונה והמכנה ונראה שהמהירות פשוט שווה למהירות המקסימלית .כשריכוז הסובסטרט שווה ל Kmנקבל [
,Km = 2[S]+]Sולאחר צמצום עם המונה ,נראה שהמהירות היא חצי מהמהירות המקסימלית.
mK
∗1
1 1 xamV אם נהפוך את משוואת מיכאליס מנטן לעקומת קו ישר נקבל משוואה ליניארית:
= +
V
xamV ] [S
ציר ה Yהוא ,V/1ציר ה Xהוא .]S[/1שיפוע הגרף הוא .Km/Vmaxנק' החיתוך עם ציר ה Xהוא ,Km/1-ונק'
החיתוך עם ציר ה Yהוא ( .Vmax/1יש תמונה די ברורה במצגת).
אינהיביטורים לאנזימים – חומרים אשר נקשרים לאנזימים וכתוצאה מכך מפריעים לפעולת האנזים .ישנו
עיכוב בלתי הפיך ,בו הקשירה בין המעכב לאנזים חזקה מאוד ,והוא אינו מתנתק (או ממש בקושי מתנתק).
בנוסף ישנו עיכוב הפיך ( – )reversible inhibitorsהאנזים מסוגל גם להתנתק מהחומר המעכב אותו .שני
סוגים חשובים של מעכבים הפיכים הם מעכב תחרותי – בו האינהיביטור נקשר לאנזים בדיוק לאותו אתר
פעיל כמו הסובסטרט ,וכתוצאה מכך מתחרה עם הסובסטרט על מקום הקישור ,ומעכב לא-תחרותי – בו
האנזים נקשר לאתר אלוסטרי אשר מפריע לפעילות האנזים ,אך לא מונע את הקישור של סובסטרט לאנזים.
העלאת ריכוז הסובסטרט תעזור רק במצב של מעכב תחרותי – העלאת ריכוז הסובסטרט תעזור לסובסטרט
לנצח את המעכב התחרותי בהיקשרות לאתר הפעיל של הסובסטרט ,אך במצב של מעכב לא תחרותי זה לא
יעזור ,כי המעכב הלא-תחרותי פשוט הופך את האנזים ללא-פעיל (בלי קשר להאם האנזים נקשר לסובסטרט
או לא) .ההבדל הזה גורם לכך שמעכבים תחרותיים ולא-תחרותיים משנים את עקומת מיכאליס מנטן
באופן שונה:
עקומת מיכאליס מנטן עוזרת לנו להבחין בין מעכבים תחרותיים ומעכבים לא תחרותיים – בהוספת מעכב
תחרותי ,ה Kmיגדל ,אך ה Vmaxלא ישתנה .בהוספת מעכב לא-תחרותי ,ה Vmaxיקטן בעוד ה Kmלא
ישתנה .הסיבה לכך היא זו:
בעיכוב תחרותי – הוספת סובסטרט בכמות מאוד גבוהה תביא אותנו למצב שכל האנזימים נקשרים
לסובסטרטים ולא למעכב התחרותי (כי יש המון סובסטרט בהשוואה למעכב) – אז נקבל את המהירות
המקסימלית של הריאקציה בלי בעיה .מנגד ,כשיש לנו מעכב תחרותי שמתחרה עם הסובסטרט על הקשר עם
האנזים – אנחנו פוגעים באפיניות של האנזים לסובסטרט (כי הסובסטרט בתחרות על האתר הפעיל) – ועל
כן אנחנו עולים ב( Kmצריך להגדיל את ריכוז הסובסטרט כדי לקשור אנזימים).
בעיכוב לא תחרותי – כביכול מה שעשינו זה להוציא חלק מהאנזימים מחוץ למשחק – הקטנת כמות האנזים
הפעיל פשוט תקטין את המהירות המקסימלית שהריאקציה יכולה להגיע אליה ,אך לא משנה את ה ,Kmכלומר
לא משנה את האפיניות של האנזימים לסובסטרט (המעכב הלא תחרותי לא מפריע לקישור של
אנזים-סובסטרט).
*אם מעכב לא-תחרותי הוא הפיך ,למה העלאת ריכוז סובסטרט לא גורם לו להתנתק – המעכב הלא-תחרותי
אכן יכול להתנתק ,וסביר שזה יקרה אם נוסיף חומר נוסף שיקשר לאתר האלוסטרי (אליו המעכב הזה נקשר),
אבל הסובסטרט (ומעכבים תחרותיים) נקשרים לאתר הפעיל .כיוון שהסובסטרט והמעכב הלא-תחרותי
נקשרים לאתרים שונים באנזים ,הם לא מפריעים זה לזה ולא גורמים זה לזה להתנתק.
רגולציה של פעילות אנזימטית – ישנה בקרה על פעילות של אנזימים במספר דרכים:
משוב שלילי ( – )feedback inhibitionתוצר הביניים של ריאקציה/תוצר הסיום של הריאקציה נקשר
לאנזים המקטלז את הריאקציה ובכך מונע את המשך הקטליזה (מונע מהאנזים להיקשר לסובסטרט
נוסף).
רגולציה על חלבון שמפעיל את האנזים – הרגולציה היא עקיפה כיוון שנעשית על מי שמפעיל את
האנזים – לדוגמה ,חלבון קלמודולין מפעיל אנזים מסוים ,אבל קלמודולין מופעל רק בנוכחות סידן –
אז ניתן להגיד שהסידן משמש כרגולציה על האנזים באופן עקיף.
על ידי קשרים קוולנטים – דוגמה לכך היא פוספורלציה – קישור של פוספט לאנזים אשר מפעיל את
האנזים/משבית אותו .זוהי מודיפיקציה שנעשית (מן הסתם) לאחר יצירת האנזים ,ולרוב מודיפיקציות
כאלו משמשות כמפסק של on/offלאנזים.
על ידי פירוק קשרים – אנזימים מסוימים מופעלים על ידי הידרוליזה של קשרים מסוימים בהם ,לזה
אנו קוראים אקטיבציה פרוטאוליטית (אקטיבציה שנעשית על ידי פירוק אנזים/חלבון) .אלו הם
– zygomensאנזימים המסונתזים בצורה לא פעילה (למה זה קורה – בסוף הסיכום) .אם אותו אנזים
פרוטאוליטי יכול לפרק חלבונים שדומים לו – נקבל מעין משוב חיובי בו אנזים פעיל מסוגל להפעיל
אנזימים לא פעילים ,שבתורם מפעילים (מפרקים) אנזימים נוספים.
רגולציה אלוסטרית – חומרים שנקשרים לאנזים באתר שאינו האתר הפעיל ,וכתוצאה מכך משנים
את המבנה המרחבי של האנזים .זה יכול לגרום לאנזים לקשור סובסטרט טוב יותר ,או טוב פחות
(כמו במקרה של אינהיביטור לא-תחרותי) .אם כך רגולטור אלוסטרי הוא מודולטור – מווסת את
פעילות האנזים על הסובסטרט שלו .הרגולטור האלוסטרי הוא לעיתים אנזים בעצמו .כיוון שהרגולטור
האלוסטרי משפיע על האפיניות של האנזים לסובסטרט – הוא מגדיל/מקטין את ה( Kmאם הוא
מגביר את האפיניות – מקטין את ה.)Km
האפקט הסיגמוידי של רגולציה אלוסטרית – כאשר יש לנו רגולטור אלוסטרי ,הריאקציה לא עובדת לפי עקומת
מיכאליס-מנטן ,אלא יוצרת מעין עקומה סיגמואידית .זה קורה כאשר אנזים קושר יותר מחומר אחד בו זמנית
(שזה המצב שלנו בהינתן שקיים רגולטור אלוסטרי) ,וקיים קשר קואופרטיבי בין החומרים השונים שנקשרים
לאנזים (קשירה של הרגולטור מעודדת קשירה של הסובסטרט) .בריכוז בינוני-גבוה של סובסטרט ,מהירות
הריאקציה תהיה גבוהה יותר בנוכחות של רגולטור אלוסטרי חיובי (שמעודד קשירת סובסטרט).
פוספורלציות – כיוון שזו המודיפיקציה הכי שכיחה ,צריך לזכור פה כמה דברים בעל פה – אנזים בשם קינאז
אחראי על להעביר קבוצת פוספט מ ATPלחלבון כלשהו (על חומצה אמינית סרין ,טירוזין ,או תריונין –
.)ser,thr,tyrהאנזים פוספטאז בעצם עושה הידרוליזה של קבוצת הפוספט מהחלבון .שני אנזימים אלו בעצם
מפעילים/מכבים את החלבונים השונים באמצעות הפוספט.
שליטה באנזים יכולה להיות על ידי שליטה בפעילות שלו (עיכוב תחרותי/לא תחרותי ,רגולציה) ,בכמות
שלו (בקרה גנטית על הייצור שלו) ,במיקום שלו בתא (הרחקה של האנזים מהסובסטרט שלו) ,בריכוז
הסובסטרט שלו (שליטה על ייצור הסובסטרט/הכנסתו לתא) ,או בריכוז התוצר שלו (הסרת תוצר מהתא
תעודד המשך קטליזה).
– Zygomensהרבה פעמים אנחנו לא רוצים שאנזים יעבוד ללא בקרה במקום בו הוא נוצר כי יש לו פעילות
פרוטאוליטית ,והפתרון לכך היא לרוב לשחרר אותו במצב לא פעיל אל מחוץ לתא עם החומר שמפעיל אותו.
למשל פפסין הוא חלבון פרוטאוליטי שאנחנו זקוקים לו בקיבה לפירוק מזון .התא שמייצר אותו זורק אותו
החוצה בצורה לא פעילה ששמה פפסינוגן .החומר שמפעיל את פפסינוגן הוא ( HClחומצה) ,והחומצה מצויה
רק בקיבה עצמה (לא בתא) ,כך החלבון מופעל רק בקיבה ולא פוגע בתא שייצר אותו מלכתחילה.